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Heatmap: Cluster_123 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000663 (APX4)
 0.94 0.82 0.73 0.75 0.46 0.29 0.68 0.87 0.93 0.67 0.71 0.92 0.38 0.2 0.15 0.26 0.39 0.21 0.39 0.36 0.41 0.43 0.06 0.59 0.61 0.61 0.63 0.73 0.81 1.0 0.62
Bra002999 (LHCB3)
 0.82 0.62 0.62 0.73 0.48 0.46 0.58 0.61 0.8 0.5 0.62 0.66 0.33 0.38 0.26 0.26 0.33 0.22 0.48 0.35 0.42 0.39 0.07 0.66 0.65 0.61 0.57 0.88 1.0 0.82 0.47
1.0 0.89 0.83 0.77 0.76 0.64 0.73 0.84 0.94 0.75 0.82 0.86 0.48 0.48 0.46 0.51 0.56 0.33 0.62 0.6 0.57 0.57 0.13 0.64 0.65 0.65 0.66 0.77 0.95 0.99 0.83
Bra003451 (LHCA2)
 0.82 0.75 0.78 0.75 0.57 0.52 0.56 0.58 0.82 0.71 0.75 0.76 0.47 0.51 0.45 0.46 0.46 0.32 0.58 0.56 0.53 0.53 0.14 0.64 0.67 0.66 0.69 0.87 1.0 0.94 0.76
Bra005405 (GPS1)
 0.53 0.43 0.45 0.61 0.39 0.4 0.45 0.41 0.73 0.62 0.7 0.61 0.37 0.31 0.29 0.46 0.44 0.16 0.47 0.42 0.48 0.46 0.07 0.64 0.66 0.67 0.59 0.79 1.0 0.69 0.51
Bra005423 (LHB1B2)
 0.84 0.84 0.88 0.9 0.39 0.38 0.4 0.47 0.47 0.47 0.59 0.71 0.23 0.3 0.26 0.24 0.28 0.31 0.6 0.36 0.36 0.41 0.08 0.63 0.62 0.67 0.63 0.78 0.89 1.0 0.64
Bra007109 (LHCA1)
 0.79 0.68 0.66 0.78 0.41 0.4 0.67 0.75 0.79 0.64 0.66 0.76 0.39 0.3 0.26 0.34 0.44 0.24 0.49 0.46 0.49 0.48 0.07 0.74 0.73 0.69 0.73 0.92 1.0 0.96 0.64
Bra012083 (OEE1)
 0.66 0.62 0.66 0.67 0.45 0.42 0.51 0.53 0.62 0.61 0.63 0.6 0.42 0.35 0.29 0.47 0.47 0.3 0.58 0.56 0.55 0.52 0.1 0.77 0.83 0.83 0.86 0.82 0.93 1.0 0.86
Bra012475 (COL16)
 0.7 0.61 0.64 0.58 0.58 0.56 0.62 0.63 0.54 0.59 0.62 0.59 0.43 0.43 0.43 0.54 0.57 0.44 0.61 0.59 0.53 0.62 0.34 0.8 0.85 0.88 0.87 0.74 0.84 1.0 0.88
Bra013183 (LHCB2)
 0.83 0.75 0.68 0.81 0.38 0.22 0.46 0.51 0.78 0.49 0.67 0.7 0.27 0.15 0.11 0.18 0.26 0.23 0.43 0.29 0.35 0.38 0.07 0.57 0.55 0.62 0.58 0.95 0.79 1.0 0.64
Bra014433 (LHCA2)
 0.71 0.59 0.55 0.7 0.54 0.53 0.64 0.6 0.79 0.81 0.8 0.81 0.51 0.45 0.36 0.6 0.61 0.27 0.66 0.67 0.67 0.66 0.12 0.9 0.93 0.83 0.92 0.94 1.0 1.0 0.8
Bra014908 (PSAF)
 0.95 0.9 0.88 0.96 0.41 0.42 0.44 0.52 0.63 0.67 0.6 0.67 0.45 0.26 0.24 0.38 0.39 0.22 0.36 0.5 0.5 0.47 0.07 0.69 0.69 0.72 0.67 0.86 1.0 0.87 0.61
0.8 0.75 0.73 0.85 0.38 0.24 0.65 0.69 0.94 0.77 0.86 1.0 0.55 0.21 0.17 0.38 0.51 0.22 0.46 0.55 0.6 0.52 0.04 0.65 0.72 0.71 0.78 0.58 0.78 0.93 0.69
Bra018144 (CAB4)
 0.8 0.65 0.66 0.73 0.47 0.47 0.68 0.71 0.84 0.66 0.75 0.74 0.49 0.39 0.31 0.46 0.52 0.26 0.55 0.54 0.56 0.53 0.1 0.69 0.69 0.66 0.65 0.89 1.0 0.85 0.63
0.57 0.75 0.54 0.51 0.42 0.38 0.38 0.33 0.71 0.45 0.68 0.62 0.32 0.34 0.23 0.34 0.38 0.25 0.46 0.4 0.41 0.48 0.06 0.64 0.66 0.62 0.62 0.59 1.0 0.74 0.64
Bra018955 (PSI-H)
 0.8 0.66 0.66 0.69 0.49 0.48 0.53 0.55 0.65 0.7 0.86 0.61 0.39 0.45 0.34 0.42 0.47 0.43 0.65 0.52 0.53 0.61 0.13 0.73 0.73 0.67 0.66 0.92 1.0 0.87 0.67
Bra021327 (TLP18.3)
 0.8 0.73 0.7 0.66 0.58 0.55 0.71 0.72 0.84 0.81 0.84 0.81 0.52 0.39 0.37 0.61 0.61 0.28 0.62 0.71 0.69 0.66 0.19 0.81 0.82 0.79 0.85 0.84 0.96 1.0 0.95
Bra021649 (PSBW)
 0.79 0.71 0.77 0.77 0.63 0.53 0.62 0.72 0.77 0.61 0.68 0.6 0.43 0.46 0.34 0.5 0.46 0.23 0.48 0.5 0.51 0.58 0.13 0.61 0.62 0.59 0.6 0.82 1.0 0.84 0.62
Bra021909 (DEG11)
 0.71 0.35 0.53 0.23 0.32 0.17 0.59 0.51 0.85 0.4 0.54 0.38 0.28 0.3 0.25 0.19 0.33 0.16 0.21 0.44 0.48 0.36 0.09 0.64 0.63 0.64 0.64 0.78 0.93 1.0 0.66
Bra023176 (PSAF)
 0.88 0.84 0.87 0.84 0.54 0.61 0.7 0.75 0.9 0.79 0.84 0.84 0.52 0.52 0.47 0.62 0.64 0.33 0.67 0.68 0.69 0.63 0.14 0.85 0.84 0.83 0.83 0.91 1.0 0.97 0.74
Bra024261 (PSAN)
 0.84 0.72 0.72 0.87 0.46 0.51 0.72 0.77 0.93 0.76 0.9 0.82 0.62 0.39 0.35 0.65 0.68 0.32 0.66 0.65 0.7 0.68 0.13 0.83 0.81 0.77 0.79 0.84 1.0 0.97 0.74
Bra025297 (DEG13)
 0.71 0.55 0.63 0.81 0.34 0.24 0.56 0.62 0.61 0.5 0.4 0.47 0.23 0.19 0.15 0.23 0.31 0.16 0.41 0.38 0.38 0.39 0.05 0.69 0.7 0.71 0.63 1.0 0.98 0.68 0.43
Bra026745 (CP24)
 0.77 0.58 0.52 0.74 0.42 0.37 0.59 0.6 0.83 0.63 0.69 0.8 0.33 0.29 0.24 0.24 0.38 0.19 0.41 0.37 0.44 0.4 0.06 0.64 0.65 0.62 0.65 0.91 1.0 0.95 0.58
Bra027188 (PSAH-1)
 0.89 0.93 1.0 0.97 0.54 0.46 0.61 0.67 0.75 0.77 0.86 0.85 0.47 0.6 0.49 0.55 0.61 0.5 0.8 0.81 0.78 0.78 0.27 0.93 0.97 0.94 0.92 0.89 0.92 0.87 0.72
Bra028906 (LHCB4.1)
 0.73 0.67 0.73 0.74 0.36 0.3 0.46 0.47 0.65 0.52 0.58 0.65 0.35 0.19 0.16 0.3 0.36 0.21 0.45 0.34 0.37 0.39 0.06 0.63 0.66 0.69 0.7 0.73 0.86 1.0 0.68
Bra029563 (PSBQ)
 0.79 0.72 0.75 0.69 0.55 0.45 0.54 0.55 0.72 0.61 0.71 0.69 0.37 0.33 0.28 0.4 0.4 0.29 0.59 0.48 0.49 0.45 0.1 0.71 0.71 0.67 0.7 0.84 0.97 1.0 0.74
Bra029732 (LHCB4.2)
 0.94 0.94 0.96 0.89 0.61 0.62 0.57 0.58 0.97 0.68 0.79 0.74 0.39 0.53 0.43 0.48 0.53 0.3 0.7 0.54 0.58 0.56 0.07 0.66 0.65 0.65 0.62 0.83 1.0 0.87 0.61
Bra030181 (CAB3)
 0.75 0.61 0.73 0.63 0.43 0.37 0.59 0.57 1.0 0.64 0.75 0.68 0.34 0.39 0.33 0.32 0.4 0.28 0.5 0.53 0.54 0.49 0.1 0.7 0.69 0.7 0.75 0.74 0.87 0.94 0.61
Bra030182 (CAB3)
 0.46 0.41 0.52 0.53 0.15 0.14 0.38 0.33 0.55 0.46 0.55 0.5 0.25 0.12 0.09 0.23 0.3 0.12 0.31 0.31 0.36 0.38 0.05 0.47 0.49 0.52 0.52 0.52 0.57 1.0 0.59
Bra030660 (OE23)
 0.82 0.8 0.72 0.92 0.51 0.47 0.67 0.77 0.96 0.93 0.98 0.79 0.58 0.3 0.33 0.56 0.63 0.35 0.84 0.73 0.65 0.68 0.14 0.8 0.86 0.84 0.87 0.78 0.89 1.0 0.82
Bra030843 (PSAG)
 0.8 0.72 0.8 0.79 0.65 0.56 0.63 0.57 0.98 0.75 0.81 0.93 0.54 0.57 0.52 0.57 0.62 0.45 0.75 0.77 0.69 0.72 0.19 0.78 0.8 0.78 0.78 0.76 0.92 1.0 0.77
Bra031427 (LHCA3)
 0.76 0.6 0.56 0.63 0.56 0.52 0.56 0.51 0.87 0.65 0.72 0.75 0.38 0.4 0.37 0.37 0.43 0.29 0.56 0.54 0.55 0.53 0.1 0.65 0.65 0.62 0.66 0.81 1.0 0.88 0.64
Bra031813 (OEE1)
 0.84 0.85 0.83 0.74 0.5 0.54 0.81 0.87 0.78 0.78 0.84 0.88 0.58 0.45 0.38 0.6 0.64 0.41 0.71 0.73 0.7 0.66 0.14 0.86 0.9 0.9 0.94 0.87 0.87 1.0 0.95
Bra033802 (PTAC16)
 0.77 0.68 0.68 0.7 0.46 0.46 0.63 0.58 0.85 0.71 0.81 0.79 0.44 0.3 0.27 0.53 0.57 0.26 0.57 0.58 0.55 0.55 0.09 0.61 0.64 0.59 0.63 0.74 1.0 0.89 0.79
Bra034911 (PSAL)
 0.63 0.61 0.63 0.68 0.4 0.43 0.52 0.5 0.67 0.61 0.7 0.72 0.36 0.37 0.31 0.4 0.4 0.27 0.56 0.54 0.53 0.5 0.12 0.81 0.81 0.77 0.81 0.89 1.0 0.96 0.61
Bra036240 (PSAD1)
 0.74 0.66 0.72 0.77 0.54 0.52 0.55 0.55 0.91 0.68 0.8 0.78 0.42 0.46 0.38 0.41 0.47 0.35 0.67 0.58 0.61 0.64 0.1 0.71 0.71 0.69 0.73 0.85 1.0 0.87 0.6
Bra036948 (CH1)
 0.85 0.82 1.0 0.98 0.43 0.55 0.63 0.63 0.71 0.6 0.64 0.63 0.41 0.44 0.41 0.51 0.5 0.34 0.58 0.52 0.52 0.54 0.19 0.62 0.65 0.65 0.61 0.87 0.88 0.75 0.56
Bra037104 (PSAG)
 0.79 0.73 0.83 0.75 0.53 0.5 0.71 0.72 0.96 0.86 0.95 0.95 0.6 0.49 0.43 0.64 0.67 0.45 0.76 0.78 0.79 0.76 0.19 0.87 0.9 0.91 0.9 0.9 0.97 1.0 0.87
Bra037164 (OEE1)
 0.83 0.89 0.52 0.54 0.45 0.31 0.48 0.4 0.64 0.47 0.64 0.52 0.3 0.24 0.21 0.35 0.29 0.2 0.43 0.37 0.4 0.39 0.12 0.83 0.86 0.86 0.88 0.88 0.94 1.0 0.81
Bra037913 (LHCB5)
 0.84 0.76 0.75 0.86 0.55 0.64 0.81 0.77 0.87 0.76 0.87 0.86 0.52 0.57 0.5 0.64 0.63 0.33 0.73 0.69 0.7 0.69 0.16 0.85 0.87 0.84 0.86 1.0 1.0 0.91 0.73
Bra038011 (PSAG)
 0.86 0.71 0.88 0.84 0.45 0.44 0.54 0.59 0.82 0.7 0.77 0.73 0.63 0.37 0.28 0.52 0.62 0.3 0.55 0.6 0.66 0.61 0.11 0.77 0.82 0.93 0.84 0.85 1.0 0.98 0.76
Bra038863 (OEC33)
 0.75 0.71 0.71 0.66 0.46 0.41 0.49 0.49 0.8 0.63 0.71 0.69 0.42 0.35 0.28 0.5 0.5 0.26 0.59 0.55 0.55 0.57 0.1 0.65 0.69 0.63 0.67 0.69 1.0 0.93 0.75
Bra039070 (DEG13)
 0.98 0.9 0.88 0.92 0.63 0.69 0.82 0.79 0.87 0.67 0.83 0.77 0.56 0.78 0.52 0.62 0.64 0.37 0.77 0.64 0.7 0.59 0.25 0.87 0.87 0.86 0.76 1.0 1.0 0.83 0.61
Bra039676 (MPK18)
 0.85 0.57 0.51 0.7 0.38 0.43 0.5 0.83 0.55 0.49 0.69 0.67 0.39 0.29 0.4 0.28 0.39 0.32 0.39 0.44 0.52 0.6 0.5 0.79 0.89 0.97 0.96 0.9 0.83 1.0 0.74
Bra040482 (PSAP)
 0.86 0.7 0.73 0.77 0.5 0.46 0.65 0.69 0.83 0.74 0.82 0.93 0.41 0.29 0.25 0.48 0.51 0.23 0.53 0.57 0.56 0.62 0.05 0.65 0.67 0.6 0.71 0.67 0.85 1.0 0.75

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)