1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_138 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.02 -0.12 -0.1 -0.22 0.24 0.53 0.31 0.37 -0.42 -0.53 -0.32 -0.53 0.28 0.56 0.89 0.38 0.01 -0.2 -0.2 -0.04 -0.12 -0.07 0.65 -0.32 -0.29 -0.51 -0.36 -0.41 -0.42 -0.62 -0.08
Bra001218 (MORF3)
 -0.24 0.32 -0.14 -0.99 0.28 0.64 -0.58 -0.13 -0.35 -0.58 -0.75 -0.55 0.26 0.97 1.21 -0.0 -0.21 0.65 0.23 -0.33 -0.37 -0.21 0.61 -0.17 -0.3 -0.6 -0.16 -0.45 -0.54 -0.9 0.22
Bra001372 (NUP1)
 -0.08 -0.01 0.06 -0.21 0.0 0.1 -0.18 0.0 -0.45 -0.21 -0.3 -0.32 0.04 0.3 0.53 0.24 0.15 0.57 -0.01 -0.03 -0.16 -0.22 0.84 -0.2 -0.12 -0.31 -0.05 -0.42 -0.32 -0.22 0.02
Bra001864 (NRPD5)
 -0.07 0.32 0.15 -0.09 0.44 0.66 -0.05 0.33 -0.36 -0.49 -0.52 -0.61 0.35 0.73 0.92 -0.01 0.09 0.39 -0.23 -0.26 -0.07 -0.16 0.85 -0.5 -0.59 -0.45 -0.82 -0.65 -0.79 -0.91 -0.32
Bra003000 (MRE11)
 -0.34 -0.21 -0.6 -0.55 0.2 0.63 -0.16 0.23 -0.5 -0.51 -0.47 -0.44 0.13 0.64 0.95 0.15 0.09 0.29 -0.03 0.05 -0.17 -0.12 0.52 -0.36 -0.27 -0.4 -0.09 -0.44 0.03 -0.44 0.4
-0.2 0.81 -0.96 -1.44 0.46 -0.12 0.05 0.58 -0.92 -1.18 -1.1 -1.63 -0.34 0.41 1.73 -0.07 0.46 1.01 -0.5 -0.28 -0.16 -0.85 1.12 -0.87 -0.05 -0.41 -0.63 -1.39 -0.78 -1.0 0.69
Bra003601 (ABC1K3)
 -0.3 0.24 -0.8 -0.51 0.42 0.36 -0.23 0.1 -0.41 -0.41 -0.5 -0.31 0.01 0.82 1.13 -0.33 -0.31 0.18 -0.22 -0.52 -0.53 -0.57 0.44 0.01 -0.02 -0.08 -0.09 0.09 0.26 -0.25 0.28
Bra003609 (EMB2217)
 -0.31 -0.26 -0.29 -1.1 -0.01 0.44 0.06 0.42 -0.19 -0.67 -0.01 -1.08 0.08 0.44 1.6 -0.16 0.37 0.68 -0.12 0.09 -0.19 -0.21 0.86 -0.8 -0.63 -0.91 -0.42 -0.94 -0.39 -0.72 0.26
Bra004638 (SIN2)
 -0.59 -0.76 -0.36 -0.24 0.31 -0.09 -0.83 0.17 -1.62 -0.85 -0.27 -1.31 0.02 -0.14 1.88 0.7 0.01 1.06 -0.08 0.29 -0.12 -0.31 1.82 -0.69 -0.84 -0.82 -0.66 -1.14 -1.35 -1.94 -0.14
-0.34 -0.19 -0.09 -0.28 0.21 0.3 -0.14 -0.13 -0.33 -0.33 -0.16 -0.32 0.12 0.35 0.66 0.15 -0.08 0.22 -0.19 -0.11 -0.07 -0.19 0.59 0.09 0.16 -0.1 -0.03 0.06 -0.13 -0.3 -0.11
Bra007281 (ALADIN)
 -0.08 0.21 0.23 -0.08 0.22 0.27 -0.11 0.14 -0.37 -0.13 -0.43 -0.4 0.23 0.37 0.78 0.25 0.1 0.31 -0.07 -0.2 -0.12 -0.12 0.48 -0.27 -0.14 -0.45 -0.26 -0.27 -0.58 -0.5 -0.09
Bra008003 (dNK)
 -0.57 -0.44 -0.39 -0.79 0.24 0.37 0.05 0.64 -0.75 -0.74 -0.63 -0.64 0.28 0.5 0.9 0.09 0.27 0.29 -0.23 -0.32 -0.5 -0.44 0.86 -0.08 -0.13 -0.26 0.05 -0.24 -0.31 -0.06 0.54
Bra009095 (MAA3)
 -1.06 0.29 -0.36 -1.18 0.36 0.86 -0.27 0.24 -1.36 -1.09 -0.67 -0.91 0.37 0.81 1.13 0.56 0.51 0.7 0.03 -0.0 -0.66 -0.43 1.46 -0.99 -0.75 -0.82 -0.6 -0.91 -1.3 -1.44 0.48
Bra009414 (ABO6)
 -0.65 -0.36 -1.13 -0.84 0.32 0.63 -0.14 -0.1 -1.07 -0.56 -0.55 -0.87 -0.22 0.41 1.32 0.65 0.61 0.75 0.23 0.04 0.06 0.1 0.64 -0.22 -0.52 -0.65 -0.29 -0.66 -1.18 -0.98 0.7
0.11 0.03 -0.18 -0.29 0.46 0.41 -0.36 -0.72 -0.15 -0.58 -0.27 -0.57 -0.18 0.72 0.77 -0.05 0.01 0.08 -0.37 -0.11 -0.32 -0.35 0.43 -0.16 -0.06 0.08 0.0 -0.3 0.11 -0.06 0.46
Bra011858 (Drg1-1)
 -0.14 0.21 -0.38 -0.46 0.11 0.6 0.15 0.3 -0.16 -0.29 -0.37 -0.36 0.27 0.64 0.81 0.24 0.19 0.08 -0.12 -0.2 -0.09 -0.13 0.87 -0.39 -0.4 -0.67 -0.31 -0.6 -0.49 -0.65 -0.12
0.23 -0.23 -1.4 -0.58 0.83 1.0 -0.96 -1.19 -0.74 -0.76 -0.35 -0.18 0.42 0.79 1.36 0.92 0.72 1.06 -0.43 -0.03 0.17 -0.21 -0.17 -1.27 -1.01 -1.59 -1.43 -0.54 -2.3 -0.34 0.25
Bra013784 (SEAP1)
 0.14 -0.05 -0.13 -0.26 0.37 0.41 -0.43 -0.44 -0.36 -0.37 -0.41 -0.39 0.03 0.67 0.78 0.0 -0.35 0.01 -0.15 -0.14 -0.28 -0.2 0.56 -0.19 -0.12 -0.26 -0.19 0.12 0.2 0.04 0.19
-0.09 0.21 -1.79 -1.25 -0.36 0.82 -1.74 -1.66 -0.71 -1.37 -1.77 -0.87 -0.42 1.08 1.46 -0.14 -0.41 2.02 0.35 -1.38 -1.03 0.12 2.66 -1.99 -1.87 -3.41 -1.12 -1.67 -1.2 -2.08 -2.02
Bra014465 (DHDPS)
 -0.85 -0.28 -0.1 -0.07 -0.17 0.52 -0.33 0.14 -0.91 -0.48 -0.83 -0.73 -0.29 0.76 1.14 0.37 0.44 0.4 -0.02 -0.03 -0.07 -0.05 1.39 -0.22 -0.07 -0.61 -0.19 -0.7 -1.18 -0.6 -0.25
-0.53 0.01 -0.25 -1.0 0.03 0.39 -0.17 0.23 -0.67 -0.49 -0.73 -0.79 0.01 0.73 1.17 0.2 0.12 -0.01 -0.03 -0.1 0.11 -0.23 0.88 -0.09 -0.39 -0.62 0.05 -0.42 -0.69 -0.13 0.63
-0.37 -0.65 -0.86 -0.44 -0.31 0.06 0.15 0.52 -0.49 -0.12 -0.27 -1.03 0.72 0.43 1.21 0.39 0.21 0.97 0.1 -0.13 0.39 -0.01 1.29 -0.57 -1.16 -0.79 -0.78 -1.15 -1.71 -1.22 0.04
Bra015366 (LIN37A)
 -0.08 0.04 0.23 -0.04 0.23 0.28 -0.42 -0.02 -0.63 -0.47 -0.38 -0.68 0.19 0.67 0.87 0.13 -0.05 0.05 -0.05 0.02 -0.2 -0.29 0.74 -0.11 0.07 -0.32 -0.02 -0.34 -0.36 -0.49 -0.07
-0.37 -0.0 -0.91 -0.32 0.17 0.61 0.32 1.01 -1.0 -0.73 -0.87 -1.08 0.34 0.6 1.14 0.44 0.48 0.28 -0.61 -0.04 0.15 -0.21 1.17 -0.68 -0.47 -0.5 -0.5 -0.74 -1.37 -1.41 -0.1
Bra015922 (HOT1)
 -1.6 1.17 -3.52 -4.93 -1.23 0.79 -1.1 -0.67 -0.29 -0.65 -1.22 -0.36 0.85 2.15 2.44 -0.34 -0.03 1.05 -0.28 -1.44 -1.65 -1.45 -0.75 -1.42 -1.54 -2.17 -1.72 -3.17 -0.71 -1.4 1.06
Bra015971 (SMU1)
 -0.13 0.0 0.07 -0.3 0.23 0.42 -0.26 -0.13 -0.35 -0.26 -0.22 -0.31 0.23 0.24 0.66 0.25 -0.01 0.31 0.05 -0.12 0.05 -0.1 0.65 -0.22 -0.09 -0.26 -0.22 -0.35 -0.47 -0.45 0.14
0.33 0.08 -0.39 -0.8 0.57 0.71 0.05 0.77 -0.79 -0.99 -0.87 -0.75 0.01 0.39 1.2 0.07 0.23 0.22 0.26 -0.11 -0.13 -0.57 0.74 -0.36 -0.6 -1.31 -0.23 -0.65 -0.59 -0.62 0.33
-0.14 0.31 -0.61 -1.1 0.15 0.73 -0.7 -0.61 -0.37 -0.7 -0.69 -0.63 0.01 1.41 1.74 -0.36 -0.3 -0.03 -0.32 -0.56 -0.64 -0.63 0.63 -0.33 -0.49 -0.67 -0.39 -1.03 -0.19 -0.23 1.03
Bra017328 (MORF6)
 -0.59 -0.06 -1.6 -0.3 -0.25 0.41 0.13 0.67 -1.08 -0.33 -0.45 -0.75 0.32 0.67 1.18 0.72 0.61 0.55 0.14 -0.13 0.32 0.05 0.88 -0.62 -0.53 -0.54 -0.36 -1.23 -1.82 -1.35 -0.01
Bra017378 (CDC48B)
 0.04 0.09 0.65 -0.51 0.15 0.11 0.04 0.65 -0.55 -0.8 -0.61 -1.06 0.11 0.6 1.21 0.28 0.18 0.73 -0.34 -0.29 -0.65 -0.65 1.27 -0.47 -0.75 -1.03 -0.42 -0.97 -0.88 -0.62 0.0
Bra018813 (RBP47A)
 -0.24 -0.01 -0.16 -0.32 0.04 0.23 0.29 0.7 -0.58 -0.51 -0.26 -0.39 0.6 0.46 0.79 0.45 0.38 -0.18 -0.63 -0.03 0.15 -0.08 0.77 -0.49 -0.47 -0.45 -0.35 -0.71 -0.55 -0.71 0.06
Bra020562 (LON1)
 -0.13 0.12 -1.03 -0.61 0.15 0.47 -0.06 0.36 -0.94 -0.42 -0.54 -0.76 0.15 0.6 1.2 0.58 0.29 0.75 -0.1 -0.23 0.13 -0.25 0.92 -0.51 -0.66 -0.6 -0.7 -0.48 -0.85 -1.04 0.33
-0.93 0.38 -1.4 -2.61 0.15 0.73 -0.07 -0.47 0.1 -0.09 -0.08 -0.32 -0.73 1.24 1.54 0.06 0.22 -0.32 0.23 -0.28 -0.66 -0.31 -1.91 0.17 -0.2 -0.25 0.09 -0.71 -0.04 -0.43 0.7
Bra020919 (smB)
 -1.17 -0.09 -0.26 -0.47 -0.11 0.4 -0.07 0.22 -0.8 -0.52 -0.53 -0.57 0.53 0.59 0.73 0.32 0.48 0.4 -0.12 0.12 -0.14 0.03 1.32 -0.28 -0.34 -0.49 -0.14 -0.79 -0.78 -0.59 0.01
Bra021584 (RIP1)
 -1.03 0.23 -0.87 -2.12 0.12 -0.13 -1.3 -0.58 -0.58 -0.33 -1.03 -1.0 -0.2 0.49 2.06 -0.36 0.1 2.07 -0.15 -0.37 -0.31 0.19 2.16 -1.71 -2.76 -4.82 -2.16 -1.91 -3.5 -1.75 0.1
-0.17 0.16 0.12 0.02 -0.06 0.38 -0.3 0.35 -0.96 -0.66 -0.79 -0.97 -0.1 1.02 1.29 0.08 -0.01 1.2 -0.43 -0.39 -0.47 -0.34 1.45 -0.86 -0.94 -0.67 -0.53 -1.0 -1.34 -0.97 0.05
Bra023114 (RSZ33)
 -0.43 -0.01 0.11 -0.39 0.09 0.43 -0.22 0.19 -0.3 -0.46 -0.36 -0.38 0.4 0.73 1.03 0.34 0.06 0.16 -0.21 -0.16 -0.16 -0.19 0.98 -0.46 -0.28 -0.76 -0.52 -0.89 -0.57 -0.51 0.28
Bra024506 (AGS1)
 -0.54 -0.64 -0.69 -0.72 0.39 0.57 -0.34 0.61 -0.84 -0.81 -0.96 -1.22 0.17 0.82 1.0 0.31 0.14 0.44 -0.22 -0.2 -0.21 -0.53 0.81 -0.03 0.16 -0.18 -0.08 0.0 -0.1 -0.77 0.26
Bra025388 (emb2076)
 -0.22 -0.09 -0.35 -0.43 0.54 0.51 -0.11 0.29 -0.09 -0.35 -0.59 -0.24 -0.02 0.89 0.77 0.09 -0.05 0.1 -0.04 -0.36 -0.15 -0.27 0.5 -0.53 -0.25 -0.72 -0.48 -0.48 -0.18 -0.1 0.56
Bra025629 (EngA-2)
 -1.07 -0.87 -1.47 -1.27 -0.16 0.54 0.04 0.34 -0.62 -0.81 -0.6 -0.11 0.04 0.25 1.06 0.59 0.92 1.05 -0.02 0.28 0.12 0.16 0.89 -0.55 -0.43 -0.48 -0.23 -0.56 -0.91 -1.03 0.06
Bra026158 (PININ)
 -0.05 0.1 0.19 -0.13 0.24 0.46 -0.25 0.23 -0.33 -0.52 -0.34 -0.5 0.08 0.66 0.81 0.04 0.09 0.36 -0.22 -0.17 -0.25 -0.36 0.73 -0.37 -0.38 -0.39 -0.44 -0.32 -0.27 -0.47 0.22
Bra026183 (NUP155)
 -0.4 0.09 -0.26 -0.87 0.5 0.5 0.05 0.24 -0.58 -0.22 -0.4 -0.51 0.33 0.18 0.93 0.48 0.16 0.2 -0.09 -0.24 -0.25 -0.49 0.78 -0.18 -0.28 -0.64 -0.2 -0.26 -0.28 -0.46 0.18
Bra027459 (U2AF35B)
 -0.16 0.25 0.29 0.03 -0.09 -0.09 -0.55 -0.17 -0.61 -0.5 -0.61 -0.47 0.45 0.45 0.67 0.03 -0.11 0.84 -0.24 -0.32 -0.42 -0.17 1.29 -0.21 -0.34 -0.37 -0.14 -0.53 -0.63 -0.26 0.24
-0.2 -0.4 -0.21 -0.99 -0.86 0.23 -0.53 0.33 -1.34 -0.59 -0.75 -0.88 -0.03 0.65 1.41 0.37 0.64 1.47 0.01 -0.04 -0.02 -0.01 1.14 -0.9 -0.75 -0.92 -0.67 -1.26 -1.53 -1.06 0.69
Bra028460 (EMB3012)
 0.06 -0.09 -0.5 -0.5 0.15 0.39 -0.19 -0.25 -0.31 0.02 -0.19 -0.22 0.06 0.68 1.01 0.46 0.32 0.47 0.18 -0.03 -0.09 -0.08 -0.01 -0.44 -0.39 -0.41 -0.45 -0.5 -0.76 -0.49 0.34
Bra028628 (HSC70-5)
 -1.11 0.71 -2.38 -3.1 -0.17 0.84 0.0 -0.02 -0.97 -0.62 -0.92 -0.88 0.64 0.94 1.83 0.73 0.74 1.12 -0.02 -0.64 -0.31 -0.5 0.83 -0.98 -1.12 -1.69 -0.92 -1.89 -1.2 -1.35 0.43
Bra029364 (NIC2)
 -0.96 1.4 -1.62 -2.51 0.27 1.21 -1.19 -2.14 0.2 -0.92 -1.24 -0.66 -0.71 1.52 2.11 -0.47 -0.3 0.64 0.02 -0.36 -1.01 -0.87 -0.63 -0.34 -0.64 -1.58 -0.38 -1.36 0.15 -0.6 0.47
Bra030642 (CLO)
 0.03 0.37 0.44 -0.11 0.18 0.62 -0.34 0.16 -0.39 -0.57 -0.47 -0.56 0.26 0.25 1.15 0.31 -0.18 0.43 -0.38 -0.08 -0.08 -0.36 0.92 -0.69 -0.61 -0.42 -0.45 -0.62 -1.06 -0.8 0.15
Bra030802 (PUR2)
 -0.43 -0.64 -1.46 -1.49 0.07 0.82 -0.01 0.11 -1.09 -0.14 -0.73 -0.6 0.26 0.6 1.15 0.38 -0.13 1.05 -0.15 0.08 0.06 -0.4 0.95 -0.12 -0.38 -0.54 -0.05 -1.36 -0.68 -0.65 0.55
Bra032529 (TPR2)
 -0.29 0.2 -0.38 -0.72 0.2 0.48 -0.07 0.05 -0.37 -0.41 -0.22 -0.07 0.57 0.64 0.93 0.09 0.24 0.23 -0.08 -0.48 -0.49 -0.33 0.47 -0.23 -0.35 -0.47 -0.17 -0.25 -0.48 -0.15 0.24
Bra034020 (MDN1)
 -0.33 -0.03 -0.17 -0.04 0.14 0.8 -0.67 0.49 -1.58 -0.72 -1.09 -1.41 -0.23 0.95 1.59 0.74 0.27 0.6 -0.5 -0.37 -0.4 -0.74 1.25 -0.61 -0.51 -0.57 -0.66 -0.84 -1.54 -1.25 0.4
-1.35 -0.34 -0.91 -1.41 0.21 0.74 -0.52 0.03 -0.68 -0.62 -0.43 -0.42 -0.32 0.44 1.64 0.72 0.44 0.95 0.35 -0.07 0.19 -0.03 1.5 -0.84 -1.09 -1.48 -1.17 -1.15 -1.42 -0.84 0.01
-0.52 -0.39 -0.16 -0.53 0.25 0.62 -0.12 0.14 -0.5 -0.35 -0.54 -0.82 0.25 0.28 0.67 0.39 0.04 0.37 -0.14 -0.04 -0.17 -0.0 0.52 -0.07 -0.09 -0.36 -0.2 -0.09 -0.11 -0.14 0.41
Bra037325 (mCSF1)
 -0.15 0.4 -0.07 -0.06 0.33 0.41 -0.06 0.15 -0.38 -0.31 -0.34 -0.27 -0.11 0.73 0.9 0.16 0.03 -0.11 -0.09 -0.24 0.15 -0.39 0.89 -0.24 -0.29 -0.61 -0.37 -0.2 -0.53 -1.02 -0.22
-0.3 -0.17 -0.35 -0.75 0.38 0.5 0.02 0.12 -0.35 -0.28 -0.4 -0.47 0.3 0.39 0.46 0.17 0.27 0.28 -0.27 -0.07 -0.02 -0.21 0.63 -0.09 -0.05 -0.28 0.05 -0.18 -0.3 -0.28 0.14
0.11 0.41 -1.25 -0.34 -0.52 0.42 -1.03 0.29 -0.89 -0.61 -0.69 -0.89 0.1 0.87 1.87 0.9 0.05 1.36 -0.17 -0.64 -0.49 -0.56 1.15 -0.47 -0.89 -0.95 -1.31 -1.58 -1.93 -1.75 0.05
-0.73 0.78 -2.14 -4.57 -0.96 0.25 -0.1 -0.1 -0.31 -1.2 -0.86 -0.09 0.74 1.51 1.8 -0.21 -0.29 0.45 0.0 -0.28 -1.44 -0.51 0.26 -0.82 -0.76 -0.99 -0.48 -1.79 -0.15 -0.27 1.36
-0.56 0.24 -0.14 -0.35 0.2 0.75 0.11 0.03 -0.23 -0.23 -0.36 -0.22 0.41 0.5 0.48 0.29 0.28 -0.19 -0.33 -0.3 -0.24 -0.29 0.97 -0.33 -0.13 -0.41 -0.2 -0.6 -0.28 -0.69 0.1
Bra040810 (NOV)
 -0.31 -0.23 -1.0 -0.35 0.42 0.51 0.16 0.83 -0.77 -0.68 -0.78 -0.98 0.33 0.81 1.28 0.59 0.33 0.15 -0.16 -0.28 -0.24 -0.69 0.8 -0.55 -0.65 -0.47 -0.22 -0.45 -0.74 -0.59 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.