1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_84 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.78 0.74 0.75 0.73 0.94 1.0 0.93 0.76 0.8 0.72 0.77 0.85 0.73 0.82 0.92 0.92 0.9 0.85 0.73 0.69 0.72 0.74 0.71 0.8 0.82 0.71 0.71 0.74 0.83 0.73
0.82 0.72 0.68 0.61 0.81 0.72 0.66 0.62 0.68 0.73 0.68 0.74 0.61 1.0 0.75 0.77 0.73 0.67 0.57 0.58 0.66 0.65 0.69 0.59 0.65 0.67 0.69 0.66 0.75 0.9
0.51 0.52 0.36 0.39 0.68 0.95 1.0 0.45 0.5 0.48 0.55 0.59 0.56 0.52 0.9 0.8 0.81 0.25 0.56 0.3 0.59 0.74 0.61 0.66 0.55 0.59 0.56 0.66 0.59 0.56
0.84 1.0 0.63 0.56 0.72 0.72 0.59 0.66 0.56 0.64 0.55 0.57 0.54 0.81 0.6 0.71 0.6 0.79 0.42 0.37 0.49 0.53 0.69 0.57 0.55 0.6 0.63 0.75 0.77 0.66
0.85 0.9 0.83 0.84 0.95 0.89 0.79 0.83 0.84 0.79 0.74 0.78 0.75 1.0 0.83 0.88 0.83 0.77 0.69 0.65 0.7 0.72 0.73 0.79 0.68 0.81 0.77 0.96 0.96 0.86
0.62 0.56 0.74 0.74 0.73 0.64 0.62 0.34 0.8 0.82 0.86 0.73 0.56 0.25 0.78 0.93 1.0 0.29 0.81 0.68 0.83 0.77 0.56 0.71 0.82 0.85 0.74 0.66 0.67 0.91
0.79 0.73 0.76 0.68 0.95 0.83 0.73 0.63 0.72 0.73 0.83 0.76 0.87 0.87 1.0 0.98 0.94 0.53 0.65 0.62 0.75 0.75 0.83 0.75 0.66 0.71 0.69 0.81 0.88 0.85
0.81 0.83 0.61 0.5 0.92 1.0 0.94 0.73 0.55 0.58 0.58 0.7 0.61 0.92 0.82 0.77 0.71 0.61 0.55 0.54 0.6 0.62 0.64 0.73 0.55 0.64 0.61 0.68 0.84 0.78
0.62 0.58 0.69 0.61 0.85 0.79 0.76 0.71 0.71 0.63 0.63 0.66 0.58 0.74 1.0 0.88 0.89 0.4 0.6 0.6 0.63 0.69 0.85 0.76 0.68 0.72 0.7 0.74 0.81 0.6
Spov3_chr1.00358 (PFA-DSP3)
 0.6 0.6 0.71 0.64 0.82 0.87 0.97 0.87 0.79 0.63 0.83 0.79 0.95 0.74 0.94 0.93 0.97 0.29 0.85 0.97 0.8 0.84 1.0 0.64 0.69 0.85 0.84 0.69 0.44 0.47
0.44 0.49 0.45 0.31 0.81 1.0 0.82 0.5 0.61 0.67 0.67 0.63 0.5 0.89 0.79 0.72 0.69 0.39 0.48 0.49 0.69 0.77 0.86 0.76 0.66 0.71 0.64 0.55 0.58 0.34
0.79 0.86 0.65 0.62 0.81 0.78 0.66 0.59 0.74 0.73 0.59 0.72 0.61 1.0 0.77 0.85 0.69 0.72 0.57 0.47 0.64 0.58 0.63 0.65 0.56 0.79 0.72 0.77 0.75 0.87
0.76 0.69 0.58 0.59 0.75 0.9 1.0 0.77 0.87 0.75 0.89 0.93 0.74 0.42 0.98 0.91 0.96 0.54 0.64 0.75 0.85 0.73 0.71 0.85 0.89 0.9 0.85 0.81 0.86 0.78
0.78 0.74 0.75 0.66 0.77 0.85 0.86 0.65 0.84 0.77 0.79 0.84 0.7 0.76 0.86 0.79 0.79 0.53 0.76 0.77 0.75 0.8 1.0 0.79 0.77 0.78 0.74 0.73 0.73 0.73
0.85 1.0 0.7 0.67 0.83 0.89 0.8 0.77 0.77 0.75 0.69 0.72 0.71 0.95 0.79 0.85 0.75 0.74 0.51 0.55 0.64 0.67 0.77 0.77 0.62 0.68 0.68 0.79 0.88 0.98
0.79 0.82 0.62 0.64 0.57 0.67 0.67 0.63 0.7 0.61 0.69 0.55 0.63 1.0 0.76 0.65 0.62 0.57 0.48 0.58 0.67 0.6 0.42 0.62 0.57 0.53 0.55 0.59 0.78 0.97
0.42 0.45 0.62 0.59 0.56 1.0 0.82 0.47 0.68 0.48 0.68 0.79 0.55 0.04 0.68 0.77 0.81 0.18 0.52 0.6 0.65 0.59 0.13 0.34 0.48 0.54 0.45 0.39 0.34 0.6
0.78 0.59 0.59 0.71 0.87 1.0 0.81 0.75 0.64 0.56 0.59 0.67 0.71 0.54 0.96 0.88 0.88 0.23 0.62 0.57 0.61 0.64 0.59 0.77 0.69 0.72 0.7 0.82 0.69 0.67
0.76 0.52 0.44 0.48 0.79 0.93 0.91 0.8 0.42 0.41 0.41 0.45 0.45 0.8 1.0 0.83 0.49 0.81 0.36 0.39 0.41 0.39 0.54 0.51 0.57 0.38 0.4 0.45 0.43 0.42
0.79 0.78 0.71 0.72 0.75 0.83 0.95 0.82 0.65 0.58 0.69 0.73 0.82 1.0 0.92 0.82 0.81 0.61 0.65 0.69 0.68 0.73 0.9 0.67 0.72 0.68 0.71 0.73 0.75 0.8
0.76 1.0 0.73 0.68 0.68 0.68 0.54 0.55 0.76 0.62 0.59 0.58 0.5 0.87 0.55 0.65 0.6 0.88 0.46 0.47 0.65 0.48 0.81 0.51 0.49 0.57 0.59 0.77 0.76 0.88
0.75 0.98 0.71 0.68 0.53 0.65 0.61 0.58 0.71 0.59 0.59 0.64 0.59 0.94 0.62 0.7 0.59 0.72 0.35 0.38 0.5 0.48 0.46 0.64 0.49 0.55 0.58 0.79 0.87 1.0
0.54 0.52 0.7 0.81 0.67 0.84 0.75 0.53 0.76 0.66 0.83 0.73 0.86 0.3 0.95 1.0 1.0 0.52 0.68 0.66 0.73 0.72 0.67 0.63 0.77 0.77 0.83 0.51 0.62 0.72
0.86 0.83 0.72 0.78 0.96 0.93 0.94 0.77 0.68 0.71 0.77 0.77 0.94 0.71 1.0 0.93 0.96 0.53 0.63 0.63 0.75 0.8 0.79 0.88 0.83 0.72 0.74 0.86 0.92 0.77
Spov3_chr1.05114 (KICP-02)
 0.64 0.6 0.64 0.52 0.96 0.92 0.95 0.82 0.71 0.71 0.72 0.8 1.0 0.99 0.87 0.75 0.77 0.4 0.72 0.83 0.61 0.62 0.87 0.68 0.62 0.7 0.66 0.77 0.74 0.73
0.28 0.34 0.21 0.13 0.31 1.0 0.64 0.57 0.4 0.35 0.3 0.51 0.43 0.47 0.68 0.52 0.4 0.35 0.29 0.27 0.32 0.24 0.21 0.57 0.33 0.53 0.37 0.34 0.43 0.54
0.83 0.8 0.69 0.64 0.87 0.93 1.0 0.87 0.82 0.8 0.78 0.83 0.75 0.97 1.0 0.89 0.85 0.66 0.65 0.69 0.75 0.72 0.8 0.99 0.8 0.86 0.8 0.76 0.78 0.73
0.57 0.59 0.78 0.77 0.65 0.66 0.74 0.82 0.83 0.68 0.72 0.76 0.51 0.32 1.0 0.91 0.94 0.44 0.6 0.65 0.79 0.75 0.63 0.67 0.63 0.73 0.71 0.73 0.69 0.59
0.75 0.81 0.61 0.58 1.0 0.82 0.53 0.58 0.57 0.56 0.67 0.68 0.8 0.85 0.81 0.92 0.95 0.79 0.56 0.6 0.61 0.71 0.78 0.67 0.69 0.56 0.65 0.79 0.93 0.85
0.78 0.8 0.68 0.62 0.69 0.74 0.57 0.68 0.51 0.62 0.57 0.76 0.61 0.98 0.78 0.85 0.73 0.75 0.52 0.5 0.62 0.56 0.62 0.59 0.57 0.72 0.6 0.66 0.66 1.0
0.74 0.65 0.58 0.48 0.83 0.8 0.7 0.76 0.65 0.56 0.6 0.67 0.61 1.0 0.63 0.69 0.68 0.57 0.47 0.48 0.52 0.53 0.48 0.55 0.52 0.63 0.56 0.64 0.67 0.61
0.74 0.69 0.62 0.7 0.67 0.53 0.6 0.66 0.6 0.54 0.65 0.65 0.81 0.59 0.77 0.72 0.8 0.54 0.59 0.58 0.68 0.61 1.0 0.65 0.71 0.6 0.67 0.71 0.54 0.56
0.59 0.54 0.77 0.85 0.71 0.86 0.9 0.79 0.76 0.87 0.8 0.8 0.8 0.31 0.93 0.92 1.0 0.61 0.9 0.7 0.95 0.76 0.83 0.8 0.79 0.83 0.76 0.6 0.61 0.76
0.85 0.7 0.62 0.54 0.76 1.0 0.78 0.69 0.69 0.67 0.65 0.63 0.69 0.89 0.87 0.74 0.8 0.86 0.6 0.65 0.6 0.66 0.73 0.67 0.72 0.71 0.61 0.8 0.67 0.65
0.35 0.36 0.45 0.58 0.45 0.37 0.43 0.62 0.56 0.55 0.51 0.5 0.41 0.43 0.5 0.46 0.56 0.16 0.42 0.41 0.42 0.4 1.0 0.34 0.41 0.37 0.43 0.54 0.37 0.16
0.67 0.66 0.44 0.38 0.59 0.71 0.36 0.48 0.47 0.43 0.48 0.42 0.38 1.0 0.56 0.69 0.76 0.4 0.52 0.38 0.36 0.33 0.14 0.38 0.33 0.45 0.47 0.46 0.47 0.59
0.85 0.76 0.79 0.81 0.92 0.92 0.85 1.0 0.72 0.67 0.77 0.79 0.77 0.83 0.81 0.79 0.75 0.92 0.7 0.7 0.72 0.75 0.9 0.73 0.75 0.73 0.8 0.76 0.83 0.83
0.65 0.31 0.39 0.45 0.44 0.86 1.0 0.92 0.48 0.37 0.43 0.47 0.51 0.77 0.73 0.8 0.54 0.31 0.26 0.32 0.28 0.32 0.58 0.39 0.34 0.32 0.31 0.34 0.4 0.56
0.44 0.37 0.38 0.35 0.48 0.99 0.68 0.27 0.32 0.41 0.34 0.32 0.3 0.94 0.88 1.0 0.74 0.14 0.47 0.6 0.5 0.97 0.56 0.54 0.3 0.53 0.42 0.47 0.4 0.24
Spov3_chr3.01431 (5PTase12)
 0.84 0.92 0.64 0.66 0.88 0.89 0.66 1.0 0.67 0.7 0.59 0.73 0.73 0.83 0.62 0.72 0.68 0.89 0.56 0.54 0.59 0.58 0.89 0.5 0.62 0.72 0.69 0.56 0.87 0.75
0.72 0.65 0.73 0.73 0.97 0.97 0.97 0.9 0.72 0.7 0.81 0.78 0.86 0.72 0.81 0.8 0.82 0.62 0.79 0.79 0.75 0.83 1.0 0.75 0.79 0.77 0.83 0.86 0.62 0.51
0.72 0.64 0.55 0.61 0.97 0.91 0.73 0.52 0.79 0.74 0.78 0.81 0.92 0.83 0.92 1.0 0.82 0.59 0.63 0.51 0.66 0.58 0.56 0.77 0.68 0.73 0.73 0.84 0.66 0.58
0.8 0.83 0.85 0.86 0.89 0.95 0.93 0.95 0.87 0.77 0.88 0.93 0.9 0.88 0.89 0.91 0.89 0.68 0.82 0.85 0.84 0.93 1.0 0.92 0.86 0.9 0.87 0.85 0.83 0.77
0.89 0.96 0.73 0.55 0.91 0.78 0.66 0.78 0.63 0.81 0.55 0.63 0.54 1.0 0.64 0.76 0.63 0.79 0.42 0.39 0.53 0.55 0.83 0.65 0.58 0.57 0.69 0.74 0.83 0.72
0.53 0.34 0.59 0.72 0.44 0.68 0.84 0.7 0.77 0.58 0.66 0.6 0.44 0.14 1.0 0.91 0.85 0.08 0.62 0.55 0.6 0.57 0.32 0.49 0.56 0.61 0.57 0.38 0.57 0.59
0.75 0.76 0.8 0.8 0.94 0.86 0.96 0.88 0.8 0.81 0.79 0.81 0.95 0.67 1.0 0.88 0.96 0.47 0.74 0.71 0.79 0.87 0.96 0.87 0.78 0.8 0.83 0.8 0.9 0.84
0.85 0.85 0.82 0.74 0.98 0.91 0.84 1.0 0.81 0.77 0.76 0.76 0.76 0.98 0.92 0.88 0.86 0.83 0.71 0.76 0.77 0.72 0.9 0.75 0.7 0.77 0.81 0.73 0.69 0.8
0.85 0.83 0.8 0.72 1.0 0.82 0.73 0.59 0.74 0.74 0.81 0.7 0.76 0.76 0.9 0.96 0.99 0.78 0.64 0.67 0.74 0.69 0.47 0.84 0.74 0.82 0.76 0.76 0.68 0.71
0.5 0.61 0.47 0.37 0.55 0.9 1.0 0.74 0.55 0.55 0.49 0.52 0.62 0.8 0.79 0.75 0.58 0.37 0.48 0.6 0.51 0.59 0.36 0.7 0.61 0.64 0.49 0.52 0.7 0.68
0.52 0.53 0.43 0.33 0.64 1.0 0.83 0.86 0.65 0.48 0.4 0.59 0.79 0.75 0.76 0.85 0.66 0.33 0.5 0.51 0.51 0.54 0.48 0.86 0.53 0.61 0.49 0.41 0.63 0.61
0.63 0.44 0.61 0.64 0.67 0.76 0.81 0.85 0.54 0.37 0.53 0.4 0.49 1.0 0.85 0.65 0.53 0.65 0.36 0.32 0.35 0.45 0.56 0.4 0.44 0.34 0.49 0.37 0.56 0.52
0.66 0.65 0.47 0.59 0.69 0.63 0.78 0.69 0.6 0.66 0.71 0.75 0.95 0.36 1.0 0.9 0.9 0.23 0.72 0.73 0.82 0.8 0.71 0.91 0.73 0.89 0.82 0.58 0.71 0.64
0.64 0.64 0.56 0.45 0.49 0.36 0.52 0.57 0.6 0.61 0.72 0.76 1.0 0.25 0.96 0.87 0.74 0.22 0.55 0.72 0.76 0.73 0.57 0.73 0.66 0.76 0.89 0.59 0.57 0.6
0.51 0.53 0.65 0.73 0.71 0.96 0.76 0.78 0.89 0.7 0.74 0.74 0.72 0.58 0.99 1.0 1.0 0.27 0.72 0.72 0.76 0.72 0.27 0.63 0.62 0.7 0.69 0.61 0.6 0.83
0.76 0.77 0.79 0.77 0.64 0.74 0.87 0.75 0.75 0.64 0.73 0.73 0.69 0.58 0.91 0.83 0.83 0.32 0.68 0.7 0.68 0.76 1.0 0.74 0.75 0.72 0.72 0.69 0.67 0.51
0.74 0.8 0.72 0.69 0.74 0.94 1.0 0.79 0.78 0.86 0.87 0.95 0.98 0.53 0.91 0.95 1.0 0.52 0.78 0.8 0.87 0.82 0.88 0.9 0.87 0.93 0.93 0.78 0.86 0.84
0.76 0.71 0.76 0.59 0.76 0.76 0.91 0.86 0.76 0.66 0.7 0.78 0.57 0.23 0.78 0.71 0.74 0.42 0.79 0.86 0.81 0.82 1.0 0.72 0.75 0.71 0.69 0.85 0.71 0.5
0.72 0.69 0.75 0.78 1.0 0.73 0.6 0.62 0.78 0.68 0.68 0.68 0.63 0.54 0.89 0.86 0.93 0.58 0.53 0.55 0.59 0.6 0.88 0.72 0.66 0.61 0.63 0.7 0.75 0.54
0.58 0.52 0.59 0.59 0.61 0.76 0.84 1.0 0.71 0.62 0.71 0.73 0.8 0.75 0.86 0.69 0.75 0.4 0.63 0.69 0.59 0.63 0.75 0.59 0.57 0.55 0.61 0.65 0.71 0.68
0.75 0.75 0.75 0.76 0.85 0.83 0.85 0.76 0.83 0.76 0.87 0.88 0.93 0.53 1.0 1.0 0.93 0.43 0.73 0.7 0.76 0.78 0.75 0.75 0.77 0.72 0.81 0.76 0.8 0.77
0.44 0.41 0.67 0.9 0.47 0.73 0.7 0.51 0.79 0.58 0.75 0.67 0.89 0.17 1.0 0.98 0.96 0.48 0.73 0.67 0.72 0.71 0.56 0.66 0.71 0.64 0.65 0.49 0.45 0.76
0.77 0.83 0.84 0.83 0.59 0.87 0.93 0.84 0.69 0.62 0.74 0.76 0.72 0.64 1.0 1.0 0.96 0.31 0.66 0.68 0.76 0.76 0.7 0.8 0.73 0.76 0.75 0.69 0.58 0.62
0.71 0.74 0.76 0.78 0.86 1.0 0.93 0.62 0.9 0.85 0.91 0.92 0.72 0.3 0.89 0.9 0.92 0.39 0.81 0.71 0.9 0.93 0.87 0.86 0.86 0.92 0.88 0.73 0.79 0.88
0.83 0.84 0.84 1.0 0.66 0.77 0.82 0.88 0.73 0.67 0.79 0.82 0.81 0.74 0.95 0.95 0.91 0.42 0.75 0.69 0.8 0.83 0.89 0.8 0.8 0.84 0.84 0.75 0.76 0.67
Spov3_chr5.01053 (PP2-A13)
 0.28 0.38 0.32 0.32 1.0 0.95 0.53 0.3 0.46 0.49 0.34 0.51 0.44 0.34 0.95 0.9 0.66 0.14 0.33 0.3 0.4 0.47 0.71 0.58 0.31 0.43 0.42 0.66 0.5 0.46
0.83 0.78 0.7 0.67 1.0 0.99 0.92 0.91 0.72 0.76 0.74 0.8 0.73 0.78 0.93 0.96 0.89 0.61 0.64 0.71 0.74 0.75 0.77 0.87 0.82 0.85 0.74 0.85 0.86 0.79
0.74 0.91 0.62 0.6 0.63 0.78 0.62 0.59 0.52 0.64 0.64 0.56 0.65 1.0 0.63 0.77 0.64 0.48 0.47 0.49 0.5 0.61 0.41 0.51 0.51 0.47 0.57 0.68 0.81 0.86
0.42 0.47 0.36 0.51 1.0 0.48 0.4 0.58 0.36 0.12 0.06 0.48 0.06 0.06 0.3 0.45 0.54 0.25 0.0 0.05 0.14 0.05 0.73 0.05 0.05 0.21 0.53 0.48 0.65 0.37
0.78 0.83 0.77 0.74 0.56 0.84 0.89 0.91 0.68 0.61 0.74 0.75 0.66 0.62 0.98 1.0 0.99 0.35 0.68 0.7 0.76 0.76 0.62 0.72 0.72 0.79 0.76 0.66 0.64 0.92
0.15 0.11 0.12 0.03 0.29 1.0 0.73 0.54 0.34 0.34 0.3 0.41 0.24 0.59 0.58 0.56 0.33 0.22 0.26 0.31 0.29 0.31 0.15 0.42 0.34 0.38 0.36 0.42 0.39 0.43
0.79 0.59 0.7 0.74 0.3 0.68 0.86 1.0 0.67 0.52 0.79 0.75 0.38 0.41 0.86 0.88 0.9 0.26 0.67 0.73 0.67 0.71 0.33 0.62 0.66 0.68 0.68 0.7 0.86 0.97
0.66 0.64 0.68 0.78 0.73 0.74 0.76 0.86 0.75 0.66 0.7 0.69 0.64 0.7 0.79 0.81 0.88 0.36 0.65 0.62 0.65 0.64 1.0 0.75 0.7 0.63 0.65 0.67 0.71 0.57
0.61 0.5 0.69 0.71 0.8 1.0 0.96 0.82 0.73 0.54 0.78 0.83 0.67 0.68 0.92 0.83 0.81 0.42 0.62 0.7 0.6 0.7 0.99 0.76 0.62 0.62 0.54 0.76 0.75 0.78
0.67 0.84 0.66 0.53 0.91 1.0 0.91 0.75 0.7 0.75 0.77 0.79 0.74 0.84 0.87 0.9 0.84 0.56 0.57 0.6 0.66 0.68 0.6 0.83 0.76 0.76 0.67 0.65 0.76 0.76
0.75 0.74 0.72 0.72 0.62 0.64 0.71 0.75 0.65 0.6 0.65 0.67 0.7 0.73 0.78 0.68 0.69 0.37 0.61 0.61 0.63 0.66 1.0 0.69 0.67 0.63 0.64 0.76 0.65 0.54
0.87 0.84 0.79 0.79 0.81 0.68 0.76 0.8 0.73 0.65 0.74 0.75 0.78 0.69 0.78 0.74 0.84 0.63 0.67 0.63 0.74 0.78 1.0 0.75 0.72 0.76 0.79 0.87 0.76 0.7
0.74 0.73 0.75 0.76 0.88 0.85 0.85 0.74 0.82 0.76 0.79 0.9 0.81 0.8 1.0 0.86 0.92 0.63 0.72 0.72 0.71 0.77 0.95 0.75 0.67 0.8 0.68 0.73 0.78 0.88
0.82 0.75 0.68 0.66 0.82 1.0 0.8 0.86 0.78 0.72 0.71 0.79 0.86 0.86 0.85 0.84 0.9 0.56 0.67 0.6 0.72 0.7 0.68 0.83 0.78 0.73 0.82 0.84 0.81 0.75
0.64 0.6 0.56 0.57 0.64 0.74 0.77 0.87 0.62 0.55 0.74 0.62 0.66 1.0 0.89 0.79 0.67 0.75 0.47 0.46 0.46 0.45 0.84 0.43 0.42 0.46 0.61 0.7 0.61 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)