1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_156 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.62 0.52 0.49 0.53 0.67 0.54 0.43 0.42 0.39 0.47 0.4 0.4 0.45 1.0 0.44 0.43 0.44 0.49 0.4 0.4 0.39 0.37 0.39 0.41 0.44 0.41 0.42 0.63 0.47 0.39
0.8 0.84 0.65 0.58 0.78 0.64 0.6 0.52 0.54 0.63 0.49 0.53 0.5 1.0 0.56 0.56 0.56 0.59 0.45 0.47 0.56 0.52 0.53 0.6 0.58 0.56 0.55 0.7 0.84 0.67
0.6 0.69 0.45 0.41 0.62 0.57 0.45 0.37 0.45 0.43 0.37 0.46 0.35 1.0 0.42 0.47 0.42 0.41 0.37 0.31 0.43 0.46 0.45 0.5 0.43 0.44 0.4 0.6 0.62 0.51
Spov3_chr1.00108 (ALDH3F1)
 0.48 0.51 0.42 0.38 0.62 0.52 0.42 0.46 0.41 0.59 0.39 0.37 0.46 1.0 0.44 0.53 0.43 0.47 0.44 0.4 0.54 0.45 0.35 0.46 0.38 0.48 0.48 0.48 0.54 0.37
0.88 0.88 0.58 0.46 0.79 0.55 0.44 0.46 0.54 0.62 0.43 0.48 0.36 1.0 0.43 0.45 0.47 0.48 0.4 0.36 0.48 0.49 0.56 0.56 0.5 0.52 0.52 0.69 0.75 0.5
0.42 0.46 0.3 0.27 0.43 0.36 0.32 0.28 0.28 0.32 0.29 0.29 0.2 1.0 0.3 0.33 0.31 0.28 0.26 0.25 0.3 0.27 0.17 0.33 0.28 0.3 0.27 0.3 0.42 0.34
0.8 0.79 0.7 0.72 0.76 0.7 0.66 0.76 0.62 0.66 0.62 0.63 0.67 1.0 0.81 0.79 0.73 0.72 0.68 0.6 0.66 0.67 0.77 0.69 0.66 0.67 0.71 0.73 0.76 0.69
0.57 0.53 0.41 0.36 0.44 0.45 0.44 0.43 0.37 0.47 0.41 0.48 0.39 1.0 0.38 0.38 0.38 0.43 0.36 0.34 0.39 0.39 0.37 0.38 0.37 0.4 0.44 0.48 0.42 0.51
0.48 0.56 0.4 0.31 0.42 0.4 0.32 0.28 0.38 0.43 0.35 0.42 0.35 1.0 0.41 0.37 0.33 0.26 0.29 0.3 0.4 0.37 0.26 0.49 0.39 0.39 0.39 0.48 0.5 0.33
0.67 0.71 0.53 0.51 0.7 0.57 0.53 0.52 0.47 0.51 0.42 0.44 0.44 1.0 0.53 0.54 0.52 0.52 0.45 0.38 0.49 0.44 0.47 0.56 0.4 0.47 0.51 0.63 0.59 0.59
0.72 0.71 0.6 0.59 0.7 0.67 0.61 0.61 0.53 0.55 0.53 0.55 0.54 1.0 0.69 0.62 0.61 0.58 0.53 0.47 0.51 0.53 0.67 0.61 0.53 0.54 0.55 0.75 0.62 0.55
0.77 0.78 0.7 0.73 0.84 0.66 0.59 0.7 0.58 0.62 0.55 0.61 0.62 1.0 0.77 0.8 0.78 0.63 0.59 0.55 0.64 0.63 0.67 0.66 0.65 0.64 0.65 0.74 0.74 0.74
0.66 0.72 0.51 0.48 0.58 0.51 0.41 0.41 0.41 0.44 0.38 0.42 0.38 1.0 0.5 0.54 0.51 0.43 0.4 0.37 0.42 0.43 0.43 0.48 0.4 0.42 0.41 0.52 0.48 0.46
0.78 0.83 0.64 0.57 0.76 0.61 0.52 0.5 0.63 0.73 0.58 0.64 0.57 1.0 0.63 0.56 0.55 0.57 0.47 0.48 0.59 0.55 0.62 0.6 0.51 0.6 0.63 0.75 0.77 0.67
0.77 0.7 0.55 0.57 0.73 0.63 0.52 0.5 0.52 0.56 0.55 0.52 0.53 1.0 0.6 0.7 0.68 0.61 0.46 0.44 0.57 0.53 0.59 0.53 0.59 0.63 0.54 0.63 0.7 0.6
0.6 0.71 0.56 0.65 0.7 0.5 0.44 0.53 0.51 0.52 0.51 0.49 0.52 1.0 0.59 0.61 0.63 0.53 0.48 0.44 0.53 0.48 0.61 0.59 0.53 0.53 0.55 0.57 0.56 0.49
0.79 0.89 0.67 0.7 0.71 0.65 0.56 0.62 0.57 0.63 0.54 0.62 0.58 1.0 0.64 0.66 0.67 0.6 0.51 0.48 0.63 0.63 0.72 0.7 0.58 0.62 0.64 0.73 0.7 0.62
0.64 0.68 0.6 0.68 0.65 0.58 0.47 0.66 0.5 0.54 0.56 0.54 0.55 1.0 0.64 0.68 0.66 0.52 0.51 0.5 0.62 0.52 0.61 0.57 0.53 0.58 0.57 0.62 0.62 0.6
0.73 0.71 0.64 0.61 0.69 0.6 0.61 0.58 0.55 0.57 0.56 0.58 0.52 1.0 0.65 0.61 0.62 0.48 0.48 0.45 0.55 0.62 0.65 0.6 0.62 0.58 0.59 0.71 0.59 0.53
0.72 0.73 0.63 0.59 0.75 0.56 0.48 0.59 0.56 0.58 0.49 0.5 0.43 1.0 0.58 0.52 0.56 0.54 0.47 0.46 0.48 0.53 0.48 0.5 0.47 0.48 0.51 0.69 0.62 0.52
0.64 0.63 0.55 0.54 0.63 0.56 0.58 0.47 0.5 0.53 0.5 0.53 0.51 1.0 0.6 0.57 0.53 0.46 0.41 0.43 0.5 0.52 0.42 0.51 0.49 0.52 0.53 0.6 0.58 0.57
0.66 0.74 0.57 0.59 0.7 0.58 0.52 0.66 0.51 0.54 0.5 0.49 0.61 1.0 0.62 0.68 0.66 0.67 0.53 0.47 0.52 0.52 0.55 0.6 0.53 0.53 0.53 0.66 0.58 0.61
0.6 0.56 0.51 0.53 0.52 0.48 0.44 0.54 0.47 0.47 0.45 0.41 0.46 1.0 0.52 0.46 0.55 0.6 0.4 0.36 0.42 0.43 0.44 0.46 0.38 0.38 0.38 0.54 0.56 0.54
0.47 0.42 0.36 0.39 0.65 0.29 0.23 0.26 0.35 0.37 0.22 0.22 0.18 1.0 0.26 0.27 0.21 0.42 0.23 0.22 0.21 0.22 0.24 0.21 0.17 0.22 0.2 0.47 0.49 0.32
0.5 0.5 0.47 0.4 0.47 0.43 0.33 0.38 0.36 0.44 0.36 0.34 0.43 1.0 0.42 0.44 0.47 0.35 0.34 0.31 0.38 0.36 0.25 0.39 0.39 0.35 0.36 0.47 0.43 0.25
0.8 0.8 0.73 0.63 0.75 0.55 0.58 0.54 0.58 0.64 0.53 0.6 0.44 1.0 0.66 0.63 0.63 0.47 0.49 0.47 0.57 0.57 0.57 0.61 0.59 0.58 0.59 0.73 0.67 0.54
0.65 0.73 0.5 0.36 0.72 0.47 0.32 0.4 0.45 0.53 0.32 0.44 0.3 1.0 0.36 0.43 0.41 0.46 0.31 0.31 0.38 0.42 0.42 0.44 0.33 0.36 0.36 0.51 0.51 0.42
0.59 0.63 0.51 0.42 0.6 0.52 0.49 0.49 0.43 0.45 0.46 0.48 0.45 1.0 0.62 0.51 0.51 0.4 0.48 0.43 0.5 0.51 0.52 0.57 0.44 0.49 0.5 0.57 0.55 0.42
0.67 0.6 0.44 0.37 0.76 0.47 0.39 0.43 0.43 0.5 0.36 0.4 0.27 1.0 0.47 0.49 0.42 0.39 0.37 0.33 0.43 0.39 0.29 0.44 0.39 0.43 0.4 0.56 0.57 0.39
0.57 0.63 0.48 0.43 0.57 0.49 0.43 0.49 0.46 0.54 0.43 0.47 0.42 1.0 0.49 0.51 0.54 0.43 0.41 0.4 0.46 0.46 0.36 0.49 0.42 0.5 0.48 0.46 0.49 0.41
0.85 0.82 0.66 0.65 0.72 0.57 0.55 0.52 0.56 0.53 0.51 0.56 0.55 1.0 0.71 0.66 0.65 0.47 0.53 0.52 0.51 0.56 0.58 0.56 0.54 0.56 0.53 0.68 0.68 0.58
0.64 0.65 0.56 0.54 0.6 0.53 0.52 0.5 0.55 0.57 0.52 0.56 0.48 1.0 0.6 0.56 0.5 0.45 0.48 0.46 0.52 0.54 0.58 0.52 0.5 0.5 0.57 0.65 0.66 0.51
0.76 0.79 0.66 0.62 0.62 0.58 0.54 0.67 0.57 0.54 0.52 0.53 0.52 1.0 0.62 0.59 0.61 0.6 0.49 0.46 0.54 0.53 0.57 0.55 0.49 0.52 0.52 0.73 0.65 0.61
0.43 0.48 0.36 0.35 0.49 0.43 0.33 0.31 0.39 0.52 0.37 0.39 0.29 1.0 0.33 0.43 0.32 0.46 0.31 0.24 0.29 0.32 0.35 0.38 0.32 0.35 0.37 0.57 0.49 0.25
0.72 0.67 0.55 0.46 0.6 0.53 0.47 0.42 0.48 0.5 0.44 0.51 0.41 1.0 0.57 0.52 0.47 0.41 0.39 0.39 0.49 0.46 0.49 0.55 0.4 0.52 0.51 0.66 0.59 0.51
0.72 0.68 0.52 0.53 0.68 0.63 0.58 0.5 0.53 0.62 0.48 0.5 0.5 1.0 0.61 0.54 0.46 0.55 0.48 0.45 0.5 0.52 0.47 0.6 0.51 0.53 0.54 0.69 0.64 0.5
0.6 0.56 0.51 0.53 0.52 0.48 0.44 0.54 0.47 0.47 0.45 0.41 0.46 1.0 0.52 0.46 0.55 0.6 0.4 0.36 0.42 0.43 0.44 0.46 0.38 0.38 0.38 0.54 0.56 0.54
0.71 0.76 0.62 0.68 0.58 0.53 0.5 0.59 0.51 0.54 0.49 0.5 0.53 1.0 0.58 0.59 0.56 0.58 0.49 0.43 0.56 0.55 0.54 0.58 0.5 0.52 0.52 0.65 0.59 0.54
0.7 0.7 0.56 0.53 0.63 0.58 0.57 0.48 0.56 0.61 0.51 0.58 0.47 1.0 0.58 0.59 0.52 0.55 0.48 0.47 0.53 0.53 0.59 0.6 0.54 0.56 0.58 0.68 0.67 0.51
1.0 0.84 0.62 0.66 0.73 0.63 0.61 0.45 0.65 0.7 0.58 0.63 0.51 0.97 0.65 0.6 0.6 0.43 0.51 0.51 0.53 0.54 0.69 0.66 0.55 0.59 0.6 0.76 0.71 0.57
0.84 0.83 0.75 0.67 0.85 0.7 0.64 0.66 0.74 0.75 0.71 0.69 0.62 1.0 0.71 0.72 0.7 0.73 0.61 0.57 0.67 0.69 0.69 0.72 0.64 0.7 0.71 0.8 0.79 0.63
0.73 0.77 0.63 0.65 0.72 0.65 0.59 0.65 0.55 0.55 0.53 0.58 0.55 1.0 0.67 0.67 0.66 0.63 0.49 0.5 0.55 0.56 0.56 0.6 0.58 0.59 0.59 0.66 0.61 0.53
0.9 0.8 0.7 0.69 0.82 0.7 0.73 0.63 0.69 0.64 0.63 0.71 0.66 1.0 0.74 0.73 0.76 0.6 0.62 0.63 0.67 0.68 0.64 0.79 0.72 0.68 0.69 0.77 0.78 0.65
0.67 0.68 0.54 0.53 0.64 0.57 0.51 0.48 0.5 0.55 0.49 0.51 0.45 1.0 0.57 0.57 0.53 0.5 0.45 0.44 0.51 0.51 0.46 0.54 0.48 0.54 0.52 0.62 0.61 0.53
0.75 0.77 0.64 0.65 0.78 0.68 0.64 0.71 0.62 0.66 0.59 0.62 0.62 1.0 0.75 0.77 0.73 0.68 0.55 0.56 0.62 0.63 0.58 0.71 0.63 0.61 0.68 0.76 0.74 0.69
0.72 0.71 0.56 0.6 0.69 0.66 0.67 0.56 0.6 0.65 0.61 0.62 0.6 1.0 0.7 0.7 0.67 0.61 0.51 0.57 0.56 0.56 0.64 0.67 0.56 0.61 0.62 0.74 0.69 0.62
0.59 0.66 0.51 0.5 0.55 0.57 0.4 0.39 0.43 0.44 0.41 0.41 0.35 1.0 0.5 0.52 0.47 0.44 0.38 0.33 0.43 0.4 0.3 0.44 0.38 0.42 0.39 0.47 0.53 0.5
0.84 0.83 0.7 0.71 0.72 0.67 0.64 0.68 0.64 0.66 0.68 0.66 0.63 1.0 0.72 0.67 0.68 0.68 0.51 0.58 0.6 0.66 0.75 0.64 0.63 0.68 0.69 0.78 0.79 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)