1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_162 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
18.05 17.17 14.16 16.19 15.12 16.57 12.62 16.04 12.22 13.8 11.73 12.79 13.05 23.73 17.13 17.66 17.23 16.9 11.05 11.54 12.29 12.25 18.14 15.33 13.8 13.64 13.99 13.97 15.05 17.98
7.12 7.9 5.74 4.63 5.44 4.24 4.53 6.21 3.81 4.96 3.9 3.83 3.76 8.12 5.06 4.72 5.16 5.82 3.6 3.57 3.99 4.11 6.75 3.76 3.59 3.94 3.99 7.05 6.93 5.57
4.36 4.62 4.14 4.08 3.89 3.5 3.47 3.69 3.46 3.73 3.51 3.42 3.49 4.81 4.1 3.73 3.76 3.51 2.87 2.77 3.3 3.45 4.41 3.34 3.26 3.71 3.95 3.84 4.34 4.75
4.77 4.84 4.17 4.25 4.68 4.21 3.67 4.03 3.57 3.77 3.3 3.76 4.22 5.73 4.18 3.84 3.74 4.42 3.13 3.13 3.16 3.38 5.39 3.72 3.3 3.79 3.3 4.15 4.79 4.93
4.09 4.87 3.27 4.22 3.96 3.05 2.26 2.84 2.5 2.62 2.29 2.68 2.81 4.56 2.88 3.05 3.02 3.47 2.45 2.06 2.8 2.61 3.23 2.77 2.41 3.13 2.8 3.84 3.7 3.38
1.39 1.54 1.28 1.27 0.87 0.9 0.77 0.93 1.09 1.26 1.06 0.95 1.1 1.8 1.1 0.95 0.95 1.04 0.61 0.76 0.93 0.83 1.15 1.0 1.1 1.05 1.07 1.47 1.3 1.56
29.7 31.42 24.26 23.33 24.65 19.61 20.61 28.35 20.99 23.84 20.96 21.74 23.18 37.9 24.62 21.01 21.75 23.97 17.52 18.7 20.59 20.61 23.85 23.09 20.78 21.46 22.42 28.84 28.09 22.83
4.61 4.7 4.28 4.46 4.37 3.7 3.19 3.87 3.28 3.42 3.34 3.5 3.65 5.68 3.97 3.75 3.75 3.66 2.82 2.8 3.39 3.32 4.65 3.1 3.38 3.28 3.55 3.99 4.44 5.56
8.57 9.86 8.11 8.4 7.52 6.3 5.46 7.37 6.47 6.81 5.7 5.7 6.08 9.3 6.85 6.6 5.98 6.85 4.46 4.59 5.58 5.88 8.7 5.77 5.75 6.05 6.05 8.97 8.8 7.67
8.04 8.0 6.39 5.35 6.6 6.15 6.05 6.82 5.11 5.68 5.57 5.75 5.24 8.86 6.62 5.89 6.15 6.97 4.81 5.37 6.41 5.8 8.43 5.06 5.29 5.66 5.69 6.29 6.32 7.12
4.21 4.58 3.82 3.93 3.91 3.63 3.36 3.86 3.02 3.25 3.02 2.89 3.87 4.96 3.9 3.59 3.66 3.53 2.73 2.68 2.65 2.96 3.33 3.27 3.08 2.88 3.0 4.1 3.8 3.86
3.7 4.3 3.42 3.66 3.15 3.2 2.54 2.97 2.61 2.76 2.68 2.53 2.76 4.88 3.29 3.31 3.37 3.32 2.14 2.11 2.5 2.43 3.99 2.76 2.32 2.74 2.7 3.0 3.13 3.74
15.09 15.54 12.86 14.11 12.7 11.95 10.96 13.6 9.72 11.11 10.9 10.92 13.46 16.9 13.98 12.82 13.95 13.23 9.88 10.09 11.25 11.29 13.32 12.04 11.18 11.11 12.03 14.86 14.12 14.66
10.81 10.52 9.34 9.54 10.49 8.74 7.89 8.61 7.84 8.34 7.97 8.41 9.13 14.5 9.71 9.67 9.57 10.04 7.97 7.98 9.26 8.02 10.51 8.23 8.05 8.68 9.47 9.93 9.85 10.88
8.0 7.29 6.43 7.51 5.92 5.72 5.39 6.48 5.4 5.71 5.53 5.72 7.31 9.66 7.0 7.0 6.9 7.22 4.7 4.74 5.3 5.5 7.11 5.81 5.6 5.72 6.15 7.03 6.28 6.65
12.7 13.42 12.21 11.64 11.76 10.52 9.69 12.41 10.29 9.92 9.46 9.68 9.9 15.21 11.09 10.17 10.59 9.91 8.4 8.32 9.7 10.03 11.56 10.23 9.19 9.92 10.17 13.18 12.44 11.33
17.48 17.78 15.47 16.42 15.71 13.06 13.23 15.43 13.74 16.46 13.79 13.71 14.13 22.58 13.16 13.58 13.96 15.73 13.09 11.62 13.35 13.5 15.73 14.26 13.13 13.56 14.6 19.01 17.95 14.61
Spov3_chr3.00847 (ATU2AF65A)
 28.19 31.41 25.86 28.54 26.43 24.06 22.81 27.97 23.91 25.04 22.05 24.04 23.41 34.96 24.63 25.66 25.19 32.89 19.77 18.88 20.62 21.23 23.19 24.41 22.7 22.35 22.08 28.73 30.46 31.39
9.17 9.66 8.77 9.29 9.14 7.68 8.33 9.25 7.28 7.41 7.13 7.07 8.63 10.24 9.55 8.97 8.78 8.83 7.04 7.27 7.53 7.55 9.04 8.28 7.88 7.53 8.01 9.52 9.36 8.81
13.67 14.93 13.44 13.58 11.26 9.75 10.17 12.01 12.74 13.85 11.47 11.36 11.47 17.97 10.25 10.05 10.25 11.56 10.08 9.49 11.12 11.06 12.58 11.51 10.87 10.52 11.01 15.68 14.5 15.21
3.78 3.82 3.72 3.28 3.28 2.88 2.79 3.42 3.02 3.14 2.89 2.94 3.05 4.11 2.8 3.26 3.15 3.36 2.46 2.35 2.75 2.84 3.01 2.93 2.89 2.84 2.92 3.58 3.71 3.36
4.45 4.96 4.46 4.25 3.54 3.3 3.08 3.91 3.27 3.31 3.26 3.33 4.23 5.53 4.5 3.58 3.7 3.61 2.91 3.07 3.52 3.7 4.59 2.88 3.29 3.67 4.08 3.67 3.96 5.44
6.44 6.44 5.85 5.23 6.2 5.58 5.24 5.5 4.73 5.77 4.91 5.11 5.03 8.62 5.65 5.45 5.03 6.72 4.14 4.11 5.13 4.79 7.73 4.59 4.25 5.25 4.87 5.17 5.76 7.09
3.2 3.32 2.98 3.06 3.01 2.66 2.15 2.97 2.35 2.45 2.5 2.43 2.47 3.69 2.35 2.88 2.5 2.63 2.2 1.85 2.33 2.26 2.81 2.82 2.45 2.35 2.57 2.86 3.21 3.57
5.52 5.88 5.49 5.39 4.45 4.63 4.67 4.95 5.02 5.27 4.79 4.84 5.51 7.58 4.94 5.04 5.3 5.88 3.95 3.96 4.69 4.68 4.7 5.31 4.38 4.77 4.37 5.54 6.18 5.98
6.44 6.51 6.19 5.67 5.94 4.89 4.87 6.16 5.1 5.19 4.67 4.73 4.86 6.64 5.3 5.16 4.97 5.59 3.87 3.79 4.71 5.01 6.37 4.37 4.46 4.79 5.33 6.59 6.64 6.81
4.44 4.87 4.15 4.14 3.58 3.09 2.92 3.78 3.26 3.6 2.96 3.14 2.94 4.8 3.14 3.19 3.21 3.88 2.95 2.53 2.92 2.71 3.66 3.44 2.82 3.13 3.37 4.11 4.27 3.75
13.02 13.16 11.34 12.8 12.38 10.75 9.59 11.38 9.26 9.47 9.04 9.2 9.95 14.91 9.97 9.94 9.96 11.25 7.99 8.29 10.13 9.74 11.66 10.32 9.5 9.42 9.87 12.18 12.75 12.37
7.51 8.17 7.2 7.83 5.99 5.87 5.28 7.02 6.41 6.11 6.32 5.84 6.4 7.98 5.56 6.19 6.2 7.38 5.04 4.8 5.67 5.88 7.15 5.72 5.4 5.57 6.01 7.58 7.5 7.36
6.58 6.07 5.05 4.77 5.94 4.88 3.88 3.34 4.11 4.1 3.95 4.69 4.56 8.7 5.0 4.79 4.22 6.35 3.39 3.57 4.36 4.05 6.26 3.93 3.79 4.03 4.21 4.95 5.15 6.26
3.05 3.17 2.72 2.64 3.06 2.49 2.36 2.49 2.46 2.55 2.39 2.45 2.56 3.55 2.9 2.43 2.4 2.42 2.12 2.09 2.41 2.52 3.46 2.22 2.23 2.47 2.8 2.8 3.1 3.16
15.25 17.29 16.13 17.0 17.23 14.78 12.55 16.7 12.63 14.39 13.22 13.02 15.2 19.3 15.36 15.79 17.03 16.07 12.6 13.82 14.78 14.26 18.22 15.17 14.27 14.08 15.05 17.0 17.03 16.19
5.86 6.5 5.28 5.57 5.65 4.83 3.63 4.79 3.73 4.3 3.72 4.03 3.76 6.99 4.23 3.98 3.92 5.1 3.26 2.73 3.52 3.75 5.89 4.17 3.64 3.94 3.84 5.77 6.09 5.88
3.5 3.62 3.28 3.1 2.95 2.37 2.22 3.11 2.58 2.61 2.18 2.55 2.57 4.19 2.26 2.65 2.43 3.1 1.97 2.19 2.35 2.03 2.35 2.32 2.04 2.33 2.33 3.15 3.75 3.81
5.6 5.59 5.0 4.8 4.7 4.06 3.72 4.71 4.43 4.43 3.85 3.99 3.66 6.77 4.43 3.87 3.79 4.45 3.45 3.45 3.69 3.8 5.27 3.68 3.83 3.89 4.07 5.29 5.38 4.68
17.01 15.94 15.62 17.79 17.23 15.67 15.85 18.21 14.92 15.47 14.29 15.22 16.2 19.3 18.3 17.35 17.35 16.54 13.46 13.58 15.17 14.99 16.19 16.34 14.91 15.24 16.16 16.48 17.2 15.77
4.05 3.89 3.52 3.76 3.42 3.0 3.01 3.68 2.85 2.99 2.93 2.98 3.03 4.27 3.09 3.22 2.91 3.38 2.26 2.29 2.68 2.64 3.64 2.7 2.71 2.83 2.94 3.76 3.67 3.6
17.06 19.42 15.56 17.47 18.44 17.61 15.55 18.09 13.13 14.7 13.93 13.0 14.25 22.76 18.07 17.69 17.65 15.59 12.45 11.87 13.49 13.41 16.9 16.85 13.87 14.17 14.1 17.7 16.6 15.77
9.51 9.33 8.57 9.3 8.84 6.58 6.14 7.43 6.84 7.34 6.45 6.38 7.35 9.08 6.98 7.31 7.12 7.97 5.71 5.25 7.13 6.72 8.33 6.8 5.83 7.0 7.44 8.31 8.27 7.45
4.14 4.83 3.53 2.73 3.27 3.22 3.13 3.48 2.56 3.29 2.31 2.7 3.69 8.5 3.48 2.92 2.76 5.53 1.76 1.9 2.4 2.34 5.51 2.66 2.17 2.38 2.46 3.1 4.06 5.76
4.14 4.83 3.53 2.73 3.27 3.22 3.13 3.48 2.56 3.29 2.31 2.7 3.69 8.5 3.48 2.92 2.76 5.53 1.76 1.9 2.4 2.34 5.51 2.66 2.17 2.38 2.46 3.1 4.06 5.76
4.43 5.12 4.15 4.12 4.43 3.88 3.75 4.26 3.18 3.74 3.59 3.63 3.28 5.93 3.57 3.78 3.87 4.43 3.26 2.87 3.46 3.38 3.75 3.82 3.23 3.53 3.47 4.66 4.48 4.09
4.73 4.23 3.32 3.96 3.96 3.0 2.74 2.85 2.72 3.04 2.88 3.08 2.94 5.63 3.88 3.11 3.22 3.83 2.31 2.42 2.52 2.9 5.06 2.82 2.93 3.14 3.28 3.02 4.12 4.06
7.41 7.56 6.51 7.06 6.62 5.79 5.21 5.79 6.08 5.77 5.66 5.57 5.72 8.77 6.73 6.74 6.76 6.23 4.91 4.79 6.15 5.98 6.64 5.54 5.62 6.17 6.62 6.51 6.63 7.19
9.2 9.64 7.83 8.46 7.33 6.69 5.98 6.51 5.91 6.73 6.25 6.14 6.72 12.26 8.21 9.2 7.99 7.41 5.53 5.36 6.37 6.21 8.49 6.22 5.49 5.61 6.33 8.16 7.17 8.49
8.56 8.82 7.6 7.77 8.02 6.87 6.44 7.12 6.44 7.0 6.12 6.46 7.29 10.68 7.66 7.06 7.2 6.88 5.8 5.16 6.09 5.76 7.46 6.85 6.32 6.56 6.67 8.43 8.3 7.36
4.69 4.47 3.81 4.11 3.86 3.63 3.37 3.74 3.29 3.6 3.41 3.44 3.45 5.23 4.08 3.81 3.93 3.39 2.74 3.07 3.38 3.39 4.25 3.32 3.33 3.61 3.54 3.92 4.04 4.28
9.48 9.28 7.81 8.12 7.78 6.42 6.32 7.42 5.53 6.5 5.74 5.96 6.8 9.88 7.12 7.16 7.45 7.55 4.74 5.34 5.85 5.79 7.16 6.27 6.01 5.78 5.71 8.93 7.98 8.65
15.66 15.95 13.01 15.12 14.46 12.91 9.91 11.54 9.93 10.8 10.1 11.37 13.47 25.04 18.69 18.49 19.4 15.4 10.75 10.64 13.63 13.96 18.12 12.84 11.81 11.17 11.84 12.18 14.69 17.08
4.17 3.96 3.11 3.22 3.25 2.79 2.55 3.22 2.7 3.0 2.37 2.59 2.92 4.65 2.73 2.78 2.67 3.19 2.33 2.08 2.61 2.62 3.03 3.02 2.71 2.51 2.69 4.06 3.96 3.39
3.33 3.29 2.89 2.92 2.79 2.58 2.29 2.41 2.28 2.56 2.51 2.77 2.55 4.08 2.9 2.52 2.71 2.71 2.19 2.08 2.47 2.29 3.39 2.32 2.2 2.52 2.64 2.94 3.35 3.55
4.01 3.89 3.66 3.61 3.44 2.89 2.86 3.35 3.12 3.42 3.11 3.24 3.46 4.47 3.39 3.21 3.37 3.05 2.6 2.8 3.09 3.12 3.19 3.15 2.94 3.09 3.25 3.65 3.6 3.89

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)