1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_130 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.67 0.65 0.76 0.92 0.64 0.57 0.69 0.89 0.62 0.58 0.65 0.6 0.84 0.45 0.74 0.74 0.73 0.52 0.65 0.67 0.64 0.63 1.0 0.65 0.72 0.67 0.71 0.73 0.65 0.69
0.34 0.35 0.64 0.88 0.44 0.33 0.42 1.0 0.36 0.48 0.47 0.43 0.69 0.26 0.45 0.46 0.56 0.57 0.47 0.49 0.61 0.47 0.73 0.39 0.55 0.42 0.65 0.42 0.44 0.73
0.62 0.64 0.71 0.85 0.61 0.56 0.6 0.9 0.57 0.53 0.61 0.59 0.81 0.47 0.74 0.7 0.78 0.51 0.58 0.58 0.6 0.62 1.0 0.58 0.64 0.61 0.68 0.69 0.6 0.67
0.49 0.5 0.67 1.0 0.43 0.47 0.48 0.9 0.48 0.4 0.56 0.5 0.68 0.29 0.64 0.63 0.68 0.44 0.52 0.51 0.56 0.57 0.9 0.53 0.61 0.57 0.64 0.57 0.45 0.46
0.65 0.63 0.71 0.97 0.62 0.61 0.67 1.0 0.55 0.54 0.62 0.57 0.82 0.61 0.79 0.81 0.8 0.51 0.6 0.62 0.65 0.67 0.99 0.59 0.67 0.62 0.69 0.68 0.63 0.67
0.48 0.49 0.64 0.96 0.61 0.35 0.41 1.0 0.45 0.57 0.44 0.39 0.74 0.22 0.36 0.39 0.46 0.5 0.51 0.48 0.57 0.53 0.71 0.51 0.6 0.55 0.62 0.79 0.67 0.51
Spov3_chr1.04605 (HSC70-5)
 0.49 0.49 0.59 0.87 0.41 0.43 0.43 0.97 0.44 0.4 0.51 0.49 0.76 0.32 0.57 0.57 0.67 0.57 0.42 0.44 0.49 0.46 1.0 0.38 0.47 0.47 0.54 0.55 0.47 0.67
0.66 0.73 0.79 0.95 0.67 0.57 0.63 1.0 0.65 0.62 0.73 0.63 0.86 0.54 0.78 0.76 0.82 0.59 0.67 0.63 0.68 0.68 0.88 0.66 0.73 0.7 0.75 0.75 0.64 0.61
0.6 0.64 0.72 1.0 0.56 0.56 0.48 0.94 0.51 0.52 0.56 0.56 0.8 0.42 0.74 0.69 0.79 0.54 0.5 0.52 0.59 0.56 0.9 0.48 0.57 0.56 0.68 0.63 0.61 0.74
0.52 0.62 0.7 1.0 0.52 0.49 0.49 0.79 0.45 0.45 0.57 0.48 0.8 0.43 0.75 0.83 0.86 0.63 0.63 0.59 0.71 0.64 0.76 0.59 0.63 0.61 0.66 0.53 0.43 0.59
0.5 0.51 0.65 1.0 0.59 0.54 0.59 1.0 0.47 0.44 0.56 0.49 0.8 0.41 0.71 0.72 0.71 0.64 0.5 0.55 0.56 0.54 0.94 0.49 0.56 0.52 0.63 0.59 0.53 0.6
0.35 0.46 0.59 1.0 0.37 0.37 0.39 0.82 0.43 0.46 0.55 0.43 0.93 0.18 0.45 0.61 0.62 0.61 0.44 0.52 0.61 0.55 0.72 0.39 0.55 0.51 0.65 0.54 0.46 0.73
0.49 0.44 0.63 1.0 0.51 0.47 0.43 0.77 0.6 0.51 0.61 0.54 0.9 0.45 0.69 0.73 0.79 0.64 0.53 0.62 0.62 0.59 0.82 0.53 0.61 0.55 0.65 0.55 0.49 0.68
Spov3_chr3.01389 (EIF2 GAMMA)
 0.55 0.54 0.71 0.95 0.52 0.55 0.6 1.0 0.57 0.49 0.6 0.59 0.83 0.42 0.75 0.72 0.77 0.5 0.59 0.6 0.63 0.63 0.94 0.55 0.64 0.59 0.65 0.63 0.54 0.63
0.49 0.5 0.68 0.95 0.45 0.41 0.37 0.93 0.48 0.38 0.49 0.44 0.69 0.3 0.54 0.51 0.56 0.32 0.37 0.43 0.41 0.43 1.0 0.38 0.44 0.39 0.5 0.52 0.51 0.62
Spov3_chr3.02896 (TOM20-3)
 0.6 0.59 0.71 1.0 0.58 0.54 0.55 0.94 0.6 0.61 0.65 0.57 0.8 0.42 0.71 0.73 0.82 0.65 0.6 0.59 0.68 0.61 0.96 0.55 0.63 0.65 0.77 0.63 0.62 0.68
0.55 0.54 0.68 0.91 0.56 0.51 0.47 0.75 0.51 0.55 0.58 0.6 0.76 0.39 0.71 0.67 0.74 0.54 0.55 0.61 0.62 0.62 1.0 0.48 0.62 0.59 0.63 0.63 0.56 0.65
Spov3_chr3.04058 (ATKRS-1)
 0.62 0.62 0.71 0.99 0.54 0.57 0.56 0.88 0.51 0.51 0.58 0.52 0.76 0.49 0.74 0.75 0.79 0.47 0.51 0.49 0.58 0.58 1.0 0.51 0.6 0.57 0.64 0.69 0.57 0.61
0.36 0.38 0.72 1.0 0.45 0.22 0.3 0.78 0.4 0.47 0.45 0.36 0.89 0.13 0.35 0.38 0.41 0.74 0.53 0.52 0.53 0.51 0.67 0.37 0.54 0.42 0.63 0.6 0.56 0.71
0.7 0.71 0.78 1.0 0.64 0.6 0.66 0.99 0.6 0.58 0.63 0.58 0.92 0.56 0.76 0.71 0.76 0.56 0.6 0.63 0.62 0.66 0.98 0.6 0.68 0.61 0.7 0.75 0.66 0.8
0.36 0.39 0.55 0.99 0.35 0.38 0.36 0.96 0.35 0.29 0.39 0.3 0.56 0.23 0.56 0.53 0.6 0.42 0.38 0.43 0.43 0.44 1.0 0.34 0.39 0.39 0.49 0.39 0.33 0.47
Spov3_chr4.03391 (EF1alpha)
 0.45 0.47 0.65 0.94 0.41 0.51 0.49 0.85 0.42 0.38 0.53 0.46 0.75 0.36 0.73 0.72 0.8 0.31 0.49 0.51 0.54 0.54 1.0 0.41 0.53 0.52 0.58 0.5 0.4 0.53
Spov3_chr4.03393 (ELONGATION FACTOR-TU FAMILY)
 0.49 0.49 0.72 1.0 0.53 0.53 0.61 0.97 0.57 0.51 0.69 0.62 0.91 0.29 0.7 0.68 0.78 0.41 0.57 0.61 0.6 0.64 0.89 0.54 0.68 0.59 0.67 0.64 0.53 0.57
0.5 0.52 0.65 1.0 0.45 0.49 0.48 0.89 0.5 0.54 0.59 0.55 0.9 0.38 0.65 0.68 0.68 0.63 0.58 0.63 0.58 0.61 0.87 0.56 0.66 0.56 0.68 0.68 0.54 0.57
0.51 0.55 0.68 1.0 0.46 0.51 0.5 0.85 0.45 0.42 0.54 0.48 0.78 0.39 0.74 0.76 0.77 0.5 0.6 0.6 0.67 0.63 0.98 0.58 0.69 0.62 0.67 0.6 0.43 0.45
0.6 0.6 0.76 0.88 0.7 0.58 0.57 0.98 0.61 0.59 0.6 0.56 0.78 0.6 0.89 0.79 0.9 0.66 0.63 0.64 0.67 0.66 1.0 0.55 0.59 0.64 0.71 0.67 0.66 0.84
0.59 0.62 0.72 1.0 0.62 0.56 0.61 0.95 0.58 0.56 0.67 0.57 0.93 0.56 0.76 0.74 0.76 0.54 0.58 0.6 0.59 0.64 0.93 0.67 0.7 0.62 0.69 0.69 0.54 0.52
0.55 0.57 0.73 0.99 0.54 0.52 0.59 1.0 0.57 0.53 0.62 0.56 0.95 0.37 0.72 0.68 0.74 0.51 0.59 0.63 0.61 0.63 0.92 0.54 0.62 0.58 0.71 0.7 0.57 0.67
0.43 0.44 0.62 1.0 0.37 0.36 0.38 0.77 0.45 0.42 0.54 0.44 0.84 0.26 0.59 0.62 0.74 0.47 0.48 0.51 0.53 0.59 0.89 0.48 0.57 0.45 0.54 0.49 0.43 0.62
0.49 0.48 0.65 0.82 0.52 0.51 0.56 0.85 0.5 0.47 0.61 0.54 0.82 0.33 0.69 0.61 0.73 0.48 0.59 0.63 0.6 0.6 1.0 0.5 0.59 0.59 0.67 0.55 0.47 0.59
0.48 0.5 0.66 1.0 0.46 0.49 0.43 0.83 0.48 0.45 0.56 0.48 0.72 0.38 0.65 0.66 0.7 0.57 0.51 0.52 0.59 0.56 0.92 0.52 0.62 0.58 0.65 0.57 0.46 0.45
0.49 0.52 0.68 1.0 0.52 0.47 0.42 0.94 0.53 0.5 0.54 0.5 0.78 0.27 0.6 0.61 0.71 0.52 0.52 0.56 0.57 0.56 0.92 0.45 0.61 0.58 0.64 0.63 0.53 0.61
0.66 0.7 0.75 1.0 0.68 0.56 0.58 0.86 0.59 0.61 0.65 0.58 0.88 0.51 0.77 0.76 0.82 0.68 0.65 0.64 0.67 0.67 0.97 0.61 0.68 0.68 0.75 0.69 0.64 0.7
0.38 0.45 0.63 1.0 0.44 0.39 0.38 0.87 0.4 0.44 0.48 0.43 0.9 0.17 0.58 0.6 0.65 0.52 0.5 0.45 0.42 0.55 0.68 0.37 0.49 0.48 0.56 0.53 0.46 0.71
0.55 0.54 0.68 0.87 0.55 0.56 0.57 0.98 0.5 0.48 0.57 0.5 0.82 0.34 0.74 0.71 0.75 0.49 0.56 0.59 0.58 0.58 1.0 0.53 0.61 0.57 0.66 0.61 0.52 0.57
0.35 0.43 0.6 0.99 0.4 0.35 0.34 0.74 0.43 0.42 0.57 0.46 0.85 0.23 0.63 0.58 0.7 0.62 0.51 0.59 0.6 0.58 1.0 0.41 0.56 0.52 0.6 0.47 0.42 0.62
Spov3_chr5.01405 (RPL23A2)
 0.45 0.45 0.55 0.88 0.43 0.43 0.41 0.75 0.41 0.39 0.5 0.45 0.78 0.39 0.66 0.63 0.73 0.57 0.47 0.47 0.49 0.47 1.0 0.44 0.51 0.48 0.55 0.48 0.42 0.54
0.37 0.43 0.59 0.89 0.38 0.4 0.42 1.0 0.45 0.47 0.53 0.44 0.9 0.28 0.63 0.72 0.77 0.64 0.56 0.58 0.57 0.59 0.95 0.44 0.57 0.49 0.61 0.56 0.51 0.75
0.33 0.36 0.45 0.77 0.35 0.49 0.33 0.66 0.36 0.34 0.43 0.4 0.54 0.44 0.66 0.7 0.73 0.4 0.36 0.4 0.49 0.41 1.0 0.36 0.47 0.46 0.43 0.32 0.33 0.42
0.59 0.6 0.74 1.0 0.51 0.54 0.59 0.91 0.58 0.53 0.66 0.6 0.92 0.47 0.83 0.73 0.81 0.57 0.6 0.64 0.64 0.69 0.99 0.58 0.65 0.62 0.7 0.69 0.59 0.73
0.48 0.48 0.59 0.95 0.42 0.49 0.48 1.0 0.4 0.35 0.47 0.42 0.73 0.37 0.57 0.63 0.65 0.37 0.47 0.47 0.52 0.49 0.75 0.41 0.51 0.5 0.53 0.52 0.45 0.63
0.52 0.57 0.66 0.96 0.49 0.48 0.54 1.0 0.49 0.43 0.52 0.5 0.79 0.39 0.82 0.74 0.81 0.49 0.49 0.51 0.51 0.51 0.93 0.46 0.5 0.53 0.56 0.56 0.51 0.6
0.55 0.66 0.69 0.94 0.4 0.46 0.43 0.85 0.47 0.37 0.52 0.46 0.7 0.58 0.69 0.71 0.8 0.63 0.49 0.52 0.54 0.53 1.0 0.44 0.52 0.49 0.55 0.53 0.49 0.59
0.48 0.47 0.65 0.85 0.42 0.47 0.5 1.0 0.47 0.37 0.52 0.49 0.82 0.38 0.62 0.48 0.61 0.4 0.49 0.52 0.51 0.54 0.96 0.46 0.54 0.48 0.62 0.48 0.48 0.69
0.55 0.57 0.68 1.0 0.48 0.5 0.49 0.89 0.46 0.47 0.56 0.49 0.8 0.46 0.75 0.78 0.82 0.6 0.59 0.57 0.64 0.62 0.83 0.53 0.63 0.6 0.68 0.54 0.51 0.67
0.27 0.32 0.4 0.83 0.32 0.39 0.3 0.75 0.36 0.36 0.44 0.38 0.58 0.34 0.53 0.64 0.66 0.38 0.36 0.36 0.46 0.41 1.0 0.38 0.46 0.44 0.47 0.37 0.33 0.41
0.55 0.55 0.66 1.0 0.51 0.45 0.47 0.78 0.48 0.47 0.54 0.54 0.67 0.49 0.64 0.67 0.72 0.53 0.48 0.49 0.55 0.55 0.91 0.52 0.58 0.54 0.61 0.64 0.61 0.61
0.52 0.58 0.72 1.0 0.56 0.57 0.46 0.96 0.52 0.54 0.66 0.58 0.82 0.4 0.78 0.82 0.93 0.54 0.65 0.64 0.75 0.68 0.85 0.58 0.72 0.63 0.66 0.62 0.54 0.64
0.45 0.51 0.59 0.86 0.47 0.5 0.44 0.8 0.42 0.37 0.46 0.41 0.68 0.42 0.71 0.66 0.74 0.5 0.43 0.46 0.45 0.44 1.0 0.4 0.44 0.42 0.51 0.48 0.44 0.67
0.39 0.49 0.63 1.0 0.4 0.34 0.36 0.77 0.56 0.51 0.61 0.52 0.89 0.36 0.6 0.53 0.64 0.72 0.5 0.58 0.57 0.6 0.63 0.49 0.66 0.51 0.73 0.59 0.53 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)