Heatmap: Cluster_100 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_13200.1 (TCP15)	-1.57	-2.06	-1.16	-0.36	1.05	-0.08	-1.4	-0.97	-0.2	-0.06	-0.46	0.06	0.37	0.11	-0.11	0.06	-0.48	1.58	-0.25	-0.29	-0.25	-0.47	0.47	-0.36	-1.05	0.18	-0.14	-0.7	0.41	0.31	1.36
Lsat_1_v5_gn_1_18880.1 (BGLU13)	-1.12	-0.83	0.07	0.5	0.73	1.01	-0.87	-0.66	-0.51	-0.4	0.02	-0.36	-0.04	0.67	-0.08	0.21	-0.5	-0.48	-0.02	-0.47	-0.42	0.03	-2.38	-0.01	-0.03	-0.26	0.07	-0.73	0.45	0.58	1.22
Lsat_1_v5_gn_1_21220.1	-0.95	-1.29	-2.33	-1.28	0.84	0.4	-1.37	-1.6	-0.3	-0.22	-0.01	-0.01	0.72	0.48	0.64	0.09	0.14	0.02	0.03	0.15	0.03	-0.14	-1.43	-0.03	0.16	-0.2	-0.05	-0.22	0.08	0.13	1.5
Lsat_1_v5_gn_1_21761.1	-1.01	-1.49	-0.48	-0.2	1.85	0.69	-1.96	-1.85	-0.68	-0.17	-0.28	-0.4	0.84	-0.92	-0.34	-0.62	-0.71	1.87	-0.43	-0.91	-1.18	-0.71	-0.5	-0.26	-0.65	-0.6	-0.53	-0.23	0.3	-0.02	1.46
Lsat_1_v5_gn_1_46340.1 (ASG7)	-0.17	-0.72	-0.53	-0.77	1.13	0.27	-0.22	-0.28	0.39	0.26	0.08	0.13	-1.16	0.64	0.68	-0.21	-0.53	0.31	-0.13	-0.29	-0.27	-0.7	-1.59	-1.13	-0.82	-0.37	0.13	-1.35	0.44	0.76	1.16
Lsat_1_v5_gn_1_46861.1	-1.26	-1.13	-0.41	0.05	0.59	0.15	-0.76	-1.34	-0.32	-0.13	0.11	-0.2	-0.02	0.54	0.25	-0.04	-0.11	0.79	-0.19	-0.22	-0.03	-0.12	-0.07	-0.28	-0.09	0.12	0.07	-0.32	0.45	0.45	0.83
Lsat_1_v5_gn_1_50180.1 (TSC10A)	-0.55	-0.3	-0.19	-0.11	0.26	0.41	-0.5	-0.61	-0.09	-0.18	0.03	-0.02	0.41	0.41	0.29	0.14	-0.14	-0.02	-0.0	-0.19	-0.2	-0.02	-0.16	-0.06	-0.0	0.01	-0.23	-0.0	0.05	0.18	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_51321.1 (ATRAB)	-0.42	-0.16	0.13	0.59	0.45	-0.14	-0.61	-0.77	-0.23	-0.1	0.08	0.14	-0.11	0.39	0.42	-0.45	-0.45	0.41	0.07	0.04	-0.27	-0.34	-0.15	-0.6	-0.27	-0.13	-0.33	-0.57	0.31	0.36	0.95
Lsat_1_v5_gn_1_58740.1 (MED7A)	-0.05	-0.05	0.07	0.11	0.07	0.06	-0.21	-0.45	-0.03	-0.06	0.03	-0.09	0.22	-0.02	-0.4	0.09	-0.17	0.81	-0.5	-0.17	-0.22	-0.06	0.31	-0.37	-0.12	0.01	0.04	-0.29	0.18	0.12	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_61941.1 (VFP4)	-0.7	-0.82	-0.2	0.59	0.85	0.34	-0.96	-1.76	0.13	-0.41	0.51	-0.32	-0.72	-0.79	-0.37	0.32	-0.37	1.33	-0.74	-0.5	-0.71	-0.1	-0.11	-0.99	-0.35	-0.11	-0.0	-1.07	0.16	0.8	1.41
Lsat_1_v5_gn_1_8741.1 (LecRK-S.6)	-2.21	-2.65	-3.99	-2.75	1.48	0.48	-0.99	-0.73	-0.01	-0.07	-0.36	-0.09	0.42	0.29	0.75	-0.45	-0.09	1.84	-0.1	-0.77	-1.13	-0.72	-0.07	0.09	-0.15	-0.15	-0.15	-1.07	-0.13	-0.45	1.35
Lsat_1_v5_gn_2_101081.1 (LHT2)	-1.19	-0.88	-0.57	0.48	0.07	0.26	-0.52	-0.55	-0.5	-0.19	0.18	-0.22	-0.41	0.63	0.09	0.06	-0.33	0.71	0.04	-0.57	-0.6	-0.47	0.35	-0.49	-0.26	-0.07	-0.02	-0.77	0.6	0.54	1.33
Lsat_1_v5_gn_2_12460.1	-0.57	-0.16	-0.34	0.17	1.28	1.17	-1.27	-1.07	-0.59	-0.52	-0.39	-0.54	0.33	0.52	0.4	-0.02	-0.6	0.97	-0.07	-0.8	-0.38	-0.27	-0.97	-0.29	-0.38	-0.33	-0.38	-0.76	0.44	0.05	0.8
Lsat_1_v5_gn_2_127221.1 (LLR1)	-0.82	-1.27	-1.41	-0.52	0.98	-0.1	-1.1	-1.53	-0.14	-0.54	-0.06	-0.25	0.18	0.4	0.62	0.04	-0.45	1.4	-0.47	-0.72	-0.42	-0.37	1.09	-1.14	-1.17	-0.56	-0.55	-0.39	0.42	1.0	1.07
Lsat_1_v5_gn_2_27321.1	-0.39	-0.21	-0.09	0.23	0.55	0.42	-0.2	-0.11	-0.29	-0.2	-0.1	-0.47	-0.79	0.55	0.56	0.14	0.13	0.59	-0.06	-0.55	-0.77	-0.65	-1.83	-0.53	-0.41	-0.09	-0.02	-1.25	0.49	0.65	1.12
Lsat_1_v5_gn_2_52660.1 (SUB1)	-0.67	-0.37	-0.42	-0.45	0.35	0.27	-0.45	-0.57	-0.27	-0.1	-0.06	-0.01	0.47	0.27	0.24	-0.01	0.03	-0.33	0.16	-0.07	-0.11	-0.11	-0.1	-0.12	0.09	0.09	-0.01	-0.16	0.22	0.35	0.77
Lsat_1_v5_gn_2_56181.1 (Kin7.3)	-0.9	-0.63	-0.19	-0.02	0.31	0.22	-0.42	-0.67	-0.22	-0.05	0.1	0.02	0.26	0.39	0.45	-0.06	-0.0	-0.25	-0.04	-0.14	-0.11	-0.08	0.08	-0.29	-0.19	0.02	-0.02	-0.2	0.14	0.38	0.87
Lsat_1_v5_gn_2_58660.1 (BDR1)	-1.18	-0.5	-0.65	-0.3	0.47	0.02	-0.39	-0.42	0.24	0.29	0.27	0.07	-0.51	0.36	0.6	0.21	0.03	-0.34	0.18	0.03	-0.01	-0.08	-1.3	-0.47	-0.23	0.04	0.02	-0.39	0.57	0.62	0.52
Lsat_1_v5_gn_2_66201.1 (RABA4a)	-0.91	-0.29	-0.25	0.2	0.69	0.38	-0.45	-0.55	-0.24	0.02	0.14	0.02	0.35	0.18	0.11	-0.02	-0.18	0.55	-0.34	-0.22	-0.21	-0.21	-0.31	-0.32	-0.21	-0.13	0.09	-0.29	0.33	0.21	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_76561.1 (TLP2)	-0.57	-0.22	0.01	0.28	0.56	0.49	-0.31	-0.81	-0.15	-0.03	0.13	-0.12	0.11	0.05	-0.02	0.09	-0.39	0.59	-0.03	-0.26	-0.29	-0.21	0.29	-0.58	-0.21	-0.06	-0.09	-0.24	0.16	0.2	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_95200.1 (LWD1)	-1.02	-0.71	-0.24	-0.02	0.04	0.04	-0.41	-0.65	-0.0	-0.29	-0.07	-0.13	0.27	0.38	0.12	0.23	0.07	0.43	0.04	0.04	-0.06	-0.07	0.52	-0.12	-0.05	-0.16	-0.08	-0.32	0.07	0.12	0.79
Lsat_1_v5_gn_3_116100.1	-0.31	-0.26	-0.01	-0.08	0.28	0.21	-0.32	-0.57	-0.07	-0.13	0.12	-0.09	0.2	0.35	0.4	0.01	-0.04	0.6	-0.25	-0.14	-0.23	-0.23	0.16	-0.38	-0.21	-0.16	-0.03	-0.1	0.16	0.13	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_117120.1	-0.79	-0.45	-0.81	-0.23	0.14	0.17	-0.16	-0.53	0.04	0.05	0.12	0.02	0.36	0.27	0.11	-0.01	-0.01	-0.25	0.07	-0.05	-0.0	-0.09	-0.24	-0.12	0.1	0.16	0.04	-0.03	0.22	0.18	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_32700.1 (VIM1)	-0.45	-0.45	-0.16	0.18	0.55	0.09	-0.72	-0.83	-0.11	-0.06	0.13	0.09	0.1	0.3	0.15	-0.24	-0.4	0.55	0.14	-0.37	-0.51	-0.08	0.11	-0.42	-0.26	-0.35	-0.22	-0.41	0.59	0.39	0.91
Lsat_1_v5_gn_3_39100.1	-0.75	-0.39	0.29	0.05	0.58	0.26	-0.45	-1.19	0.11	0.3	-0.22	-0.22	-0.98	0.8	0.51	-0.35	-0.16	0.7	-0.07	-0.75	-0.41	-0.68	0.21	-0.2	-0.4	-0.73	-0.33	-1.8	0.47	0.68	1.1
Lsat_1_v5_gn_3_50960.1 (SUC3)	-1.96	-0.68	-2.23	-0.85	1.46	-0.19	-2.17	-3.5	-0.57	-0.42	0.25	0.07	0.46	1.13	1.09	0.04	-0.62	0.69	0.33	-0.56	-1.22	-0.86	-2.46	-0.99	-1.02	-1.34	-0.81	-0.91	0.88	0.79	1.85
Lsat_1_v5_gn_3_76640.1 (TLP2)	-0.53	-0.61	-0.31	0.22	0.36	0.18	-0.47	-0.85	-0.03	0.2	0.23	0.09	0.22	0.24	0.31	0.14	-0.01	0.06	-0.22	-0.15	-0.18	-0.14	-0.13	-0.22	-0.1	0.01	-0.02	-0.3	0.2	0.29	0.54
Lsat_1_v5_gn_3_7740.1	-0.62	-0.76	-0.46	-0.1	0.77	0.22	-0.65	-0.87	-0.06	-0.12	0.15	0.15	-0.02	0.36	0.5	0.1	-0.02	-0.39	0.23	-0.07	-0.16	0.03	-1.19	-0.17	-0.09	-0.12	-0.09	-0.17	0.31	0.48	0.8
Lsat_1_v5_gn_4_106080.1	-1.25	-0.96	-0.41	0.17	0.22	0.27	-0.62	-0.36	-0.23	0.01	0.08	0.08	0.22	0.44	0.25	0.1	-0.04	-0.02	0.04	-0.3	-0.09	0.03	0.1	-0.24	-0.13	0.08	0.01	-0.43	0.3	0.24	0.85
Lsat_1_v5_gn_4_138261.1 (ATL78)	-1.18	-1.61	-0.39	0.34	1.38	1.02	-0.54	-1.15	-0.2	-0.24	0.02	-0.47	-0.77	0.11	0.23	0.06	-0.16	0.14	0.2	-0.33	0.12	0.05	-2.22	-0.75	0.16	-0.68	-0.31	-0.56	0.45	0.34	1.23
Lsat_1_v5_gn_4_150561.1	-0.57	0.03	0.0	0.01	0.76	0.53	-0.46	-1.14	-0.33	-0.45	-0.43	-0.63	0.12	1.04	0.48	-0.49	-0.29	0.57	-0.16	-0.86	-0.16	-0.85	0.15	-1.02	-1.0	-0.16	-0.3	-0.94	0.47	0.32	1.41
Lsat_1_v5_gn_4_167020.1	-0.51	-0.34	-0.31	0.03	0.47	0.41	-0.22	-0.27	-0.08	0.04	0.07	0.06	0.44	0.05	0.12	0.18	0.01	-0.98	-0.14	-0.2	-0.18	-0.07	-0.69	-0.12	-0.01	-0.13	-0.15	-0.08	0.32	0.4	0.69
Lsat_1_v5_gn_4_22580.1 (BBR)	-0.6	-0.61	-0.17	0.01	0.14	0.16	-0.91	-1.1	-0.15	-0.13	-0.06	-0.11	0.33	0.52	0.3	-0.02	0.08	0.69	0.0	-0.31	-0.16	-0.21	0.37	-0.17	-0.14	-0.03	0.09	-0.3	0.22	0.15	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_98620.1 (LYK3)	-0.2	-0.56	-0.07	0.01	0.69	0.35	-0.84	-1.25	-0.16	-0.24	-0.02	-0.02	0.44	0.7	0.4	0.02	-0.05	0.18	0.2	-0.17	-0.24	-0.09	-1.07	-0.45	-0.34	-0.01	-0.15	-0.39	-0.12	-0.03	1.09
Lsat_1_v5_gn_5_113300.1	-1.34	-0.94	-1.52	-0.96	1.14	0.57	0.18	-0.35	-0.22	-0.1	-0.07	-0.37	-0.05	-0.1	0.43	0.51	0.28	0.94	0.04	-0.15	-0.15	-0.33	-1.14	-0.18	-0.09	-0.05	-0.16	-0.15	0.1	0.28	0.44
Lsat_1_v5_gn_5_121400.1 (TMN12)	-0.61	-0.44	-0.33	-0.05	0.42	0.26	-0.46	-0.31	-0.26	-0.15	-0.03	-0.02	0.25	0.54	0.2	0.07	0.02	-0.63	0.08	-0.21	-0.12	-0.03	-0.32	-0.02	0.01	0.03	0.02	-0.18	0.27	0.34	0.64
Lsat_1_v5_gn_5_132941.1 (PDR12)	-0.19	0.32	0.45	0.27	0.66	0.02	-0.67	-0.7	-0.12	-0.12	-0.08	-0.14	-0.68	0.6	0.58	-0.25	-0.29	0.99	0.35	-0.55	-0.68	-0.73	-2.63	-0.47	-0.57	-0.69	-0.44	-0.95	0.43	0.64	0.98
Lsat_1_v5_gn_5_134641.1 (IAA9)	-1.01	-1.43	-0.21	0.41	0.66	0.7	-0.76	-1.34	-0.29	-0.13	0.04	-0.05	0.36	0.64	0.44	-0.16	-0.48	0.37	0.09	-0.3	-0.28	-0.24	-0.94	-0.37	-0.17	-0.19	-0.18	-0.4	0.48	0.2	1.09
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.