Heatmap: Cluster_96 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_4301.1 (PUB26)	-0.39	0.05	-0.98	-1.45	0.28	0.37	0.08	-0.2	-0.29	-0.47	-0.14	-0.84	-0.04	0.62	0.75	0.62	0.48	-0.27	-0.17	-0.21	0.11	-0.01	-1.41	0.08	0.14	0.25	0.33	-0.08	0.25	0.01	-0.01
Lsat_1_v5_gn_1_18820.1 (KCS4)	-0.44	-0.37	-0.98	-1.1	-0.2	0.34	0.17	-0.13	-0.14	-0.2	-0.05	-0.13	0.3	0.14	0.32	0.4	0.3	-0.26	0.1	0.02	0.14	0.22	0.27	-0.0	0.06	0.21	0.12	0.13	-0.14	-0.17	0.01
Lsat_1_v5_gn_1_51040.1 (NPQ6)	0.24	0.08	-0.16	-0.5	0.22	0.36	0.17	0.03	-0.22	-0.26	-0.12	-0.29	-0.2	0.11	0.13	0.08	0.01	-1.57	0.24	0.02	0.18	0.18	-0.35	0.16	0.12	0.23	0.2	0.27	0.03	0.0	-0.47
Lsat_1_v5_gn_1_75221.1	-0.49	-0.3	-0.43	-0.42	0.53	0.71	0.27	0.03	-0.14	-0.06	-0.04	-0.05	-0.72	0.54	0.31	0.32	0.07	-0.87	0.17	-0.11	-0.04	-0.1	-0.25	-0.2	-0.06	0.12	0.29	0.05	0.11	-0.06	-0.49
Lsat_1_v5_gn_1_77780.1	0.52	0.06	-0.62	-0.83	0.9	0.84	-0.74	-0.8	-0.16	-0.32	-0.25	-0.58	-1.24	-0.35	0.11	0.17	-0.31	-0.05	0.83	-0.15	0.32	0.4	-1.21	-0.02	0.04	0.1	0.29	0.34	0.55	0.01	-1.54
Lsat_1_v5_gn_2_109001.1 (PIP2F)	-2.04	-1.83	-3.39	-3.26	-1.88	0.37	0.95	0.77	-1.03	-0.99	-1.31	-1.46	0.32	0.89	1.0	1.03	0.72	0.36	-0.18	-0.14	-0.12	-0.38	1.42	-0.37	0.08	-0.08	-0.12	-0.7	-0.19	0.17	-0.39
Lsat_1_v5_gn_2_40220.1	-0.52	-0.61	-1.09	-1.2	-0.16	0.19	0.29	0.16	0.02	-0.01	-0.01	-0.15	0.3	0.23	0.47	0.24	0.23	-1.06	0.18	0.05	0.18	0.16	0.09	0.02	0.17	0.23	0.19	0.23	-0.0	-0.14	-0.25
Lsat_1_v5_gn_2_76100.1 (ARQ1)	-0.81	-0.98	-1.05	-0.83	-0.04	0.67	0.19	0.23	-0.05	-0.14	0.08	-0.21	0.16	0.26	0.18	0.17	0.12	-0.63	0.15	0.15	-0.01	0.2	-0.24	0.27	0.25	0.17	0.21	0.27	-0.17	-0.09	-0.04
Lsat_1_v5_gn_2_84581.1	-0.23	-0.19	-0.69	-0.23	0.58	0.84	-0.02	0.06	-0.35	-0.48	-0.19	-0.26	0.29	0.05	0.06	0.34	0.21	-0.45	0.21	-0.31	0.07	0.13	-1.35	-0.26	-0.05	0.26	0.21	0.36	0.34	-0.03	-0.66
Lsat_1_v5_gn_2_92000.1 (LSF1)	-0.15	-0.47	-0.9	-1.34	0.46	1.08	-0.01	-0.3	-0.09	-0.27	-0.04	-0.67	-0.43	0.28	0.46	0.6	0.15	-2.4	0.29	0.07	0.34	0.42	-1.98	0.17	0.18	0.26	0.34	0.11	-0.24	-0.28	0.04
Lsat_1_v5_gn_2_93941.1 (CSN3)	-0.54	-0.7	-0.97	-1.41	-0.12	0.14	0.19	0.48	-0.45	-0.43	-0.22	-0.35	0.39	0.17	0.15	0.13	0.07	0.26	0.12	-0.09	-0.06	0.16	0.68	-0.05	-0.05	0.08	0.02	0.18	0.04	-0.05	0.49
Lsat_1_v5_gn_3_16220.1 (SYR1)	-0.02	-0.46	-0.66	-0.62	0.19	0.67	-0.36	-0.68	-0.39	-0.44	-0.22	-0.47	-0.03	0.56	0.09	0.4	0.14	-1.31	0.39	-0.04	0.29	0.32	-0.22	0.04	0.25	0.26	0.32	0.28	0.05	-0.05	-0.09
Lsat_1_v5_gn_3_2180.1 (VI1)	-4.22	-4.19	-3.28	-4.16	0.05	1.42	-0.72	-3.52	-0.52	-0.39	-0.58	-0.67	-1.0	-1.16	0.9	1.7	1.05	-1.01	-0.06	0.62	0.4	0.32	0.52	-0.1	0.19	0.41	0.42	-1.16	-0.46	0.08	0.56
Lsat_1_v5_gn_3_23181.1 (PQR2)	-1.08	-0.74	-1.26	-0.83	-0.15	0.13	0.43	0.61	-0.06	-0.15	0.06	-0.18	0.25	0.21	0.24	0.22	0.16	0.12	-0.02	-0.16	-0.04	-0.03	0.59	-0.06	0.11	-0.02	-0.06	-0.21	-0.0	0.11	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_3081.1 (VI1)	-0.66	-1.18	-0.52	-1.79	-0.28	1.91	-1.1	-2.67	-1.44	-1.02	-0.56	-1.11	0.73	0.33	0.72	1.64	0.79	-1.26	-0.26	-0.36	-0.06	0.31	-0.64	0.04	0.16	0.13	0.2	-1.08	-0.39	-0.21	-0.06
Lsat_1_v5_gn_3_4220.1	-0.38	-0.18	-0.81	-0.86	0.57	0.58	0.19	-0.08	-0.3	-0.28	-0.21	-0.41	-0.35	0.18	0.57	0.43	0.38	-1.05	0.3	0.11	0.13	0.24	-0.78	-0.08	0.11	0.17	0.26	0.26	-0.03	-0.15	-0.33
Lsat_1_v5_gn_3_46280.1	-1.37	-0.49	-1.66	-1.17	-0.19	0.2	0.39	0.79	-0.4	-0.25	-0.14	0.03	0.31	0.35	0.18	0.25	0.24	0.4	-0.06	-0.13	-0.03	-0.08	0.51	-0.01	0.01	0.15	0.1	-0.33	-0.21	0.0	0.19
Lsat_1_v5_gn_3_59241.1 (BBX14)	0.66	-0.37	0.13	-0.18	0.48	0.89	-0.18	-0.43	-0.19	-0.21	-0.05	-0.23	-0.37	-0.24	0.23	0.3	-0.03	-2.21	0.4	-0.21	0.06	0.19	-0.67	-0.17	-0.05	0.21	0.24	-0.07	0.07	-0.03	-0.25
Lsat_1_v5_gn_3_67100.1 (RVE1)	-0.32	-0.27	-1.94	-2.24	-0.43	1.11	-0.16	-0.45	-0.53	-0.74	-0.27	-0.92	0.33	0.46	0.27	0.6	0.08	-0.69	0.11	-0.2	0.22	0.47	-0.28	-0.05	0.33	0.58	0.53	0.09	0.06	0.02	0.1
Lsat_1_v5_gn_4_109001.1 (EIN4)	-1.68	-1.65	-2.15	-1.72	-0.28	0.84	0.15	-0.42	-0.02	0.18	0.06	-0.17	-0.12	-1.19	-0.33	0.71	0.35	-1.79	-0.0	0.52	0.39	0.56	0.02	0.37	0.45	0.8	0.62	0.77	-0.39	-0.38	-0.86
Lsat_1_v5_gn_4_11221.1 (CDF2)	-3.91	-2.85	-3.85	-4.92	-0.98	1.17	-0.04	-1.5	-0.8	-1.51	-1.23	-2.66	-0.25	0.82	1.14	0.96	0.46	0.51	0.68	0.27	0.48	0.52	-0.26	-0.01	0.56	0.91	0.76	0.07	-0.33	-0.64	-0.85
Lsat_1_v5_gn_4_120721.1 (CYP82C4)	-0.97	-1.09	-0.7	-0.73	0.83	0.66	-0.49	-1.79	-0.09	0.01	-0.1	0.24	0.73	-2.47	-0.11	0.86	0.56	0.44	-0.42	0.31	0.4	0.18	-1.09	-0.34	0.3	0.3	0.55	-0.12	-0.94	-0.86	0.44
Lsat_1_v5_gn_4_121781.1 (JAC1)	0.23	0.34	-0.17	-0.31	-0.22	0.39	0.4	0.19	0.03	-0.09	0.09	-0.32	-0.39	-0.44	-0.02	0.32	0.09	-3.49	-0.06	-0.05	0.1	0.17	-0.04	-0.16	0.0	0.28	0.12	0.21	0.18	0.12	-0.24
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Lsat_1_v5_gn_4_169820.1 (HYP1)	-0.54	-0.53	-0.8	-1.4	-0.13	0.29	0.28	0.17	-0.12	-0.09	0.03	-0.06	-0.19	0.01	0.02	0.32	0.3	-0.67	0.2	-0.08	0.16	0.22	0.18	-0.16	0.16	0.06	0.1	0.22	0.26	0.33	0.11
Lsat_1_v5_gn_4_175001.1 (BBX2)	-1.57	-1.87	-3.58	-2.5	-1.19	0.96	0.54	-0.64	0.04	0.37	0.09	-1.51	-1.79	-0.53	1.02	0.76	0.03	-4.12	0.68	0.7	0.57	0.39	-4.83	0.32	0.63	0.61	0.65	0.53	0.14	0.04	-0.77
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Lsat_1_v5_gn_4_78380.1	-0.75	-0.52	-0.75	-0.9	-0.36	0.16	0.41	0.2	-0.08	-0.16	-0.11	-0.13	0.41	0.18	0.36	0.19	0.15	-0.23	0.04	-0.01	0.15	-0.02	0.59	-0.1	-0.06	0.18	0.12	0.08	-0.09	-0.14	0.06
Lsat_1_v5_gn_5_106681.1	-1.18	-0.43	-2.43	-2.78	-0.58	1.21	1.58	-0.24	-0.09	-0.36	0.05	-1.01	0.91	-2.76	-0.1	0.28	0.33	-3.09	-0.83	0.18	0.49	0.72	-4.16	-0.15	0.25	0.78	0.83	0.9	-0.42	-0.88	-1.58
Lsat_1_v5_gn_5_122181.1 (NOI)	-0.04	-0.4	-0.5	-0.36	0.51	0.79	0.03	-0.43	-0.44	-0.31	-0.65	-0.63	-0.25	0.49	0.15	-0.19	-0.05	-0.01	-0.04	-0.02	-0.0	0.14	-0.23	0.01	0.16	0.25	0.3	0.28	0.21	0.04	-0.0
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Lsat_1_v5_gn_5_30800.1 (BSD2)	0.28	-0.17	-0.07	-0.11	-0.19	0.0	-0.24	-0.08	-0.05	-0.05	-0.07	-0.25	-0.27	0.22	0.09	-0.2	-0.3	-1.61	0.24	0.24	0.19	0.4	-0.81	0.34	0.26	0.42	0.33	0.22	-0.0	0.04	-0.16
Lsat_1_v5_gn_5_50601.1 (BAM9)	-0.83	-0.63	-1.36	-0.93	0.02	0.94	0.43	-0.63	0.22	-0.13	0.03	-0.65	0.15	-0.3	0.07	0.43	-0.09	-1.39	-0.08	-0.05	0.42	0.38	0.44	-0.03	0.1	0.45	0.23	0.34	0.15	0.11	-0.66
Lsat_1_v5_gn_5_50720.1 (BAM9)	-0.5	-0.3	-2.84	-3.05	-0.26	0.81	0.64	-0.67	0.17	-0.18	-0.17	-0.51	0.14	-1.27	-0.78	0.67	0.45	-2.71	-0.1	0.12	0.44	0.44	0.21	0.08	0.46	0.46	0.41	0.45	0.28	0.42	-0.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.