Heatmap: Cluster_86 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.05 -0.03 -1.2 -1.43 -0.12 -0.28 -0.72 -1.41 -1.26 -1.17 -1.11 -0.99 0.16 1.8 -0.11 -0.34 -0.16 3.1 -0.98 -0.45 -1.02 -0.66 -0.01 -1.2 -1.33 -0.72 -1.65 -1.29 -0.99 -0.27
0.34 0.07 -0.16 -4.0 0.41 -0.06 -1.02 -0.5 -1.55 -1.26 -1.18 -0.88 -0.23 1.7 -0.47 -0.4 -0.82 2.88 -0.71 -0.56 -1.87 -0.38 0.06 -0.17 -1.42 -0.77 -1.43 -0.48 -0.52 -0.02
0.13 0.13 -0.27 -0.53 0.02 0.1 -0.15 -0.69 -0.16 0.04 -0.19 -0.12 -0.41 0.95 -0.09 -0.3 -0.22 1.58 -0.27 -0.43 -0.18 -0.31 0.15 -0.09 -0.26 -0.25 -0.17 0.14 0.11 -0.61
-0.08 -0.11 -0.63 -0.71 -0.03 0.03 -0.08 -0.6 -0.41 -0.28 -0.57 -0.4 -0.57 0.64 -0.12 -0.06 -0.26 2.53 -0.49 -0.61 -0.38 -0.39 -0.03 -0.07 -0.35 -0.38 -0.44 -0.18 -0.22 -0.61
-1.71 -1.39 -1.18 -0.22 -0.41 -0.44 -1.08 -0.3 -0.57 -0.55 -0.38 -0.71 -0.99 0.77 -0.52 -0.28 -0.16 3.27 -0.52 -0.93 -0.34 -0.91 -0.14 -0.45 -0.45 -0.19 -0.21 -0.9 -1.04 -0.93
-0.31 -0.15 -0.65 -1.08 0.18 0.02 -0.1 -0.31 -0.66 -0.37 -0.55 -0.49 -0.37 0.86 -0.23 -0.25 -0.36 2.45 -0.4 -0.47 -0.33 -0.25 0.33 -0.13 -0.35 -0.26 -0.28 -0.08 -0.36 -0.94
0.27 -0.1 -0.55 -0.51 0.36 -0.23 -0.47 -0.23 -0.04 0.11 -0.31 -0.23 -0.2 1.11 -0.33 -0.47 -0.73 2.16 -0.59 -0.77 -0.67 -0.45 -0.48 -0.23 -0.6 -0.4 -0.54 0.35 0.36 -0.76
-0.21 0.84 -0.65 -2.58 -0.26 -0.22 -1.34 -1.6 -1.88 -1.08 -2.68 -1.69 -1.25 2.03 -1.09 -1.94 -0.66 3.28 -0.5 -0.55 -0.81 -0.46 0.02 -0.97 -1.37 -0.52 -1.34 -1.62 -1.03 -0.24
-0.06 -0.18 -0.8 -1.01 0.01 -0.05 -0.31 -0.66 -0.41 -0.59 -0.38 -0.07 -0.74 1.63 -0.24 -0.22 -0.2 2.41 -0.32 -0.3 -0.4 -0.25 -0.76 -0.31 -0.4 -0.38 -0.24 -0.5 -0.48 -0.82
-0.24 -0.19 -0.39 -0.65 -0.17 -0.27 -0.49 -0.55 -0.3 -0.24 -0.51 -0.4 -0.5 0.93 -0.21 -0.39 -0.22 2.68 -0.63 -0.45 -0.07 -0.27 -0.73 -0.15 -0.72 -0.42 -0.67 -0.16 -0.25 -0.37
Spov3_chr1.04419 (AtNPC1 - 1)
-0.17 0.06 0.03 -0.38 0.79 -0.94 -1.33 -1.11 -0.2 0.19 -0.84 -0.86 -1.12 -0.22 -1.13 -1.22 -1.18 3.17 -0.91 -1.03 -0.8 -0.89 -0.23 -0.61 -0.93 -0.76 -0.66 0.08 0.32 -0.46
0.36 0.59 -0.41 -0.56 -0.19 0.53 -0.51 -0.97 -0.82 -0.85 -0.68 -0.85 -0.37 1.29 0.13 -0.46 -0.5 2.41 -0.2 -0.2 -0.42 -0.27 -0.46 -0.85 -1.3 -0.79 -0.77 0.14 -0.3 -0.28
-1.8 -0.28 -1.27 -1.83 1.38 -1.12 -1.24 -5.12 -1.14 -1.91 -2.1 -2.0 -2.61 0.99 -1.66 -5.03 -2.94 4.01 -2.26 -1.88 -1.78 -2.64 0.08 -2.79 -3.72 -1.19 -1.28 -0.48 -0.39 -2.16
-0.53 -0.44 -0.48 -0.69 -0.64 -0.23 0.06 0.12 -0.68 -0.56 -0.39 -0.08 0.19 0.73 -0.61 -0.28 -0.71 2.3 -0.06 -0.34 -0.5 -0.31 -0.04 -0.02 -0.59 -0.31 -0.38 -0.23 0.16 0.44
-1.08 -0.9 -1.02 -0.9 0.45 -0.38 -0.68 -0.18 -1.36 -0.92 -1.33 -0.74 -0.66 2.07 -0.57 -0.7 -0.69 3.27 -1.29 -1.29 -1.14 -0.91 -0.91 -1.33 -1.38 -1.43 -1.31 -0.33 -0.97 -0.33
-0.28 -0.12 -0.61 -0.7 0.1 0.05 -0.32 -0.05 -0.45 -0.36 -0.5 -0.38 -0.72 0.86 -0.43 -0.39 -0.33 2.83 -0.5 -0.76 -0.71 -0.96 -0.57 -0.45 -0.87 -0.56 -0.73 -0.42 -0.07 -0.1
-0.18 -0.7 -1.19 -1.56 -1.91 -1.14 -0.96 -1.55 -1.65 -1.75 -1.76 -1.44 0.13 1.85 0.25 -0.71 -1.34 3.08 -1.41 -2.05 -2.7 -1.09 1.3 -1.01 -1.48 -1.74 -1.72 -0.55 -0.1 1.44
0.7 0.52 0.09 -0.15 0.1 -0.8 -0.71 -0.55 -0.56 -0.08 -0.61 -0.52 -0.93 0.3 -0.59 -0.37 -0.49 2.45 -0.57 -0.69 -0.26 -0.43 -0.62 -0.47 -0.33 -0.5 -0.47 0.18 0.18 -0.06
0.17 0.06 -0.09 -0.43 0.2 -0.43 -0.57 -0.28 -0.34 -0.06 -0.45 -0.34 -0.37 0.59 -0.18 -0.39 -0.36 2.15 -0.44 -0.53 -0.37 -0.43 -0.24 -0.2 -0.26 -0.16 -0.21 0.1 0.14 -0.1
0.34 0.35 -0.44 -0.73 0.04 0.16 -0.21 -0.53 -0.65 -0.44 -0.5 -0.28 -0.39 0.86 0.1 -0.05 -0.13 2.07 -0.74 -0.66 -0.43 -0.38 -0.01 -0.05 -0.35 -0.35 -0.42 -0.03 -0.04 -0.31
0.03 -0.06 -0.15 -0.37 0.09 -0.26 -0.28 -0.17 -0.28 0.05 -0.3 -0.19 -0.36 -0.03 -0.48 -0.23 -0.55 2.24 -0.36 -0.41 -0.19 -0.3 -0.18 -0.3 -0.25 -0.36 -0.1 0.01 0.09 -0.14
-0.06 0.16 -0.67 -0.64 0.01 0.08 -0.39 -0.16 -0.47 -0.57 -0.62 -0.51 -0.57 0.81 -0.46 -0.29 -0.3 2.8 -0.89 -0.74 -0.41 -0.99 -0.49 -0.3 -0.74 -0.35 -0.42 -0.38 -0.27 -0.31
0.18 0.12 -0.15 -0.73 0.12 0.17 -0.31 -0.2 -0.22 -0.06 -0.21 -0.21 -0.03 0.79 0.15 0.16 0.03 1.43 -0.3 -0.24 -0.13 -0.16 -0.54 -0.58 -0.29 -0.19 -0.18 -0.1 -0.18 -0.06
-0.11 -0.13 -0.28 -0.46 0.16 -0.1 -0.17 -0.22 -0.4 -0.21 -0.46 -0.51 -0.39 0.29 -0.3 -0.3 -0.29 2.35 -0.43 -0.45 -0.33 -0.23 -0.08 -0.22 -0.4 -0.28 -0.36 0.02 -0.01 -0.12
0.1 0.52 -0.44 -0.56 0.19 -0.37 -1.26 -0.75 -0.19 0.03 -0.56 -0.45 -0.46 0.86 -0.58 -0.26 -0.01 2.55 -0.51 -0.48 -0.72 -0.59 -0.22 -0.52 -0.66 -0.64 -0.45 -0.32 -0.12 -0.02
Spov3_chr3.04487 (SULTR4;1)
-0.25 -0.9 -0.85 -0.03 -2.74 -0.18 -1.09 -1.19 -1.66 -1.27 -2.01 -2.0 -1.66 1.43 -0.21 -0.55 -1.27 3.64 -1.06 -1.6 -2.04 -0.88 -0.46 -1.82 -2.69 -2.11 -2.33 -2.12 0.02 1.06
-0.83 -0.66 -0.94 -0.27 -1.23 -0.54 -0.83 -1.34 -1.01 -0.87 -1.1 -1.1 -0.9 2.19 -0.01 -0.21 -0.57 3.17 -1.05 -1.28 -0.72 -1.37 0.52 -1.8 -2.13 -1.21 -1.6 -1.63 -1.13 0.47
0.16 -0.03 -0.1 -0.1 0.2 -0.24 -0.25 -0.31 -0.11 -0.07 -0.06 -0.26 0.04 0.62 -0.08 -0.03 0.05 1.34 -0.25 -0.31 -0.17 -0.24 -0.33 -0.22 -0.1 -0.12 -0.09 0.03 -0.15 -0.13
-0.16 -0.27 -0.42 -0.32 0.01 -0.13 -0.23 -0.1 -0.35 -0.23 -0.36 -0.29 -0.33 0.44 -0.15 -0.01 -0.15 2.24 -0.33 -0.27 -0.06 -0.12 -0.19 -0.23 -0.26 -0.18 -0.15 -0.4 -0.44 -0.35
-0.51 -0.09 -0.84 -0.76 -0.42 -0.14 -0.59 -0.55 -0.97 -0.43 -0.73 -0.55 -0.54 1.67 0.03 0.01 -0.13 2.79 -0.78 -0.73 -0.85 -1.03 -0.62 0.07 -1.15 -0.35 -0.6 -1.04 -0.69 -0.01
-0.17 -0.17 -1.05 -1.16 -0.75 -0.46 -0.93 -1.05 -0.98 -1.03 -1.28 -0.47 -0.89 1.73 -0.35 -0.09 0.17 2.99 -0.99 -0.97 -0.35 -0.36 -0.46 -0.11 -0.36 -0.4 -0.39 -1.76 -0.75 -0.42
Spov3_chr4.01663 (AtTIM21L-2)
0.33 0.43 0.02 -0.39 -0.03 -0.6 -0.54 -0.48 -0.63 -0.14 -0.21 -0.38 -0.1 0.7 -0.22 -0.36 -0.29 1.98 -0.7 -0.61 -0.55 -0.25 -0.1 -0.08 -0.44 -0.29 -0.48 0.36 0.24 0.0
-0.17 0.1 -0.45 -0.74 0.22 0.12 -0.13 -0.16 -0.28 -0.14 -0.53 -0.3 -0.45 1.1 -0.13 -0.02 -0.11 2.17 -0.38 -0.62 -0.34 -0.52 -0.86 -0.18 -0.52 -0.37 -0.58 -0.45 -0.08 0.05
-0.31 -0.16 -0.31 -0.4 0.24 0.05 -0.3 -0.12 -0.74 -0.49 -0.41 -0.77 0.14 1.08 0.23 0.02 0.15 1.85 -0.17 -0.17 -0.13 -0.27 0.31 -0.62 -0.73 -0.28 -0.54 -0.65 -0.49 0.17
-0.13 -0.06 -0.21 -0.11 -0.18 0.08 -0.17 -0.1 -0.12 -0.16 -0.22 -0.07 -0.41 0.51 0.11 -0.06 0.02 1.74 -0.06 -0.36 -0.18 -0.2 -0.64 -0.2 -0.28 -0.1 -0.1 -0.2 -0.13 -0.15
-0.25 -0.12 -0.54 -0.6 -0.3 0.07 0.01 -0.02 -0.65 -0.27 -0.37 -0.43 0.04 0.79 0.1 0.14 0.01 2.23 -0.64 -0.61 -0.56 -0.42 0.1 -0.17 -0.42 -0.31 -0.51 -0.21 -0.29 -0.34
-0.18 -0.15 -0.51 -0.58 0.23 -0.19 -0.48 -0.62 -0.2 0.19 -0.35 -0.5 -0.73 0.58 -0.27 -0.53 -0.43 2.66 -0.08 -0.78 -0.18 -0.46 0.05 -0.81 -0.38 -0.06 -0.52 -0.13 -0.56 -1.06
0.63 -0.09 -1.31 -1.58 -0.92 -0.33 -0.86 -1.92 -1.64 -1.0 -1.06 -0.98 -0.04 2.03 -0.65 -0.9 -0.92 3.08 -0.94 -1.48 -1.16 -1.13 0.43 -0.68 -0.81 -0.85 -0.9 -0.03 -0.77 -0.67
-0.01 0.09 -0.38 -0.46 -0.14 -0.17 -0.29 -0.28 -0.41 -0.11 -0.4 -0.26 -0.49 0.55 -0.01 -0.12 -0.12 2.23 -0.68 -0.8 -0.46 -0.34 0.37 -0.14 -0.32 -0.35 -0.26 -0.04 -0.07 -0.38
0.22 0.23 -0.3 -0.55 0.28 -0.41 -0.36 -0.45 -0.54 -0.32 -0.55 -0.47 -0.44 0.42 -0.23 -0.25 -0.49 2.37 -0.36 -0.58 -0.31 -0.52 -0.09 -0.14 -0.26 -0.05 -0.38 0.08 -0.2 -0.25
0.21 0.31 -0.26 -0.38 0.29 -0.26 -0.52 -0.49 -0.21 0.02 -0.35 -0.33 -0.7 0.8 -0.35 -0.28 -0.49 2.17 -0.46 -0.53 -0.42 -0.41 -0.43 -0.26 -0.42 -0.25 -0.27 0.09 0.14 -0.26
-0.18 -0.25 -0.5 -0.3 0.13 -0.45 -0.8 -0.41 -0.83 -0.05 -0.45 -0.63 -1.05 0.56 -0.71 -0.62 -0.43 2.99 -0.97 -1.04 -0.33 -0.82 -0.2 -0.55 -0.8 -0.49 -0.43 -0.12 -0.05 -0.09
Spov3_chr5.00801 (NRT1.12)
-0.8 -0.17 -0.46 -1.09 0.98 -0.27 -0.97 -0.24 -0.24 -0.24 -1.1 -0.7 -0.9 0.57 -0.76 -0.53 -0.85 2.96 -0.78 -1.0 -0.9 -1.05 -0.33 -0.58 -1.34 -0.97 -1.07 0.34 0.63 -0.01
-0.16 -0.36 -0.88 -1.23 0.73 -1.05 -0.93 -0.22 -0.9 -0.42 -0.72 -1.09 -0.01 1.48 -0.33 -0.7 -0.77 2.91 -0.92 -1.21 -0.63 -0.48 0.11 -0.73 -0.55 -0.72 -0.38 -0.16 -0.36 -1.19
0.11 0.25 -0.23 -0.23 0.08 -0.08 -0.33 -0.31 -0.2 -0.3 -0.24 -0.14 -0.02 0.65 0.2 0.01 0.02 1.51 -0.08 -0.41 -0.13 -0.21 -0.46 -0.15 -0.24 -0.22 -0.02 -0.28 -0.21 -0.15
-0.01 -0.09 -0.67 -1.18 -0.11 -0.31 0.1 -0.47 -0.33 -0.29 -0.3 -0.17 -0.33 1.09 -0.32 -0.63 -0.76 2.33 -0.12 -0.32 -0.55 -0.3 0.24 0.04 -0.32 -0.5 -0.54 0.14 0.05 -1.39
0.09 -0.26 -0.61 -0.59 0.28 -0.21 -0.76 -0.76 -0.87 -0.57 -0.46 -0.39 -0.04 1.52 0.01 -0.35 -0.27 2.23 -0.57 -0.83 -0.77 -0.61 0.34 -0.38 -0.61 -0.78 -0.54 -0.18 -0.06 0.48
-0.16 -0.27 -0.42 -0.32 0.01 -0.13 -0.23 -0.1 -0.35 -0.23 -0.36 -0.29 -0.33 0.44 -0.15 -0.01 -0.15 2.24 -0.33 -0.27 -0.06 -0.12 -0.19 -0.23 -0.26 -0.18 -0.15 -0.4 -0.44 -0.35
-0.55 0.67 -1.54 -2.7 -0.6 -0.12 -2.15 -2.65 -4.37 -0.46 -2.68 - -1.77 1.67 -1.31 -1.72 -1.68 3.54 -0.27 0.13 -0.18 -1.15 1.49 -1.62 -3.45 -0.73 -1.71 -2.5 -1.7 -1.57
0.15 0.17 -0.14 -0.17 0.17 -0.17 -0.4 -0.32 -0.4 -0.17 -0.38 -0.42 -0.32 0.52 -0.17 -0.22 -0.24 2.03 -0.53 -0.51 -0.35 -0.33 0.25 -0.26 -0.39 -0.31 -0.26 0.08 -0.08 -0.13
0.27 0.26 -0.38 -0.72 0.06 -0.42 -0.65 -0.6 -0.25 -0.2 -0.62 -0.4 -0.05 1.13 -0.27 -0.08 -0.47 2.19 -0.71 -0.53 -0.69 -0.33 -0.35 -0.43 -0.49 -0.33 -0.74 0.17 0.35 0.08
0.21 0.06 -0.41 0.05 -0.07 -0.17 -0.51 -0.13 -0.69 -0.43 -0.7 -0.39 -0.05 0.62 -0.06 -0.14 -0.13 2.41 -0.51 -0.59 -0.91 -0.63 -0.29 -0.47 -0.53 -0.53 -0.82 -0.25 0.11 0.31
-0.73 -0.11 -0.48 -2.02 -0.54 -0.39 -2.91 -2.79 -0.86 -1.31 -1.18 -0.69 -0.81 1.53 -0.88 -1.29 -0.71 3.74 -2.21 -2.79 -1.29 -1.01 0.27 -2.1 -1.18 -1.5 -1.0 -0.56 -1.04 -2.18
-0.46 0.09 -1.29 -2.39 0.03 0.49 -0.86 -2.08 -1.8 -0.18 -0.95 -1.23 -0.54 1.63 -0.5 -0.17 -0.98 2.94 -0.19 -0.84 -0.4 -0.36 0.2 -0.36 -1.42 -0.24 -0.28 -0.56 -1.53 -0.41
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-0.37 -0.24 -0.77 -1.73 0.24 0.18 -0.06 -0.88 -0.49 -0.09 -0.44 -0.05 -0.52 1.31 0.17 0.03 -0.06 2.1 -0.43 -0.6 -0.21 -0.35 -0.97 -0.15 -0.15 -0.08 -0.18 -0.06 -0.19 -0.47
0.07 0.1 -0.29 -0.35 -0.01 -0.08 -0.3 -0.38 -0.27 -0.22 -0.21 -0.37 -0.32 0.94 0.07 -0.09 -0.05 1.81 -0.38 -0.47 -0.25 -0.37 0.07 -0.06 -0.39 -0.26 -0.34 0.05 -0.14 -0.31
-0.02 0.1 -0.15 -0.33 -0.04 -0.28 -0.33 -0.27 -0.43 -0.08 -0.23 -0.34 0.11 0.54 0.01 0.06 -0.04 1.81 -0.53 -0.55 -0.19 -0.26 0.23 -0.14 -0.39 -0.23 -0.06 -0.15 -0.1 -0.23
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1.09 0.53 -0.61 -0.82 1.73 -0.97 -1.71 -1.58 -0.4 -1.55 -1.44 -1.65 -3.4 1.92 -1.09 -1.28 -2.49 3.2 -1.64 -1.64 -0.75 -0.82 -0.83 -1.07 -1.2 -1.45 -1.8 -0.65 -2.07 -4.59
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.