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Heatmap: Cluster_56 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.08 -0.18 -0.13 0.04 -0.03 -0.14 -0.02 0.03 0.05 -0.15 -0.01 -0.08 0.01 0.28 0.28 0.35 0.24 -0.17 -0.06 -0.06 0.0 0.03 0.28 -0.03 0.04 -0.07 0.11 -0.19 -0.22 -0.38
Spov3_C0003.00067 (epsilon2-COP)
 -0.1 -0.21 -0.11 -0.02 0.02 -0.21 -0.06 0.25 -0.13 0.02 0.08 -0.07 0.1 0.2 0.23 0.12 0.19 0.01 0.07 0.04 0.13 0.16 -0.16 -0.21 0.04 0.1 0.21 -0.19 -0.4 -0.43
-0.04 -0.19 -0.11 -0.15 0.12 0.03 0.21 0.27 -0.02 -0.13 0.06 -0.0 -0.05 0.32 0.21 0.22 0.23 -0.16 -0.07 -0.22 0.04 -0.04 0.14 -0.11 -0.02 -0.05 0.05 -0.17 -0.24 -0.42
-0.29 -0.06 -0.49 -0.28 -0.23 -0.07 -0.26 0.15 -0.28 -0.2 -0.07 0.0 0.4 0.78 0.21 0.35 0.45 0.42 -0.24 -0.06 0.03 -0.1 0.25 0.12 -0.25 -0.06 -0.27 -0.25 -0.27 -0.4
-0.12 -0.24 -0.14 -0.25 0.05 -0.25 -0.08 -0.01 -0.16 0.0 -0.1 -0.14 0.37 0.52 0.09 0.29 0.26 0.24 -0.04 -0.04 -0.08 0.04 0.22 0.2 -0.03 -0.06 -0.05 -0.42 -0.3 -0.25
-0.27 -0.19 -0.19 -0.28 -0.15 -0.05 -0.22 0.11 -0.17 -0.14 0.06 0.19 0.17 0.2 0.36 0.47 0.29 0.1 -0.11 0.06 0.16 0.2 0.12 -0.15 0.12 -0.07 0.02 -0.33 -0.51 -0.35
-0.17 -0.19 -0.28 -0.65 0.06 0.19 0.22 0.06 -0.18 -0.25 0.06 -0.2 0.27 0.45 0.25 0.16 0.23 0.48 -0.11 -0.04 -0.05 0.06 -0.49 -0.1 -0.14 -0.01 -0.14 -0.05 -0.28 0.21
-0.3 -0.21 -0.03 0.26 -0.37 -0.24 -0.35 -0.34 -0.02 -0.26 0.01 -0.16 0.29 0.24 0.44 0.64 0.56 0.06 0.03 0.15 0.12 0.11 0.06 -0.07 -0.06 -0.02 -0.03 -0.49 -0.55 -0.35
Spov3_chr1.00592 (TRAPPC4)
 -0.33 -0.35 -0.21 -0.19 -0.03 -0.22 -0.1 0.28 0.12 -0.05 -0.0 0.14 0.2 -0.11 0.14 0.03 0.09 0.3 0.04 0.21 0.22 -0.05 0.12 -0.1 0.08 0.21 0.14 -0.28 -0.37 -0.35
-0.1 -0.2 -0.32 -0.22 -0.03 -0.04 -0.2 -0.15 -0.04 -0.03 0.18 -0.31 0.33 0.39 0.26 0.09 0.17 0.27 0.15 -0.07 0.16 -0.2 0.11 0.18 0.08 -0.01 0.13 -0.32 -0.28 -0.44
Spov3_chr1.02238 (TRAPPC5)
 -0.18 -0.07 -0.15 0.06 -0.03 -0.19 -0.18 -0.09 -0.02 0.03 0.09 -0.12 0.25 0.34 0.25 0.14 0.33 0.15 -0.19 0.03 0.08 0.11 -0.02 -0.09 0.07 -0.06 -0.01 -0.37 -0.26 -0.17
-0.77 -0.77 -0.51 -0.11 0.14 0.06 -0.24 -0.26 -0.05 0.29 0.16 -0.27 0.81 0.5 -0.05 0.05 0.13 0.29 0.05 0.08 0.0 -0.18 0.25 -0.39 -0.26 0.14 -0.03 -0.21 -0.47 0.36
-0.29 -0.22 -0.2 -0.06 -0.05 -0.23 -0.23 0.17 0.14 0.07 0.1 0.04 0.1 -0.04 0.09 0.22 0.02 0.09 0.09 0.19 0.14 0.17 -0.02 0.14 0.06 0.1 0.13 -0.29 -0.33 -0.42
-0.13 -0.15 -0.2 -0.22 0.06 -0.21 -0.24 -0.25 -0.07 0.04 0.14 -0.04 0.05 0.33 0.22 0.15 0.11 0.2 0.11 -0.0 0.07 -0.03 0.11 0.14 0.18 0.1 0.05 -0.26 -0.38 -0.17
-0.04 -0.09 -0.05 -0.04 -0.08 -0.06 0.05 0.03 -0.02 -0.03 -0.01 0.0 0.05 0.27 0.33 0.26 0.27 0.19 -0.01 0.04 0.0 0.07 -0.24 -0.15 -0.08 -0.07 0.03 -0.21 -0.32 -0.32
-0.96 -0.38 -0.57 -0.86 -0.33 -0.33 -0.26 -0.04 -0.43 -0.29 -0.02 -0.18 0.48 0.37 0.47 0.5 0.54 0.58 -0.26 0.03 0.32 0.19 0.15 0.42 0.26 0.25 0.13 -0.62 -0.61 -0.38
Spov3_chr1.04556 (tTRAPPC2(L))
 -0.22 -0.06 -0.26 -0.24 0.09 -0.13 -0.22 -0.14 -0.08 0.01 -0.0 -0.01 0.21 0.28 0.28 0.08 0.17 0.01 0.08 0.1 0.13 0.14 0.13 0.01 -0.04 0.05 0.2 -0.19 -0.37 -0.35
Spov3_chr1.04890 (TRAPPC2)
 -0.02 -0.08 -0.04 -0.1 0.04 -0.25 -0.1 -0.15 0.02 -0.04 0.0 -0.06 0.06 0.32 0.31 0.24 0.3 0.25 0.09 0.04 0.07 -0.06 -0.13 -0.17 -0.06 0.11 -0.03 -0.3 -0.38 -0.21
-0.37 -0.47 -0.3 -0.14 -0.05 -0.16 -0.09 -0.02 0.02 -0.03 0.19 0.12 0.19 0.04 0.26 0.24 0.38 0.36 0.05 0.17 0.12 0.14 -0.13 -0.14 0.09 0.05 0.07 -0.34 -0.44 -0.32
-0.07 -0.18 -0.14 -0.13 0.15 -0.16 -0.05 -0.06 0.01 -0.11 0.12 0.09 0.13 0.4 0.25 0.09 0.34 0.11 -0.03 0.01 -0.06 0.05 0.03 -0.1 -0.06 -0.07 -0.03 -0.22 -0.26 -0.33
-0.38 -0.2 -0.15 -0.31 0.3 -0.05 0.01 -0.17 -0.12 -0.01 0.01 -0.05 0.22 0.27 0.21 0.13 0.21 0.11 0.2 -0.01 0.19 0.05 0.04 -0.12 -0.22 0.11 0.11 -0.45 -0.45 0.09
-0.14 -0.1 -0.1 0.07 0.0 -0.1 -0.12 0.05 -0.08 -0.21 0.04 -0.06 0.08 0.27 0.3 0.16 0.22 -0.01 0.08 0.06 0.17 0.1 0.07 -0.17 0.04 0.14 0.2 -0.5 -0.47 -0.33
-0.46 -0.59 -0.56 -0.48 0.42 -0.29 -0.6 -0.42 -0.02 0.17 0.19 -0.08 0.64 0.37 0.28 0.44 0.53 0.06 0.16 -0.16 -0.09 -0.07 0.01 -0.04 0.24 0.14 0.08 -0.28 -0.75 -0.15
-0.51 -0.63 -0.36 -0.76 0.18 0.13 0.27 -0.39 -0.33 -0.3 0.32 -0.14 0.88 -0.06 0.43 0.35 0.43 0.46 0.17 0.27 0.2 0.22 -1.11 -0.35 -0.16 0.1 0.28 -0.65 -0.99 -0.06
-0.43 -0.72 -0.9 -1.12 0.53 -0.6 -0.94 -1.51 -0.26 -0.01 -0.27 0.08 0.69 0.98 1.0 0.71 0.95 0.51 0.11 -0.16 -0.6 -0.32 -0.04 -0.41 -0.01 0.46 0.43 -0.98 -1.0 -1.0
-1.23 -1.59 -0.38 -0.5 -0.8 0.26 0.08 -0.11 -0.06 -0.15 0.3 -0.79 0.92 -0.13 0.4 0.55 -0.15 0.02 0.35 0.45 0.51 0.81 -0.3 0.26 -0.11 -0.01 0.79 -0.66 -1.34 -1.66
-0.22 -0.27 -0.3 -0.31 -0.27 -0.16 0.15 0.01 0.05 -0.12 0.18 0.08 0.22 0.37 0.16 0.19 0.19 0.68 0.18 0.2 0.15 0.16 -0.39 -0.29 -0.02 0.01 0.06 -0.54 -0.61 -0.37
-0.08 -0.03 -0.25 -0.25 0.15 0.14 0.01 0.07 -0.24 -0.04 -0.11 -0.08 0.26 0.31 0.12 0.23 0.21 0.04 -0.0 -0.24 -0.04 -0.0 -0.08 0.12 0.03 0.01 -0.11 0.09 -0.18 -0.28
-0.29 -0.23 -0.14 -0.11 0.1 0.03 -0.03 0.03 -0.02 0.04 0.12 -0.0 0.18 0.03 0.2 0.2 0.22 -0.03 0.01 0.1 0.02 0.06 0.21 -0.1 0.03 0.05 0.17 -0.33 -0.39 -0.42
-0.17 -0.19 0.03 0.21 -0.04 -0.1 -0.08 0.01 0.0 -0.14 0.02 -0.06 0.17 0.03 0.24 0.26 0.2 -0.11 -0.06 -0.15 0.03 -0.01 0.07 -0.06 0.05 -0.03 0.07 -0.07 -0.17 -0.12
-0.22 -0.19 -0.39 -0.46 -0.46 -0.07 0.04 0.08 -0.51 -0.06 -0.07 -0.36 0.57 0.65 0.29 0.48 0.57 0.29 -0.09 0.06 0.24 0.15 -0.75 -0.01 -0.03 0.18 0.09 -0.48 -0.73 -0.18
-0.1 -0.06 -0.12 -0.09 -0.0 0.05 -0.0 -0.0 -0.07 -0.07 0.05 -0.03 0.14 0.15 0.19 0.1 0.16 -0.01 0.04 0.02 0.13 0.12 0.03 0.02 0.16 0.12 0.14 -0.29 -0.49 -0.54
-0.03 -0.11 -0.42 -0.31 0.12 0.17 0.09 0.11 -0.39 -0.04 -0.19 -0.11 0.22 0.55 0.07 0.2 0.15 -0.07 -0.04 -0.18 0.04 0.01 -0.1 0.12 -0.09 -0.03 0.08 -0.01 -0.08 -0.1
-0.43 -0.14 -0.26 -0.07 -0.25 -0.4 0.08 0.13 0.04 0.18 0.24 0.13 0.18 -0.02 0.06 0.11 -0.06 0.12 -0.01 0.1 0.16 0.04 -0.06 0.14 0.14 0.28 0.24 -0.34 -0.41 -0.37
-0.66 -0.62 -0.52 -0.68 -0.08 0.2 0.21 0.22 0.1 0.02 0.34 0.26 0.13 0.4 0.4 0.34 0.47 0.41 -0.01 0.12 0.06 0.1 -1.45 -0.17 -0.11 0.06 -0.04 -0.34 -0.44 -0.32
Spov3_chr3.03021 (OEP16-3)
 -0.18 -0.09 -0.21 -0.04 0.04 -0.15 -0.12 -0.08 0.06 0.12 0.07 0.1 0.11 0.32 0.3 0.22 0.31 -0.19 0.02 -0.05 0.1 0.02 0.22 -0.04 -0.03 -0.04 -0.02 -0.4 -0.34 -0.4
-0.29 0.05 -0.34 -0.35 -0.18 -0.15 -0.28 -0.09 -0.14 -0.04 -0.07 -0.13 0.41 0.64 0.22 0.3 0.32 0.3 -0.03 -0.22 -0.24 -0.11 0.4 0.13 0.01 -0.04 0.04 -0.22 -0.44 -0.2
-0.29 -0.23 -0.12 0.13 0.02 -0.15 -0.07 0.18 -0.02 -0.03 0.1 -0.02 0.19 -0.07 0.29 0.29 0.4 0.07 0.06 0.05 0.08 -0.05 0.13 -0.13 0.02 -0.09 0.05 -0.21 -0.51 -0.51
-0.15 -0.01 -0.2 -0.02 0.09 0.05 -0.19 -0.08 -0.11 -0.09 0.13 0.06 0.2 0.46 0.18 0.19 0.31 -0.32 -0.17 -0.09 -0.09 -0.06 0.34 0.17 0.1 -0.07 -0.14 -0.23 -0.29 -0.38
-0.25 -0.32 -0.27 -0.16 -0.19 -0.24 0.18 0.25 -0.13 -0.07 0.11 0.15 0.28 -0.54 0.27 0.18 0.4 -0.06 0.11 0.15 0.09 -0.14 0.73 0.03 0.02 -0.1 -0.08 -0.33 -0.57 -0.31
-0.08 -0.21 -0.15 -0.23 0.04 -0.01 0.03 -0.04 0.0 -0.14 0.02 -0.07 0.01 0.23 0.25 0.24 0.28 -0.13 0.07 0.08 0.06 0.09 0.16 -0.11 -0.04 0.05 0.05 -0.11 -0.3 -0.28
-0.07 -0.65 -0.34 -0.64 -0.44 -0.21 0.27 -0.3 -0.6 -0.38 -0.03 -0.32 0.62 -0.04 0.68 0.44 0.38 -0.05 0.26 0.41 0.48 0.23 -0.29 0.13 0.04 0.22 0.34 -0.75 -0.88 -0.29
-0.21 -0.05 -0.11 0.23 -0.13 -0.29 -0.36 0.04 -0.31 -0.22 -0.05 -0.13 0.21 0.06 0.41 0.35 0.41 0.03 0.02 -0.06 0.13 0.08 0.13 -0.04 0.09 0.15 0.18 -0.35 -0.46 -0.28
-0.39 -0.25 -0.56 -0.17 0.05 -0.4 -0.12 -0.1 -0.03 0.11 -0.11 0.06 0.28 0.76 0.34 0.36 0.46 0.03 -0.26 -0.01 0.33 0.16 -0.0 0.07 0.23 -0.19 -0.22 -0.4 -0.82 -0.28
-0.22 -0.28 -0.23 -0.11 -0.02 -0.1 -0.04 -0.04 0.0 -0.04 0.14 0.14 0.17 0.14 0.19 0.15 0.26 0.12 0.03 0.03 0.11 0.1 0.05 0.08 0.08 0.06 0.06 -0.27 -0.43 -0.43
-0.11 -0.15 -0.28 -0.13 0.28 -0.26 -0.02 0.1 -0.11 -0.04 -0.12 -0.09 0.13 0.25 0.1 0.16 0.36 0.14 0.05 -0.11 -0.07 0.07 0.24 -0.26 -0.06 0.04 0.04 -0.13 -0.37 0.03
-0.02 -0.1 -0.07 -0.06 -0.01 -0.04 0.05 0.24 -0.05 -0.01 0.05 -0.08 0.11 0.32 0.09 0.07 0.13 -0.07 -0.01 -0.07 0.08 0.09 0.12 -0.17 -0.08 -0.05 0.04 -0.08 -0.33 -0.28
-0.28 -0.18 -0.01 0.13 -0.02 -0.17 -0.19 -0.09 -0.14 -0.07 0.12 -0.02 0.14 0.11 0.2 0.26 0.22 -0.07 0.08 0.04 0.18 -0.06 0.26 -0.25 0.01 0.08 0.15 -0.14 -0.24 -0.32
-0.29 -0.4 0.11 0.36 -0.39 -0.12 -0.19 0.3 -0.16 -0.25 -0.24 -0.23 0.2 0.07 0.52 0.35 0.49 0.24 -0.02 -0.01 0.1 -0.13 -0.08 -0.2 0.12 0.07 0.18 -0.31 -0.32 -0.51
-0.4 -0.25 -0.2 -0.34 -0.24 0.12 0.45 0.25 0.06 0.02 0.21 0.14 -0.07 0.2 0.33 0.23 0.19 -0.06 0.06 0.03 -0.05 0.05 -0.36 -0.09 0.05 -0.04 0.03 -0.35 -0.15 -0.3
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Spov3_chr5.01727 (EMB2786)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.