Heatmap: Cluster_70 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000472 (PH1)
-0.06 0.18 0.48 -0.17 0.66 0.43 -0.2 -0.17 0.12 0.04 0.11 -0.08 -0.0 0.74 0.65 -0.09 -0.11 -0.02 -0.13 0.14 -0.18 -0.06 -0.51 -0.35 -0.39 -0.5 -0.52 -0.42 -0.22 -0.26 -0.39
Bra001092 (APRL5)
0.26 0.61 1.06 0.24 0.32 0.39 -0.56 -0.52 -0.17 -0.08 -0.21 -0.3 -0.35 0.27 0.65 -0.06 -0.24 0.3 -0.23 -0.13 -0.06 -0.08 0.34 -0.36 -0.24 -0.65 -0.65 -0.48 -0.19 -0.51 -0.3
0.01 0.23 0.17 -0.17 0.51 0.02 -0.42 -0.13 0.13 0.05 0.2 0.02 0.0 0.74 0.54 0.17 -0.06 0.43 -0.09 -0.17 -0.23 -0.18 -0.07 -0.33 -0.55 -0.28 -0.34 -0.22 -0.5 -0.31 -0.17
Bra002823 (BTL04)
0.65 0.47 0.92 0.17 0.62 0.99 -0.54 -0.89 -0.01 -0.31 -0.46 0.13 -0.45 1.08 0.46 -0.34 -0.95 0.01 0.25 -0.26 -0.05 -0.33 0.56 -0.9 -1.2 -1.67 -1.3 -0.26 -0.29 -0.24 -0.54
0.62 0.74 0.58 -0.44 1.37 0.8 -1.18 -1.28 0.58 0.03 -0.25 0.11 -2.03 1.04 0.43 -0.58 -1.13 -0.01 -0.32 -0.18 -0.58 0.03 0.43 -1.0 -1.19 -1.38 -0.78 -0.1 0.17 0.13 -1.41
Bra003718 (RDS2)
-0.03 0.22 0.05 -0.13 0.66 0.48 -0.43 -0.53 0.15 0.17 -0.01 0.18 0.18 0.73 0.77 0.04 0.05 0.11 -0.2 0.05 -0.19 0.12 -0.24 -0.44 -0.49 -0.43 -0.32 -0.56 -0.34 -0.44 -0.81
0.66 1.18 0.54 -0.17 0.79 0.65 -0.51 -0.67 -0.42 -0.61 -0.86 0.18 -1.38 0.67 0.73 0.19 -0.17 0.46 -0.38 -0.04 -0.7 0.21 1.71 -1.28 -1.71 -1.54 -1.6 -1.36 -1.1 -0.37 -2.06
Bra004301 (ARG1)
0.33 0.45 0.63 0.16 0.34 0.38 -0.17 -0.15 -0.06 -0.1 -0.09 -0.2 -0.13 0.41 0.51 -0.12 -0.22 0.07 -0.1 0.09 -0.06 0.11 0.1 -0.5 -0.43 -0.54 -0.58 -0.26 -0.12 -0.5 -0.35
Bra005710 (SSR1)
0.67 1.12 0.71 -0.35 1.16 0.69 -0.65 -0.76 -0.5 -0.7 -0.61 -0.25 -0.45 0.46 1.11 -0.05 -0.47 0.17 -0.2 -0.29 -0.24 0.07 0.03 -0.63 -1.1 -0.82 -0.9 -0.46 -0.7 -0.38 -0.13
Bra005828 (ALA1)
0.46 0.63 0.71 0.24 0.56 0.41 -0.33 -0.2 -0.07 -0.2 -0.27 -0.07 -0.42 0.43 0.41 0.06 -0.03 0.39 -0.18 0.04 -0.25 0.07 0.21 -0.79 -0.76 -0.63 -0.66 -0.5 -0.36 -0.18 -0.58
Bra006039 (NRPB4)
0.69 0.37 0.45 -0.01 1.02 0.81 -0.4 -0.47 -0.03 -0.28 -0.16 0.03 -0.26 0.89 0.5 -0.06 -0.48 -0.09 -0.05 -0.25 -0.42 -0.05 0.22 -0.83 -0.88 -1.17 -0.87 -0.38 -0.1 -0.4 -0.35
0.16 0.63 0.44 0.17 0.71 0.37 -0.35 -0.43 0.08 0.17 0.02 -0.04 -0.48 0.62 0.62 0.05 -0.18 0.15 0.07 0.03 -0.23 0.05 -0.23 -0.52 -0.65 -0.72 -0.69 -0.25 -0.34 -0.4 -0.59
Bra006350 (AAE5)
-0.14 1.36 1.53 0.59 1.25 0.46 -1.97 -3.01 -0.26 -1.07 -1.16 -1.0 -1.4 0.34 1.12 -1.19 -1.45 1.29 -0.02 -0.59 -0.98 -1.26 0.96 -0.97 -1.75 -0.07 -1.5 -0.9 -0.39 0.49 -1.57
Bra006373 (BPA1)
0.86 1.04 0.9 0.59 0.85 0.94 -0.61 -0.75 -0.24 -0.47 -0.24 -0.4 -0.48 0.7 1.1 -0.03 -0.17 -0.06 -0.27 -0.49 -0.48 -0.25 -0.27 -0.74 -1.05 -1.01 -0.96 -0.65 -0.65 -1.19 -0.8
Bra006933 (MMZ3)
0.54 0.47 0.37 0.28 1.01 0.89 -0.67 -0.2 0.41 0.26 0.11 0.1 -0.15 0.82 1.04 -0.05 -0.68 0.03 0.01 -0.08 -0.5 0.33 -0.9 -1.06 -1.17 -1.37 -1.22 -0.93 -0.73 -1.04 -1.04
Bra007006 (JAT4)
0.95 0.91 0.77 0.34 1.81 1.39 -1.3 -1.03 -0.17 -0.37 -0.56 0.04 -0.48 1.59 1.25 -0.28 -1.21 0.53 0.01 -0.44 0.32 -0.33 -2.52 -3.17 -3.07 -2.9 -3.03 -2.84 -2.52 -2.78 -3.21
Bra007547 (VAP)
0.56 0.8 0.65 0.17 1.02 0.63 -0.66 -0.93 0.49 0.15 0.34 0.04 -0.16 0.92 1.12 0.02 -0.31 0.32 0.09 -0.05 -0.38 0.18 -0.98 -1.23 -1.63 -1.31 -1.67 -1.54 -1.1 -1.21 -1.43
0.33 0.38 0.63 0.2 0.46 0.45 -0.7 -0.61 -0.09 -0.01 -0.34 -0.35 -0.56 0.27 0.44 -0.23 -0.1 0.58 0.01 -0.12 -0.17 0.08 1.08 -0.23 -0.23 -1.01 -0.55 -0.37 -0.3 -0.45 -0.88
Bra009629 (HAKAI)
0.43 0.36 0.51 0.31 0.44 0.44 -0.63 -0.54 0.18 -0.3 -0.22 -0.14 -0.23 0.45 0.66 -0.16 -0.26 0.18 -0.05 -0.12 -0.1 -0.16 0.31 -0.33 -0.16 -0.68 -0.26 -0.27 -0.17 -0.43 -0.45
Bra009849 (CID6)
0.19 0.36 0.48 -0.16 0.93 0.4 -0.8 -0.86 0.35 0.07 0.02 0.09 -0.8 0.61 0.62 -0.21 -0.51 -0.25 -0.05 -0.27 -0.14 0.12 0.24 -0.22 -0.4 -1.03 -0.24 -0.27 0.03 -0.06 -0.42
Bra009857 (PEX4)
0.04 0.24 0.29 -0.01 0.44 0.35 -0.35 -0.56 0.34 0.05 0.05 -0.11 0.01 0.65 0.59 -0.03 -0.02 0.16 -0.13 -0.24 -0.05 -0.09 -0.06 -0.23 -0.3 -0.34 -0.38 -0.08 -0.37 -0.5 -0.34
-0.49 -0.74 -0.69 -4.06 0.45 0.37 -0.97 -0.4 0.14 -0.29 -0.12 -0.28 0.65 1.49 0.86 0.35 0.05 0.64 0.41 0.45 0.55 -0.13 0.73 -0.57 -0.55 -1.59 -0.54 -1.16 -0.89 -0.78 -0.51
Bra010195 (TPR9)
0.67 0.62 0.82 0.32 0.76 0.59 -0.62 -0.37 0.17 -0.24 -0.01 -0.36 -0.1 0.7 0.78 -0.09 -0.06 0.12 0.15 -0.13 -0.21 -0.38 -0.65 -0.82 -0.76 -0.93 -0.87 -0.64 -0.41 -0.64 -0.57
0.39 0.78 0.73 0.19 0.96 0.68 -0.71 -1.17 -0.08 0.21 0.04 0.2 -1.31 0.65 0.55 -0.14 -0.41 0.52 -0.41 -0.16 -0.51 0.03 0.8 -1.04 -0.82 -0.84 -0.86 -0.57 -0.46 -0.59 -1.19
Bra011067 (ckl3)
0.78 0.96 0.64 -0.11 1.42 0.92 -1.9 -2.01 0.13 -0.31 -0.16 -0.29 -1.87 1.03 0.93 -0.38 -0.79 -0.76 -0.09 -0.36 -0.67 -0.22 -0.14 -0.61 -0.87 -0.47 -1.28 -0.25 0.0 0.23 -0.95
Bra011075 (TCX5)
0.66 0.68 0.65 0.64 0.85 0.76 -0.92 -0.59 -0.28 -0.35 -0.03 -0.52 -0.51 0.76 0.93 0.06 -0.23 0.26 -0.6 -0.53 -0.55 -0.27 0.14 -0.72 -0.96 -0.92 -0.84 -0.53 -0.08 -0.31 -0.53
Bra011120 (PECP3)
0.61 0.63 1.07 0.14 0.74 0.52 -0.19 -0.76 0.04 -0.29 -0.13 -0.31 -0.38 0.51 0.52 -0.03 -0.32 -0.42 -0.27 -0.2 0.08 0.18 -0.19 -0.39 -0.57 -0.95 -0.68 -0.42 -0.34 -0.47 -0.25
Bra011504 (VHA-H)
-0.19 0.01 -0.11 -0.27 0.3 -0.05 -0.39 -0.43 0.13 0.28 -0.07 -0.07 0.08 0.77 0.52 0.15 -0.07 0.23 0.07 -0.04 -0.11 0.03 0.31 -0.26 -0.29 -0.19 -0.12 -0.2 -0.31 -0.33 -0.19
Bra011578 (RAC3)
-0.11 0.1 0.32 -0.0 0.61 0.47 -0.39 -0.41 0.05 0.21 0.18 -0.11 -0.16 0.56 0.52 0.32 -0.07 0.25 -0.08 -0.05 -0.21 0.02 -0.44 -0.27 -0.41 -0.4 -0.51 -0.25 -0.34 -0.23 -0.28
Bra011598 (GPAT9)
0.32 0.5 0.71 0.21 0.51 0.49 -0.47 -0.75 0.27 0.05 0.03 -0.22 -0.55 0.49 0.89 -0.05 -0.45 0.25 0.09 -0.25 -0.16 -0.32 0.08 -0.56 -0.69 -0.5 -0.53 -0.27 -0.33 -0.37 -0.54
Bra013172 (ATG8D)
0.35 0.71 0.28 0.14 1.0 0.73 -1.11 -1.28 0.17 -0.14 -0.01 -0.13 -0.51 0.71 0.62 -0.1 -0.37 -0.11 -0.25 -0.3 -0.36 0.03 0.21 -0.41 -0.6 -0.39 -0.5 -0.23 -0.18 -0.11 -0.58
Bra014390 (UXS2)
0.17 0.29 0.38 -0.12 0.56 0.37 -0.28 -0.03 -0.33 0.14 -0.24 -0.02 -0.16 0.51 0.52 0.16 0.15 0.36 -0.11 -0.02 0.08 0.28 0.75 -0.71 -0.57 -0.57 -0.6 -0.45 -0.64 -0.69 -1.32
0.96 0.85 1.16 0.89 1.58 1.22 -0.3 -0.83 -1.02 -0.18 -0.81 0.01 -0.89 0.92 1.08 0.03 -0.94 0.47 -0.66 -0.26 -0.39 -0.91 -1.89 -2.23 -2.07 -2.77 -1.95 -1.25 -0.39 -0.52 -1.91
0.88 0.33 0.6 0.68 1.33 1.15 -0.37 -0.37 0.04 -0.02 0.09 -0.15 -0.19 0.79 1.05 -0.19 -0.38 0.13 0.0 -0.32 -0.58 -0.49 -1.49 -1.57 -1.34 -1.77 -1.7 -0.74 -1.02 -0.8 -0.86
-0.14 0.57 0.31 0.14 0.37 0.62 -0.4 -0.21 0.08 -0.1 0.05 -0.0 -0.15 0.6 0.69 -0.05 -0.04 0.35 -0.1 0.05 -0.06 -0.12 0.11 -0.61 -0.68 -0.49 -0.57 -0.53 -0.34 -0.51 -0.43
0.41 0.63 0.25 0.28 0.64 0.51 -0.39 -0.43 0.07 -0.03 -0.09 -0.04 -0.26 0.61 0.63 0.09 -0.25 0.2 -0.03 -0.2 -0.23 -0.15 -0.33 -0.75 -0.6 -0.63 -0.6 -0.25 -0.25 -0.22 -0.29
Bra019048 (RMA3)
0.88 1.09 0.85 -0.32 0.79 1.15 -1.79 -2.49 0.2 -0.58 -0.23 0.12 -2.14 0.98 1.13 -0.67 -1.23 -1.02 -0.12 -0.59 -0.67 0.22 0.27 -0.5 -0.87 -1.32 -0.91 -0.38 0.06 0.16 -0.71
-0.32 1.18 2.22 -0.35 1.22 1.03 -1.32 -3.18 -0.84 -0.66 -1.59 -1.81 -0.93 1.2 1.46 -0.68 -0.8 0.99 -1.42 -1.49 -1.32 -0.65 1.65 -2.0 -2.57 -3.62 -1.49 -1.47 -1.63 -1.7 -1.91
0.42 -0.01 0.48 0.48 0.78 0.74 -0.34 -0.19 0.19 0.03 0.06 0.06 -0.18 0.83 0.82 -0.05 -0.09 0.43 0.14 -0.08 -0.27 -0.03 -0.77 -0.85 -0.99 -0.82 -1.18 -0.96 -0.55 -0.64 -0.86
Bra023262 (TTM1)
0.6 0.57 0.43 -0.09 0.78 0.83 -0.63 -0.77 0.02 -0.4 -0.11 -0.1 0.0 0.74 0.61 -0.31 -0.14 -0.0 -0.16 -0.03 -0.12 0.04 0.01 -0.51 -0.59 -0.36 -0.24 -0.4 -0.58 -0.8 -0.71
Bra023618 (LUC7B)
0.29 0.48 0.35 0.24 0.85 0.79 -0.23 -0.04 -0.55 -0.28 -0.32 -0.13 -0.03 0.36 0.72 -0.37 -0.09 0.04 -0.2 -0.25 -0.25 -0.17 -0.06 -0.33 -0.46 -0.8 -0.38 -0.22 -0.13 -0.44 -0.13
0.57 0.74 0.7 0.33 0.61 0.85 -0.35 -0.49 0.18 -0.09 -0.08 -0.03 -0.68 0.63 0.66 0.1 -0.08 -0.28 -0.09 -0.07 -0.23 0.04 -0.54 -1.02 -0.87 -1.08 -0.88 -0.59 -0.22 -0.19 -0.7
Bra025265 (PUX1)
0.37 0.54 0.58 0.06 0.56 0.68 -0.08 -0.4 0.0 0.03 -0.06 -0.13 -0.14 0.71 0.85 -0.11 -0.07 -0.08 -0.15 -0.29 -0.01 -0.1 -0.1 -0.65 -0.54 -0.89 -0.72 -0.4 -0.45 -0.57 -0.61
0.55 0.99 0.72 0.87 1.02 0.77 -0.83 -0.96 -0.28 -0.59 -0.6 -0.32 -0.3 0.69 0.61 -0.41 -0.46 0.3 -0.22 -0.09 -0.17 -0.23 0.04 -0.86 -0.79 -0.35 -0.69 -0.61 -0.66 -0.72 -0.61
Bra025399 (EXO70E1)
0.08 0.84 0.64 0.19 0.7 0.58 -0.46 -0.35 -0.15 -0.17 -0.36 -0.1 -1.03 0.61 0.64 -0.17 -0.17 0.43 -0.31 -0.13 -0.38 -0.28 0.28 -0.4 -0.7 -0.4 -0.52 -0.75 -0.12 0.02 -0.43
0.67 0.96 0.76 -0.33 1.48 1.05 -0.83 -1.68 0.31 -0.08 0.13 0.0 -1.72 0.87 1.06 -0.55 -0.56 -0.2 0.06 -0.53 -0.5 -0.27 -0.08 -1.63 -1.94 -1.42 -1.36 -0.83 -0.68 0.13 -0.59
Bra025593 (WIG)
0.48 0.51 0.56 0.1 0.61 0.59 -0.32 -0.27 0.06 -0.29 -0.11 -0.08 0.15 0.79 0.62 0.18 -0.02 0.08 -0.06 -0.1 -0.12 -0.04 0.14 -1.01 -0.83 -0.98 -0.85 -0.61 -0.68 -0.61 -0.43
Bra026095 (GOS11)
0.35 0.96 0.48 0.39 0.79 0.75 -0.5 -0.79 0.26 -0.25 -0.1 -0.08 -0.44 0.83 0.87 -0.11 -0.26 -0.37 -0.14 -0.29 -0.3 -0.27 -0.14 -0.83 -0.51 -0.79 -0.66 -0.31 -0.19 -0.68 -0.95
Bra026732 (WAKL4)
1.01 1.17 1.55 0.45 1.17 0.5 -0.34 -0.82 0.38 -1.14 -1.41 0.06 -1.05 0.1 -0.28 -0.72 0.23 0.68 0.32 -0.57 -0.79 -0.85 0.79 -1.61 -1.66 -1.96 -1.51 -1.44 -0.78 0.23 -1.58
Bra026825 (AL7)
0.44 0.61 0.3 -0.07 0.76 0.71 -0.06 -0.01 -0.27 -0.27 -0.2 -0.36 0.15 0.46 0.73 -0.06 -0.17 -0.12 -0.14 -0.18 -0.17 -0.04 0.08 -0.34 -0.4 -0.59 -0.47 -0.42 -0.44 -0.69 -0.52
Bra029076 (UBC10)
0.17 0.19 0.09 0.1 0.46 0.3 -0.21 -0.52 0.2 0.02 0.0 0.1 0.05 0.56 0.69 0.07 -0.11 -0.21 -0.18 0.0 -0.11 0.27 0.17 -0.31 -0.38 -0.31 -0.31 -0.31 -0.26 -0.54 -0.76
Bra032266 (PAT4)
0.62 0.58 0.39 0.36 0.85 0.73 -0.33 -0.69 0.2 -0.02 0.18 0.07 -0.57 1.04 1.02 0.01 -0.1 0.04 -0.03 -0.13 -0.2 -0.07 -0.49 -1.11 -1.05 -1.61 -1.05 -0.94 -0.6 -0.79 -0.98
Bra032351 (MNS3)
0.33 0.69 0.59 0.12 0.42 0.45 -0.32 -0.4 -0.08 0.19 -0.08 -0.05 -0.31 0.38 0.56 0.03 0.07 0.43 -0.05 -0.12 -0.15 0.2 0.67 -0.78 -0.87 -0.98 -0.77 -0.53 -0.7 -0.48 -0.99
Bra033076 (AAR3)
0.72 0.44 0.52 -0.02 1.69 0.87 -0.74 -0.86 -0.14 -0.39 -0.12 -0.45 -0.52 0.72 0.75 -0.22 -0.61 -0.04 0.09 -0.15 -0.37 -0.48 -0.45 -0.43 -0.86 -1.3 -0.87 -0.71 0.15 -0.73 -0.34
Bra033777 (SIS3)
0.54 0.14 0.37 0.12 0.84 0.84 -0.08 -0.66 0.01 -0.45 -0.27 -0.06 -0.33 0.64 0.6 -0.19 -0.08 -0.06 0.05 -0.0 -0.25 0.0 -0.21 -0.57 -0.33 -0.67 -0.34 -0.27 -0.23 -0.58 -0.41
Bra033840 (BIB)
0.73 0.82 0.28 0.44 1.39 0.74 -0.84 -0.92 -0.18 -0.32 -0.34 -0.07 -0.08 1.09 0.5 -0.37 -0.42 0.21 -0.1 -0.51 -0.42 -0.45 -0.39 -1.29 -1.05 -0.63 -0.89 -0.36 -0.29 -0.01 -1.04
0.3 0.45 0.35 -0.05 0.84 0.6 -0.4 -0.39 -0.02 -0.43 0.05 -0.43 -0.18 0.82 0.63 -0.13 -0.07 0.22 -0.21 -0.19 -0.33 -0.08 0.44 -0.58 -0.47 -0.78 -0.65 -0.46 -0.28 -0.49 -0.16
Bra035217 (CRK34)
0.13 0.64 1.15 0.43 1.05 0.39 -0.92 -2.77 -0.24 -0.62 -0.02 -0.04 -0.97 0.26 0.2 -1.28 -0.98 0.84 -0.37 -1.35 -2.09 -0.57 1.39 -0.38 -2.19 0.69 -0.65 -0.67 0.62 0.17 -1.13
0.27 0.35 0.62 0.0 0.57 0.42 -0.34 -0.36 0.28 -0.06 0.07 0.01 -0.21 0.71 0.73 -0.03 -0.06 0.35 -0.18 -0.07 -0.09 0.03 -0.08 -0.48 -0.64 -0.55 -0.69 -0.59 -0.53 -0.71 -0.71
Bra036818 (VPS35C)
0.14 0.21 0.18 -0.2 0.62 0.28 -0.29 -0.48 0.17 0.03 0.02 -0.08 -0.14 0.62 0.25 0.1 -0.01 0.03 0.04 -0.16 -0.13 0.02 -0.09 -0.21 -0.33 -0.24 -0.22 -0.28 -0.25 -0.24 -0.08
0.25 0.1 -0.09 -0.14 0.66 0.32 -0.33 -0.1 0.12 0.06 0.13 0.02 0.09 0.64 0.55 0.03 -0.13 0.33 -0.09 -0.08 -0.31 -0.02 -0.1 -0.57 -0.6 -0.32 -0.5 -0.08 -0.25 -0.35 -0.3
0.53 0.62 0.9 0.27 1.04 0.75 -0.32 -0.57 -0.05 -0.23 -0.33 -0.22 -0.07 0.92 0.89 -0.3 -0.53 0.5 -0.01 -0.62 -0.29 -0.04 0.75 -0.9 -1.15 -1.65 -1.18 -0.93 -0.92 -1.26 -1.8
0.3 0.43 0.62 0.06 0.41 0.28 -0.14 -0.46 -0.32 -0.15 -0.34 -0.27 -0.52 0.3 0.67 -0.21 0.05 0.58 0.09 -0.17 -0.46 -0.04 1.09 -0.54 -0.39 -1.03 -0.52 -0.68 -0.31 -0.32 -0.37
Bra040885 (SAY1)
0.42 0.5 0.28 0.03 0.56 0.71 -0.25 -0.56 0.08 0.1 0.07 -0.0 -0.4 0.36 0.76 -0.21 -0.27 -0.27 -0.23 -0.1 -0.28 -0.06 0.22 -0.45 -0.42 -0.41 -0.48 -0.3 -0.12 -0.41 -0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.