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Heatmap: Cluster_162 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.26 0.19 -0.09 0.11 0.01 0.14 -0.25 0.09 -0.3 -0.12 -0.36 -0.23 -0.2 0.66 0.19 0.23 0.2 0.17 -0.44 -0.38 -0.29 -0.3 0.27 0.03 -0.12 -0.14 -0.1 -0.11 0.0 0.26
0.49 0.64 0.18 -0.13 0.11 -0.25 -0.16 0.29 -0.41 -0.03 -0.38 -0.4 -0.43 0.68 -0.0 -0.1 0.03 0.2 -0.49 -0.5 -0.34 -0.3 0.42 -0.43 -0.49 -0.36 -0.34 0.48 0.45 0.14
0.21 0.29 0.13 0.11 0.04 -0.11 -0.12 -0.03 -0.12 -0.02 -0.1 -0.14 -0.11 0.35 0.12 -0.02 -0.01 -0.1 -0.39 -0.45 -0.2 -0.13 0.22 -0.18 -0.21 -0.03 0.06 0.02 0.2 0.33
0.24 0.26 0.04 0.07 0.21 0.06 -0.14 -0.0 -0.18 -0.1 -0.29 -0.11 0.06 0.5 0.05 -0.07 -0.11 0.13 -0.37 -0.37 -0.36 -0.26 0.41 -0.12 -0.29 -0.09 -0.3 0.04 0.24 0.29
0.39 0.64 0.07 0.43 0.34 -0.04 -0.46 -0.14 -0.32 -0.25 -0.44 -0.22 -0.15 0.55 -0.12 -0.03 -0.05 0.15 -0.35 -0.6 -0.15 -0.26 0.05 -0.17 -0.37 0.0 -0.16 0.3 0.25 0.12
0.33 0.48 0.22 0.21 -0.35 -0.3 -0.53 -0.25 -0.02 0.19 -0.06 -0.22 -0.0 0.71 -0.0 -0.22 -0.21 -0.09 -0.85 -0.53 -0.24 -0.41 0.07 -0.14 -0.01 -0.07 -0.04 0.42 0.23 0.5
0.33 0.41 0.03 -0.02 0.06 -0.27 -0.2 0.26 -0.17 0.01 -0.18 -0.12 -0.03 0.68 0.06 -0.17 -0.12 0.02 -0.44 -0.34 -0.2 -0.2 0.01 -0.04 -0.19 -0.14 -0.08 0.28 0.25 -0.05
0.26 0.29 0.15 0.21 0.18 -0.06 -0.27 0.01 -0.23 -0.17 -0.2 -0.14 -0.07 0.56 0.04 -0.04 -0.04 -0.07 -0.45 -0.46 -0.18 -0.21 0.27 -0.31 -0.19 -0.23 -0.12 0.05 0.21 0.53
0.32 0.52 0.24 0.29 0.13 -0.12 -0.33 0.1 -0.09 -0.01 -0.27 -0.27 -0.18 0.44 -0.0 -0.06 -0.2 -0.01 -0.62 -0.58 -0.3 -0.23 0.34 -0.25 -0.26 -0.19 -0.18 0.38 0.36 0.16
0.36 0.36 0.03 -0.23 0.08 -0.02 -0.05 0.13 -0.29 -0.14 -0.17 -0.12 -0.25 0.5 0.08 -0.08 -0.02 0.16 -0.38 -0.22 0.04 -0.11 0.43 -0.31 -0.24 -0.14 -0.14 0.01 0.02 0.19
0.26 0.38 0.12 0.16 0.15 0.05 -0.06 0.14 -0.22 -0.11 -0.22 -0.28 0.14 0.5 0.15 0.03 0.06 0.01 -0.36 -0.39 -0.4 -0.25 -0.08 -0.1 -0.19 -0.28 -0.23 0.22 0.11 0.14
0.27 0.49 0.16 0.26 0.04 0.06 -0.27 -0.04 -0.23 -0.15 -0.2 -0.28 -0.15 0.67 0.1 0.11 0.13 0.12 -0.52 -0.54 -0.3 -0.33 0.38 -0.15 -0.4 -0.16 -0.18 -0.03 0.03 0.29
0.25 0.3 0.02 0.16 0.01 -0.08 -0.21 0.1 -0.38 -0.19 -0.21 -0.21 0.09 0.42 0.14 0.02 0.14 0.06 -0.36 -0.33 -0.17 -0.16 0.07 -0.07 -0.18 -0.19 -0.07 0.23 0.16 0.21
0.21 0.17 0.0 0.03 0.17 -0.09 -0.24 -0.12 -0.25 -0.16 -0.23 -0.15 -0.03 0.64 0.06 0.05 0.04 0.11 -0.23 -0.23 -0.01 -0.22 0.17 -0.18 -0.21 -0.11 0.02 0.09 0.08 0.22
0.33 0.2 0.02 0.24 -0.1 -0.15 -0.24 0.03 -0.24 -0.15 -0.2 -0.15 0.2 0.6 0.14 0.14 0.12 0.18 -0.44 -0.42 -0.26 -0.21 0.16 -0.13 -0.18 -0.15 -0.05 0.14 -0.02 0.06
0.23 0.31 0.17 0.1 0.12 -0.04 -0.16 0.2 -0.07 -0.13 -0.2 -0.16 -0.13 0.49 0.03 -0.09 -0.03 -0.13 -0.37 -0.38 -0.16 -0.11 0.09 -0.08 -0.24 -0.13 -0.09 0.28 0.2 0.06
0.22 0.25 0.04 0.13 0.07 -0.2 -0.18 0.04 -0.13 0.13 -0.12 -0.13 -0.09 0.59 -0.19 -0.14 -0.1 0.07 -0.2 -0.37 -0.17 -0.15 0.07 -0.07 -0.19 -0.14 -0.04 0.34 0.26 -0.04
Spov3_chr3.00847 (ATU2AF65A)
 0.15 0.3 0.02 0.17 0.06 -0.08 -0.16 0.14 -0.09 -0.02 -0.21 -0.08 -0.12 0.46 -0.05 0.01 -0.01 0.37 -0.36 -0.43 -0.3 -0.26 -0.13 -0.06 -0.16 -0.19 -0.2 0.18 0.26 0.3
0.12 0.2 0.06 0.14 0.12 -0.14 -0.02 0.13 -0.21 -0.19 -0.24 -0.25 0.03 0.28 0.18 0.09 0.06 0.07 -0.26 -0.21 -0.16 -0.16 0.1 -0.03 -0.1 -0.16 -0.07 0.17 0.15 0.06
0.17 0.3 0.15 0.17 -0.1 -0.31 -0.25 -0.01 0.07 0.19 -0.08 -0.09 -0.08 0.57 -0.24 -0.27 -0.24 -0.07 -0.27 -0.35 -0.12 -0.13 0.05 -0.07 -0.16 -0.2 -0.14 0.37 0.26 0.33
0.27 0.28 0.24 0.06 0.06 -0.13 -0.17 0.12 -0.06 -0.0 -0.12 -0.1 -0.05 0.39 -0.17 0.05 0.0 0.1 -0.35 -0.42 -0.2 -0.15 -0.06 -0.1 -0.12 -0.15 -0.11 0.19 0.24 0.1
0.22 0.37 0.22 0.15 -0.11 -0.22 -0.32 0.03 -0.23 -0.21 -0.23 -0.2 0.14 0.53 0.23 -0.1 -0.05 -0.09 -0.4 -0.32 -0.13 -0.05 0.26 -0.42 -0.22 -0.06 0.09 -0.06 0.05 0.5
0.21 0.22 0.08 -0.08 0.16 0.01 -0.08 -0.01 -0.23 0.06 -0.18 -0.12 -0.14 0.64 0.03 -0.03 -0.14 0.28 -0.42 -0.43 -0.11 -0.21 0.48 -0.27 -0.38 -0.08 -0.19 -0.1 0.05 0.35
0.25 0.3 0.14 0.18 0.16 -0.02 -0.33 0.14 -0.2 -0.14 -0.11 -0.15 -0.13 0.45 -0.2 0.09 -0.11 -0.03 -0.29 -0.55 -0.21 -0.25 0.06 0.06 -0.14 -0.2 -0.07 0.09 0.25 0.4
0.11 0.2 0.1 0.07 -0.2 -0.14 -0.13 -0.05 -0.03 0.04 -0.1 -0.08 0.1 0.57 -0.05 -0.02 0.05 0.2 -0.38 -0.37 -0.13 -0.13 -0.12 0.05 -0.23 -0.1 -0.23 0.11 0.27 0.22
0.26 0.27 0.2 0.07 0.14 -0.14 -0.14 0.19 -0.08 -0.05 -0.21 -0.19 -0.15 0.3 -0.02 -0.06 -0.12 0.05 -0.48 -0.51 -0.19 -0.1 0.24 -0.3 -0.27 -0.17 -0.02 0.29 0.3 0.34
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0.22 0.35 0.16 0.28 -0.1 -0.13 -0.28 0.13 -0.0 -0.07 -0.02 -0.14 -0.01 0.31 -0.21 -0.05 -0.05 0.2 -0.35 -0.42 -0.18 -0.13 0.15 -0.17 -0.25 -0.21 -0.1 0.24 0.22 0.2
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0.35 0.34 0.18 0.12 0.09 -0.12 -0.25 0.09 0.01 0.0 -0.2 -0.14 -0.27 0.62 0.01 -0.19 -0.22 0.01 -0.36 -0.36 -0.26 -0.21 0.26 -0.26 -0.2 -0.18 -0.12 0.26 0.29 0.08
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0.46 0.39 0.04 0.09 0.1 -0.12 -0.25 0.09 -0.17 -0.01 -0.35 -0.22 -0.05 0.62 -0.15 -0.13 -0.18 0.07 -0.38 -0.54 -0.21 -0.21 0.0 -0.01 -0.16 -0.27 -0.17 0.42 0.39 0.16
0.28 0.27 0.08 0.09 0.03 -0.09 -0.26 -0.18 -0.26 -0.1 -0.12 0.02 -0.1 0.58 0.08 -0.12 -0.01 -0.01 -0.32 -0.39 -0.15 -0.25 0.31 -0.24 -0.31 -0.12 -0.05 0.1 0.29 0.38
0.27 0.22 0.13 0.12 0.05 -0.2 -0.22 0.01 -0.1 0.04 -0.1 -0.04 0.05 0.42 0.03 -0.05 0.02 -0.13 -0.36 -0.25 -0.11 -0.09 -0.06 -0.08 -0.18 -0.11 -0.04 0.13 0.11 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.