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Heatmap: Cluster_84 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.04 -0.1 -0.09 -0.11 0.24 0.33 0.23 -0.07 0.02 -0.14 -0.05 0.1 -0.12 0.05 0.21 0.21 0.17 0.1 -0.13 -0.21 -0.13 -0.1 -0.15 0.01 0.04 -0.16 -0.16 -0.09 0.06 -0.12
0.23 0.03 -0.05 -0.21 0.21 0.03 -0.08 -0.19 -0.05 0.06 -0.05 0.07 -0.19 0.51 0.1 0.14 0.06 -0.07 -0.29 -0.28 -0.09 -0.1 -0.03 -0.26 -0.11 -0.06 -0.03 -0.09 0.09 0.36
-0.23 -0.18 -0.71 -0.6 0.2 0.68 0.75 -0.4 -0.24 -0.31 -0.1 -0.02 -0.09 -0.18 0.61 0.43 0.46 -1.25 -0.07 -0.99 -0.02 0.31 0.03 0.15 -0.12 -0.0 -0.08 0.16 -0.0 -0.08
0.4 0.65 -0.02 -0.19 0.18 0.17 -0.1 0.05 -0.18 -0.0 -0.21 -0.17 -0.24 0.35 -0.08 0.15 -0.08 0.32 -0.61 -0.79 -0.39 -0.27 0.11 -0.17 -0.21 -0.1 -0.02 0.24 0.28 0.05
0.07 0.15 0.03 0.05 0.23 0.13 -0.05 0.03 0.04 -0.05 -0.14 -0.05 -0.12 0.3 0.04 0.11 0.03 -0.08 -0.24 -0.33 -0.22 -0.18 -0.15 -0.05 -0.26 -0.0 -0.08 0.25 0.24 0.07
-0.17 -0.32 0.08 0.08 0.06 -0.14 -0.18 -1.04 0.18 0.23 0.29 0.07 -0.32 -1.49 0.16 0.41 0.51 -1.28 0.21 -0.05 0.24 0.14 -0.32 0.01 0.23 0.27 0.09 -0.1 -0.06 0.37
0.02 -0.09 -0.03 -0.19 0.29 0.1 -0.08 -0.3 -0.11 -0.09 0.09 -0.02 0.16 0.17 0.37 0.33 0.28 -0.56 -0.25 -0.32 -0.05 -0.05 0.1 -0.05 -0.23 -0.13 -0.18 0.06 0.18 0.13
0.21 0.25 -0.19 -0.48 0.4 0.52 0.43 0.06 -0.35 -0.27 -0.28 0.01 -0.2 0.4 0.23 0.13 0.02 -0.19 -0.35 -0.37 -0.22 -0.18 -0.13 0.07 -0.35 -0.13 -0.2 -0.03 0.26 0.16
-0.17 -0.27 -0.04 -0.21 0.28 0.17 0.1 0.01 0.02 -0.17 -0.16 -0.1 -0.27 0.08 0.51 0.32 0.34 -0.8 -0.24 -0.23 -0.16 -0.04 0.27 0.11 -0.05 0.03 -0.02 0.07 0.2 -0.23
Spov3_chr1.00358 (PFA-DSP3)
 -0.35 -0.34 -0.11 -0.25 0.09 0.19 0.33 0.18 0.04 -0.29 0.11 0.04 0.3 -0.05 0.29 0.27 0.33 -1.38 0.15 0.34 0.07 0.13 0.38 -0.27 -0.15 0.14 0.13 -0.15 -0.81 -0.7
-0.53 -0.36 -0.48 -1.03 0.37 0.67 0.38 -0.33 -0.05 0.08 0.09 -0.0 -0.34 0.5 0.33 0.19 0.14 -0.7 -0.38 -0.36 0.13 0.29 0.44 0.28 0.07 0.16 0.02 -0.2 -0.13 -0.89
0.16 0.28 -0.13 -0.19 0.2 0.14 -0.09 -0.25 0.08 0.04 -0.25 0.03 -0.21 0.5 0.12 0.26 -0.03 0.03 -0.32 -0.59 -0.14 -0.28 -0.17 -0.11 -0.34 0.15 0.04 0.12 0.09 0.3
-0.06 -0.2 -0.45 -0.43 -0.06 0.18 0.34 -0.03 0.14 -0.08 0.17 0.24 -0.09 -0.9 0.32 0.21 0.29 -0.53 -0.31 -0.07 0.1 -0.1 -0.14 0.11 0.17 0.19 0.12 0.03 0.12 -0.02
0.01 -0.05 -0.04 -0.22 -0.0 0.14 0.16 -0.25 0.13 0.01 0.03 0.13 -0.13 -0.01 0.16 0.04 0.04 -0.54 -0.03 0.0 -0.03 0.06 0.38 0.04 -0.0 0.03 -0.05 -0.08 -0.07 -0.08
0.16 0.4 -0.11 -0.19 0.13 0.24 0.07 0.02 0.02 -0.02 -0.15 -0.07 -0.09 0.32 0.05 0.16 -0.02 -0.04 -0.57 -0.47 -0.26 -0.18 0.02 0.03 -0.29 -0.15 -0.16 0.07 0.21 0.37
0.28 0.34 -0.08 -0.03 -0.19 0.04 0.03 -0.06 0.11 -0.09 0.09 -0.24 -0.05 0.62 0.22 -0.0 -0.08 -0.2 -0.45 -0.18 0.05 -0.12 -0.65 -0.07 -0.18 -0.3 -0.24 -0.13 0.26 0.57
-0.36 -0.27 0.2 0.13 0.05 0.89 0.59 -0.21 0.34 -0.16 0.32 0.54 0.02 -3.89 0.33 0.51 0.59 -1.61 -0.05 0.14 0.27 0.12 -2.07 -0.66 -0.18 -0.01 -0.25 -0.46 -0.67 0.16
0.17 -0.23 -0.23 0.03 0.32 0.52 0.22 0.12 -0.12 -0.31 -0.24 -0.05 0.03 -0.37 0.46 0.34 0.34 -1.61 -0.16 -0.28 -0.19 -0.12 -0.23 0.16 -0.0 0.04 0.01 0.24 -0.01 -0.06
0.43 -0.12 -0.35 -0.24 0.48 0.72 0.69 0.5 -0.41 -0.45 -0.47 -0.34 -0.33 0.5 0.82 0.55 -0.19 0.52 -0.64 -0.54 -0.47 -0.54 -0.08 -0.14 0.01 -0.57 -0.49 -0.34 -0.41 -0.42
0.05 0.05 -0.09 -0.07 -0.02 0.14 0.33 0.12 -0.21 -0.38 -0.14 -0.05 0.13 0.4 0.28 0.11 0.09 -0.3 -0.22 -0.13 -0.15 -0.05 0.25 -0.17 -0.08 -0.16 -0.1 -0.05 -0.02 0.09
0.21 0.61 0.16 0.04 0.04 0.04 -0.27 -0.25 0.21 -0.07 -0.14 -0.17 -0.39 0.4 -0.25 -0.01 -0.12 0.42 -0.5 -0.49 -0.01 -0.44 0.3 -0.36 -0.41 -0.19 -0.15 0.23 0.21 0.43
0.23 0.61 0.14 0.08 -0.28 0.02 -0.08 -0.15 0.15 -0.12 -0.11 0.0 -0.13 0.55 -0.06 0.12 -0.12 0.16 -0.88 -0.75 -0.35 -0.42 -0.47 -0.01 -0.39 -0.24 -0.14 0.31 0.43 0.64
-0.4 -0.44 -0.03 0.2 -0.07 0.24 0.07 -0.41 0.09 -0.11 0.23 0.05 0.27 -1.25 0.42 0.49 0.49 -0.46 -0.06 -0.11 0.03 0.02 -0.08 -0.17 0.13 0.12 0.23 -0.47 -0.19 0.03
0.1 0.05 -0.16 -0.04 0.26 0.21 0.22 -0.07 -0.24 -0.17 -0.05 -0.06 0.23 -0.18 0.32 0.21 0.26 -0.61 -0.35 -0.35 -0.11 0.0 -0.02 0.13 0.04 -0.15 -0.12 0.1 0.2 -0.06
Spov3_chr1.05114 (KICP-02)
 -0.22 -0.31 -0.23 -0.5 0.36 0.31 0.36 0.13 -0.07 -0.07 -0.05 0.1 0.43 0.42 0.23 0.01 0.05 -0.91 -0.04 0.16 -0.28 -0.25 0.22 -0.13 -0.27 -0.09 -0.17 0.04 -0.01 -0.03
-0.54 -0.29 -0.96 -1.63 -0.38 1.29 0.64 0.48 -0.04 -0.23 -0.46 0.32 0.07 0.18 0.72 0.35 -0.02 -0.23 -0.5 -0.63 -0.37 -0.8 -0.95 0.46 -0.33 0.36 -0.16 -0.26 0.07 0.39
0.04 -0.01 -0.22 -0.35 0.1 0.19 0.3 0.1 0.02 -0.01 -0.06 0.04 -0.12 0.26 0.3 0.13 0.06 -0.29 -0.32 -0.24 -0.1 -0.16 -0.01 0.29 -0.03 0.08 -0.01 -0.1 -0.05 -0.15
-0.28 -0.24 0.16 0.14 -0.09 -0.08 0.09 0.23 0.25 -0.03 0.05 0.12 -0.44 -1.11 0.53 0.38 0.43 -0.66 -0.22 -0.1 0.19 0.11 -0.14 -0.06 -0.13 0.08 0.04 0.08 -0.01 -0.24
0.05 0.17 -0.25 -0.32 0.47 0.18 -0.46 -0.33 -0.33 -0.38 -0.1 -0.09 0.15 0.23 0.17 0.36 0.4 0.12 -0.37 -0.28 -0.24 -0.01 0.11 -0.1 -0.08 -0.36 -0.15 0.13 0.36 0.23
0.19 0.24 0.01 -0.12 0.02 0.12 -0.26 0.01 -0.42 -0.14 -0.25 0.17 -0.16 0.54 0.19 0.32 0.11 0.15 -0.4 -0.44 -0.13 -0.28 -0.12 -0.19 -0.26 0.09 -0.17 -0.04 -0.04 0.56
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0.16 0.07 -0.08 0.09 0.02 -0.31 -0.13 -0.01 -0.14 -0.28 -0.03 -0.03 0.31 -0.16 0.22 0.12 0.28 -0.29 -0.15 -0.18 0.04 -0.11 0.6 -0.02 0.11 -0.14 0.02 0.11 -0.29 -0.22
-0.39 -0.5 0.01 0.14 -0.12 0.16 0.23 0.04 -0.02 0.17 0.05 0.06 0.05 -1.29 0.28 0.25 0.38 -0.33 0.23 -0.15 0.31 -0.02 0.1 0.05 0.04 0.11 -0.02 -0.36 -0.33 -0.02
0.24 -0.02 -0.22 -0.41 0.08 0.48 0.12 -0.05 -0.06 -0.09 -0.15 -0.19 -0.06 0.31 0.28 0.04 0.16 0.27 -0.26 -0.13 -0.26 -0.11 0.03 -0.09 0.0 -0.0 -0.24 0.16 -0.1 -0.13
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0.45 0.42 -0.18 -0.37 0.26 0.53 -0.43 -0.04 -0.08 -0.21 -0.04 -0.24 -0.36 1.02 0.18 0.5 0.63 -0.31 0.07 -0.39 -0.45 -0.58 -1.78 -0.38 -0.57 -0.14 -0.05 -0.09 -0.05 0.27
0.09 -0.07 -0.0 0.03 0.21 0.2 0.09 0.33 -0.14 -0.26 -0.05 -0.02 -0.04 0.07 0.02 -0.01 -0.09 0.21 -0.19 -0.18 -0.15 -0.1 0.17 -0.13 -0.09 -0.14 0.01 -0.06 0.06 0.06
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-0.21 -0.45 -0.45 -0.54 -0.1 0.95 0.41 -0.94 -0.68 -0.31 -0.61 -0.67 -0.76 0.88 0.78 0.97 0.52 -1.84 -0.11 0.23 -0.03 0.91 0.13 0.08 -0.79 0.05 -0.27 -0.12 -0.35 -1.09
Spov3_chr3.01431 (5PTase12)
 0.24 0.36 -0.17 -0.12 0.29 0.31 -0.13 0.48 -0.1 -0.04 -0.28 0.03 0.03 0.21 -0.21 0.01 -0.09 0.31 -0.37 -0.4 -0.28 -0.31 0.32 -0.52 -0.22 0.01 -0.05 -0.35 0.28 0.06
-0.13 -0.27 -0.11 -0.11 0.3 0.3 0.31 0.2 -0.12 -0.16 0.05 -0.02 0.12 -0.13 0.05 0.03 0.06 -0.35 0.01 0.0 -0.06 0.08 0.35 -0.07 0.01 -0.03 0.09 0.13 -0.34 -0.64
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-0.12 -0.07 -0.04 -0.01 0.03 0.12 0.09 0.13 -0.0 -0.18 0.02 0.1 0.04 0.01 0.03 0.06 0.04 -0.36 -0.08 -0.03 -0.05 0.1 0.2 0.09 -0.02 0.05 0.0 -0.04 -0.07 -0.18
0.37 0.48 0.09 -0.33 0.39 0.18 -0.08 0.17 -0.14 0.23 -0.34 -0.13 -0.36 0.53 -0.11 0.14 -0.13 0.2 -0.71 -0.81 -0.4 -0.34 0.26 -0.09 -0.26 -0.29 -0.01 0.1 0.26 0.06
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-0.13 -0.13 -0.05 -0.05 0.18 0.06 0.22 0.1 -0.04 -0.03 -0.06 -0.03 0.2 -0.3 0.28 0.09 0.21 -0.8 -0.16 -0.21 -0.07 0.07 0.21 0.08 -0.09 -0.04 0.0 -0.04 0.12 0.02
0.06 0.06 0.01 -0.13 0.26 0.17 0.04 0.3 -0.01 -0.08 -0.11 -0.09 -0.1 0.27 0.18 0.11 0.09 0.03 -0.2 -0.1 -0.08 -0.17 0.14 -0.13 -0.21 -0.09 -0.01 -0.17 -0.23 -0.02
0.15 0.11 0.06 -0.1 0.38 0.1 -0.08 -0.38 -0.05 -0.05 0.07 -0.14 -0.01 -0.02 0.24 0.32 0.37 0.02 -0.26 -0.19 -0.05 -0.15 -0.7 0.14 -0.04 0.1 -0.01 -0.02 -0.16 -0.11
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.