Heatmap: Cluster_110 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
16.27 16.37 14.42 14.38 15.84 10.73 10.77 10.88 11.92 14.28 11.97 11.15 12.1 16.05 12.42 11.97 12.18 13.54 10.63 9.95 12.85 12.51 14.23 12.71 12.04 13.1 13.97 16.11 14.36 11.91
82.84 90.75 71.99 78.85 77.38 62.94 56.99 65.67 63.63 77.43 64.12 65.26 65.75 101.33 69.61 71.26 69.6 62.06 57.26 53.37 66.72 64.63 71.3 73.29 66.06 70.99 73.97 91.21 85.23 66.61
14.32 15.33 12.61 13.27 15.35 10.17 9.04 8.53 10.41 11.29 10.28 10.27 11.96 13.42 12.47 11.25 11.05 10.22 8.97 8.48 10.19 10.71 12.44 10.84 10.49 11.15 12.07 13.74 12.73 11.36
2.98 3.12 2.32 2.5 2.52 1.5 1.42 1.7 1.95 2.07 1.77 1.81 1.61 1.86 1.5 1.85 1.91 1.39 1.46 1.31 1.69 1.77 1.84 1.87 1.67 1.88 1.86 2.56 3.01 2.34
4.93 5.16 4.66 4.99 4.77 3.69 4.01 4.39 4.33 4.4 4.34 4.11 3.92 4.73 4.22 3.99 3.97 3.75 3.68 3.62 4.27 4.0 4.3 3.74 4.22 4.37 4.8 5.03 4.56 4.06
2.8 2.9 2.24 2.23 2.29 1.46 1.38 1.32 1.88 2.31 1.64 1.81 1.46 2.29 1.53 1.55 1.43 1.59 1.24 1.2 1.65 1.7 1.54 1.63 1.6 1.76 1.99 2.64 2.75 2.07
2.04 2.38 1.96 1.92 1.7 1.23 1.3 1.6 1.42 1.56 1.34 1.35 1.42 1.74 1.46 1.32 1.23 1.21 0.97 0.95 1.26 1.41 1.58 1.28 1.2 1.54 1.7 1.95 2.11 2.12
9.58 9.96 8.24 7.77 7.9 6.47 6.2 6.25 8.21 7.61 6.57 6.85 6.15 10.32 6.74 6.67 6.16 5.96 5.12 5.08 6.37 6.81 7.34 6.57 6.35 6.96 7.28 9.37 8.95 7.81
Spov3_chr2.00964 (UGT79B6)
1.36 1.46 1.08 0.79 1.5 0.66 0.6 0.66 0.73 0.83 0.68 0.56 0.94 1.1 0.59 0.74 0.88 1.47 0.83 0.7 0.94 1.08 0.56 0.79 0.65 0.72 0.81 1.22 1.18 1.02
6.42 6.15 5.91 6.37 5.64 4.38 4.23 4.24 5.36 5.83 5.19 5.09 5.49 6.7 5.2 4.96 4.84 5.11 4.3 4.42 4.95 4.56 4.95 4.57 4.77 5.37 5.6 5.97 5.83 5.96
9.98 10.05 8.22 6.33 10.22 5.8 5.91 5.02 7.67 8.58 7.26 7.01 7.6 7.78 6.57 7.63 7.99 8.98 7.13 5.95 8.18 7.95 5.57 5.91 7.53 8.67 9.06 8.31 8.69 8.79
9.98 10.05 8.22 6.33 10.22 5.8 5.91 5.02 7.67 8.58 7.26 7.01 7.6 7.78 6.57 7.63 7.99 8.98 7.13 5.95 8.18 7.95 5.57 5.91 7.53 8.67 9.06 8.31 8.69 8.79
5.16 5.29 4.86 4.66 5.32 4.05 4.08 4.62 4.63 4.79 4.51 4.43 4.02 5.15 4.21 4.36 4.69 4.3 3.88 3.81 4.25 4.36 4.3 3.98 4.55 4.67 5.14 4.97 4.92 4.37
18.19 18.06 16.67 16.54 18.22 14.94 13.36 14.25 15.3 15.53 14.18 14.66 14.24 16.22 14.62 14.02 14.02 13.8 12.68 12.45 14.37 14.34 17.85 13.7 14.22 14.92 15.45 17.15 17.26 16.4
3.94 3.85 3.64 3.54 3.43 3.08 3.08 3.34 3.35 3.77 3.41 3.78 3.17 4.27 3.35 3.21 3.37 2.75 2.67 2.79 3.33 3.2 3.15 3.02 3.22 3.5 3.73 4.08 3.61 3.48
3.82 3.7 3.16 3.08 3.98 2.79 2.7 2.94 2.87 2.93 2.98 2.83 3.31 3.46 3.24 3.11 3.33 3.15 2.58 2.39 3.01 2.94 3.35 2.81 2.88 3.08 3.44 3.15 3.56 3.71
4.35 4.69 3.68 3.78 3.66 2.34 1.8 1.82 2.94 3.32 2.44 2.62 2.04 4.43 2.36 2.29 2.07 2.71 1.9 1.8 2.49 2.44 2.41 2.49 2.42 2.7 2.97 3.79 4.12 3.5
8.36 8.79 6.13 6.02 7.32 3.96 3.75 4.8 5.53 6.3 5.23 5.53 5.88 8.26 5.13 5.37 5.12 4.79 4.87 3.9 5.77 5.46 7.05 6.81 5.47 5.74 6.74 7.56 7.77 5.33
2.53 2.59 2.19 2.24 2.26 1.89 1.84 2.06 2.13 2.32 2.15 2.07 1.88 2.81 2.18 2.16 2.18 2.03 1.74 1.63 2.02 1.73 2.12 1.69 1.88 2.15 2.19 2.34 2.44 2.15
5.1 4.73 4.1 3.78 5.68 3.88 3.68 3.69 3.97 5.0 3.79 3.96 3.83 4.97 4.02 3.8 4.13 3.67 3.31 3.61 3.85 3.78 3.48 3.53 4.15 4.12 5.03 4.64 4.74 4.63
22.6 23.77 21.92 22.25 24.84 18.47 16.75 16.94 20.29 22.1 19.62 19.36 19.84 24.39 20.31 19.72 19.64 21.14 17.84 16.46 18.56 18.32 23.12 19.69 19.74 19.28 21.59 23.53 21.12 20.32
8.29 8.45 7.95 7.98 7.45 6.33 5.99 6.42 7.18 7.22 6.73 7.07 6.46 7.65 6.95 6.46 6.93 6.6 6.28 6.09 6.78 6.96 6.49 6.31 6.44 7.02 7.37 7.31 7.84 8.22
7.77 7.29 6.63 6.64 7.02 5.36 4.94 5.26 5.64 6.14 5.3 5.67 5.29 7.56 5.65 5.48 5.6 5.16 4.54 4.41 5.26 5.22 6.36 5.85 5.34 5.58 5.8 7.39 7.46 5.92
4.81 5.15 3.97 4.3 4.31 3.79 3.46 3.69 3.65 3.99 3.38 3.69 3.27 5.54 3.66 3.97 3.61 3.46 2.92 2.72 3.07 3.52 3.86 3.61 3.2 3.75 3.82 4.43 4.23 3.89
8.74 8.33 7.24 7.73 6.76 5.4 5.1 5.1 6.05 6.8 5.64 5.79 5.55 6.4 5.36 5.35 5.36 5.08 4.87 4.3 5.34 5.61 5.23 5.52 5.82 6.04 6.52 8.07 8.06 6.75
3.61 3.59 3.08 2.87 2.86 2.63 2.66 2.34 2.65 3.07 2.65 2.47 2.61 3.49 2.78 2.84 2.7 2.58 2.37 2.05 2.77 2.52 3.24 2.49 2.35 2.55 2.79 3.12 3.1 3.03
7.88 8.08 6.42 6.68 7.79 6.06 5.99 5.22 6.38 7.35 6.34 6.21 6.31 9.72 6.15 6.66 6.85 6.07 5.42 5.12 5.75 6.01 7.26 6.55 6.38 6.2 6.77 8.67 8.38 6.17
7.01 7.09 5.81 6.21 6.21 4.08 3.55 3.88 4.67 5.68 4.38 4.28 4.77 4.42 3.73 4.25 4.27 4.66 3.41 3.13 4.64 4.12 5.93 4.69 4.53 4.68 5.28 6.62 6.39 5.44
8.17 8.56 7.67 7.76 8.54 6.29 6.12 7.11 6.4 6.89 5.99 6.12 6.14 8.1 6.48 6.17 6.32 6.51 5.85 5.34 5.91 6.45 7.59 6.54 6.29 6.74 7.02 8.59 8.76 7.83
7.62 7.55 6.98 7.16 6.89 5.43 5.68 6.46 6.29 6.71 5.78 5.55 5.55 6.57 5.76 5.86 5.91 6.03 5.07 4.91 5.7 5.6 6.82 5.6 5.98 6.08 6.23 7.35 7.29 6.66
3.93 4.49 3.31 3.72 3.46 2.92 2.6 3.03 2.61 2.79 2.55 2.7 2.85 4.37 2.99 2.98 3.15 3.06 2.15 2.12 2.58 2.62 2.71 2.86 2.72 2.94 3.11 3.75 3.38 3.08
7.74 7.05 6.71 6.41 8.57 5.32 4.87 6.77 5.59 7.62 6.05 6.04 5.99 6.09 6.0 6.29 5.71 6.01 5.64 5.64 6.41 5.56 5.85 5.88 6.06 6.32 6.89 7.66 7.41 6.39
3.78 3.68 3.3 3.32 3.08 2.54 2.37 2.72 2.89 2.94 2.51 2.77 2.68 3.49 2.72 2.58 2.91 2.85 2.12 2.25 2.52 2.63 3.12 2.57 2.77 2.62 2.85 3.48 3.33 3.03
2.31 2.59 2.1 2.04 1.88 1.39 1.43 1.53 1.89 1.96 1.69 1.74 1.54 2.15 1.6 1.55 1.42 1.38 1.29 1.3 1.7 1.64 2.17 1.56 1.53 1.71 1.92 2.01 2.16 2.04
10.89 10.7 9.25 9.47 8.03 7.03 6.68 6.52 7.41 7.76 6.88 7.15 6.54 10.9 7.89 7.63 7.18 7.11 6.11 5.89 7.09 7.41 9.04 7.15 6.84 6.85 7.67 9.63 9.32 8.8
7.14 7.39 6.84 6.98 6.15 4.21 4.01 4.26 5.31 5.59 4.8 5.03 4.79 5.39 4.68 4.3 4.27 4.87 4.0 3.87 4.54 4.88 5.83 4.24 4.52 5.07 5.88 6.13 6.9 6.43
4.46 4.41 3.94 4.02 3.27 2.82 2.8 3.31 3.37 3.46 2.97 3.13 2.83 3.72 2.79 2.82 2.99 2.34 2.55 2.43 2.88 3.11 3.46 3.08 3.03 3.04 3.28 4.11 3.89 3.54
6.39 7.16 6.41 6.28 7.13 4.54 4.07 4.91 4.77 5.71 4.73 4.78 4.87 7.02 4.72 4.9 4.65 5.56 4.22 4.02 5.2 4.9 4.9 5.25 4.92 5.12 5.46 6.47 6.55 5.04
3.72 4.03 3.25 3.44 3.37 2.72 2.56 2.71 2.86 3.04 2.8 2.9 2.76 3.46 2.81 2.8 2.81 2.47 2.35 2.25 2.64 2.79 2.86 2.86 2.69 2.95 2.97 3.48 3.42 3.21
8.32 9.1 7.46 7.27 7.58 6.53 6.14 6.01 7.0 7.23 6.38 6.84 6.37 8.74 7.14 6.32 6.33 5.53 5.11 4.98 5.73 6.16 6.7 6.12 5.84 6.14 6.68 7.63 8.19 7.25
3.8 3.88 3.14 3.36 2.95 2.68 2.24 2.66 2.95 3.45 2.76 3.15 2.81 3.8 2.75 2.83 2.81 2.59 2.53 2.25 2.74 2.72 2.9 3.06 2.74 2.99 3.26 4.17 3.25 2.82
5.88 5.85 5.27 4.81 5.74 4.07 4.34 4.53 5.39 5.44 5.03 5.11 4.86 5.07 5.3 4.76 4.82 4.34 4.39 4.29 4.97 5.18 5.31 4.56 4.78 5.2 5.44 5.44 5.77 4.99
9.4 9.83 8.36 9.71 7.9 7.67 7.04 8.02 7.18 7.45 7.41 7.53 7.2 10.74 8.02 7.94 8.12 6.77 6.22 6.21 6.95 7.61 7.87 7.58 7.4 7.47 7.78 10.03 8.9 7.9
9.88 10.25 9.11 9.54 8.73 7.54 7.09 7.2 7.44 7.98 7.27 7.69 7.13 11.39 7.63 7.47 7.38 7.94 6.39 6.06 7.87 7.75 7.42 7.69 7.44 7.74 7.92 10.34 8.88 6.81
4.63 4.44 4.19 4.24 3.87 2.71 2.86 3.49 3.11 3.37 2.84 2.98 2.8 3.67 3.2 2.97 3.11 2.74 2.36 2.34 2.91 2.97 3.88 3.17 2.96 2.93 3.38 4.24 4.41 3.67
20.86 19.11 17.43 15.37 19.67 11.25 11.14 12.35 15.38 19.7 15.42 14.07 15.37 16.74 14.81 13.56 14.48 15.28 13.67 12.4 14.85 15.44 12.99 14.82 15.13 16.09 16.43 17.67 17.81 16.56
4.22 4.18 3.23 2.85 3.46 2.07 1.91 2.85 2.36 3.12 2.39 2.75 2.4 3.36 2.21 2.53 2.62 2.71 2.61 2.11 2.43 2.4 3.44 2.9 2.73 2.79 3.15 3.96 3.05 3.21
4.41 4.66 4.04 3.79 3.75 3.13 2.75 2.73 3.14 3.49 3.03 3.23 2.78 5.16 3.21 2.96 3.03 2.98 2.3 2.32 3.03 3.14 3.4 2.6 2.64 2.97 3.46 4.11 4.15 3.79
5.59 5.33 4.7 4.82 5.27 3.35 3.29 3.69 4.01 4.64 3.7 4.14 3.34 4.52 3.73 3.62 3.58 3.83 3.55 3.07 3.58 3.79 5.12 4.02 3.9 4.22 4.61 5.3 5.27 4.34
2.81 2.85 2.44 2.24 3.09 2.02 2.07 2.65 2.08 2.63 2.25 2.26 2.5 2.66 2.57 2.58 2.43 2.1 1.87 1.87 2.18 2.35 2.24 2.58 2.36 2.38 2.61 2.46 2.77 2.4
10.38 10.9 9.09 9.7 9.79 7.48 7.03 7.86 7.04 7.71 6.78 7.21 7.56 10.9 7.58 7.34 7.56 7.88 5.91 5.7 7.15 6.98 8.57 7.6 7.24 7.69 7.89 10.17 9.84 8.5
8.07 8.55 7.44 7.4 5.96 5.77 5.61 6.34 6.85 7.3 6.78 6.83 6.06 8.29 6.75 5.79 6.04 4.99 5.0 5.19 5.98 6.4 6.75 6.36 6.32 6.29 6.54 7.82 8.0 7.36
7.44 7.13 5.92 5.92 7.51 5.75 5.23 5.34 5.84 6.49 5.9 6.11 5.87 7.46 5.47 5.25 5.31 5.6 5.13 5.13 5.59 5.65 5.73 5.93 5.83 6.02 6.17 7.08 6.87 5.86

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)