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Heatmap: Cluster_172 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.18 0.1 0.15 0.29 0.4 -0.3 -0.15 0.32 0.1 0.2 0.0 0.04 -0.01 -0.28 -0.28 -0.14 -0.05 -0.21 -0.11 -0.32 -0.06 -0.1 -0.45 -0.19 -0.13 -0.02 0.13 0.22 0.3 -0.1
0.21 0.12 0.25 0.34 0.45 -0.32 -0.12 -0.17 0.3 0.39 -0.05 0.07 -0.38 0.0 -0.64 -0.33 -0.58 -0.41 -0.14 -0.24 0.16 -0.02 -0.56 -0.09 0.22 0.14 0.27 0.3 0.31 -0.47
0.14 0.18 0.01 0.19 0.01 -0.13 -0.14 0.14 -0.02 -0.01 -0.17 -0.08 -0.04 0.25 -0.02 0.03 -0.16 -0.09 -0.22 -0.3 -0.16 -0.07 0.16 -0.03 0.03 -0.04 0.06 0.24 0.15 -0.14
0.49 0.35 -0.01 0.21 0.48 -0.33 -0.51 -0.34 -0.17 0.36 -0.14 -0.23 -0.27 0.25 -0.24 -0.24 -0.38 0.49 -0.26 -0.3 -0.14 -0.3 0.14 -0.1 -0.01 0.02 -0.0 0.07 0.36 -0.11
0.64 0.47 0.35 0.14 0.57 -0.53 -1.05 -0.42 0.03 0.27 0.0 -0.21 -0.35 0.37 -0.41 -0.54 -0.47 -0.65 -0.23 -0.21 -0.17 -0.18 -0.4 -0.21 -0.19 0.06 0.01 0.19 0.66 0.62
0.25 0.26 0.27 0.24 0.49 -0.29 -0.51 0.05 0.09 0.29 -0.21 -0.23 -0.38 0.16 -0.22 -0.15 -0.24 -0.37 -0.21 -0.29 -0.09 -0.22 -0.62 -0.17 -0.09 0.23 0.24 0.3 0.41 0.15
0.12 0.25 0.16 0.01 0.3 -0.53 -0.39 -0.17 0.13 0.36 -0.03 -0.01 -0.43 -0.04 0.01 -0.34 -0.15 -0.36 -0.16 -0.27 -0.04 -0.01 -0.03 -0.11 -0.07 0.13 0.26 0.35 0.37 0.1
0.2 0.33 0.08 0.21 0.12 -0.14 -0.18 0.13 0.0 0.02 -0.14 -0.05 -0.05 0.32 -0.17 -0.01 -0.04 0.02 -0.21 -0.25 -0.18 -0.11 0.03 -0.04 -0.09 -0.17 -0.05 0.12 0.06 0.01
0.01 0.0 -0.23 0.23 1.02 0.08 -0.54 0.35 -0.01 -0.01 -0.48 -0.25 -0.2 0.27 -0.32 -0.46 -0.2 -0.13 -0.16 -0.33 -0.06 -0.25 -0.78 -0.44 -0.21 0.0 0.09 0.45 0.45 0.6
0.08 0.1 0.01 0.16 0.05 -0.09 -0.2 0.02 -0.17 0.02 -0.12 -0.14 -0.06 0.17 0.07 -0.01 0.09 0.11 -0.25 -0.24 0.02 -0.1 0.17 -0.12 0.01 -0.04 0.16 0.18 -0.04 0.01
0.24 0.14 0.2 0.3 0.13 -0.24 -0.13 0.29 0.17 0.04 0.02 -0.06 -0.07 -0.41 -0.18 -0.14 -0.13 -0.06 -0.1 -0.3 -0.16 -0.21 -0.16 -0.22 -0.04 -0.08 0.07 0.27 0.2 0.26
0.24 0.45 0.14 0.24 0.26 -0.36 -0.41 -0.07 -0.14 0.03 -0.1 -0.2 -0.11 0.38 -0.27 -0.21 -0.09 0.14 -0.22 -0.46 -0.07 -0.07 -0.04 -0.12 -0.07 -0.08 0.14 0.27 0.3 -0.05
0.25 0.27 0.17 0.49 0.41 -0.43 -0.33 0.09 -0.27 0.09 -0.28 -0.2 -0.08 0.25 -0.3 -0.2 -0.2 -0.22 -0.09 -0.22 -0.04 -0.03 -0.29 0.03 0.02 -0.07 0.12 0.34 0.26 -0.14
0.14 0.22 0.08 0.23 0.12 -0.51 -0.44 0.04 -0.06 0.06 -0.01 -0.2 0.08 0.07 -0.29 -0.12 -0.02 0.08 -0.04 -0.2 0.12 -0.05 -0.1 0.08 -0.19 0.01 0.21 0.3 0.09 -0.03
0.11 0.12 0.24 0.26 0.44 -0.24 -0.32 -0.01 -0.07 0.04 -0.23 -0.25 0.04 0.45 -0.14 -0.3 -0.21 -0.09 -0.23 -0.23 -0.07 -0.11 0.25 -0.28 -0.21 -0.15 -0.05 0.58 0.08 -0.03
0.23 0.47 0.07 0.3 0.28 -0.02 -0.44 0.02 -0.3 0.02 -0.28 -0.15 0.26 0.75 -0.3 -0.15 0.06 -0.07 -0.46 -0.47 -0.38 -0.19 -0.18 -0.41 -0.14 -0.1 -0.15 0.34 0.12 0.31
0.14 0.19 0.12 0.23 0.21 -0.25 -0.15 0.02 -0.05 0.05 -0.05 -0.1 -0.09 0.28 -0.07 -0.03 -0.08 -0.05 -0.12 -0.17 0.01 -0.06 0.01 -0.17 -0.06 -0.09 0.1 0.18 0.06 -0.23
0.16 0.09 0.08 0.46 0.1 -0.27 -0.22 0.09 0.17 0.15 0.13 -0.05 0.02 -0.07 -0.1 -0.09 -0.05 -0.19 -0.19 -0.24 -0.2 -0.12 -0.21 -0.23 0.01 -0.07 0.12 0.21 0.16 0.05
-0.07 0.15 0.11 0.19 0.84 -0.22 -0.37 0.03 -0.13 0.33 -0.26 -0.22 0.02 0.19 -0.3 -0.53 -0.53 -0.19 -0.31 -0.59 -0.25 -0.19 -0.21 -0.02 -0.09 -0.16 0.15 0.68 0.47 0.27
Spov3_chr2.01968 (NF-YB11)
 0.26 0.34 0.13 0.15 0.27 0.08 -0.2 0.02 -0.4 -0.33 -0.2 -0.18 -0.07 0.38 -0.34 -0.1 -0.1 0.32 -0.1 -0.34 -0.08 -0.02 0.07 0.0 0.0 -0.04 -0.13 0.28 0.09 -0.24
0.1 0.21 0.11 0.25 0.2 -0.21 -0.36 -0.01 -0.0 0.28 -0.03 0.1 0.17 -0.11 -0.12 -0.2 -0.29 -0.43 -0.28 -0.12 -0.06 0.04 -0.55 -0.1 -0.05 -0.05 0.15 0.37 0.35 0.15
0.22 0.16 0.09 0.2 0.4 -0.34 -0.32 -0.03 0.25 0.37 0.0 -0.1 -0.21 0.16 -0.31 -0.25 -0.36 -0.18 -0.02 -0.17 -0.0 -0.07 -0.08 -0.15 -0.07 0.05 0.15 0.16 0.19 -0.21
0.2 0.28 0.16 0.3 0.18 -0.21 -0.45 0.03 -0.05 -0.0 -0.12 -0.21 -0.35 0.22 -0.25 -0.13 -0.3 -0.1 -0.15 -0.29 0.08 -0.16 -0.15 -0.04 -0.0 0.08 0.05 0.24 0.4 0.28
0.32 0.35 0.1 0.28 0.22 0.02 -0.22 -0.25 -0.17 -0.01 -0.13 -0.26 -0.26 0.28 -0.19 -0.09 -0.05 0.04 -0.12 -0.22 -0.03 -0.11 0.01 -0.07 -0.05 0.06 0.05 0.14 0.12 -0.08
0.64 0.56 0.19 0.08 0.46 -0.74 -0.52 -0.57 -0.14 0.11 -0.2 -0.3 -0.05 0.68 -0.43 -0.25 -0.41 0.29 -0.24 -0.37 -0.14 -0.27 0.34 -0.11 -0.19 -0.02 0.02 0.39 0.13 -0.33
0.2 -0.01 0.08 0.41 0.7 -0.01 -0.32 0.15 -0.1 0.16 -0.24 -0.19 -0.24 0.44 -0.28 -0.36 -0.27 -0.45 -0.22 -0.33 -0.25 -0.29 -0.21 -0.03 -0.16 -0.04 0.06 0.5 0.24 0.19
Spov3_chr3.02424 (atPub30)
 0.77 0.47 0.05 0.13 0.72 -0.41 -0.4 -0.39 -0.31 -0.09 -0.28 -0.48 -0.3 0.56 -0.51 -0.32 -0.42 0.22 -0.12 -0.36 -0.18 -0.15 0.24 -0.04 -0.08 -0.13 -0.05 0.48 0.19 -0.19
0.24 0.18 0.21 0.19 0.29 -0.44 -0.29 -0.07 0.06 0.18 0.0 -0.0 -0.3 0.31 -0.12 -0.32 -0.27 -0.34 -0.06 -0.22 0.03 0.06 -0.27 -0.35 -0.02 0.01 0.23 0.31 0.29 -0.06
0.32 0.38 0.16 0.29 0.43 -0.22 -0.39 -0.3 -0.11 -0.07 -0.23 -0.17 -0.12 0.27 -0.16 -0.15 -0.22 0.22 -0.18 -0.3 0.02 -0.22 0.03 0.04 -0.1 0.07 0.1 0.22 0.16 -0.29
0.08 0.19 0.16 0.16 0.1 -0.08 -0.05 0.27 0.16 0.01 -0.09 -0.07 -0.25 0.12 -0.15 0.04 0.03 -0.41 -0.24 -0.18 -0.06 -0.15 -0.46 0.05 0.01 0.02 0.14 0.25 0.16 -0.08
0.19 0.2 0.23 0.41 -0.14 -0.09 -0.19 0.46 0.23 0.17 -0.13 -0.11 -0.29 0.51 -0.2 -0.09 -0.17 -0.15 -0.35 -0.38 -0.15 -0.25 -0.04 -0.24 -0.17 -0.1 -0.1 0.3 0.1 -0.08
-0.07 -0.24 0.29 0.57 0.14 -0.42 -0.2 0.23 0.04 0.22 0.03 -0.16 -0.06 0.13 -0.08 -0.13 0.03 -0.69 -0.07 -0.26 -0.02 -0.16 -0.23 -0.04 0.11 -0.01 0.11 0.35 -0.06 0.08
0.18 0.32 0.14 0.14 0.25 -0.09 -0.14 0.3 -0.42 -0.18 -0.16 -0.13 -0.06 0.3 -0.09 -0.09 0.04 0.38 -0.3 -0.39 -0.18 -0.08 0.22 0.01 -0.03 -0.17 -0.14 0.34 0.03 -0.54
0.04 0.18 0.11 0.22 0.07 -0.23 -0.22 0.4 0.06 0.19 -0.06 -0.03 -0.17 0.28 -0.14 -0.15 -0.17 -0.38 -0.15 -0.3 -0.04 -0.15 -0.19 0.03 -0.08 0.02 -0.02 0.4 0.24 -0.15
0.1 0.38 0.17 0.11 0.37 -0.12 -0.3 -0.16 -0.16 0.16 -0.15 -0.29 -0.05 0.31 -0.23 -0.26 -0.1 0.36 -0.32 -0.37 -0.06 -0.15 0.01 -0.1 -0.23 -0.16 0.13 0.26 0.2 0.14
0.35 0.3 0.09 0.57 0.23 -0.23 -0.51 -0.41 -0.16 0.21 -0.12 -0.22 -0.17 0.18 -0.38 -0.25 -0.31 0.42 -0.45 -0.34 -0.01 -0.35 -0.01 -0.15 -0.04 -0.03 0.16 0.12 0.35 0.32
0.19 0.17 0.07 0.05 0.55 0.06 -0.2 -0.08 -0.19 0.07 -0.1 -0.04 -0.08 0.27 -0.02 -0.07 -0.19 0.02 -0.33 -0.73 -0.35 -0.35 -0.15 0.05 -0.08 -0.11 0.11 0.39 0.24 0.22
0.17 0.15 -0.06 0.16 0.17 -0.1 -0.19 0.02 -0.17 -0.07 -0.16 -0.14 -0.04 0.36 -0.05 -0.11 0.01 0.35 -0.13 -0.23 -0.1 -0.14 0.23 -0.06 -0.07 0.0 0.02 0.08 -0.04 -0.07
Spov3_chr4.02710 (emb1427)
 0.3 0.24 0.11 0.08 0.3 -0.05 -0.28 -0.18 -0.03 0.17 -0.13 0.02 -0.03 0.29 -0.05 -0.18 -0.07 -0.43 -0.11 -0.31 -0.04 -0.11 -0.43 -0.14 -0.26 0.1 0.16 0.25 0.28 0.07
0.15 0.35 0.13 0.15 0.26 -0.33 -0.51 -0.12 -0.21 0.08 -0.36 -0.24 -0.05 0.54 -0.09 -0.21 -0.03 -0.02 -0.13 -0.43 -0.01 -0.17 -0.15 -0.04 -0.07 -0.06 0.16 0.14 0.25 0.4
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0.08 0.05 0.12 0.03 0.13 -0.2 -0.14 0.2 -0.03 0.06 -0.02 -0.03 -0.12 0.1 -0.19 -0.11 -0.11 -0.45 -0.14 -0.22 -0.03 -0.09 -0.04 -0.08 0.05 -0.01 0.14 0.31 0.26 0.22
0.26 0.21 0.09 0.11 0.23 -0.18 -0.06 0.06 -0.08 0.08 -0.14 -0.12 -0.16 0.08 -0.07 -0.16 -0.1 -0.06 -0.16 -0.14 -0.02 -0.1 -0.06 -0.22 -0.02 0.02 0.12 0.12 0.17 0.11
0.24 0.25 0.03 0.21 0.25 -0.08 -0.18 -0.15 -0.0 0.11 -0.09 -0.1 -0.34 0.32 -0.2 -0.06 -0.11 -0.11 -0.17 -0.32 -0.01 -0.12 -0.22 -0.06 -0.15 0.07 0.13 0.24 0.25 0.02
0.25 0.22 0.36 0.43 0.3 -0.31 -0.35 0.44 0.08 0.16 -0.05 -0.11 0.06 -0.57 -0.42 -0.27 -0.34 -0.06 -0.21 -0.22 -0.01 -0.07 -0.4 -0.49 -0.09 -0.03 0.17 0.35 0.13 0.23
0.28 0.29 0.11 0.27 0.11 -0.13 -0.23 -0.2 -0.1 0.11 -0.15 -0.11 -0.09 0.48 -0.21 -0.06 -0.08 0.03 -0.35 -0.27 -0.03 -0.13 -0.37 -0.08 -0.08 -0.1 -0.06 0.26 0.22 0.25
0.16 0.3 0.2 0.36 0.21 -0.47 -0.5 0.17 -0.05 0.19 -0.2 -0.22 -0.2 0.15 -0.3 -0.2 -0.19 -0.16 -0.1 -0.3 0.03 0.04 0.17 0.02 -0.09 -0.13 0.18 0.34 0.28 -0.27
0.17 0.12 0.06 -0.0 0.13 -0.11 -0.07 0.1 -0.06 -0.04 -0.08 -0.12 -0.09 0.16 -0.07 -0.0 -0.07 0.29 -0.11 -0.17 0.02 0.04 0.16 -0.11 -0.02 -0.02 -0.02 0.07 -0.04 -0.25
0.22 0.32 0.01 0.25 0.39 -0.18 -0.27 0.08 -0.16 0.04 -0.08 -0.23 -0.33 0.01 -0.21 -0.14 -0.09 -0.69 -0.16 -0.45 -0.26 -0.13 -0.08 0.24 0.06 0.02 0.08 0.41 0.41 0.23
0.06 0.2 0.2 0.17 0.19 -0.18 -0.27 0.18 0.01 0.39 -0.08 -0.07 -0.16 -0.05 -0.36 -0.16 -0.28 -0.07 -0.17 -0.26 -0.05 -0.18 -0.51 0.0 -0.04 -0.04 0.04 0.5 0.26 0.2
0.77 0.52 0.42 0.38 0.96 -0.89 -1.23 -0.28 -0.04 0.29 -0.29 -0.41 -0.18 0.37 -1.07 -0.92 -1.14 0.38 -0.56 -0.91 -0.2 -0.43 0.35 -0.1 -0.06 -0.31 -0.02 0.83 0.47 -0.24
0.22 0.07 0.08 0.1 0.24 -0.26 -0.16 0.05 -0.03 0.12 0.06 -0.02 -0.04 -0.05 -0.07 -0.04 0.04 -0.19 -0.07 -0.15 -0.06 0.01 -0.17 -0.15 -0.01 0.04 0.14 0.11 0.14 -0.07
0.21 0.33 0.03 0.24 0.3 -0.08 -0.13 0.07 -0.05 0.13 -0.32 -0.1 0.01 0.39 -0.13 -0.09 -0.17 -0.32 -0.33 -0.35 -0.16 -0.18 -0.07 -0.01 -0.14 -0.07 0.08 0.2 0.12 0.18
0.13 0.25 0.03 0.04 0.15 -0.2 -0.26 -0.12 -0.11 0.15 -0.02 -0.1 -0.09 0.35 -0.07 0.05 0.02 0.25 -0.27 -0.38 -0.05 -0.21 0.12 -0.06 -0.11 0.0 0.06 0.09 0.12 -0.04
0.23 0.03 0.24 0.46 0.2 -0.43 -0.22 -0.01 -0.01 0.26 -0.0 -0.08 -0.17 0.13 -0.21 -0.22 -0.04 -0.31 -0.18 -0.26 -0.06 -0.17 -0.23 -0.16 -0.02 0.04 0.17 0.27 0.13 0.18
-0.15 0.02 0.07 0.21 0.78 -0.28 -0.38 0.27 -0.09 0.48 -0.13 -0.29 0.01 0.12 -0.5 -0.47 -0.24 -0.21 -0.06 -0.35 -0.33 -0.31 -0.29 0.07 0.03 -0.04 0.26 0.54 0.2 0.08
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0.27 0.12 0.07 -0.06 0.19 -0.21 -0.06 0.06 0.13 0.06 0.03 0.03 -0.13 -0.03 -0.14 0.16 -0.14 -0.63 -0.12 -0.16 -0.13 -0.15 -0.24 0.1 0.11 0.02 0.09 0.31 0.29 -0.2
0.03 0.1 0.27 0.5 -0.02 -0.45 -0.21 0.57 -0.1 -0.02 -0.07 -0.05 -0.05 -0.33 -0.24 -0.21 -0.02 -0.12 -0.13 -0.27 0.02 -0.15 -0.18 -0.18 0.03 -0.01 0.11 0.35 0.11 0.18
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0.28 0.29 0.17 0.29 0.24 -0.26 -0.57 -0.25 -0.3 -0.05 -0.27 -0.25 -0.04 0.45 -0.28 -0.03 -0.07 0.47 -0.36 -0.23 0.12 -0.19 0.36 -0.08 -0.02 -0.22 -0.05 0.28 0.02 -0.17
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Spov3_chr6.01484 (AtBBE18)
 0.2 0.2 0.05 0.14 0.69 0.0 -0.13 -0.03 -0.05 0.24 -0.12 -0.18 -0.17 -0.04 -0.42 -0.25 -0.18 -0.34 -0.04 -0.15 -0.34 -0.23 -0.84 0.08 -0.14 0.05 -0.03 0.6 0.35 0.21
0.06 0.16 0.11 0.26 -0.06 -0.33 -0.31 0.17 -0.11 -0.03 -0.16 -0.18 -0.02 0.12 -0.12 -0.07 -0.01 0.18 -0.15 -0.18 0.05 -0.06 0.15 0.05 -0.04 -0.05 0.07 0.21 0.04 0.02
Spov3_S02.00076 (ROPGAP4)
 -0.17 0.1 -0.09 -0.17 0.48 -0.08 -0.01 0.29 -0.06 0.4 0.02 -0.04 -0.0 -0.22 -0.35 -0.26 0.01 -0.47 -0.04 -0.13 -0.1 -0.3 -0.53 -0.12 -0.04 0.07 0.24 0.48 0.15 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.