Heatmap: Cluster_63 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00060 (TIF3H1)	-0.23	-0.15	-0.0	0.44	-0.32	-0.15	-0.08	0.49	-0.27	-0.32	-0.05	-0.12	0.26	-0.06	0.29	0.28	0.36	-0.36	-0.18	-0.19	-0.0	-0.07	0.51	-0.1	0.0	-0.07	0.09	-0.12	-0.41	-0.17
Spov3_C0002.00084	-0.01	0.06	0.14	0.83	-0.27	-0.08	-0.37	0.58	-0.44	-0.42	-0.23	-0.27	0.12	-0.5	0.47	0.42	0.59	-0.55	-0.39	-0.31	-0.07	-0.09	0.22	-0.55	-0.22	-0.09	0.02	-0.06	-0.25	0.3
Spov3_C0002.00117 (UBA2A)	-0.06	-0.0	-0.08	0.12	0.12	0.04	0.03	0.4	-0.28	-0.28	-0.14	-0.27	0.26	0.07	0.38	0.34	0.38	-0.11	-0.22	-0.19	-0.04	-0.05	0.25	-0.12	-0.09	-0.18	-0.14	-0.1	-0.34	-0.16
Spov3_C0004.00097 (SYNC3)	-0.03	-0.08	0.08	0.42	-0.08	0.02	-0.11	0.2	-0.3	-0.39	-0.09	-0.16	0.15	-0.0	0.4	0.31	0.44	-0.27	-0.13	-0.12	-0.05	-0.06	-0.15	-0.11	0.01	-0.05	0.02	-0.09	-0.14	-0.06
Spov3_C0012.00086 (GRP2)	0.24	0.19	0.3	0.76	-0.19	-0.36	-0.35	0.5	-0.27	-0.31	-0.3	-0.51	0.29	-0.08	0.08	0.06	0.19	0.18	-0.37	-0.26	-0.22	-0.19	-0.01	-0.45	-0.17	-0.4	-0.11	0.09	0.01	0.57
Spov3_C0022.00029	-0.04	0.13	0.12	0.42	-0.17	-0.17	-0.18	0.5	-0.23	-0.23	-0.21	-0.23	0.46	-0.03	0.11	0.07	0.17	-0.12	-0.34	-0.22	-0.11	-0.17	0.55	-0.35	-0.21	-0.17	-0.03	-0.09	-0.14	0.27
Spov3_C0092.00003 (IMB3)	-0.2	-0.14	0.18	0.68	-0.33	-0.06	-0.19	0.53	-0.24	-0.42	-0.03	-0.11	0.56	0.0	0.59	0.28	0.37	-0.9	-0.3	-0.21	-0.18	-0.03	-0.04	-0.44	-0.2	-0.22	0.0	-0.19	-0.18	0.22
Spov3_chr1.00275	-0.23	-0.05	0.14	0.53	-0.34	-0.16	-0.14	0.4	-0.36	-0.47	-0.1	-0.3	0.34	-0.55	0.31	0.34	0.38	0.3	-0.02	-0.03	0.06	0.04	0.05	-0.22	0.07	0.01	0.07	-0.25	-0.49	-0.12
Spov3_chr1.00283 (DEG10)	0.07	0.14	0.22	0.74	-0.15	-0.04	-0.66	0.51	-0.45	-0.37	-0.08	-0.24	0.12	-0.57	0.37	0.34	0.4	-0.05	-0.54	-0.62	-0.01	-0.22	0.03	-0.75	-0.22	0.04	0.18	0.09	0.09	0.3
Spov3_chr1.00916	-0.2	-0.08	0.09	0.51	0.06	-0.14	-0.13	0.63	-0.26	-0.42	-0.23	-0.32	0.33	0.3	0.3	0.19	0.3	0.07	-0.31	-0.19	-0.25	-0.18	-0.03	-0.36	-0.31	-0.33	-0.13	-0.07	0.07	0.3
Spov3_chr1.04752	-0.21	-0.19	0.02	0.14	-0.0	-0.0	0.05	0.43	-0.22	-0.33	-0.09	-0.13	0.22	-0.11	0.42	0.26	0.4	-0.15	-0.19	-0.11	-0.1	-0.15	0.26	-0.24	-0.14	-0.04	0.02	-0.03	-0.24	0.01
Spov3_chr1.04756 (LIF2)	-0.08	-0.04	0.05	0.28	-0.26	-0.09	0.06	0.4	-0.22	-0.24	-0.09	-0.15	0.18	-0.25	0.34	0.31	0.39	-0.22	-0.21	-0.09	-0.0	-0.06	0.2	-0.1	-0.05	-0.03	0.07	-0.01	-0.33	-0.19
Spov3_chr1.04780 (RPL24C)	-0.16	-0.08	0.07	0.41	-0.32	-0.08	-0.19	0.37	-0.24	-0.3	0.01	-0.09	0.15	-0.0	0.28	0.41	0.39	-0.21	-0.17	-0.18	0.07	0.04	-0.12	-0.09	0.01	-0.02	-0.0	-0.07	-0.31	-0.07
Spov3_chr1.04838 (PP5)	0.01	-0.1	0.05	0.38	-0.15	-0.06	-0.05	0.4	-0.15	-0.18	-0.13	-0.18	0.01	0.01	0.28	0.32	0.27	-0.53	-0.3	-0.24	-0.04	-0.11	0.41	-0.12	0.02	-0.09	-0.03	0.04	-0.09	-0.11
Spov3_chr2.00847 (NOB1)	-0.11	0.06	0.22	0.76	-0.24	-0.26	-0.39	0.37	-0.24	-0.41	-0.18	-0.28	0.34	-0.06	0.19	0.29	0.31	-0.15	-0.23	-0.21	-0.12	-0.17	0.22	-0.28	-0.24	-0.22	-0.08	-0.03	-0.01	0.35
Spov3_chr2.01009 (ADNT1)	-0.01	-0.02	0.09	0.43	-0.18	-0.02	-0.09	0.26	-0.31	-0.28	-0.19	-0.21	0.17	0.05	0.44	0.36	0.35	-0.26	-0.33	-0.3	-0.1	-0.05	0.27	-0.39	-0.21	-0.1	0.01	-0.18	-0.12	0.32
Spov3_chr2.01706 (UAP56a)	-0.1	-0.1	0.06	0.35	-0.14	-0.21	-0.14	0.5	-0.14	-0.18	-0.07	-0.22	0.08	0.06	0.23	0.23	0.28	-0.14	-0.12	-0.16	-0.03	-0.12	0.37	-0.26	-0.1	0.01	0.07	0.05	-0.3	-0.2
Spov3_chr2.01728 (Nug2)	-0.01	0.08	0.13	0.32	0.01	-0.07	-0.07	0.27	-0.12	-0.2	-0.12	-0.15	0.23	-0.04	0.2	0.14	0.19	-0.17	-0.24	-0.15	-0.05	-0.19	0.36	-0.07	-0.09	-0.07	0.03	0.03	-0.26	-0.22
Spov3_chr2.01885 (CYR1)	-0.19	-0.13	0.09	0.61	-0.04	0.11	-0.13	0.55	-0.15	-0.38	-0.25	-0.28	0.15	0.14	0.15	0.4	0.25	0.07	-0.28	-0.17	-0.13	-0.13	0.02	-0.35	-0.3	-0.21	0.04	-0.2	-0.06	0.14
Spov3_chr2.03472 (RH17)	-0.22	-0.07	-0.1	0.77	-0.16	0.06	-0.59	0.57	-0.32	-0.43	-0.15	-0.28	0.35	0.01	0.46	0.43	0.47	-0.64	-0.51	-0.33	-0.16	-0.24	0.42	-0.64	-0.33	-0.14	0.23	-0.16	-0.1	0.31
Spov3_chr2.04030	-0.07	0.08	0.28	0.65	-0.1	-0.22	-0.39	0.52	-0.07	-0.07	-0.09	-0.21	0.02	-0.33	0.08	0.14	0.24	-0.08	-0.17	-0.24	-0.01	-0.05	-0.11	-0.1	-0.06	-0.1	0.01	0.15	-0.12	-0.08
Spov3_chr3.01293 (EDA7)	-0.05	0.06	0.28	0.98	-0.12	0.06	-0.33	0.47	-0.33	-0.63	-0.22	-0.39	0.2	-0.49	0.24	0.38	0.39	-0.19	-0.29	-0.2	-0.29	-0.23	0.39	-0.42	-0.17	-0.28	-0.12	0.05	-0.11	0.08
Spov3_chr3.01345	0.15	0.06	0.14	0.82	-0.16	0.17	-0.22	0.46	-0.02	-0.23	-0.27	-0.3	0.18	-0.03	0.38	0.45	0.44	-0.1	-0.58	-0.48	-0.39	-0.29	-0.3	-0.3	-0.22	-0.37	-0.16	-0.15	0.05	0.17
Spov3_chr3.01497	-0.18	-0.0	0.09	0.69	-0.34	-0.13	-0.58	0.53	-0.4	-0.42	-0.31	-0.25	0.28	0.29	0.47	0.56	0.55	-0.01	-0.38	-0.31	0.01	-0.25	0.25	-0.28	-0.24	-0.21	-0.18	-0.21	-0.36	0.05
Spov3_chr3.02583 (MTR4)	0.05	0.18	0.08	0.4	-0.1	-0.03	-0.16	0.26	-0.2	-0.27	-0.2	-0.23	0.1	0.26	0.34	0.29	0.3	-0.49	-0.35	-0.38	-0.21	-0.15	0.41	-0.14	-0.2	-0.13	-0.07	0.01	-0.04	0.06
Spov3_chr3.02606 (MORF1)	-0.14	-0.1	0.28	0.79	-0.37	-0.3	-0.7	0.49	-0.35	-0.21	-0.09	-0.25	0.19	-0.56	0.21	0.27	0.42	-0.25	-0.29	-0.31	-0.02	-0.18	0.22	-0.47	-0.19	0.03	0.02	-0.06	0.02	0.64
Spov3_chr3.02796 (NFA2)	-0.07	-0.01	0.04	0.4	-0.03	0.07	-0.05	0.17	-0.29	-0.38	-0.08	-0.11	0.07	0.15	0.3	0.27	0.37	-0.29	-0.13	-0.2	-0.07	-0.03	0.02	0.0	0.02	-0.01	-0.01	-0.09	-0.24	-0.13
Spov3_chr3.02966 (TSN1)	0.05	0.14	0.07	0.15	-0.15	-0.2	-0.11	0.36	-0.27	-0.27	-0.15	-0.24	0.11	-0.12	0.4	0.28	0.32	-0.37	-0.13	-0.14	0.0	-0.03	0.49	-0.35	-0.17	-0.03	0.07	-0.07	-0.19	0.02
Spov3_chr3.03041 (KHZ2)	-0.08	0.07	-0.1	0.31	-0.32	-0.29	-0.39	0.42	-0.18	-0.09	-0.08	-0.18	0.27	-0.17	0.23	0.26	0.38	0.11	-0.22	-0.15	0.02	-0.01	0.18	-0.1	-0.02	-0.06	-0.0	-0.13	-0.13	0.03
Spov3_chr3.03301	-0.05	0.0	0.14	0.53	-0.03	-0.15	-0.1	0.41	-0.19	-0.3	-0.13	-0.23	0.27	-0.14	0.17	0.23	0.17	-0.09	-0.27	-0.18	0.01	-0.13	-0.04	-0.1	-0.04	-0.08	0.02	0.09	-0.14	-0.04
Spov3_chr3.03362 (IMB3)	0.19	0.25	0.19	0.55	0.13	0.08	-0.2	0.24	-0.14	-0.27	-0.17	-0.29	0.19	-0.05	0.29	0.27	0.26	-0.65	-0.42	-0.41	-0.22	-0.2	0.31	-0.19	-0.22	-0.22	-0.08	0.04	-0.02	0.05
Spov3_chr3.03385 (CCT8)	-0.05	0.01	0.04	0.36	-0.09	-0.09	-0.12	0.35	-0.34	-0.2	-0.11	-0.22	0.18	-0.12	0.29	0.24	0.24	-0.05	-0.21	-0.24	-0.01	-0.11	0.22	-0.2	-0.07	-0.05	0.06	0.01	-0.13	0.05
Spov3_chr3.03773	0.07	0.18	0.02	0.66	-0.03	-0.19	-0.54	0.6	-0.29	-0.29	-0.01	-0.34	0.23	-0.55	-0.03	0.19	0.37	0.1	-0.48	-0.24	-0.17	-0.23	0.04	-0.46	-0.13	-0.11	-0.07	0.08	0.11	0.5
Spov3_chr3.03870 (NEDD1)	-0.15	-0.03	0.19	0.75	-0.14	-0.13	-0.24	0.4	-0.2	-0.32	-0.1	-0.25	0.23	-0.14	0.27	0.21	0.26	-0.36	-0.26	-0.32	-0.12	-0.17	0.19	0.05	0.03	-0.08	0.13	0.25	-0.21	-0.5
Spov3_chr3.04438 (BBC1)	-0.22	-0.25	0.09	0.68	-0.15	-0.12	-0.42	0.41	-0.53	-0.52	-0.2	-0.26	0.43	-0.44	0.46	0.44	0.54	0.36	-0.25	-0.18	0.08	-0.02	-0.04	-0.42	-0.14	-0.03	0.08	-0.28	-0.44	0.13
Spov3_chr3.05221	0.05	0.01	0.16	0.47	-0.22	-0.18	-0.06	0.48	-0.32	-0.4	-0.14	-0.16	0.1	-0.02	0.17	0.14	0.25	-0.48	-0.07	-0.12	-0.05	0.0	0.1	0.03	0.13	-0.05	0.04	0.02	-0.13	-0.21
Spov3_chr4.00030 (UBP2)	0.13	0.2	0.15	0.51	-0.06	-0.17	-0.16	0.33	-0.22	-0.18	-0.08	-0.24	0.22	0.12	0.03	0.08	0.16	0.05	-0.32	-0.48	-0.23	-0.14	0.12	-0.28	-0.14	-0.23	-0.06	0.06	0.04	0.29
Spov3_chr4.00862 (EMA1)	-0.24	-0.17	0.1	0.74	-0.29	-0.13	-0.25	0.74	-0.21	-0.4	-0.14	-0.27	0.57	-0.15	0.46	0.31	0.43	-0.33	-0.44	-0.28	-0.22	-0.15	0.33	-0.5	-0.26	-0.25	-0.08	-0.17	-0.19	0.14
Spov3_chr4.00901	-0.1	-0.13	0.05	0.39	-0.37	-0.16	-0.14	0.33	-0.35	-0.35	-0.17	-0.22	0.15	-0.09	0.35	0.25	0.29	-0.18	-0.03	-0.03	0.01	-0.03	0.47	-0.03	0.12	0.07	0.1	-0.12	-0.33	-0.29
Spov3_chr4.02476 (TRM1a)	-0.01	-0.02	0.18	0.55	-0.16	-0.23	-0.33	0.53	-0.21	-0.33	-0.13	-0.26	0.25	-0.13	0.19	0.3	0.32	-0.19	-0.18	-0.31	-0.0	-0.23	0.24	-0.4	-0.16	-0.12	-0.01	-0.01	-0.07	0.26
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Spov3_chr4.03396 (ELONGATION FACTOR-TU FAMILY)	-0.1	-0.01	0.14	0.52	-0.31	-0.14	-0.22	0.36	-0.35	-0.4	-0.09	-0.23	0.33	-0.02	0.41	0.36	0.48	-0.5	-0.22	-0.21	-0.04	-0.09	0.58	-0.32	-0.13	-0.15	-0.06	-0.15	-0.34	-0.02
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.