Heatmap: Cluster_216 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-2.29 -3.22 -3.22 -1.48 -1.42 -1.71 -2.21 -2.9 -0.74 -0.69 -0.95 0.24 2.27 0.2 0.62 -0.62 -0.5 1.33 -0.99 -0.43 -0.81 -1.5 0.14 -0.06 -0.12 -1.08 -1.04 -1.05 -0.39 0.09 2.7
-0.54 -0.79 -1.53 -1.89 -0.41 -0.09 -0.26 -0.28 -0.77 -0.8 -0.49 -0.53 1.48 0.87 0.53 -0.31 -0.32 0.83 -0.34 -0.59 -0.28 -0.54 -0.02 -0.03 -0.21 -0.46 -0.54 -0.19 0.25 0.05 1.79
-2.56 -2.04 -1.51 -0.87 0.65 0.19 -1.86 -1.73 -0.44 0.03 -0.05 0.14 1.47 1.3 0.76 -0.64 -0.97 0.98 0.06 -0.52 -1.03 -1.17 -1.78 -0.84 -0.79 -0.52 -0.89 -1.56 0.12 0.36 2.16
-1.16 -1.51 -1.39 -1.39 -0.4 -0.41 -0.84 -1.26 -0.69 -0.32 -0.33 -0.14 1.78 0.15 -0.31 -0.46 -0.27 0.48 -0.94 -0.48 -0.54 -0.34 0.21 0.22 -0.25 -0.3 -0.37 0.04 -0.43 0.24 2.35
-0.79 -0.94 -0.45 -0.68 -1.39 -1.87 -0.67 -0.74 -0.26 -0.06 -0.12 -0.08 1.91 -0.28 0.06 -0.4 0.25 0.75 -0.31 -0.13 -0.52 -1.31 0.05 0.1 0.13 -0.51 -0.86 -0.81 -0.68 0.22 2.04
-0.97 -1.54 -1.56 -0.35 0.06 -0.15 -0.47 0.01 -0.54 -0.35 0.05 -0.1 0.82 0.89 0.63 -0.34 -0.2 0.27 -0.44 -0.47 -0.41 -0.13 0.53 0.4 -0.46 -0.41 -0.26 -0.53 0.39 0.32 1.27
-3.3 -2.5 -2.39 -1.53 0.51 0.32 -0.8 -1.5 -0.5 -0.73 -0.81 -0.78 1.83 0.81 0.55 0.03 -0.15 0.68 0.25 -0.44 -0.7 -0.42 -1.91 -0.74 -0.35 -0.42 -0.64 -1.74 -0.01 0.12 2.36
-2.04 -2.3 -1.16 -1.23 -0.41 -0.09 -1.34 -1.07 -0.61 -0.77 -0.56 -0.3 1.87 0.1 -0.03 -0.26 -0.37 0.95 -0.41 -0.21 -0.53 -0.35 -1.32 0.16 -0.69 -0.3 -0.83 -0.21 0.34 0.3 2.37
-0.58 -1.06 -1.43 -1.19 -0.57 -0.24 -0.78 -0.37 -0.19 -0.04 -0.01 0.33 1.04 1.02 0.4 0.08 0.08 -0.61 -0.32 -0.4 -0.4 -0.13 0.02 0.29 0.01 -0.05 -0.33 0.15 0.33 0.31 1.03
-2.28 -2.16 -2.11 -2.0 -0.37 -0.71 -1.07 -1.8 -0.65 -0.3 -0.44 0.03 2.2 -0.36 -0.21 -1.46 -0.94 0.66 -0.64 -0.05 -1.01 -0.81 0.25 0.06 -0.21 -0.61 -0.31 -0.72 -0.34 0.15 2.65
-0.5 -0.35 -0.52 -0.44 0.02 -0.23 -0.66 -0.38 -0.11 -0.11 0.06 0.31 1.16 0.83 0.24 -0.28 -0.18 -0.65 -0.41 -0.44 -0.25 -0.13 -0.49 0.1 -0.01 -0.08 -0.37 -0.11 0.12 0.21 1.15
-2.31 -1.9 -1.56 -0.89 -0.34 -0.32 -1.05 -0.83 -0.31 -0.18 -0.04 -0.11 1.76 0.68 0.73 -0.45 -0.39 0.76 -0.1 -0.31 -0.44 -0.54 -0.35 -0.17 -0.3 -0.49 -0.54 -1.02 0.11 0.26 1.92
-1.4 -1.74 -1.5 -1.07 0.07 0.15 -1.2 -1.27 -0.08 -0.18 0.06 0.24 1.21 0.86 0.2 0.25 0.12 -0.31 -0.26 -0.27 -0.13 0.02 -0.66 0.24 -0.04 -0.02 -0.1 0.02 -0.16 0.2 1.44
-3.29 -2.99 -2.64 -1.69 -0.03 -0.09 -0.88 -0.99 -0.48 -0.44 -0.33 -0.17 1.27 0.24 0.49 0.29 0.28 0.63 -0.07 0.18 0.01 -0.3 -0.72 -0.09 0.1 0.04 0.12 -0.58 0.3 0.42 1.74
-0.48 -0.63 -0.74 -0.43 0.04 -0.02 -0.29 -0.7 -0.11 -0.09 0.02 0.11 0.74 0.09 0.07 0.04 0.09 0.52 0.03 -0.04 -0.14 0.04 -0.78 -0.05 0.05 -0.02 0.11 -0.11 -0.01 0.04 1.02
-1.09 -1.24 -1.42 -1.15 -0.47 -0.19 -0.92 -0.41 -0.37 -0.37 -0.23 0.21 1.31 0.85 0.27 -0.15 -0.2 -0.01 -0.43 -0.48 -0.24 -0.1 0.07 0.42 0.15 -0.04 -0.32 -0.15 0.32 0.19 1.48
-0.54 -0.54 -0.19 -0.58 -0.1 -0.06 -0.38 -0.37 -0.17 -0.29 -0.21 -0.13 0.93 0.56 0.28 0.1 -0.07 0.68 0.0 -0.17 -0.27 -0.29 -0.82 -0.16 -0.11 -0.22 -0.07 -0.24 -0.0 0.16 1.17
-3.3 -3.32 -3.77 -2.28 -0.5 -0.61 -1.97 -1.59 -1.13 -0.95 -0.97 -0.9 2.14 1.39 0.76 -0.89 -0.54 1.49 -0.09 0.15 -1.27 -0.92 -1.01 -0.93 -1.23 -1.15 -1.66 -1.84 -0.54 -0.0 2.73
-0.58 -0.65 -0.94 -0.67 -0.27 0.1 -0.74 -0.33 -0.4 -0.22 -0.21 0.15 0.97 0.94 0.33 -0.21 -0.03 -0.69 -0.3 -0.56 -0.02 -0.02 -0.43 0.3 0.21 0.07 -0.26 -0.04 0.48 0.2 1.05
-1.86 -1.95 -1.67 -1.17 0.28 -0.18 -1.11 -1.37 0.05 0.27 -0.35 0.16 1.4 1.01 0.88 -0.49 0.02 0.87 -0.38 -0.16 -0.44 -0.28 -2.27 -0.66 -0.33 -0.29 0.02 -0.78 -0.04 -0.11 1.77
-2.07 -1.67 -1.65 -1.84 -0.2 -0.84 -0.81 -0.68 -0.35 -0.26 -0.26 -0.04 1.55 0.69 0.64 -0.36 -0.03 0.98 -0.21 0.15 -0.4 -0.32 -1.77 0.08 -0.22 -0.46 -0.47 -0.46 0.1 0.39 1.88
-2.01 -1.27 -1.64 -1.28 -0.2 -0.42 -0.75 -1.01 -0.38 -0.28 -0.15 -0.19 1.4 0.66 0.34 -0.32 -0.01 0.89 -0.51 -0.17 -0.38 -0.59 0.15 0.06 -0.12 -0.1 -0.22 -0.38 0.04 0.31 1.79
-0.55 -0.98 -0.91 -0.81 -0.62 -0.69 -0.71 -0.67 -0.05 0.05 -0.13 0.35 1.44 0.32 0.13 -0.01 -0.01 -0.22 -0.33 -0.36 -0.26 -0.39 0.44 0.44 -0.12 -0.28 -0.32 -0.32 -0.06 0.42 1.37
-0.8 -0.72 -0.89 -0.43 0.23 0.1 -0.63 -0.91 -0.44 -0.22 -0.18 -0.1 1.18 0.43 0.17 -0.18 -0.29 0.38 -0.15 -0.38 -0.53 -0.24 0.0 -0.36 -0.33 -0.16 -0.29 -0.4 0.01 0.31 1.78
-0.88 -2.54 -1.97 0.04 0.48 -0.72 -1.46 -3.47 0.05 0.09 0.72 0.56 1.61 1.24 -0.05 -0.11 -0.55 0.53 -1.95 -0.57 -1.18 -0.13 -0.37 -0.6 -0.28 -0.25 -0.29 -1.66 -0.57 -0.13 1.92
-0.34 -0.2 -0.33 -0.54 -0.22 0.13 -0.77 -0.94 -0.16 -0.04 0.1 0.34 0.67 0.79 0.06 -0.24 -0.12 -1.18 -0.03 -0.56 -0.02 0.05 -0.58 0.2 0.07 0.21 -0.19 -0.03 0.05 0.15 1.21
-3.49 -3.5 -3.16 -2.29 -0.9 -1.62 -0.78 -0.88 -0.12 -0.08 -0.23 0.19 1.78 0.52 0.25 -0.44 0.2 1.09 -0.33 0.06 -0.29 -0.38 0.14 0.03 0.0 -0.33 -0.64 -1.17 -0.6 0.31 2.09
-2.19 -2.67 -3.57 -4.32 -0.7 0.17 -1.1 -1.93 -0.52 -0.38 -0.43 -0.14 1.96 0.82 0.58 0.28 0.0 0.34 -0.23 -0.16 -0.72 -0.24 -4.95 -0.3 -0.11 -0.15 -0.24 -0.83 -0.4 0.31 2.32
-1.63 -1.29 -0.92 -0.42 0.26 0.04 -0.98 -0.96 -0.34 -0.07 -0.01 0.18 1.22 1.25 -0.12 -0.05 -0.13 0.84 -0.83 -0.46 -0.64 -0.42 -0.97 -0.21 -0.13 -0.15 -0.16 -0.68 0.14 0.4 1.46
-0.41 -0.56 -1.09 -0.72 0.03 0.09 -0.22 -0.07 -0.72 -0.39 -0.22 -0.17 0.82 0.96 0.27 -0.17 -0.0 -1.0 -0.17 -0.51 -0.06 0.1 -0.19 0.21 0.16 -0.07 -0.2 -0.36 0.39 0.29 1.18
-3.88 -4.32 -2.36 - -3.6 -3.07 -1.31 -0.74 -1.04 -1.0 -0.29 -0.27 2.38 -0.53 0.75 -0.54 0.15 1.59 -1.46 -0.81 -1.42 -1.64 0.52 0.21 -0.4 -0.95 -2.46 -1.95 -0.69 0.53 2.69
-1.19 -0.96 -0.91 -0.68 -0.09 -0.17 -0.23 -0.49 -0.15 -0.1 -0.12 0.03 0.76 0.24 0.25 0.01 0.18 -0.19 0.05 0.08 -0.2 -0.19 -0.06 -0.03 -0.04 0.02 -0.12 -0.4 0.24 0.42 1.43
-0.52 -0.44 -0.51 -0.49 -0.16 -0.13 -0.19 -0.1 -0.09 -0.11 0.13 0.13 0.52 0.49 0.18 -0.04 -0.0 -0.24 -0.0 -0.1 -0.14 -0.07 -0.02 0.07 -0.05 -0.04 -0.04 -0.08 0.22 0.22 0.74
-1.64 -1.38 -2.01 -1.97 -0.55 -0.28 -1.45 -1.39 -0.3 -0.36 -0.16 0.18 1.84 0.7 0.55 -0.41 -0.2 1.37 -0.29 -0.79 -0.65 -0.76 -0.24 -0.08 -0.6 -1.3 -0.85 -0.57 -0.29 0.18 2.13
-1.12 -1.62 -1.74 -1.06 0.82 0.24 -0.56 -1.04 -0.22 -0.44 -0.35 -0.32 1.72 0.26 -0.01 -0.3 -0.65 0.73 -0.64 -0.68 -0.74 -0.72 0.5 -0.28 -0.57 -0.75 -0.64 -0.5 -0.02 0.17 2.04
-0.51 -0.45 -0.72 -0.52 0.63 0.15 -0.77 -0.58 -0.08 -0.03 0.1 0.15 1.23 0.37 0.09 -0.31 -0.31 0.33 -0.35 -0.52 -0.77 -0.51 0.77 -0.37 -0.47 -0.47 -0.21 -0.71 -0.15 0.12 1.32
-0.93 -1.12 -1.36 -0.65 -0.35 -0.03 -0.56 0.09 -0.43 -0.03 -0.18 0.09 0.76 0.87 0.4 -0.24 -0.09 0.31 -0.38 -0.66 -0.34 -0.08 0.49 -0.12 -0.3 -0.17 -0.28 -0.32 0.44 0.43 1.3
-1.22 -1.24 -1.7 -0.86 -0.41 -0.75 -0.49 -0.24 -0.21 -0.24 -0.29 0.17 1.6 0.79 0.28 -0.12 0.05 0.03 -0.62 -0.15 -0.24 -0.35 -0.26 0.43 0.13 -0.41 -0.37 0.03 -0.34 0.01 1.57
-0.53 -0.51 -0.69 -0.4 -0.05 -0.05 -0.52 -0.41 -0.24 -0.24 -0.1 0.14 0.8 0.84 0.42 -0.05 0.04 -0.76 -0.15 -0.33 -0.15 -0.13 -0.2 0.16 -0.03 -0.02 -0.22 -0.09 0.24 0.26 1.01
-0.09 -0.09 -0.39 -0.17 0.07 0.18 -0.67 -0.58 -0.14 -0.21 -0.04 0.02 0.65 0.69 0.18 -0.15 -0.08 -0.97 0.1 -0.23 -0.21 -0.0 -0.18 0.26 0.06 -0.03 -0.16 -0.2 -0.04 0.07 0.9
-0.87 -0.79 -0.52 -0.83 -0.46 -0.6 -0.65 -0.87 -0.59 -0.08 -0.3 0.02 1.59 0.27 0.39 -0.08 -0.07 0.79 0.14 -0.2 -0.51 -0.23 -1.04 -0.21 -0.17 -0.43 -0.36 -0.72 0.02 0.23 1.76
-3.12 -2.9 -1.87 -2.16 -1.34 -1.1 -0.77 -1.04 -0.61 -0.46 -0.27 0.03 2.22 0.12 0.53 -0.51 -0.07 0.96 -0.48 -0.18 -0.94 -0.97 -3.33 -0.32 -0.53 -1.19 -1.44 -1.6 -0.2 0.39 2.76
-3.03 -1.65 -1.39 -0.5 -0.5 -0.8 -0.9 -1.2 -0.51 -0.54 -0.03 -0.62 1.74 0.47 0.5 -0.16 -0.23 1.16 -0.63 -0.17 -0.75 -0.41 -0.08 -0.08 0.09 -0.68 -0.62 -0.94 -0.06 0.29 2.08
-0.97 -1.01 -0.9 -0.76 -0.34 -0.07 -0.72 -0.66 -0.14 -0.19 0.03 0.41 1.41 0.71 0.09 -0.03 0.03 -0.74 -0.79 -0.42 -0.21 0.06 -0.43 0.4 0.31 -0.14 -0.19 -0.17 -0.16 0.0 1.43
-1.68 -1.78 -2.17 -1.71 -0.22 -0.8 -1.27 -1.66 -0.52 -0.19 -0.19 0.0 1.91 0.29 0.37 -0.11 -0.01 0.58 -0.34 -0.11 -0.52 -0.55 -2.47 -0.08 -0.11 -0.27 -0.36 -0.53 -0.16 0.47 2.27
-0.45 -0.43 -0.6 -0.78 -0.02 -0.09 -0.45 -0.37 -0.23 -0.26 -0.24 0.02 0.7 0.77 0.25 -0.21 -0.18 0.26 -0.27 -0.26 -0.06 -0.02 0.38 -0.05 0.09 -0.18 -0.16 -0.16 0.1 0.23 0.99
-1.23 -0.96 -1.09 -0.72 -0.12 0.0 -0.38 -0.39 -0.37 -0.23 -0.14 -0.39 1.31 1.03 0.69 -0.18 -0.12 0.65 -0.01 -0.27 -0.37 -0.47 -0.18 -0.34 -0.54 -0.47 -0.43 -0.71 0.09 -0.03 1.55
-1.53 -1.99 -1.29 -0.96 -0.04 -0.28 -0.5 -0.59 -0.05 0.13 0.11 -0.13 1.25 0.12 0.45 0.02 0.08 0.65 0.18 0.05 -0.29 -0.37 -1.86 0.09 -0.0 -0.08 -0.26 -0.3 0.04 0.45 1.43
-3.75 -6.17 -3.17 -3.09 -1.97 -1.42 -1.14 -1.52 -1.06 -0.56 -0.83 -0.82 2.01 1.56 1.41 -0.46 0.09 1.7 0.05 -0.7 -1.14 -1.54 -0.65 -0.06 -0.65 -0.61 -1.07 -1.82 -1.08 -0.12 2.27
-0.88 -0.5 -0.88 -0.73 -0.0 -0.43 -0.7 -0.88 -0.46 -0.16 -0.15 -0.02 1.3 0.15 0.2 -0.18 -0.21 0.46 -0.39 0.02 -0.39 -0.51 0.05 -0.23 -0.05 -0.29 -0.29 -0.15 -0.13 0.07 1.9
-0.5 -0.72 -0.5 -0.78 -0.17 -0.29 -0.4 -0.65 -0.1 -0.09 0.09 0.05 1.16 0.38 0.35 -0.33 0.06 0.41 -0.12 0.06 -0.28 -0.33 -0.73 -0.05 -0.13 -0.11 -0.26 -0.25 -0.08 0.08 1.43
-1.04 -0.73 -0.88 -0.64 -0.82 -1.32 -0.25 -1.02 -0.84 -0.21 -0.41 0.17 1.66 -0.31 0.31 0.17 -0.3 1.3 0.23 0.15 -0.47 -0.73 -1.5 -0.14 -0.13 -0.59 -0.85 -0.36 -0.17 0.24 1.88
-0.54 -0.62 -0.85 -0.57 -0.26 -0.1 -0.32 -0.15 -0.17 -0.14 0.05 0.19 0.64 0.83 0.24 -0.03 -0.01 -0.0 -0.28 -0.37 -0.3 -0.18 0.3 0.15 0.07 -0.21 -0.12 -0.14 0.02 0.13 1.01
-2.6 -2.41 -2.18 -1.52 0.14 0.31 -2.48 -1.67 -0.45 -0.56 -0.28 0.13 1.61 1.03 -0.11 -0.12 -0.34 -0.37 -0.39 -0.6 -0.27 0.07 -0.13 0.5 0.09 -0.12 -0.15 -0.15 0.12 0.36 1.86
-1.66 -1.99 -1.22 -1.26 -0.48 -0.62 -0.3 -0.26 -0.25 -0.11 -0.12 -0.1 1.59 0.73 0.73 -0.25 -0.23 1.22 -0.06 0.02 -0.62 -0.68 -1.48 -0.24 -0.45 -0.19 -0.67 -0.5 0.08 0.27 1.56
-2.76 - - -3.91 -1.91 -2.85 -2.06 -2.14 -1.26 -0.88 -0.56 -0.07 2.47 1.24 1.33 -0.79 0.15 1.43 -0.42 -0.12 -0.82 -1.45 -1.95 0.35 -0.67 -2.28 -1.29 -1.07 -1.01 0.25 2.31
-0.95 -1.55 -0.78 -1.29 0.52 0.18 -1.65 -2.43 -0.48 -0.62 -0.07 -0.51 1.27 0.57 0.05 -0.2 -0.2 0.47 0.05 -0.17 -0.51 -0.16 0.34 -0.36 -0.11 -0.16 -0.25 -0.66 0.08 0.33 1.94
-2.62 -2.58 -1.38 -1.33 -0.6 -0.54 -1.05 -0.88 -0.45 -0.41 -0.1 0.2 1.68 0.74 0.14 -0.18 -0.22 0.41 -1.08 -0.42 -0.63 -0.43 -0.32 0.4 0.04 -0.36 -0.38 -0.56 0.01 0.5 2.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.