1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_138 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.53 0.5 0.5 0.46 0.64 0.78 0.67 0.69 0.4 0.37 0.43 0.37 0.65 0.8 1.0 0.7 0.54 0.47 0.47 0.52 0.5 0.51 0.84 0.43 0.44 0.38 0.42 0.41 0.4 0.35 0.51
Bra001218 (MORF3)
 0.37 0.54 0.39 0.22 0.52 0.67 0.29 0.39 0.34 0.29 0.26 0.3 0.52 0.85 1.0 0.43 0.37 0.68 0.51 0.34 0.33 0.37 0.66 0.38 0.35 0.28 0.39 0.32 0.3 0.23 0.5
Bra001372 (NUP1)
 0.53 0.55 0.58 0.48 0.56 0.6 0.49 0.56 0.41 0.48 0.45 0.45 0.57 0.69 0.8 0.66 0.62 0.83 0.55 0.55 0.5 0.48 1.0 0.48 0.51 0.45 0.54 0.42 0.45 0.48 0.57
Bra001864 (NRPD5)
 0.5 0.66 0.59 0.5 0.71 0.83 0.51 0.66 0.41 0.38 0.37 0.34 0.67 0.87 1.0 0.52 0.56 0.69 0.45 0.44 0.5 0.47 0.95 0.37 0.35 0.39 0.3 0.34 0.31 0.28 0.42
Bra003000 (MRE11)
 0.41 0.45 0.34 0.35 0.59 0.8 0.46 0.61 0.37 0.36 0.37 0.38 0.56 0.8 1.0 0.57 0.55 0.63 0.51 0.53 0.46 0.48 0.74 0.4 0.43 0.39 0.49 0.38 0.53 0.38 0.68
0.26 0.53 0.16 0.11 0.41 0.28 0.31 0.45 0.16 0.13 0.14 0.1 0.24 0.4 1.0 0.29 0.42 0.61 0.21 0.25 0.27 0.17 0.66 0.17 0.29 0.23 0.2 0.12 0.18 0.15 0.49
Bra003601 (ABC1K3)
 0.37 0.54 0.26 0.32 0.61 0.58 0.39 0.49 0.34 0.34 0.32 0.37 0.46 0.8 1.0 0.36 0.37 0.52 0.39 0.32 0.32 0.31 0.62 0.46 0.45 0.43 0.43 0.49 0.55 0.38 0.55
Bra003609 (EMB2217)
 0.27 0.27 0.27 0.15 0.33 0.45 0.34 0.44 0.29 0.21 0.33 0.16 0.35 0.45 1.0 0.3 0.42 0.53 0.3 0.35 0.29 0.28 0.6 0.19 0.21 0.18 0.25 0.17 0.25 0.2 0.39
Bra004638 (SIN2)
 0.18 0.16 0.21 0.23 0.34 0.25 0.15 0.31 0.09 0.15 0.23 0.11 0.27 0.25 1.0 0.44 0.27 0.57 0.26 0.33 0.25 0.22 0.96 0.17 0.15 0.15 0.17 0.12 0.11 0.07 0.25
0.5 0.56 0.6 0.52 0.74 0.78 0.58 0.58 0.5 0.5 0.57 0.51 0.69 0.81 1.0 0.7 0.6 0.74 0.56 0.59 0.6 0.55 0.95 0.67 0.71 0.59 0.62 0.66 0.58 0.52 0.59
Bra007281 (ALADIN)
 0.55 0.67 0.69 0.55 0.68 0.71 0.54 0.64 0.45 0.53 0.43 0.44 0.68 0.76 1.0 0.69 0.63 0.72 0.56 0.51 0.54 0.54 0.82 0.48 0.53 0.43 0.49 0.48 0.39 0.41 0.55
Bra008003 (dNK)
 0.36 0.4 0.41 0.31 0.63 0.7 0.55 0.84 0.32 0.32 0.35 0.34 0.65 0.76 1.0 0.57 0.65 0.66 0.46 0.43 0.38 0.4 0.98 0.51 0.49 0.45 0.56 0.45 0.43 0.51 0.78
Bra009095 (MAA3)
 0.17 0.44 0.28 0.16 0.47 0.66 0.3 0.43 0.14 0.17 0.23 0.19 0.47 0.63 0.8 0.53 0.52 0.59 0.37 0.36 0.23 0.27 1.0 0.18 0.22 0.2 0.24 0.19 0.15 0.13 0.51
Bra009414 (ABO6)
 0.25 0.31 0.18 0.22 0.5 0.62 0.36 0.37 0.19 0.27 0.27 0.22 0.34 0.53 1.0 0.63 0.61 0.67 0.47 0.41 0.42 0.43 0.62 0.34 0.28 0.26 0.33 0.25 0.18 0.2 0.65
0.63 0.6 0.52 0.48 0.8 0.78 0.45 0.36 0.53 0.39 0.48 0.39 0.51 0.96 1.0 0.56 0.59 0.62 0.45 0.54 0.47 0.46 0.79 0.52 0.56 0.62 0.59 0.47 0.63 0.56 0.8
Bra011858 (Drg1-1)
 0.5 0.63 0.42 0.4 0.59 0.83 0.61 0.67 0.49 0.45 0.42 0.43 0.66 0.85 0.96 0.65 0.62 0.58 0.5 0.48 0.51 0.5 1.0 0.42 0.41 0.34 0.44 0.36 0.39 0.35 0.51
0.46 0.33 0.15 0.26 0.69 0.78 0.2 0.17 0.23 0.23 0.31 0.34 0.52 0.67 1.0 0.74 0.64 0.81 0.29 0.38 0.44 0.34 0.35 0.16 0.19 0.13 0.14 0.27 0.08 0.31 0.46
Bra013784 (SEAP1)
 0.64 0.56 0.53 0.49 0.75 0.77 0.43 0.43 0.45 0.45 0.44 0.45 0.59 0.93 1.0 0.58 0.45 0.58 0.52 0.53 0.48 0.5 0.86 0.51 0.53 0.49 0.51 0.63 0.67 0.6 0.66
0.15 0.18 0.05 0.07 0.12 0.28 0.05 0.05 0.1 0.06 0.05 0.09 0.12 0.33 0.43 0.14 0.12 0.64 0.2 0.06 0.08 0.17 1.0 0.04 0.04 0.01 0.07 0.05 0.07 0.04 0.04
Bra014465 (DHDPS)
 0.21 0.31 0.36 0.36 0.34 0.55 0.3 0.42 0.2 0.27 0.21 0.23 0.31 0.64 0.84 0.49 0.52 0.5 0.37 0.37 0.36 0.37 1.0 0.33 0.36 0.25 0.33 0.23 0.17 0.25 0.32
0.31 0.45 0.37 0.22 0.45 0.58 0.39 0.52 0.28 0.32 0.27 0.26 0.45 0.74 1.0 0.51 0.48 0.44 0.43 0.41 0.48 0.38 0.82 0.42 0.34 0.29 0.46 0.33 0.27 0.4 0.69
0.31 0.26 0.23 0.3 0.33 0.42 0.45 0.58 0.29 0.38 0.34 0.2 0.67 0.55 0.94 0.53 0.47 0.8 0.44 0.37 0.53 0.4 1.0 0.27 0.18 0.24 0.24 0.18 0.12 0.17 0.42
Bra015366 (LIN37A)
 0.52 0.56 0.64 0.53 0.64 0.66 0.41 0.54 0.35 0.39 0.42 0.34 0.62 0.87 1.0 0.6 0.53 0.57 0.53 0.55 0.48 0.45 0.91 0.51 0.57 0.44 0.54 0.43 0.42 0.39 0.52
0.34 0.44 0.24 0.36 0.5 0.68 0.56 0.9 0.22 0.27 0.24 0.21 0.56 0.68 0.98 0.6 0.62 0.54 0.29 0.43 0.5 0.38 1.0 0.28 0.32 0.32 0.32 0.27 0.17 0.17 0.41
Bra015922 (HOT1)
 0.06 0.42 0.02 0.01 0.08 0.32 0.09 0.12 0.15 0.12 0.08 0.14 0.33 0.82 1.0 0.15 0.18 0.38 0.15 0.07 0.06 0.07 0.11 0.07 0.06 0.04 0.06 0.02 0.11 0.07 0.38
Bra015971 (SMU1)
 0.58 0.63 0.66 0.52 0.74 0.85 0.53 0.58 0.5 0.53 0.54 0.51 0.74 0.75 1.0 0.76 0.63 0.79 0.66 0.58 0.66 0.59 1.0 0.54 0.59 0.53 0.54 0.5 0.46 0.46 0.7
0.55 0.46 0.33 0.25 0.65 0.71 0.45 0.74 0.25 0.22 0.24 0.26 0.44 0.57 1.0 0.46 0.51 0.51 0.52 0.4 0.4 0.29 0.73 0.34 0.29 0.18 0.37 0.28 0.29 0.28 0.55
0.27 0.37 0.2 0.14 0.33 0.5 0.18 0.2 0.23 0.18 0.19 0.19 0.3 0.8 1.0 0.23 0.24 0.29 0.24 0.2 0.19 0.19 0.47 0.24 0.21 0.19 0.23 0.15 0.26 0.26 0.61
Bra017328 (MORF6)
 0.29 0.43 0.15 0.36 0.37 0.59 0.48 0.71 0.21 0.35 0.32 0.26 0.55 0.7 1.0 0.73 0.68 0.65 0.49 0.4 0.55 0.46 0.82 0.29 0.31 0.3 0.34 0.19 0.13 0.17 0.44
Bra017378 (CDC48B)
 0.43 0.44 0.66 0.29 0.46 0.45 0.43 0.65 0.28 0.24 0.27 0.2 0.45 0.63 0.96 0.5 0.47 0.69 0.33 0.34 0.27 0.27 1.0 0.3 0.25 0.2 0.31 0.21 0.23 0.27 0.42
Bra018813 (RBP47A)
 0.49 0.57 0.52 0.46 0.6 0.68 0.7 0.94 0.39 0.4 0.48 0.44 0.87 0.79 1.0 0.79 0.75 0.51 0.37 0.56 0.64 0.55 0.99 0.41 0.42 0.42 0.45 0.35 0.4 0.35 0.6
Bra020562 (LON1)
 0.4 0.47 0.21 0.28 0.48 0.6 0.42 0.56 0.23 0.32 0.3 0.26 0.48 0.66 1.0 0.65 0.53 0.73 0.4 0.37 0.47 0.37 0.82 0.3 0.27 0.29 0.27 0.31 0.24 0.21 0.55
0.18 0.45 0.13 0.06 0.38 0.57 0.33 0.25 0.37 0.32 0.33 0.28 0.21 0.81 1.0 0.36 0.4 0.28 0.4 0.28 0.22 0.28 0.09 0.39 0.3 0.29 0.37 0.21 0.34 0.25 0.56
Bra020919 (smB)
 0.18 0.38 0.33 0.29 0.37 0.53 0.38 0.47 0.23 0.28 0.28 0.27 0.58 0.6 0.67 0.5 0.56 0.53 0.37 0.44 0.36 0.41 1.0 0.33 0.32 0.28 0.36 0.23 0.23 0.27 0.4
Bra021584 (RIP1)
 0.11 0.26 0.12 0.05 0.24 0.2 0.09 0.15 0.15 0.18 0.11 0.11 0.19 0.31 0.93 0.17 0.24 0.94 0.2 0.17 0.18 0.26 1.0 0.07 0.03 0.01 0.05 0.06 0.02 0.07 0.24
0.33 0.41 0.4 0.37 0.35 0.48 0.3 0.47 0.19 0.23 0.21 0.19 0.34 0.74 0.89 0.39 0.36 0.84 0.27 0.28 0.26 0.29 1.0 0.2 0.19 0.23 0.25 0.18 0.14 0.19 0.38
Bra023114 (RSZ33)
 0.36 0.49 0.53 0.37 0.52 0.66 0.42 0.56 0.4 0.36 0.38 0.38 0.65 0.81 1.0 0.62 0.51 0.55 0.42 0.44 0.44 0.43 0.97 0.36 0.4 0.29 0.34 0.26 0.33 0.35 0.59
Bra024506 (AGS1)
 0.34 0.32 0.31 0.3 0.65 0.74 0.4 0.77 0.28 0.29 0.26 0.22 0.56 0.88 1.0 0.62 0.55 0.68 0.43 0.44 0.43 0.35 0.88 0.49 0.56 0.44 0.47 0.5 0.47 0.29 0.6
Bra025388 (emb2076)
 0.46 0.51 0.42 0.4 0.78 0.76 0.5 0.66 0.51 0.42 0.36 0.46 0.53 1.0 0.92 0.57 0.52 0.58 0.52 0.42 0.49 0.45 0.76 0.37 0.45 0.33 0.38 0.39 0.47 0.5 0.79
Bra025629 (EngA-2)
 0.23 0.26 0.17 0.2 0.43 0.7 0.49 0.61 0.31 0.27 0.32 0.45 0.5 0.57 1.0 0.72 0.91 0.99 0.48 0.58 0.52 0.54 0.89 0.33 0.36 0.34 0.41 0.33 0.26 0.23 0.5
Bra026158 (PININ)
 0.55 0.61 0.65 0.52 0.67 0.78 0.48 0.67 0.45 0.4 0.45 0.4 0.6 0.9 1.0 0.59 0.61 0.73 0.49 0.51 0.48 0.44 0.94 0.44 0.44 0.43 0.42 0.46 0.47 0.41 0.66
Bra026183 (NUP155)
 0.4 0.56 0.44 0.29 0.74 0.75 0.55 0.62 0.35 0.45 0.4 0.37 0.66 0.6 1.0 0.73 0.59 0.61 0.49 0.45 0.44 0.37 0.91 0.46 0.43 0.34 0.46 0.44 0.43 0.38 0.6
Bra027459 (U2AF35B)
 0.37 0.49 0.5 0.42 0.38 0.38 0.28 0.36 0.27 0.29 0.27 0.29 0.56 0.56 0.65 0.42 0.38 0.73 0.35 0.33 0.31 0.36 1.0 0.35 0.32 0.32 0.37 0.28 0.26 0.34 0.48
0.31 0.27 0.31 0.18 0.2 0.42 0.25 0.46 0.14 0.24 0.21 0.2 0.35 0.57 0.96 0.47 0.56 1.0 0.36 0.35 0.36 0.36 0.8 0.19 0.22 0.19 0.23 0.15 0.13 0.17 0.58
Bra028460 (EMB3012)
 0.52 0.47 0.35 0.35 0.55 0.65 0.44 0.42 0.4 0.5 0.43 0.43 0.52 0.79 1.0 0.68 0.62 0.69 0.56 0.49 0.47 0.47 0.5 0.37 0.38 0.37 0.36 0.35 0.29 0.35 0.63
Bra028628 (HSC70-5)
 0.13 0.46 0.05 0.03 0.25 0.5 0.28 0.28 0.14 0.18 0.15 0.15 0.44 0.54 1.0 0.47 0.47 0.61 0.28 0.18 0.23 0.2 0.5 0.14 0.13 0.09 0.15 0.08 0.12 0.11 0.38
Bra029364 (NIC2)
 0.12 0.61 0.08 0.04 0.28 0.54 0.1 0.05 0.27 0.12 0.1 0.15 0.14 0.66 1.0 0.17 0.19 0.36 0.23 0.18 0.11 0.13 0.15 0.18 0.15 0.08 0.18 0.09 0.26 0.15 0.32
Bra030642 (CLO)
 0.46 0.58 0.61 0.42 0.51 0.69 0.36 0.5 0.34 0.3 0.32 0.3 0.54 0.54 1.0 0.56 0.4 0.61 0.35 0.43 0.43 0.35 0.85 0.28 0.3 0.34 0.33 0.29 0.22 0.26 0.5
Bra030802 (PUR2)
 0.33 0.29 0.16 0.16 0.47 0.8 0.45 0.49 0.21 0.41 0.27 0.3 0.54 0.68 1.0 0.59 0.41 0.93 0.41 0.48 0.47 0.34 0.87 0.41 0.35 0.31 0.43 0.18 0.28 0.29 0.66
Bra032529 (TPR2)
 0.43 0.6 0.4 0.32 0.6 0.73 0.5 0.54 0.41 0.39 0.45 0.5 0.78 0.81 1.0 0.56 0.62 0.61 0.5 0.38 0.37 0.42 0.73 0.45 0.41 0.38 0.47 0.44 0.38 0.47 0.62
Bra034020 (MDN1)
 0.26 0.33 0.3 0.32 0.37 0.58 0.21 0.47 0.11 0.2 0.16 0.12 0.28 0.64 1.0 0.56 0.4 0.5 0.23 0.26 0.25 0.2 0.79 0.22 0.23 0.22 0.21 0.19 0.11 0.14 0.44
0.13 0.25 0.17 0.12 0.37 0.54 0.22 0.33 0.2 0.21 0.24 0.24 0.26 0.44 1.0 0.53 0.44 0.62 0.41 0.31 0.37 0.31 0.91 0.18 0.15 0.12 0.14 0.14 0.12 0.18 0.32
0.44 0.48 0.56 0.44 0.75 0.97 0.58 0.69 0.45 0.49 0.43 0.36 0.75 0.76 1.0 0.82 0.65 0.81 0.57 0.61 0.56 0.63 0.9 0.6 0.59 0.49 0.55 0.59 0.58 0.57 0.84
Bra037325 (mCSF1)
 0.48 0.71 0.51 0.51 0.67 0.71 0.51 0.59 0.41 0.43 0.42 0.44 0.49 0.89 1.0 0.6 0.55 0.5 0.5 0.45 0.59 0.41 0.99 0.45 0.44 0.35 0.42 0.47 0.37 0.27 0.46
0.53 0.58 0.51 0.39 0.84 0.92 0.66 0.7 0.51 0.53 0.49 0.47 0.8 0.85 0.89 0.73 0.78 0.79 0.54 0.62 0.64 0.56 1.0 0.61 0.63 0.53 0.67 0.57 0.53 0.53 0.71
0.29 0.36 0.11 0.22 0.19 0.36 0.13 0.33 0.15 0.18 0.17 0.15 0.29 0.5 1.0 0.51 0.28 0.7 0.24 0.17 0.19 0.19 0.61 0.2 0.15 0.14 0.11 0.09 0.07 0.08 0.28
0.17 0.49 0.06 0.01 0.15 0.34 0.27 0.27 0.23 0.12 0.16 0.27 0.48 0.82 1.0 0.25 0.23 0.39 0.29 0.24 0.11 0.2 0.34 0.16 0.17 0.14 0.21 0.08 0.26 0.24 0.73
0.35 0.6 0.46 0.4 0.59 0.86 0.55 0.52 0.44 0.44 0.4 0.44 0.68 0.73 0.71 0.62 0.62 0.45 0.41 0.42 0.43 0.42 1.0 0.41 0.47 0.39 0.45 0.34 0.42 0.32 0.55
Bra040810 (NOV)
 0.33 0.35 0.21 0.32 0.55 0.59 0.46 0.73 0.24 0.26 0.24 0.21 0.52 0.72 1.0 0.62 0.52 0.46 0.37 0.34 0.35 0.25 0.71 0.28 0.26 0.3 0.35 0.3 0.25 0.27 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)