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Heatmap: Cluster_95 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
1.03 1.29 0.26 -0.48 -0.21 0.09 -0.36 0.01 -0.08 -0.29 -0.41 -0.39 0.28 1.31 -0.03 -0.2 -0.39 -0.48 -0.94 -0.54 -0.69 -0.71 -1.15 -0.68 -0.34 -0.46 -0.52 0.23 0.43 0.44
1.24 1.2 0.54 0.01 0.45 -0.62 -0.63 -0.64 -0.16 -0.17 -0.52 -0.53 -0.57 0.44 -0.42 -0.77 -0.75 0.85 -0.42 -0.62 -0.4 -0.48 0.6 -0.69 -0.55 -0.52 -0.46 0.04 0.5 0.12
0.41 0.46 0.18 0.08 0.16 0.18 -0.07 -0.25 -0.12 -0.19 -0.31 -0.23 -0.44 0.62 0.07 0.08 0.16 0.14 -0.11 -0.15 -0.05 -0.11 0.19 -0.22 -0.32 -0.23 -0.31 0.02 -0.12 -0.16
0.88 1.2 0.19 -0.16 0.35 0.34 -0.49 -0.2 -0.16 0.26 -0.86 -0.51 -1.32 1.43 -0.29 -0.74 -0.31 -0.34 -0.02 -0.54 -0.32 -0.35 -0.33 0.11 -0.79 -0.61 -0.25 -0.01 0.32 -0.35
0.62 0.76 0.04 -0.22 -0.43 -0.19 -0.33 -0.53 -0.23 0.13 -0.23 -0.18 -1.74 1.0 -0.07 0.06 0.02 0.79 -0.05 -0.38 0.06 -0.13 -1.0 0.09 -0.12 -0.07 -0.19 -0.17 -0.0 0.23
0.62 0.76 0.04 -0.22 -0.43 -0.19 -0.33 -0.53 -0.23 0.13 -0.23 -0.18 -1.74 1.0 -0.07 0.06 0.02 0.79 -0.05 -0.38 0.06 -0.13 -1.0 0.09 -0.12 -0.07 -0.19 -0.17 -0.0 0.23
0.87 0.7 0.07 -0.3 -0.2 -0.25 -0.37 -0.38 -0.25 0.04 -0.09 -0.08 -0.29 0.48 -0.03 -0.35 -0.2 0.46 -0.34 -0.42 -0.05 -0.21 0.4 0.09 -0.28 -0.18 -0.09 0.15 0.17 -0.29
0.88 0.5 0.07 -0.57 -0.13 -0.32 -0.18 -0.39 -0.26 0.15 -0.29 -0.15 -0.57 1.21 0.06 -0.37 -0.18 0.4 -0.11 -0.24 -0.09 -0.3 -0.19 -0.25 -0.13 -0.23 -0.38 0.27 0.22 -0.24
0.82 0.7 0.44 0.36 0.53 -0.26 -0.09 -0.02 -0.21 -0.31 -0.77 -0.79 -0.53 0.69 0.46 0.1 0.17 0.02 -0.11 -0.13 -0.21 -0.17 0.74 -0.95 -0.95 -0.82 -0.76 -0.41 0.25 -0.64
1.06 1.29 0.85 -0.07 -0.07 -0.45 0.06 -0.93 0.17 -0.58 -0.52 -0.38 -0.1 1.09 0.31 0.25 -0.38 -0.48 -2.57 -1.73 -0.41 -0.2 -0.79 -0.28 -1.31 -0.25 -0.43 0.36 0.69 -0.22
0.88 0.76 0.35 0.27 0.6 -0.52 -0.52 -0.4 -0.03 0.08 -0.41 -0.37 -0.32 0.25 -0.62 -0.5 -0.54 0.45 -0.27 -0.39 -0.09 -0.04 0.67 -0.54 -0.41 -0.47 -0.35 0.23 0.2 -0.03
0.97 1.09 0.28 -0.3 0.51 0.0 -0.01 -0.01 -0.15 0.09 -0.54 -0.56 -0.71 0.91 -0.1 -0.43 -0.43 -0.12 -0.19 -0.42 -0.28 -0.09 -0.57 -0.16 -0.45 -0.31 -0.15 -0.03 0.28 -0.48
2.19 2.08 0.37 0.13 -0.41 -1.16 -1.49 -1.68 -2.11 -2.43 -1.67 -1.32 -2.65 1.22 -1.36 -1.74 -1.85 2.26 -0.93 -0.74 -0.65 -0.2 0.06 -0.8 -1.58 -1.72 -2.04 -0.65 0.26 -0.77
0.99 0.8 0.15 -0.01 0.4 0.04 -0.23 -0.34 -0.15 0.1 -0.49 -0.46 -0.75 1.02 -0.07 -0.72 -0.75 0.29 -0.85 -0.63 -0.33 -0.45 0.05 -0.29 -0.26 -0.26 -0.28 0.35 0.43 0.09
Spov3_chr1.04564 (PP2C.D6)
 0.44 0.25 0.07 0.1 0.11 -0.21 -0.28 -0.28 -0.09 -0.04 -0.07 -0.28 0.14 0.43 0.13 -0.03 -0.0 0.38 -0.2 -0.27 -0.24 -0.21 0.58 -0.22 -0.14 -0.23 -0.09 -0.06 -0.28 -0.0
2.54 1.49 0.5 0.43 -0.56 -0.88 -1.93 -1.72 -0.23 -0.36 -1.47 -1.76 -1.83 2.55 -1.2 -1.92 -2.46 0.18 -2.14 -1.89 -2.35 -1.89 0.79 -1.68 -2.72 -1.94 -2.16 0.05 0.02 -0.42
1.31 1.11 0.2 0.02 0.11 -0.36 -0.59 -0.83 0.01 0.1 -0.19 -0.2 -0.61 1.04 -0.17 -0.52 -0.54 -0.03 -0.56 -0.52 -0.3 -0.09 -0.3 -0.34 -0.62 -0.44 -0.24 0.43 0.17 -0.17
1.08 1.25 0.61 -0.08 1.02 -0.48 -1.07 -0.7 0.08 0.34 -0.67 -0.26 -1.35 0.79 -0.69 -0.69 -0.67 0.36 -1.01 -0.86 -0.4 -0.86 0.27 -0.42 -0.52 -0.38 -0.51 0.49 0.52 -0.23
0.6 0.76 0.25 0.22 0.0 -0.02 -0.29 -0.26 -0.76 -0.29 -0.24 -0.38 -0.18 0.46 0.06 0.06 -0.02 0.66 -0.33 -0.31 -0.01 0.03 0.01 -0.38 -0.38 -0.24 -0.45 0.33 -0.0 -0.2
1.33 1.22 0.23 -0.4 0.27 -0.32 -0.59 -0.81 0.04 0.11 -0.26 -0.24 -0.86 0.99 -0.86 -0.79 -1.05 0.13 -0.43 -0.24 -0.18 0.01 0.17 -0.4 -0.6 -0.45 -0.46 0.36 0.28 -0.04
0.64 0.68 0.11 -0.2 0.07 -0.14 -0.47 -0.71 -0.28 -0.04 -0.26 -0.16 -1.26 1.17 0.03 0.03 0.07 0.25 -0.28 -0.64 -0.01 -0.1 -0.64 0.12 0.01 -0.16 -0.22 0.36 0.1 -0.19
0.55 0.34 -0.05 -0.24 -0.33 -0.26 -0.07 -0.02 -0.04 0.1 -0.03 -0.02 -0.25 0.82 -0.05 -0.13 -0.09 0.41 -0.15 -0.1 -0.2 -0.15 -0.0 -0.01 -0.13 -0.18 -0.15 0.07 -0.12 -0.25
1.32 1.15 0.14 0.1 0.37 -0.73 -1.31 -0.75 -0.1 0.16 -0.2 -0.11 -0.42 0.76 -1.07 -0.81 -1.12 0.96 -0.83 -0.82 -0.49 -0.4 0.48 -0.72 -0.74 -0.43 -0.35 0.91 0.12 -0.35
0.48 0.71 0.1 0.55 -0.2 -0.46 -0.45 -0.6 -0.17 -0.13 -0.28 -0.21 -0.2 0.23 0.04 0.18 0.05 0.91 -0.32 -0.41 0.07 -0.03 0.2 -0.31 -0.47 -0.29 -0.22 0.17 -0.26 -0.07
0.61 0.58 0.05 -0.16 0.17 0.21 0.17 -0.42 -0.1 -0.05 -0.42 -0.23 -0.38 0.51 0.02 -0.14 -0.19 0.41 -0.23 -0.19 -0.19 -0.11 0.3 -0.39 -0.44 -0.39 -0.41 0.16 0.12 0.11
0.62 0.66 0.04 0.23 0.06 -0.27 -0.22 0.14 -0.37 -0.24 -0.4 -0.12 -0.16 0.54 0.23 -0.03 0.09 0.41 -0.34 -0.26 -0.14 -0.15 0.41 -0.6 -0.58 -0.15 -0.24 -0.21 -0.29 0.17
1.19 1.35 0.94 0.43 -0.02 -0.49 -0.26 -0.49 -0.41 -0.53 -0.91 -0.82 -0.62 -0.17 0.15 -0.25 -0.29 0.25 -0.01 -0.01 -0.07 0.04 1.07 -0.81 -0.92 -0.76 -0.81 -0.13 -0.27 -0.9
1.04 0.84 0.35 -0.12 -0.1 -0.09 -0.78 -0.99 -0.37 0.05 -0.23 -0.38 -0.81 1.44 0.19 -0.17 -0.11 0.8 -0.9 -0.88 -0.25 -0.38 -0.24 -0.19 -0.51 -0.41 -0.28 -0.23 0.56 -0.86
0.87 1.04 0.3 -0.59 0.61 -0.16 -0.74 -1.73 -0.79 -0.21 -0.55 -0.8 -1.14 1.54 -0.02 0.23 0.27 1.16 -0.37 -0.84 -0.28 -0.61 -1.02 -0.64 -0.05 -0.58 -0.91 0.15 0.16 -0.12
1.6 1.29 0.67 0.46 1.33 -1.07 -1.44 -1.73 -0.35 -0.53 -1.63 -1.62 -2.04 1.32 -0.84 -1.35 -1.56 1.31 -0.66 -0.4 -0.49 -0.18 0.7 -1.88 -2.09 -1.69 -1.8 -0.33 0.86 -0.1
1.0 1.17 0.1 0.26 -0.16 -0.22 -0.37 0.11 -0.14 -0.58 -0.48 -0.17 -0.17 1.02 0.38 0.22 -0.87 0.09 -1.63 -1.2 -0.07 0.25 -0.32 -0.2 -0.59 -1.11 -0.56 0.23 0.5 -0.45
0.97 1.04 0.57 -0.18 -0.18 -0.28 -0.22 0.13 0.19 -0.06 -0.54 -0.06 0.31 0.92 -0.2 -0.14 -0.05 -0.32 -1.77 -1.13 -0.16 -0.14 -0.71 -0.82 -1.15 -0.62 -0.66 -0.05 0.76 0.52
1.0 1.11 0.78 -0.21 -0.08 0.02 -0.43 -0.02 -0.05 -0.03 -0.42 0.09 -0.23 0.73 -0.02 -0.37 -0.33 -0.76 -1.16 -1.25 -0.36 0.25 -0.92 -0.58 -0.82 -0.56 -0.57 0.54 0.45 0.46
0.76 0.92 0.17 0.05 -0.12 0.07 -0.81 0.02 0.5 -0.06 -0.44 -0.14 -0.22 1.0 -0.16 0.09 -0.06 -0.13 -1.17 -1.29 -1.03 0.17 -0.43 -0.15 -1.18 -0.03 -0.29 0.05 0.36 0.4
1.12 1.03 -0.04 -0.32 0.33 -0.24 -0.32 -0.11 -0.47 -0.1 -0.62 -0.5 -0.75 0.88 -0.36 -0.63 -0.56 0.88 -0.47 -0.69 -0.67 -0.5 0.35 -0.65 -0.62 -0.38 -0.33 0.9 0.33 -0.23
Spov3_chr3.00884 (UBDK GAMMA 7)
 0.56 0.59 -0.05 -0.11 0.24 0.1 0.04 -0.3 -0.3 -0.15 -0.12 -0.09 -0.01 0.22 0.15 -0.04 -0.08 -0.1 -0.21 -0.34 -0.21 -0.21 0.16 -0.17 -0.29 -0.1 -0.13 0.22 -0.04 0.21
0.66 0.39 0.28 0.05 0.44 -0.04 -0.05 -0.19 0.04 -0.08 -0.16 -0.16 -0.41 0.66 0.09 0.04 -0.08 -0.38 -0.25 -0.23 -0.2 -0.17 0.12 -0.21 -0.25 -0.23 -0.21 -0.05 0.12 -0.39
0.53 0.5 0.1 0.0 0.06 -0.03 -0.12 -0.26 -0.36 -0.29 -0.16 -0.16 0.03 0.16 0.12 0.21 0.2 0.21 -0.17 -0.32 -0.09 -0.13 0.25 -0.03 -0.14 -0.09 -0.07 0.0 -0.22 -0.23
2.47 2.44 -0.01 -1.3 -0.2 -1.19 -1.82 -2.3 -2.37 -1.61 -2.08 -1.81 -1.22 1.58 -1.57 -1.98 -2.12 2.37 -1.1 -1.39 -0.96 -1.02 -0.48 -0.87 -2.16 -1.95 -2.41 -0.76 -0.8 -1.12
1.16 1.15 0.26 -0.31 0.27 -0.16 -0.06 0.18 0.02 -0.01 -0.47 -0.48 -0.58 0.85 -0.13 -0.49 -0.39 -0.59 -0.36 -0.3 0.03 -0.03 -0.61 -0.19 -0.36 -0.26 -0.46 0.28 0.02 -0.55
0.85 0.5 0.18 0.22 0.22 -0.26 -0.15 -0.35 0.09 0.04 -0.16 -0.17 -0.36 0.66 -0.18 -0.21 -0.31 -0.09 -0.27 -0.38 -0.14 -0.25 -0.05 -0.12 -0.18 -0.17 -0.11 0.11 0.22 -0.17
1.04 1.03 0.19 -0.23 0.19 -0.42 -0.4 -0.25 -0.07 0.2 -0.54 -0.3 -0.67 0.99 -0.5 -0.63 -0.59 0.59 -0.38 -0.52 -0.39 -0.54 0.49 -0.23 -0.72 -0.31 -0.33 0.1 0.57 -0.41
1.24 1.11 0.41 -0.11 0.75 -0.5 -0.61 -0.46 -0.08 -0.09 -0.67 -0.59 -0.89 0.74 -0.18 -0.47 -0.53 0.6 -0.43 -0.4 -0.37 -0.37 0.43 -0.6 -0.84 -0.66 -0.64 0.13 0.55 -0.33
0.23 0.19 0.13 0.06 0.31 -0.05 -0.01 0.0 -0.06 -0.12 -0.18 -0.08 -0.0 0.52 0.23 0.1 0.11 0.15 -0.21 -0.25 -0.38 -0.35 0.16 -0.14 -0.29 -0.31 -0.18 -0.0 0.1 -0.13
0.36 0.24 0.05 -0.11 -0.06 -0.08 0.05 -0.18 0.05 0.07 -0.15 -0.25 -0.33 0.79 0.05 -0.01 0.14 0.02 -0.19 -0.26 -0.15 -0.1 -0.14 -0.21 -0.22 -0.1 -0.06 0.2 -0.02 0.08
0.38 0.35 0.02 -0.24 0.32 0.05 -0.06 -0.51 0.01 -0.04 -0.09 -0.06 -0.25 0.69 0.03 0.04 0.01 -0.43 -0.09 -0.16 -0.09 -0.02 0.3 -0.11 -0.1 -0.12 -0.03 -0.06 -0.07 -0.29
0.35 0.11 0.1 0.07 0.49 -0.07 -0.03 -0.26 -0.03 -0.04 -0.02 -0.15 -0.07 0.67 0.17 -0.11 -0.07 -0.11 -0.1 -0.25 -0.2 -0.16 0.2 -0.22 -0.18 -0.22 -0.09 0.08 0.06 -0.49
1.37 1.09 0.54 0.02 0.77 -0.35 -0.71 -1.13 0.03 -0.18 -0.54 -0.44 -1.32 0.93 -0.37 -0.65 -0.64 0.09 -0.62 -0.62 -0.36 -0.57 0.78 -0.45 -0.67 -0.64 -0.62 0.59 0.26 -0.52
0.45 0.55 0.26 0.07 0.43 -0.2 -0.42 -0.14 -0.02 -0.07 -0.2 -0.16 -0.11 0.21 -0.19 -0.32 -0.17 0.24 -0.31 -0.13 -0.21 -0.24 0.5 -0.09 -0.25 -0.17 -0.14 0.13 0.02 -0.04
0.85 0.91 0.27 0.16 0.4 -0.23 -0.55 -0.88 -0.27 0.0 -0.24 -0.38 -0.69 0.51 -0.18 -0.06 -0.38 0.74 -0.14 -0.26 0.03 0.01 0.13 -0.28 -0.4 -0.5 -0.35 -0.19 -0.04 0.08
1.87 1.52 0.43 -0.0 0.72 -0.79 -0.83 -0.72 -0.58 -0.92 -1.15 -0.9 -1.41 1.3 -0.26 -0.94 -1.31 -0.01 -0.39 -0.92 -0.36 -0.73 1.69 -1.31 -0.88 -1.36 -1.11 0.02 -0.19 -1.42
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Spov3_chr5.01571 (emb1967)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.