1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_115 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.3 1.0 0.13 0.07 0.36 0.32 0.05 0.21 0.04 0.01 0.13 0.06 0.13 0.0 0.0 0.31 0.09 0.0 0.0 0.05 0.07 0.05 0.98 0.34 0.5 0.11 0.3 0.12 0.03 0.09 0.04
0.37 0.3 0.33 0.41 0.86 1.0 0.41 0.26 0.49 0.55 0.55 0.49 0.54 0.72 0.7 0.74 0.63 0.59 0.69 0.54 0.58 0.63 0.62 0.47 0.6 0.73 0.71 0.71 0.56 0.54 0.62
0.0 0.0 0.03 0.03 0.07 0.08 0.04 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.0 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 1.0 0.23 0.15 0.01 0.11 0.02 0.1 0.06 0.06
0.23 0.28 0.23 0.31 1.0 0.64 0.5 0.27 0.41 0.41 0.48 0.47 0.3 0.35 0.44 0.35 0.32 0.37 0.36 0.31 0.37 0.42 0.3 0.15 0.19 0.24 0.17 0.21 0.64 0.34 0.27
0.07 0.01 0.07 0.22 1.0 0.44 0.01 0.0 0.29 0.15 0.21 0.49 0.07 0.06 0.07 0.22 0.17 0.03 0.13 0.17 0.38 0.5 0.0 0.33 0.35 0.24 0.36 0.24 0.08 0.16 0.28
0.1 0.11 0.13 0.24 1.0 0.76 0.18 0.25 0.32 0.36 0.35 0.37 0.11 0.56 0.47 0.34 0.31 0.05 0.25 0.36 0.31 0.33 0.46 0.23 0.33 0.32 0.38 0.26 0.59 0.5 0.26
0.2 0.18 0.3 0.37 0.95 1.0 0.22 0.12 0.38 0.35 0.43 0.33 0.24 0.35 0.42 0.59 0.37 0.34 0.34 0.3 0.38 0.46 0.62 0.27 0.38 0.49 0.5 0.41 0.36 0.38 0.32
0.46 0.54 0.52 0.7 0.93 0.76 0.44 0.52 0.58 0.63 0.75 0.64 0.48 0.98 1.0 0.73 0.6 0.4 0.63 0.48 0.61 0.61 0.25 0.44 0.48 0.54 0.72 0.58 0.81 0.81 0.5
0.05 0.18 0.22 0.27 1.0 0.55 0.24 0.14 0.4 0.42 0.4 0.22 0.0 0.1 0.38 0.29 0.15 0.03 0.32 0.26 0.24 0.29 0.04 0.19 0.19 0.21 0.26 0.07 0.37 0.44 0.23
0.02 0.04 0.19 0.25 1.0 0.58 0.2 0.18 0.19 0.33 0.62 0.39 0.4 0.27 0.32 0.29 0.27 0.34 0.23 0.33 0.27 0.43 0.13 0.37 0.22 0.21 0.27 0.28 0.41 0.4 0.47
0.44 0.42 0.43 0.48 1.0 0.8 0.43 0.33 0.45 0.55 0.48 0.5 0.52 0.65 0.77 0.52 0.49 0.29 0.48 0.45 0.55 0.53 0.64 0.44 0.52 0.53 0.54 0.57 0.53 0.51 0.46
0.49 0.66 0.59 0.58 1.0 0.96 0.64 0.5 0.64 0.63 0.7 0.57 0.4 0.64 0.81 0.78 0.57 0.33 0.58 0.57 0.63 0.63 0.61 0.49 0.53 0.66 0.64 0.48 0.72 0.76 0.7
0.13 0.28 0.1 0.15 0.89 1.0 0.13 0.14 0.25 0.27 0.14 0.22 0.09 0.35 0.28 0.39 0.1 0.29 0.28 0.15 0.18 0.21 0.81 0.21 0.26 0.28 0.2 0.25 0.19 0.13 0.06
0.15 0.23 0.15 0.11 0.21 0.23 0.33 0.33 0.25 0.26 0.3 0.19 0.24 0.06 0.1 0.25 0.27 0.17 0.24 0.31 0.2 0.28 1.0 0.83 0.72 0.4 0.31 0.29 0.22 0.33 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.01 0.02 0.39 0.31 0.29 0.22 0.0 0.0 0.0 0.15 0.09 0.02 0.06 0.22 0.11 0.39 0.0 0.12 0.17 0.2 0.3 0.09 0.1 0.21 0.13
0.09 0.34 0.4 0.43 1.0 0.72 0.43 0.51 0.43 0.69 0.58 0.32 0.18 0.19 0.28 0.54 0.56 0.61 0.37 0.45 0.49 0.43 0.98 0.45 0.36 0.41 0.39 0.13 0.39 0.73 0.57
0.55 0.61 0.36 0.45 0.74 0.87 0.86 1.0 0.53 0.59 0.6 0.63 0.69 0.62 0.71 0.73 0.68 0.52 0.64 0.63 0.63 0.67 0.77 0.6 0.6 0.7 0.66 0.71 0.63 0.59 0.47
0.19 0.0 0.13 0.39 0.88 0.11 0.13 0.07 0.84 0.84 0.58 0.81 0.24 0.0 0.13 0.57 0.37 0.23 0.32 0.54 0.1 0.43 0.0 0.35 0.24 0.34 0.3 0.27 0.22 0.53 1.0
0.27 0.32 0.33 0.5 1.0 0.92 0.49 0.37 0.59 0.58 0.52 0.5 0.65 0.73 0.62 0.61 0.56 0.79 0.64 0.55 0.49 0.6 0.56 0.55 0.53 0.59 0.65 0.6 0.63 0.69 0.77
0.0 0.13 0.05 0.01 0.35 0.31 0.03 0.19 0.07 0.03 0.07 0.06 0.15 0.34 0.14 0.14 0.08 0.21 0.08 0.04 0.09 0.1 0.67 1.0 0.6 0.06 0.17 0.06 0.15 0.05 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.22 0.57 0.0 0.22 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 1.0 0.43 0.0 0.18 0.0 0.12 0.03 0.04
0.2 0.3 0.24 0.2 0.48 0.35 0.16 0.21 0.17 0.18 0.21 0.16 0.18 0.42 0.33 0.23 0.13 0.36 0.19 0.14 0.15 0.17 1.0 0.38 0.5 0.15 0.22 0.14 0.33 0.28 0.28
0.04 0.04 0.01 0.0 0.33 0.11 0.01 0.08 0.03 0.02 0.08 0.03 0.08 0.0 0.01 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.32 1.0 0.35 0.01 0.12 0.02 0.04 0.03 0.03
0.44 0.44 0.45 0.49 0.96 1.0 0.53 0.53 0.51 0.52 0.58 0.52 0.37 0.72 0.65 0.56 0.45 0.26 0.55 0.48 0.55 0.59 0.64 0.47 0.54 0.65 0.66 0.47 0.53 0.48 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.78 0.26 0.16 0.81 0.46 0.05 0.35 0.11 0.17 0.32 0.14 0.05 0.0 0.0 0.36 0.05 0.01 0.0 0.02 0.11 0.18 1.0 0.49 0.46 0.07 0.18 0.11 0.2 0.21 0.17
0.03 0.22 0.06 0.02 0.22 0.18 0.01 0.18 0.04 0.03 0.07 0.03 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 1.0 0.78 0.66 0.03 0.09 0.01 0.08 0.11 0.11
0.0 0.05 0.02 0.02 1.0 0.82 0.17 0.12 0.33 0.52 0.49 0.21 0.05 0.04 0.33 0.51 0.15 0.04 0.28 0.43 0.35 0.22 0.96 0.86 0.46 0.2 0.35 0.07 0.27 0.29 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.66 0.04 0.06 0.18 0.15 0.48 0.1 0.06 0.0 0.02 0.14 0.08 0.0 0.0 0.13 0.16 0.11 0.99 0.65 0.39 0.03 0.19 0.03 0.01 0.0 0.01
0.07 0.77 0.1 0.01 0.26 0.31 0.02 0.4 0.03 0.05 0.13 0.06 0.04 0.0 0.01 0.26 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 1.0 0.62 0.49 0.09 0.17 0.09 0.07 0.08 0.04
0.07 0.39 0.05 0.0 0.21 0.16 0.03 0.14 0.04 0.02 0.08 0.05 0.04 0.0 0.0 0.16 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.05 1.0 0.23 0.21 0.03 0.04 0.05 0.02 0.06 0.05
0.29 0.43 0.34 0.32 0.86 0.57 0.28 0.67 0.19 0.3 0.37 0.28 0.22 0.01 0.05 0.51 0.1 0.18 0.14 0.07 0.35 0.38 1.0 0.72 0.7 0.15 0.33 0.13 0.64 0.53 0.47
0.56 0.49 0.5 0.76 1.0 0.92 0.39 0.17 0.83 0.77 0.8 0.6 0.3 0.22 0.32 0.57 0.44 0.48 0.74 0.49 0.52 0.47 0.51 0.59 0.56 0.58 0.68 0.59 0.6 0.67 0.68
0.52 0.47 0.34 0.36 0.82 1.0 0.61 0.58 0.51 0.49 0.58 0.42 0.43 0.5 0.55 0.65 0.41 0.41 0.52 0.42 0.52 0.55 0.85 0.46 0.47 0.54 0.49 0.44 0.58 0.65 0.45
0.19 0.27 0.17 0.25 0.96 1.0 0.46 0.38 0.59 0.54 0.58 0.46 0.19 0.34 0.47 0.65 0.45 0.18 0.48 0.47 0.47 0.56 0.96 0.47 0.51 0.59 0.61 0.36 0.56 0.63 0.45
0.41 0.41 0.31 0.37 0.96 0.9 0.91 0.89 0.55 0.55 0.56 0.47 0.48 0.46 0.69 0.74 0.65 0.47 0.59 0.54 0.59 0.63 1.0 0.49 0.55 0.61 0.62 0.59 0.75 0.65 0.46
0.45 0.53 0.47 0.76 1.0 0.75 0.4 0.27 0.66 0.69 0.72 0.62 0.28 0.6 0.71 0.77 0.58 0.24 0.56 0.54 0.58 0.57 0.14 0.37 0.43 0.61 0.64 0.62 0.67 0.59 0.32
0.44 0.85 0.42 0.36 0.69 0.42 0.23 0.46 0.35 0.39 0.48 0.46 0.52 0.21 0.24 0.52 0.24 0.14 0.2 0.23 0.4 0.34 1.0 0.84 0.75 0.3 0.42 0.29 0.57 0.52 0.79
0.69 0.63 0.67 0.88 0.98 0.9 0.68 0.51 0.84 0.81 0.84 0.84 0.63 0.66 0.72 0.86 0.77 0.63 0.68 0.79 0.78 0.82 0.65 0.68 0.76 0.74 0.82 1.0 0.9 0.77 0.59
0.49 0.44 0.46 0.6 0.77 0.76 0.57 0.44 0.7 0.68 0.74 0.7 0.54 0.65 0.76 0.68 0.77 0.55 0.67 0.73 0.63 0.67 1.0 0.66 0.67 0.67 0.64 0.7 0.65 0.72 0.77
0.51 0.32 0.18 0.15 1.0 0.77 0.34 0.3 0.56 0.49 0.5 0.39 0.09 0.24 0.62 0.65 0.54 0.01 0.39 0.44 0.58 0.56 0.15 0.41 0.48 0.53 0.62 0.39 0.61 0.56 0.23
0.18 0.24 0.22 0.4 0.31 0.31 0.5 0.34 0.48 0.59 0.46 0.31 0.53 0.41 0.35 0.4 0.47 0.0 0.45 0.59 0.62 0.33 0.95 1.0 0.93 0.41 0.47 0.36 0.38 0.58 0.37
0.05 0.1 0.05 0.04 0.73 1.0 0.32 0.27 0.26 0.26 0.31 0.16 0.12 0.11 0.24 0.35 0.31 0.43 0.27 0.31 0.35 0.43 0.71 0.16 0.33 0.42 0.45 0.15 0.78 0.49 0.19
0.37 0.42 0.32 0.4 1.0 0.76 0.2 0.14 0.37 0.4 0.44 0.3 0.09 0.31 0.54 0.58 0.26 0.08 0.4 0.3 0.33 0.29 0.06 0.22 0.24 0.29 0.31 0.13 0.39 0.35 0.19
0.1 0.11 0.08 0.05 0.17 0.15 0.08 0.34 0.08 0.1 0.07 0.15 0.21 0.04 0.05 0.15 0.03 0.07 0.06 0.04 0.07 0.1 1.0 0.4 0.4 0.07 0.16 0.08 0.21 0.14 0.24
0.1 0.13 0.09 0.07 0.2 0.12 0.06 0.32 0.05 0.08 0.11 0.08 0.06 0.02 0.03 0.16 0.05 0.03 0.03 0.02 0.08 0.09 1.0 0.42 0.37 0.04 0.08 0.03 0.18 0.13 0.1
0.15 0.09 0.17 0.39 1.0 0.91 0.6 0.29 0.53 0.63 0.68 0.58 0.26 0.28 0.39 0.61 0.29 0.67 0.4 0.54 0.6 0.71 0.95 0.36 0.44 0.55 0.46 0.43 0.69 0.42 0.39
0.09 0.2 0.28 0.25 1.0 0.75 0.19 0.16 0.64 0.65 0.62 0.36 0.03 0.06 0.26 0.49 0.31 0.01 0.18 0.34 0.41 0.38 0.07 0.46 0.44 0.32 0.54 0.19 0.47 0.44 0.26
0.2 0.18 0.22 0.29 0.54 0.73 0.53 0.48 0.54 0.51 0.6 0.55 0.35 0.57 0.72 0.58 0.53 0.23 0.5 0.5 0.49 0.66 1.0 0.49 0.57 0.55 0.61 0.55 0.51 0.52 0.61
0.11 0.45 0.06 0.04 0.68 1.0 0.17 0.15 0.06 0.05 0.11 0.04 0.14 0.16 0.19 0.15 0.05 0.54 0.38 0.09 0.15 0.17 0.87 0.11 0.1 0.17 0.13 0.1 0.22 0.13 0.08
0.55 0.46 0.43 0.39 1.0 0.88 0.49 0.33 0.49 0.57 0.56 0.48 0.68 0.43 0.68 0.65 0.49 0.49 0.28 0.39 0.48 0.53 0.79 0.43 0.56 0.51 0.57 0.48 0.53 0.44 0.64
0.9 0.71 0.36 0.41 1.0 0.84 0.5 0.49 0.5 0.45 0.54 0.51 0.29 0.59 0.7 0.63 0.51 0.28 0.42 0.42 0.55 0.61 0.35 0.41 0.49 0.53 0.58 0.61 0.62 0.54 0.3
0.55 0.37 0.15 0.21 1.0 0.79 0.6 0.43 0.57 0.38 0.52 0.3 0.09 0.43 0.83 0.49 0.47 0.0 0.43 0.37 0.68 0.73 0.28 0.34 0.37 0.39 0.54 0.38 0.74 0.39 0.07
0.02 0.08 0.04 0.01 0.18 0.1 0.02 0.06 0.02 0.04 0.05 0.03 0.04 0.01 0.01 0.08 0.01 0.16 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.27 0.21 0.01 0.04 0.01 0.11 0.1 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)