Heatmap: Cluster_148 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Bra000225	-1.21	-1.35	-0.94	-1.05	1.17	0.61	0.41	0.15	-0.03	-0.14	-0.31	-0.45	-0.22	0.84	0.78	0.52	0.02	-0.39	0.18	0.42	-0.45	0.02	-0.8	-0.12	0.21	-0.4	0.05	-0.13	0.08	-0.67	-0.51
Bra000973 (TRM15)	-0.29	-0.49	-0.83	-1.45	1.11	0.73	-1.11	-1.08	-0.41	-0.27	-0.24	-0.52	0.26	0.32	0.57	0.33	-0.04	0.9	0.15	-0.39	-0.48	-0.36	0.44	-0.12	-0.26	-0.47	-0.34	0.11	0.18	0.17	0.36
Bra001949	-0.95	-0.96	-1.38	-1.2	0.77	1.46	-0.51	-0.5	-0.44	-1.1	-0.8	-0.6	0.13	1.18	1.32	0.41	-0.06	0.06	-0.04	-0.44	0.1	0.02	-0.86	0.22	0.03	-0.42	-0.26	-0.06	0.14	-0.47	-0.44
Bra001964 (ANX1)	0.12	-0.22	0.5	-0.09	0.77	0.88	-0.66	-0.53	-0.08	-0.5	-0.48	-0.38	-0.39	0.4	0.56	-0.14	-0.07	0.43	-0.02	-0.44	-0.37	-0.19	0.06	-0.34	-0.35	-0.79	-0.28	-0.1	0.04	0.24	0.46
Bra002454	-1.66	-0.84	-1.12	-0.29	2.2	1.97	-2.62	-1.57	0.0	-1.56	-0.44	-1.71	-0.41	2.07	1.63	-0.23	-0.83	-0.32	-0.83	-1.3	-1.19	-1.3	0.45	-0.68	-0.87	-1.88	-1.98	-0.88	-0.17	-0.9	-1.46
Bra002479 (ARF4)	0.5	0.26	0.1	-0.63	0.81	0.93	-0.72	-0.67	-0.67	-0.63	-0.73	-0.83	0.15	0.46	0.59	-0.07	-0.22	0.33	-0.06	-0.31	-0.36	-0.32	-0.14	-0.21	-0.15	-0.39	-0.1	0.13	0.15	-0.09	0.48
Bra003796	-0.79	-0.93	-0.3	-0.78	0.53	0.55	0.05	-0.44	-0.31	-0.19	-0.25	-0.74	0.54	0.63	0.87	0.29	0.14	0.2	-0.15	0.09	-0.35	0.13	-0.1	0.12	-0.02	-0.46	-0.23	-0.18	0.14	-0.29	0.23
Bra004249	0.12	-0.31	-0.27	-0.81	0.83	1.0	-0.41	-0.66	-0.47	-0.3	-0.33	-0.49	0.18	0.32	0.63	0.25	0.08	0.74	0.11	-0.1	0.06	-0.2	-0.14	-0.35	-0.32	-0.08	-0.45	-0.14	-0.15	-0.45	0.05
Bra004501 (NGA1)	-0.52	-1.64	-1.61	-1.24	1.22	1.01	0.04	0.35	-0.32	-0.08	-0.05	-0.63	0.42	0.82	0.94	0.65	0.14	0.19	-0.06	0.04	-0.06	0.36	-1.75	-0.28	-0.65	-0.16	-0.96	-0.65	-0.11	-0.6	-0.38
Bra004600 (CRK1)	-0.1	-0.07	0.1	-0.44	0.79	0.69	-0.31	-0.58	-0.06	-0.09	-0.29	-0.4	-0.12	0.56	0.79	0.27	-0.01	0.1	0.12	0.09	-0.07	-0.09	-0.27	-0.17	-0.28	-0.46	-0.31	-0.16	-0.04	-0.41	-0.21
Bra005255	-0.33	-2.03	-1.29	-0.89	1.28	1.38	-0.41	-0.64	0.18	-0.08	-0.32	-0.24	-0.7	1.31	0.91	-0.15	-0.06	0.6	0.28	-0.35	0.05	-0.04	-1.02	-0.2	-0.3	-1.19	-1.27	-0.43	-0.22	-0.06	-0.12
Bra005591 (GLR5)	-0.45	-0.72	-0.89	-0.87	0.76	0.65	-0.16	-0.21	-0.25	0.08	-0.18	-0.12	0.05	0.54	0.55	0.4	0.48	0.3	-0.06	-0.01	-0.02	0.15	-0.23	-0.25	-0.23	-0.47	-0.26	-0.19	-0.09	-0.32	0.24
Bra005700	-0.83	-1.95	-1.37	-0.77	0.79	1.29	-0.25	-1.01	-0.03	-0.22	-0.04	-0.47	-0.59	0.86	0.91	0.17	-0.07	0.06	0.02	0.25	-0.0	-0.02	-0.4	0.22	0.0	0.25	-0.3	0.2	0.15	-0.74	-0.48
Bra006945 (FTSZ2-2)	-0.65	-1.02	-0.76	-0.62	0.6	0.51	-0.08	-0.12	-0.11	0.09	-0.03	-0.21	0.08	0.58	0.64	0.37	0.19	0.09	0.02	-0.05	-0.18	-0.07	-0.47	0.05	-0.04	-0.28	-0.27	0.08	0.06	-0.18	0.23
Bra007298	-0.71	-0.99	-0.18	-0.52	1.05	0.71	0.15	0.02	-0.17	0.04	-0.29	-0.49	-0.07	0.66	0.37	0.04	-0.01	-0.91	-0.25	0.13	0.09	0.33	-0.15	-0.1	-0.06	-0.39	0.02	-0.01	0.18	-0.29	-0.21
Bra007698 (BGLU10)	-0.42	-0.91	-1.79	-1.1	0.58	1.33	-0.17	-0.33	0.05	-0.14	-0.29	-0.37	-0.34	1.1	1.05	-0.1	-0.23	0.17	0.26	-0.09	-0.01	0.04	-1.12	-0.17	-0.37	-0.94	-0.43	0.22	-0.18	-0.26	0.48
Bra007903	0.06	0.68	0.3	-0.79	1.15	0.64	-1.21	-0.44	-0.39	-0.59	-0.64	-0.07	-0.39	0.92	1.03	-0.64	-1.22	-0.59	-0.32	-0.5	-0.72	-0.92	0.17	-0.33	-0.26	-0.62	0.0	-0.03	0.63	0.29	0.42
Bra008266	-0.05	-0.22	-0.12	-0.4	0.8	0.7	-0.18	-0.32	-0.15	-0.19	-0.15	-0.2	-0.26	0.59	0.8	0.07	0.19	-0.2	-0.05	0.13	0.05	0.02	-0.42	-0.17	-0.2	-0.34	-0.2	-0.04	0.01	-0.37	-0.42
Bra008415 (KDO8PS)	-0.51	-0.57	-0.45	-0.71	0.97	0.46	-0.74	-0.67	-0.16	0.01	0.07	-0.44	-0.09	0.37	0.61	0.13	0.01	0.51	0.04	0.03	-0.34	-0.16	0.21	-0.26	-0.3	-0.78	-0.24	0.21	0.15	0.19	0.47
Bra008675	0.08	-0.44	-0.13	-0.69	0.9	1.04	-0.5	-0.98	0.14	-0.1	-0.07	-0.17	-0.66	0.83	0.87	-0.15	-0.25	0.02	0.07	-0.17	0.04	-0.08	-0.24	-0.06	-0.22	-0.32	-0.44	-0.04	0.14	-0.39	-0.48
Bra009836 (PLDALPHA3)	-0.08	-0.25	-0.16	-0.85	0.83	0.87	-0.25	-0.44	0.1	-0.09	-0.22	-0.18	-0.18	0.53	0.68	0.34	-0.07	-0.08	-0.31	-0.02	-0.05	-0.01	-0.43	-0.03	-0.0	-0.44	-0.26	0.04	0.2	-0.47	-0.34
Bra011045 (IAA11)	-0.23	-0.94	-0.68	-1.16	1.17	0.88	-0.08	-0.61	0.35	-0.56	-0.2	-0.0	-0.4	0.96	1.2	-0.01	-0.4	-0.23	0.22	0.12	0.1	0.08	-0.38	0.15	-0.25	-1.05	-0.25	-0.17	-0.2	-0.77	-0.52
Bra011138 (CFIM-25)	-0.68	-0.41	-0.34	-0.94	1.21	1.16	-1.57	-1.75	-0.58	-0.62	-0.68	-0.31	-0.9	0.9	1.39	-0.19	-0.39	0.73	-0.29	-0.45	-0.27	-0.05	0.7	-0.18	-0.47	-0.34	-0.28	-0.1	0.29	-0.3	-0.16
Bra012201	-0.5	-0.84	-0.53	-1.01	1.14	1.24	-0.0	-0.36	0.12	-0.54	-0.23	-0.41	-0.44	1.01	1.4	0.09	-0.05	-0.49	0.25	0.14	-0.02	0.32	-0.22	-0.25	-0.33	-1.24	-0.81	-0.35	-0.33	-0.79	-0.96
Bra014922 (CASPL5B3)	-0.31	-0.67	-1.07	-0.23	0.95	1.02	0.03	-0.27	-0.43	-0.12	-0.4	-0.7	-0.45	0.99	0.95	-0.13	-0.11	0.16	-0.46	-0.1	-0.61	0.06	0.13	-0.37	0.16	-0.13	-0.09	-0.26	-0.01	-0.28	-0.13
Bra015229	0.4	-0.07	-0.03	-0.25	1.03	0.72	-0.94	-1.05	-0.69	-0.87	-0.76	-1.06	-0.06	0.34	0.47	-0.4	-0.3	0.19	-0.26	-0.51	-0.7	-0.95	1.03	0.08	0.07	0.31	-0.26	0.36	0.14	-0.1	0.53
Bra015785	-0.92	-0.72	-0.71	-1.0	1.54	1.02	-1.15	-1.17	-0.36	-0.48	-0.61	-0.69	-0.81	1.29	0.96	-0.4	-0.23	0.45	0.05	-0.47	0.3	-0.2	0.87	-0.81	-0.75	-0.25	-0.7	-0.2	-0.42	0.42	-0.07
Bra016202 (GGT2)	-0.57	-1.05	-2.35	-1.3	1.19	1.32	0.4	-0.2	-0.18	-0.5	-0.69	-0.88	-1.2	1.04	1.45	0.1	-0.58	0.29	0.44	-0.07	-0.5	0.12	-1.02	-0.06	-0.25	-0.84	-0.2	-0.58	-0.13	-0.27	0.14
Bra017837 (MEL1)	-0.88	-0.85	-0.76	-1.18	0.93	1.04	-0.07	-0.53	-0.31	-0.54	-0.58	-0.56	0.0	0.65	0.91	0.41	0.16	0.64	0.07	0.11	-0.16	0.05	-0.63	0.2	0.05	-0.51	-0.18	0.01	-0.06	-0.57	-0.2
Bra017838	-0.45	-0.92	-1.32	-0.73	0.76	0.67	0.08	-0.3	-0.12	-0.32	-0.34	-0.37	0.06	0.6	0.44	0.31	0.06	0.34	-0.05	0.19	0.18	-0.02	-0.65	0.26	-0.0	-0.12	0.04	0.12	0.02	-0.43	-0.04
Bra018627	0.67	0.09	0.13	0.01	1.14	0.51	-0.84	-0.95	-0.49	-1.19	-1.28	-0.81	-0.41	0.97	0.79	-0.39	-0.54	-0.18	-0.4	-0.44	-1.09	-1.29	0.76	-0.03	0.18	-0.24	0.01	0.27	0.26	0.07	0.2
Bra018877	-0.25	-0.17	-0.07	-0.62	0.84	0.81	-0.21	-0.39	-0.91	-0.59	-0.64	-0.76	-0.45	0.12	0.52	-0.14	-0.41	0.07	0.07	-0.17	-0.29	-0.94	0.87	0.14	0.01	-0.11	0.01	0.18	0.03	0.19	0.73
Bra020462	-1.15	-1.16	-0.34	-1.36	1.59	1.54	-2.4	-1.7	-1.39	-1.1	-0.5	-0.52	0.51	0.99	1.03	-0.08	-1.37	1.51	-0.66	0.03	-0.99	-1.32	0.95	0.15	-1.46	-0.44	-1.31	-0.08	0.01	-0.51	-0.19
Bra021659	-0.4	-0.76	-0.61	-1.15	0.72	0.7	-0.15	-0.43	0.07	-0.04	-0.03	-0.07	-0.06	0.67	0.66	0.12	0.02	0.39	0.21	0.08	0.03	0.17	-0.26	-0.1	-0.15	-0.67	-0.13	-0.17	0.01	-0.38	-0.16
Bra022479 (ARI8)	-0.27	-0.37	-0.55	-0.83	0.57	0.5	-0.02	-0.38	0.23	0.05	0.02	-0.13	-0.14	0.77	0.66	0.26	0.06	-0.03	0.23	0.32	0.02	-0.01	0.13	-0.36	-0.31	-0.7	-0.25	-0.33	-0.03	-0.45	-0.17
Bra023620 (DFR1)	-0.12	-0.41	-0.29	-0.53	1.04	0.85	-0.53	-0.56	-0.82	-0.09	-0.58	-0.47	0.24	0.36	0.53	-0.14	0.12	0.43	-0.01	-0.39	-0.41	-0.26	0.38	0.16	-0.03	-0.05	-0.1	-0.08	-0.18	-0.51	0.33
Bra024949	-0.04	0.19	0.1	-0.2	0.56	0.37	-0.5	-0.31	-0.13	-0.35	-0.64	-0.99	0.01	0.79	0.36	-0.09	-0.22	-0.16	-0.32	-0.08	-0.2	-0.62	0.6	0.01	0.06	-0.37	-0.19	0.08	0.31	0.13	0.27
Bra025381	-0.22	-0.04	-0.26	-0.6	0.7	0.45	-0.54	-0.67	0.08	0.07	-0.2	-0.25	-0.09	0.51	0.26	0.18	-0.11	0.57	-0.01	-0.0	-0.28	-0.12	-0.17	-0.12	-0.09	-0.29	-0.13	0.12	0.11	0.03	0.04
Bra026265	-0.65	-1.15	-0.85	-0.88	1.39	1.74	-0.51	-1.58	-0.37	-0.93	-0.47	-1.07	-0.35	1.44	1.07	-0.14	-0.15	0.56	-0.31	0.38	0.07	-0.09	-1.16	-0.58	-0.57	-0.13	-1.14	-0.07	0.47	-1.1	-1.34
Bra026944 (PIRL3)	-0.42	-0.29	-0.43	-0.74	1.01	0.97	-0.25	-0.49	-0.03	-0.13	-0.21	-0.39	-0.52	0.99	1.14	0.02	0.14	-0.38	0.22	0.11	-0.08	0.04	0.03	-0.23	-0.31	-1.23	-0.32	-0.36	0.03	-0.59	-0.54
Bra027119 (U2AF65b)	0.15	0.01	0.0	-0.4	0.72	0.63	-0.51	-0.62	-0.46	-0.27	-0.26	-0.4	-0.55	0.44	0.49	-0.09	-0.44	-0.23	-0.08	-0.02	-0.53	-0.52	0.67	0.05	0.03	-0.57	-0.12	0.14	0.4	0.16	0.43
Bra027334 (CID9)	-0.55	-1.54	-2.16	-1.48	0.92	0.82	-0.43	-0.79	-0.09	-0.23	-0.21	-0.23	-0.3	0.84	0.96	0.43	0.11	0.68	0.44	-0.25	0.12	-0.07	-0.72	0.27	0.12	-0.34	-0.16	0.25	-0.36	-0.23	-0.55
Bra028753 (PAI2)	-0.82	-0.66	-0.87	-0.59	0.76	0.93	-0.49	-1.4	-0.5	-0.61	-0.7	-0.95	-0.3	0.55	0.72	-0.12	-0.02	0.99	0.15	-0.32	-0.36	-0.43	0.2	0.35	0.15	-0.38	-0.06	0.09	0.36	-0.16	0.72
Bra028875 (MT2B)	-0.18	-0.27	-0.64	-0.63	0.78	0.8	-0.28	-0.61	-0.08	-0.36	-0.23	-0.37	-0.16	0.81	0.98	0.01	-0.29	0.33	0.67	0.27	0.17	0.41	-0.7	-0.06	-0.16	-0.62	-0.18	-0.87	-0.61	-0.74	-0.12
Bra031162	-4.34	-	-5.79	-5.36	2.59	2.48	-1.59	-1.9	-2.61	-0.84	-1.96	-2.81	-4.52	2.34	2.03	-1.0	-0.88	0.09	0.33	0.43	-2.1	-0.8	-1.79	-0.41	-0.74	-3.35	-1.62	-1.92	-1.87	-2.81	-3.28
Bra031267 (MRP6)	-0.99	-1.7	-1.45	-1.59	1.36	1.64	-0.7	-1.12	-0.23	-0.27	-0.51	-0.86	0.09	0.81	1.1	0.54	0.2	0.13	0.21	-0.26	-0.05	-0.01	-0.01	-0.62	-0.72	-1.09	-0.75	-0.01	0.19	-0.65	0.17
Bra031268 (GLTP3)	-0.62	-0.99	-0.72	-1.24	0.95	1.13	0.02	0.03	-0.02	-0.44	0.01	-0.14	-0.02	1.06	0.69	0.1	-0.23	-0.6	-0.07	0.02	0.07	0.21	-0.31	-0.29	-0.41	-0.8	-0.16	-0.29	0.16	-0.31	0.0
Bra032099	-0.34	-0.31	-0.49	-0.49	0.83	0.85	-0.01	-0.35	-0.01	0.01	-0.22	-0.22	-0.32	0.74	0.64	-0.23	-0.1	0.24	0.51	0.21	-0.3	0.14	-0.27	-0.25	-0.28	-0.59	-0.26	-0.34	-0.11	-0.25	-0.22
Bra032360 (NUDX25)	-0.05	-0.64	-0.65	-0.45	1.12	1.39	-0.8	-1.16	-0.02	-0.39	-0.47	-0.63	-0.6	1.28	0.97	-0.08	-0.7	0.14	-0.32	0.13	-0.12	-0.13	-0.46	0.01	-0.42	-0.63	-0.72	0.26	0.26	-0.46	-0.36
Bra032401	0.22	-1.52	-0.66	-1.78	1.06	0.53	-1.64	-0.95	-0.37	-0.11	-0.34	-0.52	0.04	0.97	0.72	0.4	0.12	0.43	0.46	-0.04	-0.21	-0.4	-0.05	-0.14	0.17	-1.49	-0.47	0.38	0.07	0.09	0.22
Bra032823 (SPL10)	-0.08	-1.48	-1.67	-1.96	1.6	1.46	-0.63	-1.29	0.31	-0.29	0.0	-0.63	-0.03	1.38	1.18	0.2	0.28	-0.27	-0.39	-0.04	-0.22	-0.3	-1.28	-0.38	-0.24	-1.39	-0.28	-0.31	-0.24	-0.77	-0.61
Bra033229	-0.44	-0.12	-0.27	-0.5	0.93	1.07	-0.32	-1.01	0.23	0.06	-0.16	-0.03	-0.56	0.5	1.03	0.13	0.03	-0.35	0.01	0.09	-0.04	0.12	-0.47	-0.26	-0.31	-0.71	-0.41	-0.03	0.18	-0.38	-0.68
Bra033382	-0.63	-0.49	-0.88	-1.19	1.0	1.53	-0.64	-1.35	-0.09	-0.57	-0.59	-0.31	-1.27	0.67	1.38	0.01	-0.49	-0.51	-0.17	0.07	-0.04	0.3	0.01	0.13	-0.08	-0.56	-0.16	0.08	0.34	-0.23	-0.57
Bra034645 (B22)	-0.56	-0.29	-0.22	-0.4	0.53	0.43	0.07	-0.09	0.04	0.01	-0.06	-0.19	0.2	0.25	0.28	0.08	0.14	0.08	-0.01	-0.08	-0.07	0.01	-0.05	-0.06	-0.17	-0.09	-0.14	-0.03	0.0	-0.1	-0.02
Bra035086	-0.9	-1.05	-0.49	-1.02	0.76	0.8	-0.05	-0.5	-0.04	0.07	-0.09	-0.24	-0.29	0.75	0.72	0.33	0.14	0.12	0.01	0.1	0.06	0.16	-0.27	-0.36	-0.1	-0.42	-0.32	0.08	0.26	-0.32	-0.18
Bra036773	0.06	-0.0	-0.03	-0.09	0.6	0.52	-0.31	-0.48	-0.35	-0.24	-0.31	-0.23	-0.37	0.28	0.43	-0.03	-0.05	-0.09	-0.09	-0.35	-0.11	-0.32	0.31	-0.06	0.06	-0.07	-0.02	0.14	0.03	-0.03	0.4
Bra038238	-0.35	-0.18	-0.11	-0.54	0.53	1.12	-0.41	-1.08	-0.13	-0.33	-0.23	-0.3	-0.66	0.71	0.94	-0.14	-0.55	0.28	0.29	0.03	-0.41	0.0	0.17	-0.01	-0.01	-0.64	-0.13	-0.07	0.36	-0.31	-0.3
Bra038323	-0.11	0.0	-0.61	-0.89	1.84	1.42	-0.33	-0.94	0.31	-2.01	0.23	-1.16	-1.31	1.89	1.77	-0.34	-0.2	-0.93	-0.0	-0.54	-2.11	-0.04	-1.97	-1.24	-0.62	-1.01	-1.2	-1.92	-0.41	-0.67	-0.46
Bra040738 (ATG8F)	-0.04	-0.79	-0.52	-0.94	1.51	1.45	-0.71	-1.81	0.51	-0.43	-0.26	-0.45	-1.44	1.38	1.18	-0.64	-0.34	-0.21	0.51	-0.16	-0.46	0.28	-1.22	-0.14	-0.48	-1.08	-0.69	-0.16	0.22	-0.87	-1.04
Bra040991	0.06	-0.0	-0.03	-0.09	0.6	0.52	-0.31	-0.48	-0.35	-0.24	-0.31	-0.23	-0.37	0.28	0.43	-0.03	-0.05	-0.09	-0.09	-0.35	-0.11	-0.32	0.31	-0.06	0.06	-0.07	-0.02	0.14	0.03	-0.03	0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.