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Heatmap: Cluster_154 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.08 0.11 0.01 0.13 -0.2 -0.29 -0.34 -0.18 -0.05 0.02 -0.15 -0.2 0.11 0.36 0.02 -0.0 0.0 0.25 -0.18 -0.27 -0.08 -0.11 0.64 0.03 -0.13 -0.09 -0.03 0.09 -0.03 0.04
0.06 0.19 -0.01 0.09 -0.02 0.05 -0.1 0.26 -0.23 -0.21 -0.12 -0.15 0.18 0.35 0.13 0.13 0.18 -0.04 -0.39 -0.3 -0.18 -0.11 0.43 -0.2 -0.2 -0.21 -0.07 0.03 -0.0 0.09
0.17 0.18 -0.07 -0.03 -0.07 -0.16 -0.11 -0.03 -0.29 -0.14 -0.29 -0.13 -0.02 0.68 0.22 0.15 0.22 -0.03 -0.27 -0.45 -0.19 -0.2 0.69 -0.05 -0.18 -0.14 -0.05 0.0 -0.01 -0.06
-0.01 0.03 0.05 0.42 -0.17 -0.09 -0.45 0.03 -0.15 -0.28 -0.29 -0.28 0.16 0.28 0.32 0.13 0.33 0.14 -0.27 -0.51 -0.19 0.1 0.56 -0.39 0.01 -0.16 0.08 -0.06 -0.16 0.14
0.21 0.26 0.01 1.0 -0.44 0.06 -0.9 0.68 -0.63 -0.45 -0.33 -0.55 0.29 -0.13 0.38 0.47 0.42 -0.78 -0.84 -0.7 -0.49 -0.35 0.69 -0.55 -0.23 -0.37 -0.27 0.17 0.13 0.57
0.04 0.09 -0.1 0.27 0.09 -0.19 -0.24 0.25 -0.25 -0.25 -0.15 -0.39 0.06 0.53 0.12 0.19 0.08 0.0 -0.26 -0.28 -0.27 -0.14 0.6 -0.17 -0.05 -0.16 0.02 0.06 -0.03 -0.02
0.03 0.08 -0.07 0.09 -0.12 -0.09 -0.2 0.08 -0.11 -0.12 -0.17 -0.17 0.13 0.53 0.1 0.11 0.07 0.05 -0.25 -0.36 -0.21 -0.17 0.42 -0.05 -0.09 -0.04 0.01 0.06 0.05 0.07
-0.04 0.11 0.03 0.18 0.07 -0.13 -0.3 0.36 -0.01 -0.08 -0.21 -0.22 0.08 0.09 0.17 -0.04 0.02 0.1 -0.33 -0.31 0.0 -0.27 0.59 -0.3 -0.13 -0.07 0.07 -0.02 -0.03 0.17
0.04 0.27 0.09 0.02 0.1 -0.04 0.02 0.09 -0.13 -0.14 -0.12 -0.29 -0.19 0.32 0.16 0.13 0.14 0.02 -0.23 -0.39 -0.09 -0.11 0.7 -0.15 -0.34 -0.04 -0.09 -0.15 -0.13 0.05
-0.02 0.14 0.06 0.56 0.04 -0.03 -0.4 0.22 -0.24 -0.21 -0.33 -0.16 0.09 0.2 0.14 0.22 0.16 -0.04 -0.31 -0.31 -0.15 -0.16 0.49 -0.21 -0.17 -0.16 -0.14 0.03 -0.01 0.15
0.01 0.19 0.07 0.41 -0.1 -0.13 -0.1 0.18 -0.2 -0.13 -0.08 -0.12 0.13 0.25 0.24 0.03 0.06 0.05 -0.36 -0.41 -0.13 -0.09 0.34 -0.15 -0.23 -0.13 -0.06 -0.05 -0.03 0.14
0.25 0.21 -0.01 0.05 0.22 -0.07 -0.15 0.14 -0.21 -0.25 -0.29 -0.17 0.13 0.32 -0.1 0.14 0.07 0.08 -0.53 -0.42 -0.13 -0.16 0.58 -0.23 -0.32 -0.12 0.03 0.1 0.13 0.14
0.08 0.06 0.11 0.2 0.02 -0.12 -0.14 0.22 -0.12 -0.07 -0.17 -0.12 0.13 0.24 0.13 -0.02 -0.01 -0.14 -0.22 -0.25 -0.1 -0.13 0.36 -0.15 -0.11 -0.04 -0.01 0.1 -0.02 0.08
-0.02 0.22 0.25 1.02 -0.03 -0.08 -0.81 0.47 -0.5 -0.44 -0.4 -0.49 -0.02 0.26 0.31 0.41 0.51 0.05 -0.69 -0.64 -0.18 -0.4 0.72 -0.49 -0.51 -0.29 -0.31 -0.12 -0.18 0.31
0.07 0.12 -0.05 0.13 -0.15 -0.02 -0.14 0.05 -0.22 -0.08 -0.17 -0.14 0.22 0.48 0.24 0.12 0.09 -0.2 -0.44 -0.42 -0.16 -0.15 0.57 -0.05 -0.13 -0.16 -0.06 0.09 0.05 -0.01
0.23 0.1 -0.16 0.03 -0.19 -0.43 -0.16 0.31 -0.41 -0.16 -0.13 -0.31 0.54 -0.01 0.14 0.04 0.17 -0.41 -0.24 -0.22 -0.19 -0.22 0.96 -0.08 -0.12 -0.04 0.09 0.0 -0.04 -0.01
0.08 0.19 -0.06 0.13 0.2 0.1 -0.14 -0.07 -0.3 -0.16 -0.2 -0.2 -0.03 0.59 0.34 0.26 0.2 0.07 -0.35 -0.43 -0.11 -0.14 0.27 -0.18 -0.26 -0.16 -0.11 0.09 -0.0 -0.11
0.09 0.03 -0.15 -0.22 -0.2 0.11 0.11 0.25 0.03 -0.02 -0.09 -0.05 0.0 0.51 -0.09 -0.0 0.0 -0.29 -0.44 -0.16 -0.07 -0.07 0.8 -0.08 -0.16 -0.2 -0.11 0.08 -0.05 -0.14
-0.02 0.05 -0.01 0.23 -0.13 -0.27 -0.11 0.18 -0.18 -0.13 -0.17 -0.18 0.17 0.25 0.12 0.14 0.16 0.09 -0.28 -0.29 -0.1 -0.06 0.33 -0.12 -0.06 -0.08 0.05 0.12 0.01 0.0
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0.02 0.19 0.12 0.63 -0.06 -0.07 -0.49 0.38 -0.12 0.01 -0.28 -0.14 0.12 -0.03 0.23 0.22 0.11 -0.27 -0.49 -0.36 -0.03 -0.29 0.56 -0.47 -0.26 -0.08 0.08 -0.1 -0.07 0.15
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0.07 -0.04 0.1 0.23 0.16 -0.23 -0.22 0.2 -0.06 -0.12 -0.02 -0.11 0.02 -0.04 0.15 0.04 0.09 0.23 -0.21 -0.25 -0.0 -0.07 0.49 -0.32 -0.13 -0.15 -0.03 -0.07 -0.06 0.07
0.15 0.15 0.16 0.43 -0.1 -0.01 -0.13 0.13 -0.28 -0.36 -0.18 -0.15 0.19 0.02 0.24 0.25 0.26 -0.08 -0.28 -0.53 -0.11 -0.09 0.46 -0.23 -0.26 -0.15 0.01 0.0 -0.06 -0.0
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0.02 -0.02 -0.03 0.13 -0.06 -0.19 -0.2 -0.0 -0.15 -0.15 -0.1 -0.2 0.2 0.32 0.11 0.09 0.06 0.11 -0.23 -0.27 -0.13 -0.14 0.56 -0.07 -0.15 -0.1 0.05 0.05 -0.04 0.19
-0.26 0.17 -0.0 0.44 -0.32 -0.07 -0.44 0.23 -0.65 -0.67 -0.6 -0.27 0.07 0.3 0.52 0.1 0.08 0.62 -0.66 -0.64 -0.64 -0.62 1.64 -0.22 -0.48 -0.27 -0.26 -0.44 -0.23 0.47
0.15 0.05 0.07 0.26 0.11 -0.05 -0.12 0.14 -0.11 -0.04 -0.14 -0.12 0.09 0.44 0.13 -0.01 -0.02 0.17 -0.3 -0.27 -0.28 -0.17 0.51 -0.25 -0.26 -0.14 -0.1 -0.03 -0.05 -0.06
0.05 0.15 0.23 0.43 -0.15 -0.17 -0.3 0.38 -0.2 -0.14 -0.16 -0.28 -0.09 0.31 0.19 0.08 0.15 -0.12 -0.35 -0.35 -0.05 -0.32 0.78 -0.18 -0.25 -0.16 -0.08 -0.04 -0.09 0.02
0.04 0.08 0.01 0.09 -0.09 -0.2 -0.24 -0.07 -0.21 -0.16 -0.2 -0.19 0.2 0.5 0.3 0.12 0.15 0.13 -0.28 -0.29 -0.15 -0.17 0.63 -0.12 -0.19 -0.13 -0.13 -0.04 -0.02 0.12
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.