Heatmap: Cluster_93 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.39 0.53 0.3 0.33 0.21 0.44 0.41 0.46 0.5 1.0 0.31 0.66 0.27 0.5 0.6 0.38 0.33 0.21 0.51 0.35 0.66 0.25 0.2 0.29 0.19 0.46 0.44 0.52 0.41 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.28 0.0 0.04 0.08 0.11 0.04 0.17 0.27 0.08 0.17 0.0 0.05 0.33 0.0 0.41 0.13 1.0 0.15 0.04 0.51 0.07 0.11 0.39 0.19 0.23 0.04 0.22 0.05 0.18
0.11 0.0 0.0 0.2 0.0 0.33 0.0 0.2 1.0 0.2 0.1 0.0 0.76 0.38 0.18 0.39 0.0 0.68 0.0 0.2 0.65 0.21 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_C0047.00005 (DELTA-OAT)
0.27 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.22 0.21 0.08 0.1 0.0 0.11 0.11 0.0 0.45 0.62 0.19 0.11 0.29 0.0 0.12 0.19 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.3 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.21 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0
0.0 0.0 0.37 0.7 0.0 0.0 0.19 0.18 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 1.0 0.46 0.11 0.15 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.13 0.14 0.32 0.0 0.12 0.4 0.12 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.2 0.23 0.2 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.21 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.12 0.31 0.08 0.4 0.31 0.06 0.4 0.18 0.9 0.16 0.0 0.22 0.1 0.46 0.31 0.0 0.0 0.25 0.15 1.0 0.26 0.0 0.04 0.04 0.16 0.26 0.67 0.14 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.74 0.56 0.37 0.44 0.0 0.0 0.45 0.25 0.0 0.14 0.71 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.06
Spov3_chr1.04704 (EMB3127)
0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0
Spov3_chr2.02191 (CYP87A2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.15 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.25 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.19 0.33 0.0 0.18 0.32 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.16 0.0 0.21 0.0 0.0 0.4 1.0 0.2 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.26 0.0
0.14 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.55 0.43 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.14 0.0
0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.28 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.73 0.24 0.14 0.38 0.12 0.11 0.14 0.13 0.0 0.14 0.0 0.0 0.14 0.36 0.13 0.0 0.34 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.26 0.0 0.23 0.0 0.15 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.39 0.22 0.0 0.31 0.0 0.0 0.02 0.0 0.22 0.0 0.13 0.27 0.0 0.62 0.0 0.0 1.0 0.17 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.12 0.29 0.15 0.0
0.65 0.32 0.31 0.0 0.0 0.13 0.16 0.16 0.0 0.16 0.33 0.54 0.0 0.59 0.14 0.0 0.47 0.0 0.52 0.0 1.0 0.49 0.14 0.0 0.0 0.75 0.15 0.17 0.0 0.0
0.28 0.29 0.0 0.32 0.17 0.56 0.54 0.68 0.42 0.09 0.41 0.27 0.0 0.68 0.71 1.0 0.52 0.0 0.2 0.35 0.7 0.76 0.0 0.59 0.0 0.82 0.67 0.49 0.27 0.47
0.28 0.29 0.0 0.32 0.17 0.56 0.54 0.68 0.42 0.09 0.41 0.27 0.0 0.68 0.71 1.0 0.52 0.0 0.2 0.35 0.7 0.76 0.0 0.59 0.0 0.82 0.67 0.49 0.27 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.47 0.0 0.12 0.0 0.72 0.14 0.46 0.0 0.95 0.2 0.3 0.33 0.65 0.45 0.4 0.46 0.0 0.21 0.08 1.0 0.46 0.11 0.74 0.0 0.36 0.73 0.64 0.0 0.89
0.0 0.0 0.1 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.1
0.07 0.08 0.0 0.0 0.2 0.5 0.0 0.0 0.24 0.0 0.18 0.08 0.26 1.0 0.0 0.08 0.07 0.62 0.53 0.07 0.63 0.07 0.75 0.09 0.07 0.06 0.37 0.0 0.07 0.0
0.7 0.42 0.5 0.59 0.51 0.45 0.51 0.63 0.51 0.53 0.79 0.59 0.51 0.98 0.62 0.68 1.0 0.48 0.6 0.39 0.8 0.67 0.32 0.81 0.53 0.51 0.49 0.67 0.28 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr4.04457 (CYP82F1)
0.11 0.46 0.0 0.6 0.11 0.17 0.34 0.22 0.0 0.12 0.22 0.1 0.0 0.48 0.1 0.71 1.0 0.2 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.18 0.27 0.27 0.17 0.0 0.34 0.14
Spov3_chr5.00403 (Hsp70-2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.48 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.38 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.37 0.08 0.36 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.19 0.32 0.19 0.09 0.19 0.0 0.74 0.0 0.09 1.0 0.09 0.63 0.36 0.27 0.19 0.0 0.09 0.16 0.34
0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.54 0.95 0.0 0.0
0.19 0.0 0.18 0.18 0.16 0.0 0.79 0.38 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.11 0.59 0.36 0.23 0.19 0.8 0.46 0.13 0.07 0.34 0.23 0.2 0.08 0.34 0.17 0.3 0.19 0.35 0.13 0.25 1.0 0.59 0.13 0.14 0.29 0.41 0.12 0.45 0.25 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.0 0.34 0.12 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.49 0.0
0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.33 0.0 0.17 0.0 0.0 0.15 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.48 0.13 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)