Heatmap: Cluster_216 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.03 0.02 0.02 0.06 0.06 0.05 0.03 0.02 0.09 0.1 0.08 0.18 0.74 0.18 0.24 0.1 0.11 0.39 0.08 0.11 0.09 0.05 0.17 0.15 0.14 0.07 0.08 0.07 0.12 0.16 1.0
0.2 0.17 0.1 0.08 0.22 0.27 0.24 0.24 0.17 0.17 0.21 0.2 0.81 0.53 0.42 0.23 0.23 0.52 0.23 0.19 0.24 0.2 0.29 0.28 0.25 0.21 0.2 0.25 0.34 0.3 1.0
0.04 0.05 0.08 0.12 0.35 0.26 0.06 0.07 0.16 0.23 0.22 0.25 0.62 0.55 0.38 0.14 0.11 0.44 0.23 0.16 0.11 0.1 0.07 0.13 0.13 0.16 0.12 0.08 0.24 0.29 1.0
0.09 0.07 0.07 0.07 0.15 0.15 0.11 0.08 0.12 0.16 0.16 0.18 0.67 0.22 0.16 0.14 0.16 0.27 0.1 0.14 0.13 0.15 0.23 0.23 0.16 0.16 0.15 0.2 0.15 0.23 1.0
0.14 0.13 0.18 0.15 0.09 0.07 0.15 0.15 0.2 0.23 0.22 0.23 0.92 0.2 0.25 0.18 0.29 0.41 0.2 0.22 0.17 0.1 0.25 0.26 0.27 0.17 0.13 0.14 0.15 0.28 1.0
0.21 0.14 0.14 0.33 0.43 0.37 0.3 0.42 0.28 0.32 0.43 0.39 0.73 0.77 0.64 0.33 0.36 0.5 0.31 0.3 0.31 0.38 0.6 0.55 0.3 0.31 0.35 0.29 0.54 0.52 1.0
0.02 0.03 0.04 0.07 0.28 0.24 0.11 0.07 0.14 0.12 0.11 0.11 0.69 0.34 0.29 0.2 0.18 0.31 0.23 0.14 0.12 0.15 0.05 0.12 0.15 0.15 0.13 0.06 0.19 0.21 1.0
0.05 0.04 0.09 0.08 0.15 0.18 0.08 0.09 0.13 0.11 0.13 0.16 0.71 0.21 0.19 0.16 0.15 0.37 0.15 0.17 0.13 0.15 0.08 0.22 0.12 0.16 0.11 0.17 0.25 0.24 1.0
0.33 0.23 0.18 0.21 0.33 0.41 0.28 0.38 0.43 0.47 0.48 0.61 1.0 0.99 0.64 0.52 0.52 0.32 0.39 0.37 0.37 0.44 0.49 0.6 0.49 0.47 0.39 0.54 0.61 0.6 1.0
0.03 0.04 0.04 0.04 0.12 0.1 0.08 0.05 0.1 0.13 0.12 0.16 0.73 0.12 0.14 0.06 0.08 0.25 0.1 0.15 0.08 0.09 0.19 0.17 0.14 0.1 0.13 0.1 0.13 0.18 1.0
0.32 0.35 0.31 0.33 0.45 0.38 0.28 0.34 0.42 0.41 0.47 0.56 1.0 0.8 0.53 0.37 0.4 0.29 0.34 0.33 0.38 0.41 0.32 0.48 0.45 0.43 0.35 0.42 0.49 0.52 0.99
0.05 0.07 0.09 0.14 0.21 0.21 0.13 0.15 0.21 0.23 0.26 0.24 0.89 0.42 0.44 0.19 0.2 0.45 0.25 0.21 0.2 0.18 0.21 0.24 0.21 0.19 0.18 0.13 0.28 0.32 1.0
0.14 0.11 0.13 0.18 0.39 0.41 0.16 0.15 0.35 0.32 0.38 0.43 0.85 0.67 0.42 0.44 0.4 0.3 0.31 0.31 0.34 0.37 0.23 0.43 0.36 0.36 0.34 0.37 0.33 0.42 1.0
0.03 0.04 0.05 0.09 0.29 0.28 0.16 0.15 0.21 0.22 0.24 0.27 0.72 0.35 0.42 0.37 0.36 0.46 0.29 0.34 0.3 0.24 0.18 0.28 0.32 0.31 0.33 0.2 0.37 0.4 1.0
0.35 0.32 0.29 0.37 0.5 0.49 0.4 0.3 0.46 0.46 0.5 0.53 0.82 0.52 0.52 0.5 0.52 0.71 0.5 0.48 0.45 0.51 0.29 0.48 0.51 0.49 0.53 0.46 0.49 0.51 1.0
0.17 0.15 0.13 0.16 0.26 0.31 0.19 0.27 0.28 0.28 0.3 0.41 0.88 0.64 0.43 0.32 0.31 0.35 0.27 0.26 0.3 0.33 0.37 0.48 0.4 0.35 0.29 0.32 0.45 0.41 1.0
0.31 0.31 0.39 0.3 0.41 0.43 0.34 0.35 0.4 0.37 0.39 0.41 0.85 0.66 0.54 0.48 0.42 0.71 0.45 0.4 0.37 0.36 0.25 0.4 0.41 0.38 0.42 0.38 0.45 0.5 1.0
0.02 0.02 0.01 0.03 0.11 0.1 0.04 0.05 0.07 0.08 0.08 0.08 0.67 0.39 0.26 0.08 0.1 0.43 0.14 0.17 0.06 0.08 0.07 0.08 0.06 0.07 0.05 0.04 0.1 0.15 1.0
0.32 0.31 0.25 0.3 0.4 0.52 0.29 0.38 0.37 0.41 0.42 0.54 0.94 0.92 0.61 0.42 0.47 0.3 0.39 0.33 0.47 0.47 0.36 0.59 0.56 0.5 0.4 0.47 0.67 0.55 1.0
0.08 0.08 0.09 0.13 0.36 0.26 0.14 0.11 0.31 0.36 0.23 0.33 0.78 0.59 0.54 0.21 0.3 0.54 0.23 0.26 0.22 0.24 0.06 0.19 0.23 0.24 0.3 0.17 0.29 0.27 1.0
0.06 0.09 0.09 0.08 0.24 0.15 0.15 0.17 0.21 0.23 0.23 0.26 0.79 0.44 0.43 0.21 0.27 0.54 0.24 0.3 0.21 0.22 0.08 0.29 0.23 0.2 0.2 0.2 0.29 0.36 1.0
0.07 0.12 0.09 0.12 0.25 0.22 0.17 0.14 0.22 0.24 0.26 0.25 0.77 0.46 0.37 0.23 0.29 0.54 0.2 0.26 0.22 0.19 0.32 0.3 0.27 0.27 0.25 0.22 0.3 0.36 1.0
0.25 0.19 0.19 0.21 0.24 0.23 0.22 0.23 0.36 0.38 0.34 0.47 1.0 0.46 0.4 0.37 0.36 0.32 0.29 0.29 0.31 0.28 0.5 0.5 0.34 0.3 0.29 0.29 0.35 0.49 0.95
0.17 0.18 0.16 0.21 0.34 0.31 0.19 0.15 0.21 0.25 0.26 0.27 0.66 0.39 0.33 0.26 0.24 0.38 0.26 0.22 0.2 0.25 0.29 0.23 0.23 0.26 0.24 0.22 0.29 0.36 1.0
0.14 0.05 0.07 0.27 0.37 0.16 0.1 0.02 0.27 0.28 0.43 0.39 0.81 0.62 0.25 0.24 0.18 0.38 0.07 0.18 0.12 0.24 0.2 0.17 0.22 0.22 0.22 0.08 0.18 0.24 1.0
0.34 0.38 0.35 0.3 0.37 0.47 0.25 0.23 0.39 0.42 0.46 0.55 0.69 0.75 0.45 0.37 0.4 0.19 0.42 0.29 0.43 0.45 0.29 0.5 0.45 0.5 0.38 0.42 0.45 0.48 1.0
0.02 0.02 0.03 0.05 0.13 0.08 0.14 0.13 0.22 0.22 0.2 0.27 0.8 0.34 0.28 0.17 0.27 0.5 0.19 0.24 0.19 0.18 0.26 0.24 0.23 0.19 0.15 0.1 0.15 0.29 1.0
0.04 0.03 0.02 0.01 0.12 0.22 0.09 0.05 0.14 0.15 0.15 0.18 0.78 0.35 0.3 0.24 0.2 0.25 0.17 0.18 0.12 0.17 0.01 0.16 0.18 0.18 0.17 0.11 0.15 0.25 1.0
0.12 0.15 0.19 0.27 0.44 0.37 0.18 0.19 0.29 0.35 0.36 0.41 0.84 0.86 0.33 0.35 0.33 0.65 0.2 0.26 0.23 0.27 0.19 0.31 0.33 0.33 0.32 0.23 0.4 0.48 1.0
0.33 0.3 0.21 0.27 0.45 0.47 0.38 0.42 0.27 0.34 0.38 0.39 0.78 0.86 0.53 0.39 0.44 0.22 0.39 0.31 0.42 0.47 0.39 0.51 0.49 0.42 0.38 0.34 0.58 0.54 1.0
0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.06 0.09 0.08 0.08 0.13 0.13 0.81 0.11 0.26 0.11 0.17 0.46 0.06 0.09 0.06 0.05 0.22 0.18 0.12 0.08 0.03 0.04 0.1 0.22 1.0
0.16 0.19 0.2 0.23 0.35 0.33 0.32 0.26 0.34 0.35 0.34 0.38 0.63 0.44 0.44 0.37 0.42 0.33 0.38 0.39 0.32 0.33 0.36 0.36 0.36 0.38 0.34 0.28 0.44 0.5 1.0
0.41 0.44 0.42 0.43 0.54 0.54 0.52 0.56 0.56 0.55 0.65 0.65 0.86 0.84 0.68 0.58 0.6 0.51 0.6 0.56 0.54 0.57 0.59 0.63 0.58 0.58 0.58 0.56 0.7 0.69 1.0
0.07 0.09 0.06 0.06 0.16 0.19 0.08 0.09 0.19 0.18 0.21 0.26 0.82 0.37 0.33 0.17 0.2 0.59 0.19 0.13 0.15 0.14 0.19 0.22 0.15 0.09 0.13 0.15 0.19 0.26 1.0
0.11 0.08 0.07 0.12 0.43 0.29 0.16 0.12 0.21 0.18 0.19 0.19 0.8 0.29 0.24 0.2 0.15 0.4 0.16 0.15 0.14 0.15 0.34 0.2 0.16 0.14 0.16 0.17 0.24 0.27 1.0
0.28 0.29 0.24 0.28 0.62 0.44 0.23 0.27 0.38 0.39 0.43 0.44 0.94 0.52 0.42 0.32 0.32 0.5 0.31 0.28 0.23 0.28 0.68 0.31 0.29 0.29 0.35 0.24 0.36 0.44 1.0
0.21 0.19 0.16 0.26 0.32 0.4 0.28 0.43 0.3 0.4 0.36 0.43 0.69 0.74 0.54 0.34 0.38 0.5 0.31 0.26 0.32 0.39 0.57 0.37 0.33 0.36 0.34 0.33 0.55 0.55 1.0
0.14 0.14 0.1 0.18 0.25 0.2 0.24 0.28 0.29 0.28 0.27 0.37 1.0 0.57 0.4 0.3 0.34 0.34 0.22 0.3 0.28 0.26 0.28 0.45 0.36 0.25 0.26 0.34 0.26 0.33 0.98
0.34 0.35 0.31 0.37 0.48 0.48 0.34 0.37 0.42 0.42 0.46 0.55 0.86 0.89 0.66 0.48 0.51 0.29 0.45 0.39 0.45 0.45 0.43 0.55 0.48 0.49 0.42 0.46 0.58 0.59 1.0
0.5 0.5 0.41 0.48 0.56 0.61 0.34 0.36 0.49 0.46 0.52 0.54 0.84 0.86 0.61 0.48 0.51 0.27 0.57 0.46 0.46 0.53 0.47 0.64 0.56 0.52 0.48 0.47 0.52 0.56 1.0
0.16 0.17 0.21 0.17 0.22 0.19 0.19 0.16 0.2 0.28 0.24 0.3 0.89 0.36 0.39 0.28 0.28 0.51 0.33 0.26 0.21 0.25 0.14 0.26 0.26 0.22 0.23 0.18 0.3 0.35 1.0
0.02 0.02 0.04 0.03 0.06 0.07 0.09 0.07 0.1 0.11 0.12 0.15 0.69 0.16 0.21 0.1 0.14 0.29 0.11 0.13 0.08 0.08 0.01 0.12 0.1 0.06 0.05 0.05 0.13 0.19 1.0
0.03 0.07 0.09 0.17 0.17 0.14 0.13 0.1 0.17 0.16 0.23 0.15 0.79 0.33 0.33 0.21 0.2 0.53 0.15 0.21 0.14 0.18 0.22 0.22 0.25 0.15 0.15 0.12 0.23 0.29 1.0
0.19 0.18 0.2 0.22 0.29 0.35 0.23 0.24 0.34 0.33 0.38 0.49 0.99 0.61 0.4 0.37 0.38 0.22 0.21 0.28 0.32 0.39 0.28 0.49 0.46 0.34 0.33 0.33 0.33 0.37 1.0
0.06 0.06 0.05 0.06 0.18 0.12 0.09 0.07 0.14 0.18 0.18 0.21 0.78 0.25 0.27 0.19 0.21 0.31 0.16 0.19 0.14 0.14 0.04 0.2 0.19 0.17 0.16 0.14 0.19 0.29 1.0
0.37 0.37 0.33 0.29 0.5 0.47 0.37 0.39 0.43 0.42 0.43 0.51 0.82 0.86 0.6 0.44 0.45 0.6 0.42 0.42 0.48 0.5 0.66 0.49 0.54 0.44 0.45 0.45 0.54 0.59 1.0
0.15 0.18 0.16 0.21 0.31 0.34 0.26 0.26 0.26 0.29 0.31 0.26 0.84 0.7 0.55 0.3 0.31 0.54 0.34 0.28 0.26 0.25 0.3 0.27 0.23 0.25 0.25 0.21 0.36 0.34 1.0
0.13 0.09 0.15 0.19 0.36 0.31 0.26 0.25 0.36 0.41 0.4 0.34 0.88 0.41 0.51 0.38 0.39 0.58 0.42 0.38 0.3 0.29 0.1 0.4 0.37 0.35 0.31 0.3 0.38 0.51 1.0
0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.08 0.09 0.07 0.1 0.14 0.12 0.12 0.84 0.61 0.55 0.15 0.22 0.67 0.21 0.13 0.09 0.07 0.13 0.2 0.13 0.14 0.1 0.06 0.1 0.19 1.0
0.14 0.19 0.15 0.16 0.27 0.2 0.16 0.15 0.19 0.24 0.24 0.26 0.66 0.3 0.31 0.24 0.23 0.37 0.2 0.27 0.2 0.19 0.28 0.23 0.26 0.22 0.22 0.24 0.24 0.28 1.0
0.26 0.23 0.26 0.22 0.33 0.3 0.28 0.24 0.35 0.35 0.4 0.38 0.83 0.48 0.47 0.3 0.39 0.5 0.34 0.39 0.31 0.3 0.22 0.36 0.34 0.35 0.31 0.31 0.35 0.39 1.0
0.13 0.16 0.15 0.18 0.15 0.11 0.23 0.13 0.15 0.24 0.21 0.31 0.86 0.22 0.34 0.31 0.22 0.67 0.32 0.3 0.2 0.16 0.1 0.25 0.25 0.18 0.15 0.21 0.24 0.32 1.0
0.34 0.32 0.28 0.33 0.41 0.46 0.4 0.45 0.44 0.45 0.51 0.56 0.77 0.88 0.59 0.48 0.49 0.49 0.41 0.38 0.4 0.44 0.61 0.55 0.52 0.43 0.46 0.45 0.5 0.54 1.0
0.05 0.05 0.06 0.1 0.3 0.34 0.05 0.09 0.2 0.19 0.23 0.3 0.84 0.57 0.26 0.25 0.22 0.21 0.21 0.18 0.23 0.29 0.25 0.39 0.29 0.25 0.25 0.25 0.3 0.35 1.0
0.11 0.08 0.14 0.14 0.24 0.22 0.27 0.28 0.28 0.31 0.31 0.31 1.0 0.55 0.55 0.28 0.28 0.77 0.32 0.34 0.22 0.21 0.12 0.28 0.24 0.29 0.21 0.24 0.35 0.4 0.98
0.03 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.04 0.04 0.08 0.1 0.12 0.17 1.0 0.42 0.45 0.1 0.2 0.49 0.13 0.17 0.1 0.07 0.05 0.23 0.11 0.04 0.07 0.09 0.09 0.21 0.89
0.13 0.09 0.15 0.11 0.37 0.3 0.08 0.05 0.19 0.17 0.25 0.18 0.63 0.39 0.27 0.23 0.23 0.36 0.27 0.23 0.18 0.23 0.33 0.2 0.24 0.23 0.22 0.16 0.28 0.33 1.0
0.04 0.04 0.09 0.09 0.15 0.15 0.11 0.12 0.16 0.17 0.21 0.26 0.71 0.37 0.25 0.2 0.19 0.3 0.11 0.17 0.14 0.16 0.18 0.29 0.23 0.17 0.17 0.15 0.22 0.32 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)