Heatmap: Cluster_130 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.03 -0.08 0.14 0.41 -0.1 -0.26 0.01 0.37 -0.15 -0.26 -0.09 -0.19 0.29 -0.61 0.09 0.1 0.09 -0.41 -0.08 -0.04 -0.11 -0.13 0.54 -0.09 0.06 -0.05 0.05 0.09 -0.09 0.01
-0.62 -0.55 0.3 0.78 -0.21 -0.66 -0.29 0.95 -0.54 -0.11 -0.15 -0.27 0.42 -0.99 -0.2 -0.18 0.12 0.14 -0.14 -0.06 0.24 -0.13 0.5 -0.41 0.08 -0.29 0.33 -0.3 -0.22 0.5
-0.08 -0.04 0.11 0.37 -0.11 -0.22 -0.13 0.46 -0.2 -0.29 -0.11 -0.15 0.31 -0.48 0.18 0.09 0.25 -0.36 -0.17 -0.17 -0.13 -0.07 0.61 -0.18 -0.03 -0.1 0.05 0.08 -0.12 0.02
-0.23 -0.2 0.23 0.81 -0.39 -0.27 -0.24 0.65 -0.24 -0.5 -0.04 -0.2 0.25 -1.0 0.18 0.15 0.25 -0.37 -0.14 -0.16 -0.02 -0.01 0.66 -0.11 0.09 0.0 0.17 -0.01 -0.34 -0.32
-0.07 -0.13 0.06 0.51 -0.15 -0.18 -0.04 0.55 -0.31 -0.35 -0.15 -0.26 0.26 -0.17 0.2 0.24 0.23 -0.44 -0.2 -0.14 -0.07 -0.04 0.53 -0.21 -0.04 -0.14 0.02 -0.01 -0.12 -0.03
-0.2 -0.17 0.22 0.8 0.16 -0.64 -0.43 0.86 -0.28 0.05 -0.32 -0.49 0.42 -1.29 -0.63 -0.49 -0.24 -0.15 -0.1 -0.19 0.04 -0.06 0.37 -0.1 0.13 -0.01 0.17 0.52 0.28 -0.12
Spov3_chr1.04605 (HSC70-5)
-0.15 -0.17 0.12 0.68 -0.4 -0.33 -0.35 0.83 -0.32 -0.44 -0.09 -0.15 0.49 -0.75 0.08 0.07 0.29 0.06 -0.38 -0.31 -0.16 -0.25 0.88 -0.52 -0.22 -0.2 -0.01 0.01 -0.21 0.29
-0.1 0.04 0.15 0.42 -0.09 -0.33 -0.19 0.49 -0.14 -0.19 0.03 -0.17 0.27 -0.41 0.13 0.09 0.21 -0.26 -0.09 -0.18 -0.06 -0.06 0.31 -0.1 0.03 -0.02 0.07 0.07 -0.16 -0.22
-0.09 0.02 0.19 0.66 -0.19 -0.19 -0.39 0.58 -0.3 -0.29 -0.18 -0.18 0.33 -0.58 0.22 0.13 0.32 -0.24 -0.33 -0.27 -0.11 -0.18 0.5 -0.38 -0.14 -0.17 0.11 -0.0 -0.05 0.22
-0.26 -0.0 0.15 0.68 -0.27 -0.36 -0.35 0.34 -0.49 -0.48 -0.14 -0.37 0.36 -0.53 0.26 0.42 0.47 0.01 0.01 -0.07 0.19 0.02 0.28 -0.09 0.01 -0.04 0.09 -0.24 -0.55 -0.09
-0.3 -0.25 0.09 0.71 -0.06 -0.18 -0.04 0.71 -0.38 -0.48 -0.13 -0.33 0.39 -0.56 0.22 0.23 0.21 0.06 -0.28 -0.14 -0.11 -0.17 0.62 -0.31 -0.14 -0.23 0.05 -0.06 -0.22 -0.04
-0.65 -0.24 0.11 0.88 -0.54 -0.54 -0.48 0.6 -0.34 -0.23 0.02 -0.34 0.78 -1.56 -0.26 0.16 0.2 0.17 -0.3 -0.07 0.17 0.01 0.4 -0.48 0.02 -0.09 0.25 -0.01 -0.24 0.43
-0.34 -0.48 0.03 0.7 -0.28 -0.37 -0.53 0.32 -0.03 -0.26 -0.01 -0.2 0.55 -0.46 0.17 0.26 0.37 0.07 -0.2 0.0 0.01 -0.06 0.42 -0.22 -0.02 -0.15 0.09 -0.16 -0.34 0.16
Spov3_chr3.01389 (EIF2 GAMMA)
-0.23 -0.26 0.14 0.57 -0.3 -0.22 -0.1 0.64 -0.18 -0.38 -0.09 -0.13 0.38 -0.61 0.22 0.16 0.26 -0.37 -0.12 -0.09 -0.04 -0.02 0.56 -0.23 0.0 -0.13 0.01 -0.04 -0.25 -0.03
-0.08 -0.04 0.39 0.88 -0.21 -0.33 -0.46 0.85 -0.11 -0.42 -0.09 -0.24 0.42 -0.76 0.06 -0.02 0.11 -0.69 -0.47 -0.25 -0.34 -0.27 0.96 -0.45 -0.23 -0.4 -0.06 0.01 -0.01 0.27
Spov3_chr3.02896 (TOM20-3)
-0.16 -0.18 0.1 0.58 -0.21 -0.32 -0.28 0.5 -0.15 -0.12 -0.04 -0.24 0.26 -0.66 0.09 0.12 0.29 -0.03 -0.17 -0.18 0.02 -0.13 0.52 -0.28 -0.07 -0.03 0.21 -0.09 -0.11 0.03
-0.17 -0.2 0.13 0.56 -0.15 -0.28 -0.39 0.27 -0.28 -0.18 -0.09 -0.05 0.3 -0.68 0.19 0.1 0.25 -0.18 -0.17 -0.03 -0.01 0.0 0.69 -0.36 -0.0 -0.08 0.03 0.03 -0.13 0.07
Spov3_chr3.04058 (ATKRS-1)
-0.02 -0.04 0.18 0.65 -0.22 -0.14 -0.17 0.47 -0.31 -0.3 -0.12 -0.27 0.27 -0.38 0.23 0.25 0.33 -0.44 -0.32 -0.37 -0.11 -0.13 0.66 -0.3 -0.09 -0.15 0.01 0.12 -0.15 -0.06
-0.51 -0.45 0.49 0.96 -0.19 -1.2 -0.77 0.61 -0.35 -0.13 -0.2 -0.49 0.79 -1.98 -0.54 -0.44 -0.33 0.54 0.05 0.02 0.06 -0.01 0.38 -0.47 0.07 -0.28 0.29 0.21 0.14 0.47
0.0 0.01 0.16 0.51 -0.13 -0.22 -0.09 0.5 -0.22 -0.27 -0.15 -0.28 0.39 -0.31 0.12 0.01 0.12 -0.31 -0.23 -0.16 -0.18 -0.09 0.48 -0.23 -0.05 -0.19 -0.0 0.09 -0.08 0.2
-0.37 -0.28 0.24 1.08 -0.43 -0.3 -0.39 1.03 -0.42 -0.71 -0.27 -0.63 0.27 -1.05 0.26 0.18 0.35 -0.16 -0.3 -0.11 -0.14 -0.09 1.09 -0.44 -0.25 -0.26 0.07 -0.28 -0.5 0.01
Spov3_chr4.03391 (EF1alpha)
-0.31 -0.24 0.21 0.75 -0.44 -0.15 -0.19 0.61 -0.4 -0.57 -0.08 -0.29 0.43 -0.63 0.38 0.37 0.51 -0.84 -0.19 -0.13 -0.05 -0.06 0.84 -0.44 -0.08 -0.12 0.04 -0.15 -0.47 -0.09
Spov3_chr4.03393 (ELONGATION FACTOR-TU FAMILY)
-0.39 -0.37 0.18 0.66 -0.25 -0.26 -0.04 0.62 -0.16 -0.32 0.13 -0.03 0.52 -1.15 0.14 0.09 0.29 -0.61 -0.14 -0.06 -0.07 0.01 0.48 -0.22 0.1 -0.1 0.07 0.02 -0.26 -0.15
-0.32 -0.25 0.07 0.69 -0.45 -0.35 -0.37 0.52 -0.3 -0.2 -0.07 -0.18 0.53 -0.69 0.06 0.14 0.14 0.03 -0.1 0.02 -0.1 -0.01 0.49 -0.14 0.09 -0.14 0.14 0.12 -0.21 -0.12
-0.26 -0.15 0.14 0.7 -0.41 -0.26 -0.29 0.48 -0.45 -0.55 -0.18 -0.35 0.34 -0.66 0.27 0.3 0.33 -0.31 -0.04 -0.03 0.13 0.04 0.67 -0.07 0.17 0.01 0.13 -0.03 -0.51 -0.45
-0.22 -0.22 0.12 0.34 -0.0 -0.26 -0.3 0.49 -0.19 -0.25 -0.21 -0.32 0.16 -0.21 0.35 0.18 0.36 -0.07 -0.15 -0.12 -0.05 -0.08 0.52 -0.35 -0.23 -0.11 0.02 -0.06 -0.07 0.27
-0.18 -0.12 0.1 0.58 -0.1 -0.26 -0.14 0.51 -0.21 -0.26 -0.01 -0.23 0.48 -0.27 0.17 0.15 0.19 -0.31 -0.21 -0.16 -0.18 -0.07 0.47 -0.01 0.05 -0.11 0.05 0.03 -0.31 -0.36
-0.24 -0.18 0.17 0.6 -0.27 -0.32 -0.15 0.62 -0.2 -0.29 -0.08 -0.22 0.54 -0.82 0.15 0.07 0.2 -0.36 -0.14 -0.05 -0.08 -0.04 0.5 -0.27 -0.07 -0.17 0.12 0.11 -0.18 0.05
-0.35 -0.32 0.2 0.88 -0.54 -0.58 -0.53 0.5 -0.27 -0.38 -0.02 -0.3 0.63 -1.06 0.11 0.19 0.45 -0.2 -0.18 -0.09 -0.04 0.11 0.7 -0.18 0.07 -0.27 -0.01 -0.16 -0.32 0.18
-0.3 -0.33 0.11 0.45 -0.21 -0.23 -0.11 0.5 -0.27 -0.36 0.01 -0.16 0.45 -0.88 0.21 0.02 0.29 -0.32 -0.02 0.07 -0.01 0.01 0.73 -0.28 -0.04 -0.02 0.16 -0.14 -0.37 -0.02
-0.28 -0.22 0.18 0.78 -0.33 -0.24 -0.43 0.52 -0.28 -0.37 -0.05 -0.28 0.3 -0.62 0.15 0.18 0.27 -0.04 -0.18 -0.16 0.02 -0.05 0.66 -0.16 0.1 -0.0 0.15 -0.04 -0.34 -0.35
-0.28 -0.18 0.2 0.76 -0.19 -0.34 -0.51 0.66 -0.17 -0.25 -0.13 -0.25 0.39 -1.11 0.02 0.05 0.26 -0.18 -0.19 -0.09 -0.07 -0.09 0.64 -0.41 0.04 -0.02 0.11 0.1 -0.15 0.03
-0.08 -0.0 0.11 0.52 -0.04 -0.33 -0.27 0.29 -0.25 -0.2 -0.11 -0.26 0.33 -0.46 0.13 0.12 0.23 -0.04 -0.11 -0.14 -0.06 -0.07 0.47 -0.19 -0.04 -0.05 0.1 -0.01 -0.12 0.0
-0.46 -0.23 0.25 0.91 -0.27 -0.43 -0.49 0.72 -0.41 -0.29 -0.13 -0.31 0.77 -1.63 0.12 0.17 0.28 -0.02 -0.1 -0.24 -0.34 0.04 0.37 -0.53 -0.11 -0.16 0.08 0.0 -0.19 0.42
-0.18 -0.2 0.14 0.5 -0.16 -0.16 -0.12 0.66 -0.3 -0.37 -0.12 -0.31 0.4 -0.85 0.25 0.19 0.28 -0.34 -0.14 -0.07 -0.09 -0.08 0.69 -0.23 -0.02 -0.13 0.09 -0.03 -0.26 -0.11
-0.65 -0.37 0.12 0.84 -0.46 -0.66 -0.7 0.42 -0.35 -0.4 0.04 -0.27 0.63 -1.25 0.19 0.08 0.35 0.17 -0.12 0.1 0.11 0.07 0.86 -0.45 0.03 -0.07 0.11 -0.24 -0.41 0.17
Spov3_chr5.01405 (RPL23A2)
-0.27 -0.25 0.04 0.7 -0.32 -0.32 -0.38 0.48 -0.4 -0.45 -0.11 -0.27 0.53 -0.48 0.28 0.22 0.44 0.08 -0.19 -0.2 -0.14 -0.19 0.89 -0.3 -0.09 -0.16 0.02 -0.18 -0.37 -0.01
-0.67 -0.44 0.02 0.61 -0.63 -0.56 -0.49 0.78 -0.37 -0.31 -0.14 -0.41 0.63 -1.07 0.11 0.3 0.41 0.13 -0.05 0.0 -0.03 0.02 0.71 -0.4 -0.03 -0.24 0.07 -0.06 -0.21 0.37
-0.53 -0.4 -0.08 0.71 -0.42 0.04 -0.51 0.48 -0.4 -0.46 -0.13 -0.23 0.18 -0.09 0.48 0.56 0.62 -0.25 -0.38 -0.25 0.05 -0.22 1.08 -0.41 -0.01 -0.05 -0.13 -0.55 -0.53 -0.17
-0.19 -0.17 0.12 0.56 -0.4 -0.33 -0.2 0.44 -0.22 -0.36 -0.04 -0.18 0.44 -0.52 0.3 0.1 0.25 -0.25 -0.17 -0.09 -0.07 0.03 0.55 -0.23 -0.07 -0.14 0.05 0.03 -0.19 0.12
-0.16 -0.15 0.15 0.83 -0.35 -0.15 -0.15 0.9 -0.43 -0.61 -0.19 -0.35 0.45 -0.53 0.08 0.23 0.29 -0.53 -0.2 -0.21 -0.06 -0.13 0.49 -0.39 -0.08 -0.11 -0.01 -0.06 -0.24 0.22
-0.18 -0.07 0.16 0.69 -0.29 -0.3 -0.14 0.75 -0.29 -0.48 -0.19 -0.27 0.41 -0.6 0.47 0.32 0.44 -0.28 -0.29 -0.23 -0.23 -0.24 0.64 -0.36 -0.25 -0.17 -0.09 -0.1 -0.21 0.0
-0.09 0.17 0.23 0.69 -0.55 -0.35 -0.45 0.53 -0.33 -0.67 -0.18 -0.36 0.26 -0.03 0.25 0.27 0.44 0.1 -0.26 -0.17 -0.1 -0.15 0.77 -0.43 -0.17 -0.26 -0.09 -0.14 -0.26 0.01
-0.23 -0.24 0.22 0.6 -0.4 -0.24 -0.16 0.84 -0.24 -0.59 -0.11 -0.2 0.56 -0.55 0.14 -0.21 0.13 -0.49 -0.2 -0.1 -0.12 -0.06 0.78 -0.28 -0.06 -0.22 0.15 -0.21 -0.21 0.31
-0.2 -0.13 0.13 0.67 -0.37 -0.32 -0.34 0.51 -0.43 -0.42 -0.16 -0.35 0.36 -0.44 0.26 0.32 0.4 -0.06 -0.08 -0.15 0.02 -0.0 0.41 -0.24 -0.0 -0.05 0.12 -0.22 -0.29 0.09
-0.75 -0.52 -0.17 0.86 -0.52 -0.23 -0.61 0.72 -0.34 -0.34 -0.05 -0.27 0.35 -0.44 0.21 0.49 0.53 -0.27 -0.36 -0.33 0.03 -0.16 1.13 -0.26 0.01 -0.06 0.03 -0.3 -0.48 -0.16
-0.1 -0.1 0.15 0.75 -0.22 -0.4 -0.32 0.4 -0.31 -0.34 -0.14 -0.15 0.18 -0.29 0.11 0.17 0.27 -0.16 -0.3 -0.28 -0.1 -0.12 0.62 -0.2 -0.04 -0.14 0.04 0.1 0.05 0.03
-0.35 -0.2 0.13 0.59 -0.24 -0.23 -0.54 0.53 -0.36 -0.3 -0.0 -0.2 0.31 -0.73 0.23 0.3 0.49 -0.31 -0.04 -0.05 0.18 0.04 0.36 -0.2 0.12 -0.07 -0.01 -0.09 -0.3 -0.06
-0.26 -0.08 0.14 0.67 -0.2 -0.1 -0.29 0.57 -0.36 -0.54 -0.22 -0.39 0.34 -0.35 0.4 0.3 0.46 -0.1 -0.33 -0.23 -0.25 -0.28 0.89 -0.41 -0.28 -0.34 -0.08 -0.17 -0.29 0.31
-0.55 -0.22 0.13 0.8 -0.53 -0.75 -0.69 0.42 -0.03 -0.18 0.09 -0.15 0.63 -0.68 0.06 -0.11 0.15 0.33 -0.2 0.01 -0.02 0.06 0.13 -0.23 0.19 -0.17 0.35 0.04 -0.11 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.