1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_56 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.74 0.69 0.72 0.8 0.77 0.71 0.77 0.8 0.81 0.7 0.78 0.74 0.79 0.95 0.95 1.0 0.92 0.7 0.75 0.75 0.79 0.8 0.95 0.77 0.81 0.75 0.84 0.69 0.67 0.6
Spov3_C0003.00067 (epsilon2-COP)
 0.79 0.73 0.78 0.83 0.86 0.73 0.81 1.0 0.77 0.86 0.89 0.8 0.9 0.97 0.99 0.91 0.96 0.85 0.89 0.87 0.92 0.94 0.76 0.73 0.87 0.9 0.98 0.74 0.64 0.62
0.78 0.7 0.74 0.72 0.87 0.82 0.93 0.97 0.79 0.73 0.84 0.8 0.78 1.0 0.93 0.94 0.94 0.72 0.76 0.69 0.82 0.78 0.88 0.74 0.79 0.78 0.83 0.71 0.68 0.6
0.48 0.56 0.41 0.48 0.49 0.56 0.49 0.64 0.48 0.51 0.55 0.58 0.77 1.0 0.67 0.74 0.79 0.78 0.49 0.56 0.59 0.54 0.69 0.63 0.49 0.56 0.48 0.49 0.48 0.44
0.64 0.59 0.63 0.59 0.72 0.58 0.66 0.69 0.62 0.7 0.65 0.63 0.9 1.0 0.74 0.85 0.83 0.82 0.68 0.67 0.66 0.71 0.81 0.8 0.68 0.67 0.67 0.52 0.57 0.59
0.6 0.63 0.63 0.6 0.65 0.7 0.62 0.78 0.64 0.65 0.76 0.82 0.81 0.83 0.93 1.0 0.89 0.78 0.67 0.76 0.81 0.83 0.79 0.65 0.79 0.69 0.74 0.58 0.51 0.57
0.64 0.63 0.59 0.46 0.75 0.82 0.84 0.75 0.63 0.6 0.75 0.63 0.87 0.98 0.85 0.8 0.84 1.0 0.67 0.7 0.7 0.75 0.51 0.67 0.65 0.72 0.65 0.69 0.59 0.83
0.52 0.55 0.63 0.77 0.5 0.54 0.5 0.51 0.63 0.54 0.65 0.57 0.78 0.76 0.87 1.0 0.94 0.67 0.65 0.71 0.7 0.69 0.67 0.61 0.61 0.63 0.63 0.46 0.44 0.5
Spov3_chr1.00592 (TRAPPC4)
 0.64 0.64 0.7 0.71 0.79 0.7 0.76 0.99 0.88 0.78 0.81 0.89 0.93 0.75 0.89 0.83 0.86 1.0 0.83 0.94 0.95 0.79 0.88 0.76 0.86 0.94 0.89 0.67 0.63 0.64
0.71 0.66 0.61 0.65 0.74 0.74 0.66 0.69 0.74 0.74 0.86 0.61 0.96 1.0 0.91 0.81 0.85 0.92 0.84 0.73 0.85 0.66 0.82 0.86 0.8 0.75 0.83 0.61 0.63 0.56
Spov3_chr1.02238 (TRAPPC5)
 0.7 0.76 0.71 0.82 0.78 0.7 0.7 0.74 0.78 0.81 0.84 0.73 0.94 1.0 0.94 0.87 1.0 0.88 0.7 0.81 0.84 0.86 0.78 0.74 0.83 0.76 0.78 0.61 0.66 0.7
0.33 0.33 0.4 0.53 0.63 0.59 0.48 0.48 0.55 0.7 0.64 0.47 1.0 0.81 0.55 0.59 0.62 0.7 0.59 0.6 0.57 0.5 0.68 0.44 0.48 0.63 0.56 0.49 0.41 0.73
0.7 0.73 0.74 0.82 0.83 0.73 0.73 0.96 0.94 0.9 0.92 0.88 0.91 0.83 0.91 1.0 0.87 0.91 0.91 0.98 0.94 0.96 0.84 0.95 0.9 0.91 0.94 0.7 0.68 0.64
0.73 0.72 0.69 0.68 0.83 0.69 0.67 0.67 0.76 0.81 0.87 0.77 0.82 1.0 0.92 0.88 0.86 0.91 0.86 0.79 0.83 0.78 0.86 0.88 0.9 0.85 0.82 0.66 0.61 0.71
0.77 0.75 0.77 0.78 0.75 0.76 0.83 0.81 0.79 0.78 0.79 0.8 0.83 0.96 1.0 0.95 0.96 0.91 0.79 0.82 0.8 0.84 0.68 0.72 0.75 0.76 0.82 0.69 0.64 0.64
0.34 0.52 0.45 0.37 0.53 0.53 0.56 0.65 0.5 0.55 0.66 0.59 0.93 0.87 0.93 0.94 0.97 1.0 0.56 0.68 0.83 0.76 0.74 0.9 0.8 0.79 0.73 0.43 0.44 0.51
Spov3_chr1.04556 (tTRAPPC2(L))
 0.71 0.79 0.69 0.7 0.87 0.75 0.71 0.74 0.78 0.83 0.82 0.82 0.95 1.0 1.0 0.87 0.93 0.83 0.87 0.88 0.9 0.91 0.9 0.82 0.8 0.85 0.94 0.72 0.64 0.64
Spov3_chr1.04890 (TRAPPC2)
 0.79 0.76 0.78 0.75 0.82 0.67 0.74 0.72 0.81 0.78 0.8 0.77 0.83 1.0 0.99 0.94 0.98 0.95 0.85 0.82 0.84 0.77 0.73 0.71 0.77 0.86 0.78 0.65 0.61 0.69
0.59 0.56 0.63 0.7 0.74 0.69 0.72 0.76 0.78 0.75 0.88 0.83 0.88 0.79 0.92 0.91 1.0 0.99 0.8 0.87 0.84 0.85 0.71 0.7 0.82 0.8 0.81 0.61 0.57 0.61
0.72 0.67 0.69 0.69 0.84 0.68 0.73 0.73 0.76 0.7 0.82 0.81 0.83 1.0 0.9 0.81 0.96 0.82 0.74 0.76 0.73 0.79 0.77 0.71 0.73 0.72 0.74 0.65 0.63 0.6
0.62 0.71 0.73 0.66 1.0 0.78 0.81 0.72 0.74 0.8 0.82 0.78 0.94 0.98 0.94 0.88 0.93 0.87 0.93 0.8 0.92 0.84 0.83 0.75 0.69 0.87 0.88 0.59 0.59 0.86
0.74 0.76 0.76 0.85 0.81 0.76 0.75 0.84 0.77 0.71 0.84 0.78 0.86 0.98 1.0 0.91 0.95 0.81 0.86 0.85 0.91 0.87 0.85 0.72 0.84 0.9 0.93 0.58 0.59 0.65
0.47 0.43 0.44 0.46 0.86 0.53 0.42 0.48 0.63 0.72 0.74 0.61 1.0 0.83 0.78 0.87 0.93 0.67 0.72 0.58 0.6 0.61 0.65 0.63 0.76 0.71 0.68 0.53 0.38 0.58
0.38 0.35 0.42 0.32 0.62 0.6 0.65 0.41 0.43 0.44 0.68 0.49 1.0 0.52 0.73 0.69 0.73 0.75 0.61 0.66 0.62 0.63 0.25 0.43 0.49 0.58 0.66 0.35 0.27 0.52
0.37 0.3 0.27 0.23 0.72 0.33 0.26 0.18 0.42 0.5 0.41 0.53 0.81 0.99 1.0 0.82 0.97 0.71 0.54 0.45 0.33 0.4 0.49 0.38 0.5 0.69 0.67 0.25 0.25 0.25
0.22 0.18 0.41 0.37 0.3 0.63 0.56 0.49 0.51 0.47 0.65 0.3 1.0 0.48 0.7 0.77 0.48 0.53 0.67 0.72 0.75 0.92 0.43 0.63 0.49 0.52 0.91 0.33 0.21 0.17
0.54 0.52 0.5 0.5 0.52 0.56 0.69 0.63 0.65 0.58 0.71 0.66 0.73 0.81 0.7 0.71 0.71 1.0 0.71 0.72 0.69 0.69 0.48 0.51 0.62 0.63 0.65 0.43 0.41 0.48
0.76 0.79 0.68 0.68 0.9 0.89 0.82 0.85 0.68 0.79 0.75 0.76 0.96 1.0 0.88 0.94 0.93 0.83 0.81 0.69 0.78 0.81 0.76 0.88 0.82 0.81 0.75 0.86 0.71 0.66
0.7 0.73 0.78 0.79 0.92 0.88 0.84 0.87 0.84 0.88 0.93 0.85 0.97 0.87 0.98 0.98 1.0 0.84 0.86 0.92 0.87 0.89 0.99 0.8 0.87 0.89 0.96 0.68 0.65 0.64
0.74 0.73 0.86 0.97 0.81 0.78 0.79 0.84 0.84 0.76 0.85 0.8 0.94 0.85 0.99 1.0 0.96 0.78 0.8 0.75 0.85 0.83 0.88 0.8 0.87 0.82 0.88 0.8 0.75 0.77
0.55 0.56 0.49 0.46 0.46 0.61 0.65 0.67 0.45 0.61 0.61 0.5 0.95 1.0 0.78 0.89 0.94 0.78 0.6 0.66 0.75 0.71 0.38 0.63 0.62 0.72 0.68 0.46 0.38 0.56
0.82 0.84 0.8 0.83 0.88 0.91 0.87 0.88 0.83 0.83 0.9 0.86 0.97 0.97 1.0 0.94 0.98 0.87 0.9 0.89 0.96 0.95 0.89 0.89 0.98 0.95 0.97 0.71 0.63 0.6
0.67 0.64 0.51 0.55 0.74 0.77 0.73 0.74 0.52 0.67 0.6 0.64 0.8 1.0 0.72 0.79 0.76 0.65 0.67 0.6 0.7 0.69 0.64 0.75 0.64 0.67 0.72 0.68 0.65 0.64
0.61 0.74 0.69 0.78 0.69 0.62 0.87 0.9 0.85 0.93 0.97 0.9 0.93 0.81 0.86 0.89 0.79 0.89 0.82 0.88 0.92 0.85 0.79 0.91 0.91 1.0 0.97 0.65 0.62 0.64
0.46 0.47 0.5 0.45 0.68 0.83 0.84 0.85 0.78 0.74 0.92 0.87 0.79 0.95 0.95 0.92 1.0 0.96 0.72 0.79 0.76 0.77 0.26 0.65 0.67 0.75 0.7 0.57 0.53 0.58
Spov3_chr3.03021 (OEP16-3)
 0.71 0.76 0.7 0.78 0.83 0.72 0.74 0.76 0.84 0.87 0.84 0.86 0.86 1.0 0.99 0.93 1.0 0.71 0.82 0.78 0.86 0.82 0.94 0.78 0.79 0.78 0.79 0.61 0.63 0.61
0.52 0.66 0.51 0.51 0.57 0.58 0.53 0.6 0.58 0.63 0.61 0.59 0.86 1.0 0.75 0.79 0.8 0.79 0.63 0.55 0.54 0.6 0.85 0.7 0.65 0.62 0.66 0.55 0.47 0.56
0.62 0.65 0.7 0.83 0.77 0.68 0.72 0.86 0.74 0.74 0.81 0.75 0.87 0.72 0.93 0.93 1.0 0.8 0.79 0.79 0.8 0.73 0.83 0.69 0.77 0.71 0.78 0.65 0.53 0.53
0.66 0.72 0.63 0.72 0.78 0.75 0.64 0.69 0.67 0.68 0.79 0.76 0.83 1.0 0.82 0.83 0.9 0.58 0.65 0.69 0.68 0.7 0.92 0.82 0.78 0.69 0.66 0.62 0.6 0.56
0.51 0.48 0.5 0.54 0.53 0.51 0.68 0.72 0.55 0.57 0.65 0.67 0.73 0.42 0.73 0.68 0.79 0.58 0.65 0.67 0.64 0.55 1.0 0.62 0.61 0.56 0.57 0.48 0.4 0.48
0.78 0.71 0.74 0.7 0.85 0.81 0.84 0.8 0.83 0.75 0.83 0.78 0.83 0.96 0.98 0.97 1.0 0.75 0.87 0.87 0.86 0.88 0.92 0.76 0.8 0.85 0.85 0.76 0.67 0.68
0.59 0.4 0.49 0.4 0.46 0.54 0.75 0.51 0.41 0.48 0.61 0.5 0.96 0.61 1.0 0.85 0.81 0.6 0.75 0.83 0.87 0.73 0.51 0.68 0.64 0.72 0.79 0.37 0.34 0.51
0.65 0.73 0.7 0.89 0.69 0.62 0.59 0.78 0.61 0.65 0.73 0.69 0.87 0.79 1.0 0.96 1.0 0.77 0.77 0.72 0.82 0.8 0.82 0.73 0.8 0.83 0.85 0.59 0.55 0.62
0.45 0.5 0.4 0.53 0.61 0.45 0.54 0.55 0.58 0.64 0.55 0.62 0.72 1.0 0.75 0.76 0.81 0.6 0.49 0.59 0.74 0.66 0.59 0.62 0.69 0.52 0.51 0.45 0.34 0.49
0.72 0.69 0.71 0.77 0.83 0.78 0.81 0.81 0.84 0.81 0.92 0.92 0.94 0.92 0.96 0.93 1.0 0.91 0.85 0.85 0.9 0.9 0.86 0.88 0.88 0.87 0.87 0.69 0.62 0.62
0.72 0.7 0.64 0.71 0.95 0.65 0.77 0.84 0.72 0.76 0.72 0.73 0.85 0.92 0.84 0.87 1.0 0.86 0.81 0.72 0.74 0.82 0.92 0.65 0.75 0.8 0.8 0.71 0.6 0.8
0.79 0.74 0.76 0.77 0.79 0.78 0.83 0.94 0.77 0.8 0.83 0.76 0.86 1.0 0.85 0.84 0.87 0.76 0.79 0.76 0.84 0.85 0.87 0.71 0.75 0.77 0.82 0.76 0.64 0.66
0.69 0.74 0.83 0.91 0.82 0.74 0.73 0.78 0.76 0.8 0.91 0.82 0.92 0.9 0.96 1.0 0.97 0.8 0.88 0.86 0.95 0.8 1.0 0.7 0.84 0.88 0.93 0.76 0.71 0.67
0.57 0.53 0.75 0.89 0.53 0.64 0.61 0.86 0.62 0.59 0.59 0.59 0.8 0.73 1.0 0.89 0.98 0.83 0.69 0.69 0.75 0.64 0.66 0.61 0.76 0.73 0.79 0.56 0.56 0.49
0.55 0.62 0.64 0.57 0.62 0.79 1.0 0.87 0.76 0.74 0.84 0.81 0.69 0.84 0.92 0.85 0.83 0.7 0.76 0.74 0.7 0.76 0.57 0.69 0.75 0.71 0.74 0.57 0.66 0.59
0.42 0.41 0.33 0.27 0.6 0.88 0.77 0.59 0.38 0.46 0.55 0.57 0.74 0.94 0.77 0.9 0.99 1.0 0.67 0.59 0.6 0.66 0.25 0.51 0.62 0.62 0.74 0.39 0.36 0.78
0.65 0.7 0.6 0.71 0.66 0.6 0.65 0.79 0.6 0.66 0.72 0.7 0.85 1.0 0.79 0.7 0.88 0.87 0.68 0.7 0.76 0.76 0.75 0.64 0.7 0.76 0.79 0.56 0.63 0.57
0.81 0.75 0.7 0.59 0.88 0.77 0.63 0.57 0.77 0.8 0.86 0.75 0.86 0.85 0.89 0.84 0.81 1.0 0.85 0.88 0.86 0.74 0.71 0.73 0.72 0.79 0.77 0.64 0.59 0.54
Spov3_chr5.01727 (EMB2786)
 0.6 0.54 0.6 0.84 0.69 0.59 0.58 1.0 0.72 0.72 0.67 0.8 0.91 0.46 0.85 0.74 0.7 0.98 0.83 0.85 0.78 0.77 0.81 0.55 0.81 1.0 0.94 0.66 0.52 0.73
0.44 0.52 0.43 0.42 0.76 0.87 0.68 0.54 0.46 0.65 0.61 0.57 1.0 0.87 0.71 0.83 0.83 0.74 0.72 0.65 0.74 0.71 0.49 0.69 0.69 0.74 0.71 0.61 0.47 0.78
0.53 0.63 0.67 0.71 0.72 0.62 0.64 0.75 0.73 0.78 0.84 0.77 1.0 0.91 0.9 0.95 0.92 0.78 0.72 0.79 0.79 0.8 0.96 0.82 0.8 0.76 0.77 0.66 0.63 0.62
0.48 0.47 0.34 0.27 0.48 0.62 0.68 0.54 0.36 0.52 0.51 0.53 1.0 0.78 0.77 0.72 0.74 0.82 0.46 0.53 0.61 0.63 0.46 0.55 0.6 0.62 0.61 0.51 0.36 0.58
0.59 0.66 0.67 0.78 0.69 0.71 0.73 0.84 0.76 0.7 0.84 0.83 0.91 0.79 0.89 0.79 1.0 0.69 0.73 0.75 0.85 0.8 0.98 0.75 0.86 0.8 0.72 0.59 0.48 0.52
0.76 0.74 0.77 0.79 0.73 0.74 0.79 0.77 0.83 0.79 0.9 0.86 0.93 1.0 1.0 0.97 1.0 0.81 0.85 0.87 0.87 0.85 0.78 0.81 0.82 0.88 0.87 0.71 0.63 0.62
0.41 0.51 0.49 0.68 0.55 0.49 0.46 0.62 0.67 0.74 0.81 0.74 1.0 0.78 0.76 0.87 0.92 0.75 0.6 0.68 0.76 0.67 0.73 0.62 0.75 0.75 0.73 0.38 0.38 0.41
0.81 0.74 0.72 0.76 0.81 0.74 0.76 0.85 0.78 0.91 0.81 0.85 1.0 0.97 0.87 0.95 0.94 0.89 0.81 0.85 0.88 0.82 0.91 0.85 0.93 0.75 0.85 0.74 0.73 0.69
0.42 0.51 0.34 0.16 0.2 0.82 0.63 0.42 0.25 0.48 0.32 0.39 0.44 0.95 0.65 0.76 0.74 1.0 0.59 0.61 0.85 0.71 0.06 0.24 0.26 0.72 0.57 0.22 0.11 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)