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Heatmap: Cluster_156 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.38 0.14 0.04 0.15 0.49 0.19 -0.14 -0.16 -0.28 -0.01 -0.26 -0.23 -0.07 1.07 -0.1 -0.15 -0.11 0.03 -0.26 -0.25 -0.3 -0.38 -0.3 -0.2 -0.1 -0.2 -0.17 0.41 -0.0 -0.3
0.39 0.45 0.08 -0.07 0.34 0.07 -0.04 -0.25 -0.18 0.04 -0.31 -0.2 -0.3 0.7 -0.14 -0.14 -0.13 -0.05 -0.44 -0.37 -0.13 -0.24 -0.21 -0.03 -0.08 -0.14 -0.17 0.19 0.46 0.12
0.31 0.52 -0.09 -0.25 0.35 0.25 -0.09 -0.37 -0.09 -0.16 -0.38 -0.07 -0.48 1.05 -0.21 -0.03 -0.2 -0.23 -0.36 -0.62 -0.17 -0.08 -0.09 0.04 -0.17 -0.13 -0.27 0.31 0.36 0.08
Spov3_chr1.00108 (ALDH3F1)
 0.02 0.11 -0.18 -0.32 0.39 0.14 -0.19 -0.06 -0.23 0.3 -0.3 -0.37 -0.04 1.07 -0.1 0.14 -0.16 -0.02 -0.12 -0.25 0.19 -0.08 -0.45 -0.05 -0.32 0.01 0.02 0.02 0.19 -0.36
0.66 0.67 0.07 -0.28 0.51 -0.01 -0.33 -0.28 -0.04 0.17 -0.36 -0.21 -0.62 0.85 -0.38 -0.31 -0.24 -0.2 -0.48 -0.63 -0.21 -0.17 0.02 0.0 -0.14 -0.09 -0.1 0.31 0.43 -0.14
0.34 0.48 -0.13 -0.29 0.36 0.13 -0.06 -0.23 -0.24 -0.05 -0.21 -0.19 -0.74 1.59 -0.13 -0.0 -0.09 -0.25 -0.33 -0.39 -0.15 -0.27 -0.93 0.01 -0.27 -0.14 -0.29 -0.16 0.34 0.03
0.17 0.15 -0.02 0.02 0.09 -0.04 -0.12 0.09 -0.2 -0.11 -0.21 -0.18 -0.09 0.49 0.18 0.15 0.03 0.0 -0.08 -0.26 -0.12 -0.09 0.1 -0.04 -0.1 -0.1 -0.02 0.04 0.09 -0.05
0.38 0.26 -0.11 -0.27 -0.0 0.05 0.01 -0.04 -0.25 0.1 -0.1 0.12 -0.17 1.19 -0.21 -0.2 -0.22 -0.04 -0.27 -0.38 -0.18 -0.17 -0.24 -0.22 -0.23 -0.13 0.0 0.12 -0.06 0.23
0.24 0.47 0.01 -0.36 0.06 0.01 -0.34 -0.5 -0.08 0.11 -0.19 0.05 -0.19 1.31 0.03 -0.13 -0.28 -0.63 -0.45 -0.4 -0.0 -0.13 -0.65 0.28 -0.03 -0.06 -0.06 0.24 0.31 -0.29
0.31 0.4 -0.02 -0.06 0.38 0.09 -0.02 -0.05 -0.19 -0.08 -0.36 -0.29 -0.28 0.9 -0.02 0.01 -0.05 -0.05 -0.26 -0.48 -0.14 -0.29 -0.18 0.05 -0.42 -0.18 -0.07 0.22 0.13 0.15
0.25 0.23 -0.02 -0.05 0.21 0.13 0.01 0.0 -0.21 -0.15 -0.2 -0.14 -0.17 0.72 0.18 0.03 0.0 -0.08 -0.2 -0.36 -0.27 -0.2 0.13 -0.0 -0.19 -0.17 -0.14 0.3 0.02 -0.16
0.16 0.18 0.03 0.08 0.28 -0.06 -0.23 0.02 -0.24 -0.14 -0.32 -0.17 -0.14 0.54 0.17 0.22 0.18 -0.12 -0.23 -0.33 -0.11 -0.12 -0.04 -0.05 -0.08 -0.11 -0.08 0.1 0.1 0.11
0.45 0.58 0.07 0.0 0.27 0.09 -0.25 -0.24 -0.26 -0.15 -0.36 -0.19 -0.34 1.05 0.05 0.15 0.09 -0.16 -0.28 -0.39 -0.19 -0.17 -0.16 -0.02 -0.29 -0.21 -0.25 0.1 -0.01 -0.06
0.31 0.4 0.01 -0.14 0.27 -0.04 -0.28 -0.33 -0.01 0.21 -0.13 0.02 -0.15 0.66 0.0 -0.17 -0.19 -0.14 -0.41 -0.39 -0.09 -0.19 -0.03 -0.08 -0.29 -0.07 0.0 0.25 0.29 0.08
0.36 0.22 -0.12 -0.08 0.28 0.07 -0.22 -0.27 -0.22 -0.1 -0.13 -0.22 -0.18 0.73 -0.0 0.22 0.18 0.03 -0.4 -0.45 -0.08 -0.18 -0.03 -0.17 -0.03 0.06 -0.15 0.06 0.22 0.0
0.09 0.33 -0.0 0.2 0.3 -0.19 -0.35 -0.08 -0.15 -0.11 -0.16 -0.2 -0.13 0.82 0.06 0.1 0.14 -0.1 -0.25 -0.35 -0.09 -0.22 0.12 0.07 -0.1 -0.09 -0.05 0.02 -0.02 -0.21
0.27 0.43 0.03 0.09 0.11 -0.0 -0.22 -0.08 -0.21 -0.06 -0.27 -0.07 -0.16 0.61 -0.03 0.02 0.03 -0.12 -0.37 -0.46 -0.06 -0.06 0.13 0.09 -0.18 -0.09 -0.03 0.16 0.1 -0.09
0.09 0.18 -0.0 0.18 0.11 -0.04 -0.35 0.13 -0.25 -0.15 -0.09 -0.16 -0.12 0.74 0.09 0.18 0.13 -0.21 -0.24 -0.26 0.05 -0.19 0.03 -0.08 -0.17 -0.05 -0.08 0.05 0.04 -0.0
0.25 0.21 0.08 0.01 0.18 -0.01 0.01 -0.06 -0.14 -0.1 -0.11 -0.07 -0.23 0.71 0.08 0.01 0.03 -0.36 -0.33 -0.44 -0.15 0.02 0.08 -0.02 0.03 -0.08 -0.05 0.23 -0.06 -0.2
0.34 0.36 0.14 0.07 0.41 -0.02 -0.23 0.06 -0.01 0.03 -0.2 -0.19 -0.39 0.82 0.03 -0.12 -0.03 -0.07 -0.27 -0.29 -0.25 -0.1 -0.24 -0.18 -0.29 -0.25 -0.16 0.28 0.12 -0.13
0.23 0.2 -0.0 -0.02 0.2 0.03 0.08 -0.23 -0.13 -0.03 -0.14 -0.04 -0.09 0.87 0.13 0.07 -0.03 -0.23 -0.43 -0.36 -0.11 -0.08 -0.39 -0.11 -0.16 -0.08 -0.05 0.13 0.08 0.07
0.13 0.31 -0.06 -0.01 0.23 -0.05 -0.2 0.15 -0.23 -0.16 -0.27 -0.29 0.04 0.74 0.05 0.19 0.15 0.17 -0.17 -0.34 -0.19 -0.21 -0.12 0.01 -0.17 -0.18 -0.18 0.14 -0.05 0.02
0.27 0.19 0.05 0.11 0.07 -0.06 -0.18 0.12 -0.09 -0.07 -0.13 -0.27 -0.11 1.02 0.07 -0.11 0.16 0.28 -0.3 -0.46 -0.25 -0.22 -0.16 -0.11 -0.4 -0.39 -0.37 0.12 0.19 0.12
0.53 0.38 0.13 0.24 1.0 -0.16 -0.5 -0.32 0.1 0.2 -0.59 -0.56 -0.84 1.62 -0.32 -0.28 -0.6 0.38 -0.51 -0.6 -0.65 -0.57 -0.43 -0.67 -0.91 -0.55 -0.72 0.52 0.6 -0.03
0.28 0.27 0.2 -0.03 0.2 0.07 -0.31 -0.12 -0.19 0.1 -0.2 -0.28 0.05 1.28 0.01 0.11 0.19 -0.25 -0.29 -0.39 -0.11 -0.21 -0.75 -0.09 -0.1 -0.25 -0.21 0.2 0.06 -0.7
0.37 0.36 0.25 0.02 0.28 -0.18 -0.08 -0.18 -0.09 0.04 -0.23 -0.05 -0.48 0.69 0.08 0.04 0.04 -0.39 -0.33 -0.39 -0.13 -0.11 -0.11 -0.01 -0.07 -0.09 -0.06 0.24 0.12 -0.21
0.53 0.69 0.13 -0.35 0.67 0.06 -0.52 -0.18 -0.01 0.22 -0.5 -0.04 -0.62 1.14 -0.32 -0.08 -0.16 0.02 -0.56 -0.56 -0.26 -0.12 -0.11 -0.05 -0.44 -0.33 -0.34 0.17 0.15 -0.1
0.18 0.28 -0.02 -0.31 0.2 0.01 -0.07 -0.08 -0.27 -0.2 -0.16 -0.11 -0.19 0.95 0.25 -0.03 -0.01 -0.39 -0.13 -0.26 -0.05 -0.02 -0.01 0.14 -0.23 -0.08 -0.04 0.14 0.08 -0.29
0.54 0.38 -0.06 -0.31 0.71 0.03 -0.23 -0.09 -0.1 0.12 -0.36 -0.21 -0.76 1.12 0.02 0.07 -0.15 -0.24 -0.32 -0.48 -0.1 -0.25 -0.65 -0.07 -0.25 -0.1 -0.21 0.27 0.31 -0.26
0.22 0.35 -0.02 -0.19 0.21 -0.01 -0.19 0.01 -0.08 0.14 -0.19 -0.05 -0.24 1.03 -0.01 0.04 0.15 -0.18 -0.25 -0.3 -0.09 -0.09 -0.43 -0.02 -0.23 0.04 -0.04 -0.08 0.01 -0.28
0.47 0.42 0.11 0.08 0.23 -0.11 -0.15 -0.23 -0.13 -0.2 -0.26 -0.13 -0.15 0.71 0.22 0.1 0.08 -0.37 -0.2 -0.23 -0.27 -0.13 -0.07 -0.14 -0.17 -0.13 -0.2 0.16 0.14 -0.08
0.2 0.22 0.0 -0.04 0.09 -0.09 -0.11 -0.17 -0.02 0.02 -0.12 0.01 -0.22 0.83 0.09 -0.0 -0.18 -0.31 -0.21 -0.28 -0.11 -0.06 0.06 -0.12 -0.18 -0.15 0.02 0.21 0.23 -0.14
0.34 0.4 0.13 0.05 0.06 -0.06 -0.16 0.15 -0.06 -0.16 -0.2 -0.18 -0.2 0.74 0.06 -0.02 0.02 0.01 -0.29 -0.39 -0.16 -0.19 -0.07 -0.13 -0.3 -0.19 -0.19 0.28 0.12 0.02
0.1 0.27 -0.15 -0.16 0.31 0.11 -0.26 -0.34 -0.01 0.4 -0.1 -0.04 -0.47 1.33 -0.27 0.1 -0.32 0.21 -0.38 -0.72 -0.44 -0.32 -0.17 -0.05 -0.33 -0.19 -0.12 0.53 0.31 -0.67
0.46 0.36 0.06 -0.19 0.2 0.01 -0.14 -0.3 -0.13 -0.08 -0.24 -0.03 -0.36 0.93 0.13 -0.0 -0.15 -0.35 -0.42 -0.42 -0.11 -0.18 -0.09 0.06 -0.37 -0.0 -0.05 0.33 0.17 -0.04
0.34 0.25 -0.12 -0.11 0.26 0.14 0.03 -0.2 -0.11 0.13 -0.24 -0.19 -0.17 0.82 0.11 -0.07 -0.32 -0.04 -0.26 -0.32 -0.17 -0.13 -0.29 0.07 -0.14 -0.09 -0.07 0.27 0.17 -0.19
0.27 0.19 0.05 0.11 0.07 -0.06 -0.18 0.12 -0.09 -0.07 -0.13 -0.27 -0.11 1.02 0.07 -0.11 0.16 0.28 -0.3 -0.46 -0.25 -0.22 -0.16 -0.11 -0.4 -0.39 -0.37 0.12 0.19 0.12
0.31 0.4 0.1 0.23 0.01 -0.13 -0.2 0.02 -0.19 -0.11 -0.22 -0.21 -0.13 0.79 0.0 0.03 -0.03 -0.0 -0.23 -0.41 -0.03 -0.08 -0.09 0.01 -0.2 -0.15 -0.14 0.16 0.03 -0.09
0.27 0.26 -0.06 -0.14 0.11 -0.0 -0.03 -0.27 -0.05 0.07 -0.19 -0.02 -0.31 0.78 -0.01 0.02 -0.17 -0.08 -0.29 -0.32 -0.13 -0.14 0.03 0.05 -0.1 -0.05 -0.01 0.23 0.2 -0.2
0.65 0.41 -0.04 0.06 0.2 -0.01 -0.06 -0.49 0.03 0.14 -0.14 -0.01 -0.33 0.61 0.04 -0.07 -0.09 -0.57 -0.32 -0.32 -0.27 -0.24 0.11 0.06 -0.22 -0.12 -0.09 0.26 0.16 -0.15
0.23 0.22 0.07 -0.09 0.24 -0.04 -0.16 -0.12 0.04 0.06 -0.01 -0.05 -0.21 0.48 -0.02 0.01 -0.03 0.02 -0.24 -0.34 -0.11 -0.05 -0.06 0.01 -0.17 -0.04 -0.02 0.15 0.13 -0.2
0.23 0.32 0.03 0.07 0.21 0.06 -0.08 0.06 -0.17 -0.18 -0.22 -0.08 -0.17 0.69 0.11 0.1 0.09 0.03 -0.35 -0.32 -0.16 -0.14 -0.14 -0.04 -0.09 -0.08 -0.08 0.1 -0.02 -0.22
0.34 0.16 -0.04 -0.06 0.2 -0.04 0.04 -0.18 -0.05 -0.15 -0.19 -0.02 -0.12 0.48 0.04 0.03 0.1 -0.26 -0.2 -0.18 -0.09 -0.07 -0.15 0.15 0.01 -0.06 -0.05 0.11 0.13 -0.14
0.28 0.31 -0.03 -0.05 0.22 0.05 -0.11 -0.21 -0.13 -0.01 -0.18 -0.1 -0.28 0.86 0.05 0.05 -0.06 -0.14 -0.29 -0.31 -0.1 -0.12 -0.26 -0.03 -0.19 -0.03 -0.09 0.18 0.16 -0.05
0.14 0.17 -0.09 -0.08 0.19 0.01 -0.09 0.07 -0.13 -0.04 -0.21 -0.14 -0.15 0.55 0.15 0.18 0.1 0.0 -0.31 -0.27 -0.13 -0.12 -0.23 0.05 -0.11 -0.15 0.0 0.16 0.11 0.03
0.17 0.15 -0.2 -0.09 0.1 0.05 0.06 -0.19 -0.11 0.02 -0.07 -0.06 -0.1 0.64 0.12 0.13 0.05 -0.07 -0.33 -0.19 -0.19 -0.2 0.0 0.05 -0.21 -0.07 -0.06 0.2 0.11 -0.05
0.34 0.48 0.11 0.08 0.23 0.27 -0.22 -0.26 -0.14 -0.1 -0.2 -0.2 -0.43 1.09 0.09 0.13 0.02 -0.09 -0.3 -0.52 -0.14 -0.25 -0.65 -0.1 -0.3 -0.16 -0.28 0.01 0.18 0.09
0.28 0.26 0.02 0.04 0.05 -0.05 -0.12 -0.03 -0.11 -0.07 -0.02 -0.08 -0.14 0.53 0.05 -0.05 -0.03 -0.03 -0.44 -0.26 -0.21 -0.07 0.11 -0.11 -0.13 -0.04 -0.01 0.18 0.19 -0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.