Heatmap: Cluster_202 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
2.77 3.36 2.35 3.26 9.03 8.69 5.43 5.01 5.65 5.85 5.73 5.28 7.16 10.8 11.84 7.4 6.13 7.04 6.74 5.69 6.03 5.77 6.41 5.48 5.19 5.42 5.42 5.78 7.79 7.8 9.38
29.91 30.26 25.18 23.83 49.36 48.9 36.38 35.99 30.83 31.35 36.25 35.59 46.21 56.6 48.51 40.04 38.69 41.03 43.35 34.02 35.72 37.36 43.99 37.16 38.32 36.5 37.81 40.46 45.84 45.79 48.55
6.36 6.12 5.5 5.91 10.2 8.53 6.45 5.74 7.5 7.71 7.68 7.66 8.94 10.25 10.38 8.98 7.58 7.95 8.6 7.1 6.99 7.71 12.47 8.03 6.68 7.79 7.29 8.9 8.73 8.76 9.28
28.54 26.93 33.12 36.94 58.66 69.71 33.95 28.04 39.39 40.48 49.11 42.25 42.24 73.7 66.48 58.95 48.34 25.42 48.25 43.4 43.61 46.58 54.48 43.56 46.21 48.49 49.22 44.66 52.57 59.86 76.75
27.64 26.18 25.47 27.95 48.22 48.29 27.61 26.62 26.89 28.25 30.24 27.81 35.06 61.2 51.16 31.29 27.25 24.26 34.22 27.05 28.92 30.39 48.69 28.27 28.41 29.0 27.04 29.64 32.03 30.91 40.81
11.33 14.85 10.43 12.21 26.3 27.01 18.61 17.19 16.56 17.17 17.88 18.11 27.01 30.34 26.67 24.4 21.08 16.42 21.26 16.93 18.93 19.81 25.98 17.14 18.77 20.3 20.4 17.21 23.14 23.86 28.05
7.3 9.05 8.12 8.81 23.66 27.26 16.62 16.33 16.08 16.83 16.0 15.04 17.84 33.31 29.07 19.4 16.08 16.07 19.93 14.25 17.3 16.11 15.54 13.7 15.79 17.42 17.45 14.14 23.28 22.51 24.31
8.18 9.5 8.43 9.34 17.59 18.77 13.14 13.1 10.95 11.68 12.93 12.76 14.44 20.06 18.15 14.38 12.57 11.82 13.34 11.55 12.2 13.15 11.14 11.59 12.15 12.89 12.36 12.47 16.03 14.94 15.75
1.79 1.71 1.89 2.63 5.22 5.97 3.19 2.43 3.26 2.77 3.26 3.27 3.99 5.09 4.55 3.42 3.12 3.38 3.62 3.61 3.31 3.67 4.61 4.1 3.55 3.47 3.68 3.71 4.83 4.45 6.66
0.35 0.45 0.35 0.46 2.8 2.64 1.26 1.06 1.2 1.24 1.32 1.11 1.6 4.08 4.06 1.98 1.67 2.09 1.6 1.19 1.2 1.34 1.81 1.44 1.14 1.24 1.35 0.99 1.94 2.43 2.54
5.98 6.53 5.59 5.99 11.72 10.44 7.38 6.34 8.0 7.74 7.97 8.58 11.35 12.24 11.23 10.14 9.99 8.17 8.07 7.12 7.49 7.86 10.87 6.63 8.09 8.28 7.91 8.61 9.7 10.05 12.52
5.13 6.69 5.55 7.0 11.21 10.97 7.91 8.21 7.65 7.94 8.13 7.32 8.41 13.13 12.01 8.92 8.45 7.3 8.67 7.56 7.38 7.86 11.36 6.88 7.49 7.99 8.0 7.22 9.97 9.96 11.59
3.18 4.76 3.97 3.72 6.76 6.97 4.43 4.83 4.56 4.56 5.31 4.57 5.71 8.66 7.87 5.9 5.12 4.4 6.16 5.02 5.23 5.65 6.41 4.96 5.16 5.35 6.05 5.56 6.68 5.89 6.34
8.48 8.64 6.42 8.12 18.06 14.41 7.07 7.69 8.03 8.2 9.58 8.78 11.46 15.13 15.88 11.52 9.31 10.95 9.85 8.46 8.94 8.94 16.89 7.89 8.36 8.48 10.03 10.69 12.25 11.75 11.78
10.1 11.8 9.63 9.66 18.67 17.8 14.49 14.16 12.12 11.07 13.04 12.7 16.08 21.04 20.76 17.49 14.85 12.18 15.77 12.24 13.38 13.08 15.36 13.2 13.65 14.79 14.68 13.44 17.32 16.89 17.36
9.9 10.89 9.56 11.12 23.39 27.8 15.4 14.57 12.75 13.21 16.2 13.06 20.38 31.06 27.08 20.32 16.94 14.79 18.03 12.65 14.56 16.32 20.06 14.67 14.65 15.28 16.08 13.87 20.78 20.2 25.12
13.32 14.57 14.5 15.26 26.29 26.28 18.44 15.99 20.44 20.48 22.47 21.22 24.03 28.21 26.72 24.76 21.68 17.4 20.53 20.7 20.2 18.4 27.04 19.93 21.2 22.69 22.85 18.38 24.06 24.94 29.51
58.33 41.51 44.18 39.19 99.4 146.59 47.03 52.31 54.69 48.52 54.61 43.5 86.48 150.56 107.71 97.93 63.35 26.26 67.52 45.24 64.63 68.84 93.69 67.21 65.53 68.62 72.02 47.57 77.33 85.32 97.11
1.4 1.9 0.94 1.21 3.81 3.58 2.2 2.94 1.9 2.22 2.44 2.39 4.08 4.48 3.39 3.17 2.59 2.49 2.32 2.45 2.42 2.96 3.02 2.45 2.27 2.52 2.73 2.68 3.15 2.89 3.89
4.7 5.09 3.83 5.05 9.19 9.89 6.95 7.12 6.3 6.79 6.94 6.95 9.0 11.8 9.59 7.46 6.75 5.69 7.43 6.29 6.3 6.84 7.39 6.78 6.88 6.94 7.06 6.68 7.97 8.39 11.23
42.04 35.58 26.71 23.99 45.88 70.46 35.93 39.08 33.21 28.45 37.81 31.26 43.77 77.04 71.71 56.44 45.39 18.0 45.05 34.44 40.77 41.37 57.23 48.48 42.02 48.49 45.12 33.95 45.77 48.25 52.49
13.0 13.12 14.54 15.38 25.44 23.61 16.42 16.05 14.25 16.25 16.33 14.35 17.22 33.01 25.92 16.17 14.25 16.47 14.68 14.03 15.22 15.36 24.72 15.2 14.06 13.9 16.64 15.21 18.44 19.57 19.35
9.62 12.2 9.28 9.45 20.03 20.5 15.15 14.3 12.95 14.83 13.8 13.62 20.81 22.86 19.03 15.95 14.52 16.45 14.64 15.42 15.34 16.57 16.95 15.53 15.89 15.35 16.13 15.62 17.07 17.26 21.27
24.72 19.11 24.3 25.41 49.65 43.29 19.49 17.74 22.3 24.09 25.36 23.26 31.61 49.9 48.22 32.46 25.17 35.28 31.32 23.1 24.45 27.61 48.52 23.29 24.51 26.61 27.53 26.34 36.5 35.06 37.12
9.08 10.17 10.43 9.5 14.27 15.59 12.39 12.4 10.26 9.91 10.44 9.47 14.3 19.75 18.14 11.82 10.32 9.88 12.33 10.34 10.33 11.62 17.21 10.21 9.48 11.13 9.99 10.13 13.31 13.76 17.76
23.37 27.41 18.78 19.23 39.08 41.1 27.53 25.12 26.23 26.06 27.38 25.77 32.19 35.61 32.63 31.62 26.99 32.0 31.96 28.31 29.3 29.93 39.31 27.71 30.3 31.93 33.3 30.53 33.86 31.36 37.62
20.39 11.01 7.08 11.01 201.29 452.47 139.14 121.79 56.95 58.65 50.15 76.02 68.32 788.15 655.78 216.76 100.74 79.55 237.54 105.47 164.35 188.34 217.43 86.68 111.5 153.38 172.75 296.33 92.52 31.48 53.14
7.56 8.09 10.95 12.74 20.84 27.26 12.82 9.52 11.52 13.23 13.89 11.07 17.23 37.55 30.25 20.7 15.49 13.24 17.61 12.57 14.17 16.51 18.4 11.28 13.61 16.28 15.33 14.34 13.03 11.78 15.4
12.01 12.14 10.5 12.1 27.14 28.22 20.13 18.83 18.95 19.3 20.28 18.93 24.27 30.43 29.85 23.39 19.66 22.15 19.53 19.25 18.36 19.67 26.1 17.79 19.02 18.86 19.29 19.17 24.44 23.09 25.13
0.19 0.19 0.27 0.29 1.03 1.39 0.68 0.18 0.86 0.92 0.66 1.03 0.44 3.31 2.16 1.47 1.2 0.48 0.86 0.69 0.63 0.78 0.57 0.41 0.74 0.92 0.79 0.68 0.69 0.51 0.96
35.38 37.52 29.2 31.02 78.76 73.53 41.75 44.1 39.48 39.31 44.09 39.22 50.41 74.4 67.81 52.26 43.59 45.7 49.33 37.82 43.21 45.75 66.21 41.13 42.92 44.03 46.13 39.14 60.83 58.12 63.09
5.41 6.7 5.03 5.31 12.65 11.17 7.36 6.89 7.62 8.9 7.93 8.73 11.44 13.39 12.68 10.0 9.18 8.68 9.1 8.74 8.03 8.0 10.28 7.28 7.86 9.16 8.74 7.9 9.96 10.13 13.66
6.17 10.11 8.06 11.13 55.31 69.02 27.78 24.45 27.22 24.3 31.57 24.4 21.77 74.91 84.32 43.83 28.7 43.22 47.24 30.14 31.61 32.96 30.64 30.26 31.45 33.28 37.21 23.28 40.62 36.28 43.04
11.01 8.31 9.01 10.69 15.53 16.98 10.48 8.89 11.99 11.44 11.24 12.7 15.13 17.17 15.41 11.27 12.69 12.62 12.47 12.45 11.97 11.8 16.98 11.97 13.79 12.91 13.65 14.21 15.41 12.85 13.61
6.2 5.58 5.07 6.82 16.77 12.44 6.23 6.55 8.43 10.43 9.61 9.78 13.02 12.23 14.79 10.85 10.27 9.72 9.63 8.9 8.68 9.14 15.55 9.4 8.49 9.03 8.13 9.8 11.18 11.94 13.89
6.72 6.86 6.94 7.91 18.95 16.58 6.66 8.94 7.58 7.34 7.79 8.29 8.47 19.54 16.17 9.24 7.51 10.06 10.73 7.58 7.74 8.11 15.64 8.66 8.16 7.51 8.85 7.94 14.63 12.38 14.24
8.46 9.5 7.09 7.39 20.01 16.2 10.26 10.79 9.17 9.45 10.25 9.66 12.89 18.33 16.23 11.51 11.1 11.16 11.16 9.11 10.02 10.38 21.1 9.23 9.85 10.06 10.14 11.08 14.39 13.2 15.44
6.55 6.42 4.8 4.9 14.29 13.51 8.2 5.71 6.99 7.76 8.69 9.26 11.83 14.79 14.23 11.22 10.31 11.29 10.52 9.12 9.58 10.31 15.18 8.27 10.23 10.03 10.53 10.59 13.24 12.15 11.67
6.01 7.85 5.8 6.42 11.03 10.54 9.12 8.59 7.71 7.77 8.33 8.18 9.07 13.73 12.72 9.15 8.76 7.31 8.81 7.76 8.05 8.38 12.89 7.53 7.52 8.72 8.43 8.21 10.71 10.13 10.83
2.61 2.8 1.67 2.13 7.47 7.01 3.25 3.04 5.72 5.88 6.36 5.1 7.48 6.97 7.28 6.08 6.14 4.83 5.52 4.17 4.41 5.65 5.51 4.67 4.81 5.69 5.01 4.76 6.7 6.74 8.72
30.4 35.87 24.81 25.39 51.01 58.0 43.95 41.44 33.05 35.01 36.69 34.48 42.5 58.16 50.87 45.56 39.61 40.63 43.73 36.81 36.72 39.29 43.69 33.25 35.83 39.46 41.26 36.68 45.64 42.56 48.8
25.75 26.78 25.87 24.6 36.87 38.74 24.15 24.9 22.14 21.46 24.99 23.21 30.2 50.3 42.95 29.72 25.44 23.67 28.07 22.75 24.7 26.96 44.23 22.79 26.14 25.81 26.03 25.93 32.64 29.82 36.45
3.33 3.45 3.49 4.22 8.28 8.2 5.05 5.86 5.24 5.1 5.56 5.5 7.31 10.57 9.08 5.55 5.98 5.03 6.21 5.5 5.32 5.71 7.18 5.13 4.96 5.99 5.68 5.7 7.27 6.44 9.08
4.4 5.91 4.83 7.02 14.97 13.67 5.54 4.56 6.32 7.55 6.76 7.02 5.46 15.44 14.93 8.85 5.98 8.92 8.81 6.64 5.87 6.26 11.79 6.78 6.67 6.61 7.77 5.21 11.5 10.66 11.23
6.13 7.54 5.4 5.76 11.07 11.77 7.65 6.46 7.19 6.99 7.53 7.01 9.14 13.11 10.71 8.88 7.71 7.36 7.2 6.57 6.57 7.45 9.06 6.8 7.34 7.69 7.67 7.6 9.43 9.35 10.43
6.81 7.71 7.48 7.86 14.92 15.99 7.45 5.89 9.88 8.81 10.79 10.27 14.17 22.48 18.96 14.55 12.24 14.03 12.07 10.34 10.25 11.29 15.85 9.09 11.02 11.93 11.26 10.99 13.98 13.33 13.08
6.44 7.17 6.85 8.92 36.86 47.12 16.79 14.92 19.6 20.74 21.65 17.87 18.48 55.14 46.94 30.54 24.71 22.9 30.49 22.52 21.4 26.55 23.1 20.76 19.81 24.88 25.23 20.37 21.9 22.55 27.77
33.46 31.88 30.17 26.96 39.58 41.07 31.83 32.36 32.51 32.08 36.07 33.94 36.33 51.54 45.94 35.55 33.71 18.45 37.55 32.58 33.01 34.63 38.45 34.34 33.14 32.56 34.4 32.62 33.79 34.76 42.2
6.6 7.33 6.53 6.7 16.17 13.5 8.1 8.36 7.39 7.04 7.76 7.42 8.81 16.1 14.55 10.26 8.11 11.51 9.07 7.46 7.84 7.85 15.77 6.8 7.41 8.42 8.55 8.5 11.45 11.25 11.65
27.55 29.68 28.78 33.44 46.11 50.68 29.75 30.55 27.9 29.25 34.23 28.65 38.75 58.39 44.57 35.94 29.38 23.44 32.34 28.6 30.15 32.49 42.35 32.57 32.65 33.03 34.42 29.41 39.51 39.85 45.61
5.6 6.23 5.02 5.53 11.43 10.19 6.92 6.49 6.89 6.87 6.88 6.56 8.31 12.5 10.58 7.5 6.96 6.13 7.49 6.18 6.32 6.93 10.89 5.95 6.88 6.79 7.4 6.73 10.03 9.37 10.76
3.61 2.97 1.95 3.25 8.34 9.36 3.48 2.93 4.74 4.72 5.47 5.44 6.14 8.64 8.32 6.62 4.84 4.41 7.84 5.36 6.86 6.91 9.35 6.03 6.12 6.73 6.94 7.32 8.27 7.81 10.73
17.07 17.9 14.51 20.56 33.67 35.86 21.95 21.97 21.62 20.5 22.92 22.14 30.44 30.49 29.67 23.96 20.56 27.64 24.62 22.31 24.76 24.6 33.1 21.81 24.24 25.38 24.79 29.33 28.13 26.76 29.32
7.15 8.28 8.21 9.51 16.44 17.33 11.27 12.21 10.24 10.61 11.8 10.48 12.64 21.19 20.17 14.33 12.73 10.35 12.38 10.1 10.74 11.25 10.35 10.01 10.71 11.28 11.56 9.35 13.28 14.35 17.06
4.47 5.71 3.9 4.66 11.16 10.42 6.69 6.98 6.65 5.88 7.96 6.9 7.94 13.63 11.65 7.93 7.07 7.2 7.24 5.79 6.14 7.07 7.07 5.67 6.69 6.89 7.17 6.17 9.85 8.84 9.69
6.07 6.26 6.09 8.15 13.5 12.45 9.5 8.7 8.48 9.51 9.67 9.66 11.22 15.29 14.55 9.49 8.46 9.5 9.75 8.32 8.63 9.16 10.16 7.91 8.43 8.55 9.59 7.67 10.75 10.21 14.28
9.35 8.49 7.07 7.62 14.63 14.09 10.01 10.21 9.16 10.32 10.85 10.87 12.68 15.52 13.33 11.48 10.67 8.93 10.83 9.39 10.2 10.47 12.38 11.04 9.97 10.14 10.61 11.32 12.38 11.34 14.54
11.0 10.99 12.1 13.11 18.25 18.66 13.65 16.16 12.95 12.77 13.35 13.08 16.86 23.47 20.78 15.07 14.39 11.67 15.74 12.37 12.79 13.84 17.26 13.36 12.81 14.69 13.05 13.18 16.63 15.7 19.71
6.2 5.58 5.07 6.82 16.77 12.44 6.23 6.55 8.43 10.43 9.61 9.78 13.02 12.23 14.79 10.85 10.27 9.72 9.63 8.9 8.68 9.14 15.55 9.4 8.49 9.03 8.13 9.8 11.18 11.94 13.89
2.39 3.09 3.54 3.33 9.34 9.24 5.64 5.03 6.71 6.41 6.67 6.69 9.24 9.09 9.99 8.49 7.82 7.62 5.99 6.31 5.79 6.36 9.89 5.58 6.33 6.93 6.89 5.73 8.24 8.32 11.0
7.82 8.79 8.54 9.14 13.13 16.09 10.33 8.81 9.25 8.22 10.36 8.96 10.46 16.23 14.42 12.53 10.03 9.21 10.59 9.25 11.38 11.8 14.2 8.92 10.04 11.91 12.35 11.03 12.01 12.67 14.24
77.57 77.11 67.37 71.51 160.03 166.81 103.81 103.47 100.04 102.26 98.62 97.23 152.9 180.02 140.21 108.25 109.13 96.58 96.92 101.0 100.79 112.61 111.78 105.68 109.18 110.53 110.83 116.22 140.37 130.3 155.03
7.92 6.19 7.97 7.34 18.2 20.19 8.69 8.06 9.3 8.63 11.33 9.81 12.98 26.36 20.69 13.84 11.8 9.62 12.77 9.85 11.08 12.18 12.64 9.63 11.37 11.65 12.3 10.52 10.48 11.87 16.6
4.69 5.3 5.23 6.18 9.02 8.46 6.01 5.74 5.9 7.05 6.59 7.17 7.9 12.55 11.18 7.94 7.55 7.52 8.69 6.91 6.39 6.7 8.46 5.97 6.06 6.97 6.96 5.95 7.85 7.8 10.17
1.26 0.98 1.99 3.01 10.14 11.75 3.58 2.39 4.19 3.39 4.86 3.44 4.09 14.44 14.6 6.96 5.42 7.51 7.37 4.47 4.75 5.25 6.91 5.41 5.74 6.24 6.62 3.79 7.17 6.02 8.63

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)