1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_95 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.82 0.99 0.48 0.29 0.35 0.43 0.32 0.41 0.38 0.33 0.3 0.31 0.49 1.0 0.4 0.35 0.31 0.29 0.21 0.28 0.25 0.25 0.18 0.25 0.32 0.29 0.28 0.47 0.54 0.55
1.0 0.97 0.61 0.42 0.58 0.27 0.27 0.27 0.38 0.38 0.3 0.29 0.28 0.57 0.32 0.25 0.25 0.76 0.32 0.28 0.32 0.3 0.64 0.26 0.29 0.3 0.31 0.43 0.6 0.46
0.87 0.9 0.74 0.69 0.73 0.74 0.62 0.55 0.6 0.57 0.52 0.55 0.48 1.0 0.68 0.69 0.73 0.72 0.6 0.59 0.63 0.6 0.74 0.56 0.52 0.55 0.52 0.66 0.6 0.58
0.68 0.85 0.42 0.33 0.47 0.47 0.26 0.32 0.33 0.44 0.2 0.26 0.15 1.0 0.3 0.22 0.3 0.29 0.37 0.25 0.3 0.29 0.29 0.4 0.21 0.24 0.31 0.37 0.46 0.29
0.77 0.84 0.51 0.43 0.37 0.44 0.4 0.34 0.43 0.55 0.42 0.44 0.15 1.0 0.48 0.52 0.5 0.86 0.48 0.38 0.52 0.45 0.25 0.53 0.46 0.48 0.44 0.44 0.5 0.58
0.77 0.84 0.51 0.43 0.37 0.44 0.4 0.34 0.43 0.55 0.42 0.44 0.15 1.0 0.48 0.52 0.5 0.86 0.48 0.38 0.52 0.45 0.25 0.53 0.46 0.48 0.44 0.44 0.5 0.58
1.0 0.88 0.57 0.44 0.48 0.46 0.42 0.42 0.46 0.56 0.51 0.52 0.45 0.76 0.53 0.43 0.48 0.75 0.43 0.41 0.53 0.47 0.72 0.58 0.45 0.48 0.51 0.61 0.61 0.44
0.8 0.61 0.46 0.29 0.4 0.35 0.38 0.33 0.36 0.48 0.35 0.39 0.29 1.0 0.45 0.34 0.38 0.57 0.4 0.37 0.41 0.35 0.38 0.36 0.39 0.37 0.33 0.52 0.5 0.37
1.0 0.92 0.77 0.73 0.82 0.47 0.53 0.56 0.49 0.46 0.33 0.33 0.39 0.91 0.78 0.61 0.64 0.58 0.53 0.52 0.49 0.5 0.95 0.29 0.29 0.32 0.33 0.43 0.67 0.36
0.85 1.0 0.74 0.39 0.39 0.3 0.43 0.21 0.46 0.27 0.28 0.32 0.38 0.87 0.51 0.49 0.31 0.29 0.07 0.12 0.31 0.36 0.24 0.34 0.17 0.34 0.3 0.52 0.66 0.35
1.0 0.92 0.69 0.65 0.82 0.38 0.38 0.41 0.53 0.57 0.41 0.42 0.43 0.64 0.35 0.38 0.37 0.74 0.45 0.41 0.51 0.53 0.86 0.37 0.41 0.39 0.43 0.63 0.62 0.53
0.92 1.0 0.57 0.38 0.67 0.47 0.47 0.47 0.42 0.5 0.32 0.32 0.29 0.88 0.44 0.35 0.35 0.43 0.41 0.35 0.39 0.44 0.32 0.42 0.34 0.38 0.42 0.46 0.57 0.34
0.95 0.88 0.27 0.23 0.16 0.09 0.07 0.06 0.05 0.04 0.07 0.08 0.03 0.49 0.08 0.06 0.06 1.0 0.11 0.12 0.13 0.18 0.22 0.12 0.07 0.06 0.05 0.13 0.25 0.12
0.98 0.86 0.55 0.49 0.65 0.51 0.42 0.39 0.45 0.53 0.35 0.36 0.29 1.0 0.47 0.3 0.29 0.6 0.27 0.32 0.39 0.36 0.51 0.4 0.41 0.41 0.41 0.63 0.67 0.53
Spov3_chr1.04564 (PP2C.D6)
 0.91 0.8 0.7 0.72 0.73 0.58 0.55 0.55 0.63 0.65 0.64 0.55 0.74 0.9 0.73 0.66 0.67 0.87 0.58 0.56 0.57 0.58 1.0 0.58 0.61 0.57 0.63 0.64 0.55 0.67
0.99 0.48 0.24 0.23 0.12 0.09 0.04 0.05 0.15 0.13 0.06 0.05 0.05 1.0 0.07 0.05 0.03 0.19 0.04 0.05 0.03 0.05 0.3 0.05 0.03 0.04 0.04 0.18 0.17 0.13
1.0 0.87 0.46 0.41 0.44 0.32 0.27 0.23 0.41 0.43 0.35 0.35 0.27 0.83 0.36 0.28 0.28 0.4 0.28 0.28 0.33 0.38 0.33 0.32 0.26 0.3 0.34 0.55 0.46 0.36
0.89 1.0 0.64 0.4 0.85 0.3 0.2 0.26 0.44 0.53 0.26 0.35 0.16 0.73 0.26 0.26 0.26 0.54 0.21 0.23 0.32 0.23 0.51 0.31 0.29 0.32 0.3 0.59 0.6 0.36
0.89 1.0 0.7 0.69 0.59 0.58 0.48 0.49 0.35 0.48 0.5 0.45 0.52 0.82 0.61 0.62 0.58 0.93 0.47 0.48 0.59 0.6 0.59 0.45 0.45 0.5 0.43 0.74 0.59 0.51
1.0 0.92 0.46 0.3 0.48 0.32 0.26 0.23 0.41 0.43 0.33 0.34 0.22 0.79 0.22 0.23 0.19 0.43 0.29 0.34 0.35 0.4 0.45 0.3 0.26 0.29 0.29 0.51 0.48 0.39
0.69 0.71 0.48 0.38 0.46 0.4 0.32 0.27 0.37 0.43 0.37 0.4 0.19 1.0 0.45 0.45 0.47 0.53 0.37 0.28 0.44 0.41 0.28 0.48 0.45 0.4 0.38 0.57 0.48 0.39
0.83 0.72 0.55 0.48 0.45 0.47 0.54 0.56 0.55 0.61 0.55 0.56 0.47 1.0 0.55 0.52 0.53 0.75 0.51 0.53 0.49 0.51 0.57 0.56 0.52 0.5 0.51 0.6 0.52 0.48
1.0 0.89 0.44 0.43 0.52 0.24 0.16 0.24 0.37 0.45 0.35 0.37 0.3 0.68 0.19 0.23 0.19 0.78 0.23 0.23 0.29 0.3 0.56 0.24 0.24 0.3 0.32 0.75 0.44 0.32
0.74 0.87 0.57 0.78 0.46 0.39 0.39 0.35 0.47 0.49 0.44 0.46 0.46 0.62 0.54 0.6 0.55 1.0 0.42 0.4 0.55 0.52 0.61 0.43 0.38 0.43 0.46 0.6 0.44 0.5
1.0 0.98 0.68 0.59 0.73 0.75 0.74 0.49 0.61 0.63 0.49 0.56 0.5 0.93 0.66 0.59 0.57 0.87 0.56 0.57 0.58 0.61 0.81 0.5 0.48 0.5 0.49 0.73 0.71 0.71
0.97 1.0 0.65 0.74 0.66 0.52 0.54 0.7 0.49 0.53 0.48 0.58 0.57 0.92 0.74 0.62 0.68 0.84 0.5 0.53 0.57 0.57 0.84 0.42 0.42 0.57 0.54 0.55 0.52 0.71
0.89 1.0 0.75 0.53 0.39 0.28 0.33 0.28 0.3 0.27 0.21 0.22 0.26 0.35 0.43 0.33 0.32 0.46 0.39 0.39 0.37 0.4 0.82 0.22 0.21 0.23 0.22 0.36 0.33 0.21
0.76 0.66 0.47 0.34 0.34 0.35 0.22 0.19 0.29 0.38 0.31 0.28 0.21 1.0 0.42 0.33 0.34 0.64 0.2 0.2 0.31 0.28 0.31 0.32 0.26 0.28 0.3 0.32 0.54 0.2
0.63 0.71 0.42 0.23 0.52 0.31 0.21 0.1 0.2 0.3 0.23 0.2 0.16 1.0 0.34 0.4 0.41 0.77 0.27 0.19 0.28 0.23 0.17 0.22 0.33 0.23 0.18 0.38 0.39 0.32
1.0 0.8 0.52 0.45 0.83 0.16 0.12 0.1 0.26 0.23 0.11 0.11 0.08 0.82 0.18 0.13 0.11 0.82 0.21 0.25 0.23 0.29 0.54 0.09 0.08 0.1 0.09 0.26 0.6 0.31
0.88 1.0 0.47 0.53 0.4 0.38 0.34 0.48 0.4 0.3 0.32 0.4 0.39 0.9 0.58 0.52 0.24 0.47 0.14 0.19 0.42 0.53 0.35 0.38 0.3 0.21 0.3 0.52 0.63 0.32
0.95 1.0 0.72 0.43 0.43 0.4 0.42 0.53 0.55 0.47 0.33 0.47 0.6 0.92 0.42 0.44 0.47 0.39 0.14 0.22 0.44 0.44 0.3 0.28 0.22 0.32 0.31 0.47 0.82 0.7
0.93 1.0 0.8 0.4 0.44 0.47 0.35 0.46 0.45 0.45 0.35 0.49 0.4 0.77 0.46 0.36 0.37 0.27 0.21 0.2 0.36 0.55 0.25 0.31 0.26 0.32 0.31 0.68 0.64 0.64
0.85 0.95 0.56 0.52 0.46 0.53 0.29 0.51 0.71 0.48 0.37 0.45 0.43 1.0 0.45 0.53 0.48 0.46 0.22 0.21 0.25 0.56 0.37 0.45 0.22 0.49 0.41 0.52 0.65 0.66
1.0 0.94 0.45 0.37 0.58 0.39 0.37 0.43 0.33 0.43 0.3 0.33 0.27 0.85 0.36 0.3 0.31 0.85 0.33 0.29 0.29 0.32 0.59 0.29 0.3 0.35 0.37 0.86 0.58 0.39
Spov3_chr3.00884 (UBDK GAMMA 7)
 0.97 1.0 0.64 0.61 0.78 0.71 0.68 0.54 0.54 0.6 0.61 0.62 0.66 0.77 0.73 0.65 0.63 0.62 0.57 0.52 0.57 0.57 0.74 0.59 0.54 0.62 0.61 0.77 0.64 0.76
1.0 0.83 0.77 0.66 0.86 0.61 0.61 0.55 0.65 0.6 0.57 0.57 0.48 1.0 0.67 0.65 0.6 0.49 0.53 0.54 0.55 0.56 0.69 0.55 0.53 0.54 0.55 0.61 0.69 0.48
1.0 0.97 0.74 0.69 0.72 0.68 0.64 0.58 0.54 0.56 0.62 0.62 0.71 0.77 0.75 0.8 0.79 0.8 0.61 0.56 0.65 0.63 0.82 0.68 0.63 0.65 0.66 0.69 0.59 0.59
1.0 0.98 0.18 0.07 0.16 0.08 0.05 0.04 0.04 0.06 0.04 0.05 0.08 0.54 0.06 0.05 0.04 0.93 0.08 0.07 0.09 0.09 0.13 0.1 0.04 0.05 0.03 0.11 0.1 0.08
1.0 1.0 0.54 0.36 0.54 0.4 0.43 0.51 0.45 0.45 0.32 0.32 0.3 0.81 0.41 0.32 0.34 0.3 0.35 0.36 0.46 0.44 0.29 0.39 0.35 0.37 0.33 0.55 0.46 0.31
1.0 0.78 0.63 0.65 0.65 0.46 0.5 0.44 0.59 0.57 0.5 0.49 0.43 0.88 0.49 0.48 0.45 0.52 0.46 0.43 0.5 0.47 0.54 0.51 0.49 0.49 0.51 0.6 0.65 0.49
1.0 0.99 0.55 0.41 0.55 0.36 0.37 0.41 0.46 0.56 0.33 0.39 0.31 0.96 0.34 0.31 0.32 0.73 0.37 0.34 0.37 0.33 0.68 0.41 0.29 0.39 0.39 0.52 0.72 0.36
1.0 0.91 0.56 0.39 0.71 0.3 0.28 0.31 0.4 0.4 0.27 0.28 0.23 0.71 0.37 0.3 0.29 0.64 0.31 0.32 0.33 0.33 0.57 0.28 0.24 0.27 0.27 0.46 0.62 0.34
0.82 0.8 0.76 0.73 0.87 0.67 0.69 0.7 0.67 0.64 0.62 0.66 0.7 1.0 0.82 0.75 0.75 0.78 0.6 0.59 0.54 0.55 0.78 0.64 0.57 0.56 0.62 0.7 0.75 0.64
0.74 0.68 0.6 0.54 0.55 0.55 0.6 0.51 0.6 0.61 0.52 0.49 0.46 1.0 0.6 0.57 0.64 0.59 0.51 0.48 0.52 0.54 0.52 0.5 0.5 0.54 0.56 0.67 0.57 0.61
0.81 0.79 0.63 0.52 0.77 0.64 0.59 0.43 0.62 0.6 0.58 0.59 0.52 1.0 0.63 0.64 0.62 0.46 0.58 0.55 0.58 0.61 0.76 0.57 0.58 0.57 0.61 0.59 0.59 0.5
0.8 0.68 0.68 0.66 0.89 0.6 0.61 0.53 0.62 0.61 0.62 0.57 0.6 1.0 0.71 0.58 0.6 0.58 0.59 0.53 0.55 0.56 0.72 0.54 0.56 0.54 0.59 0.66 0.66 0.45
1.0 0.82 0.56 0.39 0.66 0.3 0.24 0.18 0.4 0.34 0.27 0.28 0.15 0.73 0.3 0.25 0.25 0.41 0.25 0.25 0.3 0.26 0.66 0.28 0.24 0.25 0.25 0.58 0.46 0.27
0.93 1.0 0.82 0.71 0.92 0.59 0.51 0.62 0.67 0.65 0.59 0.61 0.63 0.79 0.6 0.54 0.61 0.8 0.55 0.62 0.59 0.58 0.97 0.64 0.57 0.61 0.62 0.75 0.69 0.66
0.96 1.0 0.64 0.6 0.71 0.45 0.36 0.29 0.44 0.53 0.45 0.41 0.33 0.76 0.47 0.51 0.41 0.89 0.48 0.45 0.55 0.54 0.58 0.44 0.4 0.38 0.42 0.47 0.52 0.56
1.0 0.79 0.37 0.27 0.45 0.16 0.15 0.17 0.18 0.14 0.12 0.15 0.1 0.67 0.23 0.14 0.11 0.27 0.21 0.15 0.21 0.16 0.89 0.11 0.15 0.11 0.13 0.28 0.24 0.1
1.0 0.82 0.59 0.46 0.41 0.39 0.33 0.29 0.39 0.39 0.36 0.36 0.43 0.75 0.51 0.43 0.42 0.78 0.39 0.38 0.41 0.42 0.87 0.36 0.32 0.35 0.34 0.46 0.45 0.45
1.0 0.93 0.74 0.57 0.69 0.46 0.44 0.49 0.59 0.59 0.47 0.49 0.42 0.77 0.5 0.41 0.44 0.89 0.5 0.44 0.55 0.55 0.93 0.5 0.46 0.51 0.52 0.71 0.63 0.53
0.99 0.93 0.8 0.73 0.85 0.64 0.65 0.66 0.7 0.77 0.66 0.64 0.66 1.0 0.66 0.68 0.71 0.94 0.63 0.53 0.67 0.64 0.82 0.72 0.62 0.76 0.71 1.0 0.86 0.8
Spov3_chr5.01571 (emb1967)
 0.96 1.0 0.7 0.69 0.79 0.57 0.52 0.52 0.53 0.65 0.56 0.61 0.55 0.91 0.6 0.63 0.57 0.68 0.53 0.41 0.52 0.51 0.8 0.51 0.53 0.59 0.6 0.85 0.73 0.66
0.85 1.0 0.53 0.34 0.48 0.28 0.44 0.45 0.33 0.46 0.26 0.22 0.35 0.68 0.27 0.24 0.29 0.3 0.21 0.21 0.33 0.42 0.29 0.32 0.21 0.29 0.31 0.48 0.34 0.19
1.0 0.8 0.55 0.45 0.69 0.38 0.33 0.35 0.42 0.44 0.33 0.37 0.35 0.93 0.42 0.38 0.39 0.58 0.33 0.35 0.41 0.35 0.64 0.37 0.35 0.36 0.36 0.79 0.6 0.41
0.96 1.0 0.61 0.44 0.47 0.4 0.39 0.43 0.41 0.46 0.32 0.37 0.42 0.68 0.48 0.38 0.35 0.72 0.39 0.41 0.41 0.41 0.79 0.37 0.3 0.35 0.34 0.44 0.52 0.5
1.0 0.81 0.51 0.46 0.44 0.38 0.33 0.29 0.39 0.45 0.4 0.41 0.32 0.71 0.39 0.35 0.35 0.82 0.33 0.36 0.37 0.4 0.41 0.39 0.38 0.37 0.37 0.48 0.49 0.46
1.0 0.92 0.52 0.22 0.53 0.3 0.31 0.3 0.38 0.41 0.2 0.21 0.22 0.77 0.3 0.21 0.16 0.76 0.18 0.19 0.17 0.17 0.4 0.18 0.19 0.2 0.2 0.41 0.39 0.11
0.99 1.0 0.49 0.41 0.35 0.37 0.32 0.3 0.45 0.33 0.45 0.36 0.25 0.99 0.57 0.61 0.59 0.54 0.15 0.19 0.37 0.47 0.37 0.29 0.2 0.34 0.31 0.46 0.58 0.22
0.93 0.98 0.71 0.69 0.86 0.63 0.52 0.62 0.67 0.71 0.6 0.6 0.63 1.0 0.69 0.63 0.68 0.68 0.57 0.54 0.65 0.63 0.66 0.63 0.51 0.63 0.6 0.79 0.67 0.71
0.99 1.0 0.78 0.56 0.74 0.55 0.45 0.52 0.49 0.48 0.41 0.44 0.41 0.7 0.66 0.58 0.56 0.56 0.46 0.44 0.49 0.5 0.74 0.59 0.44 0.42 0.4 0.55 0.68 0.54
0.97 0.83 0.58 0.53 0.75 0.51 0.5 0.5 0.48 0.55 0.46 0.5 0.49 0.86 0.57 0.56 0.54 0.75 0.48 0.39 0.54 0.48 0.74 0.57 0.5 0.54 0.55 1.0 0.65 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)