Heatmap: Cluster_238 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-1.52 -1.6 -2.15 -2.1 0.03 0.02 -0.08 0.2 -0.7 -0.48 -0.49 -0.33 0.99 1.42 1.03 -0.11 0.04 0.69 0.29 0.07 -0.35 -0.31 -0.26 -0.07 -0.34 -0.5 -0.3 -0.44 0.11 0.07 0.84
-0.3 -0.67 -0.42 -0.02 -0.28 -0.09 -0.1 0.33 -0.09 0.13 0.16 0.11 0.76 0.21 0.21 0.11 0.15 -1.31 -0.18 0.11 -0.11 -0.01 -0.74 0.19 0.16 0.05 -0.02 0.2 -0.12 -0.15 0.4
-1.27 -2.06 -2.16 -1.69 0.39 0.51 -0.15 -1.01 0.03 0.31 0.16 0.48 0.66 0.19 0.7 0.47 0.24 -1.32 0.08 0.22 0.01 -0.13 -1.08 0.15 0.2 -0.09 -0.34 0.29 -0.16 0.13 0.83
-1.94 -2.9 -1.72 -1.91 -0.03 0.29 -0.94 -1.14 -0.3 -0.54 -0.75 -0.48 0.97 1.27 1.0 0.16 0.0 1.19 0.37 -0.15 -0.54 -0.59 -0.54 -0.24 -0.09 -0.15 -0.06 -0.68 -0.23 -0.14 1.59
-0.83 -0.83 -1.2 -0.94 -0.03 0.21 0.11 -0.02 -0.05 0.03 0.0 -0.02 0.62 0.63 0.59 0.22 0.13 -0.61 -0.05 0.02 -0.18 -0.11 -0.6 -0.1 -0.02 -0.09 -0.17 -0.17 0.14 0.27 0.9
-0.47 -0.35 -0.2 0.0 0.27 -0.16 -0.72 -0.74 0.11 0.23 0.21 0.13 0.64 0.76 0.54 0.0 -0.24 -0.33 -0.02 -0.26 -0.4 -0.37 -1.2 -0.33 -0.25 -0.12 -0.23 -0.22 0.22 0.41 0.93
-6.21 -4.96 -3.62 -4.27 -0.15 -0.61 -1.69 -2.6 -0.92 -0.6 -0.91 -0.18 1.72 2.16 1.95 -0.16 0.16 1.23 0.19 0.21 -0.95 -1.16 -2.41 -0.66 -0.88 -1.24 -0.99 -1.66 -1.43 -0.74 1.74
-1.46 -0.64 -1.02 -1.3 -0.16 0.28 0.04 0.09 -0.12 -0.37 -0.39 -0.36 0.79 0.61 0.63 0.24 0.14 0.0 0.09 0.02 -0.15 -0.09 -0.24 -0.08 -0.18 -0.08 -0.23 -0.27 0.12 0.15 1.11
-1.92 -1.36 -2.75 -1.65 0.06 0.17 -0.09 -0.56 -0.46 -0.38 -0.29 -0.23 0.63 1.29 1.3 0.34 0.21 1.07 -0.21 -0.03 -0.34 -0.47 -1.1 -0.13 -0.01 -0.46 -0.65 -0.55 -0.22 0.14 1.14
-0.48 -0.5 -0.39 -0.26 -0.24 0.01 -0.13 -0.19 0.02 -0.06 -0.06 0.17 0.7 0.23 0.06 0.07 0.38 -0.83 -0.08 0.11 0.0 -0.12 -0.67 0.14 0.2 -0.12 -0.14 0.18 0.15 0.24 0.54
-3.52 -3.43 -2.77 -1.17 -0.37 -0.48 -0.39 -1.49 -0.08 -0.94 -0.03 0.02 1.12 1.64 1.4 0.02 0.31 0.37 0.4 -0.11 -0.02 -0.14 -5.78 -0.08 -0.12 -0.05 0.31 -0.48 -1.06 -0.08 1.2
-0.92 -0.89 -0.56 -0.67 0.29 0.44 -0.23 -0.14 -0.31 -0.4 -0.35 -0.38 0.13 1.2 0.95 0.12 -0.14 -0.4 0.3 -0.26 -0.2 -0.2 -0.3 -0.3 -0.24 -0.12 -0.15 -0.19 0.39 0.28 0.67
-1.57 -1.42 -2.26 -1.39 -0.26 0.41 -0.14 -0.23 -0.34 -0.32 -0.3 -0.36 0.76 0.31 0.3 0.11 0.25 0.15 0.15 -0.11 -0.19 0.06 0.04 0.24 0.27 -0.06 0.08 -0.1 0.08 0.31 1.28
-1.11 -0.86 -0.75 -1.18 -0.17 0.11 -0.46 -0.42 -0.11 -0.22 -0.25 -0.17 0.31 1.1 0.74 0.21 -0.26 0.78 0.19 -0.15 -0.39 -0.46 0.11 0.02 -0.37 -0.75 -0.26 -0.56 0.19 0.24 1.27
-0.1 -0.11 -0.22 -0.44 0.31 0.36 -0.13 -0.11 -0.32 -0.26 -0.19 -0.38 0.22 0.9 0.48 0.14 0.04 -0.16 -0.09 -0.28 -0.29 -0.24 -0.04 -0.16 -0.15 -0.05 -0.1 -0.23 0.04 0.12 0.47
-0.64 -0.92 -0.51 -0.36 0.04 0.06 -0.28 -0.39 -0.42 -0.48 -0.27 -0.25 0.45 0.87 0.62 0.15 0.08 0.33 0.07 -0.18 -0.27 -0.31 0.11 -0.01 -0.06 -0.08 -0.16 -0.26 -0.07 0.13 1.06
-1.08 -0.82 -1.03 -0.78 0.42 0.4 -0.64 -0.54 -0.1 -0.05 0.01 0.01 0.25 1.06 0.95 0.18 -0.13 -0.19 0.15 -0.22 -0.16 -0.04 -0.36 0.01 -0.23 -0.17 -0.15 -0.43 0.03 0.26 0.7
-0.46 -0.55 -0.49 -0.44 -0.09 0.14 -0.09 -0.13 -0.1 0.03 0.07 0.1 0.59 0.33 0.13 0.16 0.18 -0.48 -0.08 -0.06 -0.08 0.08 -0.43 0.16 0.13 0.03 -0.06 0.1 0.05 0.04 0.46
-0.98 -0.62 -0.11 0.37 -0.15 -0.31 -0.73 -0.83 0.06 0.32 0.22 0.36 0.77 0.64 0.48 -0.2 -0.36 0.28 -0.35 -0.12 -0.54 -0.46 -1.11 -0.54 -0.48 -0.55 -0.32 -0.71 -0.05 0.28 1.69
-0.6 -0.51 -0.28 0.32 0.13 -0.12 -0.28 -0.32 -0.1 0.09 0.07 -0.07 0.5 0.51 0.26 -0.12 -0.0 -0.07 -0.12 -0.13 -0.39 -0.16 -0.83 -0.18 -0.1 -0.1 -0.15 -0.32 0.21 0.4 1.02
-0.85 -1.09 -0.91 -0.92 0.55 0.31 -0.16 -0.38 -0.59 -0.54 -0.31 -0.28 0.62 1.22 0.66 -0.12 0.13 0.65 0.27 -0.14 -0.15 -0.13 -0.15 -0.57 -0.36 -0.23 -0.34 -0.45 0.09 -0.31 1.0
-0.63 -0.47 -0.4 -0.61 0.14 0.29 -0.27 -0.05 -0.28 -0.06 -0.24 -0.1 0.61 0.64 0.29 -0.12 0.08 -0.23 0.03 -0.19 -0.07 -0.13 -0.68 0.08 0.01 -0.0 -0.08 -0.03 0.17 0.16 0.85
-2.41 -2.1 -2.97 -2.27 -0.7 0.11 0.31 1.01 -0.61 -0.75 -0.99 -0.42 1.05 1.29 0.84 0.18 0.23 0.44 -0.26 -0.25 -0.5 -0.36 -0.53 -0.38 0.3 0.15 0.18 -0.22 -0.05 -0.02 0.93
-0.55 -0.58 -0.19 -0.12 0.13 -0.03 -0.73 -0.78 -0.36 -0.01 0.02 0.15 0.86 0.46 0.29 -0.04 -0.06 0.05 -0.08 -0.18 -0.38 -0.24 -0.86 -0.05 -0.15 -0.16 -0.11 -0.4 0.25 0.33 1.28
-0.31 -0.38 -0.22 -0.29 0.27 0.49 -0.13 -0.01 -0.25 -0.45 -0.21 -0.23 0.01 1.0 0.58 0.0 -0.13 -0.24 0.03 -0.29 -0.17 -0.03 -0.38 -0.19 -0.16 0.02 -0.06 -0.1 0.13 0.12 0.44
-1.15 -0.8 -1.41 -0.96 0.2 -0.26 -0.5 -0.29 -0.45 -0.56 -0.34 -0.23 0.46 1.33 0.82 -0.13 -0.05 1.2 -0.06 -0.0 -0.45 -0.35 -0.67 -0.08 -0.09 -0.31 -0.06 -0.0 -0.12 0.19 0.9
-1.0 -0.8 -0.43 -0.77 0.02 -0.21 -0.37 -0.38 -0.28 -0.31 -0.24 -0.25 0.86 1.14 0.8 -0.03 -0.02 0.12 0.05 -0.11 -0.34 -0.14 0.06 -0.14 -0.35 -0.31 -0.47 -0.26 -0.09 0.02 1.23
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-0.55 -0.47 -0.62 -0.39 0.37 0.38 -0.18 -0.3 -0.37 -0.29 -0.05 -0.19 0.5 1.01 0.71 0.19 -0.11 -0.21 -0.08 -0.23 -0.25 -0.2 -0.54 -0.33 -0.26 -0.08 -0.03 -0.51 0.33 0.3 0.62
-0.45 -0.27 -0.28 -0.1 0.06 0.33 -0.04 -0.13 -0.3 -0.1 -0.04 -0.11 0.5 0.42 0.16 0.11 0.01 0.04 -0.18 -0.16 -0.09 -0.01 -0.77 -0.06 -0.06 0.09 -0.12 -0.22 0.12 0.21 0.65
-0.14 -0.23 -0.02 -0.25 0.04 0.16 -0.16 -0.24 -0.26 -0.19 -0.13 -0.23 0.33 0.82 0.43 0.16 0.04 -0.06 0.01 -0.22 -0.2 -0.15 -0.29 -0.24 -0.11 -0.09 -0.06 -0.09 0.05 0.08 0.52
-0.91 -0.87 -0.71 -0.47 -0.07 0.11 -0.16 0.02 -0.15 -0.11 -0.01 0.14 0.51 0.5 0.25 0.29 0.11 -0.61 -0.25 -0.13 -0.15 -0.04 -0.16 0.16 0.06 0.05 -0.06 -0.18 0.26 0.33 0.79
Lsat_1_v5_gn_5_62360.1 (KINESIN-13A)
-0.45 -0.39 -0.37 -0.29 0.06 0.02 -0.18 -0.27 -0.07 0.02 0.08 0.13 0.37 0.25 0.28 0.05 0.01 -0.06 -0.18 -0.08 -0.14 -0.14 0.05 -0.23 -0.02 -0.01 0.02 -0.07 0.21 0.3 0.54
-0.61 -0.68 -0.5 -0.19 -0.13 0.18 0.03 0.23 -0.19 -0.08 -0.03 0.07 0.64 0.42 0.2 0.34 0.31 -0.61 -0.06 -0.05 -0.02 -0.01 -0.46 0.02 0.04 -0.0 -0.07 0.04 -0.06 -0.02 0.3
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-0.99 -0.74 -1.43 -1.65 0.73 0.55 -0.23 -0.42 -0.53 -0.25 -0.2 -0.48 1.04 1.06 1.0 0.33 -0.13 -0.48 -0.13 -0.17 -0.4 -0.34 -2.34 -0.28 -0.63 -0.53 -0.33 -0.54 0.3 0.33 1.41
-0.23 -0.16 -0.24 -0.23 0.17 0.14 -0.59 -0.73 -0.44 -0.33 -0.12 -0.23 0.35 1.21 0.72 -0.21 -0.44 0.1 0.24 -0.29 -0.31 -0.28 -0.06 -0.5 -0.18 -0.3 -0.19 -0.63 0.16 0.2 1.04
-0.92 -0.92 -0.52 -0.07 0.21 -0.37 -0.65 -1.52 0.16 0.05 0.16 0.17 0.55 0.56 0.72 -0.43 0.0 0.09 0.02 0.01 -0.07 -0.25 -1.21 -0.24 -0.19 -0.05 -0.05 -0.06 0.41 0.33 1.1
-0.62 -0.81 -0.61 -0.41 0.28 0.29 -0.14 -0.29 -0.09 -0.15 0.01 0.11 0.65 0.54 0.34 -0.08 -0.01 -0.52 -0.07 -0.28 -0.1 -0.27 -0.03 0.16 -0.05 -0.06 -0.13 -0.26 0.19 0.2 0.81
-0.5 -0.3 -0.04 0.14 0.13 0.01 -0.48 -0.7 -0.13 0.02 0.06 -0.06 0.26 0.68 0.35 0.01 -0.0 -0.66 0.11 -0.22 -0.17 -0.15 -0.17 -0.31 -0.11 -0.11 -0.06 -0.27 0.23 0.35 0.86
-1.14 -0.91 -0.73 -0.96 0.13 0.09 0.1 0.19 -0.22 -0.24 -0.27 -0.24 1.16 0.68 0.31 -0.06 -0.25 0.03 -0.24 -0.38 -0.14 0.03 -1.12 0.19 -0.19 -0.02 -0.37 -0.2 0.02 0.08 1.33
-0.77 -0.59 -0.48 -0.54 -0.01 0.01 -0.57 -0.35 -0.05 0.12 -0.08 0.08 1.04 0.21 0.12 0.03 0.06 0.13 0.09 -0.22 -0.33 -0.12 -0.77 0.19 0.04 -0.13 -0.33 -0.21 0.06 0.27 1.1
-0.73 -0.8 -0.5 -0.37 0.03 0.1 -0.4 -0.45 -0.06 0.05 -0.04 0.12 0.38 0.47 0.32 0.05 0.12 -0.65 0.02 0.02 -0.1 -0.1 -0.16 -0.07 -0.01 -0.03 0.12 -0.16 0.26 0.4 0.85
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.