1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_100 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.22 0.15 0.29 0.5 1.33 0.61 0.24 0.33 0.56 0.62 0.47 0.67 0.83 0.7 0.6 0.67 0.46 1.92 0.54 0.53 0.54 0.46 0.89 0.5 0.31 0.73 0.58 0.4 0.86 0.8 1.65
4.25 5.22 9.74 13.1 15.34 18.71 5.07 5.85 6.51 7.0 9.4 7.21 9.02 14.73 8.79 10.72 6.55 6.63 9.17 6.7 6.95 9.49 1.79 9.21 9.06 7.73 9.73 5.6 12.67 13.81 21.53
0.94 0.74 0.36 0.75 3.25 2.39 0.7 0.6 1.47 1.56 1.8 1.8 2.99 2.53 2.82 1.93 2.0 1.84 1.86 2.01 1.85 1.64 0.67 1.77 2.03 1.58 1.75 1.56 1.92 1.99 5.14
0.61 0.44 0.88 1.07 4.41 1.98 0.32 0.34 0.76 1.09 1.01 0.93 2.2 0.65 0.97 0.8 0.75 4.48 0.91 0.65 0.54 0.75 0.86 1.03 0.78 0.81 0.85 1.05 1.51 1.21 3.37
0.87 0.6 0.68 0.57 2.13 1.18 0.84 0.8 1.28 1.17 1.03 1.07 0.44 1.52 1.56 0.84 0.68 1.21 0.89 0.8 0.81 0.6 0.33 0.45 0.55 0.76 1.07 0.38 1.32 1.66 2.19
0.66 0.72 1.19 1.63 2.37 1.75 0.93 0.62 1.26 1.44 1.7 1.37 1.55 2.29 1.87 1.53 1.46 2.73 1.38 1.35 1.55 1.44 1.5 1.29 1.48 1.72 1.65 1.26 2.15 2.14 2.8
6.71 7.98 8.63 9.09 11.75 13.08 6.97 6.44 9.21 8.68 10.06 9.71 13.09 13.06 11.99 10.86 8.93 9.67 9.81 8.61 8.57 9.73 8.8 9.43 9.82 9.92 8.38 9.81 10.21 11.16 14.75
3.31 3.96 4.86 6.69 6.07 4.02 2.91 2.61 3.79 4.13 4.68 4.88 4.1 5.82 5.94 3.24 3.24 5.89 4.66 4.54 3.67 3.51 3.98 2.93 3.67 4.05 3.53 2.99 5.49 5.71 8.57
14.17 14.18 15.43 15.84 15.48 15.38 12.75 10.8 14.39 14.08 15.06 13.81 17.15 14.52 11.12 15.65 13.09 25.84 10.42 13.12 12.61 14.08 18.26 11.4 13.5 14.79 15.15 12.0 16.72 15.98 19.28
0.83 0.76 1.18 2.02 2.44 1.71 0.69 0.4 1.47 1.01 1.92 1.08 0.82 0.78 1.04 1.68 1.04 3.4 0.81 0.95 0.82 1.26 1.25 0.68 1.06 1.25 1.35 0.64 1.5 2.34 3.59
0.04 0.03 0.01 0.03 0.57 0.28 0.1 0.12 0.2 0.19 0.16 0.19 0.27 0.25 0.34 0.15 0.19 0.73 0.19 0.12 0.09 0.12 0.19 0.22 0.18 0.18 0.18 0.1 0.19 0.15 0.52
0.21 0.27 0.33 0.68 0.52 0.59 0.34 0.33 0.35 0.43 0.56 0.42 0.37 0.76 0.52 0.51 0.39 0.8 0.5 0.33 0.32 0.35 0.62 0.35 0.41 0.47 0.48 0.29 0.74 0.71 1.23
4.31 5.74 5.06 7.22 15.5 14.36 2.65 3.06 4.24 4.45 4.9 4.41 8.07 9.21 8.45 6.31 4.23 12.57 6.09 3.67 4.94 5.32 3.27 5.24 4.93 5.09 4.92 3.78 8.71 6.61 11.18
0.31 0.23 0.21 0.39 1.1 0.52 0.26 0.19 0.51 0.38 0.54 0.47 0.63 0.73 0.85 0.57 0.41 1.47 0.4 0.34 0.42 0.43 1.19 0.25 0.25 0.38 0.38 0.42 0.74 1.11 1.16
0.63 0.72 0.78 0.97 1.21 1.1 0.72 0.77 0.67 0.72 0.77 0.6 0.48 1.21 1.22 0.91 0.9 1.24 0.79 0.56 0.49 0.53 0.23 0.57 0.62 0.78 0.82 0.35 1.16 1.3 1.8
6.29 7.72 7.46 7.33 12.7 12.07 7.31 6.74 8.31 9.3 9.55 9.9 13.86 12.02 11.83 9.89 10.2 7.97 11.19 9.51 9.27 9.28 9.29 9.2 10.6 10.62 9.89 8.93 11.63 12.76 17.05
3.82 4.6 6.22 7.04 8.85 8.28 5.33 4.47 6.1 6.86 7.62 7.21 8.52 9.35 9.71 6.83 7.1 5.98 6.93 6.47 6.61 6.74 7.51 5.82 6.24 7.21 7.01 6.2 7.87 9.29 12.99
7.41 11.92 10.68 13.69 23.22 17.01 12.82 12.52 19.8 20.61 20.3 17.68 11.84 21.62 25.54 19.5 17.21 13.26 19.09 17.16 16.72 15.9 6.81 12.17 14.29 17.32 17.03 12.84 24.92 25.86 24.1
11.62 17.93 18.37 25.12 35.42 28.46 15.98 14.91 18.52 22.15 24.2 22.27 27.89 24.73 23.55 21.55 19.32 31.94 17.33 18.84 18.99 18.88 17.62 17.57 18.89 20.04 23.26 17.87 27.52 25.29 32.63
6.66 8.5 9.97 12.07 14.57 13.95 8.0 5.65 8.93 9.74 10.81 9.09 10.69 10.28 9.76 10.56 7.58 14.94 9.74 8.28 8.1 8.57 12.12 6.64 8.57 9.53 9.3 8.4 11.04 11.37 13.87
6.7 8.32 11.5 13.36 13.93 13.94 10.24 8.69 13.56 11.09 12.91 12.42 16.34 17.65 14.75 15.89 14.27 18.36 13.96 13.93 13.02 12.94 19.5 12.53 13.12 12.19 12.88 10.85 14.23 14.78 23.5
20.14 20.88 24.79 23.71 30.49 28.94 20.05 16.91 23.8 22.86 27.15 23.55 28.68 31.81 33.04 25.23 24.36 37.93 21.02 22.77 21.32 21.38 28.02 19.21 21.58 22.39 24.46 23.42 27.92 27.42 30.68
2.09 2.66 2.08 3.1 4.01 4.09 3.24 2.51 3.72 3.75 3.95 3.68 4.65 4.38 3.91 3.59 3.61 3.04 3.81 3.51 3.62 3.4 3.06 3.35 3.89 4.05 3.73 3.56 4.23 4.11 6.02
3.35 3.36 4.09 5.19 6.71 4.87 2.77 2.57 4.25 4.39 5.02 4.89 4.92 5.64 5.1 3.87 3.48 6.71 5.07 3.55 3.23 4.33 4.97 3.43 3.82 3.61 3.94 3.45 6.89 6.03 8.64
1.7 2.18 3.48 2.94 4.26 3.43 2.09 1.25 3.08 3.51 2.45 2.45 1.45 4.98 4.07 2.24 2.55 4.62 2.72 1.7 2.14 1.78 3.31 2.48 2.16 1.72 2.27 0.82 3.95 4.58 6.11
0.18 0.42 0.14 0.38 1.87 0.59 0.15 0.06 0.46 0.51 0.81 0.72 0.93 1.49 1.45 0.7 0.44 1.1 0.86 0.46 0.29 0.37 0.12 0.34 0.34 0.27 0.39 0.36 1.25 1.18 2.46
9.13 8.62 10.58 15.36 16.89 14.92 9.49 7.31 12.86 15.07 15.39 14.04 15.31 15.53 16.32 14.5 13.06 13.67 11.31 11.84 11.6 11.98 12.06 11.28 12.3 13.22 13.02 10.72 15.15 16.1 19.1
3.15 2.86 3.53 4.51 8.27 5.67 3.1 2.66 4.65 4.47 5.39 5.37 4.78 6.24 6.84 5.22 4.79 3.71 5.7 4.63 4.33 4.96 2.13 4.3 4.56 4.47 4.57 4.32 6.0 6.75 8.47
2.72 3.33 4.89 7.27 7.56 7.83 4.22 5.04 5.53 6.51 6.84 6.87 7.57 8.77 7.73 6.96 6.28 6.4 6.66 5.25 6.08 6.63 6.97 5.5 5.9 6.87 6.55 4.82 8.0 7.67 11.65
1.27 0.94 2.19 3.65 7.51 5.85 1.98 1.3 2.5 2.44 2.92 2.08 1.68 3.1 3.38 3.0 2.57 3.17 3.31 2.29 3.12 2.98 0.62 1.71 3.21 1.79 2.32 1.95 3.93 3.64 6.77
0.22 0.34 0.33 0.34 0.57 0.48 0.24 0.15 0.27 0.24 0.25 0.22 0.36 0.69 0.47 0.24 0.27 0.49 0.3 0.18 0.3 0.19 0.37 0.17 0.17 0.3 0.27 0.17 0.46 0.42 0.89
15.56 17.49 17.9 22.61 30.58 29.37 19.0 18.29 20.92 22.78 23.25 23.11 29.92 22.88 24.0 25.02 22.21 11.23 20.08 19.3 19.48 21.12 13.75 20.37 21.93 20.27 19.93 20.87 27.67 29.22 35.59
7.45 7.42 10.11 11.41 12.47 12.69 6.04 5.29 10.23 10.38 10.87 10.49 14.23 16.21 13.93 11.16 11.98 18.34 11.36 9.15 10.13 9.82 14.6 10.06 10.3 11.14 12.1 9.18 13.16 12.61 17.07
3.97 3.1 4.35 4.6 7.33 5.79 2.55 1.91 4.07 3.85 4.49 4.5 6.17 7.39 6.02 4.62 4.41 5.15 5.23 4.04 3.85 4.28 2.16 3.33 3.6 4.54 4.1 3.49 4.2 4.48 9.68
4.42 5.82 3.9 5.75 24.72 16.59 12.66 8.77 9.59 10.43 10.65 8.64 10.83 10.43 15.1 15.91 13.6 21.48 11.49 10.08 10.12 8.89 5.07 9.91 10.53 10.84 10.01 10.06 11.96 13.57 15.24
10.13 11.38 12.34 14.93 20.75 18.58 11.26 12.51 12.9 13.98 15.17 15.2 18.41 22.53 17.81 16.25 15.67 9.99 16.37 13.37 14.27 15.15 12.39 15.25 15.55 15.74 15.64 13.64 18.66 19.56 24.08
2.98 4.25 4.67 4.11 5.38 3.45 2.14 2.1 3.15 3.13 3.22 3.1 2.12 5.16 5.1 2.86 2.8 6.78 4.34 2.32 2.13 2.05 0.55 2.47 2.3 2.11 2.52 1.76 4.58 5.29 6.74
10.26 7.67 17.94 27.49 32.62 33.61 12.22 8.17 16.94 18.91 21.33 20.0 26.56 32.22 28.1 18.49 14.82 26.75 22.03 16.85 17.05 17.48 10.77 16.03 18.39 18.11 18.2 15.69 28.92 23.68 43.94
3.55 4.23 5.14 6.7 11.25 8.57 3.97 4.38 6.37 7.72 7.16 7.88 8.35 11.58 9.93 6.05 5.52 7.73 8.12 5.94 5.7 5.45 6.52 4.88 5.2 5.76 6.24 4.68 7.82 8.26 12.14
3.82 4.55 5.36 5.72 7.18 7.87 4.29 2.85 4.79 4.83 5.49 4.97 5.82 6.74 6.02 5.3 4.82 5.47 4.46 4.34 5.11 5.28 3.19 4.49 5.39 5.63 5.38 4.71 5.7 6.08 8.36
2.79 2.88 4.66 5.03 6.55 6.55 4.04 4.72 4.6 5.29 5.99 5.4 6.81 7.54 7.62 5.2 5.22 5.2 6.1 5.06 5.7 5.35 7.08 4.96 5.72 6.52 6.01 5.48 5.91 6.93 9.35
40.59 51.44 57.63 53.36 57.62 46.45 34.13 41.44 41.13 43.06 44.02 48.86 35.64 53.07 40.97 37.97 34.94 71.94 38.67 32.79 35.51 34.89 46.17 28.31 33.56 38.86 37.05 33.95 46.58 45.93 47.85
55.81 57.9 59.25 77.03 137.26 80.65 45.83 45.7 74.7 79.36 75.17 66.31 72.59 77.83 84.55 60.1 58.86 146.64 100.43 70.39 60.12 60.83 113.51 65.01 62.93 61.78 72.93 52.91 119.21 133.71 173.53
2.28 2.53 2.48 2.78 4.87 2.93 1.56 1.49 2.55 2.37 2.29 2.32 2.9 5.47 3.21 2.63 2.41 4.97 2.41 1.68 2.31 2.22 1.99 1.63 2.33 1.87 2.33 2.3 2.54 2.6 5.58
5.14 5.89 6.51 8.05 13.19 10.21 4.29 3.99 6.84 7.07 7.76 8.03 11.88 10.59 10.65 8.02 7.17 9.22 9.09 6.75 6.71 6.73 2.84 6.59 6.95 6.99 7.18 6.91 10.97 10.63 18.59
21.61 26.7 25.26 29.08 42.55 34.68 21.91 18.3 25.2 26.5 28.62 26.53 32.6 34.55 30.52 21.37 22.39 30.58 29.13 24.1 24.47 23.97 26.9 20.07 22.04 23.46 23.17 20.19 33.09 28.28 41.56
2073.35 1933.55 2878.46 3329.83 2665.86 2147.74 758.23 506.63 2089.62 2080.8 2261.33 1867.02 2596.87 1292.07 1115.44 1258.88 983.42 4283.6 1085.68 1144.26 1471.59 1547.32 2447.23 1268.08 1517.15 1863.04 1754.77 974.62 2593.07 2666.95 3397.32
8.05 8.67 9.45 11.6 13.65 12.42 7.7 6.31 12.17 13.03 13.32 13.19 15.14 16.68 15.85 15.1 13.23 17.45 12.12 12.24 12.04 12.48 13.05 11.58 12.01 13.26 14.03 10.14 13.45 13.26 18.12
1.69 1.82 2.59 3.16 3.91 3.5 2.56 2.13 3.1 3.29 3.66 3.06 3.9 4.51 4.13 3.53 3.29 2.86 2.85 3.06 3.0 3.03 2.9 3.08 3.21 3.38 3.31 2.61 4.1 4.4 6.55
0.32 0.22 0.08 0.25 1.79 0.76 0.28 0.13 0.07 0.61 0.4 0.23 0.62 0.76 0.59 0.37 0.12 2.2 0.41 0.42 0.49 0.43 0.55 0.67 0.26 0.34 0.67 0.4 0.59 0.61 1.18
0.96 1.2 1.78 2.54 2.57 2.87 2.16 2.31 2.38 2.4 2.69 2.84 2.68 3.64 3.48 2.53 1.93 2.53 2.6 2.7 2.48 2.26 3.32 2.46 2.51 2.16 2.73 2.21 3.03 3.58 4.51
8.78 9.51 9.85 10.93 16.06 16.32 10.09 8.97 11.86 11.29 12.28 13.17 15.19 16.61 15.43 12.1 11.42 15.33 12.83 11.63 11.26 12.18 7.79 10.43 11.14 11.51 11.95 11.35 14.7 15.95 22.77
5.64 6.08 7.07 8.01 10.22 9.34 4.42 4.25 8.17 6.61 8.49 7.38 8.92 12.37 11.46 8.64 9.36 13.73 8.85 7.56 7.12 7.06 11.43 7.38 6.13 7.84 6.65 6.05 9.21 10.0 11.85
5.0 1.16 7.01 8.05 13.89 5.88 2.27 2.32 4.39 4.61 5.54 6.04 5.64 8.66 5.31 3.78 3.53 15.67 4.15 3.8 3.63 3.34 7.6 3.71 4.07 3.89 4.39 3.81 6.38 6.16 13.28
2.71 4.37 2.72 1.92 12.11 10.22 6.12 6.02 4.18 3.25 4.48 3.29 6.67 9.75 10.63 7.89 7.52 12.93 6.87 4.93 4.93 5.17 3.6 5.82 6.25 6.77 7.05 4.42 8.21 10.06 15.27
Lsat_1_v5_gn_9_15761.1 (AUXILIN-LIKE2)
 1.9 2.61 2.23 3.79 4.67 3.95 2.48 1.8 3.48 3.46 4.2 4.17 4.99 4.15 4.09 3.46 3.43 3.22 4.2 3.65 3.22 3.53 2.92 3.34 3.4 3.43 3.72 3.24 4.03 4.45 5.95
0.53 0.62 1.21 1.17 4.39 3.18 1.01 1.09 1.76 1.91 2.42 1.66 2.46 2.74 2.66 1.45 1.33 4.19 1.23 1.22 2.07 1.67 0.97 0.9 1.01 1.44 2.07 1.03 2.55 1.76 4.56
7.02 8.23 10.03 17.54 35.56 19.5 13.77 23.68 21.88 27.61 27.17 29.92 19.64 36.24 33.29 21.68 19.0 15.42 20.96 17.96 14.74 15.31 7.51 15.87 15.93 14.96 15.96 13.24 32.02 35.08 34.49
4.45 3.69 4.67 6.47 9.13 10.47 6.6 5.42 6.4 7.05 7.48 8.3 9.71 11.54 11.18 7.96 6.31 10.52 7.59 5.95 6.74 5.47 3.77 6.57 6.55 5.96 6.28 6.27 9.29 9.61 14.2
16.07 18.14 22.67 24.32 31.44 30.15 22.22 19.58 19.97 21.38 21.78 21.77 31.49 29.13 27.43 25.14 25.28 19.21 26.05 21.58 21.57 23.75 18.47 22.37 23.57 24.7 23.97 22.46 28.33 30.35 39.35
11.89 11.91 13.13 15.81 19.52 20.67 15.97 15.0 14.86 16.29 17.59 15.97 20.55 21.85 21.88 18.34 15.75 13.05 19.79 16.09 15.15 16.0 13.39 15.94 16.1 17.16 17.25 16.56 18.48 20.03 23.02
4.55 4.39 5.0 6.55 7.67 7.04 4.55 3.64 5.86 7.02 6.83 6.61 7.87 7.8 7.31 6.02 5.49 9.23 4.96 5.53 5.52 4.98 6.75 4.8 5.93 6.41 5.56 5.47 7.38 7.72 9.73
3.08 3.31 2.62 2.38 12.49 6.14 3.42 2.07 3.91 5.02 4.05 4.6 8.18 6.35 8.97 6.65 6.76 5.76 8.3 5.7 5.28 5.03 0.57 4.16 4.33 4.61 3.82 4.78 7.29 6.72 9.55
0.17 0.22 0.43 0.58 0.7 0.65 0.25 0.2 0.37 0.34 0.4 0.31 0.21 0.57 0.46 0.39 0.31 0.56 0.29 0.3 0.24 0.27 0.64 0.25 0.27 0.42 0.27 0.21 0.58 0.57 0.6
5.32 5.28 5.55 4.41 11.82 9.97 9.57 12.08 11.84 13.21 13.43 12.97 4.8 15.34 14.5 10.13 10.46 7.59 8.91 9.72 9.73 9.08 6.11 8.83 8.31 6.71 8.89 6.73 13.97 17.42 16.97

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)