1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_70 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000472 (PH1)
 0.58 0.68 0.84 0.53 0.95 0.81 0.52 0.53 0.65 0.62 0.65 0.57 0.6 1.0 0.94 0.56 0.56 0.59 0.55 0.66 0.53 0.58 0.42 0.47 0.46 0.42 0.42 0.45 0.51 0.5 0.46
Bra001092 (APRL5)
 0.57 0.73 1.0 0.56 0.6 0.63 0.32 0.33 0.42 0.45 0.41 0.39 0.38 0.58 0.75 0.46 0.41 0.59 0.41 0.44 0.46 0.45 0.6 0.37 0.4 0.31 0.3 0.34 0.42 0.34 0.39
0.61 0.7 0.67 0.53 0.86 0.61 0.45 0.55 0.66 0.62 0.69 0.61 0.6 1.0 0.87 0.68 0.58 0.81 0.56 0.53 0.51 0.53 0.57 0.48 0.41 0.49 0.47 0.51 0.42 0.48 0.53
Bra002823 (BTL04)
 0.74 0.65 0.89 0.53 0.72 0.94 0.33 0.25 0.47 0.38 0.34 0.52 0.35 1.0 0.65 0.37 0.24 0.48 0.56 0.39 0.46 0.38 0.7 0.25 0.21 0.15 0.19 0.4 0.39 0.4 0.33
0.6 0.65 0.58 0.28 1.0 0.68 0.17 0.16 0.58 0.4 0.33 0.42 0.09 0.8 0.52 0.26 0.18 0.38 0.31 0.34 0.26 0.39 0.52 0.19 0.17 0.15 0.23 0.36 0.43 0.42 0.15
Bra003718 (RDS2)
 0.57 0.68 0.61 0.54 0.93 0.82 0.44 0.41 0.65 0.66 0.58 0.66 0.67 0.97 1.0 0.6 0.61 0.63 0.51 0.61 0.51 0.64 0.5 0.43 0.42 0.43 0.47 0.4 0.46 0.43 0.33
0.48 0.69 0.44 0.27 0.53 0.48 0.21 0.19 0.23 0.2 0.17 0.34 0.12 0.49 0.5 0.35 0.27 0.42 0.23 0.3 0.19 0.35 1.0 0.13 0.09 0.11 0.1 0.12 0.14 0.24 0.07
Bra004301 (ARG1)
 0.81 0.88 1.0 0.72 0.82 0.84 0.58 0.58 0.62 0.6 0.61 0.56 0.59 0.86 0.92 0.6 0.56 0.68 0.61 0.69 0.62 0.7 0.7 0.46 0.48 0.44 0.43 0.54 0.59 0.46 0.51
Bra005710 (SSR1)
 0.71 0.97 0.73 0.35 1.0 0.72 0.29 0.26 0.32 0.27 0.29 0.38 0.33 0.62 0.97 0.43 0.32 0.5 0.39 0.37 0.38 0.47 0.46 0.29 0.21 0.25 0.24 0.32 0.28 0.34 0.41
Bra005828 (ALA1)
 0.84 0.95 1.0 0.72 0.9 0.81 0.49 0.53 0.58 0.53 0.51 0.58 0.46 0.82 0.81 0.64 0.6 0.8 0.54 0.63 0.52 0.64 0.71 0.35 0.36 0.39 0.39 0.43 0.48 0.54 0.41
Bra006039 (NRPB4)
 0.79 0.64 0.67 0.49 1.0 0.86 0.37 0.36 0.48 0.4 0.44 0.5 0.41 0.91 0.7 0.47 0.35 0.46 0.48 0.41 0.37 0.47 0.57 0.28 0.27 0.22 0.27 0.38 0.46 0.37 0.38
0.68 0.95 0.83 0.69 1.0 0.79 0.48 0.45 0.65 0.69 0.62 0.59 0.44 0.94 0.94 0.63 0.54 0.68 0.64 0.62 0.52 0.63 0.52 0.43 0.39 0.37 0.38 0.51 0.48 0.47 0.41
Bra006350 (AAE5)
 0.32 0.89 1.0 0.52 0.83 0.48 0.09 0.04 0.29 0.16 0.16 0.17 0.13 0.44 0.76 0.15 0.13 0.85 0.34 0.23 0.18 0.14 0.68 0.18 0.1 0.33 0.12 0.19 0.27 0.49 0.12
Bra006373 (BPA1)
 0.85 0.96 0.87 0.7 0.84 0.89 0.31 0.28 0.39 0.34 0.4 0.35 0.33 0.76 1.0 0.46 0.41 0.45 0.39 0.33 0.33 0.39 0.39 0.28 0.23 0.23 0.24 0.3 0.3 0.2 0.27
Bra006933 (MMZ3)
 0.71 0.67 0.63 0.59 0.98 0.91 0.31 0.42 0.65 0.59 0.53 0.52 0.44 0.86 1.0 0.47 0.3 0.5 0.49 0.46 0.34 0.61 0.26 0.23 0.22 0.19 0.21 0.26 0.29 0.24 0.24
Bra007006 (JAT4)
 0.55 0.54 0.49 0.36 1.0 0.74 0.12 0.14 0.25 0.22 0.19 0.29 0.2 0.86 0.68 0.23 0.12 0.41 0.29 0.21 0.36 0.23 0.05 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.05 0.04 0.03
Bra007547 (VAP)
 0.68 0.8 0.72 0.52 0.94 0.71 0.29 0.24 0.65 0.51 0.58 0.47 0.41 0.88 1.0 0.47 0.37 0.58 0.49 0.45 0.35 0.52 0.23 0.2 0.15 0.19 0.14 0.16 0.21 0.2 0.17
0.6 0.61 0.73 0.54 0.65 0.64 0.29 0.31 0.45 0.47 0.37 0.37 0.32 0.57 0.64 0.4 0.44 0.71 0.48 0.43 0.42 0.5 1.0 0.4 0.4 0.23 0.32 0.36 0.38 0.35 0.26
Bra009629 (HAKAI)
 0.85 0.81 0.9 0.78 0.86 0.86 0.41 0.43 0.71 0.51 0.54 0.57 0.54 0.87 1.0 0.57 0.53 0.71 0.61 0.58 0.59 0.57 0.78 0.5 0.57 0.39 0.53 0.52 0.56 0.47 0.46
Bra009849 (CID6)
 0.6 0.67 0.73 0.47 1.0 0.69 0.3 0.29 0.67 0.55 0.53 0.56 0.3 0.8 0.81 0.45 0.37 0.44 0.51 0.43 0.48 0.57 0.62 0.45 0.4 0.26 0.45 0.44 0.54 0.5 0.39
Bra009857 (PEX4)
 0.66 0.76 0.78 0.64 0.87 0.81 0.5 0.43 0.81 0.66 0.66 0.59 0.64 1.0 0.96 0.63 0.63 0.71 0.58 0.54 0.62 0.6 0.61 0.55 0.52 0.5 0.49 0.61 0.49 0.45 0.51
0.25 0.21 0.22 0.02 0.49 0.46 0.18 0.27 0.39 0.29 0.33 0.29 0.56 1.0 0.65 0.46 0.37 0.56 0.47 0.49 0.52 0.33 0.59 0.24 0.24 0.12 0.25 0.16 0.19 0.21 0.25
Bra010195 (TPR9)
 0.91 0.87 1.0 0.71 0.96 0.86 0.37 0.44 0.64 0.48 0.56 0.44 0.53 0.92 0.97 0.53 0.54 0.62 0.63 0.52 0.49 0.44 0.36 0.32 0.33 0.3 0.31 0.36 0.43 0.36 0.38
0.67 0.88 0.85 0.59 1.0 0.82 0.31 0.23 0.49 0.59 0.53 0.59 0.21 0.81 0.75 0.47 0.39 0.74 0.39 0.46 0.36 0.53 0.89 0.25 0.29 0.29 0.28 0.35 0.37 0.34 0.23
Bra011067 (ckl3)
 0.64 0.73 0.58 0.35 1.0 0.7 0.1 0.09 0.41 0.3 0.33 0.3 0.1 0.76 0.71 0.29 0.22 0.22 0.35 0.29 0.23 0.32 0.34 0.24 0.2 0.27 0.15 0.31 0.37 0.44 0.19
Bra011075 (TCX5)
 0.83 0.84 0.82 0.82 0.95 0.89 0.28 0.35 0.43 0.41 0.52 0.37 0.37 0.89 1.0 0.55 0.45 0.63 0.35 0.36 0.36 0.44 0.58 0.32 0.27 0.28 0.29 0.36 0.5 0.43 0.37
Bra011120 (PECP3)
 0.73 0.74 1.0 0.53 0.79 0.68 0.42 0.28 0.49 0.39 0.43 0.39 0.37 0.68 0.68 0.47 0.38 0.36 0.39 0.41 0.5 0.54 0.42 0.36 0.32 0.25 0.3 0.36 0.38 0.34 0.4
Bra011504 (VHA-H)
 0.51 0.59 0.54 0.49 0.72 0.57 0.45 0.44 0.64 0.71 0.56 0.56 0.62 1.0 0.84 0.65 0.56 0.69 0.61 0.57 0.54 0.6 0.72 0.49 0.48 0.51 0.54 0.51 0.47 0.47 0.51
Bra011578 (RAC3)
 0.61 0.7 0.82 0.65 1.0 0.91 0.5 0.49 0.68 0.75 0.74 0.61 0.58 0.96 0.94 0.82 0.63 0.78 0.62 0.63 0.57 0.66 0.48 0.54 0.49 0.49 0.46 0.55 0.52 0.56 0.54
Bra011598 (GPAT9)
 0.67 0.76 0.88 0.62 0.77 0.76 0.39 0.32 0.65 0.56 0.55 0.46 0.37 0.76 1.0 0.52 0.4 0.64 0.57 0.45 0.48 0.43 0.57 0.37 0.33 0.38 0.37 0.45 0.43 0.42 0.37
Bra013172 (ATG8D)
 0.64 0.82 0.61 0.55 1.0 0.83 0.23 0.21 0.56 0.46 0.5 0.46 0.35 0.82 0.77 0.47 0.39 0.46 0.42 0.41 0.39 0.51 0.58 0.38 0.33 0.38 0.35 0.43 0.44 0.46 0.33
Bra014390 (UXS2)
 0.67 0.73 0.77 0.55 0.87 0.77 0.49 0.58 0.47 0.65 0.5 0.59 0.53 0.84 0.85 0.67 0.66 0.76 0.55 0.59 0.63 0.72 1.0 0.36 0.4 0.4 0.39 0.43 0.38 0.37 0.24
0.65 0.6 0.74 0.62 1.0 0.78 0.27 0.19 0.17 0.3 0.19 0.34 0.18 0.63 0.71 0.34 0.17 0.46 0.21 0.28 0.25 0.18 0.09 0.07 0.08 0.05 0.09 0.14 0.26 0.23 0.09
0.73 0.5 0.6 0.64 1.0 0.88 0.31 0.31 0.41 0.39 0.42 0.36 0.35 0.69 0.82 0.35 0.3 0.44 0.4 0.32 0.27 0.28 0.14 0.13 0.16 0.12 0.12 0.24 0.2 0.23 0.22
0.56 0.92 0.77 0.68 0.8 0.95 0.47 0.54 0.66 0.58 0.64 0.62 0.56 0.94 1.0 0.6 0.6 0.79 0.58 0.64 0.6 0.57 0.67 0.41 0.39 0.44 0.42 0.43 0.49 0.44 0.46
0.85 0.99 0.76 0.78 1.0 0.92 0.49 0.47 0.67 0.63 0.6 0.62 0.54 0.98 0.99 0.68 0.54 0.74 0.63 0.56 0.55 0.58 0.51 0.38 0.42 0.41 0.42 0.54 0.54 0.55 0.52
Bra019048 (RMA3)
 0.83 0.96 0.82 0.36 0.78 1.0 0.13 0.08 0.52 0.3 0.38 0.49 0.1 0.89 0.99 0.28 0.19 0.22 0.42 0.3 0.28 0.53 0.55 0.32 0.25 0.18 0.24 0.35 0.47 0.51 0.28
0.17 0.49 1.0 0.17 0.5 0.44 0.09 0.02 0.12 0.14 0.07 0.06 0.11 0.49 0.59 0.13 0.12 0.43 0.08 0.08 0.09 0.14 0.67 0.05 0.04 0.02 0.08 0.08 0.07 0.07 0.06
0.75 0.56 0.78 0.78 0.97 0.94 0.44 0.49 0.64 0.57 0.58 0.59 0.5 1.0 0.99 0.54 0.53 0.76 0.62 0.53 0.47 0.55 0.33 0.31 0.28 0.32 0.25 0.29 0.38 0.36 0.31
Bra023262 (TTM1)
 0.85 0.84 0.76 0.53 0.97 1.0 0.36 0.33 0.57 0.43 0.52 0.53 0.56 0.94 0.86 0.46 0.51 0.56 0.5 0.55 0.52 0.58 0.57 0.4 0.38 0.44 0.48 0.43 0.38 0.32 0.34
Bra023618 (LUC7B)
 0.67 0.77 0.71 0.66 1.0 0.96 0.47 0.54 0.38 0.46 0.44 0.51 0.54 0.71 0.91 0.43 0.52 0.57 0.48 0.46 0.47 0.49 0.53 0.44 0.4 0.32 0.43 0.48 0.51 0.41 0.51
0.82 0.93 0.9 0.7 0.85 1.0 0.44 0.4 0.63 0.52 0.53 0.55 0.35 0.86 0.88 0.6 0.52 0.46 0.52 0.53 0.47 0.57 0.38 0.27 0.3 0.26 0.3 0.37 0.48 0.49 0.34
Bra025265 (PUX1)
 0.72 0.81 0.83 0.58 0.82 0.89 0.52 0.42 0.55 0.57 0.53 0.51 0.5 0.91 1.0 0.51 0.53 0.52 0.5 0.45 0.55 0.51 0.52 0.35 0.38 0.3 0.34 0.42 0.4 0.37 0.36
0.72 0.98 0.81 0.9 1.0 0.84 0.28 0.25 0.41 0.33 0.32 0.39 0.4 0.8 0.75 0.37 0.36 0.61 0.42 0.46 0.44 0.42 0.51 0.27 0.29 0.39 0.31 0.32 0.31 0.3 0.32
Bra025399 (EXO70E1)
 0.59 1.0 0.87 0.64 0.91 0.83 0.41 0.44 0.5 0.5 0.43 0.52 0.27 0.85 0.87 0.49 0.5 0.75 0.45 0.51 0.43 0.46 0.68 0.42 0.34 0.42 0.39 0.33 0.51 0.57 0.41
0.57 0.69 0.61 0.29 1.0 0.74 0.2 0.11 0.44 0.34 0.39 0.36 0.11 0.66 0.74 0.24 0.24 0.31 0.37 0.25 0.25 0.3 0.34 0.12 0.09 0.13 0.14 0.2 0.22 0.39 0.24
Bra025593 (WIG)
 0.81 0.82 0.86 0.62 0.88 0.87 0.46 0.48 0.6 0.47 0.54 0.55 0.64 1.0 0.89 0.65 0.57 0.61 0.55 0.54 0.53 0.56 0.64 0.29 0.33 0.29 0.32 0.38 0.36 0.38 0.43
Bra026095 (GOS11)
 0.66 1.0 0.72 0.68 0.89 0.87 0.37 0.3 0.62 0.43 0.48 0.49 0.38 0.92 0.94 0.48 0.43 0.4 0.47 0.42 0.42 0.43 0.47 0.29 0.36 0.3 0.33 0.41 0.45 0.32 0.27
Bra026732 (WAKL4)
 0.69 0.77 1.0 0.47 0.77 0.48 0.27 0.19 0.45 0.16 0.13 0.36 0.17 0.37 0.28 0.21 0.4 0.55 0.43 0.23 0.2 0.19 0.59 0.11 0.11 0.09 0.12 0.13 0.2 0.4 0.11
Bra026825 (AL7)
 0.8 0.9 0.73 0.56 1.0 0.96 0.56 0.59 0.49 0.49 0.51 0.46 0.65 0.81 0.98 0.56 0.52 0.54 0.54 0.52 0.52 0.57 0.62 0.47 0.45 0.39 0.43 0.44 0.44 0.37 0.41
Bra029076 (UBC10)
 0.7 0.71 0.66 0.66 0.86 0.76 0.54 0.43 0.71 0.63 0.62 0.67 0.64 0.92 1.0 0.65 0.58 0.54 0.55 0.62 0.57 0.75 0.7 0.5 0.48 0.5 0.5 0.5 0.52 0.43 0.37
Bra032266 (PAT4)
 0.75 0.73 0.64 0.62 0.88 0.81 0.39 0.3 0.56 0.48 0.55 0.51 0.33 1.0 0.99 0.49 0.45 0.5 0.48 0.44 0.42 0.46 0.35 0.22 0.23 0.16 0.23 0.25 0.32 0.28 0.25
Bra032351 (MNS3)
 0.78 1.0 0.93 0.67 0.83 0.85 0.5 0.47 0.59 0.71 0.59 0.6 0.5 0.81 0.92 0.63 0.65 0.84 0.6 0.57 0.56 0.71 0.99 0.36 0.34 0.32 0.36 0.43 0.38 0.45 0.31
Bra033076 (AAR3)
 0.51 0.42 0.45 0.31 1.0 0.57 0.19 0.17 0.28 0.24 0.29 0.23 0.22 0.51 0.52 0.27 0.2 0.3 0.33 0.28 0.24 0.22 0.23 0.23 0.17 0.13 0.17 0.19 0.34 0.19 0.25
Bra033777 (SIS3)
 0.81 0.61 0.72 0.6 1.0 1.0 0.53 0.35 0.56 0.41 0.46 0.54 0.44 0.87 0.85 0.49 0.53 0.53 0.58 0.56 0.47 0.56 0.48 0.38 0.44 0.35 0.44 0.46 0.47 0.37 0.42
Bra033840 (BIB)
 0.63 0.67 0.46 0.52 1.0 0.64 0.21 0.2 0.34 0.31 0.3 0.36 0.36 0.81 0.54 0.3 0.28 0.44 0.36 0.27 0.28 0.28 0.29 0.16 0.18 0.25 0.21 0.3 0.31 0.38 0.19
0.69 0.76 0.71 0.54 1.0 0.85 0.42 0.43 0.55 0.42 0.58 0.42 0.5 0.99 0.87 0.51 0.53 0.65 0.48 0.49 0.45 0.53 0.76 0.38 0.41 0.33 0.36 0.41 0.46 0.4 0.5
Bra035217 (CRK34)
 0.42 0.6 0.85 0.52 0.79 0.5 0.2 0.06 0.32 0.25 0.38 0.37 0.19 0.46 0.44 0.16 0.19 0.69 0.3 0.15 0.09 0.26 1.0 0.29 0.08 0.62 0.24 0.24 0.59 0.43 0.18
0.73 0.77 0.93 0.61 0.9 0.81 0.48 0.47 0.74 0.58 0.63 0.61 0.52 0.99 1.0 0.59 0.58 0.77 0.53 0.58 0.57 0.62 0.57 0.43 0.39 0.41 0.38 0.4 0.42 0.37 0.37
Bra036818 (VPS35C)
 0.72 0.75 0.74 0.57 1.0 0.79 0.53 0.47 0.73 0.66 0.66 0.61 0.59 0.99 0.77 0.7 0.65 0.66 0.67 0.58 0.59 0.66 0.61 0.56 0.52 0.55 0.56 0.53 0.54 0.55 0.61
0.75 0.68 0.59 0.57 1.0 0.79 0.5 0.59 0.69 0.66 0.69 0.64 0.67 0.98 0.93 0.64 0.58 0.79 0.6 0.6 0.51 0.62 0.59 0.42 0.42 0.51 0.45 0.6 0.53 0.5 0.51
0.7 0.75 0.91 0.59 1.0 0.82 0.39 0.33 0.47 0.42 0.39 0.42 0.46 0.92 0.9 0.4 0.34 0.69 0.48 0.32 0.4 0.47 0.82 0.26 0.22 0.15 0.21 0.26 0.26 0.2 0.14
0.58 0.63 0.72 0.49 0.62 0.57 0.42 0.34 0.38 0.42 0.37 0.39 0.33 0.58 0.75 0.41 0.48 0.7 0.5 0.42 0.34 0.46 1.0 0.32 0.36 0.23 0.33 0.29 0.38 0.38 0.36
Bra040885 (SAY1)
 0.79 0.84 0.72 0.61 0.87 0.97 0.5 0.4 0.62 0.64 0.62 0.59 0.45 0.76 1.0 0.51 0.49 0.49 0.5 0.55 0.49 0.57 0.69 0.43 0.44 0.45 0.43 0.48 0.54 0.45 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)