Heatmap: Cluster_156 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
11.55 9.77 9.14 9.84 12.49 10.12 8.05 7.94 7.32 8.85 7.43 7.55 8.48 18.7 8.31 7.99 8.26 9.09 7.42 7.46 7.2 6.84 7.23 7.74 8.27 7.75 7.92 11.77 8.86 7.22
6.31 6.6 5.12 4.6 6.13 5.06 4.71 4.07 4.28 4.96 3.89 4.2 3.91 7.87 4.39 4.38 4.42 4.67 3.56 3.74 4.41 4.09 4.19 4.72 4.58 4.39 4.29 5.5 6.64 5.25
3.75 4.34 2.83 2.54 3.86 3.58 2.83 2.33 2.85 2.7 2.33 2.88 2.16 6.26 2.61 2.96 2.62 2.57 2.35 1.96 2.68 2.86 2.84 3.11 2.69 2.77 2.5 3.74 3.88 3.2
Spov3_chr1.00108 (ALDH3F1)
28.88 30.67 25.02 22.79 37.36 31.3 24.91 27.24 24.24 34.98 23.17 22.03 27.75 59.79 26.59 31.4 25.46 28.13 26.1 23.94 32.46 26.95 20.86 27.5 22.74 28.61 28.8 28.92 32.41 22.12
7.61 7.67 5.06 3.98 6.87 4.79 3.83 3.98 4.7 5.42 3.75 4.18 3.13 8.68 3.71 3.89 4.09 4.2 3.47 3.12 4.18 4.29 4.89 4.83 4.39 4.54 4.49 5.99 6.5 4.38
3.77 4.16 2.72 2.45 3.82 3.26 2.86 2.54 2.53 2.88 2.58 2.62 1.78 9.0 2.72 2.98 2.8 2.52 2.37 2.28 2.68 2.47 1.56 3.0 2.48 2.71 2.45 2.67 3.78 3.05
41.46 40.76 36.17 37.3 39.13 35.89 33.97 39.23 32.06 34.01 31.72 32.42 34.54 51.56 41.71 40.82 37.54 36.89 34.81 30.73 33.85 34.61 39.47 35.72 34.24 34.33 36.39 37.84 39.3 35.51
4.17 3.85 2.97 2.65 3.2 3.31 3.22 3.12 2.69 3.44 2.99 3.49 2.84 7.31 2.77 2.8 2.75 3.11 2.65 2.46 2.83 2.84 2.72 2.74 2.74 2.92 3.21 3.47 3.07 3.76
1.69 1.98 1.43 1.11 1.49 1.44 1.12 1.01 1.35 1.54 1.25 1.48 1.25 3.55 1.46 1.31 1.18 0.92 1.05 1.08 1.42 1.3 0.91 1.74 1.39 1.38 1.37 1.69 1.78 1.17
6.24 6.63 4.96 4.8 6.55 5.34 4.95 4.83 4.39 4.74 3.92 4.1 4.12 9.35 4.93 5.06 4.85 4.83 4.19 3.59 4.56 4.11 4.43 5.2 3.76 4.42 4.77 5.85 5.51 5.56
6.69 6.59 5.54 5.44 6.49 6.15 5.68 5.64 4.87 5.07 4.89 5.11 5.01 9.24 6.36 5.73 5.64 5.32 4.9 4.38 4.67 4.88 6.17 5.62 4.93 4.99 5.09 6.93 5.7 5.05
21.38 21.78 19.65 20.29 23.34 18.36 16.37 19.5 16.3 17.45 15.34 17.06 17.42 27.91 21.53 22.32 21.75 17.61 16.37 15.27 17.75 17.64 18.72 18.48 18.21 17.83 18.19 20.55 20.61 20.7
10.41 11.41 7.99 7.64 9.22 8.1 6.41 6.48 6.39 6.87 5.96 6.68 6.02 15.77 7.9 8.47 8.11 6.84 6.29 5.82 6.67 6.78 6.83 7.51 6.26 6.61 6.4 8.21 7.56 7.33
8.0 8.49 6.5 5.85 7.75 6.26 5.32 5.14 6.4 7.45 5.89 6.55 5.8 10.21 6.47 5.73 5.65 5.85 4.84 4.94 6.05 5.65 6.33 6.09 5.26 6.13 6.47 7.69 7.87 6.82
22.99 20.77 16.49 16.85 21.67 18.73 15.33 14.77 15.36 16.64 16.29 15.35 15.82 29.74 17.84 20.85 20.21 18.26 13.54 13.1 16.89 15.75 17.48 15.85 17.47 18.68 16.07 18.66 20.76 17.89
38.98 45.75 36.39 41.99 45.02 32.05 28.58 34.53 32.97 33.86 32.71 31.81 33.27 64.54 37.99 39.2 40.34 34.04 30.68 28.67 34.27 31.3 39.67 38.26 34.09 34.35 35.2 37.1 36.11 31.59
6.73 7.55 5.7 5.96 6.04 5.57 4.78 5.28 4.83 5.36 4.63 5.31 4.99 8.52 5.45 5.66 5.69 5.16 4.33 4.05 5.37 5.36 6.1 5.95 4.94 5.26 5.49 6.26 5.99 5.25
13.22 14.0 12.38 14.05 13.36 12.05 9.71 13.57 10.4 11.14 11.67 11.08 11.42 20.66 13.21 14.0 13.59 10.7 10.53 10.38 12.87 10.84 12.67 11.7 10.99 11.98 11.7 12.82 12.75 12.35
5.6 5.45 4.96 4.72 5.33 4.65 4.71 4.49 4.27 4.38 4.34 4.46 4.0 7.7 4.98 4.72 4.79 3.67 3.72 3.45 4.24 4.75 4.97 4.65 4.79 4.44 4.54 5.49 4.52 4.1
42.57 43.29 37.25 35.26 44.79 33.3 28.67 35.25 33.41 34.33 29.34 29.52 25.8 59.4 34.5 30.91 33.06 32.21 27.92 27.51 28.25 31.38 28.57 29.72 27.63 28.43 30.27 41.0 36.74 30.83
4.79 4.7 4.09 4.03 4.69 4.18 4.34 3.5 3.74 4.0 3.72 3.98 3.84 7.5 4.48 4.3 4.0 3.48 3.04 3.19 3.78 3.86 3.13 3.79 3.67 3.87 3.95 4.49 4.32 4.3
20.87 23.58 18.29 18.92 22.26 18.34 16.58 21.11 16.27 17.07 15.79 15.57 19.56 31.86 19.63 21.67 21.05 21.37 16.96 15.07 16.67 16.46 17.54 19.19 16.92 16.76 16.8 20.92 18.33 19.3
12.9 12.17 11.03 11.54 11.19 10.28 9.46 11.65 10.07 10.19 9.76 8.9 9.91 21.63 11.19 9.94 11.92 13.0 8.69 7.8 9.01 9.21 9.6 9.88 8.11 8.17 8.26 11.59 12.17 11.6
150.97 135.81 114.27 123.85 208.4 93.58 74.05 83.97 112.15 120.19 69.48 70.79 58.47 321.06 83.51 86.38 68.85 135.75 73.48 69.13 66.49 70.62 77.87 65.92 55.62 71.64 63.37 150.29 158.62 102.19
85.16 84.97 80.71 69.11 80.57 74.05 56.58 64.81 61.49 75.59 61.14 57.88 72.78 170.79 70.92 75.88 80.3 59.37 57.73 53.58 65.28 60.72 41.93 66.19 65.77 59.01 60.86 80.88 73.59 43.23
7.76 7.72 7.11 6.07 7.27 5.29 5.66 5.29 5.63 6.17 5.11 5.79 4.3 9.7 6.36 6.16 6.15 4.58 4.76 4.58 5.5 5.55 5.54 5.96 5.73 5.64 5.75 7.09 6.52 5.2
2.4 2.69 1.82 1.31 2.65 1.73 1.16 1.47 1.65 1.94 1.18 1.61 1.08 3.67 1.33 1.58 1.49 1.69 1.13 1.13 1.39 1.54 1.54 1.61 1.22 1.32 1.31 1.88 1.85 1.55
36.61 39.11 31.78 26.05 37.07 32.5 30.69 30.45 26.74 28.16 28.79 29.88 28.17 62.21 38.31 31.6 32.02 24.61 29.55 26.86 31.23 31.74 32.06 35.42 27.47 30.52 31.32 35.48 34.17 26.38
102.53 91.77 67.97 56.91 115.72 72.27 60.36 66.24 65.85 76.48 54.91 61.13 41.57 152.96 71.58 74.25 63.66 59.84 56.75 50.61 65.73 59.51 44.98 67.05 59.39 65.8 61.18 85.12 87.39 59.02
4.84 5.29 4.08 3.63 4.81 4.12 3.65 4.17 3.92 4.57 3.65 4.0 3.52 8.46 4.14 4.27 4.61 3.66 3.48 3.37 3.9 3.9 3.08 4.11 3.54 4.26 4.03 3.92 4.17 3.43
12.03 11.63 9.4 9.2 10.21 8.04 7.87 7.43 7.96 7.56 7.25 7.97 7.85 14.21 10.14 9.31 9.18 6.74 7.59 7.41 7.25 7.97 8.28 7.91 7.74 7.94 7.57 9.71 9.61 8.24
9.63 9.73 8.38 8.13 8.93 7.85 7.78 7.45 8.24 8.47 7.7 8.41 7.17 14.94 8.93 8.35 7.4 6.77 7.22 6.9 7.78 8.04 8.73 7.73 7.41 7.52 8.49 9.67 9.85 7.63
17.85 18.71 15.45 14.64 14.7 13.57 12.66 15.69 13.55 12.67 12.31 12.47 12.28 23.58 14.73 13.94 14.34 14.2 11.53 10.79 12.65 12.41 13.48 12.92 11.49 12.37 12.37 17.12 15.38 14.29
8.88 10.02 7.48 7.41 10.32 8.99 6.93 6.56 8.24 10.92 7.76 8.05 6.01 20.88 6.89 8.89 6.66 9.63 6.37 5.04 6.11 6.66 7.37 8.02 6.59 7.29 7.63 11.96 10.29 5.22
2.83 2.64 2.14 1.81 2.35 2.07 1.86 1.67 1.88 1.95 1.74 2.02 1.6 3.92 2.24 2.05 1.85 1.62 1.54 1.53 1.91 1.82 1.93 2.14 1.58 2.05 1.98 2.59 2.3 2.0
14.27 13.44 10.37 10.48 13.52 12.42 11.52 9.84 10.47 12.34 9.53 9.9 10.01 19.87 12.18 10.77 9.07 10.99 9.45 9.03 10.03 10.29 9.24 11.82 10.22 10.57 10.78 13.64 12.67 9.88
12.9 12.17 11.03 11.54 11.19 10.28 9.46 11.65 10.07 10.19 9.76 8.9 9.91 21.63 11.19 9.94 11.92 13.0 8.69 7.8 9.01 9.21 9.6 9.88 8.11 8.17 8.26 11.59 12.17 11.6
13.59 14.48 11.78 12.93 11.07 10.04 9.56 11.13 9.63 10.17 9.4 9.52 10.03 19.02 11.0 11.19 10.74 10.96 9.4 8.26 10.72 10.38 10.3 11.03 9.54 9.89 9.97 12.27 11.18 10.34
6.01 5.96 4.77 4.53 5.36 4.97 4.88 4.13 4.81 5.2 4.36 4.92 4.02 8.54 4.92 5.04 4.44 4.72 4.07 3.99 4.55 4.52 5.07 5.17 4.64 4.81 4.94 5.84 5.73 4.34
10.53 8.9 6.51 6.96 7.68 6.64 6.43 4.77 6.81 7.4 6.07 6.65 5.32 10.19 6.87 6.36 6.3 4.5 5.36 5.35 5.56 5.66 7.25 6.99 5.74 6.17 6.27 8.04 7.49 6.02
7.99 7.91 7.14 6.38 8.02 6.62 6.09 6.25 7.0 7.09 6.77 6.55 5.9 9.48 6.69 6.87 6.64 6.9 5.76 5.38 6.32 6.56 6.54 6.84 6.06 6.61 6.72 7.55 7.44 5.94
15.95 16.96 13.95 14.27 15.72 14.21 12.87 14.22 12.11 12.03 11.66 12.84 12.12 21.97 14.66 14.63 14.48 13.93 10.7 10.91 12.16 12.38 12.32 13.24 12.82 12.91 12.93 14.57 13.4 11.7
27.29 24.08 21.04 20.78 24.78 21.07 22.19 19.05 20.82 19.48 18.97 21.37 19.93 30.24 22.29 22.01 23.12 18.03 18.84 19.13 20.26 20.57 19.46 23.92 21.71 20.69 20.83 23.38 23.58 19.61
24.54 24.99 19.79 19.56 23.48 20.88 18.76 17.49 18.51 20.13 17.83 18.87 16.69 36.76 20.87 20.9 19.41 18.31 16.52 16.35 18.89 18.65 16.85 19.73 17.68 19.85 19.05 22.86 22.52 19.49
16.06 16.47 13.77 13.85 16.65 14.69 13.76 15.3 13.32 14.2 12.62 13.22 13.2 21.46 16.16 16.53 15.71 14.62 11.8 12.09 13.37 13.45 12.42 15.18 13.55 13.15 14.63 16.36 15.81 14.88
8.65 8.55 6.72 7.24 8.28 7.97 8.04 6.76 7.15 7.79 7.32 7.39 7.17 11.98 8.35 8.41 7.99 7.33 6.14 6.77 6.76 6.72 7.72 7.98 6.68 7.35 7.42 8.88 8.32 7.44
9.04 10.0 7.72 7.56 8.38 8.64 6.17 5.97 6.51 6.7 6.23 6.25 5.33 15.26 7.65 7.86 7.24 6.74 5.82 4.98 6.5 6.04 4.55 6.71 5.82 6.42 5.9 7.21 8.13 7.64
6.6 6.51 5.51 5.59 5.63 5.26 4.98 5.34 5.02 5.18 5.34 5.15 4.92 7.83 5.62 5.24 5.32 5.32 4.0 4.52 4.69 5.19 5.86 5.03 4.96 5.3 5.38 6.13 6.21 5.34

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)