1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_148 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.19 0.17 0.23 0.21 1.0 0.67 0.59 0.49 0.43 0.4 0.36 0.32 0.38 0.8 0.76 0.63 0.45 0.34 0.5 0.59 0.32 0.45 0.26 0.41 0.51 0.34 0.46 0.41 0.47 0.28 0.31
Bra000973 (TRM15)
 0.38 0.33 0.26 0.17 1.0 0.77 0.22 0.22 0.35 0.38 0.39 0.32 0.56 0.58 0.69 0.58 0.45 0.86 0.51 0.35 0.33 0.36 0.63 0.43 0.39 0.34 0.37 0.5 0.53 0.52 0.59
0.19 0.19 0.14 0.16 0.62 1.0 0.26 0.26 0.27 0.17 0.21 0.24 0.4 0.82 0.91 0.48 0.35 0.38 0.35 0.27 0.39 0.37 0.2 0.42 0.37 0.27 0.3 0.35 0.4 0.26 0.27
Bra001964 (ANX1)
 0.59 0.47 0.77 0.51 0.93 1.0 0.35 0.38 0.52 0.38 0.39 0.42 0.42 0.72 0.81 0.5 0.52 0.74 0.54 0.4 0.42 0.48 0.57 0.43 0.43 0.32 0.45 0.51 0.56 0.64 0.75
0.07 0.12 0.1 0.18 1.0 0.86 0.04 0.07 0.22 0.07 0.16 0.07 0.16 0.91 0.68 0.19 0.12 0.18 0.12 0.09 0.1 0.09 0.3 0.14 0.12 0.06 0.06 0.12 0.19 0.12 0.08
Bra002479 (ARF4)
 0.75 0.63 0.56 0.34 0.92 1.0 0.32 0.33 0.33 0.34 0.32 0.3 0.58 0.73 0.79 0.5 0.45 0.66 0.51 0.42 0.41 0.42 0.48 0.45 0.47 0.4 0.49 0.58 0.58 0.49 0.74
0.32 0.29 0.45 0.32 0.79 0.8 0.57 0.4 0.44 0.48 0.46 0.33 0.8 0.85 1.0 0.67 0.6 0.63 0.5 0.58 0.43 0.6 0.51 0.6 0.54 0.4 0.47 0.48 0.6 0.45 0.64
0.54 0.41 0.42 0.29 0.89 1.0 0.38 0.32 0.36 0.41 0.4 0.36 0.57 0.62 0.77 0.6 0.53 0.84 0.54 0.47 0.52 0.44 0.45 0.39 0.4 0.47 0.37 0.45 0.45 0.37 0.52
Bra004501 (NGA1)
 0.3 0.14 0.14 0.18 1.0 0.87 0.44 0.55 0.34 0.41 0.42 0.28 0.58 0.76 0.83 0.68 0.47 0.49 0.41 0.44 0.41 0.55 0.13 0.35 0.27 0.39 0.22 0.27 0.4 0.28 0.33
Bra004600 (CRK1)
 0.54 0.55 0.62 0.43 1.0 0.93 0.47 0.39 0.56 0.54 0.47 0.44 0.53 0.85 0.99 0.7 0.58 0.62 0.63 0.61 0.55 0.54 0.48 0.51 0.48 0.42 0.46 0.52 0.56 0.43 0.5
0.31 0.09 0.16 0.21 0.94 1.0 0.29 0.25 0.43 0.36 0.31 0.33 0.24 0.95 0.72 0.35 0.37 0.58 0.47 0.3 0.4 0.38 0.19 0.34 0.31 0.17 0.16 0.29 0.33 0.37 0.35
Bra005591 (GLR5)
 0.43 0.36 0.32 0.32 1.0 0.93 0.53 0.51 0.5 0.63 0.52 0.55 0.61 0.86 0.87 0.78 0.82 0.73 0.57 0.59 0.58 0.66 0.5 0.5 0.5 0.43 0.49 0.52 0.56 0.47 0.7
0.23 0.11 0.16 0.24 0.71 1.0 0.34 0.2 0.4 0.35 0.4 0.3 0.27 0.74 0.77 0.46 0.39 0.43 0.41 0.49 0.41 0.4 0.31 0.48 0.41 0.49 0.33 0.47 0.45 0.24 0.29
Bra006945 (FTSZ2-2)
 0.41 0.32 0.38 0.42 0.97 0.91 0.61 0.59 0.6 0.68 0.63 0.55 0.68 0.96 1.0 0.83 0.73 0.68 0.65 0.62 0.57 0.61 0.46 0.66 0.62 0.53 0.53 0.68 0.67 0.56 0.75
0.3 0.24 0.43 0.34 1.0 0.79 0.54 0.49 0.43 0.5 0.4 0.35 0.46 0.77 0.63 0.5 0.48 0.26 0.41 0.53 0.52 0.61 0.44 0.45 0.46 0.37 0.49 0.48 0.55 0.4 0.42
Bra007698 (BGLU10)
 0.3 0.21 0.12 0.19 0.6 1.0 0.35 0.32 0.41 0.36 0.33 0.31 0.32 0.85 0.83 0.37 0.34 0.45 0.48 0.37 0.4 0.41 0.18 0.35 0.31 0.21 0.3 0.47 0.35 0.33 0.56
0.47 0.72 0.55 0.26 1.0 0.7 0.19 0.33 0.34 0.3 0.29 0.43 0.34 0.85 0.92 0.29 0.19 0.3 0.36 0.32 0.27 0.24 0.51 0.36 0.37 0.29 0.45 0.44 0.69 0.55 0.6
0.55 0.49 0.53 0.44 1.0 0.93 0.51 0.46 0.52 0.5 0.52 0.5 0.48 0.86 1.0 0.6 0.66 0.5 0.55 0.63 0.59 0.58 0.43 0.51 0.5 0.45 0.5 0.56 0.58 0.44 0.43
Bra008415 (KDO8PS)
 0.36 0.34 0.37 0.31 1.0 0.7 0.31 0.32 0.46 0.51 0.54 0.38 0.48 0.66 0.78 0.56 0.51 0.73 0.52 0.52 0.4 0.46 0.59 0.43 0.42 0.3 0.43 0.59 0.57 0.58 0.71
0.52 0.36 0.44 0.3 0.91 1.0 0.34 0.25 0.54 0.45 0.46 0.43 0.31 0.86 0.89 0.44 0.41 0.49 0.51 0.43 0.5 0.46 0.41 0.47 0.42 0.39 0.36 0.47 0.54 0.37 0.35
Bra009836 (PLDALPHA3)
 0.52 0.46 0.49 0.3 0.98 1.0 0.46 0.41 0.59 0.51 0.47 0.48 0.48 0.79 0.88 0.7 0.52 0.52 0.44 0.54 0.53 0.54 0.41 0.54 0.55 0.41 0.46 0.56 0.63 0.4 0.43
Bra011045 (IAA11)
 0.37 0.23 0.27 0.2 0.98 0.8 0.41 0.29 0.56 0.3 0.38 0.44 0.33 0.85 1.0 0.43 0.33 0.37 0.51 0.47 0.47 0.46 0.34 0.48 0.37 0.21 0.37 0.39 0.38 0.26 0.3
Bra011138 (CFIM-25)
 0.24 0.29 0.3 0.2 0.89 0.86 0.13 0.11 0.26 0.25 0.24 0.31 0.2 0.71 1.0 0.34 0.29 0.64 0.31 0.28 0.32 0.37 0.62 0.34 0.28 0.3 0.31 0.36 0.47 0.31 0.34
0.27 0.21 0.26 0.19 0.84 0.9 0.38 0.3 0.41 0.26 0.32 0.29 0.28 0.77 1.0 0.4 0.37 0.27 0.45 0.42 0.37 0.48 0.33 0.32 0.3 0.16 0.22 0.3 0.3 0.22 0.2
Bra014922 (CASPL5B3)
 0.4 0.31 0.24 0.42 0.96 1.0 0.51 0.41 0.37 0.45 0.38 0.3 0.36 0.98 0.95 0.45 0.46 0.55 0.36 0.46 0.32 0.52 0.54 0.38 0.55 0.45 0.47 0.41 0.49 0.41 0.45
0.65 0.46 0.48 0.41 1.0 0.8 0.26 0.24 0.3 0.27 0.29 0.23 0.47 0.62 0.68 0.37 0.4 0.56 0.41 0.34 0.3 0.25 0.99 0.52 0.51 0.61 0.41 0.63 0.54 0.46 0.7
0.18 0.21 0.21 0.17 1.0 0.69 0.15 0.15 0.27 0.25 0.22 0.21 0.2 0.84 0.67 0.26 0.29 0.47 0.35 0.25 0.42 0.3 0.63 0.2 0.2 0.29 0.21 0.3 0.26 0.46 0.33
Bra016202 (GGT2)
 0.25 0.18 0.07 0.15 0.84 0.91 0.48 0.32 0.32 0.26 0.23 0.2 0.16 0.75 1.0 0.39 0.24 0.45 0.5 0.35 0.26 0.4 0.18 0.35 0.31 0.2 0.32 0.25 0.34 0.3 0.41
Bra017837 (MEL1)
 0.26 0.27 0.29 0.21 0.92 1.0 0.46 0.34 0.39 0.33 0.32 0.33 0.49 0.76 0.91 0.64 0.54 0.76 0.51 0.52 0.43 0.5 0.31 0.56 0.5 0.34 0.43 0.49 0.47 0.33 0.42
0.43 0.31 0.24 0.36 1.0 0.95 0.63 0.48 0.55 0.48 0.47 0.46 0.62 0.9 0.8 0.73 0.62 0.75 0.57 0.67 0.67 0.59 0.38 0.71 0.59 0.54 0.61 0.64 0.6 0.44 0.57
0.73 0.48 0.5 0.46 1.0 0.65 0.25 0.24 0.32 0.2 0.19 0.26 0.34 0.89 0.78 0.35 0.31 0.4 0.35 0.33 0.21 0.19 0.77 0.45 0.51 0.38 0.46 0.55 0.54 0.48 0.52
0.46 0.49 0.52 0.35 0.98 0.96 0.47 0.42 0.29 0.36 0.35 0.32 0.4 0.59 0.78 0.5 0.41 0.58 0.57 0.49 0.45 0.29 1.0 0.6 0.55 0.51 0.55 0.62 0.56 0.62 0.91
0.15 0.15 0.26 0.13 1.0 0.97 0.06 0.1 0.13 0.16 0.24 0.23 0.48 0.66 0.68 0.31 0.13 0.95 0.21 0.34 0.17 0.13 0.64 0.37 0.12 0.25 0.13 0.31 0.34 0.23 0.29
0.46 0.36 0.4 0.27 1.0 0.99 0.55 0.45 0.64 0.59 0.59 0.58 0.58 0.97 0.96 0.66 0.62 0.8 0.7 0.64 0.62 0.69 0.51 0.57 0.55 0.38 0.55 0.54 0.61 0.47 0.54
Bra022479 (ARI8)
 0.49 0.45 0.4 0.33 0.87 0.83 0.58 0.45 0.69 0.61 0.6 0.54 0.53 1.0 0.93 0.7 0.61 0.57 0.69 0.73 0.59 0.58 0.64 0.46 0.47 0.36 0.5 0.47 0.58 0.43 0.52
Bra023620 (DFR1)
 0.45 0.37 0.4 0.34 1.0 0.88 0.34 0.33 0.28 0.46 0.33 0.35 0.57 0.62 0.7 0.44 0.53 0.66 0.48 0.37 0.37 0.41 0.63 0.54 0.48 0.47 0.45 0.46 0.43 0.34 0.61
0.56 0.66 0.62 0.5 0.85 0.75 0.41 0.47 0.53 0.45 0.37 0.29 0.58 1.0 0.74 0.54 0.5 0.52 0.46 0.55 0.5 0.38 0.88 0.58 0.6 0.45 0.51 0.61 0.72 0.63 0.7
0.53 0.6 0.52 0.41 1.0 0.84 0.42 0.39 0.65 0.65 0.54 0.52 0.58 0.88 0.74 0.7 0.57 0.92 0.61 0.62 0.51 0.57 0.55 0.57 0.58 0.5 0.56 0.67 0.66 0.63 0.63
0.19 0.14 0.17 0.16 0.78 1.0 0.21 0.1 0.23 0.16 0.22 0.14 0.24 0.81 0.63 0.27 0.27 0.44 0.24 0.39 0.31 0.28 0.13 0.2 0.2 0.27 0.14 0.28 0.41 0.14 0.12
Bra026944 (PIRL3)
 0.34 0.37 0.34 0.27 0.91 0.89 0.38 0.32 0.45 0.42 0.39 0.35 0.32 0.9 1.0 0.46 0.5 0.35 0.53 0.49 0.43 0.47 0.46 0.39 0.36 0.19 0.36 0.35 0.46 0.3 0.31
Bra027119 (U2AF65b)
 0.68 0.61 0.61 0.46 1.0 0.94 0.43 0.4 0.44 0.51 0.51 0.46 0.41 0.83 0.85 0.57 0.45 0.52 0.57 0.6 0.42 0.42 0.97 0.63 0.62 0.41 0.56 0.67 0.8 0.68 0.82
Bra027334 (CID9)
 0.35 0.18 0.11 0.18 0.97 0.91 0.38 0.3 0.48 0.44 0.44 0.44 0.42 0.92 1.0 0.69 0.55 0.82 0.7 0.43 0.56 0.49 0.31 0.62 0.56 0.41 0.46 0.61 0.4 0.44 0.35
Bra028753 (PAI2)
 0.29 0.32 0.27 0.33 0.85 0.96 0.36 0.19 0.35 0.33 0.31 0.26 0.41 0.73 0.83 0.46 0.5 1.0 0.56 0.4 0.39 0.37 0.58 0.64 0.56 0.39 0.48 0.53 0.65 0.45 0.83
Bra028875 (MT2B)
 0.45 0.42 0.32 0.33 0.87 0.88 0.42 0.33 0.48 0.39 0.43 0.39 0.45 0.89 1.0 0.51 0.41 0.64 0.8 0.61 0.57 0.67 0.31 0.49 0.45 0.33 0.45 0.28 0.33 0.3 0.47
0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.93 0.06 0.04 0.03 0.09 0.04 0.02 0.01 0.84 0.68 0.08 0.09 0.18 0.21 0.22 0.04 0.1 0.05 0.13 0.1 0.02 0.05 0.04 0.05 0.02 0.02
Bra031267 (MRP6)
 0.16 0.1 0.12 0.11 0.82 1.0 0.2 0.15 0.27 0.27 0.22 0.18 0.34 0.56 0.69 0.47 0.37 0.35 0.37 0.27 0.31 0.32 0.32 0.21 0.19 0.15 0.19 0.32 0.37 0.2 0.36
Bra031268 (GLTP3)
 0.3 0.23 0.28 0.19 0.89 1.0 0.47 0.47 0.45 0.34 0.46 0.42 0.45 0.95 0.74 0.49 0.39 0.3 0.44 0.46 0.48 0.53 0.37 0.38 0.34 0.26 0.41 0.37 0.51 0.37 0.46
0.44 0.45 0.4 0.4 0.99 1.0 0.55 0.44 0.55 0.56 0.48 0.48 0.45 0.93 0.87 0.47 0.52 0.66 0.79 0.64 0.45 0.61 0.46 0.47 0.46 0.37 0.46 0.44 0.51 0.47 0.48
Bra032360 (NUDX25)
 0.37 0.24 0.24 0.28 0.83 1.0 0.22 0.17 0.38 0.29 0.27 0.25 0.25 0.92 0.74 0.36 0.23 0.42 0.3 0.42 0.35 0.35 0.28 0.38 0.28 0.25 0.23 0.46 0.46 0.28 0.3
0.56 0.17 0.3 0.14 1.0 0.69 0.15 0.25 0.37 0.44 0.38 0.33 0.49 0.94 0.79 0.63 0.52 0.65 0.66 0.47 0.41 0.36 0.46 0.43 0.54 0.17 0.34 0.62 0.5 0.51 0.56
Bra032823 (SPL10)
 0.31 0.12 0.1 0.09 1.0 0.91 0.21 0.14 0.41 0.27 0.33 0.21 0.32 0.86 0.75 0.38 0.4 0.27 0.25 0.32 0.28 0.27 0.14 0.25 0.28 0.13 0.27 0.27 0.28 0.19 0.22
0.35 0.44 0.4 0.34 0.91 1.0 0.38 0.24 0.56 0.5 0.43 0.47 0.33 0.68 0.98 0.52 0.49 0.37 0.48 0.51 0.47 0.52 0.35 0.4 0.39 0.29 0.36 0.47 0.54 0.37 0.3
0.22 0.25 0.19 0.15 0.69 1.0 0.22 0.14 0.32 0.23 0.23 0.28 0.14 0.55 0.9 0.35 0.25 0.24 0.31 0.36 0.34 0.42 0.35 0.38 0.33 0.23 0.31 0.36 0.44 0.29 0.23
Bra034645 (B22)
 0.47 0.56 0.59 0.52 1.0 0.93 0.73 0.65 0.71 0.7 0.66 0.61 0.79 0.82 0.84 0.73 0.76 0.73 0.69 0.66 0.66 0.7 0.67 0.66 0.61 0.65 0.63 0.68 0.69 0.64 0.68
0.31 0.28 0.41 0.28 0.98 1.0 0.56 0.41 0.56 0.6 0.54 0.49 0.47 0.97 0.95 0.72 0.64 0.62 0.58 0.62 0.6 0.64 0.48 0.45 0.54 0.43 0.46 0.61 0.69 0.46 0.51
0.69 0.66 0.65 0.62 1.0 0.94 0.53 0.47 0.52 0.56 0.53 0.56 0.51 0.8 0.89 0.65 0.63 0.62 0.62 0.52 0.61 0.53 0.82 0.63 0.69 0.63 0.65 0.73 0.67 0.65 0.87
0.36 0.41 0.43 0.32 0.67 1.0 0.35 0.22 0.42 0.37 0.39 0.37 0.29 0.75 0.88 0.42 0.31 0.56 0.56 0.47 0.35 0.46 0.52 0.46 0.46 0.3 0.42 0.44 0.59 0.37 0.37
0.25 0.27 0.18 0.15 0.97 0.72 0.22 0.14 0.34 0.07 0.32 0.12 0.11 1.0 0.92 0.21 0.24 0.14 0.27 0.19 0.06 0.26 0.07 0.11 0.18 0.13 0.12 0.07 0.2 0.17 0.2
Bra040738 (ATG8F)
 0.34 0.2 0.25 0.18 1.0 0.96 0.21 0.1 0.5 0.26 0.29 0.26 0.13 0.91 0.8 0.23 0.28 0.3 0.5 0.32 0.26 0.43 0.15 0.32 0.25 0.17 0.22 0.31 0.41 0.19 0.17
0.69 0.66 0.65 0.62 1.0 0.94 0.53 0.47 0.52 0.56 0.53 0.56 0.51 0.8 0.89 0.65 0.63 0.62 0.62 0.52 0.61 0.53 0.82 0.63 0.69 0.63 0.65 0.73 0.67 0.65 0.87

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)