1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_130 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
28.31 27.29 26.54 29.6 16.49 20.0 42.96 52.69 18.13 25.98 23.85 22.65 38.8 23.93 26.62 32.07 35.28 23.46 22.91 28.43 27.91 26.18 18.58 22.93 23.91 26.32 26.5 23.19 19.53 21.98 28.82
32.21 44.7 45.53 45.32 15.26 28.63 47.94 77.59 15.45 28.17 27.7 28.31 70.33 25.85 34.89 42.36 42.96 31.74 16.73 30.09 34.76 30.6 79.54 37.24 38.96 41.26 35.69 46.12 22.59 22.35 51.69
Bra001934 (HSP60)
 13.98 55.86 13.73 11.18 13.22 20.45 30.75 46.47 6.92 12.4 10.01 9.3 35.4 22.04 30.75 31.86 36.35 24.05 13.56 15.72 18.02 14.95 78.18 13.89 13.39 12.49 13.85 8.6 7.23 8.61 23.17
Bra003253 (DPBF3)
 2.65 2.71 4.69 3.3 1.8 1.89 5.45 6.85 1.5 3.11 3.28 2.02 6.06 1.75 1.63 4.39 4.56 4.19 1.88 2.94 3.15 2.92 3.72 4.46 4.81 4.4 4.88 4.32 3.38 3.93 6.39
34.78 38.12 40.81 51.16 27.11 32.29 46.45 62.88 24.95 35.01 30.98 29.36 57.68 31.29 36.81 55.69 52.46 50.93 40.83 38.6 49.78 37.11 59.65 37.5 40.12 42.27 42.92 32.34 22.67 28.05 50.5
Bra003472 (emb1703)
 2.25 2.55 1.86 1.0 2.54 2.2 2.27 3.03 1.39 1.67 1.84 1.48 2.45 1.87 3.4 2.39 2.45 3.0 2.77 2.13 2.32 2.0 5.01 2.42 1.95 2.41 2.6 2.22 2.06 2.9 6.63
Bra004173 (pde194)
 8.73 8.4 7.96 9.14 5.22 6.27 8.17 9.4 4.48 5.29 6.22 5.61 10.56 4.28 6.59 8.66 8.4 7.03 4.03 6.38 6.42 5.8 5.19 5.96 5.8 6.65 5.51 5.52 3.9 4.22 7.64
Bra004365 (FLN2)
 8.46 9.52 7.06 11.32 5.72 9.84 12.18 19.64 2.67 5.86 5.28 5.0 16.9 7.27 11.74 10.82 11.49 11.89 5.59 8.25 10.98 6.76 18.07 7.03 6.8 6.82 7.52 5.71 2.82 3.8 17.54
9.36 12.05 9.26 7.74 8.52 8.89 13.79 18.18 5.93 7.68 5.89 6.68 14.76 10.61 12.66 12.2 14.12 11.72 7.16 9.32 9.95 7.7 14.45 7.23 6.71 6.39 8.28 6.7 6.47 6.47 11.88
Bra004937 (FRD4)
 22.67 24.91 27.76 27.86 22.31 19.82 26.8 27.28 12.24 16.72 17.43 19.94 31.3 10.73 14.36 22.33 25.82 19.89 12.71 14.81 20.51 16.06 21.21 20.46 21.69 20.57 22.1 20.9 14.31 17.36 36.4
23.87 23.95 23.6 23.66 16.93 14.76 16.61 30.27 11.32 12.53 11.94 18.68 30.04 13.06 14.78 18.01 23.53 20.81 13.92 11.83 17.37 11.85 27.6 10.97 12.72 11.63 13.98 9.45 10.03 12.43 14.54
Bra005495 (MORF6)
 27.26 44.47 16.41 39.2 16.42 24.36 35.37 46.3 11.62 24.93 21.14 19.34 44.51 22.82 30.57 39.51 49.29 29.92 18.52 31.43 38.04 29.19 66.01 27.4 28.03 26.63 31.34 14.88 9.09 13.77 58.17
Bra005877 (ZRF1b)
 3.92 3.81 4.21 2.47 3.48 3.62 3.49 7.25 1.47 1.88 1.66 2.03 5.79 4.32 5.01 5.02 4.19 6.75 2.81 2.9 3.0 2.9 9.18 1.22 1.12 1.01 1.47 0.83 0.94 1.34 1.71
Bra006736 (LTP3)
 49.38 39.25 37.64 75.45 27.94 14.44 73.1 173.75 37.39 70.91 45.66 51.11 78.47 14.12 13.84 79.42 112.33 32.61 11.47 20.5 26.3 54.35 7.34 33.09 27.73 48.34 40.92 17.31 10.09 38.82 40.59
Bra006878 (G4)
 21.04 20.55 22.39 26.74 18.99 22.29 28.05 34.78 16.72 20.08 20.87 20.55 31.29 14.34 16.96 25.71 26.32 20.3 17.49 20.55 21.09 18.78 31.15 22.23 22.27 21.93 22.85 27.22 17.42 18.76 29.77
Bra007159 (OVA1)
 8.46 9.88 9.17 11.68 9.42 10.5 10.81 16.61 5.44 7.65 7.13 6.89 15.48 9.22 9.71 11.29 11.6 8.99 6.9 8.81 9.21 8.36 16.81 10.22 9.78 10.58 10.68 13.71 6.81 6.33 10.84
Bra007310 (PrfB3)
 3.79 4.05 2.28 3.17 3.17 2.93 7.66 9.9 1.65 2.69 2.74 2.06 7.11 2.77 3.25 4.3 5.37 3.51 2.87 3.82 3.8 3.15 6.8 3.68 3.73 3.27 4.36 2.25 2.26 3.02 6.91
Bra009355 (PDE340)
 16.9 18.88 20.5 24.21 11.36 14.21 18.92 25.35 6.67 9.84 9.96 11.16 21.36 12.1 14.18 16.9 18.03 11.37 9.51 14.49 18.21 11.68 31.6 18.84 20.52 21.71 19.58 27.79 9.83 8.31 22.15
Bra009454 (BTR1)
 21.24 27.95 29.89 27.02 14.27 14.06 23.68 33.2 12.55 15.45 15.35 14.85 30.21 16.61 15.87 21.72 22.85 19.21 14.1 18.63 19.36 16.23 25.62 17.59 18.53 20.36 19.69 16.11 15.8 16.47 20.55
Bra009900 (RH3)
 83.89 74.26 68.06 80.43 73.79 76.98 99.41 132.38 41.35 64.45 56.31 61.24 110.32 69.22 66.96 87.2 92.8 84.76 55.67 73.91 73.67 68.12 76.44 60.46 68.18 65.73 76.47 69.55 55.23 55.85 117.5
Bra011218 (eIFiso4G2)
 4.2 3.87 4.12 6.67 4.37 5.04 4.12 6.82 3.55 3.12 3.12 3.59 5.93 3.07 4.75 6.64 5.58 4.93 1.66 2.68 4.56 2.97 7.41 2.18 2.5 1.4 2.6 1.44 1.8 1.62 2.69
Bra011543 (THY-2)
 4.98 5.6 5.81 5.24 5.36 6.41 7.22 9.48 3.48 4.93 3.64 3.74 9.26 4.54 5.99 7.43 8.09 5.72 3.73 4.98 5.58 4.39 8.67 4.86 5.86 6.07 5.94 4.6 3.97 4.36 6.83
Bra011558 (DOV1)
 15.41 9.07 9.52 14.14 9.64 13.11 28.04 51.56 7.5 9.84 9.35 10.13 24.47 7.59 8.46 18.29 18.54 7.79 9.65 17.77 20.2 15.34 28.32 11.94 12.11 8.61 14.06 13.22 7.59 12.18 12.42
Bra013467 (EMB3131)
 0.13 0.29 0.22 0.08 0.32 0.23 0.76 0.9 0.06 0.13 0.09 0.22 0.25 0.15 0.59 0.3 0.22 0.57 0.28 0.31 0.25 0.16 1.89 0.82 0.71 0.32 0.88 0.4 0.52 0.78 1.57
4.48 7.15 4.6 6.42 3.49 3.61 6.74 7.14 2.84 4.13 3.4 3.69 8.7 3.2 4.43 6.58 6.45 5.83 2.96 5.42 4.82 3.27 5.75 3.49 3.91 3.96 4.07 3.51 2.62 3.21 8.16
4.95 5.97 2.3 3.69 4.4 4.91 6.0 9.4 1.61 2.55 1.73 1.66 5.61 2.97 6.27 7.96 5.9 5.87 2.14 3.75 4.35 2.85 10.9 2.78 2.44 1.65 2.22 2.04 1.42 1.35 4.79
Bra015752 (OEP2)
 22.52 27.8 33.29 30.42 20.0 13.97 26.62 40.34 15.46 21.9 18.55 15.95 44.85 15.98 16.92 23.75 23.44 16.35 12.88 13.98 16.51 14.58 29.19 21.4 21.94 22.0 19.67 23.35 16.71 17.46 27.78
Bra015889 (PTAC2)
 10.49 11.3 11.55 11.29 11.04 13.63 13.17 16.7 6.15 7.87 7.48 7.78 14.03 9.93 11.63 12.73 12.5 10.47 8.03 9.63 10.47 9.35 12.28 10.74 12.4 8.92 11.84 11.13 9.91 9.11 14.99
2.48 2.93 3.15 2.21 2.93 2.57 2.73 4.12 1.22 1.71 1.64 1.63 3.69 2.97 3.01 3.09 3.1 2.93 1.76 1.75 1.99 1.63 4.67 1.37 1.78 1.64 1.66 1.49 1.3 1.87 3.04
Bra017675 (RBF1)
 9.6 7.14 10.75 15.17 11.38 14.2 37.12 43.88 13.75 13.72 17.32 15.26 31.78 11.21 7.29 15.37 18.73 13.76 8.02 21.11 15.73 13.62 19.85 11.65 10.56 11.12 14.05 13.0 9.58 9.08 15.53
Bra017976 (HP30)
 64.3 79.25 77.19 71.73 60.2 59.11 62.48 71.48 35.67 48.78 46.92 47.43 72.18 47.33 53.92 54.28 56.15 59.46 38.15 44.37 47.49 47.1 81.67 52.96 55.38 53.13 54.85 66.21 43.27 47.0 57.84
Bra018264 (FIONA)
 10.08 10.59 11.56 12.95 9.9 8.79 11.96 14.43 5.5 9.55 6.96 8.29 15.43 8.3 6.83 10.26 10.49 8.27 7.14 9.05 8.89 8.0 13.92 10.09 9.06 10.01 10.09 10.05 7.4 8.54 12.66
Bra018737 (TOC64-III)
 2.98 3.27 2.6 3.15 1.15 1.04 3.27 6.99 1.15 1.71 2.01 1.71 4.87 1.15 1.15 3.21 3.04 2.45 1.63 1.64 2.29 2.23 4.42 2.14 2.3 2.76 2.69 1.83 0.98 1.71 4.19
4.44 4.09 6.3 7.09 7.79 8.41 14.5 19.59 2.2 3.98 4.08 3.17 15.29 5.88 5.34 8.02 9.27 6.87 5.99 5.15 5.57 8.14 9.97 8.19 8.44 8.83 8.65 7.35 6.62 5.9 14.95
Bra018977 (PPR19)
 0.41 0.74 0.43 0.16 0.53 0.31 0.4 0.77 0.19 0.26 0.21 0.16 0.52 0.35 0.47 0.41 0.46 0.5 0.22 0.32 0.36 0.28 1.02 0.28 0.3 0.13 0.34 0.17 0.15 0.37 0.78
3.65 3.73 4.3 4.42 4.21 4.27 6.74 12.66 2.33 2.42 2.87 2.55 7.85 4.5 4.33 5.65 6.53 6.14 3.23 3.8 4.0 3.65 7.64 5.32 5.92 4.11 6.37 4.07 3.76 4.48 8.24
Bra021550 (CREF3)
 1.95 1.61 1.66 1.28 1.33 1.72 2.41 3.53 0.79 1.09 1.16 1.35 2.79 1.67 1.49 1.78 2.25 2.75 1.12 1.54 1.41 1.16 3.05 1.54 1.66 1.77 1.79 1.67 1.38 1.79 3.08
Bra022593 (HCF106)
 67.15 71.91 59.28 94.07 40.5 46.2 82.21 126.47 37.24 58.9 54.01 62.94 86.41 32.53 36.57 73.16 66.49 43.2 43.3 66.79 62.28 56.07 28.74 60.62 63.12 66.68 74.92 44.54 41.86 65.94 103.56
Bra022597 (OVA6)
 27.38 30.51 33.07 37.24 32.74 36.23 34.12 39.14 21.47 32.9 27.53 28.46 38.27 26.16 28.67 36.55 40.06 28.23 23.7 33.19 33.1 33.05 33.41 32.46 34.8 35.52 36.53 35.64 29.19 30.17 43.85
Bra023283 (HO2)
 11.46 7.7 7.84 13.02 13.36 14.7 19.42 24.27 10.36 12.19 11.98 9.74 21.65 11.85 12.38 16.59 16.56 12.44 12.74 16.97 16.93 15.07 21.15 21.14 21.14 13.58 19.28 16.92 15.27 15.03 22.64
Bra024046 (PDE327)
 4.08 4.35 4.69 5.54 5.2 5.19 10.71 16.21 2.76 4.59 3.82 4.54 14.75 4.48 4.14 8.7 9.13 6.54 4.43 5.67 5.94 5.41 6.47 7.21 8.04 6.79 9.38 6.29 4.87 6.29 16.36
3.26 2.88 1.84 3.48 1.3 0.65 2.11 4.44 0.36 1.44 0.53 0.75 2.72 0.67 0.17 1.73 2.74 1.73 0.91 0.5 1.04 0.8 0.7 0.61 1.08 3.4 0.93 0.77 0.7 1.69 1.34
3.81 5.45 2.76 2.72 4.13 4.13 5.9 7.55 2.52 4.09 3.18 2.89 6.23 5.41 7.59 6.57 6.95 5.98 4.53 4.99 4.68 4.19 9.17 2.82 3.05 2.57 3.05 2.84 2.35 2.28 4.77
Bra027986 (RP1)
 5.5 13.04 12.07 17.45 6.17 5.8 7.85 14.82 1.17 1.84 1.83 1.83 12.47 4.24 6.17 7.65 5.68 5.1 2.1 4.62 4.31 2.71 15.25 2.22 3.22 2.63 2.98 2.59 1.66 1.77 5.14
Bra028448 (PDM3)
 5.92 6.46 8.15 7.45 4.21 4.45 4.75 8.16 1.98 4.08 3.28 3.46 7.89 4.28 4.43 6.16 6.42 4.77 3.3 4.25 4.53 3.89 5.33 3.65 3.54 6.16 3.74 3.12 3.01 3.7 6.94
Bra028466 (GPDHp)
 2.95 3.93 5.14 3.25 4.52 4.27 5.17 7.22 2.65 3.1 2.89 2.04 7.7 4.29 3.72 4.83 4.52 4.68 3.05 3.25 3.64 3.35 6.29 3.8 4.38 4.38 4.81 3.51 3.69 3.73 5.06
Bra030196 (EngB-1)
 4.96 8.54 4.55 6.48 4.32 5.04 11.82 14.64 1.75 4.77 3.83 3.68 10.29 3.56 6.25 11.08 12.07 7.7 5.93 7.88 7.84 6.4 15.26 8.14 7.43 5.9 7.63 4.72 3.03 4.03 11.87
Bra031272 (TRM2a)
 5.62 5.42 5.74 6.18 6.47 6.58 7.13 8.42 3.71 5.54 5.01 5.08 7.34 5.76 6.05 6.05 6.14 5.75 4.46 5.35 5.82 4.67 6.88 4.6 4.88 4.39 5.08 5.3 5.07 5.96 7.78
17.62 19.13 22.84 16.4 16.99 11.97 15.43 17.48 10.62 13.74 10.1 12.16 22.01 12.98 14.57 14.87 17.11 13.57 13.8 10.34 11.82 10.15 24.98 11.15 13.06 11.13 11.98 14.12 9.97 10.9 12.1
Bra035077 (mTERF16)
 0.61 0.89 0.4 0.36 0.72 0.85 0.97 1.39 0.22 0.28 0.32 0.15 0.86 0.67 1.2 0.59 0.69 1.1 0.41 0.54 0.62 0.53 1.86 0.82 0.7 0.46 0.88 0.56 0.6 0.71 1.9
Bra036228 (BSM)
 15.28 16.32 12.99 14.43 12.28 14.17 16.33 15.32 8.09 10.05 10.18 9.64 15.56 10.51 12.31 13.0 15.64 11.26 10.74 12.52 11.75 10.96 13.19 11.77 11.4 11.37 11.94 11.86 8.87 8.59 16.19
Bra036261 (PPI2)
 43.48 52.67 55.43 49.06 33.96 34.9 52.29 63.4 24.92 34.85 29.72 33.18 54.82 31.12 31.72 48.66 47.93 38.54 33.39 36.4 36.03 32.94 51.97 35.48 40.78 39.4 43.89 34.09 29.85 40.04 56.03
23.14 26.86 31.91 31.29 22.76 32.37 34.35 52.65 20.58 26.13 24.17 23.64 35.3 32.91 27.91 34.08 40.99 27.23 22.92 27.57 32.21 29.87 34.27 29.98 33.39 32.4 36.88 23.3 31.1 29.02 53.25
Bra036582 (RH3)
 6.29 10.21 7.27 6.21 4.12 5.07 11.64 14.5 2.35 4.05 3.55 4.51 13.04 3.86 5.49 8.69 9.12 8.26 4.28 5.07 6.81 4.74 9.1 4.85 5.97 6.01 6.57 4.68 3.18 4.86 10.45
Bra037168 (ERA1)
 27.66 26.16 34.1 41.57 32.49 36.51 44.47 54.52 24.59 31.44 33.87 31.98 49.28 31.42 30.02 39.34 43.24 41.21 32.45 34.51 37.5 37.25 44.71 38.89 38.65 35.73 41.19 38.2 30.78 33.61 54.02
Bra037217 (JANUS)
 6.75 14.58 6.17 6.98 7.71 8.69 10.09 12.58 8.15 8.91 8.78 8.74 17.19 13.67 16.68 14.63 12.74 10.67 10.13 8.65 9.58 8.08 24.81 10.37 9.02 8.63 10.3 7.4 7.73 6.86 12.64
Bra037225 (SBA3)
 2.53 3.95 2.32 1.83 2.17 2.57 3.53 5.47 1.3 1.81 1.59 2.08 4.5 2.45 3.52 3.72 3.95 3.0 2.8 2.36 2.86 2.52 6.04 1.95 2.23 1.43 2.39 1.74 1.46 2.08 4.41
Bra037390 (WTF1)
 7.79 9.95 6.43 6.11 7.37 8.25 10.13 12.97 3.76 5.23 4.87 5.2 11.04 5.47 9.47 8.86 10.12 10.78 7.26 7.38 7.39 6.21 12.38 5.06 6.12 5.04 5.54 5.29 4.37 5.45 13.99
17.04 21.72 23.76 24.24 15.12 15.24 25.44 28.94 11.43 20.98 18.38 18.84 40.64 19.77 22.34 27.12 32.81 29.55 18.14 22.19 28.28 19.94 38.46 17.33 20.13 18.4 21.17 17.65 11.24 14.8 26.53
0.6 0.99 0.55 2.9 0.38 1.77 3.45 10.72 0.83 1.61 1.67 1.58 6.08 1.45 2.21 4.02 3.02 1.81 0.63 1.47 2.4 2.66 2.71 0.17 0.52 0.51 0.62 0.32 0.24 0.26 0.8
Bra039175 (FtsHi3)
 20.94 21.91 20.97 23.54 22.9 23.46 28.21 35.96 12.16 16.3 17.62 16.16 30.63 18.14 17.23 20.71 25.72 15.11 15.66 25.36 20.49 20.38 15.14 23.0 23.68 19.32 23.8 19.86 18.08 18.51 34.21
8.69 9.21 8.82 6.94 8.64 7.27 13.74 22.52 4.78 7.15 6.72 7.46 11.54 5.39 6.66 12.26 13.35 9.93 7.86 10.39 10.45 9.18 6.69 7.32 8.46 6.86 9.32 7.9 6.47 9.95 14.97
8.46 8.89 8.87 9.02 9.65 10.01 11.09 12.51 5.54 8.01 7.57 7.49 12.88 7.91 8.9 9.37 10.88 12.06 8.87 8.42 8.83 8.69 10.66 10.01 10.14 9.52 10.69 8.41 7.78 8.07 11.36
5.39 5.26 5.38 5.39 3.0 3.32 8.96 12.79 2.72 4.69 3.64 4.52 9.62 3.45 3.14 8.15 10.61 7.6 5.53 6.29 5.83 5.48 8.81 7.13 8.54 6.83 8.48 4.49 3.99 6.48 10.75
Bra040576 (SVR7)
 12.26 18.01 14.02 11.26 10.65 10.05 10.54 13.8 2.21 4.85 3.48 3.62 12.12 3.66 3.7 6.85 7.87 6.53 3.61 4.53 6.02 4.77 10.09 6.11 6.08 6.04 6.74 5.47 3.72 4.88 9.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)