1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_148 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.83 0.75 1.0 0.93 4.32 2.92 2.54 2.12 1.87 1.74 1.54 1.4 1.64 3.44 3.29 2.74 1.94 1.46 2.17 2.56 1.4 1.94 1.1 1.77 2.22 1.46 1.98 1.75 2.03 1.2 1.35
Bra000973 (TRM15)
 2.17 1.89 1.49 0.98 5.74 4.42 1.24 1.26 2.01 2.21 2.26 1.85 3.19 3.33 3.96 3.35 2.6 4.96 2.94 2.03 1.91 2.08 3.61 2.45 2.22 1.93 2.11 2.88 3.02 3.0 3.41
2.66 2.65 1.98 2.23 8.75 14.17 3.62 3.62 3.79 2.4 2.95 3.39 5.63 11.68 12.86 6.84 4.94 5.36 4.99 3.79 5.52 5.22 2.84 5.97 5.24 3.84 4.29 4.93 5.67 3.71 3.79
Bra001964 (ANX1)
 4.45 3.51 5.78 3.83 6.99 7.51 2.6 2.83 3.87 2.89 2.92 3.15 3.12 5.41 6.05 3.73 3.9 5.52 4.04 3.03 3.17 3.6 4.27 3.24 3.21 2.37 3.37 3.82 4.21 4.84 5.62
0.1 0.18 0.15 0.27 1.5 1.29 0.05 0.11 0.33 0.11 0.24 0.1 0.25 1.37 1.02 0.28 0.18 0.26 0.18 0.13 0.14 0.13 0.45 0.2 0.18 0.09 0.08 0.18 0.29 0.18 0.12
Bra002479 (ARF4)
 8.18 6.92 6.17 3.73 10.11 10.98 3.51 3.62 3.64 3.72 3.47 3.25 6.42 7.96 8.69 5.51 4.95 7.25 5.55 4.64 4.5 4.61 5.22 4.99 5.21 4.41 5.4 6.33 6.4 5.41 8.07
3.76 3.41 5.28 3.79 9.39 9.48 6.74 4.78 5.24 5.69 5.46 3.89 9.45 10.08 11.85 7.92 7.15 7.44 5.87 6.89 5.08 7.1 6.07 7.07 6.39 4.73 5.55 5.71 7.14 5.31 7.59
4.45 3.33 3.42 2.34 7.31 8.2 3.09 2.59 2.96 3.34 3.27 2.92 4.66 5.12 6.35 4.89 4.35 6.86 4.42 3.82 4.28 3.57 3.72 3.22 3.29 3.88 3.02 3.72 3.71 3.01 4.25
Bra004501 (NGA1)
 2.4 1.1 1.12 1.45 7.99 6.92 3.53 4.37 2.75 3.25 3.32 2.23 4.61 6.09 6.6 5.41 3.79 3.92 3.3 3.53 3.29 4.4 1.02 2.82 2.2 3.08 1.76 2.19 3.2 2.26 2.65
Bra004600 (CRK1)
 11.58 11.83 13.27 9.13 21.47 20.03 10.02 8.29 11.92 11.68 10.16 9.41 11.4 18.31 21.36 14.94 12.35 13.26 13.44 13.16 11.82 11.65 10.26 11.01 10.24 9.01 9.98 11.11 12.1 9.33 10.69
1.11 0.34 0.57 0.75 3.39 3.63 1.05 0.89 1.58 1.31 1.12 1.18 0.86 3.45 2.61 1.25 1.33 2.11 1.69 1.09 1.44 1.36 0.69 1.22 1.13 0.61 0.58 1.04 1.2 1.33 1.29
Bra005591 (GLR5)
 2.67 2.22 1.98 2.01 6.18 5.75 3.28 3.17 3.09 3.88 3.24 3.37 3.79 5.33 5.37 4.82 5.1 4.51 3.51 3.63 3.6 4.06 3.12 3.08 3.11 2.64 3.05 3.2 3.45 2.93 4.31
1.77 0.81 1.21 1.84 5.42 7.69 2.64 1.56 3.07 2.7 3.05 2.27 2.08 5.69 5.89 3.53 2.98 3.28 3.18 3.74 3.13 3.1 2.37 3.66 3.14 3.74 2.55 3.6 3.49 1.87 2.25
Bra006945 (FTSZ2-2)
 17.1 13.21 15.87 17.49 40.76 38.33 25.37 24.7 24.95 28.49 26.38 23.21 28.35 40.17 41.92 34.77 30.57 28.62 27.28 25.97 23.76 25.51 19.41 27.85 26.18 22.09 22.32 28.39 28.06 23.68 31.55
93.49 76.99 135.44 106.78 316.14 250.18 169.21 155.05 136.33 157.29 125.38 109.31 146.1 242.55 198.27 157.65 151.98 81.45 128.97 167.24 163.15 191.83 138.0 142.35 146.57 116.78 154.89 152.42 173.13 125.5 132.56
Bra007698 (BGLU10)
 10.66 7.58 4.14 6.65 21.39 35.84 12.67 11.36 14.75 12.99 11.7 11.06 11.31 30.57 29.64 13.35 12.22 16.1 17.12 13.41 14.21 14.73 6.58 12.67 11.07 7.43 10.58 16.67 12.6 11.95 19.94
7.87 12.11 9.27 4.36 16.8 11.77 3.26 5.57 5.76 5.02 4.86 7.17 5.76 14.33 15.46 4.85 3.24 5.01 6.07 5.32 4.57 3.98 8.49 6.01 6.29 4.91 7.56 7.42 11.67 9.24 10.09
5.04 4.49 4.83 3.96 9.11 8.51 4.63 4.18 4.7 4.59 4.72 4.56 4.36 7.86 9.11 5.48 5.97 4.56 5.04 5.73 5.41 5.3 3.91 4.66 4.57 4.14 4.56 5.1 5.26 4.05 3.91
Bra008415 (KDO8PS)
 4.03 3.85 4.18 3.51 11.21 7.88 3.42 3.61 5.11 5.77 6.0 4.21 5.38 7.42 8.76 6.25 5.77 8.13 5.88 5.83 4.53 5.12 6.61 4.77 4.66 3.34 4.85 6.61 6.34 6.55 7.96
10.84 7.52 9.33 6.35 19.12 21.04 7.24 5.18 11.27 9.56 9.74 9.12 6.49 18.16 18.66 9.24 8.61 10.35 10.71 9.09 10.51 9.66 8.64 9.8 8.8 8.2 7.54 9.95 11.26 7.82 7.35
Bra009836 (PLDALPHA3)
 5.94 5.25 5.6 3.47 11.16 11.42 5.29 4.63 6.69 5.88 5.39 5.52 5.52 9.05 10.07 7.95 5.98 5.92 5.07 6.18 6.06 6.21 4.66 6.15 6.25 4.63 5.25 6.45 7.2 4.51 4.95
Bra011045 (IAA11)
 7.62 4.68 5.57 4.02 20.1 16.44 8.45 5.87 11.39 6.07 7.79 8.95 6.77 17.43 20.52 8.87 6.77 7.64 10.42 9.7 9.61 9.48 6.88 9.94 7.52 4.31 7.5 7.99 7.81 5.25 6.23
Bra011138 (CFIM-25)
 2.16 2.61 2.74 1.8 8.02 7.76 1.16 1.03 2.32 2.25 2.16 2.8 1.85 6.47 9.06 3.04 2.64 5.76 2.83 2.53 2.87 3.34 5.64 3.05 2.5 2.73 2.85 3.23 4.22 2.81 3.09
3.82 3.02 3.75 2.68 11.94 12.79 5.4 4.2 5.89 3.72 4.59 4.08 3.99 10.9 14.22 5.76 5.2 3.85 6.43 5.94 5.32 6.76 4.63 4.54 4.3 2.29 3.07 4.23 4.31 3.12 2.78
Bra014922 (CASPL5B3)
 5.62 4.4 3.33 5.98 13.54 14.17 7.16 5.79 5.18 6.43 5.32 4.31 5.12 13.94 13.52 6.39 6.5 7.83 5.1 6.54 4.59 7.31 7.64 5.41 7.83 6.41 6.59 5.83 6.93 5.75 6.39
1.17 0.84 0.87 0.74 1.82 1.46 0.46 0.43 0.55 0.48 0.53 0.43 0.85 1.12 1.23 0.67 0.72 1.01 0.74 0.63 0.55 0.46 1.81 0.94 0.93 1.1 0.74 1.14 0.98 0.83 1.28
2.04 2.35 2.36 1.92 11.24 7.81 1.74 1.71 3.0 2.76 2.52 2.38 2.2 9.44 7.52 2.92 3.29 5.26 3.99 2.78 4.74 3.36 7.04 2.21 2.3 3.25 2.38 3.36 2.89 5.16 3.68
Bra016202 (GGT2)
 27.25 19.58 7.91 16.39 92.36 100.92 53.41 35.33 35.71 28.54 25.11 22.03 17.62 83.26 110.32 43.24 27.0 49.34 54.95 38.42 28.52 43.89 19.91 38.7 34.03 22.53 35.32 27.13 36.99 33.57 44.72
Bra017837 (MEL1)
 6.78 6.9 7.38 5.5 23.72 25.72 11.86 8.64 10.08 8.55 8.33 8.46 12.48 19.57 23.41 16.56 13.91 19.48 13.11 13.46 11.17 12.91 8.04 14.31 12.91 8.78 10.99 12.53 11.98 8.42 10.86
10.22 7.39 5.59 8.41 23.57 22.28 14.75 11.34 12.89 11.2 11.04 10.83 14.57 21.22 18.88 17.3 14.54 17.67 13.46 15.9 15.84 13.81 8.92 16.73 13.95 12.82 14.37 15.12 14.17 10.33 13.53
1.97 1.31 1.35 1.24 2.71 1.75 0.69 0.64 0.88 0.54 0.51 0.71 0.93 2.42 2.13 0.94 0.85 1.09 0.94 0.91 0.58 0.5 2.09 1.21 1.4 1.04 1.24 1.49 1.47 1.29 1.42
2.08 2.21 2.36 1.61 4.42 4.34 2.14 1.89 1.32 1.65 1.58 1.46 1.82 2.69 3.54 2.26 1.87 2.61 2.6 2.2 2.03 1.29 4.53 2.74 2.49 2.29 2.49 2.8 2.54 2.82 4.12
0.21 0.2 0.36 0.18 1.37 1.33 0.09 0.14 0.17 0.21 0.32 0.32 0.65 0.91 0.93 0.43 0.18 1.3 0.29 0.47 0.23 0.18 0.88 0.51 0.17 0.34 0.18 0.43 0.46 0.32 0.4
8.54 6.62 7.36 5.05 18.47 18.28 10.14 8.32 11.76 10.94 10.96 10.7 10.79 17.87 17.69 12.19 11.37 14.75 12.99 11.87 11.49 12.66 9.4 10.46 10.12 7.07 10.24 9.98 11.29 8.63 10.03
Bra022479 (ARI8)
 7.62 7.09 6.3 5.18 13.63 13.03 9.04 7.09 10.79 9.54 9.35 8.38 8.33 15.65 14.49 11.02 9.57 9.0 10.77 11.45 9.3 9.1 10.08 7.15 7.4 5.67 7.75 7.32 9.0 6.75 8.17
Bra023620 (DFR1)
 2.23 1.82 1.97 1.67 4.97 4.35 1.67 1.64 1.37 2.27 1.62 1.75 2.85 3.1 3.5 2.2 2.63 3.26 2.39 1.85 1.82 2.02 3.15 2.7 2.37 2.33 2.26 2.29 2.14 1.69 3.05
3.46 4.04 3.81 3.08 5.22 4.56 2.51 2.86 3.23 2.78 2.27 1.79 3.58 6.13 4.55 3.32 3.05 3.18 2.85 3.36 3.08 2.3 5.38 3.58 3.7 2.74 3.1 3.76 4.4 3.88 4.29
9.66 10.93 9.39 7.4 18.19 15.34 7.72 7.07 11.82 11.74 9.74 9.42 10.51 16.0 13.42 12.74 10.41 16.7 11.15 11.2 9.22 10.34 9.99 10.31 10.54 9.16 10.28 12.22 12.08 11.46 11.54
1.68 1.19 1.46 1.44 6.92 8.83 1.86 0.88 2.04 1.39 1.9 1.26 2.08 7.15 5.53 2.39 2.39 3.88 2.14 3.44 2.78 2.48 1.18 1.76 1.78 2.41 1.2 2.51 3.65 1.23 1.05
Bra026944 (PIRL3)
 8.93 9.81 8.88 7.19 24.09 23.4 10.06 8.55 11.77 10.99 10.33 9.16 8.37 23.74 26.43 12.17 13.18 9.2 13.96 12.97 11.32 12.32 12.23 10.25 9.65 5.11 9.63 9.36 12.23 7.97 8.23
Bra027119 (U2AF65b)
 2.54 2.3 2.29 1.74 3.76 3.55 1.61 1.49 1.67 1.9 1.91 1.74 1.56 3.11 3.21 2.15 1.69 1.95 2.16 2.25 1.58 1.59 3.64 2.36 2.33 1.54 2.11 2.53 3.01 2.55 3.09
Bra027334 (CID9)
 3.67 1.85 1.2 1.93 10.18 9.51 4.0 3.11 5.06 4.59 4.65 4.59 4.37 9.65 10.5 7.26 5.8 8.61 7.33 4.52 5.84 5.12 3.27 6.51 5.83 4.25 4.83 6.4 4.2 4.58 3.67
Bra028753 (PAI2)
 8.56 9.59 8.24 10.05 25.64 28.77 10.72 5.72 10.66 9.91 9.28 7.84 12.24 22.05 24.89 13.94 14.89 30.04 16.71 12.08 11.8 11.24 17.31 19.2 16.78 11.58 14.49 16.03 19.41 13.55 24.94
Bra028875 (MT2B)
 4625.92 4353.51 3355.66 3389.88 9006.06 9107.78 4324.36 3435.54 4965.97 4066.78 4454.34 4051.39 4696.82 9205.68 10345.41 5263.21 4287.74 6585.63 8326.14 6331.41 5871.34 6973.56 3224.25 5034.29 4686.23 3415.77 4604.83 2869.44 3424.66 3144.33 4822.58
0.06 0.0 0.02 0.03 7.3 6.79 0.4 0.32 0.2 0.68 0.31 0.17 0.05 6.16 4.94 0.61 0.66 1.29 1.52 1.64 0.28 0.7 0.35 0.92 0.73 0.12 0.39 0.32 0.33 0.17 0.13
Bra031267 (MRP6)
 1.1 0.67 0.8 0.73 5.59 6.79 1.34 1.0 1.86 1.81 1.53 1.2 2.32 3.81 4.66 3.17 2.51 2.38 2.52 1.82 2.11 2.16 2.17 1.41 1.32 1.02 1.29 2.16 2.49 1.39 2.46
Bra031268 (GLTP3)
 6.53 5.06 6.12 4.26 19.44 21.94 10.21 10.24 9.95 7.43 10.15 9.16 9.93 20.89 16.18 10.75 8.6 6.63 9.56 10.17 10.53 11.65 8.13 8.23 7.55 5.78 8.99 8.21 11.23 8.1 10.07
49.35 50.16 44.5 44.39 111.16 112.33 62.04 49.04 61.78 62.81 53.51 53.5 50.05 103.98 97.34 53.24 58.29 73.81 89.11 72.18 50.74 68.65 51.73 52.61 51.43 41.3 51.95 49.31 57.63 52.35 53.55
Bra032360 (NUDX25)
 11.65 7.76 7.71 8.87 26.34 31.77 6.93 5.41 11.95 9.2 8.7 7.79 7.98 29.26 23.65 11.42 7.44 13.35 9.66 13.19 11.12 11.07 8.79 12.18 9.01 7.81 7.36 14.52 14.46 8.77 9.45
1.03 0.31 0.56 0.26 1.84 1.27 0.28 0.46 0.68 0.81 0.7 0.61 0.9 1.73 1.45 1.16 0.95 1.19 1.21 0.86 0.76 0.67 0.85 0.8 0.99 0.31 0.63 1.15 0.92 0.93 1.03
Bra032823 (SPL10)
 6.16 2.33 2.05 1.68 19.67 17.95 4.21 2.66 8.06 5.31 6.51 4.21 6.37 16.97 14.75 7.49 7.91 5.4 4.98 6.32 5.6 5.28 2.68 4.99 5.51 2.47 5.36 5.24 5.52 3.82 4.25
8.48 10.56 9.55 8.15 21.81 24.04 9.21 5.69 13.49 12.0 10.31 11.25 7.82 16.24 23.48 12.57 11.74 9.0 11.6 12.26 11.19 12.49 8.32 9.61 9.26 7.04 8.63 11.26 12.98 8.8 7.17
34.28 37.63 28.85 23.18 105.82 153.52 34.11 20.78 49.63 35.76 35.26 42.76 22.03 84.06 138.26 53.53 37.64 37.26 47.04 55.45 51.5 65.18 53.44 58.09 50.13 35.98 47.55 56.01 67.28 45.23 35.75
Bra034645 (B22)
 31.42 37.65 39.59 34.92 66.72 62.01 48.38 43.38 47.56 46.59 44.37 40.52 52.96 55.02 56.21 48.78 50.87 48.93 45.79 43.79 44.01 46.63 44.62 44.17 40.96 43.33 41.88 45.26 46.2 42.97 45.61
2.29 2.07 3.04 2.11 7.24 7.42 4.13 3.02 4.16 4.49 4.03 3.62 3.5 7.21 7.06 5.38 4.72 4.64 4.31 4.58 4.44 4.78 3.55 3.34 4.0 3.2 3.42 4.51 5.12 3.43 3.78
12.5 11.93 11.75 11.21 18.17 17.1 9.66 8.6 9.38 10.12 9.67 10.18 9.25 14.56 16.08 11.75 11.53 11.22 11.23 9.38 11.11 9.55 14.83 11.51 12.45 11.36 11.8 13.21 12.21 11.72 15.75
4.49 5.02 5.3 3.92 8.24 12.38 4.3 2.7 5.21 4.53 4.86 4.62 3.61 9.35 10.94 5.17 3.89 6.92 6.97 5.82 4.3 5.7 6.4 5.66 5.65 3.66 5.22 5.42 7.3 4.61 4.64
3.06 3.31 2.17 1.79 11.79 8.82 2.63 1.73 4.11 0.82 3.87 1.48 1.33 12.2 11.24 2.61 2.87 1.73 3.29 2.27 0.76 3.22 0.84 1.4 2.15 1.64 1.43 0.87 2.48 2.07 2.41
Bra040738 (ATG8F)
 287.14 170.19 205.16 153.75 836.69 805.85 179.79 83.74 419.22 218.25 245.97 216.27 108.81 764.18 667.76 188.44 232.24 254.3 418.31 263.76 213.83 358.4 126.01 266.51 210.49 139.37 182.22 263.31 343.89 161.02 142.78
12.5 11.93 11.75 11.21 18.17 17.1 9.66 8.6 9.38 10.12 9.67 10.18 9.25 14.56 16.08 11.75 11.53 11.22 11.23 9.38 11.11 9.55 14.83 11.51 12.45 11.36 11.8 13.21 12.21 11.72 15.75

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)