1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_93 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.2 0.28 0.16 0.17 0.11 0.23 0.21 0.24 0.26 0.52 0.16 0.35 0.14 0.26 0.31 0.2 0.17 0.11 0.27 0.18 0.34 0.13 0.1 0.15 0.1 0.24 0.23 0.27 0.21 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
0.23 0.0 0.0 0.45 0.0 0.71 0.0 0.44 2.19 0.43 0.22 0.0 1.66 0.84 0.4 0.86 0.0 1.49 0.0 0.45 1.43 0.46 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_C0047.00005 (DELTA-OAT)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.05 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.1 0.14 0.04 0.02 0.06 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.06 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.1 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.1 0.0 0.0 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.7 1.81 0.44 2.34 1.79 0.36 2.32 1.04 5.3 0.92 0.0 1.26 0.6 2.72 1.8 0.0 0.0 1.44 0.9 5.86 1.53 0.0 0.21 0.21 0.94 1.52 3.93 0.83 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr1.04704 (EMB3127)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Spov3_chr2.02191 (CYP87A2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.04 0.07 0.0 0.04 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.23 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.34 0.19 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.03 0.02 0.0
0.09 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.05 0.07 0.0 0.08 0.02 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.14 0.07 0.02 0.0 0.0 0.1 0.02 0.02 0.0 0.0
0.1 0.1 0.0 0.11 0.06 0.19 0.19 0.24 0.15 0.03 0.14 0.09 0.0 0.24 0.24 0.35 0.18 0.0 0.07 0.12 0.24 0.26 0.0 0.2 0.0 0.28 0.23 0.17 0.09 0.16
0.1 0.1 0.0 0.11 0.06 0.19 0.19 0.24 0.15 0.03 0.14 0.09 0.0 0.24 0.24 0.35 0.18 0.0 0.07 0.12 0.24 0.26 0.0 0.2 0.0 0.28 0.23 0.17 0.09 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.12 0.13 0.0 0.0 0.35 0.88 0.0 0.0 0.42 0.0 0.31 0.14 0.46 1.75 0.0 0.14 0.13 1.09 0.92 0.13 1.09 0.12 1.31 0.15 0.12 0.11 0.65 0.0 0.12 0.0
1.45 0.87 1.04 1.24 1.06 0.94 1.06 1.3 1.07 1.1 1.64 1.23 1.06 2.04 1.29 1.42 2.08 1.01 1.24 0.81 1.66 1.39 0.68 1.69 1.1 1.05 1.02 1.41 0.59 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr4.04457 (CYP82F1)
 0.03 0.14 0.0 0.18 0.03 0.05 0.1 0.07 0.0 0.04 0.07 0.03 0.0 0.14 0.03 0.21 0.3 0.06 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.06 0.08 0.08 0.05 0.0 0.1 0.04
Spov3_chr5.00403 (Hsp70-2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.27 0.06 0.26 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.13 0.23 0.14 0.06 0.14 0.0 0.53 0.0 0.06 0.72 0.07 0.45 0.26 0.19 0.14 0.0 0.07 0.11 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.06 0.32 0.2 0.12 0.1 0.43 0.25 0.07 0.04 0.18 0.12 0.11 0.04 0.18 0.09 0.16 0.1 0.19 0.07 0.13 0.54 0.32 0.07 0.07 0.15 0.22 0.07 0.24 0.13 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)