Heatmap: Cluster_202 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_19620.1	-1.19	-0.91	-1.43	-0.95	0.52	0.46	-0.22	-0.33	-0.16	-0.11	-0.14	-0.26	0.18	0.77	0.91	0.23	-0.04	0.16	0.09	-0.15	-0.07	-0.13	0.02	-0.2	-0.28	-0.22	-0.22	-0.13	0.3	0.3	0.57
Lsat_1_v5_gn_0_4981.1 (NAD-ME1)	-0.38	-0.37	-0.63	-0.71	0.34	0.33	-0.1	-0.12	-0.34	-0.32	-0.11	-0.13	0.24	0.54	0.31	0.04	-0.01	0.07	0.15	-0.2	-0.13	-0.06	0.17	-0.07	-0.03	-0.1	-0.05	0.05	0.23	0.23	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_11380.1 (5-FCL)	-0.33	-0.39	-0.54	-0.43	0.35	0.09	-0.31	-0.48	-0.09	-0.05	-0.06	-0.06	0.16	0.36	0.38	0.17	-0.08	-0.01	0.11	-0.17	-0.19	-0.05	0.64	0.01	-0.26	-0.04	-0.13	0.16	0.13	0.13	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_20540.1	-0.72	-0.81	-0.51	-0.35	0.32	0.57	-0.47	-0.75	-0.26	-0.22	0.06	-0.16	-0.16	0.65	0.5	0.32	0.04	-0.89	0.04	-0.12	-0.11	-0.02	0.21	-0.11	-0.03	0.04	0.06	-0.08	0.16	0.35	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_54780.1	-0.25	-0.33	-0.36	-0.23	0.56	0.56	-0.25	-0.3	-0.29	-0.22	-0.12	-0.24	0.1	0.9	0.64	-0.07	-0.27	-0.43	0.06	-0.28	-0.18	-0.11	0.57	-0.21	-0.21	-0.18	-0.28	-0.15	-0.03	-0.09	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_71720.1 (AtSEC23F)	-0.83	-0.44	-0.95	-0.72	0.38	0.42	-0.12	-0.23	-0.28	-0.23	-0.17	-0.16	0.42	0.59	0.4	0.27	0.06	-0.3	0.08	-0.25	-0.09	-0.03	0.36	-0.23	-0.1	0.01	0.02	-0.23	0.2	0.24	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_35481.1	-1.27	-0.96	-1.11	-1.0	0.43	0.63	-0.08	-0.11	-0.13	-0.06	-0.14	-0.22	0.02	0.92	0.73	0.14	-0.13	-0.13	0.18	-0.3	-0.02	-0.13	-0.18	-0.36	-0.15	-0.01	-0.01	-0.31	0.41	0.36	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_64861.1	-0.68	-0.47	-0.64	-0.49	0.42	0.51	0.0	-0.0	-0.26	-0.17	-0.02	-0.04	0.14	0.61	0.47	0.13	-0.06	-0.15	0.02	-0.19	-0.11	0.0	-0.24	-0.18	-0.11	-0.03	-0.09	-0.08	0.29	0.19	0.26
Lsat_1_v5_gn_2_76041.1 (CaM KMT)	-1.04	-1.1	-0.96	-0.49	0.5	0.7	-0.21	-0.6	-0.17	-0.41	-0.18	-0.17	0.12	0.47	0.3	-0.11	-0.24	-0.13	-0.03	-0.03	-0.15	-0.01	0.32	0.15	-0.05	-0.09	-0.0	0.01	0.39	0.27	0.85
Lsat_1_v5_gn_2_87261.1	-2.19	-1.83	-2.18	-1.79	0.8	0.71	-0.35	-0.61	-0.43	-0.37	-0.28	-0.53	-0.01	1.34	1.33	0.3	0.05	0.38	-0.01	-0.44	-0.42	-0.27	0.17	-0.16	-0.5	-0.38	-0.25	-0.71	0.27	0.59	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_96621.1 (AP2A1)	-0.54	-0.41	-0.63	-0.53	0.44	0.27	-0.23	-0.45	-0.12	-0.16	-0.12	-0.01	0.39	0.5	0.37	0.23	0.21	-0.08	-0.1	-0.28	-0.21	-0.14	0.33	-0.38	-0.1	-0.06	-0.13	-0.01	0.16	0.21	0.53
Lsat_1_v5_gn_3_104360.1 (POD1)	-0.73	-0.35	-0.62	-0.28	0.4	0.37	-0.11	-0.05	-0.15	-0.1	-0.07	-0.22	-0.02	0.62	0.5	0.07	-0.01	-0.22	0.03	-0.17	-0.21	-0.11	0.42	-0.31	-0.18	-0.09	-0.09	-0.24	0.23	0.23	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_120281.1 (POP4)	-0.78	-0.2	-0.46	-0.56	0.3	0.35	-0.3	-0.18	-0.26	-0.26	-0.05	-0.26	0.06	0.66	0.52	0.11	-0.1	-0.32	0.17	-0.12	-0.06	0.04	0.23	-0.14	-0.09	-0.03	0.14	0.02	0.29	0.11	0.21
Lsat_1_v5_gn_3_29780.1 (KNF)	-0.29	-0.27	-0.69	-0.36	0.8	0.47	-0.55	-0.43	-0.37	-0.34	-0.12	-0.24	0.14	0.54	0.61	0.15	-0.16	0.08	-0.08	-0.3	-0.22	-0.22	0.7	-0.4	-0.31	-0.29	-0.05	0.04	0.24	0.18	0.18
Lsat_1_v5_gn_3_39241.1 (LGT4)	-0.52	-0.29	-0.59	-0.58	0.37	0.3	0.0	-0.03	-0.26	-0.39	-0.15	-0.19	0.15	0.54	0.52	0.27	0.04	-0.25	0.12	-0.24	-0.11	-0.15	0.09	-0.13	-0.09	0.03	0.02	-0.11	0.26	0.22	0.26
Lsat_1_v5_gn_3_39940.1 (NDB1)	-0.79	-0.65	-0.84	-0.62	0.45	0.7	-0.15	-0.23	-0.42	-0.37	-0.08	-0.39	0.25	0.86	0.66	0.25	-0.02	-0.21	0.07	-0.44	-0.23	-0.07	0.23	-0.22	-0.22	-0.16	-0.09	-0.3	0.28	0.24	0.55
Lsat_1_v5_gn_4_15361.1	-0.68	-0.55	-0.56	-0.49	0.3	0.3	-0.21	-0.42	-0.06	-0.06	0.07	-0.01	0.17	0.4	0.32	0.21	0.02	-0.3	-0.06	-0.05	-0.08	-0.22	0.34	-0.1	-0.01	0.09	0.1	-0.22	0.17	0.22	0.47
Lsat_1_v5_gn_4_170140.1	-0.27	-0.76	-0.67	-0.85	0.5	1.06	-0.58	-0.43	-0.36	-0.54	-0.37	-0.69	0.3	1.1	0.61	0.48	-0.15	-1.42	-0.06	-0.64	-0.12	-0.03	0.41	-0.07	-0.1	-0.04	0.03	-0.57	0.14	0.28	0.46
Lsat_1_v5_gn_4_181101.1	-0.93	-0.49	-1.5	-1.14	0.51	0.42	-0.28	0.14	-0.49	-0.27	-0.13	-0.16	0.61	0.75	0.34	0.24	-0.04	-0.1	-0.21	-0.13	-0.14	0.15	0.17	-0.13	-0.24	-0.08	0.03	0.0	0.24	0.11	0.54
Lsat_1_v5_gn_4_20360.1 (TADA)	-0.63	-0.51	-0.92	-0.52	0.34	0.44	-0.06	-0.03	-0.21	-0.1	-0.07	-0.07	0.31	0.7	0.4	0.04	-0.11	-0.35	0.03	-0.21	-0.2	-0.09	0.02	-0.1	-0.08	-0.07	-0.04	-0.12	0.13	0.21	0.63
Lsat_1_v5_gn_4_35961.1 (GPAT8)	-0.05	-0.29	-0.7	-0.86	0.08	0.7	-0.27	-0.15	-0.39	-0.61	-0.2	-0.47	0.01	0.83	0.72	0.38	0.06	-1.27	0.05	-0.33	-0.09	-0.07	0.4	0.16	-0.05	0.16	0.06	-0.36	0.08	0.15	0.27
Lsat_1_v5_gn_4_38601.1 (VPS20.2)	-0.42	-0.4	-0.26	-0.17	0.55	0.44	-0.08	-0.11	-0.28	-0.1	-0.09	-0.27	-0.01	0.93	0.58	-0.1	-0.28	-0.08	-0.24	-0.31	-0.19	-0.18	0.51	-0.19	-0.3	-0.32	-0.06	-0.19	0.09	0.17	0.16
Lsat_1_v5_gn_4_42700.1 (GOS12)	-0.71	-0.37	-0.76	-0.74	0.35	0.38	-0.06	-0.14	-0.28	-0.09	-0.19	-0.21	0.4	0.54	0.27	0.02	-0.12	0.06	-0.11	-0.03	-0.04	0.07	0.11	-0.02	0.01	-0.04	0.03	-0.01	0.12	0.13	0.43
Lsat_1_v5_gn_4_56520.1 (MAMI)	-0.28	-0.66	-0.31	-0.24	0.72	0.52	-0.63	-0.76	-0.43	-0.32	-0.25	-0.37	0.07	0.73	0.68	0.11	-0.26	0.23	0.06	-0.38	-0.3	-0.12	0.69	-0.37	-0.3	-0.18	-0.13	-0.19	0.28	0.22	0.3
Lsat_1_v5_gn_4_6500.1 (ARL1)	-0.42	-0.25	-0.22	-0.35	0.24	0.36	0.03	0.03	-0.24	-0.29	-0.21	-0.36	0.24	0.7	0.58	-0.04	-0.23	-0.3	0.02	-0.23	-0.23	-0.06	0.51	-0.25	-0.35	-0.12	-0.28	-0.26	0.14	0.18	0.55
Lsat_1_v5_gn_4_7040.1 (AP1G1)	-0.37	-0.14	-0.68	-0.65	0.38	0.45	-0.13	-0.26	-0.2	-0.21	-0.14	-0.22	0.1	0.24	0.12	0.07	-0.16	0.09	0.09	-0.09	-0.04	-0.01	0.38	-0.12	0.01	0.08	0.15	0.02	0.17	0.06	0.32
Lsat_1_v5_gn_4_74180.1 (GASA11)	-2.99	-3.88	-4.52	-3.88	0.31	1.48	-0.22	-0.41	-1.51	-1.47	-1.69	-1.09	-1.25	2.28	2.02	0.42	-0.69	-1.03	0.55	-0.62	0.02	0.22	0.42	-0.9	-0.54	-0.08	0.09	0.87	-0.81	-2.36	-1.61
Lsat_1_v5_gn_5_131541.1	-1.05	-0.95	-0.51	-0.29	0.42	0.8	-0.29	-0.71	-0.44	-0.24	-0.17	-0.5	0.14	1.27	0.95	0.41	-0.01	-0.24	0.17	-0.31	-0.14	0.08	0.24	-0.47	-0.2	0.06	-0.03	-0.12	-0.26	-0.41	-0.02
Lsat_1_v5_gn_5_133880.1 (ATB BETA)	-0.78	-0.76	-0.97	-0.77	0.4	0.46	-0.03	-0.13	-0.12	-0.09	-0.02	-0.12	0.24	0.56	0.54	0.18	-0.07	0.11	-0.08	-0.1	-0.16	-0.07	0.34	-0.21	-0.11	-0.13	-0.09	-0.1	0.25	0.17	0.29
Lsat_1_v5_gn_5_136120.1	-2.12	-2.16	-1.63	-1.54	0.29	0.73	-0.3	-2.24	0.04	0.14	-0.35	0.29	-0.94	1.98	1.37	0.81	0.52	-0.8	0.04	-0.28	-0.4	-0.11	-0.57	-1.03	-0.19	0.14	-0.08	-0.3	-0.27	-0.72	0.2
Lsat_1_v5_gn_5_137241.1 (LE)	-0.46	-0.37	-0.73	-0.65	0.7	0.6	-0.22	-0.14	-0.3	-0.3	-0.14	-0.31	0.05	0.62	0.48	0.11	-0.16	-0.09	0.02	-0.36	-0.17	-0.09	0.45	-0.24	-0.18	-0.14	-0.07	-0.31	0.33	0.26	0.38
Lsat_1_v5_gn_5_161461.1 (STL2)	-0.73	-0.42	-0.83	-0.75	0.5	0.32	-0.28	-0.38	-0.23	-0.01	-0.18	-0.04	0.35	0.58	0.5	0.16	0.03	-0.05	0.02	-0.04	-0.16	-0.16	0.2	-0.3	-0.19	0.03	-0.04	-0.18	0.15	0.18	0.61
Lsat_1_v5_gn_5_184280.1 (MARD1)	-2.48	-1.76	-2.09	-1.62	0.69	1.01	-0.31	-0.49	-0.33	-0.5	-0.12	-0.49	-0.66	1.13	1.3	0.35	-0.26	0.33	0.46	-0.19	-0.12	-0.06	-0.16	-0.18	-0.13	-0.04	0.12	-0.56	0.24	0.08	0.33
Lsat_1_v5_gn_5_48640.1 (RABH1e)	-0.22	-0.62	-0.51	-0.26	0.28	0.41	-0.29	-0.53	-0.09	-0.16	-0.19	-0.01	0.24	0.42	0.27	-0.18	-0.01	-0.02	-0.04	-0.04	-0.1	-0.12	0.41	-0.1	0.11	0.01	0.09	0.15	0.27	0.01	0.09
Lsat_1_v5_gn_5_6480.1 (HYD1)	-0.68	-0.83	-0.97	-0.55	0.75	0.32	-0.68	-0.6	-0.24	0.07	-0.05	-0.03	0.39	0.3	0.57	0.12	0.04	-0.03	-0.05	-0.16	-0.2	-0.12	0.64	-0.08	-0.23	-0.14	-0.29	-0.02	0.17	0.26	0.48
Lsat_1_v5_gn_5_75300.1 (PNC1)	-0.59	-0.56	-0.54	-0.36	0.9	0.71	-0.6	-0.18	-0.42	-0.46	-0.38	-0.29	-0.26	0.95	0.68	-0.13	-0.43	-0.01	0.08	-0.42	-0.39	-0.32	0.63	-0.22	-0.31	-0.43	-0.19	-0.35	0.53	0.29	0.49
Lsat_1_v5_gn_5_80020.1 (IEF)	-0.48	-0.31	-0.73	-0.67	0.77	0.46	-0.2	-0.12	-0.36	-0.32	-0.2	-0.28	0.13	0.64	0.46	-0.03	-0.08	-0.08	-0.08	-0.37	-0.23	-0.18	0.84	-0.35	-0.26	-0.23	-0.21	-0.09	0.29	0.17	0.39
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.