1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_37 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000034 (ARRS1)
 0.26 0.36 0.35 0.26 0.39 0.43 0.45 0.57 0.17 0.17 0.11 0.17 0.44 0.42 0.53 0.49 0.37 0.5 0.28 0.35 0.28 0.27 1.0 0.17 0.18 0.21 0.21 0.16 0.16 0.2 0.36
0.18 0.22 0.19 0.19 0.36 0.4 0.38 0.57 0.2 0.2 0.23 0.21 0.48 0.55 0.68 0.44 0.29 0.64 0.37 0.34 0.39 0.32 1.0 0.3 0.33 0.26 0.25 0.23 0.19 0.14 0.23
0.22 0.35 0.27 0.44 0.45 0.42 0.49 1.0 0.12 0.21 0.23 0.21 0.54 0.32 0.67 0.57 0.56 0.48 0.19 0.26 0.33 0.35 0.99 0.24 0.21 0.25 0.21 0.2 0.09 0.16 0.32
Bra002683 (UBP23)
 0.24 0.22 0.21 0.19 0.35 0.43 0.34 0.41 0.21 0.23 0.25 0.19 0.39 0.51 0.64 0.44 0.4 0.41 0.31 0.31 0.31 0.31 1.0 0.25 0.27 0.2 0.28 0.22 0.25 0.24 0.39
Bra002778 (NFA3)
 0.29 0.37 0.46 0.39 0.35 0.38 0.56 0.93 0.22 0.3 0.3 0.25 0.68 0.49 0.54 0.51 0.59 0.6 0.31 0.41 0.44 0.4 1.0 0.34 0.36 0.37 0.36 0.28 0.22 0.22 0.42
Bra003455 (RTN6)
 0.31 0.41 0.32 0.32 0.52 0.55 0.56 0.9 0.23 0.39 0.31 0.26 0.85 0.55 0.62 0.7 0.59 0.67 0.4 0.39 0.41 0.42 1.0 0.38 0.35 0.32 0.33 0.33 0.26 0.22 0.3
Bra003809 (PUR4)
 0.28 0.31 0.25 0.37 0.26 0.51 0.46 0.85 0.16 0.25 0.2 0.19 0.54 0.62 0.67 0.56 0.63 0.41 0.27 0.36 0.4 0.33 1.0 0.36 0.42 0.41 0.44 0.36 0.26 0.23 0.53
0.22 0.29 0.18 0.25 0.43 0.52 0.36 0.55 0.14 0.22 0.21 0.15 0.45 0.51 0.76 0.39 0.44 0.49 0.23 0.33 0.34 0.27 1.0 0.24 0.23 0.22 0.21 0.17 0.14 0.16 0.37
0.1 0.12 0.11 0.19 0.21 0.35 0.37 0.77 0.1 0.13 0.11 0.08 0.48 0.51 0.66 0.38 0.29 0.49 0.23 0.21 0.19 0.18 1.0 0.1 0.09 0.1 0.1 0.1 0.06 0.09 0.19
Bra006053 (ASN3)
 0.27 0.32 0.29 0.34 0.36 0.31 0.34 0.62 0.25 0.27 0.24 0.22 0.63 0.51 0.61 0.45 0.45 0.41 0.23 0.25 0.29 0.28 1.0 0.29 0.29 0.3 0.29 0.35 0.25 0.2 0.4
Bra007052 (FIP37)
 0.26 0.35 0.23 0.21 0.4 0.37 0.44 0.72 0.24 0.35 0.37 0.29 0.62 0.39 0.69 0.63 0.6 0.59 0.43 0.44 0.39 0.42 1.0 0.42 0.35 0.28 0.37 0.32 0.27 0.29 0.45
Bra007126 (PUR5)
 0.43 0.57 0.46 0.49 0.41 0.42 0.49 0.7 0.25 0.32 0.28 0.3 0.79 0.42 0.62 0.7 0.63 0.57 0.37 0.39 0.54 0.44 1.0 0.43 0.43 0.4 0.47 0.37 0.19 0.26 0.54
Bra007217 (TRM5a)
 0.48 0.49 0.41 0.46 0.72 0.64 0.5 0.71 0.43 0.41 0.42 0.37 0.79 0.78 0.85 0.59 0.58 0.62 0.41 0.44 0.44 0.43 1.0 0.44 0.45 0.4 0.4 0.42 0.41 0.43 0.46
0.15 0.17 0.16 0.1 0.33 0.38 0.28 0.48 0.19 0.21 0.18 0.17 0.44 0.42 0.63 0.42 0.35 0.38 0.31 0.27 0.31 0.24 1.0 0.22 0.22 0.25 0.25 0.18 0.18 0.19 0.32
0.12 0.25 0.19 0.15 0.26 0.28 0.28 0.59 0.15 0.15 0.14 0.13 0.58 0.44 0.51 0.35 0.34 0.32 0.21 0.25 0.23 0.17 1.0 0.15 0.18 0.16 0.19 0.16 0.13 0.11 0.33
Bra007399 (RH11)
 0.32 0.39 0.32 0.33 0.44 0.5 0.58 0.85 0.27 0.36 0.3 0.31 0.67 0.51 0.56 0.66 0.56 0.49 0.43 0.51 0.43 0.41 1.0 0.37 0.4 0.33 0.39 0.38 0.33 0.34 0.49
0.06 0.05 0.06 0.09 0.32 0.55 0.31 1.0 0.07 0.09 0.13 0.09 0.54 0.54 0.86 0.46 0.46 0.54 0.18 0.23 0.14 0.21 0.91 0.21 0.22 0.2 0.22 0.19 0.12 0.14 0.33
Bra007540 (G3)
 0.17 0.15 0.15 0.18 0.14 0.3 0.26 0.56 0.14 0.12 0.16 0.11 0.58 0.55 0.69 0.33 0.34 0.52 0.21 0.2 0.2 0.2 1.0 0.12 0.17 0.15 0.11 0.14 0.15 0.16 0.29
Bra009356 (STRS2)
 0.15 0.28 0.21 0.39 0.13 0.21 0.26 0.57 0.04 0.1 0.05 0.04 0.47 0.28 0.45 0.31 0.27 0.33 0.09 0.13 0.14 0.16 1.0 0.08 0.1 0.13 0.12 0.11 0.04 0.05 0.18
Bra010568 (RPPR7)
 0.24 0.34 0.23 0.3 0.25 0.23 0.31 0.73 0.12 0.21 0.15 0.2 0.59 0.36 0.47 0.5 0.4 0.59 0.27 0.25 0.34 0.31 1.0 0.18 0.2 0.18 0.18 0.13 0.08 0.12 0.36
Bra010944 (GRP2)
 0.34 0.36 0.38 0.35 0.53 0.4 0.56 0.94 0.24 0.26 0.27 0.24 0.87 0.56 0.5 0.47 0.45 0.63 0.3 0.32 0.38 0.36 1.0 0.42 0.45 0.42 0.44 0.33 0.33 0.38 0.54
0.26 0.29 0.19 0.24 0.27 0.37 0.44 0.79 0.13 0.16 0.18 0.16 0.55 0.42 0.58 0.44 0.49 0.5 0.22 0.22 0.3 0.23 1.0 0.21 0.19 0.23 0.27 0.23 0.14 0.19 0.4
0.3 0.32 0.38 0.29 0.48 0.51 0.44 0.58 0.29 0.33 0.3 0.32 0.66 0.66 0.73 0.54 0.52 0.7 0.32 0.4 0.36 0.34 1.0 0.36 0.42 0.29 0.42 0.36 0.31 0.31 0.4
0.27 0.29 0.23 0.2 0.42 0.37 0.3 0.61 0.22 0.19 0.18 0.2 0.5 0.45 0.55 0.36 0.39 0.49 0.24 0.23 0.25 0.25 1.0 0.17 0.15 0.1 0.16 0.15 0.12 0.13 0.21
0.14 0.18 0.11 0.16 0.23 0.28 0.28 0.62 0.11 0.12 0.13 0.13 0.41 0.42 0.69 0.34 0.38 0.4 0.18 0.17 0.2 0.18 1.0 0.14 0.12 0.16 0.17 0.12 0.11 0.13 0.37
0.14 0.24 0.16 0.13 0.19 0.27 0.2 0.34 0.16 0.16 0.15 0.14 0.29 0.39 0.59 0.38 0.35 0.35 0.28 0.24 0.26 0.23 1.0 0.23 0.23 0.16 0.28 0.18 0.17 0.2 0.34
0.11 0.23 0.11 0.06 0.21 0.23 0.2 0.47 0.04 0.05 0.06 0.07 0.39 0.21 0.61 0.22 0.26 0.44 0.24 0.12 0.18 0.07 1.0 0.03 0.07 0.05 0.07 0.07 0.04 0.05 0.2
0.11 0.23 0.11 0.06 0.21 0.23 0.2 0.47 0.04 0.05 0.06 0.07 0.39 0.21 0.61 0.22 0.26 0.44 0.24 0.12 0.18 0.07 1.0 0.03 0.07 0.05 0.07 0.07 0.04 0.05 0.2
0.28 0.28 0.28 0.25 0.47 0.46 0.37 0.49 0.21 0.27 0.29 0.23 0.5 0.57 0.67 0.45 0.42 0.47 0.38 0.37 0.34 0.29 1.0 0.32 0.29 0.29 0.26 0.26 0.2 0.24 0.42
0.35 0.38 0.27 0.33 0.41 0.42 0.48 0.66 0.24 0.27 0.24 0.25 0.74 0.44 0.51 0.47 0.49 0.57 0.27 0.33 0.32 0.35 1.0 0.28 0.32 0.33 0.29 0.28 0.27 0.3 0.41
0.27 0.35 0.38 0.32 0.46 0.4 0.35 0.65 0.27 0.27 0.29 0.28 0.5 0.66 0.71 0.48 0.43 0.6 0.3 0.35 0.31 0.32 1.0 0.34 0.37 0.2 0.28 0.28 0.3 0.25 0.39
Bra018764 (NUC1)
 0.25 0.31 0.31 0.24 0.27 0.27 0.27 0.99 0.16 0.18 0.15 0.12 0.57 0.28 0.57 0.31 0.25 0.45 0.19 0.19 0.2 0.16 1.0 0.16 0.17 0.16 0.1 0.24 0.15 0.19 0.23
Bra019039 (IMB4)
 0.38 0.3 0.24 0.38 0.54 0.56 0.42 0.8 0.3 0.34 0.32 0.3 0.59 0.56 0.83 0.57 0.58 0.49 0.38 0.44 0.34 0.39 1.0 0.35 0.39 0.44 0.39 0.43 0.32 0.37 0.56
Bra020336 (NRPB7)
 0.24 0.27 0.21 0.24 0.53 0.52 0.45 0.79 0.28 0.37 0.29 0.22 0.65 0.49 0.61 0.48 0.51 0.57 0.33 0.38 0.35 0.43 1.0 0.4 0.39 0.3 0.37 0.3 0.35 0.28 0.46
Bra020544 (NSUN5)
 0.19 0.29 0.27 0.19 0.24 0.27 0.23 0.72 0.1 0.1 0.11 0.1 0.48 0.31 0.51 0.29 0.3 0.4 0.12 0.15 0.22 0.21 1.0 0.12 0.1 0.14 0.14 0.11 0.07 0.09 0.21
Bra021111 (atBRX1-1)
 0.04 0.13 0.08 0.2 0.05 0.16 0.39 0.83 0.07 0.03 0.11 0.06 0.59 0.42 0.51 0.41 0.43 0.47 0.09 0.08 0.16 0.05 1.0 0.06 0.04 0.03 0.03 0.05 0.01 0.03 0.17
Bra021720 (EMA1)
 0.24 0.34 0.25 0.18 0.43 0.49 0.42 0.55 0.25 0.27 0.24 0.22 0.41 0.56 0.63 0.49 0.47 0.36 0.28 0.28 0.26 0.3 1.0 0.25 0.27 0.28 0.31 0.22 0.24 0.26 0.38
0.25 0.33 0.37 0.4 0.22 0.29 0.25 0.49 0.09 0.11 0.1 0.08 0.43 0.35 0.43 0.3 0.29 0.37 0.14 0.16 0.2 0.16 1.0 0.16 0.17 0.26 0.16 0.17 0.1 0.12 0.21
Bra023109 (RPPR5)
 0.22 0.35 0.24 0.26 0.43 0.41 0.58 0.97 0.2 0.27 0.22 0.21 0.65 0.5 0.68 0.57 0.58 0.75 0.42 0.4 0.4 0.35 1.0 0.29 0.28 0.19 0.32 0.24 0.17 0.19 0.44
0.14 0.3 0.17 0.2 0.37 0.43 0.47 0.85 0.23 0.25 0.2 0.22 0.72 0.42 0.59 0.55 0.47 0.41 0.24 0.35 0.27 0.33 1.0 0.36 0.39 0.25 0.43 0.29 0.23 0.25 0.47
Bra023227 (RH5)
 0.19 0.25 0.27 0.25 0.27 0.44 0.35 0.6 0.15 0.15 0.16 0.13 0.57 0.68 0.85 0.47 0.44 0.78 0.21 0.23 0.25 0.25 1.0 0.19 0.24 0.24 0.24 0.23 0.16 0.18 0.39
0.25 0.24 0.16 0.19 0.32 0.35 0.29 0.53 0.11 0.13 0.14 0.1 0.34 0.44 0.62 0.37 0.34 0.42 0.19 0.21 0.2 0.16 1.0 0.16 0.19 0.2 0.22 0.15 0.14 0.17 0.5
Bra025105 (MORF4)
 0.17 0.2 0.27 0.14 0.18 0.24 0.24 0.44 0.12 0.13 0.15 0.17 0.37 0.34 0.51 0.27 0.29 0.41 0.17 0.21 0.18 0.18 1.0 0.17 0.12 0.1 0.13 0.1 0.07 0.14 0.33
Bra025360 (THADA)
 0.21 0.3 0.19 0.19 0.3 0.39 0.36 0.66 0.12 0.17 0.15 0.13 0.52 0.4 0.56 0.39 0.42 0.4 0.21 0.21 0.21 0.23 1.0 0.19 0.24 0.17 0.24 0.18 0.15 0.2 0.39
Bra025513 (NOB1)
 0.33 0.36 0.24 0.26 0.26 0.33 0.34 0.55 0.14 0.2 0.15 0.17 0.59 0.4 0.49 0.37 0.34 0.39 0.22 0.18 0.23 0.19 1.0 0.19 0.18 0.19 0.2 0.18 0.15 0.19 0.32
0.22 0.23 0.18 0.2 0.45 0.5 0.39 0.8 0.23 0.25 0.25 0.24 0.69 0.73 0.8 0.43 0.48 0.54 0.31 0.37 0.32 0.39 1.0 0.21 0.23 0.17 0.19 0.22 0.19 0.16 0.24
0.19 0.44 0.17 0.2 0.24 0.31 0.3 0.64 0.08 0.19 0.14 0.16 0.53 0.29 0.4 0.34 0.36 0.39 0.2 0.26 0.2 0.17 1.0 0.19 0.12 0.2 0.15 0.13 0.11 0.14 0.25
Bra026329 (IMB4)
 0.27 0.26 0.22 0.3 0.3 0.34 0.36 0.82 0.12 0.14 0.19 0.17 0.48 0.49 0.61 0.47 0.37 0.48 0.25 0.26 0.24 0.29 1.0 0.16 0.17 0.18 0.18 0.15 0.14 0.17 0.37
0.3 0.37 0.28 0.26 0.3 0.34 0.35 0.52 0.18 0.18 0.16 0.12 0.55 0.39 0.57 0.37 0.4 0.4 0.23 0.23 0.25 0.19 1.0 0.19 0.16 0.19 0.2 0.16 0.13 0.15 0.31
Bra027728 (ABCF3)
 0.43 0.5 0.4 0.45 0.41 0.44 0.48 0.63 0.29 0.37 0.33 0.31 0.64 0.51 0.6 0.56 0.51 0.51 0.35 0.36 0.39 0.35 1.0 0.35 0.37 0.38 0.37 0.4 0.3 0.32 0.46
0.26 0.28 0.17 0.24 0.43 0.43 0.35 0.75 0.15 0.16 0.22 0.19 0.46 0.45 0.56 0.4 0.44 0.44 0.27 0.34 0.34 0.24 1.0 0.21 0.19 0.23 0.24 0.21 0.19 0.16 0.43
Bra028461 (RPL24C)
 0.12 0.13 0.16 0.09 0.16 0.29 0.26 0.54 0.1 0.12 0.13 0.13 0.49 0.33 0.48 0.32 0.34 0.35 0.18 0.16 0.19 0.19 1.0 0.15 0.15 0.16 0.18 0.1 0.1 0.16 0.32
Bra028490 (NOB1)
 0.23 0.19 0.15 0.12 0.2 0.27 0.32 0.49 0.09 0.12 0.13 0.16 0.45 0.31 0.43 0.27 0.34 0.4 0.2 0.16 0.2 0.19 1.0 0.21 0.15 0.18 0.16 0.1 0.12 0.18 0.36
0.34 0.53 0.32 0.35 0.28 0.35 0.41 0.61 0.19 0.27 0.22 0.24 0.7 0.42 0.55 0.43 0.47 0.48 0.27 0.25 0.3 0.26 1.0 0.24 0.23 0.28 0.28 0.2 0.17 0.2 0.42
0.27 0.35 0.51 0.4 0.45 0.45 0.42 0.84 0.22 0.3 0.18 0.22 0.59 0.55 0.67 0.42 0.41 0.52 0.3 0.33 0.34 0.28 1.0 0.32 0.39 0.33 0.34 0.26 0.25 0.25 0.45
Bra029275 (AtRH7)
 0.28 0.28 0.24 0.24 0.27 0.28 0.41 0.76 0.15 0.16 0.16 0.14 0.64 0.4 0.55 0.41 0.41 0.51 0.21 0.24 0.25 0.21 1.0 0.16 0.18 0.2 0.19 0.17 0.12 0.16 0.3
Bra029944 (NUWA)
 0.23 0.26 0.18 0.17 0.43 0.44 0.4 0.58 0.18 0.22 0.21 0.18 0.47 0.45 0.65 0.47 0.45 0.44 0.3 0.3 0.32 0.26 1.0 0.32 0.28 0.22 0.32 0.24 0.22 0.22 0.4
0.22 0.26 0.17 0.12 0.39 0.41 0.29 0.42 0.17 0.19 0.19 0.2 0.44 0.47 0.6 0.38 0.4 0.36 0.27 0.25 0.27 0.24 1.0 0.28 0.28 0.16 0.26 0.23 0.2 0.24 0.33
Bra031026 (MEE67)
 0.27 0.4 0.33 0.24 0.37 0.38 0.42 0.71 0.18 0.27 0.28 0.26 0.62 0.4 0.58 0.51 0.56 0.8 0.37 0.42 0.31 0.29 1.0 0.36 0.28 0.32 0.3 0.19 0.17 0.22 0.46
0.26 0.43 0.42 0.39 0.26 0.33 0.41 0.9 0.08 0.19 0.13 0.11 0.48 0.38 0.63 0.4 0.42 0.41 0.23 0.19 0.23 0.19 1.0 0.24 0.26 0.32 0.31 0.24 0.14 0.19 0.56
Bra034795 (RRP5)
 0.15 0.23 0.11 0.13 0.26 0.33 0.3 0.8 0.08 0.12 0.09 0.07 0.32 0.3 0.6 0.35 0.34 0.44 0.17 0.17 0.19 0.16 1.0 0.1 0.13 0.13 0.16 0.11 0.09 0.1 0.36
Bra035425 (MTR4)
 0.25 0.23 0.28 0.26 0.43 0.61 0.52 1.0 0.17 0.14 0.25 0.12 0.66 0.68 0.84 0.54 0.55 0.43 0.31 0.36 0.27 0.21 0.85 0.32 0.31 0.34 0.5 0.41 0.24 0.15 0.24
Bra035426 (MTR4)
 0.33 0.35 0.25 0.28 0.48 0.56 0.53 1.0 0.2 0.2 0.23 0.2 0.76 0.71 0.8 0.56 0.71 0.5 0.34 0.29 0.33 0.35 0.97 0.3 0.42 0.43 0.37 0.38 0.18 0.17 0.27
0.2 0.33 0.4 0.29 0.2 0.29 0.28 0.5 0.15 0.19 0.18 0.18 0.57 0.46 0.53 0.36 0.34 0.39 0.2 0.23 0.23 0.3 1.0 0.23 0.21 0.24 0.22 0.18 0.14 0.18 0.24
Bra036713 (ASHR2)
 0.33 0.52 0.51 0.39 0.35 0.35 0.39 0.82 0.18 0.24 0.22 0.21 0.69 0.49 0.69 0.51 0.52 0.64 0.26 0.31 0.3 0.34 1.0 0.27 0.28 0.28 0.38 0.2 0.14 0.21 0.56
Bra037538 (RBP47B)
 0.25 0.3 0.25 0.2 0.29 0.32 0.34 0.65 0.14 0.19 0.18 0.19 0.69 0.6 0.74 0.36 0.37 0.66 0.2 0.19 0.24 0.18 1.0 0.2 0.19 0.17 0.16 0.19 0.2 0.19 0.37
0.28 0.39 0.32 0.22 0.48 0.35 0.5 0.61 0.23 0.26 0.2 0.24 0.75 0.46 0.42 0.53 0.42 0.49 0.3 0.36 0.3 0.34 1.0 0.15 0.11 0.1 0.17 0.1 0.08 0.11 0.26
Bra040168 (TRM3)
 0.3 0.43 0.3 0.31 0.41 0.33 0.39 0.59 0.11 0.18 0.18 0.17 0.49 0.33 0.61 0.48 0.43 0.58 0.27 0.35 0.25 0.29 1.0 0.15 0.16 0.24 0.21 0.19 0.14 0.19 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)