Heatmap: Cluster_96 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_4301.1 (PUB26)	0.45	0.62	0.3	0.22	0.72	0.77	0.63	0.52	0.49	0.43	0.54	0.33	0.58	0.92	1.0	0.92	0.83	0.5	0.53	0.52	0.64	0.59	0.22	0.63	0.66	0.71	0.75	0.57	0.71	0.6	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_18820.1 (KCS4)	0.56	0.59	0.39	0.35	0.66	0.96	0.85	0.69	0.69	0.66	0.73	0.69	0.93	0.83	0.94	1.0	0.93	0.64	0.81	0.77	0.84	0.88	0.92	0.76	0.79	0.88	0.83	0.83	0.69	0.68	0.76
Lsat_1_v5_gn_1_51040.1 (NPQ6)	0.92	0.82	0.7	0.55	0.91	1.0	0.88	0.79	0.67	0.65	0.72	0.64	0.68	0.84	0.86	0.82	0.79	0.26	0.92	0.79	0.88	0.89	0.61	0.87	0.85	0.92	0.9	0.94	0.8	0.78	0.56
Lsat_1_v5_gn_1_75221.1	0.43	0.5	0.46	0.46	0.88	1.0	0.74	0.63	0.56	0.59	0.6	0.59	0.37	0.89	0.76	0.76	0.64	0.33	0.69	0.57	0.59	0.57	0.52	0.53	0.59	0.66	0.75	0.63	0.66	0.59	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_77780.1	0.77	0.56	0.35	0.3	1.0	0.96	0.32	0.31	0.48	0.43	0.45	0.36	0.23	0.42	0.58	0.6	0.43	0.51	0.95	0.48	0.67	0.71	0.23	0.53	0.55	0.57	0.65	0.68	0.78	0.54	0.18
Lsat_1_v5_gn_2_109001.1 (PIP2F)	0.09	0.1	0.04	0.04	0.1	0.48	0.72	0.64	0.18	0.19	0.15	0.14	0.47	0.69	0.75	0.76	0.62	0.48	0.33	0.34	0.34	0.29	1.0	0.29	0.4	0.35	0.34	0.23	0.33	0.42	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_40220.1	0.5	0.47	0.34	0.31	0.65	0.82	0.88	0.81	0.73	0.72	0.72	0.65	0.89	0.85	1.0	0.86	0.85	0.35	0.82	0.75	0.82	0.81	0.77	0.73	0.81	0.85	0.82	0.85	0.72	0.65	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_76100.1 (ARQ1)	0.36	0.32	0.3	0.35	0.61	1.0	0.72	0.74	0.61	0.57	0.66	0.54	0.7	0.75	0.71	0.71	0.68	0.4	0.7	0.7	0.62	0.72	0.53	0.76	0.75	0.71	0.73	0.76	0.56	0.59	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_84581.1	0.48	0.49	0.35	0.48	0.83	1.0	0.55	0.58	0.44	0.4	0.49	0.47	0.68	0.58	0.58	0.71	0.64	0.41	0.65	0.45	0.59	0.61	0.22	0.46	0.54	0.67	0.65	0.71	0.71	0.55	0.35
Lsat_1_v5_gn_2_92000.1 (LSF1)	0.43	0.34	0.25	0.19	0.65	1.0	0.47	0.38	0.44	0.39	0.46	0.3	0.35	0.57	0.65	0.71	0.52	0.09	0.58	0.49	0.6	0.63	0.12	0.53	0.53	0.56	0.59	0.51	0.4	0.39	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_93941.1 (CSN3)	0.43	0.39	0.32	0.23	0.58	0.69	0.71	0.87	0.46	0.46	0.54	0.49	0.82	0.7	0.69	0.68	0.66	0.75	0.68	0.59	0.6	0.7	1.0	0.61	0.6	0.66	0.63	0.71	0.64	0.61	0.88
Lsat_1_v5_gn_3_16220.1 (SYR1)	0.62	0.46	0.4	0.41	0.72	1.0	0.49	0.39	0.48	0.47	0.54	0.45	0.62	0.93	0.67	0.83	0.69	0.25	0.83	0.61	0.77	0.79	0.54	0.65	0.75	0.75	0.79	0.76	0.65	0.61	0.59
Lsat_1_v5_gn_3_2180.1 (VI1)	0.02	0.02	0.03	0.02	0.32	0.83	0.19	0.03	0.22	0.24	0.21	0.19	0.15	0.14	0.57	1.0	0.64	0.15	0.3	0.47	0.41	0.38	0.44	0.29	0.35	0.41	0.41	0.14	0.22	0.33	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_23181.1 (PQR2)	0.31	0.39	0.27	0.37	0.59	0.72	0.89	1.0	0.63	0.59	0.68	0.58	0.78	0.76	0.78	0.77	0.73	0.72	0.65	0.59	0.64	0.64	0.99	0.63	0.71	0.65	0.63	0.57	0.66	0.71	0.75
Lsat_1_v5_gn_3_3081.1 (VI1)	0.17	0.12	0.19	0.08	0.22	1.0	0.12	0.04	0.1	0.13	0.18	0.12	0.44	0.34	0.44	0.83	0.46	0.11	0.22	0.21	0.26	0.33	0.17	0.27	0.3	0.29	0.31	0.13	0.2	0.23	0.25
Lsat_1_v5_gn_3_4220.1	0.51	0.59	0.38	0.37	1.0	1.0	0.76	0.64	0.55	0.55	0.58	0.5	0.53	0.76	1.0	0.9	0.87	0.32	0.83	0.72	0.73	0.79	0.39	0.63	0.72	0.75	0.8	0.8	0.66	0.61	0.53
Lsat_1_v5_gn_3_46280.1	0.22	0.41	0.18	0.26	0.51	0.66	0.76	1.0	0.44	0.49	0.53	0.59	0.72	0.74	0.65	0.69	0.68	0.77	0.55	0.53	0.57	0.55	0.82	0.57	0.58	0.64	0.62	0.46	0.5	0.58	0.66
Lsat_1_v5_gn_3_59241.1 (BBX14)	0.85	0.42	0.59	0.48	0.75	1.0	0.48	0.4	0.47	0.47	0.52	0.46	0.42	0.46	0.63	0.67	0.53	0.12	0.71	0.47	0.56	0.61	0.34	0.48	0.52	0.62	0.64	0.51	0.56	0.53	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_67100.1 (RVE1)	0.37	0.38	0.12	0.1	0.34	1.0	0.41	0.34	0.32	0.28	0.38	0.24	0.58	0.64	0.56	0.7	0.49	0.29	0.5	0.4	0.54	0.64	0.38	0.45	0.58	0.69	0.67	0.49	0.48	0.47	0.49
Lsat_1_v5_gn_4_109001.1 (EIN4)	0.17	0.18	0.13	0.17	0.46	1.0	0.62	0.42	0.55	0.63	0.58	0.5	0.51	0.24	0.44	0.91	0.71	0.16	0.56	0.8	0.73	0.82	0.56	0.72	0.76	0.97	0.85	0.95	0.42	0.43	0.31
Lsat_1_v5_gn_4_11221.1 (CDF2)	0.03	0.06	0.03	0.01	0.23	1.0	0.43	0.16	0.26	0.16	0.19	0.07	0.38	0.79	0.98	0.87	0.61	0.63	0.71	0.54	0.62	0.64	0.37	0.44	0.66	0.83	0.76	0.47	0.35	0.29	0.25
Lsat_1_v5_gn_4_120721.1 (CYP82C4)	0.28	0.26	0.34	0.33	0.98	0.87	0.39	0.16	0.52	0.56	0.51	0.65	0.91	0.1	0.51	1.0	0.81	0.75	0.41	0.68	0.73	0.62	0.26	0.43	0.68	0.68	0.81	0.51	0.29	0.3	0.75
Lsat_1_v5_gn_4_121781.1 (JAC1)	0.89	0.96	0.67	0.61	0.65	0.99	1.0	0.87	0.77	0.71	0.81	0.61	0.58	0.56	0.75	0.95	0.81	0.07	0.73	0.73	0.81	0.85	0.73	0.68	0.76	0.92	0.82	0.88	0.86	0.82	0.64
Lsat_1_v5_gn_4_15060.1	0.32	0.36	0.27	0.34	0.6	0.63	0.56	0.7	0.45	0.43	0.53	0.56	0.72	0.67	0.68	0.65	0.59	0.62	0.66	0.58	0.6	0.67	1.0	0.57	0.64	0.73	0.69	0.62	0.63	0.7	0.77
Lsat_1_v5_gn_4_169820.1 (HYP1)	0.54	0.55	0.46	0.3	0.73	0.97	0.96	0.89	0.73	0.74	0.81	0.76	0.69	0.8	0.8	0.99	0.97	0.5	0.91	0.75	0.89	0.92	0.9	0.71	0.89	0.83	0.85	0.92	0.95	1.0	0.86
Lsat_1_v5_gn_4_175001.1 (BBX2)	0.17	0.13	0.04	0.09	0.22	0.95	0.72	0.32	0.51	0.64	0.52	0.17	0.14	0.34	1.0	0.83	0.5	0.03	0.79	0.8	0.73	0.65	0.02	0.62	0.76	0.75	0.77	0.71	0.54	0.51	0.29
Lsat_1_v5_gn_4_31280.1	0.96	0.81	0.72	0.57	0.85	1.0	0.7	0.58	0.71	0.66	0.71	0.67	0.8	0.78	0.65	0.82	0.8	0.22	0.71	0.72	0.82	0.84	0.63	0.8	0.86	0.84	0.83	0.86	0.74	0.72	0.62
Lsat_1_v5_gn_4_47601.1	0.22	0.48	0.41	0.47	0.74	0.65	0.56	0.34	0.57	0.68	0.72	0.74	0.95	0.25	0.46	1.0	0.99	0.41	0.39	0.54	0.64	0.68	0.17	0.46	0.66	0.71	0.64	0.56	0.41	0.48	0.69
Lsat_1_v5_gn_4_78380.1	0.4	0.46	0.39	0.36	0.52	0.74	0.88	0.77	0.63	0.59	0.62	0.61	0.88	0.75	0.86	0.76	0.74	0.57	0.68	0.66	0.74	0.66	1.0	0.62	0.64	0.75	0.72	0.7	0.62	0.6	0.69
Lsat_1_v5_gn_5_106681.1	0.15	0.25	0.06	0.05	0.22	0.78	1.0	0.28	0.32	0.26	0.35	0.17	0.63	0.05	0.31	0.41	0.42	0.04	0.19	0.38	0.47	0.55	0.02	0.3	0.4	0.58	0.59	0.63	0.25	0.18	0.11
Lsat_1_v5_gn_5_122181.1 (NOI)	0.56	0.44	0.41	0.45	0.83	1.0	0.59	0.43	0.43	0.47	0.37	0.37	0.49	0.81	0.64	0.51	0.56	0.58	0.56	0.57	0.58	0.64	0.49	0.58	0.64	0.69	0.71	0.7	0.67	0.59	0.58
Lsat_1_v5_gn_5_129701.1	0.42	0.25	0.13	0.15	0.72	1.0	0.29	0.22	0.26	0.37	0.26	0.21	0.16	0.44	0.54	0.38	0.24	0.1	0.26	0.23	0.43	0.55	0.02	0.33	0.5	0.51	0.57	0.34	0.35	0.24	0.47
Lsat_1_v5_gn_5_150061.1 (NPU)	0.48	0.46	0.37	0.37	0.74	0.87	0.87	0.88	0.63	0.53	0.62	0.57	1.0	0.87	0.85	0.78	0.84	0.95	0.73	0.7	0.71	0.85	0.98	0.69	0.69	0.74	0.8	0.73	0.77	0.73	0.87
Lsat_1_v5_gn_5_164480.1 (WCRKC1)	0.62	0.37	0.35	0.37	0.75	1.0	0.27	0.36	0.35	0.32	0.4	0.32	0.35	0.55	0.48	0.52	0.44	0.07	0.52	0.41	0.5	0.57	0.1	0.52	0.52	0.51	0.58	0.65	0.45	0.45	0.34
Lsat_1_v5_gn_5_172501.1 (DIV1)	0.22	0.4	0.31	0.31	0.55	0.69	0.54	0.41	0.39	0.38	0.47	0.36	0.71	0.59	1.0	0.85	0.71	0.43	0.64	0.57	0.55	0.61	0.66	0.46	0.58	0.72	0.71	0.53	0.76	0.64	0.7
Lsat_1_v5_gn_5_30800.1 (BSD2)	0.91	0.66	0.71	0.69	0.66	0.75	0.63	0.71	0.72	0.72	0.71	0.63	0.62	0.87	0.8	0.65	0.61	0.24	0.89	0.89	0.85	0.99	0.43	0.94	0.9	1.0	0.94	0.87	0.75	0.77	0.67
Lsat_1_v5_gn_5_50601.1 (BAM9)	0.29	0.34	0.2	0.27	0.53	1.0	0.7	0.34	0.61	0.48	0.53	0.33	0.58	0.42	0.55	0.7	0.49	0.2	0.49	0.5	0.7	0.68	0.71	0.51	0.56	0.71	0.61	0.66	0.58	0.56	0.33
Lsat_1_v5_gn_5_50720.1 (BAM9)	0.4	0.46	0.08	0.07	0.48	1.0	0.89	0.36	0.64	0.5	0.51	0.4	0.63	0.24	0.33	0.91	0.78	0.09	0.53	0.62	0.77	0.78	0.66	0.6	0.79	0.79	0.76	0.78	0.69	0.76	0.39
Lsat_1_v5_gn_5_5940.1 (TZ)	0.96	0.51	0.39	0.2	0.95	1.0	0.41	0.39	0.37	0.32	0.41	0.37	0.44	0.65	0.4	0.65	0.59	0.02	0.83	0.48	0.56	0.65	0.02	0.65	0.62	0.51	0.61	0.89	0.46	0.39	0.35
Lsat_1_v5_gn_6_9700.1 (SMO1-2)	0.43	0.46	0.39	0.36	0.55	0.77	0.87	0.86	0.62	0.56	0.65	0.56	0.86	0.79	0.81	0.86	0.78	0.65	0.71	0.68	0.71	0.74	1.0	0.64	0.72	0.72	0.72	0.69	0.63	0.64	0.89
Lsat_1_v5_gn_7_13780.1	0.79	0.74	0.67	0.66	0.84	0.93	1.0	0.89	0.86	0.82	0.9	0.79	0.86	0.66	0.76	0.91	0.86	0.63	0.77	0.82	0.87	0.88	0.96	0.83	0.89	0.89	0.88	0.96	0.83	0.87	0.9
Lsat_1_v5_gn_7_18280.1	0.77	0.62	0.49	0.46	0.55	0.83	0.91	0.77	0.73	0.68	0.72	0.64	0.43	0.93	0.96	0.82	0.73	0.44	0.98	0.97	0.96	0.94	0.41	0.87	0.91	0.94	1.0	0.92	0.87	0.95	0.51
Lsat_1_v5_gn_7_32261.1	0.31	0.29	0.13	0.05	0.37	0.73	0.73	1.0	0.51	0.5	0.49	0.47	0.96	0.55	0.63	0.82	0.67	0.15	0.66	0.6	0.57	0.73	0.7	0.79	0.69	0.64	0.63	0.8	0.48	0.54	0.26
Lsat_1_v5_gn_7_34400.1	0.91	0.59	0.5	0.46	0.82	1.0	0.71	0.78	0.73	0.65	0.64	0.54	0.64	0.83	0.8	0.76	0.72	0.28	0.63	0.7	0.89	0.76	0.36	0.71	0.74	0.74	0.74	0.8	0.73	0.72	0.67
Lsat_1_v5_gn_7_45600.1 (BR1)	0.44	0.45	0.24	0.23	0.49	1.0	0.77	0.59	0.58	0.55	0.6	0.54	0.57	0.72	0.6	0.85	0.66	0.34	0.52	0.58	0.71	0.72	0.29	0.74	0.68	0.79	0.89	0.68	0.57	0.6	0.5
Lsat_1_v5_gn_7_59161.1	0.47	0.46	0.25	0.21	0.63	1.0	0.81	0.8	0.53	0.61	0.6	0.54	0.74	0.78	0.96	0.84	0.78	0.55	0.79	0.71	0.71	0.78	0.72	0.69	0.73	0.77	0.71	0.8	0.61	0.61	0.68
Lsat_1_v5_gn_7_6361.1	0.38	0.38	0.13	0.1	0.48	1.0	0.62	0.35	0.49	0.39	0.46	0.32	0.24	0.14	0.22	0.82	0.59	0.06	0.32	0.42	0.68	0.57	0.18	0.43	0.47	0.66	0.64	0.51	0.35	0.34	0.14
Lsat_1_v5_gn_7_6381.1	0.3	0.34	0.21	0.22	0.57	1.0	0.76	0.4	0.57	0.38	0.55	0.33	0.24	0.19	0.23	0.64	0.48	0.58	0.36	0.41	0.59	0.59	0.71	0.49	0.49	0.6	0.64	0.59	0.34	0.37	0.32
Lsat_1_v5_gn_8_122140.1	0.08	0.09	0.13	0.32	0.51	0.41	0.48	0.39	0.37	0.51	0.36	0.53	1.0	0.08	0.29	0.47	0.5	0.5	0.35	0.53	0.43	0.46	0.01	0.41	0.45	0.56	0.51	0.52	0.13	0.09	0.3
Lsat_1_v5_gn_8_147620.1 (ENY2)	0.65	0.52	0.46	0.52	0.93	1.0	0.69	0.65	0.63	0.64	0.6	0.52	0.85	0.72	0.76	0.72	0.65	0.66	0.7	0.63	0.79	0.84	0.9	0.66	0.74	0.82	0.83	0.93	0.75	0.69	0.68
Lsat_1_v5_gn_8_166560.1	0.36	0.36	0.31	0.39	0.48	0.61	0.7	0.62	0.49	0.46	0.57	0.52	0.67	0.72	0.71	0.75	0.61	0.59	0.59	0.64	0.7	0.64	1.0	0.62	0.66	0.73	0.71	0.68	0.58	0.73	0.69
Lsat_1_v5_gn_8_40020.1 (RAP2.2)	0.2	0.31	0.21	0.21	0.45	0.5	0.7	1.0	0.38	0.43	0.43	0.51	0.71	0.81	0.67	0.66	0.66	0.64	0.51	0.54	0.49	0.47	0.47	0.59	0.55	0.54	0.51	0.44	0.44	0.49	0.81
Lsat_1_v5_gn_8_46340.1	0.18	0.21	0.14	0.2	0.41	1.0	0.53	0.27	0.33	0.3	0.36	0.21	0.25	0.35	0.42	0.61	0.41	0.14	0.38	0.35	0.55	0.54	0.13	0.36	0.48	0.55	0.55	0.57	0.42	0.37	0.24
Lsat_1_v5_gn_8_69941.1	0.38	0.41	0.33	0.51	0.78	0.91	0.99	0.93	0.82	0.86	0.89	0.93	1.0	0.96	0.94	0.89	0.89	0.45	0.73	0.83	0.81	0.92	0.88	0.83	0.88	1.0	0.93	0.85	0.69	0.7	0.93
Lsat_1_v5_gn_8_95421.1	0.74	0.71	0.69	0.71	0.8	1.0	1.0	0.88	0.84	0.84	0.83	0.65	0.68	0.78	0.9	0.87	0.74	0.24	0.8	0.72	0.82	0.81	0.77	0.73	0.78	0.88	0.84	0.8	0.88	0.87	0.66
Lsat_1_v5_gn_9_28921.1	0.14	0.25	0.09	0.04	0.27	1.0	0.19	0.12	0.06	0.04	0.07	0.04	0.26	0.71	0.52	0.47	0.23	0.56	0.27	0.24	0.23	0.21	0.09	0.25	0.22	0.56	0.34	0.22	0.17	0.26	0.25
Lsat_1_v5_gn_9_30040.1	0.7	0.57	0.56	0.56	0.81	1.0	0.59	0.54	0.53	0.51	0.61	0.54	0.62	0.71	0.69	0.75	0.63	0.55	0.56	0.61	0.7	0.71	0.64	0.66	0.69	0.81	0.79	0.77	0.61	0.56	0.55
Lsat_1_v5_gn_9_6400.1 (HSP1)	0.72	0.62	0.52	0.48	0.61	0.85	0.78	0.64	0.77	0.71	0.75	0.71	0.79	0.66	0.69	0.79	0.77	0.42	0.57	0.7	0.77	0.75	1.0	0.74	0.78	0.74	0.78	0.81	0.68	0.65	0.69
Lsat_1_v5_gn_9_9761.1 (PSBW)	0.47	0.26	0.26	0.26	1.0	0.68	0.19	0.29	0.27	0.22	0.26	0.24	0.25	0.49	0.29	0.41	0.41	0.05	0.79	0.47	0.54	0.61	0.04	0.54	0.58	0.46	0.54	0.98	0.38	0.29	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)