1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_154 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
11.97 12.2 11.43 12.45 9.83 9.26 8.97 10.01 10.93 11.51 10.22 9.9 12.22 14.58 11.52 11.3 11.37 13.51 9.99 9.41 10.73 10.53 17.63 11.6 10.39 10.67 11.1 12.03 11.13 11.69
4.44 4.84 4.22 4.53 4.19 4.41 3.97 5.1 3.63 3.67 3.92 3.82 4.83 5.42 4.67 4.66 4.82 4.13 3.24 3.45 3.75 3.95 5.73 3.72 3.69 3.68 4.05 4.33 4.25 4.52
2.82 2.83 2.39 2.44 2.37 2.23 2.32 2.45 2.05 2.27 2.04 2.28 2.47 4.01 2.91 2.78 2.9 2.44 2.07 1.83 2.19 2.17 4.03 2.41 2.21 2.27 2.42 2.5 2.48 2.4
1.97 2.03 2.06 2.67 1.77 1.87 1.46 2.03 1.79 1.64 1.63 1.64 2.22 2.42 2.49 2.18 2.51 2.2 1.66 1.4 1.74 2.13 2.93 1.52 2.0 1.78 2.1 1.91 1.79 2.2
1.17 1.21 1.02 2.02 0.74 1.06 0.54 1.62 0.66 0.74 0.8 0.69 1.23 0.92 1.32 1.4 1.35 0.59 0.57 0.62 0.72 0.79 1.64 0.69 0.86 0.78 0.84 1.14 1.1 1.5
15.02 15.58 13.65 17.65 15.53 12.79 12.41 17.36 12.29 12.32 13.15 11.13 15.25 21.09 15.9 16.69 15.5 14.65 12.25 12.07 12.12 13.24 22.12 13.02 14.08 13.13 14.78 15.25 14.28 14.41
11.15 11.52 10.37 11.61 10.07 10.27 9.53 11.52 10.1 10.05 9.72 9.69 11.98 15.75 11.73 11.78 11.47 11.31 9.21 8.52 9.45 9.69 14.58 10.52 10.23 10.61 10.99 11.36 11.33 11.47
7.26 8.08 7.63 8.49 7.87 6.81 6.09 9.6 7.44 7.06 6.48 6.42 7.88 7.98 8.43 7.25 7.56 8.02 5.97 6.03 7.5 6.18 11.24 6.06 6.82 7.14 7.85 7.36 7.33 8.41
3.25 3.83 3.37 3.21 3.4 3.08 3.2 3.37 2.88 2.86 2.9 2.59 2.78 3.95 3.53 3.45 3.49 3.2 2.69 2.41 2.97 2.92 5.14 2.85 2.5 3.09 2.97 2.85 2.9 3.27
8.63 9.67 9.13 12.91 9.02 8.63 6.67 10.25 7.43 7.57 6.99 7.86 9.37 10.09 9.64 10.23 9.83 8.55 7.06 7.09 7.93 7.85 12.36 7.57 7.81 7.86 7.94 8.97 8.69 9.75
4.49 5.07 4.65 5.93 4.15 4.06 4.16 5.05 3.87 4.06 4.19 4.1 4.88 5.29 5.26 4.55 4.65 4.61 3.46 3.36 4.07 4.17 5.62 4.0 3.79 4.07 4.28 4.29 4.36 4.91
2.37 2.29 1.98 2.06 2.32 1.89 1.79 2.19 1.72 1.67 1.63 1.76 2.18 2.48 1.86 2.19 2.08 2.1 1.38 1.48 1.81 1.78 2.96 1.69 1.6 1.83 2.02 2.13 2.18 2.19
8.88 8.82 9.09 9.66 8.58 7.74 7.67 9.83 7.75 8.03 7.49 7.73 9.22 9.93 9.2 8.29 8.38 7.64 7.25 7.08 7.88 7.68 10.8 7.61 7.82 8.17 8.39 9.03 8.32 8.91
20.25 23.91 24.45 41.69 20.08 19.5 11.69 28.46 14.53 15.11 15.52 14.67 20.24 24.66 25.48 27.33 29.21 21.23 12.69 13.16 18.19 15.55 33.83 14.66 14.45 16.76 16.62 18.86 18.1 25.42
14.03 14.51 12.88 14.58 12.05 13.12 12.15 13.83 11.47 12.65 11.82 12.12 15.49 18.65 15.71 14.5 14.24 11.63 9.85 9.97 11.94 12.05 19.83 12.86 12.22 11.97 12.81 14.22 13.77 13.29
4.09 3.73 3.12 3.56 3.05 2.6 3.12 4.33 2.62 3.13 3.18 2.81 5.08 3.45 3.85 3.59 3.94 2.62 2.96 2.99 3.06 2.99 6.79 3.31 3.21 3.39 3.72 3.49 3.39 3.46
6.19 6.71 5.62 6.41 6.74 6.29 5.35 5.6 4.78 5.25 5.12 5.11 5.74 8.87 7.44 7.02 6.75 6.16 4.62 4.35 5.44 5.32 7.1 5.17 4.91 5.25 5.45 6.25 5.87 5.43
8.39 8.06 7.1 6.78 6.88 8.51 8.52 9.39 8.05 7.78 7.42 7.62 7.9 11.21 7.41 7.89 7.91 6.46 5.83 7.05 7.53 7.53 13.75 7.49 7.06 6.87 7.33 8.32 7.64 7.17
10.41 10.92 10.46 12.34 9.62 8.74 9.73 11.92 9.32 9.61 9.37 9.29 11.85 12.52 11.44 11.61 11.73 11.16 8.67 8.59 9.83 10.13 13.2 9.66 10.1 9.93 10.9 11.46 10.63 10.53
10.69 10.12 9.47 10.34 10.23 8.52 8.55 11.27 8.11 8.01 8.26 8.61 10.21 11.15 10.38 9.47 10.05 7.86 7.54 7.6 7.92 8.28 14.5 8.57 8.49 8.35 8.81 9.41 9.4 10.64
3.25 3.66 3.5 4.96 3.07 3.06 2.28 4.19 2.95 3.23 2.64 2.92 3.49 3.14 3.76 3.75 3.46 2.66 2.29 2.49 3.15 2.62 4.74 2.32 2.68 3.03 3.39 3.0 3.05 3.56
6.13 6.72 4.33 4.97 6.46 5.2 5.55 5.91 4.15 5.06 4.71 4.69 6.82 10.0 6.98 5.22 5.64 5.87 4.27 4.11 4.59 4.7 7.16 4.86 4.94 4.98 5.53 5.24 5.17 5.45
13.32 12.31 13.55 14.84 14.12 10.82 10.84 14.56 12.1 11.61 12.51 11.69 12.8 12.28 14.01 13.05 13.44 14.8 10.93 10.64 12.64 12.06 17.73 10.16 11.52 11.37 12.39 12.07 12.1 13.29
4.39 4.39 4.43 5.34 3.7 3.95 3.63 4.34 3.25 3.08 3.5 3.58 4.52 4.03 4.67 4.72 4.76 3.76 3.26 2.75 3.68 3.72 5.46 3.39 3.3 3.58 3.98 3.97 3.79 3.95
5.82 6.33 5.74 7.32 5.55 5.28 4.88 7.3 5.05 5.22 5.2 5.08 6.82 6.93 6.23 6.63 5.99 5.97 4.56 4.54 4.93 5.42 8.55 5.15 5.27 5.25 5.62 5.99 5.48 5.07
13.9 12.64 10.09 9.88 13.46 12.54 11.95 10.53 9.61 10.94 9.82 10.58 13.86 17.09 15.23 12.78 12.94 11.18 9.06 9.68 10.2 10.22 14.46 11.01 9.96 10.07 9.97 11.79 11.46 11.7
0.52 0.43 0.67 1.04 0.62 0.41 0.27 0.6 0.34 0.41 0.45 0.37 0.62 0.49 0.66 0.49 0.55 0.71 0.3 0.45 0.53 0.55 1.31 0.4 0.58 0.5 0.57 0.52 0.55 0.6
3.37 3.71 3.43 3.89 3.56 3.16 2.58 3.79 2.6 2.43 2.5 2.82 3.48 4.43 3.3 3.45 3.17 2.39 2.38 2.89 2.77 3.15 5.66 2.93 2.76 2.75 2.57 3.37 3.45 2.58
7.08 7.6 7.38 8.15 7.93 6.72 5.55 6.59 6.02 6.45 5.64 5.44 6.32 10.76 8.87 7.11 7.58 7.29 5.31 5.65 6.33 6.41 12.55 6.71 5.61 6.14 7.05 6.17 6.66 6.1
4.16 4.6 4.18 4.23 3.87 3.9 3.89 4.3 3.48 3.74 3.62 3.57 4.36 4.77 4.65 4.15 4.29 3.46 2.95 3.12 3.49 3.63 6.01 3.75 3.5 3.48 3.68 4.07 4.26 4.39
15.13 17.07 17.42 25.35 16.79 16.51 12.71 26.73 11.93 11.49 14.11 13.97 18.48 18.66 19.2 21.13 22.31 19.32 12.67 12.57 16.31 15.36 27.43 15.16 14.36 14.84 17.77 15.63 15.54 18.4
9.41 10.31 9.21 10.86 10.38 9.87 7.48 9.94 7.32 7.5 8.03 9.62 11.21 11.05 13.24 13.63 13.89 13.38 8.13 7.36 8.57 8.07 22.6 7.56 7.94 9.23 8.05 8.04 9.2 12.04
10.34 9.9 9.94 12.23 10.13 10.09 10.07 12.92 8.57 8.52 10.29 9.14 12.79 12.47 12.51 12.28 11.68 11.54 8.81 9.09 10.35 10.03 18.18 9.94 10.24 9.26 11.2 8.53 9.64 10.78
6.94 7.6 8.09 10.42 7.55 6.8 4.17 9.54 6.24 6.39 5.81 5.9 5.78 6.84 7.38 8.24 8.43 7.46 5.18 4.94 7.22 6.19 10.48 5.63 6.61 7.56 7.74 7.62 7.84 8.47
21.41 21.16 20.74 21.5 21.11 18.62 19.15 23.95 18.21 19.43 18.67 18.21 20.17 26.5 22.69 21.63 21.57 17.77 17.82 18.37 18.32 19.8 31.38 18.63 20.33 19.03 20.67 22.95 21.07 19.05
3.54 4.23 4.41 7.17 3.5 3.78 2.22 5.07 2.33 2.73 2.91 2.82 3.71 3.69 4.38 4.55 5.06 3.25 2.15 2.13 2.98 2.85 6.71 2.87 3.03 3.22 3.56 3.89 4.22 4.84
12.26 13.37 11.35 14.02 11.65 10.34 10.0 10.68 10.21 10.8 10.05 10.21 12.26 16.46 12.42 12.46 12.45 13.61 9.78 10.74 11.6 10.01 18.55 11.57 10.68 10.78 10.97 11.79 10.34 9.96
31.59 32.62 28.42 30.34 31.71 23.26 23.84 26.33 23.89 27.53 26.29 26.2 27.3 36.67 29.65 28.88 31.54 30.78 25.28 24.27 26.86 28.59 36.98 28.96 27.36 25.8 28.67 31.29 30.31 29.63
10.04 9.24 11.64 16.44 9.25 12.6 9.69 16.32 8.43 8.37 9.63 10.8 14.81 11.17 15.88 16.13 16.29 12.18 9.5 9.58 10.96 10.38 24.82 8.86 10.26 10.61 11.57 9.61 10.08 15.39
23.93 22.9 21.09 23.14 22.5 22.55 23.06 23.55 19.32 20.21 19.61 20.15 24.72 29.14 28.45 25.03 25.14 21.03 16.76 17.34 18.75 19.87 28.39 19.48 20.56 18.91 20.82 24.12 21.52 22.34
8.7 9.32 7.83 8.1 8.66 7.09 7.35 7.63 7.51 8.11 7.29 7.55 7.59 10.82 9.82 9.04 8.92 8.35 7.17 7.08 7.52 8.28 11.77 8.1 7.88 7.59 8.53 8.32 7.96 7.82
9.27 8.89 8.17 10.11 8.09 6.46 6.31 8.91 7.32 7.67 7.21 7.13 8.97 13.02 8.66 7.78 8.15 8.26 6.7 6.62 7.05 7.18 13.79 7.57 7.52 7.11 7.81 8.67 9.05 7.7
20.13 21.12 21.54 25.83 19.66 20.11 17.59 24.39 16.67 17.89 18.55 18.02 21.62 22.5 23.1 23.24 23.56 21.54 16.75 16.1 22.01 19.15 31.77 17.06 18.85 19.36 21.43 19.84 19.95 24.17
11.04 11.12 9.95 11.18 10.84 8.94 9.01 11.13 9.68 8.7 10.08 9.65 11.05 13.2 11.01 10.93 11.37 13.26 8.72 9.17 9.67 9.3 17.32 8.81 9.28 9.12 10.76 8.5 10.25 11.75
16.49 18.0 16.74 20.25 13.42 10.57 10.12 18.14 14.08 12.93 13.44 13.59 16.84 18.27 14.57 14.12 15.95 16.95 12.52 12.31 14.56 13.61 23.52 10.33 13.51 12.7 14.81 13.37 12.47 15.16
18.02 18.63 17.2 23.11 16.79 14.99 12.71 23.14 13.98 14.92 13.98 14.83 18.12 17.29 17.39 20.32 19.28 14.72 13.64 13.61 16.8 14.61 20.04 14.56 16.18 15.5 17.26 17.2 17.67 17.77
7.75 8.63 8.13 10.05 7.25 6.25 6.58 8.42 6.49 7.22 7.53 7.6 9.84 9.09 9.57 9.16 9.68 9.43 7.11 6.29 7.51 7.62 11.42 7.32 7.54 7.92 8.18 7.89 7.59 9.48
16.81 16.91 15.16 16.02 16.94 16.24 16.77 18.29 14.87 15.2 15.24 16.02 19.83 20.27 19.53 17.3 17.43 13.09 13.23 12.6 14.58 15.37 25.01 16.99 16.56 15.58 16.27 17.67 16.07 14.8
7.42 7.5 7.2 7.43 7.67 7.33 7.51 7.48 6.65 6.31 6.56 6.87 7.79 10.63 8.42 7.46 8.3 6.87 6.78 6.0 6.82 6.32 10.53 7.08 7.24 7.0 6.82 7.68 7.37 6.71
18.84 20.04 22.8 39.06 23.96 15.98 9.95 23.28 13.05 16.23 19.52 16.0 18.23 15.51 18.37 18.4 22.64 25.68 12.46 13.28 22.1 16.44 29.92 16.62 18.75 19.32 22.31 23.94 22.67 22.28
6.1 5.96 5.91 6.62 5.79 5.28 5.24 6.02 5.43 5.45 5.62 5.23 6.93 7.53 6.49 6.41 6.3 6.51 5.13 5.01 5.5 5.48 8.89 5.72 5.45 5.63 6.26 6.23 5.87 6.86
0.64 0.87 0.77 1.04 0.62 0.73 0.57 0.9 0.49 0.48 0.51 0.64 0.81 0.95 1.11 0.83 0.81 1.19 0.49 0.5 0.5 0.5 2.4 0.66 0.55 0.64 0.64 0.57 0.66 1.07
15.47 14.44 14.6 16.66 14.99 13.46 12.84 15.4 12.88 13.57 12.64 12.8 14.88 18.95 15.2 13.83 13.76 15.7 11.36 11.54 11.49 12.35 19.83 11.74 11.61 12.66 12.99 13.69 13.49 13.38
15.52 16.58 17.51 20.2 13.5 13.26 12.17 19.43 13.03 13.62 13.39 12.32 14.08 18.5 17.08 15.83 16.59 13.76 11.78 11.74 14.45 12.01 25.68 13.18 12.55 13.36 14.15 14.52 14.03 15.18
19.73 20.37 19.38 20.48 18.06 16.74 16.28 18.29 16.69 17.24 16.73 16.9 22.17 27.22 23.65 20.86 21.31 21.11 15.86 15.7 17.33 17.17 29.84 17.72 16.89 17.6 17.65 18.7 18.97 20.95
4.95 5.35 5.41 7.27 5.14 4.68 3.18 6.19 3.83 4.26 4.55 4.18 4.63 4.33 5.57 5.19 5.85 4.87 3.13 3.66 4.62 4.17 5.85 4.06 4.16 4.46 4.85 5.27 5.53 5.45

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)