Heatmap: Cluster_100 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.11 0.08 0.15 0.26 0.7 0.32 0.13 0.17 0.29 0.32 0.24 0.35 0.43 0.36 0.31 0.35 0.24 1.0 0.28 0.27 0.28 0.24 0.46 0.26 0.16 0.38 0.3 0.21 0.45 0.41 0.86
0.2 0.24 0.45 0.61 0.71 0.87 0.24 0.27 0.3 0.33 0.44 0.33 0.42 0.68 0.41 0.5 0.3 0.31 0.43 0.31 0.32 0.44 0.08 0.43 0.42 0.36 0.45 0.26 0.59 0.64 1.0
0.18 0.14 0.07 0.15 0.63 0.47 0.14 0.12 0.29 0.3 0.35 0.35 0.58 0.49 0.55 0.38 0.39 0.36 0.36 0.39 0.36 0.32 0.13 0.35 0.4 0.31 0.34 0.3 0.37 0.39 1.0
0.14 0.1 0.2 0.24 0.98 0.44 0.07 0.08 0.17 0.24 0.23 0.21 0.49 0.14 0.22 0.18 0.17 1.0 0.2 0.15 0.12 0.17 0.19 0.23 0.17 0.18 0.19 0.23 0.34 0.27 0.75
0.4 0.27 0.31 0.26 0.98 0.54 0.38 0.37 0.59 0.54 0.47 0.49 0.2 0.7 0.72 0.39 0.31 0.56 0.41 0.36 0.37 0.28 0.15 0.2 0.25 0.35 0.49 0.18 0.61 0.76 1.0
0.23 0.26 0.42 0.58 0.85 0.62 0.33 0.22 0.45 0.51 0.6 0.49 0.55 0.82 0.67 0.55 0.52 0.97 0.49 0.48 0.55 0.52 0.54 0.46 0.53 0.61 0.59 0.45 0.77 0.77 1.0
0.46 0.54 0.59 0.62 0.8 0.89 0.47 0.44 0.62 0.59 0.68 0.66 0.89 0.89 0.81 0.74 0.61 0.66 0.67 0.58 0.58 0.66 0.6 0.64 0.67 0.67 0.57 0.67 0.69 0.76 1.0
0.39 0.46 0.57 0.78 0.71 0.47 0.34 0.3 0.44 0.48 0.55 0.57 0.48 0.68 0.69 0.38 0.38 0.69 0.54 0.53 0.43 0.41 0.46 0.34 0.43 0.47 0.41 0.35 0.64 0.67 1.0
0.55 0.55 0.6 0.61 0.6 0.6 0.49 0.42 0.56 0.55 0.58 0.53 0.66 0.56 0.43 0.61 0.51 1.0 0.4 0.51 0.49 0.54 0.71 0.44 0.52 0.57 0.59 0.46 0.65 0.62 0.75
0.23 0.21 0.33 0.56 0.68 0.48 0.19 0.11 0.41 0.28 0.53 0.3 0.23 0.22 0.29 0.47 0.29 0.95 0.23 0.27 0.23 0.35 0.35 0.19 0.29 0.35 0.37 0.18 0.42 0.65 1.0
0.06 0.04 0.02 0.04 0.78 0.39 0.14 0.17 0.28 0.27 0.22 0.26 0.37 0.34 0.47 0.2 0.26 1.0 0.26 0.16 0.13 0.17 0.27 0.3 0.25 0.25 0.25 0.13 0.25 0.2 0.71
0.18 0.22 0.27 0.56 0.42 0.48 0.28 0.27 0.28 0.35 0.45 0.34 0.3 0.62 0.43 0.42 0.32 0.65 0.41 0.27 0.26 0.29 0.51 0.29 0.33 0.38 0.39 0.23 0.61 0.58 1.0
0.28 0.37 0.33 0.47 1.0 0.93 0.17 0.2 0.27 0.29 0.32 0.28 0.52 0.59 0.55 0.41 0.27 0.81 0.39 0.24 0.32 0.34 0.21 0.34 0.32 0.33 0.32 0.24 0.56 0.43 0.72
0.21 0.16 0.14 0.26 0.75 0.35 0.18 0.13 0.35 0.26 0.37 0.32 0.43 0.5 0.58 0.39 0.28 1.0 0.27 0.23 0.28 0.29 0.81 0.17 0.17 0.26 0.26 0.29 0.51 0.76 0.79
0.35 0.4 0.43 0.54 0.67 0.61 0.4 0.43 0.37 0.4 0.43 0.33 0.27 0.67 0.68 0.51 0.5 0.69 0.44 0.31 0.27 0.29 0.13 0.32 0.35 0.43 0.45 0.19 0.65 0.72 1.0
0.37 0.45 0.44 0.43 0.74 0.71 0.43 0.4 0.49 0.55 0.56 0.58 0.81 0.71 0.69 0.58 0.6 0.47 0.66 0.56 0.54 0.54 0.54 0.54 0.62 0.62 0.58 0.52 0.68 0.75 1.0
0.29 0.35 0.48 0.54 0.68 0.64 0.41 0.34 0.47 0.53 0.59 0.56 0.66 0.72 0.75 0.53 0.55 0.46 0.53 0.5 0.51 0.52 0.58 0.45 0.48 0.56 0.54 0.48 0.61 0.72 1.0
0.29 0.46 0.41 0.53 0.9 0.66 0.5 0.48 0.77 0.8 0.79 0.68 0.46 0.84 0.99 0.75 0.67 0.51 0.74 0.66 0.65 0.61 0.26 0.47 0.55 0.67 0.66 0.5 0.96 1.0 0.93
0.33 0.51 0.52 0.71 1.0 0.8 0.45 0.42 0.52 0.63 0.68 0.63 0.79 0.7 0.66 0.61 0.55 0.9 0.49 0.53 0.54 0.53 0.5 0.5 0.53 0.57 0.66 0.5 0.78 0.71 0.92
0.45 0.57 0.67 0.81 0.98 0.93 0.54 0.38 0.6 0.65 0.72 0.61 0.72 0.69 0.65 0.71 0.51 1.0 0.65 0.55 0.54 0.57 0.81 0.44 0.57 0.64 0.62 0.56 0.74 0.76 0.93
0.29 0.35 0.49 0.57 0.59 0.59 0.44 0.37 0.58 0.47 0.55 0.53 0.7 0.75 0.63 0.68 0.61 0.78 0.59 0.59 0.55 0.55 0.83 0.53 0.56 0.52 0.55 0.46 0.61 0.63 1.0
0.53 0.55 0.65 0.63 0.8 0.76 0.53 0.45 0.63 0.6 0.72 0.62 0.76 0.84 0.87 0.67 0.64 1.0 0.55 0.6 0.56 0.56 0.74 0.51 0.57 0.59 0.64 0.62 0.74 0.72 0.81
0.35 0.44 0.34 0.51 0.67 0.68 0.54 0.42 0.62 0.62 0.66 0.61 0.77 0.73 0.65 0.6 0.6 0.51 0.63 0.58 0.6 0.56 0.51 0.56 0.65 0.67 0.62 0.59 0.7 0.68 1.0
0.39 0.39 0.47 0.6 0.78 0.56 0.32 0.3 0.49 0.51 0.58 0.57 0.57 0.65 0.59 0.45 0.4 0.78 0.59 0.41 0.37 0.5 0.57 0.4 0.44 0.42 0.46 0.4 0.8 0.7 1.0
0.28 0.36 0.57 0.48 0.7 0.56 0.34 0.21 0.5 0.57 0.4 0.4 0.24 0.82 0.67 0.37 0.42 0.76 0.45 0.28 0.35 0.29 0.54 0.41 0.35 0.28 0.37 0.13 0.65 0.75 1.0
0.07 0.17 0.06 0.15 0.76 0.24 0.06 0.02 0.19 0.21 0.33 0.29 0.38 0.61 0.59 0.28 0.18 0.45 0.35 0.19 0.12 0.15 0.05 0.14 0.14 0.11 0.16 0.15 0.51 0.48 1.0
0.48 0.45 0.55 0.8 0.88 0.78 0.5 0.38 0.67 0.79 0.81 0.74 0.8 0.81 0.85 0.76 0.68 0.72 0.59 0.62 0.61 0.63 0.63 0.59 0.64 0.69 0.68 0.56 0.79 0.84 1.0
0.37 0.34 0.42 0.53 0.98 0.67 0.37 0.31 0.55 0.53 0.64 0.63 0.56 0.74 0.81 0.62 0.57 0.44 0.67 0.55 0.51 0.59 0.25 0.51 0.54 0.53 0.54 0.51 0.71 0.8 1.0
0.23 0.29 0.42 0.62 0.65 0.67 0.36 0.43 0.47 0.56 0.59 0.59 0.65 0.75 0.66 0.6 0.54 0.55 0.57 0.45 0.52 0.57 0.6 0.47 0.51 0.59 0.56 0.41 0.69 0.66 1.0
0.17 0.13 0.29 0.49 1.0 0.78 0.26 0.17 0.33 0.32 0.39 0.28 0.22 0.41 0.45 0.4 0.34 0.42 0.44 0.31 0.42 0.4 0.08 0.23 0.43 0.24 0.31 0.26 0.52 0.48 0.9
0.25 0.38 0.38 0.38 0.64 0.54 0.27 0.17 0.3 0.28 0.28 0.24 0.41 0.77 0.53 0.27 0.31 0.56 0.34 0.21 0.34 0.21 0.42 0.19 0.19 0.34 0.3 0.2 0.52 0.47 1.0
0.44 0.49 0.5 0.64 0.86 0.83 0.53 0.51 0.59 0.64 0.65 0.65 0.84 0.64 0.67 0.7 0.62 0.32 0.56 0.54 0.55 0.59 0.39 0.57 0.62 0.57 0.56 0.59 0.78 0.82 1.0
0.41 0.4 0.55 0.62 0.68 0.69 0.33 0.29 0.56 0.57 0.59 0.57 0.78 0.88 0.76 0.61 0.65 1.0 0.62 0.5 0.55 0.54 0.8 0.55 0.56 0.61 0.66 0.5 0.72 0.69 0.93
0.41 0.32 0.45 0.47 0.76 0.6 0.26 0.2 0.42 0.4 0.46 0.46 0.64 0.76 0.62 0.48 0.45 0.53 0.54 0.42 0.4 0.44 0.22 0.34 0.37 0.47 0.42 0.36 0.43 0.46 1.0
0.18 0.24 0.16 0.23 1.0 0.67 0.51 0.35 0.39 0.42 0.43 0.35 0.44 0.42 0.61 0.64 0.55 0.87 0.46 0.41 0.41 0.36 0.21 0.4 0.43 0.44 0.4 0.41 0.48 0.55 0.62
0.42 0.47 0.51 0.62 0.86 0.77 0.47 0.52 0.54 0.58 0.63 0.63 0.76 0.94 0.74 0.67 0.65 0.41 0.68 0.56 0.59 0.63 0.51 0.63 0.65 0.65 0.65 0.57 0.77 0.81 1.0
0.44 0.63 0.69 0.61 0.79 0.51 0.32 0.31 0.46 0.46 0.47 0.46 0.31 0.76 0.75 0.42 0.41 1.0 0.64 0.34 0.31 0.3 0.08 0.36 0.34 0.31 0.37 0.26 0.68 0.78 1.0
0.23 0.17 0.41 0.63 0.74 0.76 0.28 0.19 0.39 0.43 0.49 0.46 0.6 0.73 0.64 0.42 0.34 0.61 0.5 0.38 0.39 0.4 0.25 0.36 0.42 0.41 0.41 0.36 0.66 0.54 1.0
0.29 0.35 0.42 0.55 0.93 0.71 0.33 0.36 0.52 0.64 0.59 0.65 0.69 0.95 0.82 0.5 0.45 0.64 0.67 0.49 0.47 0.45 0.54 0.4 0.43 0.47 0.51 0.39 0.64 0.68 1.0
0.46 0.54 0.64 0.68 0.86 0.94 0.51 0.34 0.57 0.58 0.66 0.59 0.7 0.81 0.72 0.63 0.58 0.65 0.53 0.52 0.61 0.63 0.38 0.54 0.65 0.67 0.64 0.56 0.68 0.73 1.0
0.3 0.31 0.5 0.54 0.7 0.7 0.43 0.51 0.49 0.57 0.64 0.58 0.73 0.81 0.82 0.56 0.56 0.56 0.65 0.54 0.61 0.57 0.76 0.53 0.61 0.7 0.64 0.59 0.63 0.74 1.0
0.56 0.72 0.8 0.74 0.8 0.65 0.47 0.58 0.57 0.6 0.61 0.68 0.5 0.74 0.57 0.53 0.49 1.0 0.54 0.46 0.49 0.48 0.64 0.39 0.47 0.54 0.51 0.47 0.65 0.64 0.67
0.32 0.33 0.34 0.44 0.79 0.46 0.26 0.26 0.43 0.46 0.43 0.38 0.42 0.45 0.49 0.35 0.34 0.85 0.58 0.41 0.35 0.35 0.65 0.37 0.36 0.36 0.42 0.3 0.69 0.77 1.0
0.41 0.45 0.45 0.5 0.87 0.52 0.28 0.27 0.46 0.42 0.41 0.42 0.52 0.98 0.58 0.47 0.43 0.89 0.43 0.3 0.41 0.4 0.36 0.29 0.42 0.34 0.42 0.41 0.46 0.47 1.0
0.28 0.32 0.35 0.43 0.71 0.55 0.23 0.21 0.37 0.38 0.42 0.43 0.64 0.57 0.57 0.43 0.39 0.5 0.49 0.36 0.36 0.36 0.15 0.35 0.37 0.38 0.39 0.37 0.59 0.57 1.0
0.51 0.63 0.59 0.68 1.0 0.81 0.51 0.43 0.59 0.62 0.67 0.62 0.77 0.81 0.72 0.5 0.53 0.72 0.68 0.57 0.58 0.56 0.63 0.47 0.52 0.55 0.54 0.47 0.78 0.66 0.98
0.48 0.45 0.67 0.78 0.62 0.5 0.18 0.12 0.49 0.49 0.53 0.44 0.61 0.3 0.26 0.29 0.23 1.0 0.25 0.27 0.34 0.36 0.57 0.3 0.35 0.43 0.41 0.23 0.61 0.62 0.79
0.44 0.48 0.52 0.64 0.75 0.69 0.43 0.35 0.67 0.72 0.74 0.73 0.84 0.92 0.88 0.83 0.73 0.96 0.67 0.68 0.66 0.69 0.72 0.64 0.66 0.73 0.77 0.56 0.74 0.73 1.0
0.26 0.28 0.39 0.48 0.6 0.53 0.39 0.32 0.47 0.5 0.56 0.47 0.6 0.69 0.63 0.54 0.5 0.44 0.43 0.47 0.46 0.46 0.44 0.47 0.49 0.52 0.5 0.4 0.63 0.67 1.0
0.15 0.1 0.04 0.11 0.81 0.35 0.13 0.06 0.03 0.28 0.18 0.1 0.28 0.35 0.27 0.17 0.06 1.0 0.19 0.19 0.22 0.2 0.25 0.3 0.12 0.16 0.3 0.18 0.27 0.28 0.54
0.21 0.27 0.4 0.56 0.57 0.64 0.48 0.51 0.53 0.53 0.6 0.63 0.59 0.81 0.77 0.56 0.43 0.56 0.58 0.6 0.55 0.5 0.74 0.55 0.56 0.48 0.61 0.49 0.67 0.79 1.0
0.39 0.42 0.43 0.48 0.71 0.72 0.44 0.39 0.52 0.5 0.54 0.58 0.67 0.73 0.68 0.53 0.5 0.67 0.56 0.51 0.49 0.53 0.34 0.46 0.49 0.51 0.52 0.5 0.65 0.7 1.0
0.41 0.44 0.51 0.58 0.74 0.68 0.32 0.31 0.6 0.48 0.62 0.54 0.65 0.9 0.83 0.63 0.68 1.0 0.64 0.55 0.52 0.51 0.83 0.54 0.45 0.57 0.48 0.44 0.67 0.73 0.86
0.32 0.07 0.45 0.51 0.89 0.38 0.15 0.15 0.28 0.29 0.35 0.39 0.36 0.55 0.34 0.24 0.23 1.0 0.27 0.24 0.23 0.21 0.49 0.24 0.26 0.25 0.28 0.24 0.41 0.39 0.85
0.18 0.29 0.18 0.13 0.79 0.67 0.4 0.39 0.27 0.21 0.29 0.22 0.44 0.64 0.7 0.52 0.49 0.85 0.45 0.32 0.32 0.34 0.24 0.38 0.41 0.44 0.46 0.29 0.54 0.66 1.0
Lsat_1_v5_gn_9_15761.1 (AUXILIN-LIKE2)
0.32 0.44 0.38 0.64 0.79 0.66 0.42 0.3 0.59 0.58 0.71 0.7 0.84 0.7 0.69 0.58 0.58 0.54 0.71 0.61 0.54 0.59 0.49 0.56 0.57 0.58 0.63 0.54 0.68 0.75 1.0
0.12 0.13 0.26 0.26 0.96 0.7 0.22 0.24 0.39 0.42 0.53 0.36 0.54 0.6 0.58 0.32 0.29 0.92 0.27 0.27 0.45 0.37 0.21 0.2 0.22 0.32 0.45 0.23 0.56 0.39 1.0
0.19 0.23 0.28 0.48 0.98 0.54 0.38 0.65 0.6 0.76 0.75 0.83 0.54 1.0 0.92 0.6 0.52 0.43 0.58 0.5 0.41 0.42 0.21 0.44 0.44 0.41 0.44 0.37 0.88 0.97 0.95
0.31 0.26 0.33 0.46 0.64 0.74 0.46 0.38 0.45 0.5 0.53 0.58 0.68 0.81 0.79 0.56 0.44 0.74 0.53 0.42 0.47 0.39 0.27 0.46 0.46 0.42 0.44 0.44 0.65 0.68 1.0
0.41 0.46 0.58 0.62 0.8 0.77 0.56 0.5 0.51 0.54 0.55 0.55 0.8 0.74 0.7 0.64 0.64 0.49 0.66 0.55 0.55 0.6 0.47 0.57 0.6 0.63 0.61 0.57 0.72 0.77 1.0
0.52 0.52 0.57 0.69 0.85 0.9 0.69 0.65 0.65 0.71 0.76 0.69 0.89 0.95 0.95 0.8 0.68 0.57 0.86 0.7 0.66 0.69 0.58 0.69 0.7 0.75 0.75 0.72 0.8 0.87 1.0
0.47 0.45 0.51 0.67 0.79 0.72 0.47 0.37 0.6 0.72 0.7 0.68 0.81 0.8 0.75 0.62 0.56 0.95 0.51 0.57 0.57 0.51 0.69 0.49 0.61 0.66 0.57 0.56 0.76 0.79 1.0
0.25 0.27 0.21 0.19 1.0 0.49 0.27 0.17 0.31 0.4 0.32 0.37 0.65 0.51 0.72 0.53 0.54 0.46 0.66 0.46 0.42 0.4 0.05 0.33 0.35 0.37 0.31 0.38 0.58 0.54 0.76
0.24 0.31 0.62 0.83 1.0 0.92 0.35 0.29 0.53 0.49 0.57 0.45 0.3 0.81 0.65 0.56 0.44 0.8 0.42 0.43 0.34 0.39 0.91 0.35 0.38 0.6 0.39 0.3 0.83 0.82 0.86
0.31 0.3 0.32 0.25 0.68 0.57 0.55 0.69 0.68 0.76 0.77 0.74 0.28 0.88 0.83 0.58 0.6 0.44 0.51 0.56 0.56 0.52 0.35 0.51 0.48 0.39 0.51 0.39 0.8 1.0 0.97

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)