Heatmap: Cluster_113 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.23 -0.2 0.21 0.73 -0.19 -0.26 -0.39 0.74 -0.32 -0.31 -0.22 -0.21 0.25 -0.6 0.11 0.15 0.24 0.14 -0.22 -0.26 0.02 -0.02 0.23 -0.37 -0.07 -0.15 0.09 0.05 -0.15 0.22
-0.4 -0.24 0.29 1.15 -0.35 -0.39 -0.57 0.99 -0.26 -0.59 -0.17 -0.36 0.55 -0.65 0.15 0.15 0.12 -0.29 -0.4 -0.2 -0.29 -0.22 0.64 -0.48 -0.2 -0.38 0.08 0.03 -0.15 0.2
-0.62 -0.51 0.34 1.66 -0.72 -0.71 -0.84 1.28 -0.66 -0.42 -0.34 -0.55 0.8 -1.75 -0.4 -0.2 -0.03 -0.13 -0.55 -0.55 -0.26 -0.27 0.77 -0.41 -0.16 -0.46 0.04 0.45 -0.21 0.31
-0.03 -0.01 0.29 0.99 0.01 -0.35 -1.08 0.42 -0.46 -0.27 -0.09 -0.23 0.11 -0.82 0.01 -0.1 0.12 -0.15 -0.66 -0.64 -0.1 -0.2 0.85 -0.65 -0.24 -0.13 0.17 0.21 0.29 0.6
-0.44 -0.23 0.28 1.5 -0.55 -0.47 -0.96 1.14 -0.68 -0.51 -0.39 -0.57 0.58 -1.18 0.04 0.2 0.4 -0.25 -0.57 -0.65 -0.26 -0.31 0.94 -0.68 -0.27 -0.41 -0.03 0.27 -0.2 0.1
Spov3_chr1.02352 (EMB2785)
-0.07 0.05 0.23 0.92 -0.1 -0.2 -0.81 0.25 -0.4 -0.35 -0.25 -0.33 0.18 -0.48 0.05 0.06 0.28 -0.15 -0.47 -0.65 0.06 -0.25 0.6 -0.65 -0.13 -0.05 0.07 0.18 0.18 0.64
-0.1 0.04 0.28 1.16 -0.24 -0.27 -0.94 0.94 -0.42 -0.35 -0.18 -0.26 0.23 -0.46 0.04 0.08 0.23 -0.08 -0.57 -0.53 -0.34 -0.35 0.69 -0.68 -0.43 -0.26 -0.11 0.2 0.04 0.33
-0.51 -0.3 0.26 1.35 -0.41 -0.32 -0.72 1.22 -0.67 -0.55 -0.32 -0.52 0.75 -1.49 0.16 0.2 0.4 -0.09 -0.57 -0.52 -0.32 -0.26 0.7 -0.74 -0.3 -0.33 -0.0 0.1 -0.26 0.19
-0.08 -0.04 0.23 0.65 0.01 -0.26 -0.52 0.28 -0.21 -0.09 -0.08 -0.19 0.17 -0.65 -0.14 -0.01 0.17 0.03 -0.21 -0.17 -0.01 -0.09 0.53 -0.44 -0.01 0.03 0.17 0.09 -0.04 0.15
-0.37 -0.28 0.26 1.05 -0.34 -0.31 -0.48 0.98 -0.22 -0.48 -0.12 -0.29 0.34 -1.38 0.3 0.22 0.25 0.07 -0.35 -0.32 -0.2 -0.29 0.75 -0.69 -0.19 -0.32 -0.06 -0.2 -0.19 0.39
Spov3_chr2.01424 (EMB2271)
-0.51 -0.51 0.26 1.51 -0.52 -0.54 -0.81 1.37 -0.4 -0.4 -0.39 -0.48 0.54 -1.53 0.1 0.02 0.06 -0.44 -0.66 -0.66 -0.29 -0.19 0.76 -0.89 -0.16 -0.34 0.17 0.25 -0.11 0.3
-0.23 -0.23 0.14 0.9 -0.11 -0.4 -1.16 0.54 -0.31 -0.08 -0.14 -0.22 0.28 -0.43 -0.0 0.06 0.28 0.0 -0.48 -0.5 -0.24 -0.32 0.84 -0.58 -0.16 -0.14 0.14 0.24 0.21 0.31
-0.34 -0.03 0.35 1.55 -0.39 -0.13 -0.91 0.99 -0.67 -0.46 -0.45 -0.51 0.28 -0.91 -0.09 0.07 0.32 -0.33 -0.89 -0.98 -0.34 -0.31 0.93 -0.87 -0.3 -0.39 -0.0 0.33 0.13 0.28
-0.38 -0.29 0.41 1.58 -0.58 -0.69 -1.11 1.11 -0.63 -0.62 -0.48 -0.47 0.81 -1.33 -0.15 -0.04 0.21 -0.13 -0.48 -0.48 -0.42 -0.41 0.7 -0.75 -0.25 -0.49 -0.02 0.31 -0.06 0.55
-0.21 -0.03 0.27 1.12 -0.18 -0.26 -0.79 0.87 -0.31 -0.24 -0.22 -0.29 0.08 -0.82 -0.15 0.06 0.12 -0.26 -0.51 -0.55 -0.14 -0.24 0.65 -0.49 -0.16 -0.12 0.1 0.07 0.22 0.38
-0.22 -0.14 0.17 1.02 -0.28 -0.22 -0.3 0.66 -0.34 -0.41 -0.12 -0.28 0.18 -0.75 0.08 0.31 0.29 -0.58 -0.31 -0.33 -0.1 -0.13 0.41 -0.01 0.13 -0.14 0.07 0.1 -0.04 -0.09
-0.2 -0.11 0.16 1.06 -0.11 -0.25 -0.65 0.69 -0.34 -0.33 -0.12 -0.25 0.15 -1.51 -0.06 -0.01 0.14 -0.44 -0.55 -0.44 -0.06 -0.17 0.92 -0.35 -0.07 -0.09 0.13 0.3 -0.03 0.3
-0.52 -0.24 0.18 1.32 -0.62 -0.17 -0.86 0.95 -0.63 -0.43 -0.41 -0.41 0.4 -0.84 0.19 0.21 0.64 -0.34 -0.6 -0.83 -0.12 -0.31 0.99 -0.67 -0.5 -0.07 0.09 0.11 -0.16 0.15
-0.51 -0.19 0.28 1.4 -0.44 -0.43 -0.86 1.18 -0.52 -0.48 -0.36 -0.41 0.5 -0.93 0.01 -0.0 0.08 -0.32 -0.72 -0.4 -0.43 -0.3 1.11 -0.77 -0.28 -0.32 0.11 0.12 -0.13 0.23
-0.06 -0.06 0.25 0.97 -0.27 -0.3 -0.51 0.61 -0.2 -0.23 -0.14 -0.27 0.23 -0.55 0.08 0.13 0.16 -0.47 -0.46 -0.26 -0.26 -0.17 0.53 -0.29 -0.04 -0.13 0.11 0.08 0.07 0.16
-0.2 -0.1 0.28 1.06 -0.27 -0.26 -0.73 1.05 -0.56 -0.35 -0.2 -0.48 0.26 -0.38 -0.1 0.0 0.3 -0.3 -0.58 -0.37 -0.2 -0.22 0.68 -0.24 -0.18 -0.18 0.09 0.13 -0.17 0.16
-0.52 -0.29 0.24 1.62 -0.55 -0.29 -0.83 1.21 -0.88 -0.56 -0.79 -0.67 0.24 -0.84 0.05 0.13 0.37 0.0 -0.61 -0.9 -0.33 -0.45 1.13 -0.91 -0.53 -0.52 -0.1 -0.02 -0.04 0.61
-0.64 -0.38 0.2 1.56 -0.51 -0.46 -0.99 0.92 -0.68 -0.38 -0.29 -0.39 0.39 -1.55 -0.19 0.0 0.25 -0.05 -0.41 -0.38 -0.01 -0.34 0.94 -0.41 -0.02 -0.31 0.2 0.16 -0.2 0.14
-0.13 0.02 0.3 1.13 -0.17 -0.33 -0.73 1.01 -0.44 -0.43 -0.3 -0.42 0.32 -0.73 0.05 0.12 0.17 -0.38 -0.52 -0.52 -0.12 -0.3 0.78 -0.68 -0.2 -0.36 0.07 -0.01 -0.03 0.38
-0.44 -0.21 0.24 1.25 -0.5 -0.39 -0.78 1.05 -0.41 -0.22 -0.12 -0.27 0.45 -0.99 -0.04 0.11 0.26 -0.38 -0.43 -0.42 -0.25 -0.27 0.68 -0.74 -0.41 -0.28 0.18 0.29 -0.1 0.29
-0.47 -0.14 0.31 1.29 -0.56 -0.67 -0.82 1.18 -0.4 -0.24 -0.1 -0.18 0.38 -1.67 -0.17 -0.22 0.01 -0.62 -0.55 -0.33 -0.18 -0.08 0.81 -0.72 -0.28 -0.26 0.17 0.3 0.11 0.43
0.04 0.13 0.29 1.11 0.1 -0.25 -0.75 0.34 -0.39 -0.27 -0.19 -0.26 0.04 -0.56 -0.03 0.03 0.26 -0.24 -0.72 -0.5 0.11 -0.33 0.69 -0.61 -0.39 -0.14 0.01 0.15 0.25 0.3
-0.43 -0.26 0.35 1.5 -0.51 -0.28 -0.72 1.12 -0.61 -0.44 -0.32 -0.46 0.43 -0.95 -0.01 0.21 0.41 -0.34 -0.56 -0.57 -0.24 -0.36 0.76 -0.73 -0.23 -0.34 0.08 0.09 -0.17 0.05
-0.46 -0.26 0.38 1.48 -0.38 -0.36 -0.72 1.09 -0.53 -0.53 -0.25 -0.55 0.45 -1.59 0.03 0.12 0.4 -0.37 -0.51 -0.42 -0.23 -0.34 0.58 -0.89 -0.33 -0.32 0.05 -0.1 -0.09 0.69
-0.1 -0.09 0.32 0.96 -0.33 -0.51 -0.45 0.71 -0.32 -0.19 -0.21 -0.34 0.29 -0.4 -0.05 -0.06 0.02 -0.0 -0.43 -0.32 -0.08 -0.09 0.54 -0.35 -0.19 -0.22 0.08 0.13 -0.12 0.42
-0.13 -0.1 0.26 1.0 -0.42 -0.42 -0.8 0.57 -0.37 -0.29 -0.11 -0.22 0.15 -0.72 0.04 0.05 0.31 -0.19 -0.35 -0.42 -0.1 -0.2 0.8 -0.43 -0.14 -0.1 0.1 0.19 0.0 0.33
-0.48 -0.54 0.1 1.38 -0.44 -0.44 -0.92 1.17 -0.41 -0.23 -0.19 -0.23 0.29 -1.42 -0.11 -0.05 0.23 -0.26 -0.63 -0.48 -0.16 -0.37 1.05 -0.58 -0.24 -0.27 0.03 -0.0 -0.12 0.53
-0.16 -0.02 0.12 0.95 -0.22 -0.26 -0.75 0.59 -0.4 -0.11 -0.15 -0.19 0.27 -0.7 -0.01 0.12 0.18 0.44 -0.46 -0.52 -0.22 -0.18 0.58 -0.43 -0.16 -0.13 0.01 0.2 0.06 0.06
-0.29 0.03 0.31 1.02 -0.25 -0.13 -0.73 0.93 -0.49 -0.14 -0.26 -0.21 0.28 -0.59 -0.08 -0.07 0.29 -0.32 -0.45 -0.49 -0.06 -0.14 0.53 -0.51 -0.38 -0.14 0.06 0.11 0.0 0.32
-0.14 0.16 0.47 1.28 -0.29 -0.45 -0.59 0.92 -0.38 -0.39 -0.31 -0.33 0.29 -0.87 -0.03 0.0 0.13 -0.6 -0.65 -0.57 -0.44 -0.31 0.8 -0.72 -0.3 -0.38 -0.07 0.2 0.16 0.48
-0.32 -0.13 0.26 1.13 -0.36 -0.28 -0.56 1.08 -0.41 -0.42 -0.22 -0.33 0.17 -0.63 0.07 0.07 0.25 -0.22 -0.5 -0.47 -0.21 -0.27 0.72 -0.53 -0.32 -0.36 0.03 0.07 -0.02 0.41
-0.21 -0.05 0.28 1.02 -0.39 -0.48 -0.67 0.8 -0.37 -0.28 -0.13 -0.35 0.56 -0.66 -0.07 0.07 0.18 0.08 -0.19 -0.35 -0.13 -0.26 0.4 -0.48 -0.14 -0.2 -0.01 0.31 0.0 0.04
-0.36 -0.17 0.24 1.28 -0.49 -0.32 -0.91 0.82 -0.57 -0.52 -0.38 -0.41 0.24 -0.52 0.06 0.35 0.38 -0.12 -0.55 -0.52 0.1 -0.32 0.73 -0.45 -0.21 -0.24 0.06 0.16 -0.16 0.25
Spov3_chr5.01419 (atBRX1-2)
-0.49 -0.38 0.2 1.27 -0.37 -0.34 -0.62 1.19 -0.71 -0.29 -0.24 -0.39 0.47 -1.05 -0.0 -0.02 0.31 -0.21 -0.59 -0.22 -0.13 -0.2 0.7 -0.57 -0.2 -0.36 0.18 0.13 -0.26 0.2
-0.15 -0.05 0.25 0.95 -0.17 -0.51 -0.87 0.36 -0.53 -0.21 -0.23 -0.28 -0.12 -0.85 0.07 0.04 0.26 -0.01 -0.58 -0.64 -0.03 -0.25 0.88 -0.65 -0.12 0.05 0.25 0.21 0.24 0.64
-0.17 -0.12 0.18 0.91 -0.27 -0.23 -0.61 0.81 -0.41 -0.29 -0.23 -0.24 0.29 -1.01 0.17 0.09 0.23 -0.1 -0.33 -0.43 -0.01 -0.04 0.51 -0.44 -0.13 -0.09 0.12 -0.01 -0.05 0.3
-0.07 -0.36 0.52 1.28 -0.41 -0.37 -0.62 0.8 -0.07 -0.3 -0.1 -0.3 0.16 -1.22 0.07 0.01 0.29 -0.59 -0.34 -0.39 -0.0 -0.17 0.54 -0.62 -0.29 -0.2 0.13 0.12 -0.1 0.22
-0.62 -0.5 0.32 1.3 -0.26 -0.58 -0.64 1.27 -0.29 -0.34 -0.19 -0.34 0.29 -1.43 -0.17 -0.03 0.07 -0.4 -0.13 -0.13 -0.08 -0.19 0.79 -0.65 -0.05 -0.17 0.27 0.08 -0.27 -0.23
-0.14 -0.04 0.3 1.21 0.02 -0.11 -0.56 0.75 -0.59 -0.61 -0.41 -0.46 0.29 -0.67 0.01 0.15 0.32 -0.23 -0.41 -0.23 -0.19 -0.29 0.4 -0.48 -0.17 -0.19 0.02 0.24 -0.01 0.15
-0.62 -0.34 0.23 1.25 -0.45 -0.3 -0.83 0.84 -0.5 -0.34 -0.19 -0.21 0.26 -1.18 -0.02 0.24 0.39 -0.34 -0.55 -0.46 0.01 -0.19 0.84 -0.39 -0.02 -0.0 0.16 0.16 -0.13 -0.0
-0.43 -0.26 0.24 1.28 -0.43 -0.28 -0.71 1.06 -0.57 -0.43 -0.32 -0.49 0.49 -0.84 0.14 0.27 0.4 -0.36 -0.46 -0.43 -0.23 -0.29 0.79 -0.59 -0.28 -0.36 0.06 0.11 -0.16 0.13
-0.38 -0.13 0.32 1.44 -0.43 -0.55 -1.53 0.79 -0.53 -0.33 -0.15 -0.5 0.39 -1.58 0.15 0.04 0.42 -0.1 -0.83 -0.84 -0.13 -0.33 1.11 -0.96 -0.17 -0.1 -0.01 0.11 0.08 0.34
-0.22 -0.09 0.2 0.94 -0.26 -0.17 -0.53 0.69 -0.32 -0.3 -0.18 -0.35 0.26 -0.46 0.14 0.11 0.24 -0.19 -0.44 -0.36 -0.17 -0.21 0.74 -0.44 -0.22 -0.17 0.16 0.05 -0.15 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.