Heatmap: Cluster_202 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.23 0.28 0.2 0.28 0.76 0.73 0.46 0.42 0.48 0.49 0.48 0.45 0.61 0.91 1.0 0.63 0.52 0.59 0.57 0.48 0.51 0.49 0.54 0.46 0.44 0.46 0.46 0.49 0.66 0.66 0.79
0.53 0.53 0.44 0.42 0.87 0.86 0.64 0.64 0.54 0.55 0.64 0.63 0.82 1.0 0.86 0.71 0.68 0.72 0.77 0.6 0.63 0.66 0.78 0.66 0.68 0.64 0.67 0.71 0.81 0.81 0.86
0.51 0.49 0.44 0.47 0.82 0.68 0.52 0.46 0.6 0.62 0.62 0.61 0.72 0.82 0.83 0.72 0.61 0.64 0.69 0.57 0.56 0.62 1.0 0.64 0.54 0.62 0.58 0.71 0.7 0.7 0.74
0.37 0.35 0.43 0.48 0.76 0.91 0.44 0.37 0.51 0.53 0.64 0.55 0.55 0.96 0.87 0.77 0.63 0.33 0.63 0.57 0.57 0.61 0.71 0.57 0.6 0.63 0.64 0.58 0.68 0.78 1.0
0.45 0.43 0.42 0.46 0.79 0.79 0.45 0.43 0.44 0.46 0.49 0.45 0.57 1.0 0.84 0.51 0.45 0.4 0.56 0.44 0.47 0.5 0.8 0.46 0.46 0.47 0.44 0.48 0.52 0.51 0.67
0.37 0.49 0.34 0.4 0.87 0.89 0.61 0.57 0.55 0.57 0.59 0.6 0.89 1.0 0.88 0.8 0.69 0.54 0.7 0.56 0.62 0.65 0.86 0.57 0.62 0.67 0.67 0.57 0.76 0.79 0.92
0.22 0.27 0.24 0.26 0.71 0.82 0.5 0.49 0.48 0.51 0.48 0.45 0.54 1.0 0.87 0.58 0.48 0.48 0.6 0.43 0.52 0.48 0.47 0.41 0.47 0.52 0.52 0.42 0.7 0.68 0.73
0.41 0.47 0.42 0.47 0.88 0.94 0.66 0.65 0.55 0.58 0.64 0.64 0.72 1.0 0.9 0.72 0.63 0.59 0.67 0.58 0.61 0.66 0.56 0.58 0.61 0.64 0.62 0.62 0.8 0.74 0.79
0.27 0.26 0.28 0.4 0.78 0.9 0.48 0.36 0.49 0.42 0.49 0.49 0.6 0.76 0.68 0.51 0.47 0.51 0.54 0.54 0.5 0.55 0.69 0.62 0.53 0.52 0.55 0.56 0.73 0.67 1.0
0.09 0.11 0.09 0.11 0.69 0.65 0.31 0.26 0.29 0.3 0.32 0.27 0.39 1.0 0.99 0.48 0.41 0.51 0.39 0.29 0.3 0.33 0.44 0.35 0.28 0.3 0.33 0.24 0.47 0.6 0.62
0.48 0.52 0.45 0.48 0.94 0.83 0.59 0.51 0.64 0.62 0.64 0.68 0.91 0.98 0.9 0.81 0.8 0.65 0.64 0.57 0.6 0.63 0.87 0.53 0.65 0.66 0.63 0.69 0.77 0.8 1.0
0.39 0.51 0.42 0.53 0.85 0.84 0.6 0.63 0.58 0.6 0.62 0.56 0.64 1.0 0.91 0.68 0.64 0.56 0.66 0.58 0.56 0.6 0.87 0.52 0.57 0.61 0.61 0.55 0.76 0.76 0.88
0.37 0.55 0.46 0.43 0.78 0.8 0.51 0.56 0.53 0.53 0.61 0.53 0.66 1.0 0.91 0.68 0.59 0.51 0.71 0.58 0.6 0.65 0.74 0.57 0.6 0.62 0.7 0.64 0.77 0.68 0.73
0.47 0.48 0.36 0.45 1.0 0.8 0.39 0.43 0.44 0.45 0.53 0.49 0.63 0.84 0.88 0.64 0.52 0.61 0.55 0.47 0.49 0.49 0.94 0.44 0.46 0.47 0.56 0.59 0.68 0.65 0.65
0.48 0.56 0.46 0.46 0.89 0.85 0.69 0.67 0.58 0.53 0.62 0.6 0.76 1.0 0.99 0.83 0.71 0.58 0.75 0.58 0.64 0.62 0.73 0.63 0.65 0.7 0.7 0.64 0.82 0.8 0.83
0.32 0.35 0.31 0.36 0.75 0.9 0.5 0.47 0.41 0.43 0.52 0.42 0.66 1.0 0.87 0.65 0.55 0.48 0.58 0.41 0.47 0.53 0.65 0.47 0.47 0.49 0.52 0.45 0.67 0.65 0.81
0.45 0.49 0.49 0.52 0.89 0.89 0.62 0.54 0.69 0.69 0.76 0.72 0.81 0.96 0.91 0.84 0.73 0.59 0.7 0.7 0.68 0.62 0.92 0.68 0.72 0.77 0.77 0.62 0.82 0.85 1.0
0.39 0.28 0.29 0.26 0.66 0.97 0.31 0.35 0.36 0.32 0.36 0.29 0.57 1.0 0.72 0.65 0.42 0.17 0.45 0.3 0.43 0.46 0.62 0.45 0.44 0.46 0.48 0.32 0.51 0.57 0.64
0.31 0.42 0.21 0.27 0.85 0.8 0.49 0.66 0.42 0.5 0.54 0.53 0.91 1.0 0.76 0.71 0.58 0.56 0.52 0.55 0.54 0.66 0.67 0.55 0.51 0.56 0.61 0.6 0.7 0.65 0.87
0.4 0.43 0.32 0.43 0.78 0.84 0.59 0.6 0.53 0.58 0.59 0.59 0.76 1.0 0.81 0.63 0.57 0.48 0.63 0.53 0.53 0.58 0.63 0.57 0.58 0.59 0.6 0.57 0.68 0.71 0.95
0.55 0.46 0.35 0.31 0.6 0.91 0.47 0.51 0.43 0.37 0.49 0.41 0.57 1.0 0.93 0.73 0.59 0.23 0.58 0.45 0.53 0.54 0.74 0.63 0.55 0.63 0.59 0.44 0.59 0.63 0.68
0.39 0.4 0.44 0.47 0.77 0.72 0.5 0.49 0.43 0.49 0.49 0.43 0.52 1.0 0.79 0.49 0.43 0.5 0.44 0.43 0.46 0.47 0.75 0.46 0.43 0.42 0.5 0.46 0.56 0.59 0.59
0.42 0.53 0.41 0.41 0.88 0.9 0.66 0.63 0.57 0.65 0.6 0.6 0.91 1.0 0.83 0.7 0.63 0.72 0.64 0.67 0.67 0.72 0.74 0.68 0.69 0.67 0.71 0.68 0.75 0.75 0.93
0.5 0.38 0.49 0.51 0.99 0.87 0.39 0.36 0.45 0.48 0.51 0.47 0.63 1.0 0.97 0.65 0.5 0.71 0.63 0.46 0.49 0.55 0.97 0.47 0.49 0.53 0.55 0.53 0.73 0.7 0.74
0.46 0.51 0.53 0.48 0.72 0.79 0.63 0.63 0.52 0.5 0.53 0.48 0.72 1.0 0.92 0.6 0.52 0.5 0.62 0.52 0.52 0.59 0.87 0.52 0.48 0.56 0.51 0.51 0.67 0.7 0.9
0.57 0.67 0.46 0.47 0.95 1.0 0.67 0.61 0.64 0.63 0.67 0.63 0.78 0.87 0.79 0.77 0.66 0.78 0.78 0.69 0.71 0.73 0.96 0.67 0.74 0.78 0.81 0.74 0.82 0.76 0.92
0.03 0.01 0.01 0.01 0.26 0.57 0.18 0.15 0.07 0.07 0.06 0.1 0.09 1.0 0.83 0.28 0.13 0.1 0.3 0.13 0.21 0.24 0.28 0.11 0.14 0.19 0.22 0.38 0.12 0.04 0.07
0.2 0.22 0.29 0.34 0.56 0.73 0.34 0.25 0.31 0.35 0.37 0.29 0.46 1.0 0.81 0.55 0.41 0.35 0.47 0.33 0.38 0.44 0.49 0.3 0.36 0.43 0.41 0.38 0.35 0.31 0.41
0.39 0.4 0.35 0.4 0.89 0.93 0.66 0.62 0.62 0.63 0.67 0.62 0.8 1.0 0.98 0.77 0.65 0.73 0.64 0.63 0.6 0.65 0.86 0.58 0.62 0.62 0.63 0.63 0.8 0.76 0.83
0.06 0.06 0.08 0.09 0.31 0.42 0.21 0.05 0.26 0.28 0.2 0.31 0.13 1.0 0.65 0.45 0.36 0.15 0.26 0.21 0.19 0.23 0.17 0.12 0.22 0.28 0.24 0.21 0.21 0.15 0.29
0.45 0.48 0.37 0.39 1.0 0.93 0.53 0.56 0.5 0.5 0.56 0.5 0.64 0.94 0.86 0.66 0.55 0.58 0.63 0.48 0.55 0.58 0.84 0.52 0.54 0.56 0.59 0.5 0.77 0.74 0.8
0.4 0.49 0.37 0.39 0.93 0.82 0.54 0.5 0.56 0.65 0.58 0.64 0.84 0.98 0.93 0.73 0.67 0.63 0.67 0.64 0.59 0.59 0.75 0.53 0.58 0.67 0.64 0.58 0.73 0.74 1.0
0.07 0.12 0.1 0.13 0.66 0.82 0.33 0.29 0.32 0.29 0.37 0.29 0.26 0.89 1.0 0.52 0.34 0.51 0.56 0.36 0.37 0.39 0.36 0.36 0.37 0.39 0.44 0.28 0.48 0.43 0.51
0.64 0.48 0.52 0.62 0.9 0.99 0.61 0.52 0.7 0.67 0.65 0.74 0.88 1.0 0.9 0.66 0.74 0.74 0.73 0.73 0.7 0.69 0.99 0.7 0.8 0.75 0.8 0.83 0.9 0.75 0.79
0.37 0.33 0.3 0.41 1.0 0.74 0.37 0.39 0.5 0.62 0.57 0.58 0.78 0.73 0.88 0.65 0.61 0.58 0.57 0.53 0.52 0.54 0.93 0.56 0.51 0.54 0.49 0.58 0.67 0.71 0.83
0.34 0.35 0.36 0.4 0.97 0.85 0.34 0.46 0.39 0.38 0.4 0.42 0.43 1.0 0.83 0.47 0.38 0.51 0.55 0.39 0.4 0.42 0.8 0.44 0.42 0.38 0.45 0.41 0.75 0.63 0.73
0.4 0.45 0.34 0.35 0.95 0.77 0.49 0.51 0.43 0.45 0.49 0.46 0.61 0.87 0.77 0.55 0.53 0.53 0.53 0.43 0.47 0.49 1.0 0.44 0.47 0.48 0.48 0.53 0.68 0.63 0.73
0.43 0.42 0.32 0.32 0.94 0.89 0.54 0.38 0.46 0.51 0.57 0.61 0.78 0.97 0.94 0.74 0.68 0.74 0.69 0.6 0.63 0.68 1.0 0.55 0.67 0.66 0.69 0.7 0.87 0.8 0.77
0.44 0.57 0.42 0.47 0.8 0.77 0.66 0.63 0.56 0.57 0.61 0.6 0.66 1.0 0.93 0.67 0.64 0.53 0.64 0.57 0.59 0.61 0.94 0.55 0.55 0.63 0.61 0.6 0.78 0.74 0.79
0.3 0.32 0.19 0.24 0.86 0.8 0.37 0.35 0.66 0.67 0.73 0.58 0.86 0.8 0.84 0.7 0.7 0.55 0.63 0.48 0.51 0.65 0.63 0.54 0.55 0.65 0.57 0.55 0.77 0.77 1.0
0.52 0.62 0.43 0.44 0.88 1.0 0.76 0.71 0.57 0.6 0.63 0.59 0.73 1.0 0.87 0.78 0.68 0.7 0.75 0.63 0.63 0.68 0.75 0.57 0.62 0.68 0.71 0.63 0.78 0.73 0.84
0.51 0.53 0.51 0.49 0.73 0.77 0.48 0.5 0.44 0.43 0.5 0.46 0.6 1.0 0.85 0.59 0.51 0.47 0.56 0.45 0.49 0.54 0.88 0.45 0.52 0.51 0.52 0.52 0.65 0.59 0.72
0.32 0.33 0.33 0.4 0.78 0.78 0.48 0.55 0.5 0.48 0.53 0.52 0.69 1.0 0.86 0.53 0.57 0.48 0.59 0.52 0.5 0.54 0.68 0.49 0.47 0.57 0.54 0.54 0.69 0.61 0.86
0.29 0.38 0.31 0.45 0.97 0.89 0.36 0.3 0.41 0.49 0.44 0.45 0.35 1.0 0.97 0.57 0.39 0.58 0.57 0.43 0.38 0.41 0.76 0.44 0.43 0.43 0.5 0.34 0.74 0.69 0.73
0.47 0.58 0.41 0.44 0.84 0.9 0.58 0.49 0.55 0.53 0.57 0.53 0.7 1.0 0.82 0.68 0.59 0.56 0.55 0.5 0.5 0.57 0.69 0.52 0.56 0.59 0.58 0.58 0.72 0.71 0.8
0.3 0.34 0.33 0.35 0.66 0.71 0.33 0.26 0.44 0.39 0.48 0.46 0.63 1.0 0.84 0.65 0.54 0.62 0.54 0.46 0.46 0.5 0.71 0.4 0.49 0.53 0.5 0.49 0.62 0.59 0.58
0.12 0.13 0.12 0.16 0.67 0.85 0.3 0.27 0.36 0.38 0.39 0.32 0.34 1.0 0.85 0.55 0.45 0.42 0.55 0.41 0.39 0.48 0.42 0.38 0.36 0.45 0.46 0.37 0.4 0.41 0.5
0.65 0.62 0.59 0.52 0.77 0.8 0.62 0.63 0.63 0.62 0.7 0.66 0.7 1.0 0.89 0.69 0.65 0.36 0.73 0.63 0.64 0.67 0.75 0.67 0.64 0.63 0.67 0.63 0.66 0.67 0.82
0.41 0.45 0.4 0.41 1.0 0.83 0.5 0.52 0.46 0.44 0.48 0.46 0.54 1.0 0.9 0.63 0.5 0.71 0.56 0.46 0.48 0.49 0.98 0.42 0.46 0.52 0.53 0.53 0.71 0.7 0.72
0.47 0.51 0.49 0.57 0.79 0.87 0.51 0.52 0.48 0.5 0.59 0.49 0.66 1.0 0.76 0.62 0.5 0.4 0.55 0.49 0.52 0.56 0.73 0.56 0.56 0.57 0.59 0.5 0.68 0.68 0.78
0.45 0.5 0.4 0.44 0.91 0.82 0.55 0.52 0.55 0.55 0.55 0.52 0.66 1.0 0.85 0.6 0.56 0.49 0.6 0.49 0.51 0.55 0.87 0.48 0.55 0.54 0.59 0.54 0.8 0.75 0.86
0.34 0.28 0.18 0.3 0.78 0.87 0.32 0.27 0.44 0.44 0.51 0.51 0.57 0.81 0.78 0.62 0.45 0.41 0.73 0.5 0.64 0.64 0.87 0.56 0.57 0.63 0.65 0.68 0.77 0.73 1.0
0.48 0.5 0.4 0.57 0.94 1.0 0.61 0.61 0.6 0.57 0.64 0.62 0.85 0.85 0.83 0.67 0.57 0.77 0.69 0.62 0.69 0.69 0.92 0.61 0.68 0.71 0.69 0.82 0.78 0.75 0.82
0.34 0.39 0.39 0.45 0.78 0.82 0.53 0.58 0.48 0.5 0.56 0.49 0.6 1.0 0.95 0.68 0.6 0.49 0.58 0.48 0.51 0.53 0.49 0.47 0.51 0.53 0.55 0.44 0.63 0.68 0.81
0.33 0.42 0.29 0.34 0.82 0.76 0.49 0.51 0.49 0.43 0.58 0.51 0.58 1.0 0.85 0.58 0.52 0.53 0.53 0.43 0.45 0.52 0.52 0.42 0.49 0.51 0.53 0.45 0.72 0.65 0.71
0.4 0.41 0.4 0.53 0.88 0.81 0.62 0.57 0.55 0.62 0.63 0.63 0.73 1.0 0.95 0.62 0.55 0.62 0.64 0.54 0.56 0.6 0.66 0.52 0.55 0.56 0.63 0.5 0.7 0.67 0.93
0.6 0.55 0.46 0.49 0.94 0.91 0.65 0.66 0.59 0.67 0.7 0.7 0.82 1.0 0.86 0.74 0.69 0.58 0.7 0.61 0.66 0.67 0.8 0.71 0.64 0.65 0.68 0.73 0.8 0.73 0.94
0.47 0.47 0.52 0.56 0.78 0.8 0.58 0.69 0.55 0.54 0.57 0.56 0.72 1.0 0.89 0.64 0.61 0.5 0.67 0.53 0.55 0.59 0.74 0.57 0.55 0.63 0.56 0.56 0.71 0.67 0.84
0.37 0.33 0.3 0.41 1.0 0.74 0.37 0.39 0.5 0.62 0.57 0.58 0.78 0.73 0.88 0.65 0.61 0.58 0.57 0.53 0.52 0.54 0.93 0.56 0.51 0.54 0.49 0.58 0.67 0.71 0.83
0.22 0.28 0.32 0.3 0.85 0.84 0.51 0.46 0.61 0.58 0.61 0.61 0.84 0.83 0.91 0.77 0.71 0.69 0.55 0.57 0.53 0.58 0.9 0.51 0.58 0.63 0.63 0.52 0.75 0.76 1.0
0.48 0.54 0.53 0.56 0.81 0.99 0.64 0.54 0.57 0.51 0.64 0.55 0.64 1.0 0.89 0.77 0.62 0.57 0.65 0.57 0.7 0.73 0.88 0.55 0.62 0.73 0.76 0.68 0.74 0.78 0.88
0.43 0.43 0.37 0.4 0.89 0.93 0.58 0.57 0.56 0.57 0.55 0.54 0.85 1.0 0.78 0.6 0.61 0.54 0.54 0.56 0.56 0.63 0.62 0.59 0.61 0.61 0.62 0.65 0.78 0.72 0.86
0.3 0.23 0.3 0.28 0.69 0.77 0.33 0.31 0.35 0.33 0.43 0.37 0.49 1.0 0.78 0.53 0.45 0.36 0.48 0.37 0.42 0.46 0.48 0.37 0.43 0.44 0.47 0.4 0.4 0.45 0.63
0.37 0.42 0.42 0.49 0.72 0.67 0.48 0.46 0.47 0.56 0.52 0.57 0.63 1.0 0.89 0.63 0.6 0.6 0.69 0.55 0.51 0.53 0.67 0.48 0.48 0.56 0.55 0.47 0.62 0.62 0.81
0.09 0.07 0.14 0.21 0.69 0.8 0.25 0.16 0.29 0.23 0.33 0.24 0.28 0.99 1.0 0.48 0.37 0.51 0.5 0.31 0.33 0.36 0.47 0.37 0.39 0.43 0.45 0.26 0.49 0.41 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)