Heatmap: Cluster_115 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.65 2.4 -0.56 -1.35 0.91 0.75 -1.93 0.13 -2.4 -4.0 -0.54 -1.78 -0.57 - - 0.7 -1.09 - - -1.94 -1.36 -1.88 2.37 0.86 1.39 -0.73 0.65 -0.62 -2.77 -1.15 -2.21
-0.63 -0.95 -0.8 -0.51 0.57 0.79 -0.48 -1.16 -0.23 -0.07 -0.09 -0.25 -0.11 0.31 0.27 0.36 0.13 0.02 0.25 -0.11 0.0 0.12 0.1 -0.29 0.06 0.34 0.29 0.3 -0.05 -0.09 0.09
- - -1.33 -1.33 -0.03 0.08 -0.84 -1.12 -3.47 -1.74 -1.53 -0.94 - -1.0 -1.5 -1.32 -1.21 -1.77 -0.76 -1.86 - - 3.73 1.62 0.97 -2.43 0.51 -2.17 0.37 -0.23 -0.4
-0.66 -0.4 -0.64 -0.25 1.45 0.8 0.44 -0.42 0.15 0.18 0.39 0.35 -0.26 -0.05 0.26 -0.06 -0.18 0.02 -0.03 -0.22 0.01 0.21 -0.3 -1.31 -0.97 -0.63 -1.12 -0.8 0.81 -0.1 -0.41
-1.56 -4.1 -1.62 0.03 2.19 1.01 -4.51 - 0.39 -0.53 -0.04 1.15 -1.57 -1.89 -1.63 -0.01 -0.37 -2.96 -0.75 -0.36 0.8 1.17 - 0.59 0.69 0.1 0.71 0.1 -1.45 -0.48 0.35
-1.82 -1.64 -1.42 -0.51 1.55 1.16 -0.92 -0.47 -0.08 0.06 0.02 0.12 -1.63 0.71 0.45 0.01 -0.15 -2.92 -0.45 0.07 -0.13 -0.05 0.44 -0.55 -0.05 -0.1 0.17 -0.39 0.79 0.56 -0.42
-0.96 -1.19 -0.43 -0.1 1.25 1.33 -0.87 -1.67 -0.08 -0.18 0.12 -0.26 -0.76 -0.18 0.06 0.57 -0.09 -0.24 -0.24 -0.42 -0.06 0.21 0.65 -0.58 -0.06 0.3 0.32 0.03 -0.15 -0.05 -0.31
-0.42 -0.19 -0.25 0.19 0.59 0.3 -0.49 -0.24 -0.09 0.04 0.29 0.05 -0.37 0.66 0.7 0.25 -0.03 -0.62 0.02 -0.35 -0.01 -0.01 -1.33 -0.49 -0.36 -0.19 0.21 -0.08 0.39 0.39 -0.31
-2.43 -0.55 -0.28 0.03 1.93 1.07 -0.11 -0.95 0.62 0.68 0.61 -0.24 -8.08 -1.46 0.54 0.15 -0.83 -3.27 0.29 -0.01 -0.14 0.12 -2.69 -0.45 -0.45 -0.35 -0.04 -1.93 0.48 0.75 -0.17
-3.73 -3.16 -0.75 -0.38 1.65 0.87 -0.7 -0.84 -0.74 0.05 0.97 0.29 0.32 -0.23 -0.02 -0.15 -0.22 0.09 -0.5 0.07 -0.26 0.44 -1.24 0.23 -0.54 -0.64 -0.25 -0.18 0.35 0.33 0.55
-0.26 -0.34 -0.29 -0.12 0.93 0.61 -0.31 -0.69 -0.23 0.06 -0.12 -0.06 -0.03 0.31 0.56 -0.01 -0.09 -0.88 -0.13 -0.24 0.08 0.02 0.29 -0.25 -0.03 0.01 0.04 0.12 0.02 -0.04 -0.2
-0.36 0.07 -0.08 -0.13 0.67 0.62 0.03 -0.34 0.02 -0.01 0.15 -0.14 -0.65 0.02 0.37 0.31 -0.14 -0.92 -0.11 -0.15 0.01 -0.0 -0.05 -0.36 -0.24 0.06 0.02 -0.4 0.21 0.28 0.16
-1.05 0.03 -1.39 -0.84 1.71 1.88 -1.1 -0.97 -0.14 0.01 -0.93 -0.31 -1.53 0.36 0.04 0.54 -1.44 0.1 0.05 -0.84 -0.6 -0.36 1.57 -0.34 -0.07 0.06 -0.46 -0.11 -0.52 -1.08 -2.24
-1.03 -0.37 -0.99 -1.49 -0.5 -0.34 0.14 0.17 -0.27 -0.21 -0.0 -0.65 -0.29 -2.38 -1.55 -0.25 -0.15 -0.77 -0.28 0.07 -0.6 -0.07 1.75 1.48 1.27 0.44 0.07 -0.02 -0.42 0.15 -0.29
- - - - 2.71 -0.11 -4.05 -3.02 1.35 1.02 0.9 0.52 - - - -0.02 -0.8 -3.07 -1.35 0.56 -0.5 1.35 - -0.34 0.13 0.42 0.98 -0.81 -0.59 0.46 -0.26
-2.37 -0.47 -0.23 -0.13 1.1 0.64 -0.13 0.14 -0.1 0.57 0.32 -0.54 -1.4 -1.3 -0.76 0.22 0.27 0.38 -0.34 -0.05 0.09 -0.11 1.07 -0.06 -0.36 -0.18 -0.25 -1.87 -0.26 0.65 0.28
-0.23 -0.08 -0.83 -0.53 0.2 0.43 0.41 0.63 -0.29 -0.12 -0.11 -0.03 0.09 -0.07 0.13 0.18 0.07 -0.32 -0.01 -0.03 -0.04 0.05 0.25 -0.1 -0.11 0.11 0.03 0.13 -0.03 -0.13 -0.46
-0.89 - -1.52 0.11 1.29 -1.65 -1.5 -2.44 1.23 1.23 0.69 1.18 -0.57 - -1.43 0.67 0.04 -0.65 -0.17 0.58 -1.79 0.25 - -0.06 -0.58 -0.07 -0.27 -0.44 -0.74 0.57 1.47
-1.12 -0.86 -0.84 -0.23 0.77 0.64 -0.27 -0.65 0.01 -0.01 -0.18 -0.24 0.14 0.31 0.09 0.04 -0.07 0.43 0.12 -0.1 -0.26 0.02 -0.05 -0.09 -0.16 0.01 0.15 0.03 0.09 0.24 0.4
-5.15 -0.45 -1.86 -4.23 0.99 0.79 -2.48 0.06 -1.4 -2.81 -1.34 -1.56 -0.21 0.92 -0.34 -0.39 -1.24 0.25 -1.09 -2.23 -1.03 -0.83 1.91 2.49 1.74 -1.51 -0.09 -1.5 -0.27 -1.74 -0.84
- - - - - - - - - - - - - - - - - 0.35 - - - - 3.85 1.68 3.04 - 1.65 - -0.46 - -
- - -3.68 - 1.13 -0.73 -4.02 0.06 - - -1.91 -3.19 -1.93 - - -0.94 - - - - - -1.74 1.35 3.67 2.47 - 1.18 - 0.67 -1.46 -1.05
-0.47 0.13 -0.2 -0.42 0.81 0.36 -0.75 -0.35 -0.67 -0.62 -0.4 -0.77 -0.57 0.64 0.28 -0.27 -1.04 0.4 -0.51 -0.99 -0.82 -0.67 1.88 0.49 0.88 -0.81 -0.32 -0.92 0.26 0.03 0.02
-1.18 -1.29 -3.44 - 1.82 0.28 -3.2 -0.23 -1.87 -2.15 -0.32 -1.58 -0.3 -4.77 -3.52 -0.57 -2.6 - -6.59 -4.35 -2.81 -1.05 1.75 3.41 1.88 -3.09 0.38 -2.45 -1.34 -1.61 -1.87
-0.3 -0.33 -0.29 -0.17 0.81 0.87 -0.06 -0.05 -0.1 -0.07 0.09 -0.08 -0.57 0.4 0.25 0.03 -0.29 -1.09 -0.0 -0.19 0.01 0.11 0.22 -0.24 -0.03 0.24 0.27 -0.23 -0.06 -0.18 -0.38
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - 3.9 - - - - - -
-0.78 1.71 0.13 -0.57 1.76 0.95 -2.29 0.57 -1.19 -0.46 0.39 -0.78 -2.38 - -6.83 0.61 -2.36 -5.13 -6.25 -3.5 -1.09 -0.41 2.06 1.02 0.95 -1.77 -0.38 -1.18 -0.25 -0.2 -0.53
-2.41 0.69 -1.1 -2.86 0.68 0.38 -3.77 0.39 -1.66 -2.04 -0.97 -2.2 -3.18 - - 0.02 -4.88 -5.42 -4.94 -3.26 -1.87 -2.24 2.89 2.54 2.28 -2.11 -0.6 -4.75 -0.7 -0.36 -0.25
- -2.54 -4.12 -3.83 1.65 1.36 -0.88 -1.4 0.03 0.7 0.62 -0.59 -2.57 -3.13 0.07 0.67 -1.06 -3.14 -0.2 0.45 0.14 -0.53 1.59 1.44 0.54 -0.7 0.13 -2.12 -0.25 -0.16 -0.3
- - - - 2.45 1.85 -2.05 -1.68 -0.01 -0.31 1.39 -0.91 -1.53 - -3.59 -0.36 -1.2 - - -0.5 -0.22 -0.77 2.43 1.84 1.1 -2.58 0.06 -2.84 -3.77 - -3.89
-1.36 2.16 -0.85 -3.79 0.57 0.82 -2.9 1.22 -2.72 -1.77 -0.45 -1.43 -2.21 - -4.85 0.58 -2.54 - - -6.26 -1.27 -0.93 2.53 1.84 1.51 -0.87 0.01 -1.02 -1.32 -1.16 -1.98
-0.6 1.88 -0.99 -5.22 0.96 0.59 -1.87 0.43 -1.58 -2.63 -0.42 -1.08 -1.27 - - 0.61 -2.12 -2.27 - - -1.26 -1.02 3.25 1.1 0.99 -1.64 -1.25 -1.07 -2.56 -0.89 -0.98
-0.35 0.19 -0.15 -0.2 1.21 0.6 -0.43 0.85 -0.96 -0.32 -0.01 -0.43 -0.74 -5.14 -3.0 0.46 -1.87 -1.06 -1.46 -2.47 -0.1 0.01 1.42 0.95 0.91 -1.35 -0.18 -1.52 0.78 0.5 0.33
-0.04 -0.24 -0.19 0.4 0.8 0.68 -0.55 -1.72 0.52 0.42 0.49 0.07 -0.95 -1.37 -0.85 -0.0 -0.37 -0.27 0.36 -0.24 -0.15 -0.27 -0.17 0.04 -0.04 0.02 0.24 0.03 0.06 0.23 0.24
-0.05 -0.17 -0.64 -0.56 0.63 0.9 0.18 0.11 -0.07 -0.11 0.12 -0.34 -0.31 -0.11 0.03 0.27 -0.39 -0.4 -0.03 -0.36 -0.05 0.03 0.67 -0.21 -0.19 0.01 -0.14 -0.27 0.12 0.27 -0.26
-1.35 -0.85 -1.54 -0.98 0.96 1.02 -0.1 -0.39 0.26 0.14 0.24 -0.08 -1.37 -0.52 -0.05 0.4 -0.14 -1.47 -0.04 -0.07 -0.06 0.19 0.96 -0.06 0.05 0.26 0.3 -0.46 0.2 0.36 -0.12
-0.57 -0.56 -0.97 -0.73 0.66 0.56 0.58 0.54 -0.13 -0.15 -0.12 -0.36 -0.33 -0.4 0.18 0.28 0.1 -0.36 -0.04 -0.17 -0.04 0.04 0.72 -0.3 -0.15 0.0 0.02 -0.05 0.31 0.1 -0.4
-0.29 -0.06 -0.24 0.47 0.85 0.44 -0.47 -1.05 0.26 0.33 0.39 0.17 -0.99 0.12 0.35 0.47 0.07 -1.22 0.03 -0.03 0.06 0.03 -2.02 -0.57 -0.36 0.14 0.22 0.17 0.27 0.1 -0.81
-0.03 0.9 -0.12 -0.32 0.59 -0.12 -1.01 0.03 -0.37 -0.23 0.09 0.0 0.2 -1.1 -0.93 0.2 -0.89 -1.7 -1.21 -1.0 -0.17 -0.43 1.14 0.89 0.72 -0.59 -0.12 -0.64 0.34 0.2 0.79
-0.15 -0.26 -0.19 0.21 0.37 0.24 -0.16 -0.57 0.14 0.1 0.14 0.15 -0.26 -0.2 -0.07 0.18 0.01 -0.27 -0.16 0.06 0.05 0.1 -0.23 -0.15 0.0 -0.03 0.1 0.4 0.25 0.02 -0.35
-0.43 -0.58 -0.51 -0.15 0.23 0.2 -0.22 -0.6 0.08 0.04 0.16 0.09 -0.29 -0.02 0.2 0.04 0.23 -0.26 0.01 0.15 -0.07 0.03 0.6 -0.01 0.03 0.01 -0.05 0.09 -0.03 0.12 0.23
0.21 -0.46 -1.26 -1.56 1.19 0.81 -0.35 -0.55 0.36 0.15 0.19 -0.17 -2.31 -0.86 0.49 0.56 0.31 -6.31 -0.16 -0.0 0.4 0.36 -1.58 -0.11 0.12 0.27 0.51 -0.17 0.47 0.35 -0.93
-1.35 -0.9 -1.01 -0.16 -0.55 -0.54 0.15 -0.41 0.09 0.39 0.04 -0.53 0.24 -0.14 -0.36 -0.18 0.05 - -0.01 0.4 0.47 -0.43 1.08 1.15 1.04 -0.14 0.06 -0.33 -0.23 0.37 -0.28
-2.78 -1.72 -2.76 -3.12 1.16 1.61 -0.02 -0.3 -0.32 -0.34 -0.1 -1.02 -1.49 -1.61 -0.45 0.11 -0.09 0.39 -0.26 -0.1 0.09 0.39 1.12 -0.99 0.02 0.37 0.44 -1.11 1.26 0.59 -0.77
0.12 0.32 -0.07 0.24 1.56 1.17 -0.73 -1.28 0.14 0.22 0.39 -0.15 -1.97 -0.12 0.68 0.79 -0.4 -2.15 0.24 -0.19 -0.03 -0.23 -2.54 -0.62 -0.47 -0.24 -0.11 -1.39 0.21 0.04 -0.81
-0.67 -0.53 -1.02 -1.56 0.05 -0.09 -0.99 1.09 -0.99 -0.7 -1.27 -0.08 0.36 -2.08 -1.82 -0.15 -2.23 -1.16 -1.52 -2.02 -1.11 -0.66 2.63 1.32 1.29 -1.14 -0.06 -1.03 0.41 -0.25 0.58
-0.48 -0.08 -0.61 -1.01 0.52 -0.25 -1.12 1.2 -1.55 -0.73 -0.34 -0.89 -1.18 -2.72 -2.17 0.22 -1.58 -2.08 -2.2 -2.89 -0.75 -0.63 2.84 1.58 1.4 -1.81 -0.87 -2.22 0.35 -0.07 -0.52
-1.73 -2.45 -1.54 -0.36 1.0 0.86 0.27 -0.81 0.08 0.34 0.44 0.21 -0.93 -0.85 -0.34 0.29 -0.78 0.43 -0.32 0.11 0.27 0.52 0.92 -0.47 -0.19 0.15 -0.11 -0.2 0.46 -0.24 -0.35
-1.93 -0.78 -0.34 -0.47 1.52 1.1 -0.9 -1.12 0.87 0.9 0.82 0.03 -3.56 -2.61 -0.42 0.48 -0.15 -5.88 -0.98 -0.04 0.22 0.11 -2.4 0.4 0.35 -0.13 0.63 -0.91 0.42 0.34 -0.43
-1.39 -1.49 -1.19 -0.8 0.08 0.5 0.05 -0.11 0.06 -0.01 0.22 0.1 -0.56 0.15 0.5 0.17 0.05 -1.15 -0.05 -0.03 -0.05 0.37 0.96 -0.07 0.16 0.09 0.26 0.09 -0.02 0.02 0.25
-0.94 1.03 -1.95 -2.64 1.62 2.19 -0.35 -0.57 -1.89 -2.09 -1.06 -2.59 -0.68 -0.5 -0.22 -0.6 -2.03 1.29 0.79 -1.37 -0.55 -0.39 1.99 -0.97 -1.13 -0.34 -0.81 -1.18 0.0 -0.8 -1.51
0.04 -0.21 -0.34 -0.47 0.89 0.71 -0.13 -0.71 -0.13 0.09 0.06 -0.17 0.34 -0.32 0.33 0.26 -0.14 -0.15 -0.93 -0.46 -0.16 -0.03 0.56 -0.32 0.05 -0.09 0.09 -0.16 -0.02 -0.28 0.25
0.74 0.41 -0.57 -0.39 0.9 0.65 -0.11 -0.13 -0.12 -0.24 0.02 -0.06 -0.87 0.14 0.38 0.22 -0.07 -0.96 -0.37 -0.34 0.03 0.19 -0.63 -0.38 -0.12 -0.03 0.12 0.17 0.21 0.02 -0.83
0.31 -0.27 -1.56 -1.1 1.16 0.82 0.43 -0.07 0.36 -0.25 0.2 -0.56 -2.39 -0.06 0.88 0.14 0.06 -7.14 -0.07 -0.28 0.6 0.71 -0.67 -0.41 -0.29 -0.2 0.26 -0.24 0.72 -0.19 -2.76
-1.99 -0.31 -1.1 -2.76 0.96 0.11 -2.52 -0.53 -2.01 -1.24 -0.83 -1.42 -1.31 -3.67 -3.17 -0.31 -3.19 0.74 -3.32 -4.01 -1.99 -1.92 3.42 1.53 1.16 -2.93 -1.21 -3.54 0.18 0.13 0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.