1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_172 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
5.57 5.29 5.48 6.01 6.51 4.0 4.46 6.16 5.27 5.67 4.95 5.08 4.88 4.05 4.07 4.49 4.75 4.26 4.58 3.94 4.73 4.61 3.61 4.31 4.5 4.87 5.41 5.76 6.06 4.61
3.29 3.1 3.39 3.61 3.89 2.29 2.63 2.54 3.5 3.73 2.75 2.98 2.19 2.85 1.82 2.26 1.91 2.14 2.58 2.42 3.18 2.81 1.93 2.68 3.32 3.14 3.42 3.5 3.53 2.05
9.43 9.7 8.63 9.76 8.64 7.82 7.76 9.45 8.45 8.53 7.63 8.12 8.31 10.18 8.45 8.77 7.66 8.07 7.35 6.96 7.65 8.18 9.55 8.37 8.72 8.32 8.93 10.13 9.5 7.76
18.89 17.14 13.4 15.58 18.79 10.72 9.48 10.64 11.96 17.32 12.21 11.46 11.19 16.07 11.44 11.38 10.39 18.95 11.23 10.98 12.22 10.94 14.82 12.61 13.41 13.72 13.45 14.19 17.36 12.48
4.9 4.35 4.0 3.47 4.68 2.18 1.52 2.36 3.2 3.79 3.15 2.71 2.47 4.06 2.36 2.16 2.28 2.01 2.69 2.71 2.79 2.78 2.38 2.72 2.76 3.29 3.18 3.59 4.98 4.84
4.02 4.06 4.08 3.98 4.73 2.76 2.38 3.49 3.6 4.13 2.91 2.88 2.59 3.78 2.9 3.05 2.87 2.61 2.93 2.76 3.17 2.9 2.2 3.01 3.18 3.97 4.0 4.17 4.49 3.75
3.42 3.74 3.53 3.18 3.89 2.18 2.41 2.81 3.44 4.04 3.09 3.13 2.34 3.07 3.18 2.49 2.84 2.46 2.83 2.62 3.07 3.14 3.1 2.92 3.01 3.44 3.77 4.03 4.07 3.37
23.38 25.56 21.6 23.55 22.13 18.44 18.03 22.23 20.37 20.67 18.54 19.63 19.64 25.42 18.07 20.23 19.86 20.63 17.64 17.16 18.0 18.89 20.73 19.76 19.14 18.06 19.74 22.16 21.18 20.47
0.76 0.76 0.65 0.89 1.53 0.8 0.52 0.97 0.75 0.75 0.54 0.63 0.66 0.91 0.61 0.55 0.66 0.69 0.67 0.6 0.73 0.63 0.44 0.56 0.66 0.76 0.8 1.03 1.03 1.14
12.21 12.32 11.63 12.89 11.91 10.82 10.01 11.67 10.24 11.71 10.62 10.42 11.03 12.96 12.14 11.41 12.25 12.41 9.72 9.76 11.68 10.78 12.93 10.63 11.62 11.22 12.9 13.02 11.21 11.59
6.95 6.49 6.78 7.28 6.48 5.02 5.38 7.23 6.63 6.08 5.98 5.65 5.61 4.43 5.22 5.35 5.39 5.66 5.5 4.8 5.3 5.11 5.27 5.07 5.76 5.58 6.22 7.1 6.79 7.05
3.85 4.43 3.58 3.84 3.89 2.54 2.45 3.11 2.96 3.33 3.03 2.83 3.01 4.24 2.71 2.82 3.07 3.6 2.8 2.37 3.1 3.11 3.17 3.0 3.1 3.07 3.59 3.92 4.01 3.14
7.01 7.12 6.63 8.28 7.83 4.38 4.69 6.25 4.88 6.27 4.84 5.11 5.58 6.99 4.77 5.14 5.13 5.04 5.55 5.05 5.73 5.78 4.81 5.99 5.96 5.62 6.4 7.44 7.05 5.34
15.54 16.38 14.94 16.49 15.36 9.89 10.39 14.45 13.5 14.69 13.98 12.3 14.94 14.8 11.51 12.96 13.91 14.95 13.68 12.24 15.33 13.65 13.15 14.87 12.32 14.16 16.33 17.41 14.96 13.8
32.04 32.25 35.08 35.58 40.47 25.15 23.77 29.51 28.33 30.55 25.38 25.07 30.61 40.64 27.03 24.22 25.78 27.95 25.4 25.38 28.26 27.62 35.41 24.49 25.67 26.89 28.77 44.5 31.4 29.09
1.76 2.08 1.57 1.85 1.82 1.48 1.1 1.52 1.22 1.52 1.24 1.35 1.8 2.52 1.22 1.35 1.56 1.43 1.09 1.08 1.15 1.31 1.32 1.13 1.36 1.4 1.35 1.9 1.63 1.85
29.16 30.15 28.58 31.01 30.44 22.17 23.72 26.82 25.57 27.33 25.52 24.64 24.8 32.1 25.16 25.91 24.94 25.57 24.22 23.5 26.55 25.24 26.65 23.52 25.29 24.86 28.34 29.93 27.5 22.56
5.49 5.24 5.22 6.76 5.27 4.07 4.22 5.25 5.53 5.45 5.39 4.76 5.01 4.7 4.6 4.64 4.76 4.32 4.32 4.16 4.29 4.52 4.26 4.19 4.95 4.7 5.36 5.71 5.52 5.11
4.86 5.69 5.52 5.85 9.13 4.39 3.96 5.23 4.67 6.44 4.27 4.4 5.2 5.83 4.14 3.54 3.53 4.47 4.13 3.4 4.31 4.48 4.42 5.03 4.8 4.56 5.67 8.21 7.06 6.17
Spov3_chr2.01968 (NF-YB11)
 23.23 24.5 21.25 21.41 23.29 20.51 16.8 19.57 14.64 15.45 16.9 17.13 18.44 25.12 15.35 18.07 18.11 24.2 18.12 15.31 18.37 19.14 20.26 19.39 19.4 18.77 17.65 23.44 20.61 16.39
2.72 2.93 2.73 3.02 2.91 2.19 1.98 2.52 2.53 3.08 2.48 2.72 2.85 2.35 2.33 2.2 2.07 1.88 2.08 2.33 2.43 2.6 1.73 2.37 2.45 2.45 2.81 3.27 3.23 2.8
20.08 19.16 18.33 19.77 22.66 13.56 13.76 16.79 20.47 22.26 17.25 16.04 14.87 19.26 13.85 14.44 13.42 15.13 16.95 15.31 17.16 16.39 16.29 15.55 16.4 17.84 19.12 19.21 19.58 14.91
6.96 7.34 6.79 7.47 6.88 5.24 4.44 6.19 5.84 6.06 5.56 5.23 4.75 7.05 5.09 5.54 4.92 5.64 5.48 4.96 6.42 5.44 5.48 5.89 6.05 6.43 6.26 7.14 7.99 7.34
7.44 7.63 6.39 7.26 6.95 6.06 5.14 5.01 5.31 5.95 5.47 4.98 4.99 7.24 5.23 5.62 5.78 6.13 5.51 5.15 5.87 5.54 6.03 5.7 5.79 6.22 6.21 6.6 6.51 5.64
30.35 28.88 22.26 20.66 26.8 11.68 13.62 13.15 17.67 21.11 17.06 15.86 18.88 31.22 14.49 16.44 14.66 23.91 16.55 15.09 17.68 16.16 24.78 18.15 17.15 19.26 19.86 25.52 21.44 15.52
17.59 15.31 16.18 20.35 24.88 15.26 12.33 17.07 14.36 17.12 13.05 13.48 13.03 20.88 12.62 12.0 12.72 11.26 13.15 12.2 12.94 12.53 13.28 15.06 13.79 14.94 16.04 21.77 18.15 17.55
Spov3_chr3.02424 (atPub30)
 10.04 8.11 6.1 6.45 9.65 4.42 4.44 4.47 4.75 5.53 4.84 4.21 4.76 8.66 4.13 4.71 4.38 6.86 5.41 4.58 5.18 5.28 6.92 5.69 5.54 5.37 5.68 8.18 6.69 5.15
10.92 10.48 10.67 10.52 11.3 6.83 7.55 8.82 9.66 10.49 9.25 9.23 7.49 11.42 8.52 7.4 7.67 7.28 8.84 7.95 9.44 9.65 7.64 7.25 9.12 9.28 10.85 11.45 11.33 8.86
9.48 9.87 8.5 9.26 10.22 6.52 5.79 6.17 7.04 7.22 6.5 6.77 6.97 9.13 6.78 6.86 6.5 8.86 6.72 6.17 7.68 6.52 7.73 7.83 7.09 7.97 8.14 8.86 8.51 6.23
15.19 16.49 16.15 16.14 15.44 13.64 13.9 17.42 16.05 14.53 13.57 13.69 12.14 15.63 12.96 14.81 14.7 10.85 12.16 12.73 13.79 12.97 10.5 14.93 14.5 14.59 15.88 17.19 16.16 13.64
9.35 9.42 9.63 10.88 7.43 7.67 7.2 11.29 9.64 9.22 7.47 7.59 6.68 11.68 7.15 7.7 7.3 7.37 6.44 6.28 7.41 6.87 7.95 6.95 7.29 7.62 7.64 10.08 8.77 7.76
3.64 3.24 4.68 5.66 4.22 2.87 3.34 4.48 3.94 4.46 3.89 3.43 3.67 4.2 3.62 3.49 3.9 2.38 3.64 3.19 3.78 3.42 3.26 3.73 4.14 3.8 4.14 4.89 3.67 4.04
123.23 135.68 119.8 119.65 129.49 102.35 98.77 134.23 81.68 96.38 97.3 99.4 104.34 134.47 102.55 102.25 111.83 142.06 88.26 82.99 96.01 103.03 126.6 109.95 106.71 96.63 98.97 137.5 111.18 74.92
10.63 11.73 11.19 12.04 10.91 8.85 8.91 13.69 10.8 11.79 9.93 10.12 9.2 12.61 9.42 9.37 9.18 7.98 9.37 8.4 10.06 9.35 9.1 10.55 9.8 10.55 10.23 13.68 12.2 9.35
1.17 1.42 1.23 1.18 1.41 1.01 0.89 0.98 0.98 1.22 0.98 0.89 1.05 1.35 0.93 0.92 1.02 1.4 0.87 0.84 1.05 0.99 1.1 1.02 0.93 0.98 1.19 1.31 1.26 1.2
2.38 2.31 1.99 2.79 2.2 1.6 1.31 1.4 1.67 2.16 1.72 1.61 1.66 2.12 1.44 1.57 1.51 2.5 1.37 1.48 1.86 1.47 1.86 1.69 1.82 1.83 2.09 2.04 2.39 2.34
1.39 1.37 1.28 1.26 1.78 1.27 1.06 1.15 1.07 1.28 1.14 1.19 1.16 1.47 1.21 1.16 1.07 1.24 0.97 0.74 0.96 0.96 1.1 1.26 1.16 1.13 1.32 1.6 1.44 1.43
15.75 15.57 13.44 15.58 15.7 13.08 12.26 14.16 12.43 13.34 12.5 12.68 13.57 17.92 13.48 12.99 14.05 17.86 12.76 11.89 13.04 12.69 16.42 13.38 13.31 14.03 14.14 14.75 13.59 13.3
Spov3_chr4.02710 (emb1427)
 2.61 2.51 2.28 2.24 2.62 2.05 1.74 1.86 2.08 2.39 1.94 2.14 2.07 2.59 2.04 1.87 2.01 1.57 1.96 1.71 2.06 1.97 1.57 1.92 1.77 2.28 2.36 2.52 2.58 2.22
2.77 3.17 2.72 2.77 2.98 1.99 1.75 2.3 2.15 2.64 1.94 2.12 2.41 3.61 2.33 2.16 2.44 2.46 2.27 1.84 2.48 2.21 2.25 2.42 2.38 2.39 2.78 2.75 2.95 3.3
1.81 2.0 1.77 2.07 2.64 0.89 0.98 1.28 1.88 2.3 1.38 1.26 0.96 1.54 0.59 0.98 0.75 1.16 1.17 0.78 1.34 1.15 1.68 1.45 1.31 1.31 1.47 2.4 2.48 1.91
12.29 12.04 12.59 11.88 12.67 10.07 10.54 13.33 11.36 12.09 11.43 11.35 10.66 12.45 10.18 10.77 10.74 8.48 10.55 9.94 11.34 10.86 11.24 10.98 11.96 11.55 12.78 14.34 13.88 13.47
17.07 16.42 15.09 15.37 16.68 12.53 13.68 14.8 13.48 15.07 12.91 13.08 12.74 15.06 13.54 12.73 13.29 13.66 12.68 12.93 13.98 13.29 13.64 12.21 14.04 14.42 15.4 15.48 15.95 15.32
12.78 12.88 11.03 12.52 12.87 10.22 9.51 9.77 10.78 11.69 10.15 10.07 8.54 13.48 9.44 10.37 10.0 9.98 9.63 8.67 10.72 9.98 9.26 10.38 9.74 11.34 11.83 12.74 12.88 10.93
4.69 4.6 5.08 5.33 4.86 3.18 3.1 5.37 4.19 4.43 3.81 3.66 4.11 2.67 2.96 3.28 3.11 3.79 3.41 3.39 3.92 3.76 3.0 2.82 3.71 3.87 4.44 5.03 4.34 4.63
11.79 11.85 10.48 11.68 10.51 8.87 8.28 8.45 9.07 10.46 8.73 8.99 9.13 13.56 8.38 9.32 9.21 9.9 7.63 8.07 9.5 8.87 7.51 9.19 9.22 9.1 9.31 11.64 11.33 11.56
3.26 3.6 3.37 3.75 3.38 2.11 2.07 3.29 2.83 3.35 2.55 2.51 2.55 3.24 2.37 2.55 2.57 2.63 2.74 2.38 2.98 3.01 3.29 2.97 2.75 2.68 3.31 3.71 3.56 2.43
22.11 21.33 20.41 19.62 21.54 18.22 18.67 21.08 18.85 19.14 18.63 18.04 18.43 21.89 18.67 19.56 18.69 23.97 18.18 17.45 19.89 20.18 21.89 18.18 19.32 19.31 19.29 20.53 19.13 16.49
5.8 6.23 5.02 5.92 6.53 4.4 4.14 5.27 4.45 5.13 4.71 4.24 3.95 5.03 4.31 4.5 4.69 3.08 4.47 3.63 4.16 4.54 4.71 5.87 5.18 5.05 5.28 6.63 6.61 5.86
10.71 11.81 11.77 11.5 11.72 9.04 8.52 11.62 10.34 13.42 9.69 9.76 9.15 9.92 8.01 9.18 8.45 9.8 9.1 8.56 9.94 9.07 7.19 10.26 9.99 9.99 10.58 14.48 12.27 11.81
3.19 2.68 2.51 2.44 3.64 1.01 0.8 1.54 1.82 2.28 1.54 1.41 1.65 2.43 0.89 0.99 0.85 2.44 1.27 1.0 1.63 1.39 2.39 1.75 1.8 1.51 1.85 3.33 2.59 1.58
34.42 31.05 31.36 31.69 34.89 24.78 26.52 30.67 28.92 32.23 30.79 29.12 28.78 28.58 28.2 28.84 30.53 25.91 28.22 26.75 28.33 29.76 26.28 26.76 29.52 30.41 32.65 31.91 32.63 28.16
4.61 5.02 4.09 4.72 4.91 3.77 3.65 4.18 3.86 4.38 3.19 3.73 4.01 5.23 3.65 3.75 3.55 3.2 3.18 3.14 3.59 3.52 3.81 3.96 3.62 3.79 4.23 4.59 4.34 4.53
7.86 8.5 7.32 7.38 7.94 6.22 5.97 6.6 6.64 7.96 7.08 6.69 6.74 9.1 6.82 7.41 7.29 8.5 5.92 5.49 6.9 6.19 7.78 6.89 6.65 7.18 7.46 7.64 7.8 6.97
9.35 8.16 9.45 10.96 9.18 5.95 6.84 7.95 7.94 9.55 7.98 7.55 7.1 8.72 6.93 6.88 7.8 6.43 7.08 6.68 7.67 7.12 6.81 7.16 7.86 8.23 9.0 9.62 8.74 9.05
5.83 6.54 6.79 7.47 11.09 5.34 4.98 7.82 6.07 9.01 5.9 5.29 6.5 7.04 4.57 4.67 5.46 5.59 6.22 5.08 5.15 5.22 5.3 6.78 6.62 6.31 7.72 9.38 7.42 6.85
18.64 19.24 19.62 24.01 20.11 16.95 16.17 21.91 18.09 18.94 17.33 18.45 17.76 18.22 17.03 18.78 18.42 17.69 15.73 15.94 18.06 16.6 13.24 18.16 20.93 20.17 20.47 20.36 20.27 18.0
17.87 16.1 15.53 14.25 16.86 12.84 14.22 15.45 16.24 15.43 15.17 15.1 13.5 14.54 13.47 16.56 13.46 9.57 13.62 13.22 13.53 13.31 12.58 15.82 15.98 14.98 15.72 18.39 18.12 12.87
8.67 9.09 10.21 11.98 8.37 6.22 7.36 12.58 7.9 8.39 8.11 8.22 8.18 6.75 7.2 7.32 8.38 7.81 7.73 7.02 8.6 7.63 7.47 7.51 8.64 8.45 9.16 10.85 9.13 9.63
1.08 1.45 1.28 1.09 2.36 1.18 1.13 1.69 1.44 1.35 1.52 1.3 1.22 1.31 0.99 1.14 1.09 0.94 1.2 1.1 1.11 1.1 0.76 1.17 1.27 1.29 1.31 1.96 1.63 1.4
12.37 14.85 12.13 15.21 15.06 10.66 8.1 8.11 9.76 11.55 10.51 10.94 13.17 10.12 8.2 8.67 8.54 14.58 9.83 8.99 11.41 9.43 11.77 11.45 11.05 11.0 11.57 15.0 13.75 12.94
3.23 2.62 2.35 3.02 2.82 1.64 1.52 1.57 2.11 2.23 2.13 2.08 2.07 2.38 1.72 1.71 1.76 2.24 1.76 1.61 1.72 1.98 2.09 2.16 1.94 2.0 2.19 3.21 2.65 1.83
10.14 10.19 9.38 10.19 9.87 6.98 5.64 7.04 6.79 8.09 6.92 7.01 8.14 11.43 6.9 8.18 7.97 11.6 6.51 7.11 9.07 7.33 10.71 7.88 8.22 7.17 8.04 10.15 8.47 7.43
14.78 14.73 14.26 16.24 14.65 11.27 10.19 13.49 13.36 12.81 12.04 11.19 12.61 14.02 12.25 12.16 12.55 14.98 11.9 11.27 13.43 13.26 13.52 12.72 13.74 13.33 15.34 15.21 15.18 12.68
Spov3_chr6.01484 (AtBBE18)
 3.93 3.94 3.54 3.76 5.52 3.43 3.12 3.35 3.31 4.04 3.15 3.02 3.04 3.33 2.55 2.88 3.02 2.7 3.32 3.09 2.71 2.92 1.92 3.62 3.1 3.55 3.36 5.18 4.37 3.97
16.05 17.1 16.53 18.43 14.77 12.22 12.42 17.33 14.26 15.07 13.79 13.52 15.11 16.67 14.17 14.64 15.27 17.35 13.8 13.53 15.85 14.71 17.08 15.87 14.95 14.86 16.1 17.81 15.77 15.61
Spov3_S02.00076 (ROPGAP4)
 5.22 6.29 5.51 5.21 8.17 5.54 5.83 7.16 5.62 7.71 5.93 5.7 5.85 5.02 4.61 4.89 5.91 4.23 5.7 5.37 5.47 4.74 4.06 5.41 5.68 6.14 6.91 8.16 6.51 7.27

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)