1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_140 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.5 0.32 0.37 0.56 0.25 0.15 0.36 0.4 0.35 0.29 0.45 0.33 0.37 0.12 0.08 0.32 0.37 1.0 0.21 0.33 0.3 0.32 0.07 0.2 0.28 0.34 0.33 0.39 0.23 0.16 0.19
0.51 0.29 0.51 0.59 0.21 0.23 0.48 0.39 0.5 0.58 0.41 0.47 0.6 0.1 0.13 0.46 0.46 1.0 0.28 0.47 0.48 0.34 0.08 0.5 0.41 0.41 0.35 0.6 0.15 0.16 0.22
0.5 0.57 0.54 0.61 0.35 0.32 0.55 0.49 0.46 0.47 0.34 0.29 0.29 0.18 0.33 0.44 0.47 1.0 0.42 0.39 0.63 0.43 0.02 0.37 0.4 0.35 0.44 0.38 0.34 0.3 0.17
0.5 0.57 0.67 0.71 0.3 0.29 0.54 0.42 0.41 0.45 0.32 0.33 0.27 0.14 0.26 0.39 0.45 1.0 0.42 0.53 0.58 0.44 0.03 0.33 0.38 0.34 0.41 0.4 0.29 0.31 0.18
0.14 0.16 0.17 0.33 0.04 0.04 0.25 0.12 0.45 0.46 0.25 0.39 0.59 0.04 0.06 0.26 0.34 1.0 0.06 0.24 0.29 0.16 0.01 0.26 0.16 0.16 0.15 0.22 0.09 0.11 0.1
0.14 0.07 0.22 0.63 0.03 0.01 0.05 0.07 0.22 0.03 0.14 0.13 0.44 0.11 0.03 0.31 0.15 1.0 0.07 0.01 0.11 0.12 0.13 0.16 0.11 0.27 0.19 0.2 0.16 0.01 0.12
0.52 0.49 0.58 1.0 0.08 0.07 0.26 0.17 0.7 0.61 0.44 0.55 0.68 0.12 0.16 0.36 0.44 0.94 0.18 0.55 0.55 0.42 0.02 0.6 0.47 0.4 0.42 0.51 0.18 0.18 0.24
Lsat_1_v5_gn_2_20580.1 (AUXILIN-LIKE4)
 0.2 0.32 0.34 0.73 0.03 0.02 0.29 0.14 0.24 0.27 0.16 0.24 0.3 0.04 0.04 0.18 0.19 1.0 0.07 0.19 0.25 0.24 0.07 0.28 0.21 0.19 0.22 0.28 0.09 0.12 0.12
0.55 0.6 0.5 0.58 0.43 0.41 0.55 0.6 0.62 0.52 0.54 0.46 0.49 0.34 0.45 0.51 0.55 1.0 0.43 0.58 0.47 0.56 0.14 0.5 0.41 0.53 0.63 0.41 0.42 0.41 0.37
0.47 0.35 0.39 0.59 0.18 0.16 0.33 0.37 0.45 0.46 0.44 0.42 0.52 0.08 0.07 0.24 0.4 1.0 0.25 0.46 0.37 0.37 0.05 0.42 0.31 0.31 0.36 0.37 0.2 0.2 0.15
0.14 0.16 0.17 0.33 0.04 0.04 0.25 0.12 0.45 0.46 0.25 0.39 0.59 0.04 0.06 0.26 0.34 1.0 0.06 0.24 0.29 0.16 0.01 0.26 0.16 0.16 0.15 0.22 0.09 0.11 0.1
0.33 0.32 0.4 0.66 0.05 0.05 0.17 0.11 0.53 0.53 0.4 0.45 0.55 0.08 0.1 0.26 0.39 1.0 0.12 0.42 0.43 0.35 0.03 0.37 0.34 0.26 0.26 0.35 0.14 0.12 0.14
0.52 0.49 0.58 1.0 0.08 0.07 0.26 0.17 0.7 0.61 0.44 0.55 0.68 0.12 0.16 0.36 0.44 0.94 0.18 0.55 0.55 0.42 0.02 0.6 0.47 0.4 0.42 0.51 0.18 0.18 0.24
0.23 0.28 0.51 0.48 0.12 0.1 0.29 0.25 0.31 0.32 0.22 0.35 0.37 0.08 0.08 0.29 0.32 1.0 0.21 0.31 0.29 0.21 0.04 0.29 0.24 0.24 0.25 0.29 0.15 0.15 0.16
0.41 0.41 0.57 0.57 0.19 0.27 0.63 0.35 0.48 0.44 0.37 0.45 0.63 0.07 0.16 0.34 0.42 1.0 0.27 0.42 0.22 0.25 0.05 0.25 0.34 0.31 0.36 0.51 0.2 0.22 0.25
0.27 0.29 0.55 0.39 0.18 0.12 0.18 0.14 0.34 0.41 0.37 0.42 0.42 0.15 0.05 0.3 0.32 1.0 0.23 0.25 0.25 0.17 0.04 0.34 0.27 0.26 0.29 0.34 0.13 0.11 0.13
0.55 0.52 0.71 0.78 0.22 0.22 0.45 0.34 0.35 0.35 0.28 0.24 0.22 0.12 0.17 0.25 0.31 1.0 0.3 0.41 0.39 0.37 0.05 0.27 0.3 0.34 0.32 0.35 0.23 0.15 0.11
0.17 0.17 0.29 0.51 0.16 0.18 0.31 0.32 0.28 0.29 0.29 0.33 0.43 0.07 0.19 0.3 0.37 1.0 0.19 0.37 0.23 0.26 0.1 0.34 0.3 0.35 0.29 0.26 0.22 0.37 0.35
0.42 0.17 0.53 0.52 0.28 0.2 0.44 0.14 0.61 0.35 0.38 0.41 0.41 0.05 0.15 0.46 0.32 1.0 0.26 0.43 0.35 0.26 0.12 0.32 0.28 0.27 0.27 0.42 0.28 0.19 0.26
0.38 0.4 0.53 1.0 0.17 0.09 0.41 0.16 0.58 0.4 0.38 0.47 0.7 0.04 0.15 0.32 0.46 0.62 0.18 0.44 0.41 0.36 0.02 0.4 0.26 0.26 0.33 0.35 0.11 0.18 0.14
0.52 0.49 0.58 1.0 0.08 0.07 0.26 0.17 0.7 0.61 0.44 0.55 0.68 0.12 0.16 0.36 0.44 0.94 0.18 0.55 0.55 0.42 0.02 0.6 0.47 0.4 0.42 0.51 0.18 0.18 0.24
0.47 0.41 0.58 1.0 0.07 0.07 0.2 0.17 0.51 0.54 0.41 0.44 0.64 0.06 0.16 0.28 0.44 0.72 0.19 0.41 0.51 0.41 0.04 0.59 0.41 0.28 0.22 0.47 0.18 0.2 0.23
0.37 0.27 0.93 1.0 0.05 0.01 0.09 0.07 0.21 0.54 0.24 0.55 0.64 0.04 0.05 0.3 0.38 0.26 0.08 0.23 0.17 0.12 0.26 0.16 0.24 0.21 0.06 0.24 0.06 0.37 0.65
0.57 0.42 0.47 0.84 0.24 0.22 0.48 0.53 0.71 0.6 0.42 0.52 0.64 0.2 0.04 0.45 0.75 1.0 0.23 0.47 0.38 0.36 0.1 0.46 0.3 0.51 0.39 0.51 0.24 0.32 0.26
0.39 0.26 1.0 0.93 0.11 0.06 0.1 0.1 0.2 0.25 0.18 0.36 0.72 0.1 0.09 0.43 0.46 0.12 0.07 0.17 0.23 0.22 0.07 0.2 0.27 0.35 0.26 0.3 0.18 0.27 0.33
0.52 0.49 0.58 1.0 0.08 0.07 0.26 0.17 0.7 0.61 0.44 0.55 0.68 0.12 0.16 0.36 0.44 0.94 0.18 0.55 0.55 0.42 0.02 0.6 0.47 0.4 0.42 0.51 0.18 0.18 0.24
0.16 0.24 0.29 0.46 0.06 0.07 0.24 0.13 0.27 0.25 0.19 0.17 0.23 0.05 0.11 0.2 0.25 1.0 0.03 0.14 0.16 0.12 0.02 0.15 0.14 0.1 0.13 0.16 0.08 0.08 0.07
0.58 0.49 0.45 0.58 0.17 0.19 0.29 0.27 0.53 0.37 0.43 0.46 0.35 0.11 0.1 0.29 0.27 1.0 0.34 0.43 0.46 0.36 0.03 0.38 0.4 0.37 0.47 0.54 0.2 0.26 0.11
0.55 0.52 0.71 0.78 0.22 0.22 0.45 0.34 0.35 0.35 0.28 0.24 0.22 0.12 0.17 0.25 0.31 1.0 0.3 0.41 0.39 0.37 0.05 0.27 0.3 0.34 0.32 0.35 0.23 0.15 0.11
0.47 0.35 0.39 0.59 0.18 0.16 0.33 0.37 0.45 0.46 0.44 0.42 0.52 0.08 0.07 0.24 0.4 1.0 0.25 0.46 0.37 0.37 0.05 0.42 0.31 0.31 0.36 0.37 0.2 0.2 0.15
0.47 0.35 0.39 0.59 0.18 0.16 0.33 0.37 0.45 0.46 0.44 0.42 0.52 0.08 0.07 0.24 0.4 1.0 0.25 0.46 0.37 0.37 0.05 0.42 0.31 0.31 0.36 0.37 0.2 0.2 0.15
0.61 0.72 0.88 0.89 0.28 0.22 0.48 0.38 0.42 0.39 0.26 0.28 0.24 0.13 0.21 0.34 0.35 1.0 0.37 0.43 0.62 0.51 0.02 0.46 0.48 0.34 0.35 0.35 0.33 0.26 0.13
0.5 0.44 1.0 0.91 0.15 0.15 0.3 0.33 0.38 0.43 0.41 0.37 0.68 0.21 0.25 0.32 0.49 0.25 0.35 0.31 0.29 0.29 0.02 0.36 0.3 0.31 0.33 0.36 0.35 0.39 0.51
0.48 0.3 0.53 0.52 0.21 0.2 0.31 0.35 0.43 0.43 0.4 0.48 0.43 0.14 0.07 0.33 0.36 1.0 0.21 0.32 0.37 0.43 0.02 0.37 0.44 0.39 0.21 0.57 0.16 0.22 0.18
0.47 0.35 0.39 0.59 0.18 0.16 0.33 0.37 0.45 0.46 0.44 0.42 0.52 0.08 0.07 0.24 0.4 1.0 0.25 0.46 0.37 0.37 0.05 0.42 0.31 0.31 0.36 0.37 0.2 0.2 0.15
0.45 0.35 0.39 0.75 0.19 0.2 0.53 0.28 0.53 0.58 0.42 0.36 0.8 0.15 0.25 0.5 0.6 1.0 0.39 0.57 0.6 0.48 0.22 0.67 0.55 0.46 0.5 0.65 0.32 0.27 0.32
0.32 0.28 0.69 1.0 0.05 0.06 0.08 0.17 0.09 0.26 0.27 0.35 0.63 0.02 0.01 0.23 0.23 0.08 0.04 0.1 0.13 0.18 0.06 0.09 0.17 0.32 0.14 0.13 0.03 0.11 0.16
0.14 0.16 0.17 0.33 0.04 0.04 0.25 0.12 0.45 0.46 0.25 0.39 0.59 0.04 0.06 0.26 0.34 1.0 0.06 0.24 0.29 0.16 0.01 0.26 0.16 0.16 0.15 0.22 0.09 0.11 0.1
0.46 0.38 0.62 1.0 0.05 0.12 0.29 0.2 0.45 0.35 0.35 0.4 0.47 0.05 0.06 0.2 0.34 0.46 0.1 0.34 0.38 0.28 0.03 0.41 0.27 0.24 0.28 0.39 0.16 0.11 0.11
0.27 0.45 0.4 0.58 0.18 0.13 0.38 0.23 0.29 0.33 0.11 0.16 0.17 0.05 0.15 0.34 0.22 1.0 0.18 0.45 0.35 0.33 0.16 0.23 0.23 0.23 0.18 0.17 0.28 0.19 0.13
0.45 0.25 0.67 1.0 0.21 0.32 0.48 0.4 0.29 0.28 0.26 0.32 0.73 0.06 0.11 0.28 0.26 0.22 0.14 0.23 0.36 0.34 0.23 0.24 0.33 0.32 0.4 0.24 0.2 0.14 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)