1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_130 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.54 0.52 0.5 0.56 0.31 0.38 0.82 1.0 0.34 0.49 0.45 0.43 0.74 0.45 0.51 0.61 0.67 0.45 0.43 0.54 0.53 0.5 0.35 0.44 0.45 0.5 0.5 0.44 0.37 0.42 0.55
0.4 0.56 0.57 0.57 0.19 0.36 0.6 0.98 0.19 0.35 0.35 0.36 0.88 0.32 0.44 0.53 0.54 0.4 0.21 0.38 0.44 0.38 1.0 0.47 0.49 0.52 0.45 0.58 0.28 0.28 0.65
Bra001934 (HSP60)
 0.18 0.71 0.18 0.14 0.17 0.26 0.39 0.59 0.09 0.16 0.13 0.12 0.45 0.28 0.39 0.41 0.46 0.31 0.17 0.2 0.23 0.19 1.0 0.18 0.17 0.16 0.18 0.11 0.09 0.11 0.3
Bra003253 (DPBF3)
 0.39 0.4 0.68 0.48 0.26 0.28 0.79 1.0 0.22 0.45 0.48 0.3 0.88 0.26 0.24 0.64 0.67 0.61 0.27 0.43 0.46 0.43 0.54 0.65 0.7 0.64 0.71 0.63 0.49 0.57 0.93
0.55 0.61 0.65 0.81 0.43 0.51 0.74 1.0 0.4 0.56 0.49 0.47 0.92 0.5 0.59 0.89 0.83 0.81 0.65 0.61 0.79 0.59 0.95 0.6 0.64 0.67 0.68 0.51 0.36 0.45 0.8
Bra003472 (emb1703)
 0.34 0.38 0.28 0.15 0.38 0.33 0.34 0.46 0.21 0.25 0.28 0.22 0.37 0.28 0.51 0.36 0.37 0.45 0.42 0.32 0.35 0.3 0.76 0.36 0.29 0.36 0.39 0.34 0.31 0.44 1.0
Bra004173 (pde194)
 0.83 0.8 0.75 0.87 0.49 0.59 0.77 0.89 0.42 0.5 0.59 0.53 1.0 0.41 0.62 0.82 0.8 0.67 0.38 0.6 0.61 0.55 0.49 0.56 0.55 0.63 0.52 0.52 0.37 0.4 0.72
Bra004365 (FLN2)
 0.43 0.48 0.36 0.58 0.29 0.5 0.62 1.0 0.14 0.3 0.27 0.25 0.86 0.37 0.6 0.55 0.59 0.61 0.28 0.42 0.56 0.34 0.92 0.36 0.35 0.35 0.38 0.29 0.14 0.19 0.89
0.51 0.66 0.51 0.43 0.47 0.49 0.76 1.0 0.33 0.42 0.32 0.37 0.81 0.58 0.7 0.67 0.78 0.64 0.39 0.51 0.55 0.42 0.8 0.4 0.37 0.35 0.46 0.37 0.36 0.36 0.65
Bra004937 (FRD4)
 0.62 0.68 0.76 0.77 0.61 0.54 0.74 0.75 0.34 0.46 0.48 0.55 0.86 0.29 0.39 0.61 0.71 0.55 0.35 0.41 0.56 0.44 0.58 0.56 0.6 0.57 0.61 0.57 0.39 0.48 1.0
0.79 0.79 0.78 0.78 0.56 0.49 0.55 1.0 0.37 0.41 0.39 0.62 0.99 0.43 0.49 0.6 0.78 0.69 0.46 0.39 0.57 0.39 0.91 0.36 0.42 0.38 0.46 0.31 0.33 0.41 0.48
Bra005495 (MORF6)
 0.41 0.67 0.25 0.59 0.25 0.37 0.54 0.7 0.18 0.38 0.32 0.29 0.67 0.35 0.46 0.6 0.75 0.45 0.28 0.48 0.58 0.44 1.0 0.42 0.42 0.4 0.47 0.23 0.14 0.21 0.88
Bra005877 (ZRF1b)
 0.43 0.41 0.46 0.27 0.38 0.39 0.38 0.79 0.16 0.2 0.18 0.22 0.63 0.47 0.55 0.55 0.46 0.74 0.31 0.32 0.33 0.32 1.0 0.13 0.12 0.11 0.16 0.09 0.1 0.15 0.19
Bra006736 (LTP3)
 0.28 0.23 0.22 0.43 0.16 0.08 0.42 1.0 0.22 0.41 0.26 0.29 0.45 0.08 0.08 0.46 0.65 0.19 0.07 0.12 0.15 0.31 0.04 0.19 0.16 0.28 0.24 0.1 0.06 0.22 0.23
Bra006878 (G4)
 0.61 0.59 0.64 0.77 0.55 0.64 0.81 1.0 0.48 0.58 0.6 0.59 0.9 0.41 0.49 0.74 0.76 0.58 0.5 0.59 0.61 0.54 0.9 0.64 0.64 0.63 0.66 0.78 0.5 0.54 0.86
Bra007159 (OVA1)
 0.5 0.59 0.55 0.69 0.56 0.62 0.64 0.99 0.32 0.46 0.42 0.41 0.92 0.55 0.58 0.67 0.69 0.53 0.41 0.52 0.55 0.5 1.0 0.61 0.58 0.63 0.64 0.82 0.41 0.38 0.65
Bra007310 (PrfB3)
 0.38 0.41 0.23 0.32 0.32 0.3 0.77 1.0 0.17 0.27 0.28 0.21 0.72 0.28 0.33 0.43 0.54 0.35 0.29 0.39 0.38 0.32 0.69 0.37 0.38 0.33 0.44 0.23 0.23 0.3 0.7
Bra009355 (PDE340)
 0.53 0.6 0.65 0.77 0.36 0.45 0.6 0.8 0.21 0.31 0.32 0.35 0.68 0.38 0.45 0.53 0.57 0.36 0.3 0.46 0.58 0.37 1.0 0.6 0.65 0.69 0.62 0.88 0.31 0.26 0.7
Bra009454 (BTR1)
 0.64 0.84 0.9 0.81 0.43 0.42 0.71 1.0 0.38 0.47 0.46 0.45 0.91 0.5 0.48 0.65 0.69 0.58 0.42 0.56 0.58 0.49 0.77 0.53 0.56 0.61 0.59 0.49 0.48 0.5 0.62
Bra009900 (RH3)
 0.63 0.56 0.51 0.61 0.56 0.58 0.75 1.0 0.31 0.49 0.43 0.46 0.83 0.52 0.51 0.66 0.7 0.64 0.42 0.56 0.56 0.51 0.58 0.46 0.52 0.5 0.58 0.53 0.42 0.42 0.89
Bra011218 (eIFiso4G2)
 0.57 0.52 0.56 0.9 0.59 0.68 0.56 0.92 0.48 0.42 0.42 0.49 0.8 0.41 0.64 0.9 0.75 0.67 0.22 0.36 0.62 0.4 1.0 0.29 0.34 0.19 0.35 0.19 0.24 0.22 0.36
Bra011543 (THY-2)
 0.53 0.59 0.61 0.55 0.57 0.68 0.76 1.0 0.37 0.52 0.38 0.39 0.98 0.48 0.63 0.78 0.85 0.6 0.39 0.52 0.59 0.46 0.91 0.51 0.62 0.64 0.63 0.48 0.42 0.46 0.72
Bra011558 (DOV1)
 0.3 0.18 0.18 0.27 0.19 0.25 0.54 1.0 0.15 0.19 0.18 0.2 0.47 0.15 0.16 0.35 0.36 0.15 0.19 0.34 0.39 0.3 0.55 0.23 0.23 0.17 0.27 0.26 0.15 0.24 0.24
Bra013467 (EMB3131)
 0.07 0.15 0.11 0.04 0.17 0.12 0.4 0.47 0.03 0.07 0.05 0.12 0.13 0.08 0.31 0.16 0.11 0.3 0.15 0.16 0.13 0.08 1.0 0.43 0.37 0.17 0.47 0.21 0.27 0.41 0.83
0.51 0.82 0.53 0.74 0.4 0.42 0.77 0.82 0.33 0.47 0.39 0.42 1.0 0.37 0.51 0.76 0.74 0.67 0.34 0.62 0.55 0.38 0.66 0.4 0.45 0.46 0.47 0.4 0.3 0.37 0.94
0.45 0.55 0.21 0.34 0.4 0.45 0.55 0.86 0.15 0.23 0.16 0.15 0.51 0.27 0.58 0.73 0.54 0.54 0.2 0.34 0.4 0.26 1.0 0.26 0.22 0.15 0.2 0.19 0.13 0.12 0.44
Bra015752 (OEP2)
 0.5 0.62 0.74 0.68 0.45 0.31 0.59 0.9 0.34 0.49 0.41 0.36 1.0 0.36 0.38 0.53 0.52 0.36 0.29 0.31 0.37 0.33 0.65 0.48 0.49 0.49 0.44 0.52 0.37 0.39 0.62
Bra015889 (PTAC2)
 0.63 0.68 0.69 0.68 0.66 0.82 0.79 1.0 0.37 0.47 0.45 0.47 0.84 0.59 0.7 0.76 0.75 0.63 0.48 0.58 0.63 0.56 0.74 0.64 0.74 0.53 0.71 0.67 0.59 0.55 0.9
0.53 0.63 0.67 0.47 0.63 0.55 0.59 0.88 0.26 0.37 0.35 0.35 0.79 0.64 0.64 0.66 0.66 0.63 0.38 0.38 0.43 0.35 1.0 0.29 0.38 0.35 0.36 0.32 0.28 0.4 0.65
Bra017675 (RBF1)
 0.22 0.16 0.25 0.35 0.26 0.32 0.85 1.0 0.31 0.31 0.39 0.35 0.72 0.26 0.17 0.35 0.43 0.31 0.18 0.48 0.36 0.31 0.45 0.27 0.24 0.25 0.32 0.3 0.22 0.21 0.35
Bra017976 (HP30)
 0.79 0.97 0.95 0.88 0.74 0.72 0.76 0.88 0.44 0.6 0.57 0.58 0.88 0.58 0.66 0.66 0.69 0.73 0.47 0.54 0.58 0.58 1.0 0.65 0.68 0.65 0.67 0.81 0.53 0.58 0.71
Bra018264 (FIONA)
 0.65 0.69 0.75 0.84 0.64 0.57 0.78 0.93 0.36 0.62 0.45 0.54 1.0 0.54 0.44 0.66 0.68 0.54 0.46 0.59 0.58 0.52 0.9 0.65 0.59 0.65 0.65 0.65 0.48 0.55 0.82
Bra018737 (TOC64-III)
 0.43 0.47 0.37 0.45 0.17 0.15 0.47 1.0 0.16 0.24 0.29 0.24 0.7 0.16 0.16 0.46 0.43 0.35 0.23 0.24 0.33 0.32 0.63 0.31 0.33 0.4 0.38 0.26 0.14 0.24 0.6
0.23 0.21 0.32 0.36 0.4 0.43 0.74 1.0 0.11 0.2 0.21 0.16 0.78 0.3 0.27 0.41 0.47 0.35 0.31 0.26 0.28 0.42 0.51 0.42 0.43 0.45 0.44 0.38 0.34 0.3 0.76
Bra018977 (PPR19)
 0.4 0.72 0.42 0.15 0.51 0.3 0.39 0.75 0.19 0.26 0.21 0.16 0.51 0.34 0.46 0.4 0.45 0.49 0.21 0.31 0.35 0.27 1.0 0.27 0.29 0.13 0.33 0.17 0.15 0.36 0.76
0.29 0.29 0.34 0.35 0.33 0.34 0.53 1.0 0.18 0.19 0.23 0.2 0.62 0.36 0.34 0.45 0.52 0.49 0.25 0.3 0.32 0.29 0.6 0.42 0.47 0.32 0.5 0.32 0.3 0.35 0.65
Bra021550 (CREF3)
 0.55 0.46 0.47 0.36 0.38 0.49 0.68 1.0 0.22 0.31 0.33 0.38 0.79 0.47 0.42 0.51 0.64 0.78 0.32 0.44 0.4 0.33 0.86 0.44 0.47 0.5 0.51 0.47 0.39 0.51 0.87
Bra022593 (HCF106)
 0.53 0.57 0.47 0.74 0.32 0.37 0.65 1.0 0.29 0.47 0.43 0.5 0.68 0.26 0.29 0.58 0.53 0.34 0.34 0.53 0.49 0.44 0.23 0.48 0.5 0.53 0.59 0.35 0.33 0.52 0.82
Bra022597 (OVA6)
 0.62 0.7 0.75 0.85 0.75 0.83 0.78 0.89 0.49 0.75 0.63 0.65 0.87 0.6 0.65 0.83 0.91 0.64 0.54 0.76 0.75 0.75 0.76 0.74 0.79 0.81 0.83 0.81 0.67 0.69 1.0
Bra023283 (HO2)
 0.47 0.32 0.32 0.54 0.55 0.61 0.8 1.0 0.43 0.5 0.49 0.4 0.89 0.49 0.51 0.68 0.68 0.51 0.52 0.7 0.7 0.62 0.87 0.87 0.87 0.56 0.79 0.7 0.63 0.62 0.93
Bra024046 (PDE327)
 0.25 0.27 0.29 0.34 0.32 0.32 0.65 0.99 0.17 0.28 0.23 0.28 0.9 0.27 0.25 0.53 0.56 0.4 0.27 0.35 0.36 0.33 0.4 0.44 0.49 0.42 0.57 0.38 0.3 0.38 1.0
0.73 0.65 0.41 0.78 0.29 0.15 0.47 1.0 0.08 0.32 0.12 0.17 0.61 0.15 0.04 0.39 0.62 0.39 0.2 0.11 0.24 0.18 0.16 0.14 0.24 0.76 0.21 0.17 0.16 0.38 0.3
0.42 0.59 0.3 0.3 0.45 0.45 0.64 0.82 0.28 0.45 0.35 0.31 0.68 0.59 0.83 0.72 0.76 0.65 0.49 0.54 0.51 0.46 1.0 0.31 0.33 0.28 0.33 0.31 0.26 0.25 0.52
Bra027986 (RP1)
 0.32 0.75 0.69 1.0 0.35 0.33 0.45 0.85 0.07 0.11 0.11 0.11 0.71 0.24 0.35 0.44 0.33 0.29 0.12 0.26 0.25 0.16 0.87 0.13 0.18 0.15 0.17 0.15 0.1 0.1 0.29
Bra028448 (PDM3)
 0.72 0.79 1.0 0.91 0.52 0.55 0.58 1.0 0.24 0.5 0.4 0.42 0.97 0.52 0.54 0.76 0.79 0.58 0.4 0.52 0.55 0.48 0.65 0.45 0.43 0.75 0.46 0.38 0.37 0.45 0.85
Bra028466 (GPDHp)
 0.38 0.51 0.67 0.42 0.59 0.55 0.67 0.94 0.34 0.4 0.37 0.26 1.0 0.56 0.48 0.63 0.59 0.61 0.4 0.42 0.47 0.44 0.82 0.49 0.57 0.57 0.62 0.46 0.48 0.48 0.66
Bra030196 (EngB-1)
 0.32 0.56 0.3 0.42 0.28 0.33 0.77 0.96 0.11 0.31 0.25 0.24 0.67 0.23 0.41 0.73 0.79 0.5 0.39 0.52 0.51 0.42 1.0 0.53 0.49 0.39 0.5 0.31 0.2 0.26 0.78
Bra031272 (TRM2a)
 0.67 0.64 0.68 0.73 0.77 0.78 0.85 1.0 0.44 0.66 0.59 0.6 0.87 0.68 0.72 0.72 0.73 0.68 0.53 0.64 0.69 0.55 0.82 0.55 0.58 0.52 0.6 0.63 0.6 0.71 0.92
0.71 0.77 0.91 0.66 0.68 0.48 0.62 0.7 0.42 0.55 0.4 0.49 0.88 0.52 0.58 0.6 0.69 0.54 0.55 0.41 0.47 0.41 1.0 0.45 0.52 0.45 0.48 0.57 0.4 0.44 0.48
Bra035077 (mTERF16)
 0.32 0.47 0.21 0.19 0.38 0.45 0.51 0.74 0.12 0.15 0.17 0.08 0.45 0.36 0.64 0.31 0.36 0.58 0.22 0.28 0.33 0.28 0.98 0.43 0.37 0.24 0.46 0.29 0.32 0.37 1.0
Bra036228 (BSM)
 0.94 1.0 0.8 0.88 0.75 0.87 1.0 0.94 0.5 0.62 0.62 0.59 0.95 0.64 0.75 0.8 0.96 0.69 0.66 0.77 0.72 0.67 0.81 0.72 0.7 0.7 0.73 0.73 0.54 0.53 0.99
Bra036261 (PPI2)
 0.69 0.83 0.87 0.77 0.54 0.55 0.82 1.0 0.39 0.55 0.47 0.52 0.86 0.49 0.5 0.77 0.76 0.61 0.53 0.57 0.57 0.52 0.82 0.56 0.64 0.62 0.69 0.54 0.47 0.63 0.88
0.43 0.5 0.6 0.59 0.43 0.61 0.64 0.99 0.39 0.49 0.45 0.44 0.66 0.62 0.52 0.64 0.77 0.51 0.43 0.52 0.6 0.56 0.64 0.56 0.63 0.61 0.69 0.44 0.58 0.55 1.0
Bra036582 (RH3)
 0.43 0.7 0.5 0.43 0.28 0.35 0.8 1.0 0.16 0.28 0.25 0.31 0.9 0.27 0.38 0.6 0.63 0.57 0.3 0.35 0.47 0.33 0.63 0.33 0.41 0.41 0.45 0.32 0.22 0.34 0.72
Bra037168 (ERA1)
 0.51 0.48 0.63 0.76 0.6 0.67 0.82 1.0 0.45 0.58 0.62 0.59 0.9 0.58 0.55 0.72 0.79 0.76 0.6 0.63 0.69 0.68 0.82 0.71 0.71 0.66 0.76 0.7 0.56 0.62 0.99
Bra037217 (JANUS)
 0.27 0.59 0.25 0.28 0.31 0.35 0.41 0.51 0.33 0.36 0.35 0.35 0.69 0.55 0.67 0.59 0.51 0.43 0.41 0.35 0.39 0.33 1.0 0.42 0.36 0.35 0.42 0.3 0.31 0.28 0.51
Bra037225 (SBA3)
 0.42 0.65 0.38 0.3 0.36 0.43 0.58 0.91 0.21 0.3 0.26 0.34 0.74 0.41 0.58 0.62 0.65 0.5 0.46 0.39 0.47 0.42 1.0 0.32 0.37 0.24 0.39 0.29 0.24 0.34 0.73
Bra037390 (WTF1)
 0.56 0.71 0.46 0.44 0.53 0.59 0.72 0.93 0.27 0.37 0.35 0.37 0.79 0.39 0.68 0.63 0.72 0.77 0.52 0.53 0.53 0.44 0.89 0.36 0.44 0.36 0.4 0.38 0.31 0.39 1.0
0.42 0.53 0.58 0.6 0.37 0.38 0.63 0.71 0.28 0.52 0.45 0.46 1.0 0.49 0.55 0.67 0.81 0.73 0.45 0.55 0.7 0.49 0.95 0.43 0.5 0.45 0.52 0.43 0.28 0.36 0.65
0.06 0.09 0.05 0.27 0.04 0.16 0.32 1.0 0.08 0.15 0.16 0.15 0.57 0.14 0.21 0.37 0.28 0.17 0.06 0.14 0.22 0.25 0.25 0.02 0.05 0.05 0.06 0.03 0.02 0.02 0.08
Bra039175 (FtsHi3)
 0.58 0.61 0.58 0.65 0.64 0.65 0.78 1.0 0.34 0.45 0.49 0.45 0.85 0.5 0.48 0.58 0.72 0.42 0.44 0.71 0.57 0.57 0.42 0.64 0.66 0.54 0.66 0.55 0.5 0.51 0.95
0.39 0.41 0.39 0.31 0.38 0.32 0.61 1.0 0.21 0.32 0.3 0.33 0.51 0.24 0.3 0.54 0.59 0.44 0.35 0.46 0.46 0.41 0.3 0.33 0.38 0.3 0.41 0.35 0.29 0.44 0.66
0.66 0.69 0.69 0.7 0.75 0.78 0.86 0.97 0.43 0.62 0.59 0.58 1.0 0.61 0.69 0.73 0.84 0.94 0.69 0.65 0.69 0.67 0.83 0.78 0.79 0.74 0.83 0.65 0.6 0.63 0.88
0.42 0.41 0.42 0.42 0.23 0.26 0.7 1.0 0.21 0.37 0.28 0.35 0.75 0.27 0.25 0.64 0.83 0.59 0.43 0.49 0.46 0.43 0.69 0.56 0.67 0.53 0.66 0.35 0.31 0.51 0.84
Bra040576 (SVR7)
 0.68 1.0 0.78 0.63 0.59 0.56 0.58 0.77 0.12 0.27 0.19 0.2 0.67 0.2 0.21 0.38 0.44 0.36 0.2 0.25 0.33 0.26 0.56 0.34 0.34 0.34 0.37 0.3 0.21 0.27 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)