1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_86 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.12 0.11 0.05 0.04 0.11 0.1 0.07 0.04 0.05 0.05 0.05 0.06 0.13 0.41 0.11 0.09 0.1 1.0 0.06 0.09 0.06 0.07 0.12 0.05 0.05 0.07 0.04 0.05 0.06 0.1
0.17 0.14 0.12 0.01 0.18 0.13 0.07 0.1 0.05 0.06 0.06 0.07 0.12 0.44 0.1 0.1 0.08 1.0 0.08 0.09 0.04 0.1 0.14 0.12 0.05 0.08 0.05 0.1 0.09 0.13
0.37 0.37 0.28 0.23 0.34 0.36 0.3 0.21 0.3 0.34 0.29 0.31 0.25 0.65 0.31 0.27 0.29 1.0 0.28 0.25 0.29 0.27 0.37 0.31 0.28 0.28 0.3 0.37 0.36 0.22
0.16 0.16 0.11 0.11 0.17 0.18 0.16 0.11 0.13 0.14 0.12 0.13 0.12 0.27 0.16 0.17 0.14 1.0 0.12 0.11 0.13 0.13 0.17 0.16 0.14 0.13 0.13 0.15 0.15 0.11
0.03 0.04 0.05 0.09 0.08 0.08 0.05 0.08 0.07 0.07 0.08 0.06 0.05 0.18 0.07 0.09 0.09 1.0 0.07 0.05 0.08 0.06 0.09 0.08 0.08 0.09 0.09 0.06 0.05 0.05
0.15 0.16 0.12 0.09 0.21 0.19 0.17 0.15 0.12 0.14 0.12 0.13 0.14 0.33 0.16 0.15 0.14 1.0 0.14 0.13 0.15 0.15 0.23 0.17 0.14 0.15 0.15 0.17 0.14 0.1
0.27 0.21 0.15 0.16 0.29 0.19 0.16 0.19 0.22 0.24 0.18 0.19 0.19 0.48 0.18 0.16 0.13 1.0 0.15 0.13 0.14 0.16 0.16 0.19 0.15 0.17 0.15 0.29 0.29 0.13
0.09 0.19 0.07 0.02 0.09 0.09 0.04 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.04 0.42 0.05 0.03 0.07 1.0 0.07 0.07 0.06 0.07 0.1 0.05 0.04 0.07 0.04 0.03 0.05 0.09
0.18 0.17 0.11 0.09 0.19 0.18 0.15 0.12 0.14 0.12 0.14 0.18 0.11 0.58 0.16 0.16 0.16 1.0 0.15 0.15 0.14 0.16 0.11 0.15 0.14 0.14 0.16 0.13 0.14 0.11
0.13 0.14 0.12 0.1 0.14 0.13 0.11 0.11 0.13 0.13 0.11 0.12 0.11 0.3 0.14 0.12 0.13 1.0 0.1 0.11 0.15 0.13 0.09 0.14 0.09 0.12 0.1 0.14 0.13 0.12
Spov3_chr1.04419 (AtNPC1 - 1)
 0.1 0.12 0.11 0.09 0.19 0.06 0.04 0.05 0.1 0.13 0.06 0.06 0.05 0.1 0.05 0.05 0.05 1.0 0.06 0.05 0.06 0.06 0.1 0.07 0.06 0.07 0.07 0.12 0.14 0.08
0.24 0.28 0.14 0.13 0.16 0.27 0.13 0.1 0.11 0.1 0.12 0.1 0.15 0.46 0.21 0.14 0.13 1.0 0.16 0.16 0.14 0.16 0.14 0.1 0.08 0.11 0.11 0.21 0.15 0.16
0.02 0.05 0.03 0.02 0.16 0.03 0.03 0.0 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.12 0.02 0.0 0.01 1.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.07 0.01 0.0 0.03 0.03 0.04 0.05 0.01
0.14 0.15 0.15 0.13 0.13 0.17 0.21 0.22 0.13 0.14 0.15 0.19 0.23 0.34 0.13 0.17 0.12 1.0 0.19 0.16 0.14 0.16 0.2 0.2 0.13 0.16 0.16 0.17 0.23 0.27
0.05 0.06 0.05 0.06 0.14 0.08 0.06 0.09 0.04 0.05 0.04 0.06 0.07 0.44 0.07 0.06 0.06 1.0 0.04 0.04 0.05 0.06 0.06 0.04 0.04 0.04 0.04 0.08 0.05 0.08
0.12 0.13 0.09 0.09 0.15 0.15 0.11 0.14 0.1 0.11 0.1 0.11 0.09 0.26 0.1 0.11 0.11 1.0 0.1 0.08 0.09 0.07 0.09 0.1 0.08 0.1 0.08 0.11 0.13 0.13
0.1 0.07 0.05 0.04 0.03 0.05 0.06 0.04 0.04 0.04 0.03 0.04 0.13 0.42 0.14 0.07 0.05 1.0 0.04 0.03 0.02 0.06 0.29 0.06 0.04 0.04 0.04 0.08 0.11 0.32
0.3 0.26 0.19 0.17 0.2 0.11 0.11 0.13 0.12 0.17 0.12 0.13 0.1 0.23 0.12 0.14 0.13 1.0 0.12 0.11 0.15 0.14 0.12 0.13 0.15 0.13 0.13 0.21 0.21 0.18
0.25 0.23 0.21 0.17 0.26 0.17 0.15 0.19 0.18 0.22 0.17 0.18 0.17 0.34 0.2 0.17 0.18 1.0 0.17 0.16 0.17 0.17 0.19 0.2 0.19 0.2 0.2 0.24 0.25 0.21
0.3 0.3 0.17 0.14 0.24 0.27 0.21 0.17 0.15 0.18 0.17 0.2 0.18 0.43 0.25 0.23 0.22 1.0 0.14 0.15 0.18 0.18 0.24 0.23 0.19 0.19 0.18 0.23 0.23 0.19
0.22 0.2 0.19 0.16 0.23 0.18 0.17 0.19 0.17 0.22 0.17 0.19 0.16 0.21 0.15 0.18 0.14 1.0 0.17 0.16 0.19 0.17 0.19 0.17 0.18 0.17 0.2 0.21 0.23 0.19
0.14 0.16 0.09 0.09 0.15 0.15 0.11 0.13 0.1 0.1 0.09 0.1 0.1 0.25 0.1 0.12 0.12 1.0 0.08 0.09 0.11 0.07 0.1 0.12 0.09 0.11 0.11 0.11 0.12 0.12
0.42 0.4 0.33 0.22 0.4 0.42 0.3 0.32 0.32 0.36 0.32 0.32 0.36 0.64 0.41 0.41 0.38 1.0 0.3 0.31 0.34 0.33 0.25 0.25 0.3 0.33 0.33 0.35 0.33 0.35
0.18 0.18 0.16 0.14 0.22 0.18 0.17 0.17 0.15 0.17 0.14 0.14 0.15 0.24 0.16 0.16 0.16 1.0 0.14 0.14 0.16 0.17 0.19 0.17 0.15 0.16 0.15 0.2 0.19 0.18
0.18 0.25 0.13 0.12 0.2 0.13 0.07 0.1 0.15 0.17 0.12 0.13 0.12 0.31 0.11 0.14 0.17 1.0 0.12 0.12 0.1 0.11 0.15 0.12 0.11 0.11 0.13 0.14 0.16 0.17
Spov3_chr3.04487 (SULTR4;1)
 0.07 0.04 0.04 0.08 0.01 0.07 0.04 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.22 0.07 0.05 0.03 1.0 0.04 0.03 0.02 0.04 0.06 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.08 0.17
0.06 0.07 0.06 0.09 0.05 0.08 0.06 0.04 0.06 0.06 0.05 0.05 0.06 0.51 0.11 0.1 0.07 1.0 0.05 0.05 0.07 0.04 0.16 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.05 0.15
0.44 0.39 0.37 0.37 0.45 0.33 0.33 0.32 0.36 0.38 0.38 0.33 0.41 0.61 0.37 0.39 0.41 1.0 0.33 0.32 0.35 0.34 0.32 0.34 0.37 0.36 0.37 0.4 0.36 0.36
0.19 0.18 0.16 0.17 0.21 0.19 0.18 0.2 0.17 0.18 0.16 0.17 0.17 0.29 0.19 0.21 0.19 1.0 0.17 0.18 0.2 0.19 0.19 0.18 0.18 0.19 0.19 0.16 0.16 0.17
0.1 0.14 0.08 0.09 0.11 0.13 0.1 0.1 0.07 0.11 0.09 0.1 0.1 0.46 0.15 0.15 0.13 1.0 0.08 0.09 0.08 0.07 0.09 0.15 0.07 0.11 0.1 0.07 0.09 0.14
0.11 0.11 0.06 0.06 0.07 0.09 0.07 0.06 0.06 0.06 0.05 0.09 0.07 0.42 0.1 0.12 0.14 1.0 0.06 0.06 0.1 0.1 0.09 0.12 0.1 0.1 0.1 0.04 0.07 0.09
Spov3_chr4.01663 (AtTIM21L-2)
 0.32 0.34 0.26 0.19 0.25 0.17 0.17 0.18 0.16 0.23 0.22 0.19 0.24 0.41 0.22 0.2 0.21 1.0 0.16 0.17 0.17 0.21 0.24 0.24 0.19 0.21 0.18 0.32 0.3 0.25
0.2 0.24 0.16 0.13 0.26 0.24 0.2 0.2 0.18 0.2 0.15 0.18 0.16 0.48 0.2 0.22 0.21 1.0 0.17 0.14 0.18 0.15 0.12 0.2 0.15 0.17 0.15 0.16 0.21 0.23
0.22 0.25 0.22 0.21 0.33 0.29 0.22 0.25 0.17 0.2 0.21 0.16 0.31 0.59 0.32 0.28 0.31 1.0 0.25 0.25 0.25 0.23 0.34 0.18 0.17 0.23 0.19 0.18 0.2 0.31
0.27 0.29 0.26 0.28 0.26 0.32 0.27 0.28 0.27 0.27 0.26 0.29 0.22 0.42 0.32 0.29 0.3 1.0 0.29 0.23 0.26 0.26 0.19 0.26 0.25 0.28 0.28 0.26 0.27 0.27
0.18 0.2 0.15 0.14 0.17 0.22 0.21 0.21 0.14 0.18 0.16 0.16 0.22 0.37 0.23 0.23 0.21 1.0 0.14 0.14 0.14 0.16 0.23 0.19 0.16 0.17 0.15 0.18 0.17 0.17
0.14 0.14 0.11 0.11 0.18 0.14 0.11 0.1 0.14 0.18 0.12 0.11 0.09 0.24 0.13 0.11 0.12 1.0 0.15 0.09 0.14 0.11 0.16 0.09 0.12 0.15 0.11 0.14 0.11 0.08
0.18 0.11 0.05 0.04 0.06 0.09 0.07 0.03 0.04 0.06 0.06 0.06 0.12 0.48 0.08 0.06 0.06 1.0 0.06 0.04 0.05 0.05 0.16 0.07 0.07 0.07 0.06 0.12 0.07 0.07
0.21 0.23 0.16 0.15 0.19 0.19 0.17 0.18 0.16 0.2 0.16 0.18 0.15 0.31 0.21 0.2 0.2 1.0 0.13 0.12 0.16 0.17 0.28 0.19 0.17 0.17 0.18 0.21 0.2 0.16
0.22 0.23 0.16 0.13 0.23 0.14 0.15 0.14 0.13 0.16 0.13 0.14 0.14 0.26 0.16 0.16 0.14 1.0 0.15 0.13 0.16 0.13 0.18 0.18 0.16 0.19 0.15 0.2 0.17 0.16
0.26 0.28 0.19 0.17 0.27 0.19 0.16 0.16 0.19 0.23 0.18 0.18 0.14 0.39 0.17 0.18 0.16 1.0 0.16 0.15 0.17 0.17 0.17 0.19 0.17 0.19 0.18 0.24 0.25 0.19
0.11 0.11 0.09 0.1 0.14 0.09 0.07 0.09 0.07 0.12 0.09 0.08 0.06 0.19 0.08 0.08 0.09 1.0 0.06 0.06 0.1 0.07 0.11 0.09 0.07 0.09 0.09 0.12 0.12 0.12
Spov3_chr5.00801 (NRT1.12)
 0.07 0.11 0.09 0.06 0.25 0.11 0.07 0.11 0.11 0.11 0.06 0.08 0.07 0.19 0.08 0.09 0.07 1.0 0.07 0.06 0.07 0.06 0.1 0.09 0.05 0.07 0.06 0.16 0.2 0.13
0.12 0.1 0.07 0.06 0.22 0.06 0.07 0.11 0.07 0.1 0.08 0.06 0.13 0.37 0.11 0.08 0.08 1.0 0.07 0.06 0.09 0.1 0.14 0.08 0.09 0.08 0.1 0.12 0.1 0.06
0.38 0.42 0.3 0.3 0.37 0.33 0.28 0.28 0.31 0.28 0.3 0.32 0.35 0.55 0.4 0.35 0.36 1.0 0.33 0.26 0.32 0.3 0.26 0.32 0.3 0.3 0.35 0.29 0.3 0.32
0.2 0.19 0.12 0.09 0.18 0.16 0.21 0.14 0.16 0.16 0.16 0.18 0.16 0.42 0.16 0.13 0.12 1.0 0.18 0.16 0.14 0.16 0.24 0.2 0.16 0.14 0.14 0.22 0.21 0.08
0.23 0.18 0.14 0.14 0.26 0.18 0.13 0.13 0.12 0.14 0.16 0.16 0.21 0.61 0.22 0.17 0.18 1.0 0.14 0.12 0.13 0.14 0.27 0.16 0.14 0.12 0.15 0.19 0.21 0.3
0.19 0.18 0.16 0.17 0.21 0.19 0.18 0.2 0.17 0.18 0.16 0.17 0.17 0.29 0.19 0.21 0.19 1.0 0.17 0.18 0.2 0.19 0.19 0.18 0.18 0.19 0.19 0.16 0.16 0.17
0.06 0.14 0.03 0.01 0.06 0.08 0.02 0.01 0.0 0.06 0.01 0.0 0.03 0.27 0.03 0.03 0.03 1.0 0.07 0.09 0.08 0.04 0.24 0.03 0.01 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03
0.27 0.28 0.22 0.22 0.27 0.22 0.19 0.2 0.18 0.22 0.19 0.18 0.2 0.35 0.22 0.21 0.21 1.0 0.17 0.17 0.19 0.19 0.29 0.2 0.19 0.2 0.2 0.26 0.23 0.22
0.27 0.26 0.17 0.13 0.23 0.16 0.14 0.14 0.18 0.19 0.14 0.17 0.21 0.48 0.18 0.21 0.16 1.0 0.13 0.15 0.14 0.17 0.17 0.16 0.16 0.17 0.13 0.25 0.28 0.23
0.22 0.2 0.14 0.19 0.18 0.17 0.13 0.17 0.12 0.14 0.12 0.14 0.18 0.29 0.18 0.17 0.17 1.0 0.13 0.13 0.1 0.12 0.15 0.14 0.13 0.13 0.11 0.16 0.2 0.23
0.05 0.07 0.05 0.02 0.05 0.06 0.01 0.01 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.22 0.04 0.03 0.05 1.0 0.02 0.01 0.03 0.04 0.09 0.02 0.03 0.03 0.04 0.05 0.04 0.02
0.09 0.14 0.05 0.02 0.13 0.18 0.07 0.03 0.04 0.11 0.07 0.06 0.09 0.4 0.09 0.12 0.07 1.0 0.11 0.07 0.1 0.1 0.15 0.1 0.05 0.11 0.11 0.09 0.05 0.1
0.07 0.08 0.05 0.04 0.09 0.15 0.08 0.04 0.06 0.06 0.05 0.06 0.07 0.37 0.09 0.09 0.07 1.0 0.05 0.06 0.07 0.06 0.07 0.08 0.05 0.06 0.05 0.05 0.05 0.07
0.18 0.2 0.14 0.07 0.28 0.26 0.22 0.13 0.17 0.22 0.17 0.23 0.16 0.58 0.26 0.24 0.22 1.0 0.17 0.15 0.2 0.18 0.12 0.21 0.21 0.22 0.21 0.22 0.2 0.17
0.3 0.31 0.23 0.22 0.28 0.27 0.23 0.22 0.24 0.25 0.25 0.22 0.23 0.55 0.3 0.27 0.28 1.0 0.22 0.21 0.24 0.22 0.3 0.27 0.22 0.24 0.23 0.3 0.26 0.23
0.28 0.31 0.26 0.23 0.28 0.24 0.23 0.24 0.21 0.27 0.24 0.23 0.31 0.41 0.29 0.3 0.28 1.0 0.2 0.2 0.25 0.24 0.33 0.26 0.22 0.24 0.27 0.26 0.27 0.24
0.15 0.2 0.15 0.18 0.15 0.23 0.13 0.14 0.15 0.1 0.12 0.1 0.09 0.56 0.19 0.19 0.21 1.0 0.1 0.13 0.11 0.16 0.11 0.21 0.13 0.09 0.15 0.09 0.16 0.16
0.16 0.18 0.13 0.14 0.18 0.16 0.14 0.14 0.17 0.21 0.18 0.17 0.18 0.28 0.21 0.21 0.19 1.0 0.16 0.14 0.17 0.17 0.18 0.17 0.17 0.17 0.16 0.15 0.13 0.14
0.23 0.16 0.07 0.06 0.36 0.06 0.03 0.04 0.08 0.04 0.04 0.03 0.01 0.41 0.05 0.04 0.02 1.0 0.04 0.04 0.06 0.06 0.06 0.05 0.05 0.04 0.03 0.07 0.03 0.0
0.25 0.26 0.23 0.21 0.26 0.21 0.21 0.22 0.22 0.25 0.21 0.24 0.19 0.37 0.25 0.19 0.24 1.0 0.24 0.21 0.22 0.21 0.19 0.2 0.22 0.22 0.24 0.22 0.23 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)