1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_149 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra001588 (ERF4)
 0.23 0.16 0.38 0.18 0.72 0.87 0.25 0.18 0.35 0.31 0.27 0.24 0.24 0.8 1.0 0.48 0.42 0.34 0.5 0.56 0.4 0.47 0.78 0.52 0.39 0.28 0.38 0.56 0.97 0.83 0.41
Bra002400 (CAF1b)
 0.12 0.17 0.81 0.2 0.22 0.1 0.05 0.08 0.1 0.08 0.12 0.13 0.16 0.18 0.16 0.16 0.08 0.15 0.17 0.22 0.13 0.09 0.4 0.12 0.05 0.23 0.1 0.14 1.0 0.9 0.18
Bra004165 (TCH2)
 0.08 0.09 0.24 0.17 0.43 0.28 0.19 0.15 0.25 0.24 0.25 0.22 0.25 0.56 0.35 0.27 0.23 0.29 0.22 0.34 0.18 0.25 1.0 0.31 0.31 0.71 0.2 0.41 0.66 0.67 0.4
0.25 0.31 0.56 0.43 0.39 0.32 0.14 0.19 0.35 0.28 0.25 0.22 0.36 0.54 0.79 0.29 0.25 1.0 0.31 0.33 0.36 0.25 0.66 0.37 0.27 0.54 0.33 0.39 0.84 0.89 0.51
0.66 0.77 0.9 0.67 0.64 0.48 0.34 0.31 0.33 0.45 0.4 0.44 0.36 0.29 0.41 0.44 0.45 0.55 0.44 0.53 0.42 0.5 0.67 0.37 0.46 0.8 0.47 0.49 0.52 1.0 0.57
0.08 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.24 0.0 0.01 0.04 0.0 0.05 0.23 0.32 0.02
0.14 0.15 0.98 0.08 0.02 0.22 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.02 0.19 0.15 0.11 0.79 0.08 0.22 0.8 1.0 0.16
Bra006696 (EXO70H7)
 0.72 0.62 0.91 0.73 0.85 0.61 0.35 0.34 0.37 0.32 0.47 0.33 0.28 0.37 0.44 0.19 0.32 0.38 0.3 0.36 0.37 0.22 0.43 0.37 0.44 1.0 0.38 0.68 0.9 0.82 0.17
Bra006925 (PUB22)
 0.12 0.19 0.61 0.22 0.08 0.21 0.05 0.04 0.03 0.04 0.09 0.06 0.01 0.01 0.02 0.03 0.06 0.02 0.06 0.1 0.09 0.05 0.15 0.16 0.19 0.56 0.19 0.22 0.75 1.0 0.18
Bra007202 (CCR3)
 0.23 0.54 0.63 0.41 0.46 0.43 0.26 0.2 0.4 0.43 0.38 0.44 0.38 0.71 0.46 0.4 0.37 0.37 0.31 0.4 0.37 0.38 0.9 0.35 0.38 1.0 0.43 0.42 0.63 0.92 0.36
Bra007205 (SZF1)
 0.23 0.3 0.48 0.25 0.25 0.25 0.06 0.04 0.08 0.09 0.08 0.08 0.06 0.26 0.2 0.15 0.1 0.16 0.08 0.13 0.09 0.14 1.0 0.11 0.09 0.79 0.09 0.18 0.43 0.74 0.09
Bra008101 (NUDT21)
 0.16 0.11 0.68 0.28 0.14 0.11 0.04 0.08 0.1 0.08 0.07 0.07 0.06 0.04 0.17 0.09 0.01 0.09 0.09 0.24 0.05 0.01 0.12 0.13 0.03 0.21 0.02 0.13 0.82 1.0 0.15
0.21 0.08 0.84 0.42 0.0 0.08 0.0 0.2 0.0 0.32 0.06 0.0 0.0 0.09 0.12 0.0 0.01 0.49 0.74 0.25 0.17 0.0 0.54 0.18 0.34 1.0 0.04 0.12 0.58 0.82 0.13
Bra009726 (AtFDA19)
 0.02 0.0 0.36 0.05 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.06 0.02 0.07 0.0 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.51 0.03 0.11 0.28 0.11 0.18 0.62 1.0 0.41
0.16 0.04 0.37 0.34 0.06 0.02 0.02 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.08 0.0 0.15 0.02 0.11 0.01 0.0 0.41 0.01 0.08 0.58 0.0 0.01 0.64 1.0 0.09
0.3 0.32 1.0 0.76 0.26 0.16 0.09 0.08 0.05 0.07 0.06 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.03 0.17 0.09 0.09 0.05 0.1 0.15 0.06 0.05 0.27 0.03 0.06 0.42 0.78 0.14
Bra010880 (ERF11)
 0.09 0.1 0.36 0.08 0.59 0.47 0.16 0.09 0.2 0.14 0.13 0.11 0.14 0.58 0.75 0.22 0.08 0.41 0.26 0.27 0.14 0.18 1.0 0.22 0.12 0.37 0.08 0.4 1.0 0.88 0.16
Bra012803 (PUB22)
 0.08 0.11 0.96 0.82 0.05 0.1 0.11 0.04 0.09 0.11 0.15 0.04 0.36 0.16 0.22 0.1 0.07 0.09 0.16 0.2 0.1 0.08 0.21 0.36 0.1 0.08 0.19 0.15 0.73 1.0 0.14
Bra012910 (MYB77)
 0.13 0.1 0.35 0.43 0.2 0.05 0.0 0.01 0.03 0.08 0.04 0.02 0.03 0.08 0.03 0.05 0.03 0.22 0.02 0.04 0.03 0.03 0.45 0.02 0.02 0.75 0.02 0.05 0.15 1.0 0.09
Bra012938 (ERF104)
 0.41 0.67 1.0 0.61 0.11 0.08 0.02 0.03 0.03 0.05 0.06 0.05 0.01 0.05 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.05 0.03 0.07 0.24 0.03 0.02 0.41 0.04 0.07 0.22 0.68 0.06
0.38 0.4 0.77 0.56 0.39 0.5 0.16 0.17 0.27 0.17 0.34 0.36 0.16 0.22 0.27 0.34 0.26 0.14 0.19 0.51 0.21 0.38 0.29 0.25 0.34 0.55 0.3 0.29 0.86 1.0 0.37
Bra016495 (PUP14)
 0.41 0.48 1.0 0.49 0.15 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.06 0.01 0.04 0.03 0.03 0.03 0.1 0.05 0.03 0.02 0.04 0.38 0.07 0.07 0.32 0.08 0.1 0.27 0.43 0.08
Bra016686 (BPC2)
 0.58 0.8 0.93 1.0 0.55 0.32 0.39 0.55 0.36 0.39 0.47 0.54 0.52 0.49 0.44 0.49 0.42 0.63 0.38 0.38 0.4 0.42 0.7 0.54 0.51 0.83 0.44 0.4 0.43 0.71 0.51
Bra016763 (DDF1)
 0.03 0.02 0.51 0.25 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.76 0.01 0.06 1.0 0.48 0.02
0.19 0.26 0.67 0.21 0.13 0.33 0.28 0.22 0.19 0.33 0.19 0.27 0.33 0.03 0.19 0.32 0.29 0.85 0.4 0.29 0.27 0.29 0.29 0.41 0.4 0.56 0.17 0.21 0.65 1.0 0.32
Bra018346 (AP2C1)
 0.06 0.09 0.32 0.1 0.08 0.12 0.05 0.05 0.04 0.09 0.07 0.06 0.23 0.04 0.1 0.1 0.11 0.14 0.06 0.08 0.05 0.12 1.0 0.09 0.09 0.23 0.1 0.09 0.57 0.86 0.18
Bra018553 (LecRK-IV.4)
 0.14 0.33 0.53 0.34 0.3 0.38 0.27 0.17 0.11 0.14 0.13 0.26 0.17 0.55 1.0 0.2 0.23 0.26 0.15 0.09 0.12 0.19 0.91 0.23 0.29 0.79 0.37 0.31 0.3 0.7 0.25
0.1 0.1 0.39 0.21 0.46 0.29 0.21 0.12 0.24 0.13 0.17 0.18 0.08 0.51 0.55 0.24 0.11 1.0 0.42 0.41 0.33 0.3 0.06 0.32 0.24 0.76 0.24 0.25 0.81 0.82 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.61 1.0 0.04
Bra019382 (BTL10)
 0.44 0.34 0.65 0.34 0.58 0.32 0.12 0.12 0.15 0.15 0.12 0.12 0.11 0.21 0.27 0.18 0.19 0.53 0.2 0.18 0.12 0.22 1.0 0.18 0.17 0.29 0.15 0.27 0.57 0.85 0.21
Bra019777 (DDF1)
 0.0 0.0 0.28 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.03 1.0 0.65 0.02
Bra020179 (CAF1b)
 0.22 0.31 0.6 0.2 0.19 0.13 0.11 0.14 0.21 0.24 0.2 0.25 0.11 0.31 0.43 0.21 0.17 0.41 0.23 0.24 0.19 0.22 0.96 0.16 0.15 0.31 0.19 0.19 0.73 1.0 0.31
Bra021965 (CYP707A3)
 0.2 0.18 0.5 0.25 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.04 0.04 0.01 0.01 0.0 0.02 0.1 0.01 0.02 1.0 0.01 0.02 0.27 0.95 0.01
Bra022437 (CPL5)
 0.06 0.03 0.48 0.16 0.08 0.08 0.05 0.02 0.04 0.06 0.03 0.04 0.04 0.03 0.09 0.08 0.02 0.04 0.07 0.12 0.04 0.06 1.0 0.15 0.11 0.2 0.1 0.1 0.76 0.85 0.21
Bra022772 (AP2C1)
 0.19 0.17 0.47 0.25 0.19 0.14 0.07 0.08 0.06 0.07 0.07 0.09 0.13 0.11 0.15 0.1 0.09 0.23 0.1 0.09 0.07 0.09 1.0 0.11 0.09 0.48 0.09 0.1 0.49 0.91 0.15
Bra022981 (JAZ7)
 0.03 0.06 0.33 0.22 0.41 0.28 0.0 0.08 0.11 0.09 0.09 0.03 0.07 0.0 0.57 0.2 0.13 0.58 0.0 0.0 0.0 0.03 0.46 0.34 0.06 1.0 0.0 0.09 0.99 0.48 0.27
0.52 0.56 0.69 0.54 0.58 0.62 0.36 0.38 0.58 0.45 0.44 0.48 0.21 0.54 0.66 0.38 0.31 0.43 0.44 0.4 0.41 0.46 0.71 0.58 0.53 0.7 0.63 0.68 0.89 1.0 0.69
0.12 0.25 0.38 0.23 0.43 0.22 0.09 0.12 0.26 0.24 0.22 0.3 0.13 0.4 0.55 0.31 0.14 0.28 0.21 0.19 0.12 0.25 0.4 0.37 0.34 0.42 0.38 0.26 0.87 1.0 0.36
Bra025917 (NUDT4)
 0.38 0.58 1.0 0.75 0.08 0.07 0.08 0.15 0.05 0.06 0.08 0.08 0.14 0.04 0.02 0.09 0.05 0.04 0.03 0.08 0.06 0.11 0.24 0.03 0.05 0.42 0.06 0.1 0.48 0.74 0.12
0.18 0.34 0.53 0.65 0.39 0.49 0.14 0.19 0.21 0.26 0.28 0.23 0.27 0.84 0.61 0.5 0.58 0.79 0.26 0.6 0.45 0.24 0.89 0.25 0.45 1.0 0.46 0.4 0.59 0.77 0.68
Bra026770 (SHN1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 1.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0
Bra026963 (DDF1)
 0.03 0.07 0.23 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.13 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.76 0.28 0.0
0.12 0.14 0.65 0.45 0.5 0.51 0.33 0.13 0.3 0.38 0.33 0.21 0.1 0.25 0.32 0.44 0.19 0.23 0.5 0.52 0.47 0.38 0.43 0.44 0.31 0.4 0.33 0.46 1.0 0.71 0.21
Bra027602 (CYP707A3)
 0.27 0.29 1.0 0.59 0.02 0.05 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.03 0.04 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.18 0.0 0.02 0.7 0.01 0.0 0.07 0.39 0.01
Bra028290 (CBF4)
 0.01 0.01 0.38 0.26 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.34 0.0 0.01 0.48 1.0 0.0
0.03 0.03 0.27 0.62 0.03 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.06 0.18 0.0 0.01 0.11 0.07 0.15 0.06 0.03 0.02 0.05 0.3 0.01 0.0 1.0 0.0 0.02 0.4 0.42 0.04
0.29 0.47 0.44 0.5 0.6 0.54 0.4 0.26 0.32 0.26 0.26 0.57 0.26 0.4 0.23 0.3 0.27 0.16 0.21 0.29 0.27 0.26 0.41 0.51 0.53 0.66 0.45 0.51 0.73 1.0 0.39
Bra029258 (MYB96)
 0.55 0.46 1.0 0.5 0.74 0.64 0.23 0.28 0.39 0.33 0.39 0.34 0.24 0.38 0.28 0.34 0.33 0.37 0.35 0.37 0.23 0.34 0.54 0.38 0.46 0.97 0.38 0.32 0.66 0.91 0.5
0.16 0.4 1.0 0.83 0.15 0.66 0.08 0.14 0.15 0.18 0.07 0.16 0.0 0.14 0.26 0.16 0.16 0.03 0.34 0.16 0.19 0.32 0.02 0.28 0.26 0.3 0.26 0.05 0.56 0.36 0.31
Bra030957 (ERF8)
 0.44 0.23 0.55 0.26 0.48 0.26 0.09 0.13 0.26 0.08 0.1 0.2 0.12 0.52 1.0 0.23 0.13 0.25 0.19 0.16 0.17 0.14 0.74 0.27 0.19 0.57 0.24 0.24 0.68 0.63 0.15
Bra031048 (B1L)
 0.24 0.24 0.59 0.37 0.51 0.31 0.15 0.23 0.19 0.17 0.15 0.25 0.18 0.58 0.46 0.22 0.17 0.74 0.37 0.16 0.26 0.15 0.64 0.28 0.23 0.58 0.23 0.43 1.0 0.94 0.28
Bra033324 (DTA1)
 0.18 0.42 1.0 0.64 0.1 0.13 0.02 0.01 0.18 0.05 0.05 0.12 0.07 0.05 0.02 0.04 0.05 0.05 0.08 0.13 0.01 0.02 0.54 0.08 0.04 0.66 0.06 0.03 0.78 0.74 0.03
Bra033430 (PUB22)
 0.12 0.13 1.0 0.21 0.16 0.33 0.03 0.03 0.17 0.21 0.23 0.17 0.01 0.11 0.17 0.01 0.13 0.05 0.09 0.18 0.09 0.32 0.06 0.06 0.04 0.03 0.01 0.12 0.5 0.3 0.13
Bra034216 (CTL18)
 0.22 0.46 1.0 0.63 0.22 0.55 0.1 0.15 0.1 0.22 0.13 0.08 0.02 0.0 0.21 0.16 0.02 0.1 0.19 0.2 0.08 0.38 0.03 0.11 0.22 0.08 0.32 0.1 0.35 0.31 0.17
Bra035002 (CAF1a)
 0.33 0.34 0.67 0.35 0.32 0.21 0.04 0.03 0.07 0.07 0.08 0.08 0.02 0.17 0.14 0.09 0.05 0.07 0.08 0.13 0.07 0.13 0.39 0.08 0.07 0.73 0.06 0.2 0.55 1.0 0.11
Bra035236 (ACS6)
 0.34 0.35 0.59 0.39 0.54 0.51 0.34 0.44 0.54 0.4 0.4 0.46 0.26 0.51 0.37 0.29 0.3 0.25 0.48 0.38 0.41 0.42 0.27 0.37 0.35 0.73 0.34 0.47 0.71 1.0 0.35
Bra035732 (ERF105)
 0.51 0.47 1.0 0.38 0.16 0.11 0.01 0.01 0.03 0.04 0.04 0.03 0.01 0.09 0.08 0.06 0.02 0.08 0.04 0.13 0.04 0.09 0.11 0.06 0.03 0.62 0.04 0.05 0.24 0.77 0.09
0.3 0.36 1.0 0.66 0.14 0.03 0.06 0.07 0.03 0.11 0.06 0.05 0.07 0.07 0.02 0.1 0.05 0.14 0.08 0.09 0.01 0.06 0.75 0.16 0.06 0.79 0.07 0.1 0.29 0.55 0.08
Bra039058 (GolS8)
 0.23 0.3 0.81 0.28 0.17 0.07 0.01 0.05 0.03 0.09 0.04 0.08 0.1 0.09 0.03 0.09 0.07 0.16 0.05 0.07 0.04 0.09 0.92 0.05 0.03 0.36 0.06 0.09 0.46 1.0 0.07
Bra040158 (ERF6)
 0.26 0.39 0.2 0.32 0.49 0.32 0.11 0.09 0.17 0.22 0.25 0.24 0.16 0.24 0.23 0.2 0.15 0.16 0.2 0.2 0.16 0.29 0.43 0.43 0.3 0.63 0.28 0.28 0.75 1.0 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)